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_audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Gouaux, E.' 1 0000-0002-8549-2360 'Zhao, Y.' 2 0000-0002-4348-256X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 364 _citation.language ? _citation.page_first 355 _citation.page_last 362 _citation.title 'Architecture and subunit arrangement of native AMPA receptors elucidated by cryo-EM.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.aaw8250 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30975770 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhao, Y.' 1 ? primary 'Chen, S.' 2 ? primary 'Swensen, A.C.' 3 ? primary 'Qian, W.J.' 4 ? primary 'Gouaux, E.' 5 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Glutamate receptor 1' 101518.773 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Glutamate receptor 2' 98783.805 2 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Glutamate receptor 3' 100556.680 1 ? ? ? ? 4 polymer nat ;A'-C' auxiliary proteins ; 13039.064 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit' 35938.746 2 ? ? ? ? 6 polymer man '11B8 scFv' 27511.527 1 ? ? ? ? 7 polymer man '15F1 Fab light chain' 25111.660 2 ? ? ? ? 8 polymer man '15F1 Fab heavy chain' 27975.439 2 ? ? ? ? 9 polymer nat '5B2 Fab' 19081.451 2 ? ? ? ? 10 branched man 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_entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MPYIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSK GVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQEALISIIDHYKWQTFVYIYDADRGLSVLQR VLDTAAEKNWQVTAVNILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIVKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPARIMQQWRTSDSRDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNA GDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGD NSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRF SPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTV ERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES 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'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; E,G ? 5 'polypeptide(L)' no no 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;EVKLLESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFDFSEYWMSWVRQAPGKGLEWIGEINPDSSSIDYTPSLKDKIIISRDNAKKTLY LQLSKVRSEDTALYYCARPRGNYVVMDYWGQGTSVTVSSSGGGGSGGGGSGGGGNIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRAS ESVDSYGSSFVHWYQQKPGQPPKLLIFLASKLESGVPARFSGSGSRTDFTLTIDPVEADDAATYYCQQTNEDPYTFGGGT KLEIKRASNWSHPQFEK ; I ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MEIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISNYLSWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGIDYSLTINNLE QEDFATYFCQQGNTLPLTFGAGTKLELKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGV LNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNECSNWSHPQFEK ; ;MEIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISNYLSWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGIDYSLTINNLE QEDFATYFCQQGNTLPLTFGAGTKLELKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGV LNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNECSNWSHPQFEK ; J,N ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MVSAIVLYVLLAAAAHSAFAMQAQLKESGPGLVAPSQSLSITCTVSGFSLTNYGVHWVRQPPGKGLEWLGVIWAGGSTNY NSALMSRVSISKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTVMYYCAREDYDYDWHFDVWGAGTTVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTN 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(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; L,M ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PRO n 1 3 TYR n 1 4 ILE n 1 5 PHE n 1 6 ALA n 1 7 PHE n 1 8 PHE n 1 9 CYS n 1 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 6 1 sample 'Biological sequence' 1 257 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 907 Rat 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 883 Rat 'Rattus norvegicus' 10116 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 888 Rat 'Rattus norvegicus' 10116 ? 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LYS N 184 ARG N 189 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 75 SG ? ? ? 1_555 A CYS 323 SG ? ? A CYS 57 A CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 732 SG ? ? ? 1_555 A CYS 787 SG ? ? A CYS 718 A CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 78 SG ? ? ? 1_555 B CYS 330 SG ? ? B CYS 57 B CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 739 SG ? ? ? 1_555 B CYS 794 SG ? ? B CYS 718 B CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 85 SG ? ? ? 1_555 C CYS 334 SG ? ? C CYS 63 C CYS 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 744 SG ? ? ? 1_555 C CYS 799 SG ? ? C CYS 718 C CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 78 SG ? ? ? 1_555 D CYS 330 SG ? ? D CYS 57 D CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 739 SG ? ? ? 1_555 D CYS 794 SG ? ? D CYS 718 D CYS 773 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf9 disulf ? ? F CYS 67 SG ? ? ? 1_555 F CYS 77 SG ? ? F CYS 67 F CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf10 disulf ? ? H CYS 67 SG ? ? ? 1_555 H CYS 77 SG ? ? H CYS 67 H CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? A ASN 63 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 45 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 249 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 231 A NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 363 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 345 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale4 covale none ? A HIS 367 CE1 ? ? ? 1_555 A LYS 378 CE ? ? A HIS 349 A LYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.076 ? ? covale5 covale none ? A HIS 367 NE2 ? ? ? 1_555 A LYS 378 CE ? ? A HIS 349 A LYS 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.305 ? ? covale6 covale none ? A LYS 372 NZ ? ? ? 1_555 Y NAG . C5 ? ? A LYS 354 A NAG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale7 covale none ? A GLN 600 OE1 ? ? ? 1_555 D ARG 607 CZ ? ? A GLN 586 D ARG 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.488 ? ? covale8 covale one ? B ASN 256 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 235 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 370 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 349 B NAG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? C ASN 57 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 35 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale11 covale none ? C GLU 60 OE2 ? ? ? 1_555 T NAG . C8 ? ? C GLU 38 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? ? covale12 covale one ? C ASN 260 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 238 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 374 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 352 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale14 covale none ? C LYS 533 CB ? ? ? 1_555 C LYS 807 NZ ? ? C LYS 509 C LYS 781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? ? covale15 covale one ? D ASN 256 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? D ASN 235 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? D ASN 370 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? D ASN 349 D NAG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale17 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? ? covale18 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale19 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale20 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale21 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale22 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale23 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale24 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale25 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale26 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale27 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? ? covale28 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale29 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 52 A . ? PRO 34 A PRO 53 A ? PRO 35 A 1 -3.10 2 ASN 326 A . ? ASN 308 A PRO 327 A ? PRO 309 A 1 -0.56 3 ASP 417 A . ? ASP 403 A PRO 418 A ? PRO 404 A 1 -6.03 4 GLU 692 A . ? GLU 678 A PRO 693 A ? PRO 679 A 1 0.31 5 LYS 730 A . ? LYS 716 A PRO 731 A ? PRO 717 A 1 -0.38 6 ASN 333 B . ? ASN 312 B PRO 334 B ? PRO 313 B 1 -8.33 7 SER 424 B . ? SER 403 B PRO 425 B ? PRO 404 B 1 -3.45 8 GLU 699 B . ? GLU 678 B PRO 700 B ? PRO 679 B 1 -1.22 9 LYS 737 B . ? LYS 716 B PRO 738 B ? PRO 717 B 1 1.41 10 PRO 25 C . ? PRO 3 C ASN 26 C ? ASN 4 C 1 6.31 11 ASN 337 C . ? ASN 315 C PRO 338 C ? PRO 316 C 1 -1.40 12 SER 427 C . ? SER 403 C PRO 428 C ? PRO 404 C 1 -5.15 13 GLU 704 C . ? GLU 678 C PRO 705 C ? PRO 679 C 1 -1.59 14 LYS 742 C . ? LYS 716 C PRO 743 C ? PRO 717 C 1 0.55 15 ASN 333 D . ? ASN 312 D PRO 334 D ? PRO 313 D 1 -7.05 16 SER 424 D . ? SER 403 D PRO 425 D ? PRO 404 D 1 -3.04 17 GLU 699 D . ? GLU 678 D PRO 700 D ? PRO 679 D 1 -1.38 18 LYS 737 D . ? LYS 716 D PRO 738 D ? PRO 717 D 1 -0.74 19 SER 141 I . ? SER 140 I PRO 142 I ? PRO 141 I 1 -1.35 20 ASP 214 I . ? ASP 213 I PRO 215 I ? PRO 214 I 1 0.28 21 ASP 232 I . ? ASP 231 I PRO 233 I ? PRO 232 I 1 0.65 22 LEU 95 J . ? LEU 95 J PRO 96 J ? PRO 96 J 1 0.26 23 TYR 141 J . ? TYR 141 J PRO 142 J ? PRO 142 J 1 0.00 24 PHE 173 K . ? PHE 153 K PRO 174 K ? PRO 154 K 1 -2.90 25 GLU 175 K . ? GLU 155 K PRO 176 K ? PRO 156 K 1 -2.17 26 TRP 215 K . ? TRP 195 K PRO 216 K ? PRO 196 K 1 -0.23 27 UNK 102 L . ? UNK 220 L UNK 103 L ? UNK 221 L 1 0.30 28 UNK 152 L . ? UNK 270 L UNK 153 L ? UNK 271 L 1 1.11 29 UNK 194 L . ? UNK 312 L UNK 195 L ? UNK 313 L 1 1.47 30 UNK 94 M . ? UNK 94 M UNK 95 M ? UNK 95 M 1 -0.32 31 UNK 140 M . ? UNK 140 M UNK 141 M ? UNK 141 M 1 1.46 32 LEU 95 N . ? LEU 95 N PRO 96 N ? PRO 96 N 1 -0.22 33 TYR 141 N . ? TYR 141 N PRO 142 N ? PRO 142 N 1 -0.16 34 PHE 173 O . ? PHE 153 O PRO 174 O ? PRO 154 O 1 -2.20 35 GLU 175 O . ? GLU 155 O PRO 176 O ? PRO 156 O 1 -1.66 36 TRP 215 O . ? TRP 195 O PRO 216 O ? PRO 196 O 1 0.31 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 8 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 8 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 8 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 8 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 5 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 6 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 6 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 6 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 3 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 6 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 4 ? AF8 ? 4 ? AF9 ? 3 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 3 ? AG3 ? 5 ? AG4 ? 4 ? AG5 ? 4 ? AG6 ? 6 ? AG7 ? 3 ? AG8 ? 4 ? AG9 ? 4 ? AH1 ? 4 ? AH2 ? 6 ? AH3 ? 4 ? AH4 ? 4 ? AH5 ? 4 ? 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anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? parallel AB8 4 5 ? parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC7 6 7 ? anti-parallel AC7 7 8 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? 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'Rattus norvegicus' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 54 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name ? _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width ? _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? SerialEM ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' ? ? ? ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? 12 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 13 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 14 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 15 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 4 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero P 10 NAG 1 P NAG 1 A NAG 903 n P 10 NAG 2 P NAG 2 A NAG 904 n P 10 BMA 3 P BMA 3 A BMA 905 n Q 10 NAG 1 Q NAG 1 A NAG 906 n Q 10 NAG 2 Q NAG 2 A NAG 907 n Q 10 BMA 3 Q BMA 3 A BMA 908 n R 11 NAG 1 R NAG 1 A NAG 909 n R 11 NAG 2 R NAG 2 A NAG 910 n S 11 NAG 1 S NAG 1 B NAG 900 n S 11 NAG 2 S NAG 2 B NAG 901 n T 10 NAG 1 T NAG 1 C NAG 900 n T 10 NAG 2 T NAG 2 C NAG 901 n T 10 BMA 3 T BMA 3 C BMA 902 n U 10 NAG 1 U NAG 1 C NAG 903 n U 10 NAG 2 U NAG 2 C NAG 904 n U 10 BMA 3 U BMA 3 C BMA 905 n V 10 NAG 1 V NAG 1 C NAG 906 n V 10 NAG 2 V NAG 2 C NAG 907 n V 10 BMA 3 V BMA 3 C BMA 908 n W 11 NAG 1 W NAG 1 D NAG 900 n W 11 NAG 2 W NAG 2 D NAG 901 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 10 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 10 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 10 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 11 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 11 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 11 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 11 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n 11 NAG 1 n 11 NAG 2 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 12 '{[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid' ZK1 13 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #