data_6R0Y # _entry.id 6R0Y # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.392 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 6R0Y pdb_00006r0y 10.2210/pdb6r0y/pdb WWPDB D_1292100893 ? ? EMDB EMD-4700 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2019-08-28 2 'Structure model' 1 1 2019-09-04 3 'Structure model' 1 2 2019-12-18 4 'Structure model' 1 3 2020-09-30 5 'Structure model' 1 4 2024-05-15 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' Other 4 4 'Structure model' 'Database references' 5 5 'Structure model' 'Data collection' 6 5 'Structure model' 'Database references' 7 5 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' atom_sites 4 4 'Structure model' citation 5 4 'Structure model' citation_author 6 5 'Structure model' chem_comp_atom 7 5 'Structure model' chem_comp_bond 8 5 'Structure model' database_2 9 5 'Structure model' em_3d_fitting_list 10 5 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 3 2 'Structure model' '_citation.title' 4 2 'Structure model' '_citation_author.name' 5 3 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]' 6 3 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]' 7 3 'Structure model' '_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]' 8 4 'Structure model' '_citation.title' 9 4 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 10 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 11 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 12 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.accession_code' 13 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id' 14 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.source_name' 15 5 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.type' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6R0Y _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-03-13 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB . 6QUM unspecified EMDB 'Thermus thermophilus V/A-type ATPase/synthase, rotational state 3' EMD-4700 'associated EM volume' PDB . 6R0W unspecified PDB . 6R0Z unspecified PDB . 6R10 unspecified EMDB . EMD-4699 'other EM volume' EMDB . EMD-4702 'other EM volume' EMDB . EMD-4703 'other EM volume' EMDB . EMD-4640 'other EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhou, L.' 1 ? 'Sazanov, L.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 365 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structure and conformational plasticity of the intact Thermus thermophilus V/A-type ATPase.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.aaw9144 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31439765 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhou, L.' 1 0000-0002-1864-8951 primary 'Sazanov, L.A.' 2 0000-0002-0977-7989 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'V-type ATP synthase alpha chain' 63699.980 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'V-type ATP synthase beta chain' 53219.500 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit D' 24715.566 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit F' 11294.904 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)' 13166.218 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit E' 20645.582 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit C' 35968.570 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit I' 72204.289 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'V-type ATP synthase, subunit K' 9841.714 12 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 ? ? ? ? 11 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'V-ATPase subunit A' 2 'V-ATPase subunit B' 3 'V-ATPase subunit D' 4 'V-ATPase subunit F' 6 'V-ATPase subunit E' 7 'V-ATPase subunit C' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MIQGVIQKIAGPAVIAKGMLGARMYDICKVGEEGLVGEIIRLDGDTAFVQVYEDTSGLKVGEPVVSTGLPLAVELGPGML NGIYDGIQRPLERIREKTGIYITRGVVVHALDREKKWAWTPMVKPGDEVRGGMVLGTVPEFGFTHKILVPPDVRGRVKEV KPAGEYTVEEPVVVLEDGTELKMYHTWPVRRARPVQRKLDPNTPFLTGMRILDVLFPVAMGGTAAIPGPFGSGKTVTQQS LAKWSNADVVVYVGCGERGNEMTDVLVEFPELTDPKTGGPLMHRTVLIANTSNMPVAAREASIYVGVTIAEYFRDQGFSV ALMADSTSRWAEALREISSRLEEMPAEEGYPPYLAARLAAFYERAGKVITLGGEEGAVTIVGAVSPPGGDMSEPVTQSTL RIVGAFWRLDASLAFRRHFPAINWNGSYSLFTSALDPWYRENVAEDYPELRDAISELLQREAGLQEIVQLVGPDALQDAE 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VAEYLAFEHDYHVLVILTDMTNYCEALREIGAAREEIPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGVVEGKKGSVTQIPILSMPDDD RTHPIPDLTGYITEGQIQLSRELHRKGIYPPIDPLPSLSRLMNNGVGKGKTREDHKQVSDQLYSAYANGVDIRKLVAIIG EDALTENDRRYLQFADAFERFFINQGQQNRSIEESLQIAWALLSMLPQGELKRISKDHIGKYYGQKLEEIWGAPQALD ; ;MDLLKKEYTGITYISGPLLFVENAKDLAYGAIVDIKDGTGRVRGGQVIEVSEEYAVIQVFEETTGLDLATTSVSLVEDVA RLGVSKEMLGRRFNGIGKPIDGLPPITPEKRLPITGLPLNPVARRKPEQFIQTGISTIDVMNTLVRGQKLPIFSGSGLPA NEIAAQIARQATVRPDLSGEGEKEEPFAVVFAAMGITQRELSYFIQEFERTGALSRSVLFLNKADDPTIERILTPRMALT VAEYLAFEHDYHVLVILTDMTNYCEALREIGAAREEIPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGVVEGKKGSVTQIPILSMPDDD RTHPIPDLTGYITEGQIQLSRELHRKGIYPPIDPLPSLSRLMNNGVGKGKTREDHKQVSDQLYSAYANGVDIRKLVAIIG EDALTENDRRYLQFADAFERFFINQGQQNRSIEESLQIAWALLSMLPQGELKRISKDHIGKYYGQKLEEIWGAPQALD ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSQVSPTRMNLLQRRGQLRLAQKGVDLLKKKRDALVAEFFGLVREAMEARKALDQAAKEAYAALLLAQAFDGPEVVAGAA LGVPPLEGVEAEVENVWGSKVPRLKATFPDGALLSPVGTPAYTLEASRAFRRYAEALIRVANTETRLKKIGEEIKKTTRR VNALEQVVIPGIRAQIRFIQQVLEQREREDTFRLKRIKGKIEAREAEEEGGRPNPQVEIGAGL ; ;MSQVSPTRMNLLQRRGQLRLAQKGVDLLKKKRDALVAEFFGLVREAMEARKALDQAAKEAYAALLLAQAFDGPEVVAGAA LGVPPLEGVEAEVENVWGSKVPRLKATFPDGALLSPVGTPAYTLEASRAFRRYAEALIRVANTETRLKKIGEEIKKTTRR VNALEQVVIPGIRAQIRFIQQVLEQREREDTFRLKRIKGKIEAREAEEEGGRPNPQVEIGAGL ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAVIADPETAQGFRLAGLEGYGASSAEEAQSLLETLVERGGYALVAVDEALLPDPERAVERLMRGRDLPVLLPIAGLKEA FQGHDVEGYMRELVRKTIGFDIKL ; ;MAVIADPETAQGFRLAGLEGYGASSAEEAQSLLETLVERGGYALVAVDEALLPDPERAVERLMRGRDLPVLLPIAGLKEA FQGHDVEGYMRELVRKTIGFDIKL ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAE TEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP ; ;MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAE TEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP ; I,K ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVL EEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGK TQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG ; ;MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVL EEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGK TQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG ; J,L ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEA REAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQD LARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAV LDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEV VCP ; ;MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEA REAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQD LARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAV LDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEV VCP ; M ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPF PEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKA LEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAK LARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVV LDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKP QVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLA LRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILS HIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGR PYRPFKSVREAQ ; ;MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPF PEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKA LEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAK LARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVV LDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKP QVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLA LRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILS HIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGR PYRPFKSVREAQ ; N ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLL PETLVIFGLLIAFILNGRL ; ;MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLL PETLVIFGLLIAFILNGRL ; O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 10 'MAGNESIUM ION' MG 11 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ILE n 1 3 GLN n 1 4 GLY n 1 5 VAL n 1 6 ILE n 1 7 GLN n 1 8 LYS n 1 9 ILE n 1 10 ALA n 1 11 GLY n 1 12 PRO n 1 13 ALA n 1 14 VAL n 1 15 ILE n 1 16 ALA n 1 17 LYS n 1 18 GLY n 1 19 MET n 1 20 LEU n 1 21 GLY n 1 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B GLU 257 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _pdbx_struct_conn_angle.id 1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id OG1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id B _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id THR _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id 235 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id B _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id THR _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id 235 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id MG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id AA _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id MG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id . _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id B _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id MG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id 601 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id OE1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id B _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id GLU _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id 257 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id B _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id GLU _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id 257 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.value 139.8 _pdbx_struct_conn_angle.value_esd ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 419 A . ? PHE 419 A PRO 420 A ? PRO 420 A 1 2.61 2 PHE 419 B . ? PHE 419 B PRO 420 B ? PRO 420 B 1 -1.85 3 PHE 419 C . ? PHE 419 C PRO 420 C ? PRO 420 C 1 1.54 4 TYR 349 D . ? TYR 349 D PRO 350 D ? PRO 350 D 1 -3.44 5 TYR 349 E . ? TYR 349 E PRO 350 E ? PRO 350 E 1 0.07 6 TYR 349 F . ? TYR 349 F PRO 350 F ? PRO 350 F 1 -7.65 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 7 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 7 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 7 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 7 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 7 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB1 4 5 ? parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB1 6 7 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC7 6 7 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD1 5 6 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD3 4 5 ? parallel AD3 5 6 ? parallel AD3 6 7 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? parallel AD8 3 4 ? parallel AD8 4 5 ? parallel AD8 5 6 ? parallel AD8 6 7 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? parallel AE1 2 3 ? parallel AE2 1 2 ? parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLN A 3 ? ALA A 10 ? GLN A 3 ALA A 10 AA1 2 ALA A 13 ? LYS A 17 ? ALA A 13 LYS A 17 AA1 3 VAL A 49 ? VAL A 51 ? VAL A 49 VAL A 51 AA1 4 LEU A 35 ? ILE A 39 ? LEU A 35 ILE A 39 AA1 5 CYS A 28 ? VAL A 30 ? CYS A 28 VAL A 30 AA1 6 PRO A 63 ? VAL A 65 ? PRO A 63 VAL A 65 AA1 7 GLN A 3 ? ALA A 10 ? GLN A 3 ALA A 10 AA2 1 ALA A 72 ? LEU A 75 ? ALA A 72 LEU A 75 AA2 2 HIS A 185 ? PRO A 188 ? HIS A 185 PRO A 188 AA3 1 GLY A 82 ? TYR A 84 ? GLY A 82 TYR A 84 AA3 2 THR A 285 ? ASN A 290 ? THR A 285 ASN A 290 AA3 3 VAL A 249 ? CYS A 255 ? VAL A 249 CYS A 255 AA3 4 SER A 319 ? ASP A 325 ? SER A 319 ASP A 325 AA3 5 GLU A 375 ? ALA A 383 ? GLU A 375 ALA A 383 AA3 6 GLY A 366 ? ILE A 369 ? GLY A 366 ILE A 369 AA3 7 ARG A 197 ? LEU A 199 ? ARG A 197 LEU A 199 AA4 1 GLY A 82 ? TYR A 84 ? GLY A 82 TYR A 84 AA4 2 THR A 285 ? ASN A 290 ? THR A 285 ASN A 290 AA4 3 VAL A 249 ? CYS A 255 ? VAL A 249 CYS A 255 AA4 4 SER A 319 ? ASP A 325 ? SER A 319 ASP A 325 AA4 5 GLU A 375 ? ALA A 383 ? GLU A 375 ALA A 383 AA4 6 ALA A 224 ? ALA A 225 ? ALA A 224 ALA A 225 AA4 7 ALA A 405 ? PHE A 406 ? ALA A 405 PHE A 406 AA5 1 TRP A 117 ? ALA A 118 ? TRP A 117 ALA A 118 AA5 2 GLU A 165 ? TYR A 166 ? GLU A 165 TYR A 166 AA6 1 THR A 120 ? PRO A 121 ? THR A 120 PRO A 121 AA6 2 VAL A 134 ? VAL A 138 ? VAL A 134 VAL A 138 AA6 3 HIS A 145 ? LEU A 148 ? HIS A 145 LEU A 148 AA7 1 GLU A 128 ? VAL A 129 ? GLU A 128 VAL A 129 AA7 2 GLY A 155 ? VAL A 160 ? GLY A 155 VAL A 160 AA7 3 VAL A 173 ? LEU A 175 ? VAL A 173 LEU A 175 AA7 4 GLU A 180 ? LEU A 181 ? GLU A 180 LEU A 181 AA8 1 GLN B 3 ? ILE B 9 ? GLN B 3 ILE B 9 AA8 2 VAL B 14 ? LYS B 17 ? VAL B 14 LYS B 17 AA8 3 ALA B 47 ? VAL B 51 ? ALA B 47 VAL B 51 AA8 4 LEU B 35 ? ILE B 40 ? LEU B 35 ILE B 40 AA8 5 ILE B 27 ? VAL B 30 ? ILE B 27 VAL B 30 AA8 6 PRO B 63 ? VAL B 65 ? PRO B 63 VAL B 65 AA8 7 GLN B 3 ? ILE B 9 ? GLN B 3 ILE B 9 AA9 1 ALA B 72 ? LEU B 75 ? ALA B 72 LEU B 75 AA9 2 HIS B 185 ? PRO B 188 ? HIS B 185 PRO B 188 AB1 1 GLY B 82 ? TYR B 84 ? GLY B 82 TYR B 84 AB1 2 THR B 285 ? ASN B 290 ? THR B 285 ASN B 290 AB1 3 VAL B 249 ? CYS B 255 ? VAL B 249 CYS B 255 AB1 4 SER B 319 ? ASP B 325 ? SER B 319 ASP B 325 AB1 5 GLU B 375 ? VAL B 384 ? GLU B 375 VAL B 384 AB1 6 GLY B 366 ? ILE B 369 ? GLY B 366 ILE B 369 AB1 7 ARG B 197 ? LYS B 198 ? ARG B 197 LYS B 198 AB2 1 GLY B 82 ? TYR B 84 ? GLY B 82 TYR B 84 AB2 2 THR B 285 ? ASN B 290 ? THR B 285 ASN B 290 AB2 3 VAL B 249 ? CYS B 255 ? VAL B 249 CYS B 255 AB2 4 SER B 319 ? ASP B 325 ? SER B 319 ASP B 325 AB2 5 GLU B 375 ? VAL B 384 ? GLU B 375 VAL B 384 AB2 6 THR B 223 ? PRO B 227 ? THR B 223 PRO B 227 AB3 1 TRP B 117 ? ALA B 118 ? TRP B 117 ALA B 118 AB3 2 GLU B 165 ? TYR B 166 ? GLU B 165 TYR B 166 AB4 1 THR B 120 ? PRO B 121 ? THR B 120 PRO B 121 AB4 2 VAL B 134 ? GLU B 140 ? VAL B 134 GLU B 140 AB4 3 PHE B 143 ? LEU B 148 ? PHE B 143 LEU B 148 AB5 1 GLU B 128 ? VAL B 129 ? GLU B 128 VAL B 129 AB5 2 GLY B 155 ? VAL B 160 ? GLY B 155 VAL B 160 AB5 3 VAL B 173 ? LEU B 175 ? VAL B 173 LEU B 175 AB5 4 GLU B 180 ? LEU B 181 ? GLU B 180 LEU B 181 AB6 1 PRO C 63 ? VAL C 65 ? PRO C 63 VAL C 65 AB6 2 GLN C 3 ? ALA C 10 ? GLN C 3 ALA C 10 AB6 3 ALA C 13 ? ALA C 16 ? ALA C 13 ALA C 16 AB6 4 THR C 46 ? GLN C 50 ? THR C 46 GLN C 50 AB6 5 ILE C 39 ? ASP C 43 ? ILE C 39 ASP C 43 AB6 6 TYR F 13 ? ILE F 14 ? TYR F 13 ILE F 14 AB7 1 LYS C 29 ? VAL C 30 ? LYS C 29 VAL C 30 AB7 2 LEU C 35 ? VAL C 36 ? LEU C 35 VAL C 36 AB8 1 ALA C 72 ? LEU C 75 ? ALA C 72 LEU C 75 AB8 2 HIS C 185 ? PRO C 188 ? HIS C 185 PRO C 188 AB9 1 GLY C 82 ? TYR C 84 ? GLY C 82 TYR C 84 AB9 2 THR C 285 ? ALA C 289 ? THR C 285 ALA C 289 AB9 3 VAL C 249 ? GLY C 254 ? VAL C 249 GLY C 254 AB9 4 SER C 319 ? ASP C 325 ? SER C 319 ASP C 325 AB9 5 GLU C 375 ? ILE C 380 ? GLU C 375 ILE C 380 AB9 6 VAL C 368 ? ILE C 369 ? VAL C 368 ILE C 369 AB9 7 ARG C 197 ? LYS C 198 ? ARG C 197 LYS C 198 AC1 1 TRP C 117 ? ALA C 118 ? TRP C 117 ALA C 118 AC1 2 GLU C 165 ? TYR C 166 ? GLU C 165 TYR C 166 AC2 1 GLU C 128 ? VAL C 129 ? GLU C 128 VAL C 129 AC2 2 GLY C 155 ? LYS C 158 ? GLY C 155 LYS C 158 AC2 3 VAL C 173 ? LEU C 175 ? VAL C 173 LEU C 175 AC2 4 GLY C 178 ? LEU C 181 ? GLY C 178 LEU C 181 AC3 1 VAL C 134 ? PRO C 139 ? VAL C 134 PRO C 139 AC3 2 THR C 144 ? LEU C 148 ? THR C 144 LEU C 148 AC4 1 ALA C 224 ? ALA C 225 ? ALA C 224 ALA C 225 AC4 2 ALA C 405 ? PHE C 406 ? ALA C 405 PHE C 406 AC4 3 TYR C 428 ? SER C 429 ? TYR C 428 SER C 429 AC5 1 ILE D 14 ? SER D 15 ? ILE D 14 SER D 15 AC5 2 LEU D 18 ? GLU D 22 ? LEU D 18 GLU D 22 AC5 3 TYR D 54 ? VAL D 59 ? TYR D 54 VAL D 59 AC5 4 VAL D 42 ? VAL D 50 ? VAL D 42 VAL D 50 AC5 5 ILE D 32 ? LYS D 36 ? ILE D 32 LYS D 36 AC5 6 SER D 72 ? VAL D 76 ? SER D 72 VAL D 76 AC6 1 ARG D 81 ? VAL D 84 ? ARG D 81 VAL D 84 AC6 2 LYS D 110 ? PRO D 113 ? LYS D 110 PRO D 113 AC7 1 ARG D 92 ? PHE D 93 ? ARG D 92 PHE D 93 AC7 2 SER D 217 ? PHE D 220 ? SER D 217 PHE D 220 AC7 3 ALA D 188 ? ALA D 192 ? ALA D 188 ALA D 192 AC7 4 HIS D 252 ? LEU D 257 ? HIS D 252 LEU D 257 AC7 5 SER D 307 ? SER D 315 ? SER D 307 SER D 315 AC7 6 ILE D 152 ? SER D 154 ? ILE D 152 SER D 154 AC7 7 ILE D 337 ? GLN D 338 ? ILE D 337 GLN D 338 AC8 1 ARG D 124 ? ARG D 125 ? ARG D 124 ARG D 125 AC8 2 VAL D 300 ? VAL D 301 ? VAL D 300 VAL D 301 AC9 1 LYS E 6 ? GLU E 7 ? LYS E 6 GLU E 7 AC9 2 GLN J 162 ? SER J 166 ? GLN J 162 SER J 166 AC9 3 GLY J 151 ? GLY J 156 ? GLY J 151 GLY J 156 AC9 4 ALA J 118 ? ALA J 123 ? ALA J 118 ALA J 123 AC9 5 GLU J 141 ? ALA J 144 ? GLU J 141 ALA J 144 AD1 1 ILE E 11 ? SER E 15 ? ILE E 11 SER E 15 AD1 2 LEU E 18 ? GLU E 22 ? LEU E 18 GLU E 22 AD1 3 TYR E 54 ? VAL E 59 ? TYR E 54 VAL E 59 AD1 4 VAL E 42 ? ILE E 48 ? VAL E 42 ILE E 48 AD1 5 ILE E 32 ? ASP E 37 ? ILE E 32 ASP E 37 AD1 6 THR E 71 ? VAL E 76 ? THR E 71 VAL E 76 AD2 1 ARG E 81 ? VAL E 84 ? ARG E 81 VAL E 84 AD2 2 LYS E 110 ? PRO E 113 ? LYS E 110 PRO E 113 AD3 1 ARG E 92 ? PHE E 93 ? ARG E 92 PHE E 93 AD3 2 SER E 217 ? 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_em_particle_selection.num_particles_selected 181245 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? 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PHENIX 1.12 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 5.4 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_initial_refinement_model.id _pdbx_initial_refinement_model.type _pdbx_initial_refinement_model.source_name _pdbx_initial_refinement_model.accession_code 1 'experimental model' PDB 5Y5Y 2 'experimental model' PDB 5Y5X # _atom_sites.entry_id 6R0Y _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C MG N O P S # loop_