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_pdbx_database_status.entry_id 6LKN _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-12-19 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Abe, K.' 1 0000-0003-2681-5921 'Irie, K.' 2 0000-0002-8178-1552 'Nakanishi, H.' 3 0000-0001-8619-9513 'Hasegawa, K.' 4 0000-0003-0331-1624 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev J.Biol.Chem. _citation.journal_id_ASTM JBCHA3 _citation.journal_id_CSD 0071 _citation.journal_id_ISSN 1083-351X _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 295 _citation.language ? _citation.page_first 10180 _citation.page_last 10194 _citation.title 'Crystal structure of a human plasma membrane phospholipid flippase.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1074/jbc.RA120.014144 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32493773 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nakanishi, H.' 1 0000-0001-8619-9513 primary 'Irie, K.' 2 ? primary 'Segawa, K.' 3 ? primary 'Hasegawa, K.' 4 0000-0003-0331-1624 primary 'Fujiyoshi, Y.' 5 ? primary 'Nagata, S.' 6 0000-0001-9758-8426 primary 'Abe, K.' 7 0000-0003-2681-5921 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Phospholipid-transporting ATPase IG' 129710.633 4 7.6.2.1 C111W ? 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We merged 1588 crystal data to improve data quality.' _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 6LKN _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 3.90 _refine.ls_d_res_low 49.97 _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 75980 _refine.ls_number_reflns_R_free 3779 _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs 71.37 _refine.ls_percent_reflns_R_free 4.97 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.2846 _refine.ls_R_factor_R_free 0.3501 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2812 _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 2.07 _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method 'FREE R-VALUE' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 6k7l _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.1100 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.9000 _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error 38.7776 _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML 0.6547 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.details ? _refine_hist.d_res_high 3.90 _refine_hist.d_res_low 49.97 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 45256 _refine_hist.number_reflns_all ? _refine_hist.number_reflns_obs ? _refine_hist.number_reflns_R_free ? _refine_hist.number_reflns_R_work ? _refine_hist.R_factor_all ? _refine_hist.R_factor_obs ? _refine_hist.R_factor_R_free ? _refine_hist.R_factor_R_work ? _refine_hist.pdbx_number_residues_total ? _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand ? _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_solvent ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 44860 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 396 _refine_hist.pdbx_number_atoms_lipid ? _refine_hist.pdbx_number_atoms_carb ? _refine_hist.pdbx_pseudo_atom_details ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'X-RAY DIFFRACTION' ? 0.0062 ? 46317 ? f_bond_d ? ? 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UNP Q9NV96 SER 292 'engineered mutation' 292 48 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 9850 ? 1 MORE -48 ? 1 'SSA (A^2)' 66690 ? 2 'ABSA (A^2)' 8610 ? 2 MORE -42 ? 2 'SSA (A^2)' 68800 ? 3 'ABSA (A^2)' 8760 ? 3 MORE -40 ? 3 'SSA (A^2)' 70310 ? 4 'ABSA (A^2)' 8670 ? 4 MORE -36 ? 4 'SSA (A^2)' 69530 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,I,J,K,L,M,N,O,P,NA 2 1 C,D,Q,R,S,T,U,V,W,X,OA 3 1 E,F,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,PA 4 1 G,H,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,QA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PHE A 55 ? 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ASP A 820 ILE A 824 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG A 839 ? SER A 845 ? ARG A 839 SER A 845 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 HIS A 854 ? ALA A 861 ? HIS A 854 ALA A 861 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 AD5 ALA A 861 ? TYR A 891 ? ALA A 861 TYR A 891 1 ? 31 HELX_P HELX_P33 AD6 GLN A 892 ? PHE A 894 ? GLN A 892 PHE A 894 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP A 904 ? LEU A 926 ? ASP A 904 LEU A 926 1 ? 23 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN A 931 ? SER A 937 ? ASN A 931 SER A 937 1 ? 7 HELX_P HELX_P36 AD9 TYR A 942 ? GLY A 947 ? TYR A 942 GLY A 947 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN A 948 ? LEU A 951 ? ASN A 948 LEU A 951 5 ? 4 HELX_P HELX_P38 AE2 GLN A 952 ? PHE A 978 ? GLN A 952 PHE A 978 1 ? 27 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY A 991 ? THR A 1015 ? GLY A 991 THR A 1015 1 ? 25 HELX_P HELX_P40 AE4 ILE A 1021 ? GLY A 1041 ? ILE A 1021 GLY A 1041 1 ? 21 HELX_P HELX_P41 AE5 PHE A 1055 ? SER A 1062 ? PHE A 1055 SER A 1062 1 ? 8 HELX_P HELX_P42 AE6 SER A 1063 ? VAL A 1090 ? SER A 1063 VAL A 1090 1 ? 28 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA B 32 ? GLN B 36 ? 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PRO N 323 HIS N 348 1 ? 26 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A BFD 409 C ? ? ? 1_555 A LYS 410 N ? ? A BFD 409 A LYS 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale3 covale both ? C THR 408 C ? ? ? 1_555 C BFD 409 N ? ? E THR 408 E BFD 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale4 covale both ? C BFD 409 C ? ? ? 1_555 C LYS 410 N ? ? E BFD 409 E LYS 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale5 covale both ? E THR 408 C ? ? ? 1_555 E BFD 409 N ? ? I THR 408 I BFD 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale6 covale both ? E BFD 409 C ? ? ? 1_555 E LYS 410 N ? ? I BFD 409 I LYS 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale7 covale both ? G THR 408 C ? ? ? 1_555 G BFD 409 N ? ? M THR 408 M BFD 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale8 covale both ? G BFD 409 C ? ? ? 1_555 G LYS 410 N ? ? M BFD 409 M LYS 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? metalc1 metalc ? ? A BFD 409 OD2 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? A BFD 409 A MG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? ? metalc2 metalc ? ? A ASP 816 OD1 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? A ASP 816 A MG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.981 ? ? metalc3 metalc ? ? A ASP 820 OD1 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? A ASP 820 A MG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? ? metalc4 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? A MG 1202 A HOH 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? ? metalc5 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? A MG 1202 A HOH 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc6 metalc ? ? S MG . MG ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? E MG 1203 E HOH 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? ? metalc7 metalc ? ? S MG . MG ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? E MG 1203 E HOH 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc8 metalc ? ? E THR 411 O ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? I THR 411 I MG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? ? metalc9 metalc ? ? E ASP 816 OD1 ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? I ASP 816 I MG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? ? metalc10 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? I MG 1203 I HOH 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc11 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? I MG 1203 I HOH 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? ? metalc12 metalc ? ? G THR 413 OG1 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? M THR 413 M MG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.989 ? ? metalc13 metalc ? ? G ASP 816 OD2 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? M ASP 816 M MG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.809 ? ? metalc14 metalc ? ? HA MG . MG ? ? ? 1_555 QA HOH . O ? ? M MG 1202 M HOH 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc15 metalc ? ? HA MG . MG ? ? ? 1_555 QA HOH . O ? ? M MG 1202 M HOH 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OD2 ? A BFD 409 ? A BFD 409 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 OD1 ? A ASP 816 ? A ASP 816 ? 1_555 59.7 ? 2 OD2 ? A BFD 409 ? A BFD 409 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 OD1 ? A ASP 820 ? A ASP 820 ? 1_555 76.0 ? 3 OD1 ? A ASP 816 ? A ASP 816 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 OD1 ? A ASP 820 ? A ASP 820 ? 1_555 135.5 ? 4 OD2 ? A BFD 409 ? A BFD 409 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1301 ? 1_555 171.7 ? 5 OD1 ? A ASP 816 ? A ASP 816 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1301 ? 1_555 121.1 ? 6 OD1 ? A ASP 820 ? A ASP 820 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1301 ? 1_555 103.3 ? 7 OD2 ? A BFD 409 ? A BFD 409 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1302 ? 1_555 83.9 ? 8 OD1 ? A ASP 816 ? A ASP 816 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1302 ? 1_555 62.8 ? 9 OD1 ? A ASP 820 ? A ASP 820 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1302 ? 1_555 120.2 ? 10 O ? NA HOH . ? A HOH 1301 ? 1_555 MG ? J MG . ? A MG 1202 ? 1_555 O ? NA HOH . ? A HOH 1302 ? 1_555 89.4 ? 11 O ? OA HOH . ? E HOH 1301 ? 1_555 MG ? S MG . ? E MG 1203 ? 1_555 O ? OA HOH . ? E HOH 1302 ? 1_555 88.9 ? 12 O ? E THR 411 ? I THR 411 ? 1_555 MG ? AA MG . ? I MG 1203 ? 1_555 OD1 ? E ASP 816 ? I ASP 816 ? 1_555 63.1 ? 13 O ? E THR 411 ? I THR 411 ? 1_555 MG ? AA MG . ? I MG 1203 ? 1_555 O ? PA HOH . ? I HOH 1301 ? 1_555 48.7 ? 14 OD1 ? E ASP 816 ? I ASP 816 ? 1_555 MG ? AA MG . ? I MG 1203 ? 1_555 O ? PA HOH . ? I HOH 1301 ? 1_555 59.1 ? 15 O ? E THR 411 ? I THR 411 ? 1_555 MG ? AA MG . ? I MG 1203 ? 1_555 O ? PA HOH . ? I HOH 1302 ? 1_555 137.3 ? 16 OD1 ? E ASP 816 ? I ASP 816 ? 1_555 MG ? AA MG . ? I MG 1203 ? 1_555 O ? PA HOH . ? I HOH 1302 ? 1_555 91.1 ? 17 O ? PA HOH . ? I HOH 1301 ? 1_555 MG ? AA MG . ? I MG 1203 ? 1_555 O ? PA HOH . ? I HOH 1302 ? 1_555 89.3 ? 18 OG1 ? G THR 413 ? M THR 413 ? 1_555 MG ? HA MG . ? M MG 1202 ? 1_555 OD2 ? G ASP 816 ? M ASP 816 ? 1_555 51.1 ? 19 OG1 ? G THR 413 ? M THR 413 ? 1_555 MG ? HA MG . ? M MG 1202 ? 1_555 O ? QA HOH . ? M HOH 1301 ? 1_555 117.8 ? 20 OD2 ? G ASP 816 ? M ASP 816 ? 1_555 MG ? HA MG . ? M MG 1202 ? 1_555 O ? QA HOH . ? M HOH 1301 ? 1_555 69.6 ? 21 OG1 ? G THR 413 ? M THR 413 ? 1_555 MG ? HA MG . ? M MG 1202 ? 1_555 O ? QA HOH . ? M HOH 1302 ? 1_555 145.4 ? 22 OD2 ? G ASP 816 ? M ASP 816 ? 1_555 MG ? HA MG . ? M MG 1202 ? 1_555 O ? QA HOH . ? M HOH 1302 ? 1_555 138.2 ? 23 O ? QA HOH . ? M HOH 1301 ? 1_555 MG ? HA MG . ? M MG 1202 ? 1_555 O ? QA HOH . ? M HOH 1302 ? 1_555 90.9 ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 BFD A 409 ? . . . . BFD A 409 ? 1_555 . . . . . . . ASP 1 BFD None 'Non-standard residue' 2 BFD C 409 ? . . . . BFD E 409 ? 1_555 . . . . . . . ASP 1 BFD None 'Non-standard residue' 3 BFD E 409 ? . . . . BFD I 409 ? 1_555 . . . . . . . ASP 1 BFD None 'Non-standard residue' 4 BFD G 409 ? . . . . BFD M 409 ? 1_555 . . . . . . . ASP 1 BFD None 'Non-standard residue' 5 CYS B 91 ? CYS B 104 ? CYS C 91 ? 1_555 CYS C 104 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 6 CYS B 94 ? CYS B 102 ? CYS C 94 ? 1_555 CYS C 102 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 7 CYS C 165 ? CYS C 197 ? CYS E 165 ? 1_555 CYS E 197 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 8 CYS D 94 ? CYS D 102 ? CYS F 94 ? 1_555 CYS F 102 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 9 CYS F 91 ? CYS F 104 ? CYS J 91 ? 1_555 CYS J 104 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS F 94 ? CYS F 102 ? CYS J 94 ? 1_555 CYS J 102 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS H 91 ? CYS H 104 ? CYS N 91 ? 1_555 CYS N 104 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS H 94 ? CYS H 102 ? CYS N 94 ? 1_555 CYS N 102 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 9 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 6 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 3 ? 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