data_6S01 # _entry.id 6S01 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.321 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6S01 WWPDB D_1292102884 EMDB EMD-10069 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of LEDGF PWWP domain bound H3K36 methylated nucleosome' _pdbx_database_related.db_id EMD-10069 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6S01 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-06-13 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wang, H.' 1 0000-0003-2416-9153 'Farnung, L.' 2 ? 'Dienemann, C.' 3 ? 'Cramer, P.' 4 0000-0001-5454-7755 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 27 _citation.language ? _citation.page_first 8 _citation.page_last 13 _citation.title 'Structure of H3K36-methylated nucleosome-PWWP complex reveals multivalent cross-gyre binding.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-019-0345-4 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31819277 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wang, H.' 1 ? primary 'Farnung, L.' 2 0000-0002-8200-2493 primary 'Dienemann, C.' 3 ? primary 'Cramer, P.' 4 0000-0001-5454-7755 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6S01 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6S01 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3' 15331.982 2 ? ? ? 'residue K36 was chemically modified to be ML3.' 2 polymer man 'Histone H4' 11263.231 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A' 13978.241 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B 1.1' 13524.752 2 ? ? ? ? 5 polymer syn 'Wisdom 601 DNA (165-MER)' 50699.316 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'Wisdom 601 DNA (165-MER)' 51170.602 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'PC4 and SFRS1-interacting protein' 60224.453 1 ? ? ? 'density of residue 30-34 and residue 92-530 are invisible' # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 4 H2B1.1 7 ;CLL-associated antigen KW-7,Dense fine speckles 70 kDa protein,DFS 70,Lens epithelium-derived growth factor,Transcriptional coactivator p75/p52 ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no yes ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGV(ML3)KPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQ DFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG) (DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA) (DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG) (DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA) (DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA) (DG)(DC)(DG)(DA)(DC) ; ;ATCAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCC CGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCATGTATTGAACA GCGAC ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA) (DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA) (DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG) (DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC) (DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG) (DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA) (DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT) (DC)(DT)(DG)(DA)(DT) ; ;GTCGCTGTTCAATACATGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAA ACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATT CTGAT ; J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MTRDFKPGDLIFAKMKGYPHWPARVDEVPDGAVKPPTNKLPIFFFGTHETAFLGPKDIFPYSENKEKYGKPNKRKGFNEG LWEIDNNPKVKFSSQQAATKQSNASSDVEVEEKETSVSKEDTDHEEKASNEDVTKAVDITTPKAARRGRKRKAEKQVETE EAGVVTTATASVNLKVSPKRGRPAATEVKIPKPRGRPKMVKQPCPSESDIITEEDKSKKKGQEEKQPKKQPKKDEEGQKE EDKPRKEPDKKEGKKEVESKRKNLAKTGVTSTSDSEEEGDDQEGEKKRKGGRNFQTAHRRNMLKGQHEKEAADRKRKQEE QMETEQQNKDEGKKPEVKKVEKKRETSMDSRLQRIHAEIKNSLKIDNLDVNRCIEALDELASLQVTMQQAQKHTEMITTL KKIRRFKVSQVIMEKSTMLYNKFKNMFLVGEGDSVITQVLNKSLAEQRQHEEANKTKDQGKKGPNKKLEKEQTGSKTLNG GSDAQDGNQPQHNGESNEDSKDNHEASTKKKPSSEERETEISLKDSTLDN ; ;MTRDFKPGDLIFAKMKGYPHWPARVDEVPDGAVKPPTNKLPIFFFGTHETAFLGPKDIFPYSENKEKYGKPNKRKGFNEG LWEIDNNPKVKFSSQQAATKQSNASSDVEVEEKETSVSKEDTDHEEKASNEDVTKAVDITTPKAARRGRKRKAEKQVETE EAGVVTTATASVNLKVSPKRGRPAATEVKIPKPRGRPKMVKQPCPSESDIITEEDKSKKKGQEEKQPKKQPKKDEEGQKE EDKPRKEPDKKEGKKEVESKRKNLAKTGVTSTSDSEEEGDDQEGEKKRKGGRNFQTAHRRNMLKGQHEKEAADRKRKQEE QMETEQQNKDEGKKPEVKKVEKKRETSMDSRLQRIHAEIKNSLKIDNLDVNRCIEALDELASLQVTMQQAQKHTEMITTL KKIRRFKVSQVIMEKSTMLYNKFKNMFLVGEGDSVITQVLNKSLAEQRQHEEANKTKDQGKKGPNKKLEKEQTGSKTLNG GSDAQDGNQPQHNGESNEDSKDNHEASTKKKPSSEERETEISLKDSTLDN ; K ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ALA n 1 2 ARG n 1 3 THR n 1 4 LYS n 1 5 GLN n 1 6 THR n 1 7 ALA n 1 8 ARG n 1 9 LYS n 1 10 SER n 1 11 THR n 1 12 GLY n 1 13 GLY n 1 14 LYS n 1 15 ALA n 1 16 PRO n 1 17 ARG n 1 18 LYS n 1 19 GLN n 1 20 LEU n 1 21 ALA n 1 22 THR n 1 23 LYS n 1 24 ALA n 1 25 ALA n 1 26 ARG n 1 27 LYS n 1 28 SER n 1 29 ALA n 1 30 PRO n 1 31 ALA n 1 32 THR n 1 33 GLY n 1 34 GLY n 1 35 VAL n 1 36 ML3 n 1 37 LYS n 1 38 PRO n 1 39 HIS n 1 40 ARG n 1 41 TYR n 1 42 ARG n 1 43 PRO n 1 44 GLY n 1 45 THR n 1 46 VAL n 1 47 ALA n 1 48 LEU n 1 49 ARG n 1 50 GLU n 1 51 ILE n 1 52 ARG n 1 53 ARG n 1 54 TYR n 1 55 GLN n 1 56 LYS n 1 57 SER n 1 58 THR n 1 59 GLU n 1 60 LEU n 1 61 LEU n 1 62 ILE n 1 63 ARG n 1 64 LYS n 1 65 LEU n 1 66 PRO n 1 67 PHE n 1 68 GLN n 1 69 ARG n 1 70 LEU n 1 71 VAL n 1 72 ARG n 1 73 GLU n 1 74 ILE n 1 75 ALA n 1 76 GLN n 1 77 ASP n 1 78 PHE n 1 79 LYS n 1 80 THR n 1 81 ASP n 1 82 LEU n 1 83 ARG n 1 84 PHE n 1 85 GLN n 1 86 SER n 1 87 SER n 1 88 ALA n 1 89 VAL n 1 90 MET n 1 91 ALA n 1 92 LEU n 1 93 GLN n 1 94 GLU n 1 95 ALA n 1 96 SER n 1 97 GLU n 1 98 ALA n 1 99 TYR n 1 100 LEU n 1 101 VAL n 1 102 ALA n 1 103 LEU n 1 104 PHE n 1 105 GLU n 1 106 ASP n 1 107 THR n 1 108 ASN n 1 109 LEU n 1 110 ALA n 1 111 ALA n 1 112 ILE n 1 113 HIS n 1 114 ALA n 1 115 LYS n 1 116 ARG n 1 117 VAL n 1 118 THR n 1 119 ILE n 1 120 MET n 1 121 PRO n 1 122 LYS n 1 123 ASP n 1 124 ILE n 1 125 GLN n 1 126 LEU n 1 127 ALA n 1 128 ARG n 1 129 ARG n 1 130 ILE n 1 131 ARG n 1 132 GLY n 1 133 GLU n 1 134 ARG n 1 135 ALA n 2 1 SER n 2 2 GLY n 2 3 ARG n 2 4 GLY n 2 5 LYS n 2 6 GLY n 2 7 GLY n 2 8 LYS n 2 9 GLY n 2 10 LEU n 2 11 GLY n 2 12 LYS n 2 13 GLY n 2 14 GLY n 2 15 ALA n 2 16 LYS n 2 17 ARG n 2 18 HIS n 2 19 ARG n 2 20 LYS n 2 21 VAL n 2 22 LEU n 2 23 ARG n 2 24 ASP n 2 25 ASN n 2 26 ILE n 2 27 GLN n 2 28 GLY n 2 29 ILE n 2 30 THR n 2 31 LYS n 2 32 PRO n 2 33 ALA n 2 34 ILE n 2 35 ARG n 2 36 ARG n 2 37 LEU n 2 38 ALA n 2 39 ARG n 2 40 ARG n 2 41 GLY n 2 42 GLY n 2 43 VAL n 2 44 LYS n 2 45 ARG n 2 46 ILE n 2 47 SER n 2 48 GLY n 2 49 LEU n 2 50 ILE n 2 51 TYR n 2 52 GLU n 2 53 GLU n 2 54 THR n 2 55 ARG n 2 56 GLY n 2 57 VAL n 2 58 LEU n 2 59 LYS n 2 60 VAL n 2 61 PHE n 2 62 LEU n 2 63 GLU n 2 64 ASN n 2 65 VAL n 2 66 ILE n 2 67 ARG n 2 68 ASP n 2 69 ALA n 2 70 VAL n 2 71 THR n 2 72 TYR n 2 73 THR n 2 74 GLU n 2 75 HIS n 2 76 ALA n 2 77 LYS n 2 78 ARG n 2 79 LYS n 2 80 THR n 2 81 VAL n 2 82 THR n 2 83 ALA n 2 84 MET n 2 85 ASP n 2 86 VAL n 2 87 VAL n 2 88 TYR n 2 89 ALA n 2 90 LEU n 2 91 LYS n 2 92 ARG n 2 93 GLN n 2 94 GLY n 2 95 ARG n 2 96 THR n 2 97 LEU n 2 98 TYR n 2 99 GLY n 2 100 PHE n 2 101 GLY n 2 102 GLY n 3 1 SER n 3 2 GLY n 3 3 ARG n 3 4 GLY n 3 5 LYS n 3 6 GLN n 3 7 GLY n 3 8 GLY n 3 9 LYS n 3 10 THR n 3 11 ARG n 3 12 ALA n 3 13 LYS n 3 14 ALA n 3 15 LYS n 3 16 THR n 3 17 ARG n 3 18 SER n 3 19 SER n 3 20 ARG n 3 21 ALA n 3 22 GLY n 3 23 LEU n 3 24 GLN n 3 25 PHE n 3 26 PRO n 3 27 VAL n 3 28 GLY n 3 29 ARG n 3 30 VAL n 3 31 HIS n 3 32 ARG n 3 33 LEU n 3 34 LEU n 3 35 ARG n 3 36 LYS n 3 37 GLY n 3 38 ASN n 3 39 TYR n 3 40 ALA n 3 41 GLU n 3 42 ARG n 3 43 VAL n 3 44 GLY n 3 45 ALA n 3 46 GLY n 3 47 ALA n 3 48 PRO n 3 49 VAL n 3 50 TYR n 3 51 LEU n 3 52 ALA n 3 53 ALA n 3 54 VAL n 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 135 'African clawed frog' ? 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A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 2 2 6S01 B 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 3 3 6S01 C 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 4 4 6S01 D 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 5 1 6S01 E 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 6 2 6S01 F 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 7 3 6S01 G 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 8 4 6S01 H 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 9 5 6S01 I 1 ? 165 ? 6S01 -72 ? 92 ? -72 92 10 6 6S01 J 1 ? 165 ? 6S01 -92 ? 72 ? -92 72 11 7 6S01 K 1 ? 530 ? O75475 1 ? 530 ? 1 530 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 6S01 ALA A 110 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 'engineered mutation' 110 1 4 6S01 THR D 29 ? UNP P02281 SER 33 conflict 29 2 5 6S01 ALA E 110 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 'engineered mutation' 110 3 8 6S01 THR H 29 ? UNP P02281 SER 33 conflict 29 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 ML3 'L-peptide linking' n '2-{[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]sulfanyl}-N,N,N-trimethylethanaminium' ? 'C8 H19 N2 O2 S 1' 207.314 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6S01 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6S01 _struct.title 'Structure of LEDGF PWWP domain bound H3K36 methylated nucleosome' _struct.pdbx_descriptor 'Histone H3, Histone H4, Histone H2A, Histone H2B 1.1, PC4 and SFRS1-interacting protein/DNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6S01 _struct_keywords.text 'LEDGF, PWWP, H3K36me3, nucleosome, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 44 ? GLN A 55 ? GLY A 44 GLN A 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 63 ? ALA A 75 ? ARG A 63 ALA A 75 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 85 ? ALA A 114 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 120 ? ARG A 131 ? MET A 120 ARG A 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN B 25 ? ILE B 29 ? ASN B 25 ILE B 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 30 ? GLY B 42 ? THR B 30 GLY B 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 ILE B 50 ? ALA B 76 ? ILE B 50 ALA B 76 1 ? 27 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 82 ? ARG B 92 ? THR B 82 ARG B 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 THR C 16 ? GLY C 22 ? THR C 16 GLY C 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 26 ? GLY C 37 ? PRO C 26 GLY C 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY C 46 ? ASN C 73 ? GLY C 46 ASN C 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P12 AB3 ILE C 79 ? ARG C 88 ? ILE C 79 ARG C 88 1 ? 10 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU C 92 ? LEU C 97 ? GLU C 92 LEU C 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 TYR D 34 ? HIS D 46 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 52 ? ASN D 81 ? SER D 52 ASN D 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P16 AB7 THR D 87 ? LEU D 99 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 GLU D 102 ? LYS D 122 ? GLU D 102 LYS D 122 1 ? 21 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL E 46 ? GLN E 55 ? VAL E 46 GLN E 55 1 ? 10 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG E 63 ? ALA E 75 ? ARG E 63 ALA E 75 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN E 76 ? PHE E 78 ? GLN E 76 PHE E 78 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN E 85 ? ALA E 114 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 AC4 MET E 120 ? ARG E 131 ? MET E 120 ARG E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP F 24 ? ILE F 29 ? ASP F 24 ILE F 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 30 ? GLY F 41 ? THR F 30 GLY F 41 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU F 49 ? ALA F 76 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P26 AC8 ALA F 83 ? GLN F 93 ? ALA F 83 GLN F 93 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 THR G 16 ? GLY G 22 ? THR G 16 GLY G 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 PRO G 26 ? GLY G 37 ? PRO G 26 GLY G 37 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY G 46 ? ASN G 73 ? GLY G 46 ASN G 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P30 AD3 ILE G 79 ? ARG G 88 ? ILE G 79 ARG G 88 1 ? 10 HELX_P HELX_P31 AD4 GLU G 92 ? LEU G 97 ? GLU G 92 LEU G 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 TYR H 34 ? HIS H 46 ? TYR H 34 HIS H 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 AD6 SER H 52 ? ASN H 81 ? SER H 52 ASN H 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P34 AD7 THR H 87 ? LEU H 99 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU H 102 ? LYS H 122 ? GLU H 102 LYS H 122 1 ? 21 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU K 79 ? ASN K 87 ? GLU K 79 ASN K 87 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale both ? 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I DC 22 O2 ? ? ? 1_555 J DG 144 N2 ? ? I DC -51 J DG 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? I DC 23 N3 ? ? ? 1_555 J DG 143 N1 ? ? I DC -50 J DG 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? I DC 23 N4 ? ? ? 1_555 J DG 143 O6 ? ? I DC -50 J DG 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? I DC 23 O2 ? ? ? 1_555 J DG 143 N2 ? ? I DC -50 J DG 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog48 hydrog ? ? I DG 24 N1 ? ? ? 1_555 J DC 142 N3 ? ? I DG -49 J DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog49 hydrog ? ? I DG 24 N2 ? ? ? 1_555 J DC 142 O2 ? ? I DG -49 J DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog50 hydrog ? ? I DG 24 O6 ? ? ? 1_555 J DC 142 N4 ? ? I DG -49 J DC 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog51 hydrog ? ? I DC 25 N3 ? ? ? 1_555 J DG 141 N1 ? ? I DC -48 J DG 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog52 hydrog ? ? I DC 25 N4 ? ? ? 1_555 J DG 141 O6 ? ? I DC -48 J DG 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog53 hydrog ? ? 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I DA 29 N6 ? ? ? 1_555 J DT 137 O4 ? ? I DA -44 J DT 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog63 hydrog ? ? I DT 30 N3 ? ? ? 1_555 J DA 136 N1 ? ? I DT -43 J DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog64 hydrog ? ? I DT 30 O4 ? ? ? 1_555 J DA 136 N6 ? ? I DT -43 J DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog65 hydrog ? ? I DT 31 N3 ? ? ? 1_555 J DA 135 N1 ? ? I DT -42 J DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog66 hydrog ? ? I DT 31 O4 ? ? ? 1_555 J DA 135 N6 ? ? I DT -42 J DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog67 hydrog ? ? I DG 32 N1 ? ? ? 1_555 J DC 134 N3 ? ? I DG -41 J DC 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog68 hydrog ? ? I DG 32 N2 ? ? ? 1_555 J DC 134 O2 ? ? I DG -41 J DC 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog69 hydrog ? ? I DG 32 O6 ? ? ? 1_555 J DC 134 N4 ? ? I DG -41 J DC 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog70 hydrog ? ? I DG 33 N1 ? ? ? 1_555 J DC 133 N3 ? ? I DG -40 J DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog71 hydrog ? ? I DG 33 N2 ? ? ? 1_555 J DC 133 O2 ? ? I DG -40 J DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog72 hydrog ? ? I DG 33 O6 ? ? ? 1_555 J DC 133 N4 ? ? I DG -40 J DC 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog73 hydrog ? ? I DT 34 N3 ? ? ? 1_555 J DA 132 N1 ? ? I DT -39 J DA 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog74 hydrog ? ? I DT 34 O4 ? ? ? 1_555 J DA 132 N6 ? ? I DT -39 J DA 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog75 hydrog ? ? I DC 35 N3 ? ? ? 1_555 J DG 131 N2 ? ? I DC -38 J DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog76 hydrog ? ? I DC 35 O2 ? ? ? 1_555 J DG 131 N1 ? ? I DC -38 J DG 38 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog77 hydrog ? ? I DG 36 N1 ? ? ? 1_555 J DC 130 N3 ? ? I DG -37 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog78 hydrog ? ? I DG 36 N2 ? ? ? 1_555 J DC 130 O2 ? ? I DG -37 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog79 hydrog ? ? I DG 36 O6 ? ? ? 1_555 J DC 130 N4 ? ? I DG -37 J DC 37 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog89 hydrog ? ? I DC 41 N3 ? ? ? 1_555 J DG 125 N1 ? ? I DC -32 J DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog90 hydrog ? ? I DC 41 N4 ? ? ? 1_555 J DG 125 O6 ? ? I DC -32 J DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog91 hydrog ? ? I DC 41 O2 ? ? ? 1_555 J DG 125 N2 ? ? I DC -32 J DG 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog92 hydrog ? ? I DA 42 N1 ? ? ? 1_555 J DT 124 N3 ? ? I DA -31 J DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog93 hydrog ? ? I DA 42 N6 ? ? ? 1_555 J DT 124 O4 ? ? I DA -31 J DT 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog94 hydrog ? ? I DG 43 N1 ? ? ? 1_555 J DC 123 N3 ? ? I DG -30 J DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog95 hydrog ? ? I DG 43 N2 ? ? ? 1_555 J DC 123 O2 ? ? I DG -30 J DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog96 hydrog ? ? I DG 43 O6 ? ? ? 1_555 J DC 123 N4 ? ? I DG -30 J DC 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog97 hydrog ? ? I DC 44 N3 ? ? ? 1_555 J DG 122 N1 ? ? I DC -29 J DG 29 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog275 hydrog ? ? I DC 115 N3 ? ? ? 1_555 J DG 51 N1 ? ? I DC 42 J DG -42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog276 hydrog ? ? I DC 115 N4 ? ? ? 1_555 J DG 51 O6 ? ? I DC 42 J DG -42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog277 hydrog ? ? I DC 115 O2 ? ? ? 1_555 J DG 51 N2 ? ? I DC 42 J DG -42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog278 hydrog ? ? I DT 116 N3 ? ? ? 1_555 J DA 50 N1 ? ? I DT 43 J DA -43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog279 hydrog ? ? I DT 116 O4 ? ? ? 1_555 J DA 50 N6 ? ? I DT 43 J DA -43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog280 hydrog ? ? I DC 117 O2 ? ? ? 1_555 J DG 49 N2 ? ? I DC 44 J DG -44 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? hydrog281 hydrog ? ? I DC 118 N3 ? ? ? 1_555 J DG 48 N1 ? ? I DC 45 J DG -45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog282 hydrog ? ? I DC 118 N4 ? ? ? 1_555 J DG 48 O6 ? ? I DC 45 J DG -45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog283 hydrog ? ? I DC 118 O2 ? ? ? 1_555 J DG 48 N2 ? ? 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K ILE 397 551 1 Y 1 K THR 398 ? K THR 398 552 1 Y 1 K THR 399 ? K THR 399 553 1 Y 1 K LEU 400 ? K LEU 400 554 1 Y 1 K LYS 401 ? K LYS 401 555 1 Y 1 K LYS 402 ? K LYS 402 556 1 Y 1 K ILE 403 ? K ILE 403 557 1 Y 1 K ARG 404 ? K ARG 404 558 1 Y 1 K ARG 405 ? K ARG 405 559 1 Y 1 K PHE 406 ? K PHE 406 560 1 Y 1 K LYS 407 ? K LYS 407 561 1 Y 1 K VAL 408 ? K VAL 408 562 1 Y 1 K SER 409 ? K SER 409 563 1 Y 1 K GLN 410 ? K GLN 410 564 1 Y 1 K VAL 411 ? K VAL 411 565 1 Y 1 K ILE 412 ? K ILE 412 566 1 Y 1 K MET 413 ? K MET 413 567 1 Y 1 K GLU 414 ? K GLU 414 568 1 Y 1 K LYS 415 ? K LYS 415 569 1 Y 1 K SER 416 ? K SER 416 570 1 Y 1 K THR 417 ? K THR 417 571 1 Y 1 K MET 418 ? K MET 418 572 1 Y 1 K LEU 419 ? K LEU 419 573 1 Y 1 K TYR 420 ? K TYR 420 574 1 Y 1 K ASN 421 ? K ASN 421 575 1 Y 1 K LYS 422 ? K LYS 422 576 1 Y 1 K PHE 423 ? K PHE 423 577 1 Y 1 K LYS 424 ? K LYS 424 578 1 Y 1 K ASN 425 ? K ASN 425 579 1 Y 1 K MET 426 ? K MET 426 580 1 Y 1 K PHE 427 ? K PHE 427 581 1 Y 1 K LEU 428 ? K LEU 428 582 1 Y 1 K VAL 429 ? K VAL 429 583 1 Y 1 K GLY 430 ? K GLY 430 584 1 Y 1 K GLU 431 ? K GLU 431 585 1 Y 1 K GLY 432 ? K GLY 432 586 1 Y 1 K ASP 433 ? K ASP 433 587 1 Y 1 K SER 434 ? K SER 434 588 1 Y 1 K VAL 435 ? K VAL 435 589 1 Y 1 K ILE 436 ? K ILE 436 590 1 Y 1 K THR 437 ? K THR 437 591 1 Y 1 K GLN 438 ? K GLN 438 592 1 Y 1 K VAL 439 ? K VAL 439 593 1 Y 1 K LEU 440 ? K LEU 440 594 1 Y 1 K ASN 441 ? K ASN 441 595 1 Y 1 K LYS 442 ? K LYS 442 596 1 Y 1 K SER 443 ? K SER 443 597 1 Y 1 K LEU 444 ? K LEU 444 598 1 Y 1 K ALA 445 ? K ALA 445 599 1 Y 1 K GLU 446 ? K GLU 446 600 1 Y 1 K GLN 447 ? K GLN 447 601 1 Y 1 K ARG 448 ? K ARG 448 602 1 Y 1 K GLN 449 ? K GLN 449 603 1 Y 1 K HIS 450 ? K HIS 450 604 1 Y 1 K GLU 451 ? K GLU 451 605 1 Y 1 K GLU 452 ? K GLU 452 606 1 Y 1 K ALA 453 ? K ALA 453 607 1 Y 1 K ASN 454 ? K ASN 454 608 1 Y 1 K LYS 455 ? K LYS 455 609 1 Y 1 K THR 456 ? K THR 456 610 1 Y 1 K LYS 457 ? K LYS 457 611 1 Y 1 K ASP 458 ? K ASP 458 612 1 Y 1 K GLN 459 ? K GLN 459 613 1 Y 1 K GLY 460 ? K GLY 460 614 1 Y 1 K LYS 461 ? K LYS 461 615 1 Y 1 K LYS 462 ? K LYS 462 616 1 Y 1 K GLY 463 ? K GLY 463 617 1 Y 1 K PRO 464 ? K PRO 464 618 1 Y 1 K ASN 465 ? K ASN 465 619 1 Y 1 K LYS 466 ? K LYS 466 620 1 Y 1 K LYS 467 ? K LYS 467 621 1 Y 1 K LEU 468 ? K LEU 468 622 1 Y 1 K GLU 469 ? K GLU 469 623 1 Y 1 K LYS 470 ? K LYS 470 624 1 Y 1 K GLU 471 ? K GLU 471 625 1 Y 1 K GLN 472 ? K GLN 472 626 1 Y 1 K THR 473 ? K THR 473 627 1 Y 1 K GLY 474 ? K GLY 474 628 1 Y 1 K SER 475 ? K SER 475 629 1 Y 1 K LYS 476 ? K LYS 476 630 1 Y 1 K THR 477 ? K THR 477 631 1 Y 1 K LEU 478 ? K LEU 478 632 1 Y 1 K ASN 479 ? K ASN 479 633 1 Y 1 K GLY 480 ? K GLY 480 634 1 Y 1 K GLY 481 ? K GLY 481 635 1 Y 1 K SER 482 ? K SER 482 636 1 Y 1 K ASP 483 ? K ASP 483 637 1 Y 1 K ALA 484 ? K ALA 484 638 1 Y 1 K GLN 485 ? K GLN 485 639 1 Y 1 K ASP 486 ? K ASP 486 640 1 Y 1 K GLY 487 ? K GLY 487 641 1 Y 1 K ASN 488 ? K ASN 488 642 1 Y 1 K GLN 489 ? K GLN 489 643 1 Y 1 K PRO 490 ? K PRO 490 644 1 Y 1 K GLN 491 ? K GLN 491 645 1 Y 1 K HIS 492 ? K HIS 492 646 1 Y 1 K ASN 493 ? K ASN 493 647 1 Y 1 K GLY 494 ? K GLY 494 648 1 Y 1 K GLU 495 ? K GLU 495 649 1 Y 1 K SER 496 ? K SER 496 650 1 Y 1 K ASN 497 ? K ASN 497 651 1 Y 1 K GLU 498 ? K GLU 498 652 1 Y 1 K ASP 499 ? K ASP 499 653 1 Y 1 K SER 500 ? K SER 500 654 1 Y 1 K LYS 501 ? K LYS 501 655 1 Y 1 K ASP 502 ? K ASP 502 656 1 Y 1 K ASN 503 ? K ASN 503 657 1 Y 1 K HIS 504 ? K HIS 504 658 1 Y 1 K GLU 505 ? K GLU 505 659 1 Y 1 K ALA 506 ? K ALA 506 660 1 Y 1 K SER 507 ? K SER 507 661 1 Y 1 K THR 508 ? K THR 508 662 1 Y 1 K LYS 509 ? K LYS 509 663 1 Y 1 K LYS 510 ? K LYS 510 664 1 Y 1 K LYS 511 ? K LYS 511 665 1 Y 1 K PRO 512 ? K PRO 512 666 1 Y 1 K SER 513 ? K SER 513 667 1 Y 1 K SER 514 ? K SER 514 668 1 Y 1 K GLU 515 ? K GLU 515 669 1 Y 1 K GLU 516 ? K GLU 516 670 1 Y 1 K ARG 517 ? K ARG 517 671 1 Y 1 K GLU 518 ? K GLU 518 672 1 Y 1 K THR 519 ? K THR 519 673 1 Y 1 K GLU 520 ? K GLU 520 674 1 Y 1 K ILE 521 ? K ILE 521 675 1 Y 1 K SER 522 ? K SER 522 676 1 Y 1 K LEU 523 ? K LEU 523 677 1 Y 1 K LYS 524 ? K LYS 524 678 1 Y 1 K ASP 525 ? K ASP 525 679 1 Y 1 K SER 526 ? K SER 526 680 1 Y 1 K THR 527 ? K THR 527 681 1 Y 1 K LEU 528 ? K LEU 528 682 1 Y 1 K ASP 529 ? K ASP 529 683 1 Y 1 K ASN 530 ? 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'Xenopus laevis' ? ? 2 3 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 3 4 ? ? 32630 ? ? 'synthetic construct' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 1 2 ? 562 'Escherichia coli' ? ? 2 3 ? 7111 'Trichoplusia ni' ? ? 3 4 ? 32630 'synthetic construct' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 43.18 _em_image_recording.average_exposure_time 9 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 527640 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? 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