data_6MUX # _entry.id 6MUX # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.388 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 6MUX pdb_00006mux 10.2210/pdb6mux/pdb WWPDB D_1000237311 ? ? EMDB EMD-9259 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2019-08-07 2 'Structure model' 1 1 2019-08-14 3 'Structure model' 1 2 2019-11-06 4 'Structure model' 1 3 2019-12-18 5 'Structure model' 1 4 2024-03-13 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Data collection' 4 3 'Structure model' 'Database references' 5 4 'Structure model' 'Author supporting evidence' 6 4 'Structure model' Other 7 5 'Structure model' 'Data collection' 8 5 'Structure model' 'Database references' 9 5 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' citation 4 3 'Structure model' citation_author 5 4 'Structure model' atom_sites 6 4 'Structure model' cell 7 4 'Structure model' pdbx_audit_support 8 5 'Structure model' chem_comp_atom 9 5 'Structure model' chem_comp_bond 10 5 'Structure model' database_2 11 5 'Structure model' em_3d_fitting_list 12 5 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 6 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 7 2 'Structure model' '_citation.title' 8 2 'Structure model' '_citation.year' 9 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 10 3 'Structure model' '_citation.page_first' 11 3 'Structure model' '_citation.page_last' 12 3 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 13 4 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]' 14 4 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]' 15 4 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]' 16 4 'Structure model' '_cell.Z_PDB' 17 4 'Structure model' '_pdbx_audit_support.funding_organization' 18 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 19 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 20 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.accession_code' 21 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id' 22 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.source_name' 23 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.type' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6MUX _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-10-23 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB 'Crystal structure of 11S subunit' 6DFK unspecified PDB 'EM structure of 20S proteasome' 6MUW unspecified PDB 'EM structure of 20S proteasome with two 11S caps' 6MUV unspecified EMDB 'The structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome in complex with one PA28 activator.' EMD-9259 'associated EM volume' EMDB . EMD-9258 'other EM volume' EMDB . EMD-9257 'other EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Metcalfe, R.D.' 1 0000-0002-7154-780X 'Xie, S.C.' 2 ? 'Hanssen, E.' 3 0000-0002-4064-1844 'Gillett, D.L.' 4 ? 'Leis, A.P.' 5 0000-0003-4905-9401 'Tilley, L.' 6 ? 'Griffin, M.D.W.' 7 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Microbiol' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2058-5276 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 4 _citation.language ? _citation.page_first 1990 _citation.page_last 2000 _citation.title 'The structure of the PA28-20S proteasome complex from Plasmodium falciparum and implications for proteostasis.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41564-019-0524-4 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31384003 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Xie, S.C.' 1 ? primary 'Metcalfe, R.D.' 2 ? primary 'Hanssen, E.' 3 ? primary 'Yang, T.' 4 ? primary 'Gillett, D.L.' 5 ? primary 'Leis, A.P.' 6 ? primary 'Morton, C.J.' 7 ? primary 'Kuiper, M.J.' 8 ? primary 'Parker, M.W.' 9 ? primary 'Spillman, N.J.' 10 ? primary 'Wong, W.' 11 ? primary 'Tsu, C.' 12 ? primary 'Dick, L.R.' 13 ? primary 'Griffin, M.D.W.' 14 ? primary 'Tilley, L.' 15 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '20S proteasome alpha-1 subunit' 29531.656 2 3.4.25.1 ? ? ? 2 polymer nat '20S proteasome alpha-2 subunit' 26556.391 2 3.4.25.1 ? ? ? 3 polymer nat '20S proteasome alpha-3 subunit' 27977.664 2 3.4.25.1 ? ? ? 4 polymer nat '20S proteasome alpha-4 subunit' 27263.285 2 3.4.25.1 ? ? ? 5 polymer nat '20S proteasome alpha-5 subunit' 28417.367 2 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'polypeptide(L)' no no ;MVRPSQSMYDRHLTIFSPDGNLYQIEYAIKAVKNTNITSVGVKGENCAVIISQKKMATQYISQDKLLDYNNITNIYNITD EIGCSMVGMPGDCLSMVYKARSEASEFLYSNGYNVNAETLCRNICDKIQVYTQHAYMRLHACSGMIIGIDENNKPELFKF DPSGFCAGYRACVIGNKEQESISVLERLLEKRKKKIQQETIDEDIRNTTILAIEALQTILAFDLKASEIEVAIVSTKNRN FTQISEKEIDNYLTYIAERD ; ;MVRPSQSMYDRHLTIFSPDGNLYQIEYAIKAVKNTNITSVGVKGENCAVIISQKKMATQYISQDKLLDYNNITNIYNITD EIGCSMVGMPGDCLSMVYKARSEASEFLYSNGYNVNAETLCRNICDKIQVYTQHAYMRLHACSGMIIGIDENNKPELFKF DPSGFCAGYRACVIGNKEQESISVLERLLEKRKKKIQQETIDEDIRNTTILAIEALQTILAFDLKASEIEVAIVSTKNRN FTQISEKEIDNYLTYIAERD ; A,O ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MADGEYSFSLTTFSPTGKLVQIEYALNRVSSSSPALGIRAKNGVIIATEKKSPNELIEENSIFKIQQISEHIGIVYAGMP GDFRVLLKRARKEAIRYSLQYGSEILVKELVKIIASIVQEFTQTGGVRPFGLSLLICGVDVYGYHLYQIDPSGCYFNWMA TCVGKDYQNNMSFLEKRYNKDIEIEDAIHTAILTLKESYEGVLNEKNIEIGVAYDNKPFKILTQNEIKDYLIEIE ; ;MADGEYSFSLTTFSPTGKLVQIEYALNRVSSSSPALGIRAKNGVIIATEKKSPNELIEENSIFKIQQISEHIGIVYAGMP GDFRVLLKRARKEAIRYSLQYGSEILVKELVKIIASIVQEFTQTGGVRPFGLSLLICGVDVYGYHLYQIDPSGCYFNWMA TCVGKDYQNNMSFLEKRYNKDIEIEDAIHTAILTLKESYEGVLNEKNIEIGVAYDNKPFKILTQNEIKDYLIEIE ; B,P ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MARRYDSRTTTFSPEGRLYQVEYALEAINNASITIGLITKDGVILGADKVFISKLIDKANNYEKIYKIDKHIFCGVAGLN ADANILINQSRLYAQRYLYNYNEVQPVSQLVVQICDIKQSYTQYGGLRPYGVSFLIGGYDTKDGYQLYHTDPSGNYSGWF ATAIGTNNLTASSVLKQEWKNDMTLEEGLLLALKTLAKSTDTEIPKSEKIELAYLTNKDGEVYQKYLTEKEIEELIKLYT QKYIKE ; ;MARRYDSRTTTFSPEGRLYQVEYALEAINNASITIGLITKDGVILGADKVFISKLIDKANNYEKIYKIDKHIFCGVAGLN ADANILINQSRLYAQRYLYNYNEVQPVSQLVVQICDIKQSYTQYGGLRPYGVSFLIGGYDTKDGYQLYHTDPSGNYSGWF ATAIGTNNLTASSVLKQEWKNDMTLEEGLLLALKTLAKSTDTEIPKSEKIELAYLTNKDGEVYQKYLTEKEIEELIKLYT QKYIKE ; C,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSYDRAITVFSPDGHLLQVEHALEAVKKGGCAVAIKSSNFAVLAVEKKNIPKLQNPKTTEKLIKLDEHNCLAFAGLNADA RVLVNKTRLECQRYYLNMDEPAPVDYIAKYVAKVQQKFTHRGGVRPFGIATLIAGFKNNKEICIYQTEPSGIYAAWKAQA IGKNAKIVQEFLEKNYQENMEQKDCIFLALKAIFEVVELSSKNVEVALLTEKDLTFIEEQEINSMVELIDQERTKNNEQN E ; ;MSYDRAITVFSPDGHLLQVEHALEAVKKGGCAVAIKSSNFAVLAVEKKNIPKLQNPKTTEKLIKLDEHNCLAFAGLNADA RVLVNKTRLECQRYYLNMDEPAPVDYIAKYVAKVQQKFTHRGGVRPFGIATLIAGFKNNKEICIYQTEPSGIYAAWKAQA IGKNAKIVQEFLEKNYQENMEQKDCIFLALKAIFEVVELSSKNVEVALLTEKDLTFIEEQEINSMVELIDQERTKNNEQN E ; D,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFSTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYALGAIKLGSTAVGICVNDGVILASERRISSTLIEKDSVEKLLSIDDHIGCAMSG LMADARTLIDYARVECNHYKFIYNENINIKSCVELISELALDFSNLSDSKRKKIMSRPFGVALLIGGVDKNGPCLWYTEP SGTNTRFSAASIGSAQEGAELLLQENYKKDMTFEQAEILALTVLRQVMEDKLSTSNVEICAIKKSDQTFYKYNTDDISRI IDVLPSPVYPTIDMTA ; ;MFSTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYALGAIKLGSTAVGICVNDGVILASERRISSTLIEKDSVEKLLSIDDHIGCAMSG LMADARTLIDYARVECNHYKFIYNENINIKSCVELISELALDFSNLSDSKRKKIMSRPFGVALLIGGVDKNGPCLWYTEP SGTNTRFSAASIGSAQEGAELLLQENYKKDMTFEQAEILALTVLRQVMEDKLSTSNVEICAIKKSDQTFYKYNTDDISRI IDVLPSPVYPTIDMTA ; E,S ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MYRNLYDTDNIIYSPEGRLYQVEYASEAIKQGTCAVAIKSKDYVVVSGLKKCISKLSFPQEKIFKIDDYIGISMSGITSD AKVLTKFMQNECLSHKFLYNENINIESLVRSVADKYQKNTQKSSKRAFGVGLMIAAYHNEPCIFETRPNGSYFEYDALSF GARSHASKTYLEKNLHLFEECSLEELILHCLKALKCSLSSESELTISNTALAVVGKNHPWQEISSLQLEEYLSKVKMDAE QEQVEENVQNEANE ; ;MYRNLYDTDNIIYSPEGRLYQVEYASEAIKQGTCAVAIKSKDYVVVSGLKKCISKLSFPQEKIFKIDDYIGISMSGITSD AKVLTKFMQNECLSHKFLYNENINIESLVRSVADKYQKNTQKSSKRAFGVGLMIAAYHNEPCIFETRPNGSYFEYDALSF GARSHASKTYLEKNLHLFEECSLEELILHCLKALKCSLSSESELTISNTALAVVGKNHPWQEISSLQLEEYLSKVKMDAE QEQVEENVQNEANE ; F,T ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MAGLSAGYDLSVSTFSPDGRLYQVEYIYKSINNNNTALCLECKDGIICCCINSNMDKNKMIKKNSYNRIYHVNNNIIITY SGFDGDARNIIDRARSEANTYYYNFHTNIPLHILVNRISLYIHAYTLYWHMRPFAASIIISSFNEKDKGDIYCIEPNGAC YKYSGIVIGKNKEMFKTEIEKKDYKDINVRDAIEDIYKFILTSDDHMNKNNLQNLVNFSWICKESSYEFQNIHEEILTPA LNKAVEYIEKLN ; ;MAGLSAGYDLSVSTFSPDGRLYQVEYIYKSINNNNTALCLECKDGIICCCINSNMDKNKMIKKNSYNRIYHVNNNIIITY SGFDGDARNIIDRARSEANTYYYNFHTNIPLHILVNRISLYIHAYTLYWHMRPFAASIIISSFNEKDKGDIYCIEPNGAC YKYSGIVIGKNKEMFKTEIEKKDYKDINVRDAIEDIYKFILTSDDHMNKNNLQNLVNFSWICKESSYEFQNIHEEILTPA LNKAVEYIEKLN ; G,U ? 8 'polypeptide(L)' no no ;TTIIGIIYDNGVMLACDSRTSSGTFISNKCSRKINRINENLYVCRSGASAHSQKIIEIIKHYCVSMKNENRKKGRFHEGE TIYDETTYDEEIDIDSINYLDYNNNNDNNLVTKNKYFYEDKFNDYNPLVENVAHITKKIIYTNNNFLSCALIFGGYDKIK KQQLYAVNLNGSIIEKHDFAVSGSGSIYIQSYLQDKYKKFMTKKECFNLILNCVKYAMHNDNSSGGLIRIVNITKSFVEE FTVVNTQMNFQY ; ;TTIIGIIYDNGVMLACDSRTSSGTFISNKCSRKINRINENLYVCRSGASAHSQKIIEIIKHYCVSMKNENRKKGRFHEGE TIYDETTYDEEIDIDSINYLDYNNNNDNNLVTKNKYFYEDKFNDYNPLVENVAHITKKIIYTNNNFLSCALIFGGYDKIK KQQLYAVNLNGSIIEKHDFAVSGSGSIYIQSYLQDKYKKFMTKKECFNLILNCVKYAMHNDNSSGGLIRIVNITKSFVEE FTVVNTQMNFQY ; H,V ? 9 'polypeptide(L)' no no ;TTICGLVCQNAVILGADTRATEGPIVADKNCSKLHYISKNIWCAGAGVAGDLEHTTLWLQHNVELHRLNTNTQPRVSMCV SRLTQELFKYQGYKVCAIVLGGVDVNGPQLYGIHPHGSSCLLPFTALGSGSLNAMAVLEAKYRDNMTIEEGKNLVCEAIC AGIFNDLGSGGNVDICVITKDSYQHIRPYKEPNMRLYHLPHPTIYPKGTTPILSEKIEYIKKFISVEDA ; ;TTICGLVCQNAVILGADTRATEGPIVADKNCSKLHYISKNIWCAGAGVAGDLEHTTLWLQHNVELHRLNTNTQPRVSMCV SRLTQELFKYQGYKVCAIVLGGVDVNGPQLYGIHPHGSSCLLPFTALGSGSLNAMAVLEAKYRDNMTIEEGKNLVCEAIC AGIFNDLGSGGNVDICVITKDSYQHIRPYKEPNMRLYHLPHPTIYPKGTTPILSEKIEYIKKFISVEDA ; I,W ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MGSIYNYNGGCVLGMSGSNCVAIACDLRLGANTFTTVSTKFSKIFKMNNNVYVGLSGLATDIQTLYEILRYRVNLYEVRQ DAEMDVECFANMLSSILYSNRFSPYFVNPIVVGFKLKHYVDEEGEKKVNYEPYLTAYDLIGAKCETRDFVVNGVTSEQLF GMCESLYVKDQDENGLFETISQCLLSALDRDCISGWGAEVLVLTPEKIIKKKLKARMD ; ;MGSIYNYNGGCVLGMSGSNCVAIACDLRLGANTFTTVSTKFSKIFKMNNNVYVGLSGLATDIQTLYEILRYRVNLYEVRQ DAEMDVECFANMLSSILYSNRFSPYFVNPIVVGFKLKHYVDEEGEKKVNYEPYLTAYDLIGAKCETRDFVVNGVTSEQLF GMCESLYVKDQDENGLFETISQCLLSALDRDCISGWGAEVLVLTPEKIIKKKLKARMD ; J,X ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MDTLIGLRGNNFVVLAADTYSINSIIKLKNDDNTKFYDIHGNKCLLLGGSIGDRLQFGEFIRKNVHLYQYQNNTDMFVKS FAFFTRKNLAYYLRRNPFEVNCLIAGYDKKDGYQLYWCDYLSNMDSVNKGAHGYGAYLVSAILDKYYHENLTVDEALDIF KLCFEELKKRFLLTQINYELRIMYDNKVETQYVTV ; ;MDTLIGLRGNNFVVLAADTYSINSIIKLKNDDNTKFYDIHGNKCLLLGGSIGDRLQFGEFIRKNVHLYQYQNNTDMFVKS FAFFTRKNLAYYLRRNPFEVNCLIAGYDKKDGYQLYWCDYLSNMDSVNKGAHGYGAYLVSAILDKYYHENLTVDEALDIF KLCFEELKKRFLLTQINYELRIMYDNKVETQYVTV ; K,Y ? 12 'polypeptide(L)' no no ;TTTLAFKFKDGIIVAVDSRASMGSFISSQNVEKIIEINKNILGTMAGGAADCLYWEKYLGKIIKIYELRNNEKISVRAAS TILSNILYQYKGYGLCCGIILSGYDHTGFNMFYVDDSGKKVEGNLFSCGSGSTYAYSILDSAYDYNLNLDQAVELARNAI YHATFRDGGSGGKVRVFHIHKNGYDKIIEGEDVFDLHYHYTNPEQKDQYVM ; ;TTTLAFKFKDGIIVAVDSRASMGSFISSQNVEKIIEINKNILGTMAGGAADCLYWEKYLGKIIKIYELRNNEKISVRAAS TILSNILYQYKGYGLCCGIILSGYDHTGFNMFYVDDSGKKVEGNLFSCGSGSTYAYSILDSAYDYNLNLDQAVELARNAI YHATFRDGGSGGKVRVFHIHKNGYDKIIEGEDVFDLHYHYTNPEQKDQYVM ; L,Z ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MDLILYNDNLTEKKTEKENVIEHGRGFKRWYPYIDNGGTVIGLTGKDYVILAADTRLSLSYSIYTRFCPKISKLTDKCII GSSGMQSDIKTLHSLLQKKIQLFVLEHSHYPDIHVIARLLCVILYSRRFFPYYAFNILAGVDENNKGVLYNYDSVGSYCE ATHSCVGSGSQLILPILDNRVEQKNQLIKNTNFNLGDDINFVKDAITSATERDIYTGDKTLIYVIDKMGINVNTLDLKQD ; ;MDLILYNDNLTEKKTEKENVIEHGRGFKRWYPYIDNGGTVIGLTGKDYVILAADTRLSLSYSIYTRFCPKISKLTDKCII GSSGMQSDIKTLHSLLQKKIQLFVLEHSHYPDIHVIARLLCVILYSRRFFPYYAFNILAGVDENNKGVLYNYDSVGSYCE ATHSCVGSGSQLILPILDNRVEQKNQLIKNTNFNLGDDINFVKDAITSATERDIYTGDKTLIYVIDKMGINVNTLDLKQD ; M,a ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MTLGPVVTGTSVIAIKYKHGIMIAADRKASYGSYAKFQNVERIFKINNKTVMGFSGELADAQYLHELLTRKNINNLSEKK 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LWIQLNVPRIEDGNNFGVGIQEEAIQELARVEESAFNLYDAIVKYYMERAKISTKVLKYPNVSDYQEAVRELDEKEWIHI KITIVDMRNNYIMLYDLLYKNWEKVVKPKNEDAHHRMTF ; c,d,e,f,g,h,i ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 VAL n 1 3 ARG n 1 4 PRO n 1 5 SER n 1 6 GLN n 1 7 SER n 1 8 MET n 1 9 TYR n 1 10 ASP n 1 11 ARG n 1 12 HIS n 1 13 LEU n 1 14 THR n 1 15 ILE n 1 16 PHE n 1 17 SER n 1 18 PRO n 1 19 ASP n 1 20 GLY n 1 21 ASN n 1 22 LEU n 1 23 TYR n 1 24 GLN n 1 25 ILE n 1 26 GLU n 1 27 TYR n 1 28 ALA n 1 29 ILE n 1 30 LYS n 1 31 ALA n 1 32 VAL n 1 33 LYS n 1 34 ASN n 1 35 THR n 1 36 ASN n 1 37 ILE n 1 38 THR n 1 39 SER n 1 40 VAL n 1 41 GLY n 1 42 VAL n 1 43 LYS n 1 44 GLY n 1 45 GLU n 1 46 ASN n 1 47 CYS n 1 48 ALA n 1 49 VAL n 1 50 ILE n 1 51 ILE n 1 52 SER n 1 53 GLN n 1 54 LYS n 1 55 LYS n 1 56 MET n 1 57 ALA n 1 58 THR n 1 59 GLN n 1 60 TYR n 1 61 ILE n 1 62 SER n 1 63 GLN n 1 64 ASP n 1 65 LYS n 1 66 LEU n 1 67 LEU n 1 68 ASP n 1 69 TYR n 1 70 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sing N N 346 TYR CD2 CE2 doub Y N 347 TYR CD2 HD2 sing N N 348 TYR CE1 CZ doub Y N 349 TYR CE1 HE1 sing N N 350 TYR CE2 CZ sing Y N 351 TYR CE2 HE2 sing N N 352 TYR CZ OH sing N N 353 TYR OH HH sing N N 354 TYR OXT HXT sing N N 355 VAL N CA sing N N 356 VAL N H sing N N 357 VAL N H2 sing N N 358 VAL CA C sing N N 359 VAL CA CB sing N N 360 VAL CA HA sing N N 361 VAL C O doub N N 362 VAL C OXT sing N N 363 VAL CB CG1 sing N N 364 VAL CB CG2 sing N N 365 VAL CB HB sing N N 366 VAL CG1 HG11 sing N N 367 VAL CG1 HG12 sing N N 368 VAL CG1 HG13 sing N N 369 VAL CG2 HG21 sing N N 370 VAL CG2 HG22 sing N N 371 VAL CG2 HG23 sing N N 372 VAL OXT HXT sing N N 373 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 100 mM NaCl 'Sodium Chloride' 1 2 5 mM MgCl2 'Magnesium Chloride' 1 3 1 mM DTT Dithiothreitol 1 4 25 mM Tris-HCl 'Tris hydrochloride' # 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'Plasmodium falciparum 3D7' ? ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 3 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain 'BL21(DE3)' # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details 'Images were gain corrected' # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 32 _em_image_recording.average_exposure_time 10 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 5200 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Bioquantum' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details 'Relion autopick from 5 class averages resulting from 200o0 particle picked manually' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 212749 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' 'manual pick then autopick' RELION 2.1 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? 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