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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Gharpure, A.' 1 ? primary 'Teng, J.' 2 ? primary 'Zhuang, Y.' 3 ? primary 'Noviello, C.M.' 4 ? primary 'Walsh Jr., R.M.' 5 ? primary 'Cabuco, R.' 6 ? primary 'Howard, R.J.' 7 ? primary 'Zaveri, N.T.' 8 ? primary 'Lindahl, E.' 9 ? primary 'Hibbs, R.E.' 10 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Fusion protein of Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3 and Soluble cytochrome b562' 60087.363 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Fusion protein of Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4 and Soluble cytochrome b562' 61337.594 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'IgG2b Fab heavy chain' 23396.051 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Kappa Fab light chain' 23401.861 2 ? ? ? ? 5 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 2 ? 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H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 96 SG ? ? H CYS 41 H CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf11 disulf ? ? I CYS 23 SG ? ? ? 1_555 I CYS 87 SG ? ? I CYS 45 I CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? covale1 covale one ? A ASN 24 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 24 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 141 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 15 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 15 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 72 B NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 117 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 145 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 145 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? C ASN 15 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 15 C NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? C ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 72 C NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? C ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? C ASN 117 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? C ASN 145 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? C ASN 145 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? D ASN 24 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? D ASN 24 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? D ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? D ASN 141 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? E ASN 15 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? E ASN 15 E NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? E ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? E ASN 72 E NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? E ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? E ASN 117 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? E ASN 145 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? E ASN 145 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale17 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale18 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale19 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K BMA . C1 ? ? K NAG 2 K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale20 covale one ? K BMA . O3 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? K BMA 3 K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale21 covale one ? K BMA . O6 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? K BMA 3 K MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale22 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale23 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? L NAG 2 L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale24 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale25 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale26 covale one ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale27 covale one ? M BMA . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale28 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale29 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale30 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale31 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale32 covale one ? O BMA . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale33 covale one ? O BMA . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale34 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale35 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? ? covale36 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale37 covale one ? Q BMA . O3 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? Q BMA 3 Q MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale38 covale one ? Q BMA . O6 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? Q BMA 3 Q MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale39 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale40 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? R NAG 2 R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale41 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale42 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale43 covale one ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale44 covale one ? S BMA . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 135 A . ? PHE 135 A PRO 136 A ? PRO 136 A 1 -0.76 2 PHE 139 B . ? PHE 139 B PRO 140 B ? PRO 140 B 1 -2.50 3 PHE 139 C . ? PHE 139 C PRO 140 C ? PRO 140 C 1 -7.27 4 PHE 135 D . ? PHE 135 D PRO 136 D ? PRO 136 D 1 -0.61 5 PHE 139 E . ? PHE 139 E PRO 140 E ? PRO 140 E 1 -2.71 6 SER 7 G . ? SER 29 G PRO 8 G ? PRO 30 G 1 -2.96 7 ASN 93 G . ? ASN 115 G PRO 94 G ? PRO 116 G 1 3.03 8 SER 7 I . ? SER 29 I PRO 8 I ? PRO 30 I 1 -4.20 9 ASN 93 I . ? ASN 115 I PRO 94 I ? PRO 116 I 1 2.77 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 6 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 6 ? AD4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AC9 5 6 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD3 5 6 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 77 ? 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ILE B 53 THR B 65 AA5 5 PRO B 125 ? ALA B 131 ? PRO B 125 ALA B 131 AA6 1 ILE B 81 ? PRO B 85 ? ILE B 81 PRO B 85 AA6 2 ASN B 111 ? ARG B 115 ? ASN B 111 ARG B 115 AA6 3 SER B 119 ? TRP B 122 ? SER B 119 TRP B 122 AA6 4 ILE B 53 ? THR B 65 ? ILE B 53 THR B 65 AA6 5 LYS B 36 ? ASN B 48 ? LYS B 36 ASN B 48 AA6 6 VAL B 163 ? LEU B 164 ? VAL B 163 LEU B 164 AA7 1 ILE B 94 ? LEU B 96 ? ILE B 94 LEU B 96 AA7 2 GLN B 143 ? SER B 152 ? GLN B 143 SER B 152 AA7 3 VAL B 201 ? ARG B 209 ? VAL B 201 ARG B 209 AA7 4 TRP B 180 ? ALA B 184 ? TRP B 180 ALA B 184 AA8 1 ILE B 94 ? LEU B 96 ? ILE B 94 LEU B 96 AA8 2 GLN B 143 ? SER B 152 ? GLN B 143 SER B 152 AA8 3 VAL B 201 ? ARG B 209 ? VAL B 201 ARG B 209 AA8 4 GLY B 187 ? ARG B 189 ? GLY B 187 ARG B 189 AA9 1 ILE C 113 ? VAL C 114 ? ILE C 113 VAL C 114 AA9 2 SER C 119 ? TRP C 122 ? SER C 119 TRP C 122 AA9 3 LYS C 61 ? THR C 65 ? LYS C 61 THR C 65 AA9 4 ILE C 33 ? GLN C 38 ? ILE C 33 GLN C 38 AA9 5 ILE C 160 ? LEU C 164 ? 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I LEU 135 1072 1 Y 1 I ASN 158 ? I ASN 136 1073 1 Y 1 I ASN 159 ? I ASN 137 1074 1 Y 1 I PHE 160 ? I PHE 138 1075 1 Y 1 I TYR 161 ? I TYR 139 1076 1 Y 1 I PRO 162 ? I PRO 140 1077 1 Y 1 I LYS 163 ? I LYS 141 1078 1 Y 1 I ASP 164 ? I ASP 142 1079 1 Y 1 I ILE 165 ? I ILE 143 1080 1 Y 1 I ASN 166 ? I ASN 144 1081 1 Y 1 I VAL 167 ? I VAL 145 1082 1 Y 1 I LYS 168 ? I LYS 146 1083 1 Y 1 I TRP 169 ? I TRP 147 1084 1 Y 1 I LYS 170 ? I LYS 148 1085 1 Y 1 I ILE 171 ? I ILE 149 1086 1 Y 1 I ASP 172 ? I ASP 150 1087 1 Y 1 I GLY 173 ? I GLY 151 1088 1 Y 1 I SER 174 ? I SER 152 1089 1 Y 1 I GLU 175 ? I GLU 153 1090 1 Y 1 I ARG 176 ? I ARG 154 1091 1 Y 1 I GLN 177 ? I GLN 155 1092 1 Y 1 I ASN 178 ? I ASN 156 1093 1 Y 1 I GLY 179 ? I GLY 157 1094 1 Y 1 I VAL 180 ? I VAL 158 1095 1 Y 1 I LEU 181 ? I LEU 159 1096 1 Y 1 I ASN 182 ? I ASN 160 1097 1 Y 1 I SER 183 ? I SER 161 1098 1 Y 1 I TRP 184 ? I TRP 162 1099 1 Y 1 I THR 185 ? I THR 163 1100 1 Y 1 I ASP 186 ? I ASP 164 1101 1 Y 1 I GLN 187 ? 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I CYS 213 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C4H11NO3 Tris 1 2 150 mM NaCl 'Sodium chloride' 1 3 1 mM C9H15O6P 'Tris(2-carboxyethyl)phosphine' 1 4 1 mM C10H14N2 Nicotine # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id _em_entity_assembly_molwt.id _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag _em_entity_assembly_molwt.units _em_entity_assembly_molwt.value 1 1 NO ? ? 1 2 NO ? ? 1 3 NO ? ? 1 4 NO ? ? 1 5 NO ? ? 1 6 NO ? ? 1 7 NO ? ? 5 1 ? ? ? 6 1 ? ? ? 7 1 ? ? ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 1 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 2 1 ? ? 10090 ? ? 'Mus musculus' ? ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 3 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 47 _em_image_recording.average_exposure_time 10 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 5053 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Quantum LS' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 705401 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? RELION ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION ? 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? 13 'VOLUME SELECTION' ? ? ? 1 ? 1 14 'SERIES ALIGNMENT' ? ? ? 1 ? 1 15 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? ? ? 1 ? 1 16 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? ? ? 1 ? 1 17 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 ? 1 18 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 ? 1 19 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 6 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Welch Foundation' 'United States' I-1812 1 'National Institutes of Health/National Institute on Drug Abuse (NIH/NIDA)' 'United States' T32DA07290 2 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' T32GM008203 3 'National Institutes of Health/National Institute on Drug Abuse (NIH/NIDA)' 'United States' DA037492 4 'National Institutes of Health/National Institute on Drug Abuse (NIH/NIDA)' 'United States' DA042072 5 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' NS095899 6 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero J 5 NAG 1 J NAG 1 A NAG 702 n J 5 NAG 2 J NAG 2 A NAG 703 n K 6 NAG 1 K NAG 1 A NAG 704 n K 6 NAG 2 K NAG 2 A NAG 705 n K 6 BMA 3 K BMA 3 A BMA 706 n K 6 MAN 4 K MAN 4 A MAN 708 n K 6 MAN 5 K MAN 5 A MAN 707 n L 7 NAG 1 L NAG 1 B NAG 703 n L 7 NAG 2 L NAG 2 B NAG 704 n L 7 BMA 3 L BMA 3 B BMA 710 n M 6 NAG 1 M NAG 1 B NAG 705 n M 6 NAG 2 M NAG 2 B NAG 706 n M 6 BMA 3 M BMA 3 B BMA 707 n M 6 MAN 4 M MAN 4 B MAN 708 n M 6 MAN 5 M MAN 5 B MAN 709 n N 7 NAG 1 N NAG 1 C NAG 703 n N 7 NAG 2 N NAG 2 C NAG 704 n N 7 BMA 3 N BMA 3 C BMA 710 n O 6 NAG 1 O NAG 1 C NAG 705 n O 6 NAG 2 O NAG 2 C NAG 706 n O 6 BMA 3 O BMA 3 C BMA 707 n O 6 MAN 4 O MAN 4 C MAN 708 n O 6 MAN 5 O MAN 5 C MAN 709 n P 5 NAG 1 P NAG 1 D NAG 702 n P 5 NAG 2 P NAG 2 D NAG 703 n Q 6 NAG 1 Q NAG 1 D NAG 704 n Q 6 NAG 2 Q NAG 2 D NAG 705 n Q 6 BMA 3 Q BMA 3 D BMA 706 n Q 6 MAN 4 Q MAN 4 D MAN 707 n Q 6 MAN 5 Q MAN 5 D MAN 708 n R 7 NAG 1 R NAG 1 E NAG 703 n R 7 NAG 2 R NAG 2 E NAG 704 n R 7 BMA 3 R BMA 3 E BMA 710 n S 6 NAG 1 S NAG 1 E NAG 705 n S 6 NAG 2 S NAG 2 E NAG 706 n S 6 BMA 3 S BMA 3 E BMA 707 n S 6 MAN 4 S MAN 4 E MAN 708 n S 6 MAN 5 S MAN 5 E MAN 709 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 7 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 7 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 7 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 6 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 6 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 6 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 7 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n 6 MAN 4 n 6 MAN 5 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 7 BMA 3 n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id NCT _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id NCT _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 8 '(S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE' NCT 9 'CHOLESTEROL HEMISUCCINATE' Y01 10 'SODIUM ION' NA 11 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 12 nonane DD9 13 water HOH # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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