data_6GSM # _entry.id 6GSM # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.366 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 6GSM pdb_00006gsm 10.2210/pdb6gsm/pdb WWPDB D_1200010401 ? ? EMDB EMD-0057 ? ? # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id SPRSDE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2019-07-31 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 6GSM _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 3JAQ _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-3048 'other EM volume' EMDB 'Almost the same complex, at lower resolution' EMD-3049 'other EM volume' PDB . 3JAP unspecified PDB 'Previous pdb model associated to the 3049 map.Replaced by this newer model.' 3JAQ unspecified EMDB 'Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in open conformation' EMD-0057 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6GSM _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-06-14 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Llacer, J.L.' 1 0000-0001-5304-1795 'Hussain, T.' 2 ? 'Gordiyenko, Y.' 3 ? 'Ramakrishnan, V.' 4 ? # loop_ _citation.abstract _citation.abstract_id_CAS _citation.book_id_ISBN _citation.book_publisher _citation.book_publisher_city _citation.book_title _citation.coordinate_linkage _citation.country _citation.database_id_Medline _citation.details _citation.id _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ASTM _citation.journal_id_CSD _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_full _citation.journal_issue _citation.journal_volume _citation.language _citation.page_first _citation.page_last _citation.title _citation.year _citation.database_id_CSD _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_patent _citation.unpublished_flag ? ? ? ? ? ? ? UK ? ? primary 'Nucleic Acids Res.' NARHAD 0389 1362-4962 ? ? ? ? ? ? 'Large-scale movement of eIF3 domains during translation initiation modulate start codon selection.' 2021 ? 10.1093/nar/gkab908 34648019 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 'Mol. Cell' MOCEFL 2168 1097-4164 ? ? 59 ? 399 412 'Conformational Differences between Open and Closed States of the Eukaryotic Translation Initiation Complex.' 2015 ? 10.1016/j.molcel.2015.06.033. 26212456 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Llacer, J.L.' 1 0000-0001-5304-1795 primary 'Hussain, T.' 2 0000-0003-4735-2380 primary 'Dong, J.' 3 ? primary 'Villamayor, L.' 4 ? primary 'Gordiyenko, Y.' 5 ? primary 'Hinnebusch, A.G.' 6 0000-0002-1627-8395 1 'Llacer, J.L.' 7 ? 1 'Hussain, T.' 8 ? 1 'Marler, L.' 9 ? 1 'Aitken, C.E.' 10 ? 1 'Thakur, A.' 11 ? 1 'Lorsch, J.R.' 12 ? 1 'Hinnebusch, A.G.' 13 ? 1 'Ramakrishnan, V.' 14 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6GSM _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 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GAUCGGGUGGUGUUUUUCUUAUGACCCACUCGGCACCUUACGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUC GCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGG AAACUCACCAGGUCCAGACACAAUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUUGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCG UUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUACUAAAUAGGGUUGCUGGCAC UUGCCGGUUGACUCUUCUUAGAGGGACUAUCGGUUUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCU UAGACGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACGGAGCCAGCGAGUACAACCUUGGCCGAGAGGUCUGGGUAAUCUUGU GAAACUCCGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGUAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGC UUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAGUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGGCCUCAGGAU UUGCUUAGAGAAGGGGGCAACUCCAUCUCAGAGCGAAGAAUCUGGUCAAACUUGGUCAUUUAGAGGAACUAAAAGUCGUA ACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA ; ;UAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAUUUAUACA GUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUCGUUUAUUUGAUAGUUCCUUUACUACAUGGAUAUCUGUGGUAAUUCU AGAGCUAAUACAUGCUUAAAAUCUCGACCCUUUGGAAGAGAUGUAUUUAUUAGAUAAAAAAUCAAUGUCUUCGGACUCCU UGAUGAUUCAUAAUAACUUUUCGAAUCGCAUGGCCUUGUGCUGGCGAUGGUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUC GAUGGUAGGAUAGUGGCCUACCAUGGUUUCAACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAA CGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUAAUUCAGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACGA UACAGGGCCCAUUCGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUGUAAAUACCUUAACGAGGAACAACUGGAGGGCAAGUCUG GUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAACUUUG GGUCUGGUUGUCCGGUCCGACUUUAUGUCGCGCACUGGUUUUCAACCGGAUCUUUCCUUCUGGCUAACCUGUACUCCUUG UGGGUGCAGGCGAACCAGGACUUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGAAAGCUCGAAUAUAUUAGCAUG GAAUAAUGGAAUAGGACGUUUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCAUCGUAAUGAUUAAUAGGGACGGUCGGGGGCA UCAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGACGUUUU CAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGAUGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGG GAUCGGGUGGUGUUUUUCUUAUGACCCACUCGGCACCUUACGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUC 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;SLPSTFDLTSEDAQLLLAARVHLGAKNVQVHQEPYVYKARPDGVNVINVGKTWEKIVLAARIIAAIPNPEDVVAISSRTY GQRAVLKYAAHTGATPIAGRFTPGSFTNYITRSFKEPRLVIVTDPRSDAQAIKESSYVNIPVIALTDLDSPSEYVDVAIP CNNRGKHSIGLIWYLLAREVLRLRGALPDRTQPWAIMPDLYFYRNPEE ; A ? 4 polyribonucleotide no no AAU AAU 3 ? 5 'polypeptide(L)' no no ;VGKNKRLSKGKKGLKKRVVDPFTRKEWYDIKAPSTFENRNVGKTLVNKSVGLKNASDSLKGRVVEVCLADLQGSEDHSFR KVKLRVDEVQGKNLLTNFHGMDFTTDKLRSMVRKWQTLIEANVTVKTSDDYVLRIFAIAFTRKQANQVKRTSYAQSSHIR QIRKVISEILTREVQNSTLAQLTSKLIPEVINKEIENATKDIFPLQNVHIRKVKLLKQPKFDLGSLLSLHG ; ;VGKNKRLSKGKKGLKKRVVDPFTRKEWYDIKAPSTFENRNVGKTLVNKSVGLKNASDSLKGRVVEVCLADLQGSEDHSFR KVKLRVDEVQGKNLLTNFHGMDFTTDKLRSMVRKWQTLIEANVTVKTSDDYVLRIFAIAFTRKQANQVKRTSYAQSSHIR QIRKVISEILTREVQNSTLAQLTSKLIPEVINKEIENATKDIFPLQNVHIRKVKLLKQPKFDLGSLLSLHG ; B ? 6 'polypeptide(L)' no no ;GWVPVTKLGRLVKAGKISSIEEIFLHSLPVKEFQIIDQLLPNLKDEVMNIKPVQKQTRAGQRTRFKAVVVVGDSNGHVGL GIKTAKEVAGAIRAGIIIAKLSVIPIRRGYWGTNLGQPHSLATKTSGKCGSVSVRLIPAPRGSGIVASPAVKKLMQLAGV 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HSCYRPRRNGERKRKSVRGAIVGPDLAVLALIITKKGEQEIEGITNDTVPKRLGPKRANNIRKFFGLTKEDDVRDYVIRR EVTKGDKSYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRQQKSLKIKNAQAQREAAAEYAQLLAKRLSERKAEKAEV ; ;MKLNISYPINGTQKCIEIDDEHRVRVFYDKRIGQEVDGESVGDEFKGYVFKIAGGNDKQGFPMKQGVLLPTRVKLLLAKG HSCYRPRRNGERKRKSVRGAIVGPDLAVLALIITKKGEQEIEGITNDTVPKRLGPKRANNIRKFFGLTKEDDVRDYVIRR EVTKGDKSYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRQQKSLKIKNAQAQREAAAEYAQLLAKRLSERKAEKAEV ; G ? 11 'polypeptide(L)' no no ;PQAKILSQAPTELELQVAQAFIDLENNSPELKADLRALQFKSIREIEVAGGKKALAVFVPVPSLAAYHKVQIKLTRELEK KFQDRHVIFLAERRILPKPSRKSRQTQKRPRSRTLTAVHDKILEDLVFPTEIVGKRVRYLVGGNKIQKILLNSKDVQHID NKLESFQAVYNKLTGKQIVFEIPS ; ;PQAKILSQAPTELELQVAQAFIDLENNSPELKADLRALQFKSIREIEVAGGKKALAVFVPVPSLAAYHKVQIKLTRELEK KFQDRHVIFLAERRILPKPSRKSRQTQKRPRSRTLTAVHDKILEDLVFPTEIVGKRVRYLVGGNKIQKILLNSKDVQHID NKLESFQAVYNKLTGKQIVFEIPS ; H ? 12 'polypeptide(L)' no no ;GISRDSRHKRAATGAKRAQFRKKRKFELGRQAANTKIGTKRIHPVRTRGGNQKFRALRIETGNFSWASEGVARKTRITGV VYHPSNNELVRTNTLTKAAIVQIDATPFRQWYESHYGQSLGKKKNTKAEEETATTSKNTERKWAARAAEAKIEHAVDSQF GAGRLYAAISSRPGQSGRCDGYILEGEELAFYLRRLTAKK ; ;GISRDSRHKRAATGAKRAQFRKKRKFELGRQAANTKIGTKRIHPVRTRGGNQKFRALRIETGNFSWASEGVARKTRITGV VYHPSNNELVRTNTLTKAAIVQIDATPFRQWYESHYGQSLGKKKNTKAEEETATTSKNTERKWAARAAEAKIEHAVDSQF GAGRLYAAISSRPGQSGRCDGYILEGEELAFYLRRLTAKK ; I ? 13 'polypeptide(L)' no no ;PRAPRTYSKTYSTPKRPYESARLDAELKLAGEYGLKNKREIYRISFQLSKIRRAARDLLTRDEKDPKRLFEGNALIRRLV RIGVLSEDKKKLDYVLALKVEDFLERRLQTQVYKLGLAKSVHHARVLISQRHIAVGKQIVNIPSFMVRLESEKHIDFART SPFGGARPGRVARKRAAAAGGE ; ;PRAPRTYSKTYSTPKRPYESARLDAELKLAGEYGLKNKREIYRISFQLSKIRRAARDLLTRDEKDPKRLFEGNALIRRLV RIGVLSEDKKKLDYVLALKVEDFLERRLQTQVYKLGLAKSVHHARVLISQRHIAVGKQIVNIPSFMVRLESEKHIDFART SPFGGARPGRVARKRAAAAGGE ; J ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MLIPKEDRKKIYQHLFQEGVLVAKKDFNQPKHEEIDTKNLFVIKALQSLTSKGFVKTQFSWQYYYYTLTEEGVVYLREYL NLPEHIFPATYLAGQS ; ;MLIPKEDRKKIYQHLFQEGVLVAKKDFNQPKHEEIDTKNLFVIKALQSLTSKGFVKTQFSWQYYYYTLTEEGVVYLREYL NLPEHIFPATYLAGQS ; K ? 15 'polypeptide(L)' no no ;STELTVQSERAFQKQPHIFTNPKAKANRKTKRWYKNVGLGFKTPKTAIEGSYIDKKCPFTGLVSIRGKILTGTVVSTRMH RTIVIRRDYLHYVPKYNRYEKRHKNVPAHVSPAFRVQVGDIVTVGQCRPISKTVRFNVLKVASATGKANKQFAKF ; ;STELTVQSERAFQKQPHIFTNPKAKANRKTKRWYKNVGLGFKTPKTAIEGSYIDKKCPFTGLVSIRGKILTGTVVSTRMH RTIVIRRDYLHYVPKYNRYEKRHKNVPAHVSPAFRVQVGDIVTVGQCRPISKTVRFNVLKVASATGKANKQFAKF ; L ? 16 'polypeptide(L)' no no ;IEDALKVVLRTSLVHDGLARGLRESAKALTRGEGQLAVLVESVTEEAISKLVQGLATENNVPLIKVADAKQLGEWAGLGK IDRDGNARKVVGASVVVVKNWGADTQEREILLEHFSQQ ; ;IEDALKVVLRTSLVHDGLARGLRESAKALTRGEGQLAVLVESVTEEAISKLVQGLATENNVPLIKVADAKQLGEWAGLGK IDRDGNARKVVGASVVVVKNWGADTQEREILLEHFSQQ ; M ? 17 'polypeptide(L)' no no ;GRMHSKGKGMSSSAIPYSRNAPAWFKGSSDGVVEQIIKYARKGLTPSQIGVLLRDAHGVTQAKVITGNKILRILKSNGLA PEIPEDLYFLIKKAVSVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYRTVSVLPPNWKYESATASALVN ; ;GRMHSKGKGMSSSAIPYSRNAPAWFKGSSDGVVEQIIKYARKGLTPSQIGVLLRDAHGVTQAKVITGNKILRILKSNGLA PEIPEDLYFLIKKAVSVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYRTVSVLPPNWKYESATASALVN ; N ? 18 'polypeptide(L)' no no ;SQVFGVARIFASFNDTFVHVTDLSGRETIARVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAAKCKEVGITAVHIKIRATGGTR SKTPGPGGQAALRALARSGLRIGRIEDVTPVPSDSTRKKGGRRGRRL ; ;SQVFGVARIFASFNDTFVHVTDLSGRETIARVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAAKCKEVGITAVHIKIRATGGTR SKTPGPGGQAALRALARSGLRIGRIEDVTPVPSDSTRKKGGRRGRRL ; O ? 19 'polypeptide(L)' no no ;KTYSYKGVDLEKLLEMPTEDFVKLAPARVRRKFARGLSEKPAGLMKKLRAAKLSAPENEKPAVVRTHLRNMIIVPEMIGS VVGVYNGKVFNQVEIRPEMVGHYLGEFSITYTPVRHGRA ; ;KTYSYKGVDLEKLLEMPTEDFVKLAPARVRRKFARGLSEKPAGLMKKLRAAKLSAPENEKPAVVRTHLRNMIIVPEMIGS VVGVYNGKVFNQVEIRPEMVGHYLGEFSITYTPVRHGRA ; P ? 20 'polypeptide(L)' no no ;TVPSVQTFGKKKSATAVAHVKAGKGLIKVNGSPITLVQPEILRFKVYEPLLLVGLDKFANIDIRVKVTGGGHVSQVYAIR QAIAKGLVAYHQKFVDEQSKNELKKAFTSYDRTLLIADSRRPEPKKFGGRGARSRFQKSYR ; ;TVPSVQTFGKKKSATAVAHVKAGKGLIKVNGSPITLVQPEILRFKVYEPLLLVGLDKFANIDIRVKVTGGGHVSQVYAIR QAIAKGLVAYHQKFVDEQSKNELKKAFTSYDRTLLIADSRRPEPKKFGGRGARSRFQKSYR ; Q ? 21 'polypeptide(L)' no no ;GRVRTKTVKRASKALIEKYYPKLTMDFQTNKRLCDEIATIQSKRLRNKIAGYTTHLMKRIQKGPVRGISFKLQEEERERK DQYVPDVSALDLSHSNDVLNVDTQTAELVNSLGLKLPLSVSSVSA ; ;GRVRTKTVKRASKALIEKYYPKLTMDFQTNKRLCDEIATIQSKRLRNKIAGYTTHLMKRIQKGPVRGISFKLQEEERERK DQYVPDVSALDLSHSNDVLNVDTQTAELVNSLGLKLPLSVSSVSA ; R ? 22 'polypeptide(L)' no no ;SLVVQEQGSFQHILRLLNTNVDGNINVVYALTTIRGVGRRYANLVCKKADVDLHKRAGELTQEELERIVQIMQNPTHYKI PAWFLNRQKDVNDGKDYHSLANNLESKLRDDLERLKKIRSHRGIRHFWGLRVRGQHTKTTGRRRA ; ;SLVVQEQGSFQHILRLLNTNVDGNINVVYALTTIRGVGRRYANLVCKKADVDLHKRAGELTQEELERIVQIMQNPTHYKI PAWFLNRQKDVNDGKDYHSLANNLESKLRDDLERLKKIRSHRGIRHFWGLRVRGQHTKTTGRRRA ; S ? 23 'polypeptide(L)' no no ;PGVSVRDVPAQDFINNYASFLQRQGKLEVPGYVDIVKTSAGNELPPQDSEGWFYKRAASVARHIYLRKQVGVGKLNKLYG GAKNRGVRPHKHVDASGSINRKVLQSLEKLGVVEISPKGGRRISDNGLRDLDRIAAATLEDEE ; ;PGVSVRDVPAQDFINNYASFLQRQGKLEVPGYVDIVKTSAGNELPPQDSEGWFYKRAASVARHIYLRKQVGVGKLNKLYG GAKNRGVRPHKHVDASGSINRKVLQSLEKLGVVEISPKGGRRISDNGLRDLDRIAAATLEDEE ; T ? 24 'polypeptide(L)' no no ;QEVVIHKIRINLTSTKVKQLENVSANIIKNAETFKLVKKGPVRLPTKVLKISTRKTPNGEGSKTWDTYEMRIHKRYIDLE APAHIVKRITQITIEPGVDVEVIIAA ; ;QEVVIHKIRINLTSTKVKQLENVSANIIKNAETFKLVKKGPVRLPTKVLKISTRKTPNGEGSKTWDTYEMRIHKRYIDLE APAHIVKRITQITIEPGVDVEVIIAA ; U ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MENDKGQLVELYVPRKCSATNRIIKAKDHSSVQINIAQVDEEGRAIPGEYVTYALSGYIRARGEADDSLNRLAQQDGLLK NVWSYSR ; ;MENDKGQLVELYVPRKCSATNRIIKAKDHSSVQINIAQVDEEGRAIPGEYVTYALSGYIRARGEADDSLNRLAQQDGLLK NVWSYSR ; V ? 26 'polypeptide(L)' no no ;TRTSVLADALNAINNAEKTGKRQVLIRPSSKVIIKFLQVMQKHGYIGEFEYIDDHRSGKIVVQLNGRLNKCGVISPRFNV KIADVEKWTANLLPARQFGYVILTTSAGIMDHEEAHRKHVSGKILGFVY ; ;TRTSVLADALNAINNAEKTGKRQVLIRPSSKVIIKFLQVMQKHGYIGEFEYIDDHRSGKIVVQLNGRLNKCGVISPRFNV KIADVEKWTANLLPARQFGYVILTTSAGIMDHEEAHRKHVSGKILGFVY ; W ? 27 'polypeptide(L)' no no ;GKGKPRGLNSARKLRVHRRNNRWAETTYKKRLLGTAFKSSPFGGSSHAKGIVLEKIGIESKQPNSAIRKCVRVQLIKNGK KVTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGRKGKAKGDIPGVRFKVVKVSGVSLLALWKEKKEKPRS ; ;GKGKPRGLNSARKLRVHRRNNRWAETTYKKRLLGTAFKSSPFGGSSHAKGIVLEKIGIESKQPNSAIRKCVRVQLIKNGK KVTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGRKGKAKGDIPGVRFKVVKVSGVSLLALWKEKKEKPRS ; X ? 28 'polypeptide(L)' no no ;SDAITIRTRKVISNPLLARKQFVVDVLHPNRANVSKDELREKLAEAYKAEKDAVSVFGFRTQYGGGKSTGFGLVYNSVAD AKKFEPAYRLVRYGLAEKVEKASRQQRKQRKNRGKKIFGTGKSIAKKAARRNAD ; ;SDAITIRTRKVISNPLLARKQFVVDVLHPNRANVSKDELREKLAEAYKAEKDAVSVFGFRTQYGGGKSTGFGLVYNSVAD AKKFEPAYRLVRYGLAEKVEKASRQQRKQRKNRGKKIFGTGKSIAKKAARRNAD ; Y ? 29 'polypeptide(L)' no no AKHAVVLDQDKFDRIMKEAPTYRYVSVSVLVDRFKLGGSLARVALRHLENEGIIKPVSKHSKQAIYTRAT AKHAVVLDQDKFDRIMKEAPTYRYVSVSVLVDRFKLGGSLARVALRHLENEGIIKPVSKHSKQAIYTRAT Z ? 30 'polypeptide(L)' no no ;PKKRASNGRNKKGRGHVKPVRCVNCSRSVPKDKAIKRMAIRNIVEAAAIRDLSEASVYAEYALPKTYNKLHYCISCAIHA RIVRVRSRTDRRIRAPPQ ; ;PKKRASNGRNKKGRGHVKPVRCVNCSRSVPKDKAIKRMAIRNIVEAAAIRDLSEASVYAEYALPKTYNKLHYCISCAIHA RIVRVRSRTDRRIRAPPQ ; a ? 31 'polypeptide(L)' no no ;VLVQDLLHPTAASEARKHKLKTLVQSPRSHFLDVKCPGCLNITTVFSHAQTAVTCESCSTVLCTPTGGKAKLSEGTSFRR K ; ;VLVQDLLHPTAASEARKHKLKTLVQSPRSHFLDVKCPGCLNITTVFSHAQTAVTCESCSTVLCTPTGGKAKLSEGTSFRR K ; b ? 32 'polypeptide(L)' no no PVTLAKVIKVLGRTGSRGGVTQVRVEFLEDTTRTIVRNVKGPVREGDILVLMESEREARRLR PVTLAKVIKVLGRTGSRGGVTQVRVEFLEDTTRTIVRNVKGPVREGDILVLMESEREARRLR c ? 33 'polypeptide(L)' no no ENVWYSHPRKFGKGSRQCRISGSHSGLIRKYGLNIDRQSFREKANDIGFYKYR ENVWYSHPRKFGKGSRQCRISGSHSGLIRKYGLNIDRQSFREKANDIGFYKYR d ? 34 'polypeptide(L)' no no VHGSLARAGKVKSQTPKVEKQEKPKQPKGRAYKRLLYTRRFVNVTLTNGKRKMNPSPS VHGSLARAGKVKSQTPKVEKQEKPKQPKGRAYKRLLYTRRFVNVTLTNGKRKMNPSPS e ? 35 'polypeptide(L)' no no KKVYTTPKKIRHKHKKVKLAVLNYYKVDDEGKVAKLRKECPNCGPGIFLANHGDRFYCGKCHSTFATQK KKVYTTPKKIRHKHKKVKLAVLNYYKVDDEGKVAKLRKECPNCGPGIFLANHGDRFYCGKCHSTFATQK f ? 36 'polypeptide(L)' no no ;SSNIMLVLRGTLEGHNGWVTSLSTSAAQPNLLVSGSRDKTLISWRLTENEQQFGVPVRSYKGHSHIVQDVVVSADGNYAV SASWDKTLRLWNLATGNSEARFVGHTGDVLSVAIDANSSKIISASRDKTIRVWNTVGDCAYVLLGHTDWVTKVRVAPKNL EDGEVDDGRITFVSAGMDKIVRSWSLNEDSYRIEADFIGHNNYINVVQPSPDGSLAASAGKDGQIYVWNLKHKSAFMNFD AKDEVFALAFSPSRFWLTAATASGIKIYDLENEVLIDELKPEFAGYTKAQDPHAVSLAWSADGQTLFAGYTDNVIRVWQV MTAN ; ;SSNIMLVLRGTLEGHNGWVTSLSTSAAQPNLLVSGSRDKTLISWRLTENEQQFGVPVRSYKGHSHIVQDVVVSADGNYAV 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IDLSKRRVSSEDIIKCEEKYQKSKTVHSILRYCAEKFQIPLEELYKTIAWPLSRKFGHAYEAFKLSIIDETVWEGIEPPS KDVLDELKNYISKRLTPQAVKIRADVEVSCFSYEGIDAIKDALKSAEDMSTEQMQVKVKLVAAPLYVLTTQALDKQKGIE QLESAIEKITEVITKYGGVCNIT ; j ? 40 'polypeptide(L)' no no ;LSAEIINRQATINIGTIGHVAHGKSTVVRAISGVQTVRFKDELERNITIKLGYANAKIYKCQEPTCPEPDCYRSFKSDKE ISPKCQRPGCPGRYKLVRHVSFVDCPGHDILMSTMLSGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHVIILQN KVDLMREESALEHQKSILKFIRGTIADGAPIVPISAQLKYNIDAVNEFIVKTIPVPPRDFMISPRLIVIRSFDVNKPGAE IEDLKGGVAGGSILNGVFKLGDEIEIRPGIVTKDDKGKIQCKPIFSNIVSLFAEQNDLKFAVPGGLIGVGTKVDPTLCRA DRLVGQVVGAKGHLPNIYTDIEINYFLLRRLLGVKTDGQKQAKVRKLEPNEVLMVNIGSTATGARVVAVKADMARLQLTS PACTEINEKIALSRRIEKHWRLIGWATIKK ; ;LSAEIINRQATINIGTIGHVAHGKSTVVRAISGVQTVRFKDELERNITIKLGYANAKIYKCQEPTCPEPDCYRSFKSDKE ISPKCQRPGCPGRYKLVRHVSFVDCPGHDILMSTMLSGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHVIILQN KVDLMREESALEHQKSILKFIRGTIADGAPIVPISAQLKYNIDAVNEFIVKTIPVPPRDFMISPRLIVIRSFDVNKPGAE IEDLKGGVAGGSILNGVFKLGDEIEIRPGIVTKDDKGKIQCKPIFSNIVSLFAEQNDLKFAVPGGLIGVGTKVDPTLCRA 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37 MRAKWRKKRTRRLKRKRRKVRARSK 1 38 UNP IF1A_YEAST P38912 ? 38 ;GPKRELIYKEEGQEYAQITKMLGNGRVEASCFDGNKRMAHIRGKLRKKVWMGQGDIILVSLRDFQDDQCDVVHKYNLDEA RTLKNQGELPENAKI ; 21 39 UNP IF2A_YEAST P20459 ? 39 ;TSHCRFYENKYPEIDDIVMVNVQQIAEMGAYVKLLEYDNIEGMILLSELSRRRIRSIQKLIRVGKNDVAVVLRVDKEKGY IDLSKRRVSSEDIIKCEEKYQKSKTVHSILRYCAEKFQIPLEELYKTIAWPLSRKFGHAYEAFKLSIIDETVWEGIEPPS KDVLDELKNYISKRLTPQAVKIRADVEVSCFSYEGIDAIKDALKSAEDMSTEQMQVKVKLVAAPLYVLTTQALDKQKGIE QLESAIEKITEVITKYGGVCNIT ; 3 40 UNP IF2G_YEAST P32481 ? 40 ;LSAEIINRQATINIGTIGHVAHGKSTVVRAISGVQTVRFKDELERNITIKLGYANAKIYKCQEPTCPEPDCYRSFKSDKE ISPKCQRPGCPGRYKLVRHVSFVDCPGHDILMSTMLSGAAVMDAALLLIAGNESCPQPQTSEHLAAIEIMKLKHVIILQN KVDLMREESALEHQKSILKFIRGTIADGAPIVPISAQLKYNIDAVNEFIVKTIPVPPRDFMISPRLIVIRSFDVNKPGAE IEDLKGGVAGGSILNGVFKLGDEIEIRPGIVTKDDKGKIQCKPIFSNIVSLFAEQNDLKFAVPGGLIGVGTKVDPTLCRA DRLVGQVVGAKGHLPNIYTDIEINYFLLRRLLGVKTDGQKQAKVRKLEPNEVLMVNIGSTATGARVVAVKADMARLQLTS PACTEINEKIALSRRIEKHWRLIGWATIKK ; 90 41 UNP IF2B_YEAST P09064 ? 41 ;VGLPYSELLSRFFNILRTNNPELAGDRSGPKFRIPPPVCLRDGKKTIFSNIQDIAEKLHRSPEHLIQYLFAELGTSGSVD GQKRLVIKGKFQSKQMENVLRRYILEYVTCKTCKSINTELKREQSNRLFFMVCKSCGSTRSVSS ; 127 42 UNP SUI1_YEAST P32911 ? 42 ;ADTGDDETATSNYIHIRIQQRNGRKTLTTVQGVPEEYDLKRILKVLKKDFACNGNIVKDPEMGEIIQLQGDQRAKVCEFM ISQLGLQKKNIKIHGF ; 13 43 UNP EIF3A_YEAST P38249 ? 43 ;PFRPENAIKRADELISVGEKQAALQSLHDFITARRIRWATPSTVEPVVFKFLEIGVELKKGKLLKDGLHQYKKLIQGSTE GLVSVGAVARKFIDLVESKIASEQTRADELQKQEIDDDLEGGVTPENLLISVYESDQSVAGFNDEAITSWLRFTWESYRA VLDLLRNNALLEITYSGVVKKTMHFCLKYQRKNEFKRLAEMLRQHLDAANYQQSKSGNNLVDLSDADTLQRYLDQRFQQV DVSVKLELWHEAYRSIEDVFHLMKISKRAPKPSTLANYYENLVKVFFVSGDPLLHTTAWKKFYKLYSTNPRATEEEFKTY SSTIFLSAISTQLDEIPSIGYDPHLRMYRLLNLDAKPTRKEMLQSIIEDESIYGKVDEELKELYDIIEVNFDVDTVKQQL ENLLVKLSSKTYFSQYIAPLRDVIMRRVFVAASQKFTTVSQSELYKLATLPAPLDLSAWDIEKSLLQAAVEDYVSITIDH ESAKVTFA ; 5 44 PDB 6GSM 6GSM ? 43 ? 489 45 UNP EIF3B_YEAST P06103 ? 44 ;QYIVVNGAPVIPSAKVPVLKKALTSLFSKAGKVVNMEFPIDEATGKTKGFLFVECGSMNDAKKIIKSFHGKRLDLKHRLF LYTMKDVERYNSDDFDTEFREPDMPTFVPSSSLKSWLMDDKVRDQFVLQDDVKTSVFWNSMFNEEDSLVESRENWSTNYV RFSPKGTYLFSYHQQGVTAWGGPNFDRLRRFYHPDVRNSSVSPNEKYLVTFSTEPIIVEEDNEFSPFTKKNEGHQLCIWD IASGLLMATFPVIKSPYLKWPLVRWSYNDKYCARMVGDSLIVHDATKNFMPLEAKALKPSGIRDFSFAPEGVKLQPFRNG DEPSVLLAYWTPETNNSACTATIAEVPRGRVLKTVNLVQVSNVTLHWQNQAEFLCFNVERHTKSGKTQFSNLQICRLTER DIPVEKVELKDSVFEFGWEPHGNRFVTISVHEVADMNYAIPANTIRFYAPETKEKTDVIKRWSLVKEIPKTFANTVSWSP AGRFVVVGALVGPNMRRSDLQFYDMDYPGEKNINDNNDVSASLKDVAHPTYSAATNITWDPSGRYVTAWSSSLKHKVEHG YKIFNIAGNLVKEDIIAGFKNFAWRPRPASILSNAERKKVRKNLREWSAQFEEQDAMEADTAMRDLILHQRELLKQWTEY REKIGQEMEKSMNFKIFDVQP ; 77 46 UNP EIF3C_YEAST P32497 ? 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47 SVAERKNWHKYGSEKGSPAGPSAVTARLGEEVELRLSRNWKQAEEERIQ 48 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6GSM 1 1 ? 76 ? 6GSM 1 ? 77 ? 1 77 2 2 6GSM 2 1 ? 1798 ? 6GSM 1 ? 1798 ? 1 1798 3 3 6GSM A 1 ? 208 ? 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UNP P32497 VAL 250 deletion ? 44 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 1MA 'RNA linking' n "6-HYDRO-1-METHYLADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H16 N5 O7 P' 361.248 1MG 'RNA linking' n "1N-METHYLGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H16 N5 O8 P' 377.247 2MG 'RNA linking' n "2N-METHYLGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H16 N5 O8 P' 377.247 5MC 'RNA linking' n "5-METHYLCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N3 O8 P' 337.223 7MG 'RNA linking' n "7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H18 N5 O8 P' 379.263 7NO non-polymer . ;[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] (2~{S})-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoate ; ? 'C15 H23 N6 O8 P S' 478.417 A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 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VAL o 409 SER o 413 5 ? 5 HELX_P HELX_P187 AU7 ARG QA 426 ? ALA QA 431 ? ARG o 430 ALA o 435 1 ? 6 HELX_P HELX_P188 AU8 ALA QA 432 ? GLN QA 434 ? ALA o 436 GLN o 438 5 ? 3 HELX_P HELX_P189 AU9 SER QA 440 ? TYR QA 445 ? SER o 444 TYR o 449 1 ? 6 HELX_P HELX_P190 AV1 LYS QA 446 ? ALA QA 448 ? LYS o 450 ALA o 452 5 ? 3 HELX_P HELX_P191 AV2 ASP QA 460 ? SER QA 464 ? ASP o 464 SER o 468 5 ? 5 HELX_P HELX_P192 AV3 UNK QA 490 ? UNK QA 567 ? UNK o 694 UNK o 771 1 ? 78 HELX_P HELX_P193 AV4 VAL RA 18 ? LEU RA 23 ? VAL p 94 LEU p 99 1 ? 6 HELX_P HELX_P194 AV5 LEU RA 23 ? SER RA 28 ? LEU p 99 SER p 104 1 ? 6 HELX_P HELX_P195 AV6 SER RA 57 ? LYS RA 62 ? SER p 133 LYS p 138 1 ? 6 HELX_P HELX_P196 AV7 MET RA 84 ? SER RA 92 ? MET p 160 SER p 168 1 ? 9 HELX_P HELX_P197 AV8 LEU RA 113 ? LEU RA 117 ? LEU p 189 LEU p 193 5 ? 5 HELX_P HELX_P198 AV9 ARG RA 594 ? SER RA 605 ? ARG p 673 SER p 684 1 ? 12 HELX_P HELX_P199 AW1 GLU RA 607 ? ARG RA 618 ? 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ASN r 86 GLN r 96 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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B U 9 OP2 ? ? ? 1_555 EB MG . MG ? ? 2 U 9 2 MG 1809 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.980 ? ? metalc3 metalc ? ? B U 37 O4 ? ? ? 1_555 EC MG . MG ? ? 2 U 37 2 MG 1835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? ? metalc4 metalc ? ? B U 44 OP1 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? 2 U 44 2 MG 1819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? ? metalc5 metalc ? ? B A 47 OP1 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? 2 A 47 2 MG 1819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? ? metalc6 metalc ? ? B A 47 OP2 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? 2 A 47 2 MG 1819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.680 ? ? metalc7 metalc ? ? B C 50 OP1 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? 2 C 50 2 MG 1807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? ? metalc8 metalc ? ? B U 64 OP1 ? ? ? 1_555 BC MG . MG ? ? 2 U 64 2 MG 1832 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc9 metalc ? ? B U 64 "O5'" ? ? ? 1_555 BC MG . MG ? ? 2 U 64 2 MG 1832 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? ? metalc10 metalc ? ? B U 98 O4 ? ? ? 1_555 YB MG . MG ? ? 2 U 98 2 MG 1829 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? ? metalc11 metalc ? ? B A 100 "O3'" ? ? ? 1_555 UB MG . MG ? ? 2 A 100 2 MG 1825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? ? metalc12 metalc ? ? B U 101 OP1 ? ? ? 1_555 UB MG . MG ? ? 2 U 101 2 MG 1825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc13 metalc ? ? B U 101 OP2 ? ? ? 1_555 UB MG . MG ? ? 2 U 101 2 MG 1825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? ? metalc14 metalc ? ? B A 212 OP2 ? ? ? 1_555 VC MG . MG ? ? 2 A 212 2 MG 1852 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? ? metalc15 metalc ? ? B A 212 "O5'" ? ? ? 1_555 VC MG . MG ? ? 2 A 212 2 MG 1852 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? ? metalc16 metalc ? ? B C 308 "O4'" ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? 2 C 308 2 MG 1801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? ? metalc17 metalc ? ? B U 331 O2 ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? 2 U 331 2 MG 1853 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.736 ? ? metalc18 metalc ? ? B U 334 OP2 ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? 2 U 334 2 MG 1853 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.846 ? ? metalc19 metalc ? ? B A 352 OP1 ? ? ? 1_555 IC MG . MG ? ? 2 A 352 2 MG 1839 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.660 ? ? metalc20 metalc ? ? B A 359 "O5'" ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? 2 A 359 2 MG 1804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? ? metalc21 metalc ? ? B A 400 OP2 ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? 2 A 400 2 MG 1813 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? ? metalc22 metalc ? ? B C 410 O2 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? 2 C 410 2 MG 1807 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? ? metalc23 metalc ? ? B C 426 OP2 ? ? ? 1_555 NB MG . MG ? ? 2 C 426 2 MG 1818 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? ? metalc24 metalc ? ? B C 426 "O2'" ? ? ? 1_555 DC MG . MG ? ? 2 C 426 2 MG 1834 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? ? metalc25 metalc ? ? B A 436 "O4'" ? ? ? 1_555 KB MG . MG ? ? 2 A 436 2 MG 1815 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? ? metalc26 metalc ? ? B G 458 "O3'" ? ? ? 1_555 DC MG . MG ? ? 2 G 458 2 MG 1834 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? ? metalc27 metalc ? ? B A 555 OP2 ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? 2 A 555 2 MG 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.847 ? ? metalc28 metalc ? ? B A 555 "O5'" ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? 2 A 555 2 MG 1803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? ? metalc29 metalc ? ? B G 561 O6 ? ? ? 1_555 RB MG . MG ? ? 2 G 561 2 MG 1822 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? ? metalc30 metalc ? ? B A 579 OP1 ? ? ? 1_555 RB MG . MG ? ? 2 A 579 2 MG 1822 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? metalc31 metalc ? ? B U 581 "O3'" ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? 2 U 581 2 MG 1838 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? ? metalc32 metalc ? ? B U 581 "O2'" ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? 2 U 581 2 MG 1838 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.000 ? ? metalc33 metalc ? ? B C 582 OP1 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? 2 C 582 2 MG 1838 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? ? metalc34 metalc ? ? B G 606 OP1 ? ? ? 1_555 LB MG . MG ? ? 2 G 606 2 MG 1816 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? ? metalc35 metalc ? ? B G 606 "O5'" ? ? ? 1_555 LB MG . MG ? ? 2 G 606 2 MG 1816 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? ? metalc36 metalc ? ? B A 618 OP1 ? ? ? 1_555 SB MG . MG ? ? 2 A 618 2 MG 1823 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? ? metalc37 metalc ? ? B A 619 OP1 ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? 2 A 619 2 MG 1821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.960 ? ? metalc38 metalc ? ? B A 619 OP2 ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? 2 A 619 2 MG 1821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? ? metalc39 metalc ? ? B A 619 "O5'" ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? 2 A 619 2 MG 1821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.250 ? ? metalc40 metalc ? ? B A 619 "O4'" ? ? ? 1_555 WB MG . MG ? ? 2 A 619 2 MG 1827 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? ? metalc41 metalc ? ? B A 621 OP1 ? ? ? 1_555 TB MG . MG ? ? 2 A 621 2 MG 1824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.979 ? ? metalc42 metalc ? ? B A 621 "O5'" ? ? ? 1_555 TB MG . MG ? ? 2 A 621 2 MG 1824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? ? metalc43 metalc ? ? B A 622 "O2'" ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? 2 A 622 2 MG 1805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? ? metalc44 metalc ? ? B A 622 OP1 ? ? ? 1_555 TB MG . MG ? ? 2 A 622 2 MG 1824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? ? metalc45 metalc ? ? B G 623 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? 2 G 623 2 MG 1805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.966 ? ? metalc46 metalc ? ? B A 760 OP2 ? ? ? 1_555 PC MG . MG ? ? 2 A 760 2 MG 1846 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.968 ? ? metalc47 metalc ? ? B A 760 "O5'" ? ? ? 1_555 PC MG . 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MG ? ? 2 G 1433 2 MG 1871 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? ? metalc75 metalc ? ? B U 1447 O4 ? ? ? 1_555 KD MG . MG ? ? 2 U 1447 2 MG 1867 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? ? metalc76 metalc ? ? B G 1539 OP2 ? ? ? 1_555 QD MG . MG ? ? 2 G 1539 2 MG 1873 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? ? metalc77 metalc ? ? B U 1596 O4 ? ? ? 1_555 TD MG . MG ? ? 2 U 1596 2 MG 1876 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? ? metalc78 metalc ? ? B C 1623 OP1 ? ? ? 1_555 MC MG . MG ? ? 2 C 1623 2 MG 1843 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? ? metalc79 metalc ? ? B A 1629 OP2 ? ? ? 1_555 QC MG . MG ? ? 2 A 1629 2 MG 1847 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? ? metalc80 metalc ? ? B G 1725 O6 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? 2 G 1725 2 MG 1830 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.768 ? ? metalc81 metalc ? ? B U 1726 O4 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? 2 U 1726 2 MG 1830 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? ? metalc82 metalc ? ? B U 1759 O4 ? ? ? 1_555 XC MG . MG ? ? 2 U 1759 2 MG 1854 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? ? metalc83 metalc ? ? B A 1760 OP1 ? ? ? 1_555 PB MG . 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MG ? ? k THR 137 k MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? ? metalc93 metalc ? ? CE MG . MG ? ? ? 1_555 DE GCP . O1G ? ? k MG 601 k GCP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.960 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A A 1 N1 ? ? ? 1_555 A U 71 N3 ? ? 1 A 1 1 U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A A 1 N6 ? ? ? 1_555 A U 71 O4 ? ? 1 A 1 1 U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 70 N3 ? ? 1 G 2 1 C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 70 O2 ? ? 1 G 2 1 C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 70 N4 ? ? 1 G 2 1 C 71 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A C 3 N3 ? ? ? 1_555 A G 69 N1 ? ? 1 C 3 1 G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A C 3 N4 ? ? ? 1_555 A G 69 O6 ? ? 1 C 3 1 G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A C 3 O2 ? ? ? 1_555 A G 69 N2 ? ? 1 C 3 1 G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? 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A G 29 N1 ? ? ? 1_555 A C 39 N3 ? ? 1 G 30 1 C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A G 29 N2 ? ? ? 1_555 A C 39 O2 ? ? 1 G 30 1 C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A G 29 O6 ? ? ? 1_555 A C 39 N4 ? ? 1 G 30 1 C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A G 29 N2 ? ? ? 1_555 B A 1574 N3 ? ? 1 G 30 2 A 1574 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A G 30 N1 ? ? ? 1_555 A C 38 N3 ? ? 1 G 31 1 C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A G 30 N2 ? ? ? 1_555 A C 38 O2 ? ? 1 G 31 1 C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A G 30 O6 ? ? ? 1_555 A C 38 N4 ? ? 1 G 31 1 C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? A C 31 N3 ? ? ? 1_555 A A 37 N6 ? ? 1 C 32 1 A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? A A 34 N1 ? ? ? 1_555 D U 3 N3 ? ? 1 A 35 3 U 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog144 hydrog ? ? B G 48 N2 ? ? ? 1_555 B C 430 O2 ? ? 2 G 48 2 C 430 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog145 hydrog ? ? B G 48 O6 ? ? ? 1_555 B C 430 N4 ? ? 2 G 48 2 C 430 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog146 hydrog ? ? B C 49 N3 ? ? ? 1_555 B G 429 N1 ? ? 2 C 49 2 G 429 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog147 hydrog ? ? B C 49 N4 ? ? ? 1_555 B G 429 O6 ? ? 2 C 49 2 G 429 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog148 hydrog ? ? B C 49 O2 ? ? ? 1_555 B G 429 N2 ? ? 2 C 49 2 G 429 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog149 hydrog ? ? B C 50 N3 ? ? ? 1_555 B G 428 N1 ? ? 2 C 50 2 G 428 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog150 hydrog ? ? B C 50 N4 ? ? ? 1_555 B G 428 O6 ? ? 2 C 50 2 G 428 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog151 hydrog ? ? B C 50 O2 ? ? ? 1_555 B G 428 N2 ? ? 2 C 50 2 G 428 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog152 hydrog ? ? B A 51 N6 ? ? ? 1_555 B A 427 N1 ? ? 2 A 51 2 A 427 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog232 hydrog ? ? B G 123 O6 ? ? ? 1_555 B C 293 N4 ? ? 2 G 123 2 C 293 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog233 hydrog ? ? B A 124 N1 ? ? ? 1_555 B U 291 N3 ? ? 2 A 124 2 U 291 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? B A 124 N6 ? ? ? 1_555 B U 291 O4 ? ? 2 A 124 2 U 291 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? B U 125 O2 ? ? ? 1_555 B G 290 N2 ? ? 2 U 125 2 G 290 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? B A 126 N3 ? ? ? 1_555 B G 203 N2 ? ? 2 A 126 2 G 203 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? B A 126 N6 ? ? ? 1_555 B G 290 N3 ? ? 2 A 126 2 G 290 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog238 hydrog ? ? B U 137 N3 ? ? ? 1_555 B A 265 N1 ? ? 2 U 137 2 A 265 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog239 hydrog ? ? B U 137 O4 ? ? ? 1_555 B A 265 N6 ? ? 2 U 137 2 A 265 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog240 hydrog ? ? B A 138 N6 ? ? ? 1_555 B G 174 N3 ? ? 2 A 138 2 G 174 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog241 hydrog ? ? B U 141 N3 ? ? ? 1_555 B A 172 N1 ? ? 2 U 141 2 A 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog242 hydrog ? ? B U 141 O4 ? ? ? 1_555 B A 172 N6 ? ? 2 U 141 2 A 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog243 hydrog ? ? B G 142 N1 ? ? ? 1_555 B C 171 N3 ? ? 2 G 142 2 C 171 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog244 hydrog ? ? B G 142 N2 ? ? ? 1_555 B C 171 O2 ? ? 2 G 142 2 C 171 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog245 hydrog ? ? B G 142 O6 ? ? ? 1_555 B C 171 N4 ? ? 2 G 142 2 C 171 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog246 hydrog ? ? B G 143 N1 ? ? ? 1_555 B A 170 N1 ? ? 2 G 143 2 A 170 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog247 hydrog ? ? B G 143 O6 ? ? ? 1_555 B A 170 N6 ? ? 2 G 143 2 A 170 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog248 hydrog ? ? B A 144 N1 ? ? ? 1_555 B A 168 N6 ? ? 2 A 144 2 A 168 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'U-U MISPAIR' ? ? ? hydrog326 hydrog ? ? B U 222 N3 ? ? ? 1_555 B G 837 O6 ? ? 2 U 222 2 G 837 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog327 hydrog ? ? B U 222 O2 ? ? ? 1_555 B G 837 N1 ? ? 2 U 222 2 G 837 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog328 hydrog ? ? B C 223 N3 ? ? ? 1_555 B G 836 N1 ? ? 2 C 223 2 G 836 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog329 hydrog ? ? B C 223 N4 ? ? ? 1_555 B G 836 O6 ? ? 2 C 223 2 G 836 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog330 hydrog ? ? B C 223 O2 ? ? ? 1_555 B G 836 N2 ? ? 2 C 223 2 G 836 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog331 hydrog ? ? B A 224 N1 ? ? ? 1_555 B U 835 N3 ? ? 2 A 224 2 U 835 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog332 hydrog ? ? B A 224 N6 ? ? ? 1_555 B U 835 O4 ? ? 2 A 224 2 U 835 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog333 hydrog ? ? B A 225 N1 ? ? ? 1_555 B G 833 N1 ? ? 2 A 225 2 G 833 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog334 hydrog ? ? B A 225 N6 ? ? ? 1_555 B G 833 O6 ? ? 2 A 225 2 G 833 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog335 hydrog ? ? B G 227 N1 ? ? ? 1_555 B C 236 O2 ? ? 2 G 227 2 C 236 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog336 hydrog ? ? B U 228 O2 ? ? ? 1_555 B A 235 N6 ? ? 2 U 228 2 A 235 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog337 hydrog ? ? B C 229 N3 ? ? ? 1_555 B G 234 N1 ? ? 2 C 229 2 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog338 hydrog ? ? B C 229 N4 ? ? ? 1_555 B G 234 O6 ? ? 2 C 229 2 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog339 hydrog ? ? B C 229 O2 ? ? ? 1_555 B G 234 N2 ? ? 2 C 229 2 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog340 hydrog ? ? B U 230 N3 ? ? ? 1_555 B G 234 O6 ? ? 2 U 230 2 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog341 hydrog ? ? B U 230 O2 ? ? ? 1_555 B G 234 N1 ? ? 2 U 230 2 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog342 hydrog ? ? B G 242 N1 ? ? ? 1_555 B C 249 N3 ? ? 2 G 242 2 C 249 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog343 hydrog ? ? B G 242 N2 ? ? ? 1_555 B C 249 O2 ? ? 2 G 242 2 C 249 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog344 hydrog ? ? B G 242 O6 ? ? ? 1_555 B C 249 N4 ? ? 2 G 242 2 C 249 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog345 hydrog ? ? B A 264 N1 ? ? ? 1_555 B U 288 N3 ? ? 2 A 264 2 U 288 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog346 hydrog ? ? B A 264 N6 ? ? ? 1_555 B U 288 O4 ? ? 2 A 264 2 U 288 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog347 hydrog ? ? B U 266 N3 ? ? ? 1_555 B A 287 N1 ? ? 2 U 266 2 A 287 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog348 hydrog ? ? B U 266 O4 ? ? ? 1_555 B A 287 N6 ? ? 2 U 266 2 A 287 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog349 hydrog ? ? B U 266 N3 ? ? ? 1_555 B U 288 O2 ? ? 2 U 266 2 U 288 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog350 hydrog ? ? B U 266 O4 ? ? ? 1_555 B U 288 N3 ? ? 2 U 266 2 U 288 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog351 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog360 hydrog ? ? B A 270 N1 ? ? ? 1_555 B G 283 N1 ? ? 2 A 270 2 G 283 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog361 hydrog ? ? B G 273 N1 ? ? ? 1_555 B C 281 N3 ? ? 2 G 273 2 C 281 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog362 hydrog ? ? B G 273 N2 ? ? ? 1_555 B C 281 O2 ? ? 2 G 273 2 C 281 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog363 hydrog ? ? B G 273 O6 ? ? ? 1_555 B C 281 N4 ? ? 2 G 273 2 C 281 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog364 hydrog ? ? B C 274 N3 ? ? ? 1_555 B G 280 N1 ? ? 2 C 274 2 G 280 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog365 hydrog ? ? B C 274 N4 ? ? ? 1_555 B G 280 O6 ? ? 2 C 274 2 G 280 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog366 hydrog ? ? B C 274 O2 ? ? ? 1_555 B G 280 N2 ? ? 2 C 274 2 G 280 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog367 hydrog ? ? B C 275 O2 ? ? ? 1_555 B G 280 N2 ? ? 2 C 275 2 G 280 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? ? hydrog368 hydrog ? ? B C 308 N3 ? ? ? 1_555 B G 356 N1 ? ? 2 C 308 2 G 356 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog369 hydrog ? ? B C 308 N4 ? ? ? 1_555 B G 356 O6 ? ? 2 C 308 2 G 356 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog370 hydrog ? ? B C 308 O2 ? ? ? 1_555 B G 356 N2 ? ? 2 C 308 2 G 356 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog371 hydrog ? ? B C 309 N3 ? ? ? 1_555 B G 355 N1 ? ? 2 C 309 2 G 355 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog372 hydrog ? ? B C 309 N4 ? ? ? 1_555 B G 355 O6 ? ? 2 C 309 2 G 355 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog373 hydrog ? ? B C 309 O2 ? ? ? 1_555 B G 355 N2 ? ? 2 C 309 2 G 355 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog374 hydrog ? ? B U 310 N3 ? ? ? 1_555 B G 354 O6 ? ? 2 U 310 2 G 354 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog375 hydrog ? ? B U 310 O2 ? ? ? 1_555 B G 354 N1 ? ? 2 U 310 2 G 354 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog376 hydrog ? ? B A 311 N1 ? ? ? 1_555 B A 352 N6 ? ? 2 A 311 2 A 352 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'G-C PAIR' ? ? ? hydrog394 hydrog ? ? B A 322 N1 ? ? ? 1_555 B U 344 N3 ? ? 2 A 322 2 U 344 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog395 hydrog ? ? B A 322 N6 ? ? ? 1_555 B U 344 O4 ? ? 2 A 322 2 U 344 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog396 hydrog ? ? B U 323 N3 ? ? ? 1_555 B A 343 N1 ? ? 2 U 323 2 A 343 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog397 hydrog ? ? B U 323 O4 ? ? ? 1_555 B A 343 N6 ? ? 2 U 323 2 A 343 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog398 hydrog ? ? B G 324 N1 ? ? ? 1_555 B C 342 N3 ? ? 2 G 324 2 C 342 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog399 hydrog ? ? B G 324 N2 ? ? ? 1_555 B C 342 O2 ? ? 2 G 324 2 C 342 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog400 hydrog ? ? B G 324 O6 ? ? ? 1_555 B C 342 N4 ? ? 2 G 324 2 C 342 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog401 hydrog ? ? B G 325 N7 ? ? ? 1_555 B G 336 N2 ? ? 2 G 325 2 G 336 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog402 hydrog ? ? 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B C 360 O2 ? ? ? 1_555 B G 382 N2 ? ? 2 C 360 2 G 382 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog420 hydrog ? ? B G 361 N1 ? ? ? 1_555 B C 381 N3 ? ? 2 G 361 2 C 381 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog421 hydrog ? ? B G 361 N2 ? ? ? 1_555 B C 381 O2 ? ? 2 G 361 2 C 381 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog422 hydrog ? ? B G 361 O6 ? ? ? 1_555 B C 381 N4 ? ? 2 G 361 2 C 381 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog423 hydrog ? ? B G 362 N1 ? ? ? 1_555 B C 380 N3 ? ? 2 G 362 2 C 380 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog424 hydrog ? ? B G 362 N2 ? ? ? 1_555 B C 380 O2 ? ? 2 G 362 2 C 380 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog425 hydrog ? ? B G 362 O6 ? ? ? 1_555 B C 380 N4 ? ? 2 G 362 2 C 380 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog426 hydrog ? ? B G 363 N7 ? ? ? 1_555 B G 376 N2 ? ? 2 G 363 2 G 376 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? ? hydrog427 hydrog ? ? B G 363 N2 ? ? ? 1_555 B A 756 N1 ? ? 2 G 363 2 A 756 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog428 hydrog ? ? B G 363 N3 ? ? ? 1_555 B A 756 N6 ? ? 2 G 363 2 A 756 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog429 hydrog ? ? B G 364 N1 ? ? ? 1_555 B C 375 N3 ? ? 2 G 364 2 C 375 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog430 hydrog ? ? B G 364 N2 ? ? ? 1_555 B C 375 O2 ? ? 2 G 364 2 C 375 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog431 hydrog ? ? B G 364 O6 ? ? ? 1_555 B C 375 N4 ? ? 2 G 364 2 C 375 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog432 hydrog ? ? B A 365 N1 ? ? ? 1_555 B U 374 N3 ? ? 2 A 365 2 U 374 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog433 hydrog ? ? B A 365 N6 ? ? ? 1_555 B U 374 O4 ? ? 2 A 365 2 U 374 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog434 hydrog ? ? B A 366 N1 ? ? ? 1_555 B U 373 N3 ? ? 2 A 366 2 U 373 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog435 hydrog ? ? B A 366 N6 ? ? ? 1_555 B U 373 O4 ? ? 2 A 366 2 U 373 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog436 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog445 hydrog ? ? B G 387 O6 ? ? ? 1_555 B C 408 N4 ? ? 2 G 387 2 C 408 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog446 hydrog ? ? B G 388 N1 ? ? ? 1_555 B C 407 N3 ? ? 2 G 388 2 C 407 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog447 hydrog ? ? B G 388 N2 ? ? ? 1_555 B C 407 O2 ? ? 2 G 388 2 C 407 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog448 hydrog ? ? B G 388 O6 ? ? ? 1_555 B C 407 N4 ? ? 2 G 388 2 C 407 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog449 hydrog ? ? B G 389 O6 ? ? ? 1_555 B A 406 N6 ? ? 2 G 389 2 A 406 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog450 hydrog ? ? B A 390 N1 ? ? ? 1_555 B U 405 N3 ? ? 2 A 390 2 U 405 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog451 hydrog ? ? B A 390 N6 ? ? ? 1_555 B U 405 O4 ? ? 2 A 390 2 U 405 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog452 hydrog ? ? B G 391 N1 ? ? ? 1_555 B C 404 N3 ? ? 2 G 391 2 C 404 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog453 hydrog ? ? 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? -127.88 -163.00 85 1 PHE G 27 ? ? -94.82 53.55 86 1 ILE G 32 ? ? 84.84 161.22 87 1 LYS G 58 ? ? -83.39 38.04 88 1 GLN G 59 ? ? -148.51 -4.80 89 1 VAL G 67 ? ? 76.65 -60.16 90 1 SER G 82 ? ? -76.27 -169.13 91 1 ALA G 107 ? ? -83.60 -71.05 92 1 GLU G 122 ? ? 47.66 -127.55 93 1 ASN G 126 ? ? -124.56 -55.98 94 1 THR G 148 ? ? 81.46 8.47 95 1 LYS G 149 ? ? 82.44 165.40 96 1 GLU G 150 ? ? 84.33 -2.97 97 1 ASP G 152 ? ? 83.63 152.05 98 1 GLU G 225 ? ? 52.80 -125.86 99 1 GLN H 5 ? ? -135.55 -30.32 100 1 PRO H 13 ? ? -99.78 -156.55 101 1 THR H 14 ? ? 45.19 -154.97 102 1 GLU H 15 ? ? -135.34 -38.21 103 1 GLU H 28 ? ? -61.41 23.97 104 1 LYS H 35 ? ? -117.01 -99.00 105 1 SER H 45 ? ? 93.31 160.09 106 1 VAL H 64 ? ? 116.30 -52.56 107 1 VAL H 73 ? ? -122.67 -66.03 108 1 GLN H 74 ? ? 34.57 -36.92 109 1 ASP H 87 ? ? 172.49 50.65 110 1 GLN H 110 ? ? 66.38 175.34 111 1 ASP H 158 ? ? 61.86 63.99 112 1 THR H 177 ? ? -125.54 -60.04 113 1 ARG I 5 ? ? -98.65 53.79 114 1 LYS I 23 ? ? 49.01 -126.32 115 1 THR I 48 ? ? -126.69 -156.16 116 1 ASN I 52 ? ? 38.73 53.63 117 1 GLN I 53 ? ? -55.03 102.77 118 1 LYS I 75 ? ? -63.03 99.95 119 1 ALA I 106 ? ? 62.99 -6.71 120 1 TYR I 117 ? ? -136.62 -55.04 121 1 SER I 120 ? ? 76.55 159.35 122 1 ALA I 148 ? ? 67.96 -166.50 123 1 GLU I 150 ? ? -143.45 -89.76 124 1 ILE I 153 ? ? 99.30 0.58 125 1 GLU I 154 ? ? 72.60 -162.23 126 1 LYS J 100 ? ? 81.45 172.10 127 1 LYS J 120 ? ? 79.32 154.61 128 1 SER J 121 ? ? 60.51 141.65 129 1 ILE J 134 ? ? 73.02 112.99 130 1 VAL J 136 ? ? -77.58 -75.40 131 1 PRO J 163 ? ? -43.06 171.71 132 1 ALA J 167 ? ? -138.70 -31.74 133 1 ARG J 171 ? ? -122.50 -65.12 134 1 ASN K 28 ? ? 59.71 14.03 135 1 PRO K 30 ? ? -49.02 -72.62 136 1 GLU K 34 ? ? 68.73 -49.71 137 1 ASP K 36 ? ? -93.93 39.26 138 1 ASN K 81 ? ? 69.18 108.28 139 1 HIS K 85 ? ? 58.54 74.57 140 1 PRO K 88 ? ? -99.05 53.71 141 1 ALA K 89 ? ? 68.86 -23.69 142 1 THR K 90 ? ? -55.86 -7.20 143 1 TYR K 91 ? ? -98.60 -149.39 144 1 ALA K 93 ? ? -161.86 -25.13 145 1 LEU L 5 ? ? 86.36 -18.18 146 1 SER L 9 ? ? -153.63 -30.87 147 1 HIS L 18 ? ? 76.04 -16.27 148 1 PRO L 23 ? ? -65.86 5.96 149 1 ALA L 27 ? ? -144.12 -54.72 150 1 LYS L 30 ? ? 63.19 -69.91 151 1 SER L 132 ? ? -136.28 -157.67 152 1 ALA L 145 ? ? 55.74 -129.30 153 1 ALA L 149 ? ? -119.62 52.77 154 1 ASP M 32 ? ? 51.06 91.44 155 1 GLU M 49 ? ? -128.13 -52.79 156 1 VAL M 59 ? ? -115.59 -159.32 157 1 THR M 60 ? ? -75.76 -80.62 158 1 GLU M 62 ? ? 74.07 -39.11 159 1 LYS M 86 ? ? -139.60 -49.50 160 1 LEU M 94 ? ? -110.26 76.64 161 1 ASN M 102 ? ? 98.09 -132.17 162 1 LYS M 105 ? ? -90.96 -143.95 163 1 VAL M 111 ? ? -20.94 94.23 164 1 GLN M 122 ? ? -134.97 -69.40 165 1 SER M 132 ? ? -88.25 -70.04 166 1 THR N 61 ? ? -96.35 -66.80 167 1 ALA N 144 ? ? -135.93 -49.27 168 1 LYS O 49 ? ? -106.41 60.79 169 1 ASP O 51 ? ? 72.87 -65.17 170 1 SER O 91 ? ? -157.44 68.27 171 1 THR O 93 ? ? 127.52 121.14 172 1 SER O 125 ? ? -83.17 -139.77 173 1 TYR P 17 ? ? -100.93 -103.14 174 1 LEU P 25 ? ? -112.56 59.02 175 1 LEU P 26 ? ? -96.28 -69.51 176 1 LEU P 36 ? ? -108.35 47.46 177 1 LEU P 56 ? ? -135.02 -33.17 178 1 PRO P 68 ? ? -67.80 24.33 179 1 GLU P 69 ? ? 69.79 -49.42 180 1 LYS P 72 ? ? 171.55 143.96 181 1 VAL P 75 ? ? -61.06 92.56 182 1 ARG P 77 ? ? -68.92 84.16 183 1 ASN P 82 ? ? -131.42 -33.27 184 1 PRO P 87 ? ? -60.89 77.37 185 1 GLU P 88 ? ? -144.95 13.45 186 1 GLN P 104 ? ? -113.96 51.96 187 1 ARG P 108 ? ? -135.49 -55.21 188 1 PRO P 109 ? ? -81.93 -120.13 189 1 GLU P 118 ? ? -133.12 -39.53 190 1 ARG P 130 ? ? 59.20 -127.64 191 1 LYS Q 14 ? ? 49.27 -129.88 192 1 ASN Q 32 ? ? 34.64 -84.43 193 1 SER Q 34 ? ? 71.50 133.82 194 1 VAL Q 39 ? ? 43.30 -169.86 195 1 GLU Q 42 ? ? 64.15 -6.29 196 1 LEU Q 44 ? ? -103.55 60.50 197 1 ILE Q 65 ? ? -117.61 57.86 198 1 HIS Q 74 ? ? -129.53 -57.28 199 1 TYR Q 112 ? ? -127.54 -72.51 200 1 THR Q 115 ? ? -138.70 -67.91 201 1 LEU Q 116 ? ? 53.23 -127.41 202 1 TYR R 20 ? ? -111.58 71.35 203 1 LYS R 23 ? ? -48.87 170.34 204 1 LEU R 24 ? ? 70.43 83.80 205 1 THR R 25 ? ? -74.13 -87.72 206 1 MET R 26 ? ? -142.82 -42.49 207 1 GLN R 62 ? ? -69.56 67.24 208 1 GLN R 74 ? ? -152.68 -39.05 209 1 GLU R 76 ? ? -172.11 -33.06 210 1 ASP R 87 ? ? -151.88 -17.31 211 1 ASN R 97 ? ? -104.53 65.16 212 1 ASP R 98 ? ? 56.91 -81.98 213 1 THR R 104 ? ? 54.00 -127.88 214 1 LEU R 115 ? ? 58.13 -92.06 215 1 GLU S 7 ? ? 51.99 -124.31 216 1 GLN S 8 ? ? 71.11 -58.27 217 1 LEU S 18 ? ? 58.90 -155.13 218 1 VAL S 29 ? ? 90.72 -11.76 219 1 LEU S 54 ? ? -119.93 64.42 220 1 HIS S 55 ? ? -140.92 -9.93 221 1 LYS S 80 ? ? 61.17 64.29 222 1 ASN S 103 ? ? 88.88 -0.81 223 1 VAL S 133 ? ? -95.71 -66.39 224 1 ARG S 134 ? ? -65.82 89.26 225 1 ARG S 143 ? ? -130.97 -36.38 226 1 ARG S 145 ? ? 64.66 177.89 227 1 SER T 50 ? ? -40.17 -89.58 228 1 ALA T 96 ? ? -77.19 -145.38 229 1 ILE U 19 ? ? 58.53 109.96 230 1 LYS U 49 ? ? 55.08 -131.00 231 1 LEU U 50 ? ? 74.96 -175.14 232 1 TYR V 12 ? ? 90.67 174.74 233 1 ALA V 19 ? ? -108.79 -63.69 234 1 ASN V 21 ? ? 56.49 13.17 235 1 SER V 30 ? ? -146.38 -25.69 236 1 SER V 31 ? ? -69.16 -179.35 237 1 THR W 4 ? ? -110.94 -73.25 238 1 ASP W 55 ? ? -140.28 -10.78 239 1 HIS W 56 ? ? 69.14 -59.08 240 1 ARG W 57 ? ? -62.28 87.27 241 1 SER W 58 ? ? 70.78 -84.08 242 1 LYS W 60 ? ? -173.86 142.98 243 1 SER W 76 ? ? -44.80 -84.64 244 1 LEU W 126 ? ? -132.25 -71.58 245 1 LYS X 3 ? ? 108.99 -40.64 246 1 SER X 40 ? ? -115.71 -161.70 247 1 SER X 41 ? ? 67.60 144.53 248 1 PHE X 43 ? ? -47.37 152.35 249 1 SER X 46 ? ? -121.59 -168.75 250 1 LEU X 54 ? ? -96.74 -70.09 251 1 GLN X 63 ? ? 67.04 -175.67 252 1 PRO X 64 ? ? -54.08 62.11 253 1 ALA X 67 ? ? -172.95 146.80 254 1 ASN X 79 ? ? -149.61 -18.57 255 1 ASN X 89 ? ? 70.28 140.99 256 1 PHE X 107 ? ? -144.30 -0.78 257 1 ASP X 116 ? ? -142.21 43.63 258 1 GLU X 138 ? ? 54.39 77.79 259 1 LYS X 139 ? ? -136.50 -65.28 260 1 GLU X 141 ? ? -114.91 -153.15 261 1 ARG X 144 ? ? 37.32 53.90 262 1 ASN Y 31 ? ? 70.26 -57.50 263 1 ASN Y 34 ? ? 64.08 -162.35 264 1 SER Y 36 ? ? 86.15 126.80 265 1 GLN Y 63 ? ? -77.60 35.43 266 1 TYR Y 64 ? ? 55.08 95.59 267 1 PRO Y 87 ? ? -42.50 150.59 268 1 ARG Y 132 ? ? -97.76 39.65 269 1 VAL Z 40 ? ? -167.34 86.72 270 1 PHE Z 69 ? ? 85.39 6.69 271 1 ASN a 8 ? ? 56.23 11.39 272 1 ASN a 11 ? ? 91.58 -7.51 273 1 CYS a 26 ? ? -164.42 68.11 274 1 SER a 27 ? ? 53.64 -124.16 275 1 ARG a 28 ? ? 92.17 157.14 276 1 VAL a 30 ? ? -35.78 126.07 277 1 ARG a 38 ? ? -168.35 116.48 278 1 GLU a 61 ? ? 59.31 106.22 279 1 LEU a 64 ? ? 90.04 105.30 280 1 THR a 67 ? ? -69.43 85.81 281 1 ARG a 82 ? ? 58.79 6.32 282 1 LEU b 21 ? ? 79.55 -1.51 283 1 ALA b 53 ? ? -30.39 111.30 284 1 LEU c 16 ? ? -108.08 68.27 285 1 GLU c 34 ? ? -48.39 -70.22 286 1 THR c 37 ? ? -123.27 -58.63 287 1 ARG c 49 ? ? -121.33 -72.36 288 1 ARG c 64 ? ? -135.00 -50.04 289 1 LYS d 13 ? ? -140.28 -21.55 290 1 HIS d 27 ? ? -117.55 63.10 291 1 TYR d 55 ? ? -130.62 -36.07 292 1 LYS e 13 ? ? -33.19 -37.28 293 1 LYS e 26 ? ? 66.92 163.64 294 1 THR e 48 ? ? -142.83 -24.71 295 1 ASN e 51 ? ? -100.46 60.53 296 1 VAL f 84 ? ? -158.69 75.88 297 1 ARG f 92 ? ? -120.15 -57.96 298 1 HIS f 93 ? ? 85.31 -175.81 299 1 ALA f 101 ? ? 81.29 13.06 300 1 VAL f 102 ? 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? 92.16 4.80 332 1 GLU j 143 ? ? -137.92 -33.04 333 1 LEU j 147 ? ? -101.50 43.70 334 1 SER j 148 ? ? -146.26 -24.89 335 1 THR j 153 ? ? -135.10 -55.47 336 1 ILE j 198 ? ? -164.16 -49.57 337 1 ALA j 225 ? ? 4.98 -89.73 338 1 GLU j 249 ? ? -106.77 43.96 339 1 LYS j 250 ? ? -148.51 -11.68 340 1 ILE j 251 ? ? -122.95 -52.68 341 1 ILE j 255 ? ? -95.24 33.92 342 1 LYS k 129 ? ? 59.36 -176.63 343 1 ILE k 136 ? ? 81.40 -167.04 344 1 LYS k 168 ? ? 88.75 142.78 345 1 VAL k 186 ? ? -131.89 -48.82 346 1 ARG k 187 ? ? -102.92 -168.37 347 1 VAL k 210 ? ? -101.63 48.91 348 1 ASP k 212 ? ? -140.35 -57.02 349 1 LYS k 240 ? ? 160.23 79.67 350 1 ASN k 249 ? ? -83.93 -70.32 351 1 ARG k 255 ? ? 79.10 -152.33 352 1 ARG k 271 ? ? -142.08 -26.41 353 1 ASP k 276 ? ? 80.71 -3.32 354 1 ALA k 278 ? ? 162.18 146.05 355 1 GLN k 286 ? ? -140.87 -33.03 356 1 ASN k 290 ? ? 4.36 56.73 357 1 PHE k 321 ? ? -144.87 -119.62 358 1 ASN k 324 ? ? 174.66 79.77 359 1 LEU k 343 ? ? -76.48 -71.20 360 1 LYS k 365 ? ? 58.09 15.23 361 1 ILE k 368 ? 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'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' ? ? 4 5 ? ? 559292 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' ? ? 3 4 ? ? 559292 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' ? ? 5 6 ? ? 28985 ? ? 'Kluyveromyces lactis' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 5 ? 4932 'Saccharomyces cerevisiae' ? ? 3 4 ? 469008 'Escherichia coli BL21(DE3)' ? ? 3 6 ? 32630 'synthetic construct' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details 'FEI Falcon III' # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 40 _em_image_recording.average_exposure_time 1.1 _em_image_recording.details 'Images were collected in movie-mode at 40 frames per second' _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 2610 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 360729 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'PARTICLE SELECTION' ? EMAN ? 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.1 ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' ? Coot 0.8 ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 12 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 13 CLASSIFICATION ? RELION 1.4 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ? RELION 1.4 1 ? ? 15 'MODEL REFINEMENT' ? REFMAC 5.8 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.15 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6GSM 'double helix' 6GSM 'a-form double helix' 6GSM 'b-form double helix' 6GSM 'parallel strands' 6GSM 'hairpin loop' 6GSM 'bulge loop' 6GSM 'mismatched base pair' 6GSM 'internal loop' 6GSM 'triple helix' 6GSM 'quadruple helix' 6GSM 'three-way junction' 6GSM 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 1 1_555 A U 71 1_555 1.423 -0.277 -0.031 0.138 2.190 0.333 1 1_A1:U72_1 1 1 ? 1 72 ? 20 1 1 A G 2 1_555 A C 70 1_555 0.294 -0.034 -0.413 -23.175 -44.894 8.814 2 1_G2:C71_1 1 2 ? 1 71 ? 19 1 1 A C 3 1_555 A G 69 1_555 1.118 0.040 -0.835 14.171 -26.593 18.693 3 1_C3:G70_1 1 3 ? 1 70 ? 19 1 1 A G 4 1_555 A C 68 1_555 1.335 0.591 -1.285 -48.182 -21.458 -21.501 4 1_G4:C69_1 1 4 ? 1 69 ? ? 1 1 A C 5 1_555 A G 67 1_555 0.369 -0.158 -0.392 -7.066 -1.761 -0.716 5 1_C5:G68_1 1 5 ? 1 68 ? 19 1 1 A C 6 1_555 A G 66 1_555 -0.161 -0.084 -0.052 -0.893 -11.308 -0.471 6 1_C6:G67_1 1 6 ? 1 67 ? 19 1 1 A G 7 1_555 A C 65 1_555 -0.802 0.480 -0.128 -24.434 -10.084 3.976 7 1_G7:C66_1 1 7 ? 1 66 ? 19 1 1 A 5MC 48 1_555 A G 64 1_555 0.026 -0.232 0.855 9.476 -19.220 -11.482 8 1_5MC49:G65_1 1 49 ? 1 65 ? 19 1 1 A U 49 1_555 A RIA 63 1_555 -2.070 1.609 -1.166 17.680 -2.252 -75.434 9 1_U50:RIA64_1 1 50 ? 1 64 ? ? ? 1 A U 8 1_555 A G 15 1_555 1.091 -1.171 1.871 2.930 -17.786 -43.231 10 1_U8:G15_1 1 8 ? 1 15 ? 28 1 1 A G 21 1_555 A C 13 1_555 1.022 -0.137 -0.196 -8.471 -13.439 0.180 11 1_G22:C13_1 1 22 ? 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1 38 ? ? 1 1 A 1MG 9 1_555 A 7MG 45 1_555 -3.173 6.114 1.978 9.413 -9.668 141.401 22 1_1MG9:7MG46_1 1 9 ? 1 46 ? ? ? 1 A G 18 1_555 A C 55 1_555 0.000 -0.061 0.215 -1.482 -11.974 -1.697 23 1_G19:C56_1 1 19 ? 1 56 ? 19 1 1 A A 34 1_555 D U 3 1_555 -0.413 -0.096 0.147 3.365 -21.905 -0.946 24 1_A35:U30_3 1 35 ? 3 30 ? 20 1 1 A U 35 1_555 D A 2 1_555 0.735 -0.241 -0.288 -1.646 -18.146 3.069 25 1_U36:A29_3 1 36 ? 3 29 ? 20 1 1 A C 50 1_555 A G 62 1_555 0.777 -0.297 0.239 -3.716 -12.439 -0.981 26 1_C51:G63_1 1 51 ? 1 63 ? 19 1 1 A G 51 1_555 A C 61 1_555 0.745 -0.092 0.179 -18.308 -9.788 -2.562 27 1_G52:C62_1 1 52 ? 1 62 ? 19 1 1 A G 52 1_555 A C 60 1_555 -0.109 -0.170 -0.702 -3.336 0.434 -1.726 28 1_G53:C61_1 1 53 ? 1 61 ? 19 1 1 A A 53 1_555 A 1MA 57 1_555 4.658 1.944 -0.047 34.496 -6.857 -126.742 29 1_A54:1MA58_1 1 54 ? 1 58 ? 5 4 1 B U 1144 1_555 B G 10 1_555 2.712 -0.836 1.128 44.291 -9.727 4.765 30 2_U1144:G10_2 2 1144 ? 2 10 ? 28 1 1 B G 1145 1_555 B C 1630 1_555 -1.248 -0.583 0.549 1.099 -9.380 -2.175 31 2_G1145:C1630_2 2 1145 ? 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