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'Manolaridis, I.' 2 ? 'Kowal, J.' 3 ? 'Zechner, M.' 4 ? 'Altmann, K.H.' 5 ? 'Locher, K.P.' 6 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat. Struct. Mol. 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_entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 657 Human ? 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'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ABCG2_HUMAN Q9UNQ0 ? 1 ;MSSSNVEVFIPVSQGNTNGFPATASNDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVEKEILSNINGIMKPGLNAILG PTGGGKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPANFKCNSGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLATTMTNHEKNER INRVIQELGLDKVADSKVGTQFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIF SIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIINGDSTAVALNREEDFKATEIIE PSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAELHQLSGGEKKKKITVFKEISYTTSFCHQLRWVSKRSFKNLLGNPQASIAQII VTVVLGLVIGAIYFGLKNDSTGIQNRAGVLFFLTTNQCFSSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLP MRMLPSIIFTCIVYFMLGLKPKADAFFVMMFTLMMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMIFSGLLVNLTT IASWLSWLQYFSIPRYGFTALQHNEFLGQNFCPGLNATGNNPCNYATCTGEEYLVKQGIDLSPWGLWKNHVALACMIVIF LTIAYLKLLFLKKYS ; 1 2 PDB 6ETI 6ETI ? 2 ? 1 3 PDB 6ETI 6ETI ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6ETI A 1 ? 655 ? Q9UNQ0 1 ? 655 ? 1 655 2 1 6ETI B 1 ? 655 ? Q9UNQ0 1 ? 655 ? 1 655 3 2 6ETI C 1 ? 214 ? 6ETI 1 ? 214 ? 1 214 4 3 6ETI D 1 ? 221 ? 6ETI 1 ? 221 ? 1 221 5 2 6ETI E 1 ? 214 ? 6ETI 1 ? 214 ? 1 214 6 3 6ETI F 1 ? 221 ? 6ETI 1 ? 221 ? 1 221 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BWQ non-polymer . ;~{tert}-butyl 3-[(2~{S},5~{S},8~{S})-14-cyclopentyloxy-2-(2-methylpropyl)-4,7-bis(oxidanylidene)-3,6,17-triazatetracyclo[8.7.0.0^{3,8}.0^{11,16}]heptadeca-1(10),11,13,15-tetraen-5-yl]propanoate ; ? 'C30 H41 N3 O5' 523.664 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ETI _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 6ETI _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 ? 12735 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.018 ? 17280 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.063 ? 7430 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.058 ? 1972 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 2146 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6ETI _struct.title 'Structure of inhibitor-bound ABCG2' _struct.pdbx_descriptor ;ATP-binding cassette sub-family G member 2, The variable domain of the light chain of 5D3(Fab), The variable domain of the heavy chain of 5D3(Fab) ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ETI _struct_keywords.text 'Multidrug transporter, ABCG2, MZ29, inhibitor, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 87 ? ALA A 94 ? SER A 87 ALA A 94 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 116 ? SER A 121 ? ASN A 116 SER A 121 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 135 ? LEU A 148 ? THR A 135 LEU A 148 1 ? 14 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 153 ? LEU A 168 ? THR A 153 LEU A 168 1 ? 16 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 187 ? MET A 198 ? SER A 187 MET A 198 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 217 ? LYS A 233 ? ASP A 217 LYS A 233 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 AA7 ARG A 246 ? LYS A 251 ? ARG A 246 LYS A 251 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 GLN A 271 ? SER A 279 ? GLN A 271 SER A 279 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 AA9 ASN A 289 ? GLY A 300 ? ASN A 289 GLY A 300 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 ILE A 329 ? ASN A 338 ? ILE A 329 ASN A 338 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 PHE A 341 ? SER A 353 ? PHE A 341 SER A 353 1 ? 13 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 372 ? ASN A 391 ? SER A 372 ASN A 391 1 ? 20 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO A 392 ? SER A 395 ? PRO A 392 SER A 395 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 AB5 ILE A 396 ? TYR A 413 ? ILE A 396 TYR A 413 1 ? 18 HELX_P HELX_P15 AB6 THR A 421 ? SER A 440 ? THR A 421 SER A 440 1 ? 20 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 441 ? ALA A 444 ? SER A 441 ALA A 444 5 ? 4 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL A 445 ? GLU A 451 ? VAL A 445 GLU A 451 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU A 451 ? SER A 461 ? GLU A 451 SER A 461 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG A 465 ? ASP A 477 ? ARG A 465 ASP A 477 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP A 477 ? GLY A 498 ? ASP A 477 GLY A 498 1 ? 22 HELX_P HELX_P21 AC3 LYS A 502 ? ALA A 529 ? LYS A 502 ALA A 529 1 ? 28 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL A 534 ? MET A 549 ? VAL A 534 MET A 549 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 ILE A 550 ? GLY A 553 ? ILE A 550 GLY A 553 5 ? 4 HELX_P HELX_P24 AC6 LEU A 565 ? PHE A 571 ? LEU A 565 PHE A 571 5 ? 7 HELX_P HELX_P25 AC7 SER A 572 ? PHE A 586 ? SER A 572 PHE A 586 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 AC8 THR A 609 ? GLN A 617 ? THR A 609 GLN A 617 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 PRO A 623 ? PHE A 650 ? PRO A 623 PHE A 650 1 ? 28 HELX_P HELX_P28 AD1 SER B 87 ? ALA B 94 ? SER B 87 ALA B 94 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN B 116 ? SER B 121 ? ASN B 116 SER B 121 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 THR B 135 ? LEU B 148 ? THR B 135 LEU B 148 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 AD4 THR B 153 ? LEU B 168 ? THR B 153 LEU B 168 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 AD5 SER B 187 ? MET B 198 ? SER B 187 MET B 198 1 ? 12 HELX_P HELX_P33 AD6 ASP B 217 ? LYS B 233 ? ASP B 217 LYS B 233 1 ? 17 HELX_P HELX_P34 AD7 ARG B 246 ? LYS B 251 ? ARG B 246 LYS B 251 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 GLN B 271 ? SER B 279 ? GLN B 271 SER B 279 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 AD9 ASN B 289 ? GLY B 300 ? ASN B 289 GLY B 300 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 AE1 ILE B 329 ? ASN B 338 ? ILE B 329 ASN B 338 1 ? 10 HELX_P HELX_P38 AE2 PHE B 341 ? SER B 353 ? PHE B 341 SER B 353 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 AE3 SER B 372 ? ASN B 391 ? SER B 372 ASN B 391 1 ? 20 HELX_P HELX_P40 AE4 PRO B 392 ? SER B 395 ? PRO B 392 SER B 395 5 ? 4 HELX_P HELX_P41 AE5 ILE B 396 ? TYR B 413 ? ILE B 396 TYR B 413 1 ? 18 HELX_P HELX_P42 AE6 THR B 421 ? SER B 440 ? THR B 421 SER B 440 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 AE7 SER B 441 ? ALA B 444 ? SER B 441 ALA B 444 5 ? 4 HELX_P HELX_P44 AE8 VAL B 445 ? GLU B 451 ? VAL B 445 GLU B 451 1 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU B 451 ? SER B 461 ? GLU B 451 SER B 461 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 AF1 ARG B 465 ? ASP B 477 ? ARG B 465 ASP B 477 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP B 477 ? GLY B 498 ? ASP B 477 GLY B 498 1 ? 22 HELX_P HELX_P48 AF3 LYS B 502 ? ALA B 529 ? LYS B 502 ALA B 529 1 ? 28 HELX_P HELX_P49 AF4 VAL B 534 ? MET B 549 ? VAL B 534 MET B 549 1 ? 16 HELX_P HELX_P50 AF5 ILE B 550 ? GLY B 553 ? ILE B 550 GLY B 553 5 ? 4 HELX_P HELX_P51 AF6 LEU B 565 ? PHE B 571 ? LEU B 565 PHE B 571 5 ? 7 HELX_P HELX_P52 AF7 SER B 572 ? PHE B 586 ? SER B 572 PHE B 586 1 ? 15 HELX_P HELX_P53 AF8 THR B 609 ? GLN B 617 ? THR B 609 GLN B 617 1 ? 9 HELX_P HELX_P54 AF9 PRO B 623 ? PHE B 650 ? PRO B 623 PHE B 650 1 ? 28 HELX_P HELX_P55 AG1 GLN C 79 ? VAL C 83 ? GLN C 79 VAL C 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 AG2 GLN E 79 ? VAL E 83 ? GLN E 79 VAL E 83 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 592 SG ? ? ? 1_555 A CYS 608 SG ? ? A CYS 592 A CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 603 SG ? ? ? 1_555 B CYS 603 SG ? ? A CYS 603 B CYS 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 592 SG ? ? ? 1_555 B CYS 608 SG ? ? B CYS 592 B CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? C CYS 23 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf5 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf6 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? E CYS 23 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf7 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 96 SG ? ? F CYS 22 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? covale1 covale one ? A ASN 596 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 596 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 596 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 596 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale4 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 69 ? MET A 71 ? GLY A 69 MET A 71 AA1 2 LEU A 37 ? HIS A 40 ? LEU A 37 HIS A 40 AA1 3 ASP A 105 ? ILE A 108 ? ASP A 105 ILE A 108 AA1 4 ALA A 111 ? PRO A 112 ? ALA A 111 PRO A 112 AA2 1 GLY A 122 ? VAL A 124 ? GLY A 122 VAL A 124 AA2 2 ILE A 206 ? LEU A 209 ? ILE A 206 LEU A 209 AA2 3 THR A 237 ? PHE A 240 ? THR A 237 PHE A 240 AA2 4 LEU A 75 ? LEU A 79 ? LEU A 75 LEU A 79 AA2 5 SER A 255 ? ALA A 260 ? SER A 255 ALA A 260 AA2 6 ARG A 263 ? GLY A 268 ? ARG A 263 GLY A 268 AA3 1 GLY B 69 ? MET B 71 ? GLY B 69 MET B 71 AA3 2 LEU B 37 ? HIS B 40 ? LEU B 37 HIS B 40 AA3 3 ASP B 105 ? ILE B 108 ? ASP B 105 ILE B 108 AA3 4 ALA B 111 ? PRO B 112 ? ALA B 111 PRO B 112 AA4 1 GLY B 122 ? VAL B 124 ? GLY B 122 VAL B 124 AA4 2 ILE B 206 ? LEU B 209 ? ILE B 206 LEU B 209 AA4 3 THR B 237 ? PHE B 240 ? THR B 237 PHE B 240 AA4 4 LEU B 75 ? LEU B 79 ? LEU B 75 LEU B 79 AA4 5 SER B 255 ? ALA B 260 ? SER B 255 ALA B 260 AA4 6 ARG B 263 ? GLY B 268 ? ARG B 263 GLY B 268 AA5 1 LEU C 4 ? THR C 5 ? LEU C 4 THR C 5 AA5 2 VAL C 19 ? ALA C 25 ? VAL C 19 ALA C 25 AA5 3 ASP C 70 ? ILE C 75 ? ASP C 70 ILE C 75 AA5 4 PHE C 62 ? GLY C 64 ? PHE C 62 GLY C 64 AA6 1 SER C 53 ? LEU C 54 ? SER C 53 LEU C 54 AA6 2 ARG C 45 ? SER C 49 ? ARG C 45 SER C 49 AA6 3 LEU C 33 ? GLN C 38 ? LEU C 33 GLN C 38 AA6 4 THR C 85 ? GLN C 90 ? THR C 85 GLN C 90 AA6 5 THR C 102 ? LYS C 103 ? THR C 102 LYS C 103 AA7 1 GLU D 6 ? SER D 7 ? GLU D 6 SER D 7 AA7 2 SER D 17 ? THR D 23 ? SER D 17 THR D 23 AA7 3 GLN D 78 ? ARG D 84 ? GLN D 78 ARG D 84 AA7 4 ILE D 68 ? ASP D 73 ? ILE D 68 ASP D 73 AA8 1 LEU D 11 ? VAL D 12 ? LEU D 11 VAL D 12 AA8 2 THR D 116 ? VAL D 117 ? THR D 116 VAL D 117 AA9 1 THR D 58 ? TYR D 60 ? THR D 58 TYR D 60 AA9 2 LEU D 46 ? ILE D 52 ? LEU D 46 ILE D 52 AA9 3 ALA D 34 ? GLN D 40 ? ALA D 34 GLN D 40 AA9 4 THR D 93 ? PHE D 99 ? THR D 93 PHE D 99 AA9 5 LEU D 106 ? TRP D 109 ? LEU D 106 TRP D 109 AB1 1 THR D 58 ? TYR D 60 ? THR D 58 TYR D 60 AB1 2 LEU D 46 ? ILE D 52 ? LEU D 46 ILE D 52 AB1 3 ALA D 34 ? GLN D 40 ? ALA D 34 GLN D 40 AB1 4 THR D 93 ? PHE D 99 ? THR D 93 PHE D 99 AB1 5 THR D 113 ? SER D 114 ? THR D 113 SER D 114 AB2 1 LEU E 4 ? THR E 5 ? LEU E 4 THR E 5 AB2 2 VAL E 19 ? ALA E 25 ? VAL E 19 ALA E 25 AB2 3 ASP E 70 ? ILE E 75 ? ASP E 70 ILE E 75 AB2 4 PHE E 62 ? GLY E 64 ? PHE E 62 GLY E 64 AB3 1 SER E 53 ? LEU E 54 ? SER E 53 LEU E 54 AB3 2 ARG E 45 ? SER E 49 ? ARG E 45 SER E 49 AB3 3 LEU E 33 ? GLN E 38 ? LEU E 33 GLN E 38 AB3 4 THR E 85 ? GLN E 90 ? THR E 85 GLN E 90 AB3 5 THR E 102 ? LYS E 103 ? THR E 102 LYS E 103 AB4 1 GLU F 6 ? SER F 7 ? GLU F 6 SER F 7 AB4 2 SER F 17 ? THR F 23 ? SER F 17 THR F 23 AB4 3 GLN F 78 ? ARG F 84 ? GLN F 78 ARG F 84 AB4 4 ILE F 68 ? ASP F 73 ? ILE F 68 ASP F 73 AB5 1 LEU F 11 ? VAL F 12 ? LEU F 11 VAL F 12 AB5 2 THR F 116 ? VAL F 117 ? THR F 116 VAL F 117 AB6 1 THR F 58 ? TYR F 60 ? THR F 58 TYR F 60 AB6 2 LEU F 46 ? ILE F 52 ? LEU F 46 ILE F 52 AB6 3 ALA F 34 ? GLN F 40 ? ALA F 34 GLN F 40 AB6 4 THR F 93 ? PHE F 99 ? THR F 93 PHE F 99 AB6 5 LEU F 106 ? TRP F 109 ? LEU F 106 TRP F 109 AB7 1 THR F 58 ? TYR F 60 ? THR F 58 TYR F 60 AB7 2 LEU F 46 ? ILE F 52 ? LEU F 46 ILE F 52 AB7 3 ALA F 34 ? GLN F 40 ? ALA F 34 GLN F 40 AB7 4 THR F 93 ? PHE F 99 ? THR F 93 PHE F 99 AB7 5 THR F 113 ? SER F 114 ? THR F 113 SER F 114 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O MET A 71 ? O MET A 71 N LEU A 37 ? N LEU A 37 AA1 2 3 N SER A 38 ? N SER A 38 O LEU A 107 ? O LEU A 107 AA1 3 4 N ILE A 108 ? N ILE A 108 O ALA A 111 ? O ALA A 111 AA2 1 2 N GLY A 122 ? N GLY A 122 O PHE A 208 ? O PHE A 208 AA2 2 3 N LEU A 209 ? N LEU A 209 O ILE A 239 ? O ILE A 239 AA2 3 4 O ILE A 238 ? O ILE A 238 N ASN A 76 ? N ASN A 76 AA2 4 5 N LEU A 79 ? N LEU A 79 O LEU A 259 ? O LEU A 259 AA2 5 6 N LEU A 256 ? N LEU A 256 O GLY A 268 ? O GLY A 268 AA3 1 2 O MET B 71 ? O MET B 71 N LEU B 37 ? N LEU B 37 AA3 2 3 N SER B 38 ? N SER B 38 O LEU B 107 ? O LEU B 107 AA3 3 4 N ILE B 108 ? N ILE B 108 O ALA B 111 ? O ALA B 111 AA4 1 2 N GLY B 122 ? N GLY B 122 O PHE B 208 ? O PHE B 208 AA4 2 3 N LEU B 209 ? N LEU B 209 O ILE B 239 ? O ILE B 239 AA4 3 4 O ILE B 238 ? O ILE B 238 N ASN B 76 ? N ASN B 76 AA4 4 5 N LEU B 79 ? N LEU B 79 O LEU B 259 ? O LEU B 259 AA4 5 6 N LEU B 256 ? N LEU B 256 O GLY B 268 ? O GLY B 268 AA5 1 2 N THR C 5 ? N THR C 5 O LYS C 24 ? O LYS C 24 AA5 2 3 N ILE C 21 ? N ILE C 21 O LEU C 73 ? O LEU C 73 AA5 3 4 O SER C 74 ? O SER C 74 N SER C 63 ? N SER C 63 AA6 1 2 O SER C 53 ? O SER C 53 N SER C 49 ? N SER C 49 AA6 2 3 O LEU C 47 ? O LEU C 47 N TRP C 35 ? N TRP C 35 AA6 3 4 N GLN C 38 ? N GLN C 38 O THR C 85 ? O THR C 85 AA6 4 5 N TYR C 86 ? N TYR C 86 O THR C 102 ? O THR C 102 AA7 1 2 N SER D 7 ? N SER D 7 O THR D 21 ? O THR D 21 AA7 2 3 N LEU D 18 ? N LEU D 18 O LEU D 83 ? O LEU D 83 AA7 3 4 O PHE D 80 ? O PHE D 80 N THR D 71 ? N THR D 71 AA8 1 2 N VAL D 12 ? N VAL D 12 O THR D 116 ? O THR D 116 AA9 1 2 O THR D 59 ? O THR D 59 N TYR D 51 ? N TYR D 51 AA9 2 3 O ILE D 52 ? O ILE D 52 N TRP D 35 ? N TRP D 35 AA9 3 4 N ILE D 38 ? N ILE D 38 O TYR D 95 ? O TYR D 95 AA9 4 5 N THR D 98 ? N THR D 98 O TYR D 108 ? O TYR D 108 AB1 1 2 O THR D 59 ? O THR D 59 N TYR D 51 ? N TYR D 51 AB1 2 3 O ILE D 52 ? O ILE D 52 N TRP D 35 ? N TRP D 35 AB1 3 4 N ILE D 38 ? N ILE D 38 O TYR D 95 ? O TYR D 95 AB1 4 5 N TYR D 94 ? N TYR D 94 O THR D 113 ? O THR D 113 AB2 1 2 N THR E 5 ? N THR E 5 O LYS E 24 ? O LYS E 24 AB2 2 3 N ILE E 21 ? N ILE E 21 O LEU E 73 ? O LEU E 73 AB2 3 4 O SER E 74 ? O SER E 74 N SER E 63 ? N SER E 63 AB3 1 2 O SER E 53 ? O SER E 53 N SER E 49 ? N SER E 49 AB3 2 3 O LEU E 47 ? O LEU E 47 N TRP E 35 ? N TRP E 35 AB3 3 4 N GLN E 38 ? N GLN E 38 O THR E 85 ? O THR E 85 AB3 4 5 N TYR E 86 ? N TYR E 86 O THR E 102 ? O THR E 102 AB4 1 2 N SER F 7 ? N SER F 7 O THR F 21 ? O THR F 21 AB4 2 3 N LEU F 18 ? N LEU F 18 O LEU F 83 ? O LEU F 83 AB4 3 4 O PHE F 80 ? O PHE F 80 N THR F 71 ? N THR F 71 AB5 1 2 N VAL F 12 ? N VAL F 12 O THR F 116 ? O THR F 116 AB6 1 2 O THR F 59 ? O THR F 59 N TYR F 51 ? N TYR F 51 AB6 2 3 O ILE F 52 ? O ILE F 52 N TRP F 35 ? N TRP F 35 AB6 3 4 N ILE F 38 ? N ILE F 38 O TYR F 95 ? O TYR F 95 AB6 4 5 N THR F 98 ? N THR F 98 O TYR F 108 ? O TYR F 108 AB7 1 2 O THR F 59 ? O THR F 59 N TYR F 51 ? N TYR F 51 AB7 2 3 O ILE F 52 ? O ILE F 52 N TRP F 35 ? N TRP F 35 AB7 3 4 N ILE F 38 ? N ILE F 38 O TYR F 95 ? O TYR F 95 AB7 4 5 N TYR F 94 ? N TYR F 94 O THR F 113 ? O THR F 113 # _atom_sites.entry_id 6ETI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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RELION ? 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.4 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Swiss National Science Foundation, National Centre of Competence in Research (NCCR) TransCure' Switzerland ? 1 'Swiss Federal Institute of Technology Zurich (ETH Zurich)' Switzerland ETH-22-14-1 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero G 4 NAG 1 G NAG 1 A NAG 1001 n G 4 NAG 2 G NAG 2 A NAG 1002 n H 4 NAG 1 H NAG 1 B NAG 1001 n H 4 NAG 2 H NAG 2 B NAG 1002 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id BWQ _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id BWQ _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name ;~{tert}-butyl 3-[(2~{S},5~{S},8~{S})-14-cyclopentyloxy-2-(2-methylpropyl)-4,7-bis(oxidanylidene)-3,6,17-triazatetracyclo[8.7.0.0^{3,8}.0^{11,16}]heptadeca-1(10),11,13,15-tetraen-5-yl]propanoate ; _pdbx_entity_nonpoly.comp_id BWQ # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ? 2 1 microscopy ? #