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_entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAEQLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDARAYDTEVRNVWATHACV PTDPNPQEVVLENVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLNCTDLRNATNTNATNTTSSSRGTMEG GEIKNCSFNITTSMRDKVQKEYALFYKLDVVPIKNDNTSYRLISCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNDK KFNGTGPCTNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEVVIRSANFTDNAKIIIVQLNKSVEINCTRPNNNTRKSIHIGP GRWFYTTGEIIGDIRQAHCNISGTKWNDTLKQIVVKLKEQFGNKTIVFNHSSGGDPEIVMHSFNCGGEFFYCNSTQLFNS TWNDGSNYTGTIVLPCRIKQIVNMWQEVGKAMYAPPIKGQIRCSSNITGLILIRDGGKNRSENTEIFRPGGGDMRDNWRS ELYKYKVVKIEPLGIAPTKCKRRVVQRRRRRR ; ;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAEQLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDARAYDTEVRNVWATHACV PTDPNPQEVVLENVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLNCTDLRNATNTNATNTTSSSRGTMEG 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;QEVLVQSGAEVKKPGASVKVSCRAFGYTFTGNALHWVRQAPGQGLEWLGWINPHSGDTTTSQKFQGRVYMTRDKSINTAF LDVTRLTSDDTGIYYCARDKYYGNEAVGMDVWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVT VSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEP ; H,O,P,Q,R,S ? 4 'polypeptide(L)' no no ;IQLTQSPSFLSASVGDKVTITCRASQGVRNELAWYQQKPGKAPNLLIYYASTLQSGVPSRFSATGSGTHFTLTVSSLQPE DFATYFCQHMSSYPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQE SVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNA ; ;IQLTQSPSFLSASVGDKVTITCRASQGVRNELAWYQQKPGKAPNLLIYYASTLQSGVPSRFSATGSGTHFTLTVSSLQPE DFATYFCQHMSSYPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQE SVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNA ; L,T,U,V,W,X ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ASP n 1 3 ALA n 1 4 MET n 1 5 LYS n 1 6 ARG n 1 7 GLY n 1 8 LEU n 1 9 CYS n 1 10 CYS n 1 11 VAL n 1 12 LEU n 1 13 LEU n 1 14 LEU n 1 15 CYS n 1 16 GLY n 1 17 ALA n 1 18 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'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6NC3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6NC3 _struct.title 'AMC011 v4.2 SOSIP Env trimer in complex with fusion peptide targeting antibody VRC34 fragment antigen binding' _struct.pdbx_descriptor ;HIV-1 Env AMC011 v4.2 SOSIP gp120, HIV-1 Env AMC011 v4.2 SOSIP gp41, Monoclonal antibody VRC34.01 fragment antigen binding heavy chain, Monoclonal antibody VRC34.01 fragment antigen binding light chain ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6NC3 _struct_keywords.text 'HIV-1 Env, SOSIP, trimer, broadly neutralizing antibody, fusion peptide, VIRAL PROTEIN, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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F CYS 228 F CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf55 disulf ? ? Q CYS 305 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 339 SG ? ? F CYS 296 F CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf56 disulf ? ? Q CYS 385 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 443 SG ? ? F CYS 378 F CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf57 disulf ? ? Q CYS 392 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 416 SG ? ? F CYS 385 F CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf58 disulf ? ? R CYS 87 SG ? ? ? 1_555 R CYS 93 SG ? ? M CYS 598 M CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf59 disulf ? ? S CYS 22 SG ? ? ? 1_555 S CYS 96 SG ? ? R CYS 22 R CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? disulf60 disulf ? ? T CYS 22 SG ? ? ? 1_555 T CYS 87 SG ? ? W CYS 23 W CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf61 disulf ? ? U CYS 59 SG ? ? ? 1_555 U CYS 79 SG ? ? G CYS 54 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.060 ? ? disulf62 disulf ? ? U CYS 124 SG ? ? ? 1_555 U CYS 214 SG ? ? G CYS 119 G CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? ? disulf63 disulf ? ? U CYS 131 SG ? ? ? 1_555 U CYS 205 SG ? ? G CYS 126 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf64 disulf ? ? U CYS 136 SG ? ? ? 1_555 U CYS 166 SG ? ? G CYS 131 G CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf65 disulf ? ? U CYS 227 SG ? ? ? 1_555 U CYS 256 SG ? ? G CYS 218 G CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf66 disulf ? ? U CYS 237 SG ? ? ? 1_555 U CYS 248 SG ? ? G CYS 228 G CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf67 disulf ? ? U CYS 305 SG ? ? ? 1_555 U CYS 339 SG ? ? G CYS 296 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf68 disulf ? ? U CYS 385 SG ? ? ? 1_555 U CYS 443 SG ? ? G CYS 378 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf69 disulf ? ? U CYS 392 SG ? ? ? 1_555 U CYS 416 SG ? ? G CYS 385 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf70 disulf ? ? V CYS 87 SG ? ? ? 1_555 V CYS 93 SG ? ? N CYS 598 N CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf71 disulf ? ? W CYS 22 SG ? ? ? 1_555 W CYS 96 SG ? ? S CYS 22 S CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? disulf72 disulf ? ? X CYS 22 SG ? ? ? 1_555 X CYS 87 SG ? ? X CYS 23 X CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? covale1 covale one ? A ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 88 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? A ASN 130 A NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 197 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 250 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? A ASN 241 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? A ASN 262 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 285 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? A ASN 276 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 304 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? A ASN 295 A NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? A ASN 332 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 446 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 448 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? E ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 88 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? E ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? C ASN 130 C NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? E ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 197 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? E ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? E ASN 250 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 241 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? E ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 262 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? E ASN 285 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 276 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? E ASN 304 ND2 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? C ASN 295 C NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? E ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 332 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? E ASN 446 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 448 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? I ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? D ASN 88 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? I ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 WB NAG . C1 ? ? D ASN 130 D NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? I ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? D ASN 197 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? I ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? D ASN 234 D NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? I ASN 250 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? D ASN 241 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? I ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? D ASN 262 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? I ASN 285 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? D ASN 276 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? I ASN 304 ND2 ? ? ? 1_555 VB NAG . C1 ? ? D ASN 295 D NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? I ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? D ASN 332 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? I ASN 446 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? D ASN 448 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? M ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? E ASN 88 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? M ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 ZB NAG . C1 ? ? E ASN 130 E NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? M ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? E ASN 197 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? M ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 XB NAG . C1 ? ? E ASN 234 E NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? M ASN 250 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? E ASN 241 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? M ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? E ASN 262 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? M ASN 285 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? E ASN 276 x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? M ASN 304 ND2 ? ? ? 1_555 YB NAG . C1 ? ? E ASN 295 E NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? M ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? E ASN 332 y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? M ASN 446 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? E ASN 448 z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? Q ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? F ASN 88 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? Q ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 CC NAG . C1 ? ? F ASN 130 F NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? Q ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? F ASN 197 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? Q ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 AC NAG . C1 ? ? F ASN 234 F NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? Q ASN 250 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? F ASN 241 2 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? Q ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? F ASN 262 3 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? Q ASN 285 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? F ASN 276 4 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? Q ASN 304 ND2 ? ? ? 1_555 BC NAG . C1 ? ? F ASN 295 F NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? Q ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? F ASN 332 5 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? Q ASN 446 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? F ASN 448 6 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? U ASN 93 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? G ASN 88 7 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? U ASN 135 ND2 ? ? ? 1_555 FC NAG . C1 ? ? G ASN 130 G NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? U ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? G ASN 197 8 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? U ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 DC NAG . C1 ? ? G ASN 234 G NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? U ASN 250 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? G ASN 241 9 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? U ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? G ASN 262 AA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale57 covale one ? U ASN 285 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? G ASN 276 BA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale58 covale one ? U ASN 304 ND2 ? ? ? 1_555 EC NAG . C1 ? ? G ASN 295 G NAG 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale59 covale one ? U ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? G ASN 332 CA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? N-Glycosylation covale60 covale one ? U ASN 446 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? G ASN 448 DA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale61 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale62 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale63 covale one ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale64 covale one ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.108 ? ? covale65 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale66 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? ? covale67 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale68 covale one ? AA BMA . O6 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a BMA 3 a MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale69 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale70 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? ? covale71 covale one ? BA BMA . O3 ? ? ? 1_555 BA MAN . C1 ? ? b BMA 3 b MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? ? covale72 covale one ? BA BMA . O6 ? ? ? 1_555 BA MAN . C1 ? ? b BMA 3 b MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale73 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale74 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? ? covale75 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? ? covale76 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale77 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale78 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale79 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale80 covale one ? FA BMA . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale81 covale one ? FA BMA . O6 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.108 ? ? covale82 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale83 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale84 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA BMA . C1 ? ? h NAG 2 h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale85 covale one ? HA BMA . O6 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h BMA 3 h MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale86 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale87 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale88 covale one ? IA BMA . O3 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.480 ? ? covale89 covale one ? IA BMA . O6 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale90 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale91 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? ? covale92 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA BMA . C1 ? ? k NAG 2 k BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? ? covale93 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale94 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA BMA . C1 ? ? l NAG 2 l BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale95 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? m NAG 1 m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale96 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA BMA . C1 ? ? m NAG 2 m BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale97 covale one ? MA BMA . O3 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? m BMA 3 m MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale98 covale one ? MA BMA . O6 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? m BMA 3 m MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.109 ? ? covale99 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? n NAG 1 n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale100 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale101 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA BMA . C1 ? ? o NAG 2 o BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale102 covale one ? OA BMA . O6 ? ? ? 1_555 OA MAN . C1 ? ? o BMA 3 o MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale103 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? p NAG 1 p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale104 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA BMA . C1 ? ? p NAG 2 p BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale105 covale one ? PA BMA . O3 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p BMA 3 p MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? ? covale106 covale one ? PA BMA . O6 ? ? ? 1_555 PA MAN . C1 ? ? p BMA 3 p MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale107 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? q NAG 1 q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale108 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? ? covale109 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA BMA . C1 ? ? r NAG 2 r BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? ? covale110 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? s NAG 1 s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale111 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA BMA . C1 ? ? s NAG 2 s BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? ? covale112 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? t NAG 1 t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale113 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA BMA . C1 ? ? t NAG 2 t BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale114 covale one ? TA BMA . O3 ? ? ? 1_555 TA MAN . C1 ? ? t BMA 3 t MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale115 covale one ? TA BMA . O6 ? ? ? 1_555 TA MAN . C1 ? ? t BMA 3 t MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.108 ? ? covale116 covale both ? UA NAG . O4 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? u NAG 1 u NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale117 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? v NAG 1 v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? ? covale118 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA BMA . C1 ? ? v NAG 2 v BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale119 covale one ? VA BMA . O6 ? ? ? 1_555 VA MAN . C1 ? ? v BMA 3 v MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale120 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? w NAG 1 w NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale121 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA BMA . C1 ? ? w NAG 2 w BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? ? covale122 covale one ? WA BMA . O3 ? ? ? 1_555 WA MAN . C1 ? ? w BMA 3 w MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? ? covale123 covale one ? WA BMA . O6 ? ? ? 1_555 WA MAN . C1 ? ? w BMA 3 w MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale124 covale both ? XA NAG . O4 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? x NAG 1 x NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale125 covale both ? YA NAG . O4 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? y NAG 1 y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? ? covale126 covale both ? YA NAG . O4 ? ? ? 1_555 YA BMA . C1 ? ? y NAG 2 y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? ? covale127 covale both ? ZA NAG . O4 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? z NAG 1 z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale128 covale both ? ZA NAG . O4 ? ? ? 1_555 ZA BMA . C1 ? ? z NAG 2 z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale129 covale both ? AB NAG . O4 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? 0 NAG 1 0 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale130 covale both ? AB NAG . O4 ? ? ? 1_555 AB BMA . C1 ? ? 0 NAG 2 0 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale131 covale one ? AB BMA . O3 ? ? ? 1_555 AB MAN . C1 ? ? 0 BMA 3 0 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale132 covale one ? AB BMA . O6 ? ? ? 1_555 AB MAN . C1 ? ? 0 BMA 3 0 MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.108 ? ? covale133 covale both ? BB NAG . O4 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? 1 NAG 1 1 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale134 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? 2 NAG 1 2 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale135 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB BMA . C1 ? ? 2 NAG 2 2 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale136 covale one ? CB BMA . O6 ? ? ? 1_555 CB MAN . C1 ? ? 2 BMA 3 2 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale137 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? 3 NAG 1 3 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale138 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB BMA . C1 ? ? 3 NAG 2 3 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale139 covale one ? DB BMA . O3 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? 3 BMA 3 3 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.480 ? ? covale140 covale one ? DB BMA . O6 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? 3 BMA 3 3 MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale141 covale both ? EB NAG . O4 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? 4 NAG 1 4 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale142 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? 5 NAG 1 5 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? ? covale143 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB BMA . C1 ? ? 5 NAG 2 5 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? ? covale144 covale both ? GB NAG . O4 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? 6 NAG 1 6 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale145 covale both ? GB NAG . O4 ? ? ? 1_555 GB BMA . C1 ? ? 6 NAG 2 6 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale146 covale both ? HB NAG . O4 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? 7 NAG 1 7 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale147 covale both ? HB NAG . O4 ? ? ? 1_555 HB BMA . C1 ? ? 7 NAG 2 7 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale148 covale one ? HB BMA . O3 ? ? ? 1_555 HB MAN . C1 ? ? 7 BMA 3 7 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale149 covale one ? HB BMA . O6 ? ? ? 1_555 HB MAN . C1 ? ? 7 BMA 3 7 MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.109 ? ? covale150 covale both ? IB NAG . O4 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? 8 NAG 1 8 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? ? covale151 covale both ? JB NAG . O4 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? 9 NAG 1 9 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale152 covale both ? JB NAG . O4 ? ? ? 1_555 JB BMA . C1 ? ? 9 NAG 2 9 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale153 covale one ? JB BMA . O6 ? ? ? 1_555 JB MAN . C1 ? ? 9 BMA 3 9 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale154 covale both ? KB NAG . O4 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? AA NAG 1 AA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale155 covale both ? KB NAG . O4 ? ? ? 1_555 KB BMA . C1 ? ? AA NAG 2 AA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? ? covale156 covale one ? KB BMA . O3 ? ? ? 1_555 KB MAN . C1 ? ? AA BMA 3 AA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? ? covale157 covale one ? KB BMA . O6 ? ? ? 1_555 KB MAN . C1 ? ? AA BMA 3 AA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale158 covale both ? LB NAG . O4 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? BA NAG 1 BA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ? ? covale159 covale both ? MB NAG . O4 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? CA NAG 1 CA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? ? covale160 covale both ? MB NAG . O4 ? ? ? 1_555 MB BMA . C1 ? ? CA NAG 2 CA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.479 ? ? covale161 covale both ? NB NAG . O4 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? DA NAG 1 DA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale162 covale both ? NB NAG . O4 ? ? ? 1_555 NB BMA . C1 ? ? DA NAG 2 DA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 93 D . ? 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anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? 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parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AD9 5 6 ? anti-parallel AE1 1 2 ? parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE3 5 6 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AE9 4 5 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF1 5 6 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF2 4 5 ? anti-parallel AF2 5 6 ? anti-parallel AF3 1 2 ? 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'n-dodecyl beta-D-maltoside' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.57 # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? 2 1 11676 ? ? 'Human immunodeficiency virus 1' ? ? ? ? 3 2 11676 ? ? 'Human immunodeficiency virus 1' ? ? ? ? 4 3 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain _em_entity_assembly_recombinant.cell 2 1 9606 'Homo sapiens' ? ? ? 3 2 9606 'Homo sapiens' ? ? ? 4 3 9606 'Homo sapiens' ? ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 56 _em_image_recording.average_exposure_time 12 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 2834 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name ? _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width ? _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? 'DoG Picker' ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf 1.06 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? Rosetta 3.10 ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? cryoSPARC ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 5 _em_specimen.details 'SEC purified sample after overnight incubation of molar excess Fab to trimer' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'P01 AI110657' 1 'Bill & Melinda Gates Foundation' 'United States' OPP1115782 2 'Bill & Melinda Gates Foundation' 'United States' OPP1084519 3 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'F31 Al131873' 4 'Other private' 'United States' 109718-63-RKNT 5 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero Y 5 NAG 1 Y NAG 1 A NAG 1088 n Y 5 NAG 2 Y NAG 2 A NAG 1089 n Y 5 BMA 3 Y BMA 3 A BMA 1090 n Y 5 MAN 4 Y MAN 4 A MAN 1091 n Y 5 MAN 5 Y MAN 5 A MAN 1092 n Z 6 NAG 1 Z NAG 1 A NAG 1197 n Z 6 NAG 2 Z NAG 2 A NAG 1198 n AA 7 NAG 1 a NAG 1 A NAG 1241 n AA 7 NAG 2 a NAG 2 A NAG 1242 n AA 7 BMA 3 a BMA 3 A BMA 1243 n AA 7 MAN 4 a MAN 4 A MAN 1244 n BA 5 NAG 1 b NAG 1 A NAG 1262 n BA 5 NAG 2 b NAG 2 A NAG 1263 n BA 5 BMA 3 b BMA 3 A BMA 1264 n BA 5 MAN 4 b MAN 4 A MAN 1265 n BA 5 MAN 5 b MAN 5 A MAN 1266 n CA 6 NAG 1 c NAG 1 A NAG 1276 n CA 6 NAG 2 c NAG 2 A NAG 1277 n DA 8 NAG 1 d NAG 1 A NAG 1332 n DA 8 NAG 2 d NAG 2 A NAG 1333 n DA 8 BMA 3 d BMA 3 A BMA 1334 n EA 8 NAG 1 e NAG 1 A NAG 1448 n EA 8 NAG 2 e NAG 2 A NAG 1449 n EA 8 BMA 3 e BMA 3 A BMA 1450 n FA 5 NAG 1 f NAG 1 C NAG 1088 n FA 5 NAG 2 f NAG 2 C NAG 1089 n FA 5 BMA 3 f BMA 3 C BMA 1090 n FA 5 MAN 4 f MAN 4 C MAN 1091 n FA 5 MAN 5 f MAN 5 C MAN 1092 n GA 6 NAG 1 g NAG 1 C NAG 1197 n GA 6 NAG 2 g NAG 2 C NAG 1198 n HA 7 NAG 1 h NAG 1 C NAG 1241 n HA 7 NAG 2 h NAG 2 C NAG 1242 n HA 7 BMA 3 h BMA 3 C BMA 1243 n HA 7 MAN 4 h MAN 4 C MAN 1244 n IA 5 NAG 1 i NAG 1 C NAG 1262 n IA 5 NAG 2 i NAG 2 C NAG 1263 n IA 5 BMA 3 i BMA 3 C BMA 1264 n IA 5 MAN 4 i MAN 4 C MAN 1265 n IA 5 MAN 5 i MAN 5 C MAN 1266 n JA 6 NAG 1 j NAG 1 C NAG 1276 n JA 6 NAG 2 j NAG 2 C NAG 1277 n KA 8 NAG 1 k NAG 1 C NAG 1332 n KA 8 NAG 2 k NAG 2 C NAG 1333 n KA 8 BMA 3 k BMA 3 C BMA 1334 n LA 8 NAG 1 l NAG 1 C NAG 1448 n LA 8 NAG 2 l NAG 2 C NAG 1449 n LA 8 BMA 3 l BMA 3 C BMA 1450 n MA 5 NAG 1 m NAG 1 D NAG 1088 n MA 5 NAG 2 m NAG 2 D NAG 1089 n MA 5 BMA 3 m BMA 3 D BMA 1090 n MA 5 MAN 4 m MAN 4 D MAN 1091 n MA 5 MAN 5 m MAN 5 D MAN 1092 n NA 6 NAG 1 n NAG 1 D NAG 1197 n NA 6 NAG 2 n NAG 2 D NAG 1198 n OA 7 NAG 1 o NAG 1 D NAG 1241 n OA 7 NAG 2 o NAG 2 D NAG 1242 n OA 7 BMA 3 o BMA 3 D BMA 1243 n OA 7 MAN 4 o MAN 4 D MAN 1244 n PA 5 NAG 1 p NAG 1 D NAG 1262 n PA 5 NAG 2 p NAG 2 D NAG 1263 n PA 5 BMA 3 p BMA 3 D BMA 1264 n PA 5 MAN 4 p MAN 4 D MAN 1265 n PA 5 MAN 5 p MAN 5 D MAN 1266 n QA 6 NAG 1 q NAG 1 D NAG 1276 n QA 6 NAG 2 q NAG 2 D NAG 1277 n RA 8 NAG 1 r NAG 1 D NAG 1332 n RA 8 NAG 2 r NAG 2 D NAG 1333 n RA 8 BMA 3 r BMA 3 D BMA 1334 n SA 8 NAG 1 s NAG 1 D NAG 1448 n SA 8 NAG 2 s NAG 2 D NAG 1449 n SA 8 BMA 3 s BMA 3 D BMA 1450 n TA 5 NAG 1 t NAG 1 E NAG 1088 n TA 5 NAG 2 t NAG 2 E NAG 1089 n TA 5 BMA 3 t BMA 3 E BMA 1090 n TA 5 MAN 4 t MAN 4 E MAN 1091 n TA 5 MAN 5 t MAN 5 E MAN 1092 n UA 6 NAG 1 u NAG 1 E NAG 1197 n UA 6 NAG 2 u NAG 2 E NAG 1198 n VA 7 NAG 1 v NAG 1 E NAG 1241 n VA 7 NAG 2 v NAG 2 E NAG 1242 n VA 7 BMA 3 v BMA 3 E BMA 1243 n VA 7 MAN 4 v MAN 4 E MAN 1244 n WA 5 NAG 1 w NAG 1 E NAG 1262 n WA 5 NAG 2 w NAG 2 E NAG 1263 n WA 5 BMA 3 w BMA 3 E BMA 1264 n WA 5 MAN 4 w MAN 4 E MAN 1265 n WA 5 MAN 5 w MAN 5 E MAN 1266 n XA 6 NAG 1 x NAG 1 E NAG 1276 n XA 6 NAG 2 x NAG 2 E NAG 1277 n YA 8 NAG 1 y NAG 1 E NAG 1332 n YA 8 NAG 2 y NAG 2 E NAG 1333 n YA 8 BMA 3 y BMA 3 E BMA 1334 n ZA 8 NAG 1 z NAG 1 E NAG 1448 n ZA 8 NAG 2 z NAG 2 E NAG 1449 n ZA 8 BMA 3 z BMA 3 E BMA 1450 n AB 5 NAG 1 0 NAG 1 F NAG 1088 n AB 5 NAG 2 0 NAG 2 F NAG 1089 n AB 5 BMA 3 0 BMA 3 F BMA 1090 n AB 5 MAN 4 0 MAN 4 F MAN 1091 n AB 5 MAN 5 0 MAN 5 F MAN 1092 n BB 6 NAG 1 1 NAG 1 F NAG 1197 n BB 6 NAG 2 1 NAG 2 F NAG 1198 n CB 7 NAG 1 2 NAG 1 F NAG 1241 n CB 7 NAG 2 2 NAG 2 F NAG 1242 n CB 7 BMA 3 2 BMA 3 F BMA 1243 n CB 7 MAN 4 2 MAN 4 F MAN 1244 n DB 5 NAG 1 3 NAG 1 F NAG 1262 n DB 5 NAG 2 3 NAG 2 F NAG 1263 n DB 5 BMA 3 3 BMA 3 F BMA 1264 n DB 5 MAN 4 3 MAN 4 F MAN 1265 n DB 5 MAN 5 3 MAN 5 F MAN 1266 n EB 6 NAG 1 4 NAG 1 F NAG 1276 n EB 6 NAG 2 4 NAG 2 F NAG 1277 n FB 8 NAG 1 5 NAG 1 F NAG 1332 n FB 8 NAG 2 5 NAG 2 F NAG 1333 n FB 8 BMA 3 5 BMA 3 F BMA 1334 n GB 8 NAG 1 6 NAG 1 F NAG 1448 n GB 8 NAG 2 6 NAG 2 F NAG 1449 n GB 8 BMA 3 6 BMA 3 F BMA 1450 n HB 5 NAG 1 7 NAG 1 G NAG 1088 n HB 5 NAG 2 7 NAG 2 G NAG 1089 n HB 5 BMA 3 7 BMA 3 G BMA 1090 n HB 5 MAN 4 7 MAN 4 G MAN 1091 n HB 5 MAN 5 7 MAN 5 G MAN 1092 n IB 6 NAG 1 8 NAG 1 G NAG 1197 n IB 6 NAG 2 8 NAG 2 G NAG 1198 n JB 7 NAG 1 9 NAG 1 G NAG 1241 n JB 7 NAG 2 9 NAG 2 G NAG 1242 n JB 7 BMA 3 9 BMA 3 G BMA 1243 n JB 7 MAN 4 9 MAN 4 G MAN 1244 n KB 5 NAG 1 AA NAG 1 G NAG 1262 n KB 5 NAG 2 AA NAG 2 G NAG 1263 n KB 5 BMA 3 AA BMA 3 G BMA 1264 n KB 5 MAN 4 AA MAN 4 G MAN 1265 n KB 5 MAN 5 AA MAN 5 G MAN 1266 n LB 6 NAG 1 BA NAG 1 G NAG 1276 n LB 6 NAG 2 BA NAG 2 G NAG 1277 n MB 8 NAG 1 CA NAG 1 G NAG 1332 n MB 8 NAG 2 CA NAG 2 G NAG 1333 n MB 8 BMA 3 CA BMA 3 G BMA 1334 n NB 8 NAG 1 DA NAG 1 G NAG 1448 n NB 8 NAG 2 DA NAG 2 G NAG 1449 n NB 8 BMA 3 DA BMA 3 G BMA 1450 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 7 DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 7 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c6-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 7 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 10 8 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 11 8 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 12 8 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 4 5 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 5 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 6 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 7 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 8 7 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 9 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 10 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 5 MAN 4 n 5 MAN 5 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 7 BMA 3 n 7 MAN 4 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #