data_6J3Z # _entry.id 6J3Z # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.315 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6J3Z WWPDB D_1300010274 EMDB EMD-9776 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB '6J3Y contains the same protein in C2S2-type PSII-FCPII supercomplex from diatom.' 6J3Y unspecified EMDB 'Structure of C2S1M1-type PSII-FCPII supercomplex from diatom' EMD-9776 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6J3Z _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-01-07 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Nagao, R.' 1 ? 'Kato, K.' 2 ? 'Shen, J.R.' 3 ? 'Miyazaki, N.' 4 ? 'Akita, F.' 5 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Plants _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2055-0278 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 5 _citation.language ? _citation.page_first 890 _citation.page_last 901 _citation.title 'Structural basis for energy harvesting and dissipation in a diatom PSII-FCPII supercomplex.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41477-019-0477-x _citation.pdbx_database_id_PubMed 31358960 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nagao, R.' 1 ? primary 'Kato, K.' 2 ? primary 'Suzuki, T.' 3 ? primary 'Ifuku, K.' 4 ? primary 'Uchiyama, I.' 5 ? primary 'Kashino, Y.' 6 ? primary 'Dohmae, N.' 7 ? primary 'Akimoto, S.' 8 ? primary 'Shen, J.R.' 9 ? primary 'Miyazaki, N.' 10 ? primary 'Akita, F.' 11 ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6J3Z _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6J3Z _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein D1' 38183.500 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Photosystem II chlorophyll protein CP47' 56475.301 2 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Photosystem II chlorophyll protein CP43' 51947.262 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein D2' 39069.520 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Cytochrome b559 subunit alpha' 9507.667 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Cytochrome b559 subunit beta' 4912.796 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein H' 7418.827 2 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein I' 4427.212 2 ? ? ? ? 9 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein J' 4093.833 2 ? ? ? ? 10 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein K' 4978.028 2 ? ? ? ? 11 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein L' 4367.076 2 ? ? ? ? 12 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein M' 14180.403 2 ? ? ? ? 13 polymer nat 'Extrinsic protein in photosystem II' 26762.297 2 ? ? ? ? 14 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein T' 3711.547 2 ? ? ? ? 15 polymer nat 'Extrinsic protein in photosystem II' 10137.501 2 ? ? ? ? 16 polymer nat 'Cytochrome c-550' 14893.812 2 ? ? ? ? 17 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein Ycf12' 3609.500 2 ? ? ? ? 18 polymer nat 'Photosystem II reaction center X protein' 3859.647 2 ? ? ? ? 19 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein Z' 6528.887 2 ? ? ? ? 20 polymer nat 'Extrinsic protein in photosystem II' 17088.086 2 ? ? ? ? 21 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein W' 7848.743 2 ? ? ? ? 22 polymer nat 'Unknown protein 0' 2656.265 2 ? ? ? ? 23 polymer nat 'Unknown protein 1' 2571.161 2 ? ? ? ? 24 polymer nat 'Unknown protein 2' 869.063 2 ? ? ? ? 25 polymer nat 'Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein Lhcf1, FCP1' 22098.182 8 ? ? ? ? 26 polymer nat 'Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein monomer 1' 18315.516 1 ? ? ? ? 27 polymer nat 'Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein monomer 2' 12188.016 1 ? ? ? ? 28 polymer nat 'Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein monomer 3' 13209.274 1 ? ? ? ? 29 non-polymer syn 'FE (II) ION' 55.845 2 ? ? ? ? 30 non-polymer syn 'CHLOROPHYLL A' 893.489 184 ? ? ? ? 31 non-polymer syn 'PHEOPHYTIN A' 871.200 4 ? ? ? ? 32 non-polymer syn BETA-CAROTENE 536.873 24 ? ? ? ? 33 non-polymer syn '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' 795.116 6 ? ? ? ? 34 non-polymer syn 'BICARBONATE ION' 61.017 2 ? ? ? ? 35 non-polymer syn 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 722.970 8 ? ? ? ? 36 non-polymer syn 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE 787.158 14 ? ? ? ? 37 non-polymer syn DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE 510.615 2 ? ? ? ? 38 non-polymer syn 'CA-MN4-O5 CLUSTER' 339.827 2 ? ? ? ? 39 non-polymer syn 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' 949.299 8 ? ? ? ? 40 non-polymer syn ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; 749.201 4 ? ? ? ? 41 non-polymer syn 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' 616.487 4 ? ? ? ? 42 non-polymer syn ;(3S,3'S,5R,5'R,6S,6'R,8'R)-3,5'-dihydroxy-8-oxo-6',7'-didehydro-5,5',6,6',7,8-hexahydro-5,6-epoxy-beta,beta-caroten-3'-yl acetate ; 658.906 59 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 7 PSII-H 13 'Extrinsic protein O of oxygen-evolving complex' 15 'Extrinsic protein U of oxygen-evolving complex' 16 'Extrinsic protein V of oxygen-evolving complex,Cytochrome c550' 18 'Photosystem II reaction center protein X' 20 'Extrinsic protein Q of oxygen-evolving complex' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MTATLERREGVSLWERFCAWITSTENRLYIGWFGCLMFPTLLTATSCFIIAFIAAPPVDIDGIREPVAGSLLYGNNIISG AVVPSSNAIGMHFYPIWEAASIDEWLYNGGPYQLIVLHFLLGVSAYMGREWELSYRLGMRPWIFVAFSAPVAAASAVFLV YPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMLVFQAEHNILMHPFHMAGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESTNYGYKFG QEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRALHFFLALWPVVGIWITSMGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADI LNRANLGIEVMHERNAHNFPLDLA ; ;MTATLERREGVSLWERFCAWITSTENRLYIGWFGCLMFPTLLTATSCFIIAFIAAPPVDIDGIREPVAGSLLYGNNIISG AVVPSSNAIGMHFYPIWEAASIDEWLYNGGPYQLIVLHFLLGVSAYMGREWELSYRLGMRPWIFVAFSAPVAAASAVFLV YPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMLVFQAEHNILMHPFHMAGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESTNYGYKFG QEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRALHFFLALWPVVGIWITSMGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADI LNRANLGIEVMHERNAHNFPLDLA ; A,a ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MALPWYRVHTVVLNDPGRLIAVHLMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLNPMWRQGMFVMPFMTRLGITDSWGGWSI TGESVSNPGIWSFEGVALSHIILSGMCFLAAIWHWVYWDLELFRDPRTGEPALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTG LFGPGIWVSDAYGITGKVQPVAPAWGADGFNPFNPGGIAAHHIAAGIFGIFAGIFHLTVRPPQRLYRALRMGNIETVLSS SISAVFFAAFVTSGTMWYGAAATPIELFGPTRYQWDSGYFQQEIERQVETSVSEGLSESQAWSRIPDKLAFYDYIGNNPA KGGLFRAGPMNKGDGIAEAWLGHPIFRDKEGRELTVRRMPAFFETFPVILVDKDGIIRADIPFRRAESKYSIEQVGVTVD FYGGKLNGQTFKDAPTVKKFARKAQLGEVFEFDRTSLESDGVFRSSPRGWYTYGHANFALLFFFGHLWHGGRTIFRDVFT GIGAEVTEQVEFGAFQKLGDKSTKKQGAV ; ;MALPWYRVHTVVLNDPGRLIAVHLMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLNPMWRQGMFVMPFMTRLGITDSWGGWSI TGESVSNPGIWSFEGVALSHIILSGMCFLAAIWHWVYWDLELFRDPRTGEPALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTG LFGPGIWVSDAYGITGKVQPVAPAWGADGFNPFNPGGIAAHHIAAGIFGIFAGIFHLTVRPPQRLYRALRMGNIETVLSS SISAVFFAAFVTSGTMWYGAAATPIELFGPTRYQWDSGYFQQEIERQVETSVSEGLSESQAWSRIPDKLAFYDYIGNNPA KGGLFRAGPMNKGDGIAEAWLGHPIFRDKEGRELTVRRMPAFFETFPVILVDKDGIIRADIPFRRAESKYSIEQVGVTVD FYGGKLNGQTFKDAPTVKKFARKAQLGEVFEFDRTSLESDGVFRSSPRGWYTYGHANFALLFFFGHLWHGGRTIFRDVFT GIGAEVTEQVEFGAFQKLGDKSTKKQGAV ; B,b ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKTLYSLRRYYHVETPFNSSIAGRDIESTGFAWWSGNARLINVSGKLLGAHVAHAGLMVFWAGAMVLFEVSHFVPEKPTY EQGFILIQHLATLGYGIGPGGEITSTVPYFAVGVIHLISSAILGFGGIYHSLLGPDTLEESFPFFGYDWRDKNKMTTILG IHLCLLGLGSFLLVIKAMYLGGVYDTWAPGGGDVRYITTPTLNPIVIFGYVFRSPFGGDGWVVSVNNMEDVIGGHIWVGI LCITGGIWHIFTKPFAWARRAFVWSGEAYLSYSLAAISLMGFTAALYSWYNNTAYPSELYGPTGPEASQAQAFTFLVRDQ RLGANVSSAQGPTGLGKYLMRSPSGEIIFGGETMRFWDLRAPWVEPLRGPNGLDINKIKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLG SLNSVGGVATEINSVNYVSPRSWLCCSHFFLAFFFLVGHWWHSGRARAAAAGFEKGINRANEPVLSMRPID ; ;MKTLYSLRRYYHVETPFNSSIAGRDIESTGFAWWSGNARLINVSGKLLGAHVAHAGLMVFWAGAMVLFEVSHFVPEKPTY EQGFILIQHLATLGYGIGPGGEITSTVPYFAVGVIHLISSAILGFGGIYHSLLGPDTLEESFPFFGYDWRDKNKMTTILG IHLCLLGLGSFLLVIKAMYLGGVYDTWAPGGGDVRYITTPTLNPIVIFGYVFRSPFGGDGWVVSVNNMEDVIGGHIWVGI LCITGGIWHIFTKPFAWARRAFVWSGEAYLSYSLAAISLMGFTAALYSWYNNTAYPSELYGPTGPEASQAQAFTFLVRDQ RLGANVSSAQGPTGLGKYLMRSPSGEIIFGGETMRFWDLRAPWVEPLRGPNGLDINKIKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLG SLNSVGGVATEINSVNYVSPRSWLCCSHFFLAFFFLVGHWWHSGRARAAAAGFEKGINRANEPVLSMRPID ; C,c ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTIAIGQNQERGLFDLVDDWLKKDRFVFVGWSGLLLFPTAYLAAGGWMTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTAAVSTP ANSVGHSLLLLWGPEAQGDFTRWCQIGGLWTFVALHGAFGLIGFCLRQFEIARLVGIRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLLYP LGQASWFFAPSFGVAAIFRFLLFLQGFHNWTLNPFHMMGVAGILGGALLCAIHGATVENTLFEDGDAANTFRAFTPTQSE ETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWTSSIGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNHLL DEGIRAWMAAQDQPHENFVFPEEVLPRGNAL ; ;MTIAIGQNQERGLFDLVDDWLKKDRFVFVGWSGLLLFPTAYLAAGGWMTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTAAVSTP ANSVGHSLLLLWGPEAQGDFTRWCQIGGLWTFVALHGAFGLIGFCLRQFEIARLVGIRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLLYP LGQASWFFAPSFGVAAIFRFLLFLQGFHNWTLNPFHMMGVAGILGGALLCAIHGATVENTLFEDGDAANTFRAFTPTQSE ETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWTSSIGIVGLALNLRAYDFVSQELRAAEDPEFETFYTKNHLL DEGIRAWMAAQDQPHENFVFPEEVLPRGNAL ; D,d ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSGGSTGERPFSDIITSVRYWIIHSITIPSLFVSGWLFISTGLAYDVFGTPRPNEYFTQDRQQVPLVNDRFSAKQELEDL TKGL ; ;MSGGSTGERPFSDIITSVRYWIIHSITIPSLFVSGWLFISTGLAYDVFGTPRPNEYFTQDRQQVPLVNDRFSAKQELEDL TKGL ; E,e ? 6 'polypeptide(L)' no no MTNNINQPVAYPIFTFRWLAIHGLAIPTVFFLGGITAMQFIQR MTNNINQPVAYPIFTFRWLAIHGLAIPTVFFLGGITAMQFIQR F,f ? 7 'polypeptide(L)' no no MALRTRLGEILRPLNAEYGKVAPGWGTTPIMGIVMLAFLIFLVIILQIYNSSLIIENVDVDWANGIV MALRTRLGEILRPLNAEYGKVAPGWGTTPIMGIVMLAFLIFLVIILQIYNSSLIIENVDVDWANGIV H,h ? 8 'polypeptide(L)' no no MLTLKILVYTTVIFFVSLFIFGFLSSDPSRNPNRKDLE MLTLKILVYTTVIFFVSLFIFGFLSSDPSRNPNRKDLE I,i ? 9 'polypeptide(L)' no no MTNTGRIPLWLVGLVGGLAVITMLSLFFYGSYSGLGSSL MTNTGRIPLWLVGLVGGLAVITMLSLFFYGSYSGLGSSL J,j ? 10 'polypeptide(L)' no no MESLLLARLPEAYVVFSPIVDVLPIIPVFFLLLAFVWQAAIGFR MESLLLARLPEAYVVFSPIVDVLPIIPVFFLLLAFVWQAAIGFR K,k ? 11 'polypeptide(L)' no no MTGPNPNKQAVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYFFN MTGPNPNKQAVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYFFN L,l ? 12 'polypeptide(L)' no no ;LHLTVVSEVGKVAVGSIPAAAIASPAFAMDSVVESLPTNMLAGEVQFGAYLAVLLGTFLPALFLVNLFIQTEARKAGKAG GQDSDLDGYLCIRVWIAIEAGRLSSHLWCPLVLPHFWRNNRTVSHLYGRYQ ; ;LHLTVVSEVGKVAVGSIPAAAIASPAFAMDSVVESLPTNMLAGEVQFGAYLAVLLGTFLPALFLVNLFIQTEARKAGKAG GQDSDLDGYLCIRVWIAIEAGRLSSHLWCPLVLPHFWRNNRTVSHLYGRYQ ; M,m ? 13 'polypeptide(L)' no no ;LTKSQINELSYLQVKGTGLANRCAEVVGEDSIKPKPGAKLVDMCIEPKAWAVEEEVGKAGKTEKKFVNSKVMTRQTYTLD AIEGPITVDGGKITFNEKEGIDYAATTVQLPGGERVPFLFTVKDLVAKGNGDTFKPGFQMGGDFNTPSYRTGLFLDPKGR GGTTGYDMAVALPALQLGEEGDAELFGENNKVFDITQGRIEMEVNKVNAEDSEIGGVFVATQLSDTDMGSKTPKKVLTKG IFYAKVDQ ; ;LTKSQINELSYLQVKGTGLANRCAEVVGEDSIKPKPGAKLVDMCIEPKAWAVEEEVGKAGKTEKKFVNSKVMTRQTYTLD AIEGPITVDGGKITFNEKEGIDYAATTVQLPGGERVPFLFTVKDLVAKGNGDTFKPGFQMGGDFNTPSYRTGLFLDPKGR GGTTGYDMAVALPALQLGEEGDAELFGENNKVFDITQGRIEMEVNKVNAEDSEIGGVFVATQLSDTDMGSKTPKKVLTKG IFYAKVDQ ; O,o ? 14 'polypeptide(L)' no no MEALVYTFLLIGTLMVIFFAVFFRETPRILR MEALVYTFLLIGTLMVIFFAVFFRETPRILR T,t ? 15 'polypeptide(L)' no no ;VIDYENIGYLGGSSIVDINNANVRAYLKMPGMYPTVAGKIVSHGPYSGVADLYKIPGLSSAEADVIKKYESRLTAKTPSP DYVIDRINNGLYR ; ;VIDYENIGYLGGSSIVDINNANVRAYLKMPGMYPTVAGKIVSHGPYSGVADLYKIPGLSSAEADVIKKYESRLTAKTPSP DYVIDRINNGLYR ; U,u ? 16 'polypeptide(L)' no no ;IDLDEATRTVVVDNAGNTTVLTPEQVKRGKRLFNATCGACHVGGITKTNPNVGLDPEALSLATPRRDNISALVDYIKNPT TYDGLESIAEVHPSIKSADIYPRMRSLTDEDLYSIAGHIMLSPKIASEKWGGGKIYY ; ;IDLDEATRTVVVDNAGNTTVLTPEQVKRGKRLFNATCGACHVGGITKTNPNVGLDPEALSLATPRRDNISALVDYIKNPT TYDGLESIAEVHPSIKSADIYPRMRSLTDEDLYSIAGHIMLSPKIASEKWGGGKIYY ; V,v ? 17 'polypeptide(L)' no no MINWQVIGQLMSTAVIMLAGPAVIVLLALKKGNL MINWQVIGQLMSTAVIMLAGPAVIVLLALKKGNL Y,y ? 18 'polypeptide(L)' no no MTASLSNFIASLIAGGVVVGVIAIALIVISKSDRILRS MTASLSNFIASLIAGGVVVGVIAIALIVISKSDRILRS X,x ? 19 'polypeptide(L)' no no MITLLVALLVLISLGLVVTVPVALATPGEWEIAKGKFNRFFQIWVFLVIVIAAADGISSSI MITLLVALLVLISLGLVVTVPVALATPGEWEIAKGKFNRFFQIWVFLVIVIAAADGISSSI Z,z ? 20 'polypeptide(L)' no no ;AVGESPRFSVFGLVGDGTSYSEGAAYGTDQADKLYSPYSVYSPEGEKSLYKPDNAEYLARKKAVLAETKNRLQKIPAYVD KKEWFNVKDELTRYMYETRGAVRSLSSSVTQKEKAEVFFRALEDTYGAATLKKGDAVKASNDKAIAALDAFTATL ; ;AVGESPRFSVFGLVGDGTSYSEGAAYGTDQADKLYSPYSVYSPEGEKSLYKPDNAEYLARKKAVLAETKNRLQKIPAYVD KKEWFNVKDELTRYMYETRGAVRSLSSSVTQKEKAEVFFRALEDTYGAATLKKGDAVKASNDKAIAALDAFTATL ; Q,q ? 21 'polypeptide(L)' no no MAALAGFMPAILSSTAAVATEGTNEWFGVDDLRLLAVLFLGHWAILSLWLGSYGDSNEDEDFFGEIDYSARK MAALAGFMPAILSSTAAVATEGTNEWFGVDDLRLLAVLFLGHWAILSLWLGSYGDSNEDEDFFGEIDYSARK W,w ? 22 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX 0,5 ? 23 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX 1,6 ? 24 'polypeptide(L)' no no '(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' XXXXXXXXXX 2,7 ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MKLAVAALLVASAAAFAPAPASKASTSLKVSEIELGVTEPLGVYDPLGWLESEPEAFERRRAVERKHGRVAMAAVVGTIV HNNHIVFDGYLSPSNNLKFSDIPTGVDGIRAIPTAGLAQILAFFALVELAWMPASKYDGDYGVGYFGTDIKDPEEKARKL NVELNNGRAAMMGIMGNMVAEVLTGQTMYEQYASGHISPFGDGQGVF ; ;MKLAVAALLVASAAAFAPAPASKASTSLKVSEIELGVTEPLGVYDPLGWLESEPEAFERRRAVERKHGRVAMAAVVGTIV HNNHIVFDGYLSPSNNLKFSDIPTGVDGIRAIPTAGLAQILAFFALVELAWMPASKYDGDYGVGYFGTDIKDPEEKARKL NVELNNGRAAMMGIMGNMVAEVLTGQTMYEQYASGHISPFGDGQGVF ; 11,12,13,14,15,16,17,18 ? 26 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; 19 ? 27 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; 20 ? 28 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; 21 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 ALA n 1 4 THR n 1 5 LEU n 1 6 GLU n 1 7 ARG n 1 8 ARG n 1 9 GLU n 1 10 GLY n 1 11 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'Chaetoceros gracilis' 184592 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 6J3Z 6J3Z ? 1 ? 1 2 PDB 6J3Z 6J3Z ? 2 ? 1 3 PDB 6J3Z 6J3Z ? 3 ? 1 4 PDB 6J3Z 6J3Z ? 4 ? 1 5 PDB 6J3Z 6J3Z ? 5 ? 1 6 PDB 6J3Z 6J3Z ? 6 ? 1 7 UNP B7XBY7_9STRA B7XBY7 ? 7 MALRTRLGEILRPLNAEYGKVAPGWGTTPIMGIVMLAFLIFLVIILQIYNSSLIIENVDVDWANGIV 1 8 PDB 6J3Z 6J3Z ? 8 ? 1 9 PDB 6J3Z 6J3Z ? 9 ? 1 10 PDB 6J3Z 6J3Z ? 10 ? 1 11 PDB 6J3Z 6J3Z ? 11 ? 1 12 PDB 6J3Z 6J3Z ? 12 ? 1 13 UNP B6ZHE8_9STRA B6ZHE8 ? 13 ;LTKSQINELSYLQVKGTGLANRCAEVVGEDSIKPKPGAKLVDMCIEPKAWAVEEEVGKAGKTEKKFVNSKVMTRQTYTLD AIEGPITVDGGKITFNEKEGIDYAATTVQLPGGERVPFLFTVKDLVAKGNGDTFKPGFQMGGDFNTPSYRTGLFLDPKGR GGTTGYDMAVALPALQLGEEGDAELFGENNKVFDITQGRIEMEVNKVNAEDSEIGGVFVATQLSDTDMGSKTPKKVLTKG IFYAKVDQ ; 60 14 PDB 6J3Z 6J3Z ? 14 ? 1 15 UNP B6ZHF0_9STRA B6ZHF0 ? 15 ;VIDYENIGYLGGSSIVDINNANVRAYLKMPGMYPTVAGKIVSHGPYSGVADLYKIPGLSSAEADVIKKYESRLTAKTPSP DYVIDRINNGLYR ; 59 16 UNP B6ZHF4_9STRA B6ZHF4 ? 16 ;IDLDEATRTVVVDNAGNTTVLTPEQVKRGKRLFNATCGACHVGGITKTNPNVGLDPEALSLATPRRDNISALVDYIKNPT TYDGLESIAEVHPSIKSADIYPRMRSLTDEDLYSIAGHIMLSPKIASEKWGGGKIYY ; 27 17 PDB 6J3Z 6J3Z ? 17 ? 1 18 UNP B6ZHF2_9STRA B6ZHF2 ? 18 MTASLSNFIASLIAGGVVVGVIAIALIVISKSDRILRS 1 19 PDB 6J3Z 6J3Z ? 19 ? 1 20 UNP B6ZHE9_9STRA B6ZHE9 ? 20 ;AVGESPRFSVFGLVGDGTSYSEGAAYGTDQADKLYSPYSVYSPEGEKSLYKPDNAEYLARKKAVLAETKNRLQKIPAYVD KKEWFNVKDELTRYMYETRGAVRSLSSSVTQKEKAEVFFRALEDTYGAATLKKGDAVKASNDKAIAALDAFTATL ; 57 21 PDB 6J3Z 6J3Z ? 21 ? 1 22 PDB 6J3Z 6J3Z ? 22 ? 1 23 PDB 6J3Z 6J3Z ? 23 ? 1 24 PDB 6J3Z 6J3Z ? 24 ? 1 25 PDB 6J3Z 6J3Z ? 25 ? 1 26 PDB 6J3Z 6J3Z ? 26 ? 1 27 PDB 6J3Z 6J3Z ? 27 ? 1 28 PDB 6J3Z 6J3Z ? 28 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6J3Z A 1 ? 344 ? 6J3Z 1 ? 344 ? 1 344 2 2 6J3Z B 1 ? 509 ? 6J3Z 1 ? 509 ? 1 509 3 3 6J3Z C 1 ? 471 ? 6J3Z 1 ? 471 ? 1 471 4 4 6J3Z D 1 ? 351 ? 6J3Z 1 ? 351 ? 1 351 5 5 6J3Z E 1 ? 84 ? 6J3Z 1 ? 84 ? 1 84 6 6 6J3Z F 1 ? 43 ? 6J3Z 1 ? 43 ? 1 43 7 7 6J3Z H 1 ? 67 ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LMG non-polymer . 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE ? 'C45 H86 O10' 787.158 LMU D-saccharide . DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE ? 'C24 H46 O11' 510.615 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 OEX non-polymer . 'CA-MN4-O5 CLUSTER' ? 'Ca Mn4 O5' 339.827 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PHO non-polymer . 'PHEOPHYTIN A' ? 'C55 H74 N4 O5' 871.200 PL9 non-polymer . ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; 'PLASTOQUINONE 9' 'C53 H80 O2' 749.201 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SQD non-polymer . '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' SULFOQUINOVOSYLDIACYLGLYCEROL 'C41 H78 O12 S' 795.116 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6J3Z _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6J3Z _struct.title 'Structure of C2S1M1-type PSII-FCPII supercomplex from diatom' _struct.pdbx_descriptor ;Photosystem II reaction center protein D1, Photosystem II chlorophyll protein CP47, Photosystem II chlorophyll protein CP43, Photosystem II reaction center protein D2, Cytochrome b559 subunit alpha, Cytochrome b559 subunit beta, Photosystem II reaction center protein H, Photosystem II reaction center protein I, Photosystem II reaction center protein J, Photosystem II reaction center protein K, Photosystem II reaction center protein L, Photosystem II reaction center protein M, Extrinsic protein in photosystem II, Photosystem II reaction center protein T, Cytochrome c-550, Photosystem II reaction center protein Ycf12, Photosystem II reaction center X protein, Photosystem II reaction center protein Z, Photosystem II reaction center protein W, Unknown protein 0, Unknown protein 1, Unknown protein 2, Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein Lhcf1, FCP1, Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein monomer 1, Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein monomer 2, Fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein monomer 3 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6J3Z _struct_keywords.text 'Photosystem, ELECTRON TRANSPORT' _struct_keywords.pdbx_keywords 'ELECTRON TRANSPORT' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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PRO 14 113 ALA 14 130 1 ? 18 HELX_P HELX_P256 BC4 GLY ZA 144 ? THR ZA 148 ? GLY 14 144 THR 14 148 5 ? 5 HELX_P HELX_P257 BC5 ASP ZA 152 ? GLU ZA 181 ? ASP 14 152 GLU 14 181 1 ? 30 HELX_P HELX_P258 BC6 THR ZA 187 ? GLY ZA 195 ? THR 14 187 GLY 14 195 1 ? 9 HELX_P HELX_P259 BC7 SER AB 31 ? GLY AB 36 ? SER 15 31 GLY 15 36 5 ? 6 HELX_P HELX_P260 BC8 GLY AB 48 ? GLU AB 53 ? GLY 15 48 GLU 15 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P261 BC9 ALA AB 56 ? ASN AB 83 ? ALA 15 56 ASN 15 83 1 ? 28 HELX_P HELX_P262 BD1 GLY AB 108 ? ILE AB 112 ? GLY 15 108 ILE 15 112 5 ? 5 HELX_P HELX_P263 BD2 PRO AB 113 ? LEU AB 129 ? PRO 15 113 LEU 15 129 1 ? 17 HELX_P HELX_P264 BD3 ASP AB 152 ? LEU AB 183 ? ASP 15 152 LEU 15 183 1 ? 32 HELX_P HELX_P265 BD4 THR AB 187 ? SER AB 194 ? THR 15 187 SER 15 194 1 ? 8 HELX_P HELX_P266 BD5 ALA BB 56 ? ASN BB 83 ? ALA 16 56 ASN 16 83 1 ? 28 HELX_P HELX_P267 BD6 VAL BB 106 ? ALA BB 111 ? VAL 16 106 ALA 16 111 1 ? 6 HELX_P HELX_P268 BD7 PRO BB 113 ? ALA BB 130 ? 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A HIS 272 NE2 ? ? ? 1_555 NB BCT . O2 ? ? A HIS 272 A BCT 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? metalc7 metalc ? ? A HIS 332 NE2 ? ? ? 1_555 PC OEX . MN1 ? ? A HIS 332 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? metalc8 metalc ? ? A GLU 333 OE1 ? ? ? 1_555 PC OEX . MN3 ? ? A GLU 333 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc9 metalc ? ? A GLU 333 OE2 ? ? ? 1_555 PC OEX . MN4 ? ? A GLU 333 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc10 metalc ? ? A GLU 333 OE2 ? ? ? 1_555 PC OEX . MN3 ? ? A GLU 333 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? metalc11 metalc ? ? A ASP 342 OD1 ? ? ? 1_555 PC OEX . MN2 ? ? A ASP 342 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? metalc12 metalc ? ? A ASP 342 OD2 ? ? ? 1_555 PC OEX . MN1 ? ? A ASP 342 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc13 metalc ? ? A ALA 344 O ? ? ? 1_555 PC OEX . CA1 ? ? A ALA 344 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.250 ? metalc14 metalc ? ? A ALA 344 O ? ? ? 1_555 PC OEX . MN2 ? ? A ALA 344 C OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? metalc15 metalc ? ? 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Y ALA 344 O ? ? ? 1_555 PF OEX . CA1 ? ? a ALA 344 c OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc38 metalc ? ? Y ALA 344 O ? ? ? 1_555 PF OEX . MN2 ? ? a ALA 344 c OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? metalc39 metalc ? ? AA ASN 37 OD1 ? ? ? 1_555 AG CLA . MG ? ? c ASN 37 c CLA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc40 metalc ? ? AA GLU 352 OE1 ? ? ? 1_555 PF OEX . MN2 ? ? c GLU 352 c OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc41 metalc ? ? AA GLU 352 OE2 ? ? ? 1_555 PF OEX . MN3 ? ? c GLU 352 c OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? metalc42 metalc ? ? AA GLU 352 OE2 ? ? ? 1_555 PF OEX . MN2 ? ? c GLU 352 c OEX 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? covale8 covale none ? BA TYR 41 CD1 ? ? ? 1_555 OG PL9 . C40 ? ? d TYR 41 d PL9 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.523 ? metalc43 metalc ? ? BA HIS 213 NE2 ? ? ? 1_555 KE FE2 . FE ? ? d HIS 213 a FE2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? metalc44 metalc ? ? BA HIS 267 NE2 ? ? ? 1_555 KE FE2 . FE ? ? d HIS 267 a FE2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc45 metalc ? ? CA HIS 24 NE2 ? ? ? 1_555 VG HEM . FE ? ? e HIS 24 f HEM 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.894 ? metalc46 metalc ? ? DA HIS 22 NE2 ? ? ? 1_555 VG HEM . FE ? ? f HIS 22 f HEM 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.806 ? covale9 covale none ? JA PHE 58 CE2 ? ? ? 1_555 BH CLA . C19 ? ? m PHE 16 m CLA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale10 covale none ? JA PHE 58 CZ ? ? ? 1_555 BH CLA . C19 ? ? m PHE 16 m CLA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? metalc47 metalc ? ? NA HIS 41 NE2 ? ? ? 1_555 EH HEM . FE ? ? v HIS 41 v HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? metalc48 metalc ? ? NA HIS 92 NE2 ? ? ? 1_555 EH HEM . FE ? ? v HIS 92 v HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.960 ? metalc49 metalc ? ? WA GLU 64 OE1 ? ? ? 1_555 JH CLA . MG ? ? 11 GLU 64 11 CLA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc50 metalc ? ? WA GLU 64 OE2 ? ? ? 1_555 JH CLA . MG ? ? 11 GLU 64 11 CLA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc51 metalc ? ? WA GLN 119 OE1 ? ? ? 1_555 MH CLA . MG ? ? 11 GLN 119 11 CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.924 ? metalc52 metalc ? ? 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MG ? ? 12 GLN 119 12 CLA 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? metalc60 metalc ? ? XA GLU 128 OE1 ? ? ? 1_555 II CLA . MG ? ? 12 GLU 128 12 CLA 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? metalc61 metalc ? ? XA GLU 128 OE2 ? ? ? 1_555 II CLA . MG ? ? 12 GLU 128 12 CLA 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc62 metalc ? ? XA GLU 163 OE1 ? ? ? 1_555 JI CLA . MG ? ? 12 GLU 163 12 CLA 311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? metalc63 metalc ? ? XA ASN 166 OD1 ? ? ? 1_555 LI CLA . MG ? ? 12 ASN 166 12 CLA 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? metalc64 metalc ? ? YA GLU 64 OE1 ? ? ? 1_555 TI CLA . MG ? ? 13 GLU 64 13 CLA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc65 metalc ? ? YA GLU 64 OE2 ? ? ? 1_555 TI CLA . MG ? ? 13 GLU 64 13 CLA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? metalc66 metalc ? ? YA GLN 119 OE1 ? ? ? 1_555 WI CLA . MG ? ? 13 GLN 119 13 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.922 ? metalc67 metalc ? ? YA GLU 128 OE1 ? ? ? 1_555 YI CLA . MG ? ? 13 GLU 128 13 CLA 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.930 ? metalc68 metalc ? ? 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ALA D 76 VAL D 77 AA9 2 PHE D 172 ? GLY D 173 ? PHE D 172 GLY D 173 AB1 1 LYS M 64 ? ASN M 68 ? LYS O 64 ASN O 68 AB1 2 LYS M 39 ? GLU M 55 ? LYS O 39 GLU O 55 AB1 3 LEU M 79 ? PRO M 85 ? LEU O 79 PRO O 85 AB2 1 LYS M 64 ? ASN M 68 ? LYS O 64 ASN O 68 AB2 2 LYS M 39 ? GLU M 55 ? LYS O 39 GLU O 55 AB2 3 LYS M 235 ? LYS M 245 ? LYS O 235 LYS O 245 AB2 4 GLU M 213 ? LEU M 223 ? GLU O 213 LEU O 223 AB2 5 THR M 196 ? ASN M 208 ? THR O 196 ASN O 208 AB2 6 MET M 140 ? THR M 146 ? MET O 140 THR O 146 AB2 7 VAL M 126 ? ASN M 130 ? VAL O 126 ASN O 130 AB2 8 LYS M 92 ? ASN M 96 ? LYS O 92 ASN O 96 AB3 1 LYS M 70 ? VAL M 71 ? LYS O 70 VAL O 71 AB3 2 TYR M 103 ? GLN M 109 ? TYR O 103 GLN O 109 AB3 3 ARG M 115 ? THR M 121 ? ARG O 115 THR O 121 AB4 1 THR P 9 ? VAL P 11 ? THR V 9 VAL V 11 AB4 2 THR P 18 ? VAL P 20 ? THR V 18 VAL V 20 AB5 1 VAL Y 58 ? ASP Y 59 ? VAL a 58 ASP a 59 AB5 2 PRO Y 66 ? VAL Y 67 ? PRO a 66 VAL a 67 AB6 1 ALA Y 81 ? VAL Y 82 ? ALA a 81 VAL a 82 AB6 2 LEU Y 174 ? GLY Y 175 ? 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O PHE O 242 N GLY M 216 ? N GLY O 216 AB2 4 5 O VAL M 219 ? O VAL O 219 N GLU M 201 ? N GLU O 201 AB2 5 6 O GLY M 198 ? O GLY O 198 N PHE M 144 ? N PHE O 144 AB2 6 7 O GLY M 141 ? O GLY O 141 N LYS M 128 ? N LYS O 128 AB2 7 8 O ALA M 127 ? O ALA O 127 N PHE M 95 ? N PHE O 95 AB3 1 2 N LYS M 70 ? N LYS O 70 O GLN M 109 ? O GLN O 109 AB3 2 3 N THR M 106 ? N THR O 106 O PHE M 118 ? O PHE O 118 AB4 1 2 N VAL P 10 ? N VAL V 10 O THR P 19 ? O THR V 19 AB5 1 2 N VAL Y 58 ? N VAL a 58 O VAL Y 67 ? O VAL a 67 AB6 1 2 N VAL Y 82 ? N VAL a 82 O LEU Y 174 ? O LEU a 174 AB7 1 2 N ASN Y 298 ? N ASN a 298 O GLY AA 400 ? O GLY c 400 AB8 1 2 N VAL Y 306 ? N VAL a 306 O ILE Y 314 ? O ILE a 314 AB9 1 2 N VAL Z 168 ? N VAL b 168 O LYS Z 177 ? O LYS b 177 AC1 1 2 N GLU Z 338 ? N GLU b 338 O GLU Z 431 ? O GLU b 431 AC2 1 2 O ALA Z 379 ? O ALA b 379 N LEU Z 370 ? N LEU b 370 AC2 2 3 O VAL Z 371 ? O VAL b 371 N THR Z 355 ? N THR b 355 AC2 3 4 O LEU Z 354 ? O LEU b 354 N PHE Z 346 ? 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