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_refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.001 ? 22510 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.460 ? 40835 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 3.029 ? 8868 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.033 ? 1753 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.001 ? 3299 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6PEK _struct.title 'Structure of Spastin Hexamer (Subunit A-E) in complex with substrate peptide' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6PEK _struct_keywords.text 'AAA+ ATPase, Microtubule Severing, MOTOR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MOTOR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 3 ? K N N 4 ? L N N 5 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 5 ? P N N 3 ? Q N N 4 ? R N N 5 ? S N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SPAST_HUMAN Q9UBP0 Q9UBP0-2 1 ;MAAKRSSGAAPAPASASAPAPVPGGEAERVRVFHKQAFEYISIALRIDEDEKAGQKEQAVEWYKKGIEELEKGIAVIVTG QGEQCERARRLQAKMMTNLVMAKDRLQLLESGAVPKRKDPLTHTSNSLPRSKTVMKTGSAGLSGHHRAPSYSGLSMVSGV KQGSGPAPTTHKGTPKTNRTNKPSTPTTATRKKKDLKNFRNVDSNLANLIMNEIVDNGTAVKFDDIAGQDLAKQALQEIV ILPSLRPELFTGLRAPARGLLLFGPPGNGKTMLAKAVAAESNATFFNISAASLTSKYVGEGEKLVRALFAVARELQPSII FIDEVDSLLCERREGEHDASRRLKTEFLIEFDGVQSAGDDRVLVMGATNRPQELDEAVLRRFIKRVYVSLPNEETRLLLL KNLLCKQGSPLTQKELAQLARMTDGYSGSDLTALAKDAALGPIRELKPEQVKNMSASEMRNIRLSDFTESLKKIKRSVSP QTLEAYIRWNKDFGDTTV ; 87 2 PDB 6PEK 6PEK ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6PEK A 1 ? 498 ? 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Q9UBP0 87 ? 584 ? 119 616 6 2 6PEK G 1 ? 10 ? 6PEK 1 ? 10 ? 1 10 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 206 ? ILE A 214 ? LEU A 324 ILE A 332 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 222 ? ILE A 226 ? LYS A 340 ILE A 344 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 229 ? ARG A 246 ? GLN A 347 ARG A 364 1 ? 18 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 269 ? SER A 281 ? GLY A 387 SER A 399 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU A 300 ? LEU A 315 ? GLU A 418 LEU A 433 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 AA6 HIS A 337 ? VAL A 354 ? HIS A 455 VAL A 472 1 ? 18 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 375 ? ARG A 380 ? ASP A 493 ARG A 498 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN A 392 ? LEU A 404 ? ASN A 510 LEU A 522 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 THR A 412 ? THR A 423 ? THR A 530 THR A 541 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 SER A 427 ? ALA A 439 ? SER A 545 ALA A 557 1 ? 13 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 440 ? GLU A 445 ? LEU A 558 GLU A 563 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 LYS A 447 ? MET A 454 ? LYS A 565 MET A 572 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 ARG A 463 ? LYS A 472 ? ARG A 581 LYS A 590 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 479 ? LYS A 491 ? SER A 597 LYS A 609 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU B 206 ? ILE B 214 ? LEU B 324 ILE B 332 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 AB7 GLN B 229 ? ARG B 246 ? GLN B 347 ARG B 364 1 ? 18 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY B 269 ? ASN B 282 ? GLY B 387 ASN B 400 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY B 299 ? LEU B 315 ? GLY B 417 LEU B 433 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 AC1 HIS B 337 ? ASP B 352 ? HIS B 455 ASP B 470 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP B 375 ? PHE B 382 ? ASP B 493 PHE B 500 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN B 392 ? LEU B 404 ? ASN B 510 LEU B 522 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 THR B 412 ? THR B 423 ? THR B 530 THR B 541 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 SER B 427 ? GLU B 445 ? SER B 545 GLU B 563 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 AC6 LYS B 447 ? MET B 454 ? LYS B 565 MET B 572 1 ? 8 HELX_P HELX_P25 AC7 ARG B 463 ? LYS B 472 ? ARG B 581 LYS B 590 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 AC8 SER B 479 ? LYS B 491 ? SER B 597 LYS B 609 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 AC9 LEU C 206 ? ILE C 214 ? LEU C 324 ILE C 332 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 AD1 GLN C 229 ? ARG C 246 ? GLN C 347 ARG C 364 1 ? 18 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY C 269 ? SER C 281 ? GLY C 387 SER C 399 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 SER C 289 ? THR C 294 ? SER C 407 THR C 412 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY C 299 ? LEU C 315 ? GLY C 417 LEU C 433 1 ? 17 HELX_P HELX_P32 AD5 HIS C 337 ? GLY C 353 ? HIS C 455 GLY C 471 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 AD6 ARG C 370 ? LEU C 374 ? ARG C 488 LEU C 492 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP C 375 ? PHE C 382 ? ASP C 493 PHE C 500 1 ? 8 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN C 392 ? LEU C 404 ? ASN C 510 LEU C 522 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 THR C 412 ? THR C 423 ? THR C 530 THR C 541 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 AE1 SER C 427 ? GLU C 445 ? SER C 545 GLU C 563 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 AE2 LYS C 447 ? MET C 454 ? LYS C 565 MET C 572 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG C 463 ? LEU C 471 ? ARG C 581 LEU C 589 1 ? 9 HELX_P HELX_P40 AE4 SER C 479 ? LYS C 491 ? SER C 597 LYS C 609 1 ? 13 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP D 203 ? ILE D 214 ? ASP D 321 ILE D 332 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 GLN D 229 ? ARG D 246 ? GLN D 347 ARG D 364 1 ? 18 HELX_P HELX_P43 AE7 GLY D 269 ? ASN D 282 ? GLY D 387 ASN D 400 1 ? 14 HELX_P HELX_P44 AE8 GLU D 300 ? LEU D 315 ? GLU D 418 LEU D 433 1 ? 16 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU D 324 ? LEU D 329 ? GLU D 442 LEU D 447 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 HIS D 337 ? ASP D 352 ? HIS D 455 ASP D 470 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 AF2 ARG D 370 ? LEU D 374 ? ARG D 488 LEU D 492 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 AF3 ASP D 375 ? PHE D 382 ? ASP D 493 PHE D 500 1 ? 8 HELX_P HELX_P49 AF4 ASN D 392 ? LEU D 404 ? ASN D 510 LEU D 522 1 ? 13 HELX_P HELX_P50 AF5 THR D 412 ? THR D 423 ? THR D 530 THR D 541 1 ? 12 HELX_P HELX_P51 AF6 SER D 427 ? LEU D 446 ? SER D 545 LEU D 564 1 ? 20 HELX_P HELX_P52 AF7 LYS D 447 ? MET D 454 ? LYS D 565 MET D 572 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 AF8 ARG D 463 ? LEU D 471 ? ARG D 581 LEU D 589 1 ? 9 HELX_P HELX_P54 AF9 SER D 479 ? ASP D 492 ? SER D 597 ASP D 610 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 AG1 LEU E 206 ? VAL E 215 ? LEU E 324 VAL E 333 1 ? 10 HELX_P HELX_P56 AG2 LYS E 222 ? ILE E 226 ? LYS E 340 ILE E 344 5 ? 5 HELX_P HELX_P57 AG3 GLN E 229 ? ARG E 246 ? GLN E 347 ARG E 364 1 ? 18 HELX_P HELX_P58 AG4 GLY E 269 ? ASN E 282 ? GLY E 387 ASN E 400 1 ? 14 HELX_P HELX_P59 AG5 GLY E 299 ? LEU E 315 ? GLY E 417 LEU E 433 1 ? 17 HELX_P HELX_P60 AG6 GLU E 324 ? LEU E 328 ? GLU E 442 LEU E 446 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 HIS E 337 ? PHE E 351 ? HIS E 455 PHE E 469 1 ? 15 HELX_P HELX_P62 AG8 ARG E 370 ? LEU E 374 ? ARG E 488 LEU E 492 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 AG9 ASP E 375 ? PHE E 382 ? ASP E 493 PHE E 500 1 ? 8 HELX_P HELX_P64 AH1 ASN E 392 ? LEU E 404 ? ASN E 510 LEU E 522 1 ? 13 HELX_P HELX_P65 AH2 THR E 412 ? MET E 422 ? THR E 530 MET E 540 1 ? 11 HELX_P HELX_P66 AH3 SER E 427 ? LYS E 436 ? SER E 545 LYS E 554 1 ? 10 HELX_P HELX_P67 AH4 PRO E 480 ? ASP E 492 ? PRO E 598 ASP E 610 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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MG ? ? B ADP 701 B MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? ? metalc11 metalc ? ? J ADP . O2B ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? B ADP 701 B MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? ? metalc12 metalc one ? K BEF . F1 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? B BEF 702 B MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? ? metalc13 metalc ? ? C THR 271 OG1 ? ? ? 1_555 O MG . MG ? ? C THR 389 C MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? ? metalc14 metalc ? ? M ADP . O3B ? ? ? 1_555 N BEF . BE ? ? C ADP 701 C BEF 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.595 ? ? metalc15 metalc ? ? M ADP . O1B ? ? ? 1_555 O MG . MG ? ? C ADP 701 C MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? ? metalc16 metalc ? ? M ADP . O2B ? ? ? 1_555 O MG . MG ? ? C ADP 701 C MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? metalc17 metalc one ? N BEF . F1 ? ? ? 1_555 O MG . MG ? ? C BEF 702 C MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? ? metalc18 metalc ? ? D THR 271 OG1 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? D THR 389 D MG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.913 ? ? metalc19 metalc ? ? P ADP . O3B ? ? ? 1_555 Q BEF . BE ? ? 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