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L 78 ? ? 2 # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.d_res_high 3.603 _refine_ls_shell.d_res_low 3.697 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 220 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 4170 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 62.48 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.556 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.492 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 2 given ? 0.866658 -0.314873 -0.386987 0.316918 0.946527 -0.060405 0.385313 -0.070292 0.920105 13.74574 16.27501 20.04833 3 given ? 0.503067 -0.545413 -0.670409 0.555180 0.798436 -0.232969 0.662343 -0.254999 0.704470 12.68721 34.74511 42.40779 4 given ? 0.005022 -0.621196 -0.783639 0.650144 0.597448 -0.469434 0.759794 -0.507121 0.406868 -2.46104 50.51884 61.28991 5 given ? -0.493664 -0.530624 -0.689010 0.576277 0.393763 -0.716139 0.651307 -0.750593 0.111400 -28.15008 59.55662 71.46659 6 given ? -0.862518 -0.290461 -0.414361 0.352474 0.242674 -0.903809 0.363076 -0.925603 -0.106931 -57.19338 59.38174 69.97346 7 given ? -0.998896 0.030493 -0.035742 0.040795 0.185596 -0.981779 -0.023304 -0.982153 -0.186635 -81.33350 50.21046 57.67261 8 given ? -0.869102 0.349556 0.349961 -0.280219 0.235077 -0.930707 -0.407602 -0.906945 -0.106354 -94.74227 34.23911 37.61187 9 given ? -0.510120 0.574840 0.639795 -0.518418 0.388060 -0.762006 -0.686310 -0.720395 0.100050 -93.88575 16.10963 16.24717 10 given ? -0.011922 0.654879 0.755639 -0.615757 0.590604 -0.521566 -0.787846 -0.471509 0.396205 -79.07475 0.29867 -2.41777 11 given ? 0.490327 0.563553 0.664821 -0.540866 0.794911 -0.274920 -0.683405 -0.224779 0.694573 -53.89626 -8.69461 -12.70981 12 given ? 0.866311 0.319159 0.384242 -0.314212 0.946184 -0.077497 -0.388298 -0.053597 0.919974 -24.74512 -9.17865 -12.01938 13 given ? 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 14 given ? 0.513734 -0.536098 -0.669834 0.556463 0.802451 -0.215454 0.653013 -0.262052 0.710565 13.68029 34.91588 41.47792 15 given ? 0.002171 -0.620679 -0.784062 0.654292 0.593823 -0.468270 0.756239 -0.511988 0.407395 -2.74228 50.83501 60.78305 16 given ? -0.498561 -0.528886 -0.686816 0.581020 0.384109 -0.717549 0.643314 -0.756796 0.115792 -28.76484 60.10290 70.47677 17 given ? -0.858473 -0.291278 -0.422114 0.356745 0.252156 -0.899528 0.368452 -0.922808 -0.112557 -56.32381 59.33386 70.64983 18 given ? -0.998746 0.034656 -0.036132 0.041995 0.186971 -0.981467 -0.027258 -0.981754 -0.188192 -81.46301 50.27188 57.46802 19 given ? -0.868671 0.342706 0.357721 -0.284107 0.246908 -0.926455 -0.405826 -0.906416 -0.117117 -95.20092 33.18712 38.66594 20 given ? -0.500862 0.577382 0.644800 -0.516525 0.398384 -0.757953 -0.694506 -0.712685 0.098696 -94.32053 15.41677 15.97742 21 given ? -0.005539 0.657855 0.753124 -0.617459 0.590163 -0.520050 -0.786584 -0.467903 0.402930 -79.05041 0.25389 -3.05310 22 given ? 0.483504 0.567749 0.666247 -0.539927 0.792523 -0.283524 -0.688987 -0.222640 0.689731 -53.86355 -8.25709 -12.47769 23 given ? 0.862169 0.332095 0.382594 -0.326282 0.941698 -0.082133 -0.387564 -0.054021 0.920259 -24.48246 -8.90699 -12.09084 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 B 1 3 C 1 4 D 1 5 E 1 6 F 1 7 G 1 8 H 1 9 I 1 10 J 1 11 K 1 12 L 1 1 A 2 2 C 2 3 D 2 4 E 2 5 F 2 6 G 2 7 H 2 8 I 2 9 J 2 10 K 2 11 L 2 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id 1 A 1 A 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 2 B 1 B 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 3 C 1 C 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 4 D 1 D 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 5 E 1 E 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 6 F 1 F 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 7 G 1 G 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 8 H 1 H 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 9 I 1 I 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 10 J 1 J 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 11 K 1 K 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 12 L 1 L 149 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 1 A 156 A 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 2 B 156 B 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 3 C 156 C 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 4 D 156 D 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 5 E 156 E 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 6 F 156 F 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 7 G 156 G 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 8 H 156 H 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 9 I 156 I 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 10 J 156 J 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 11 K 156 K 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 12 L 156 L 197 2 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 1 A 206 A 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 2 B 206 B 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 3 C 206 C 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 4 D 206 D 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 5 E 206 E 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 6 F 206 F 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 7 G 206 G 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 8 H 206 H 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 9 I 206 I 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 10 J 206 J 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 11 K 206 K 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 12 L 206 L 308 3 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 1 A 310 A 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 2 B 310 B 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 3 C 310 C 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 4 D 310 D 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 5 E 310 E 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 6 F 310 F 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 7 G 310 G 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 8 H 310 H 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 9 I 310 I 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 10 J 310 J 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 11 K 310 K 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 12 L 310 L 600 4 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 ? ? ? 1 A 150 A 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 2 C 150 C 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 3 D 150 D 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 4 E 150 E 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 5 F 150 F 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 6 G 150 G 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 7 H 150 H 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 8 I 150 I 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 9 J 150 J 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 10 K 150 K 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? 11 L 150 L 155 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? # _struct.entry_id 6QX5 _struct.title 'Crystal structure of T7 bacteriophage portal protein, 12mer, closed valve' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6QX5 _struct_keywords.text 'viral protein, DNA packaging' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code PORTL_BPT7 _struct_ref.pdbx_db_accession P03728 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;RTGLAEDGAKSVYERLKNDRAPYETRAQNCAQYTIPSLFPKDSDNASTDYQTPWQAVGARGLNNLASKLMLALFPMQTWM RLTISEYEAKQLLSDPDGLAKVDEGLSMVERIIMNYIESNSYRVTLFEALKQLVVAGNVLLYLPEPEGSNYNPMKLYRLS SYVVQRDAFGNVLQMVTRDQIAFGALPEDIRKAVEGQGGEKKADETIDVYTHIYLDEDSGEYLRYEEVEGMEVQGSDGTY PKEACPYIPIRMVRLDGESYGRSYIEEYLGDLRSLENLQEAIVKMSMISSKVIGLVNPAGITQPRRLTKAQTGDFVTGRP EDISFLQLEKQADFTVAKAVSDAIEARLSFAFMLNSAVQRTGERVTAEEIRYVASELEDTLGGVYSILSQELQLPLVRVL LKQLQATQQIPELPKEAVEPTISTGLEAIGRGQDLDKLERCVTAWAALAPMRDDPDINLAMIKLRIANAIGIDTSGILLT EEQKQQKMAQ ; _struct_ref.pdbx_align_begin 5 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6QX5 A 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 2 1 6QX5 B 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 3 1 6QX5 C 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 4 1 6QX5 D 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 5 1 6QX5 E 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 6 1 6QX5 F 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 7 1 6QX5 G 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 8 1 6QX5 H 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 9 1 6QX5 I 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 10 1 6QX5 J 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 11 1 6QX5 K 1 ? 490 ? P03728 5 ? 494 ? 5 494 12 1 6QX5 L 1 ? 490 ? 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