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_citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2019.10.009 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31708416 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Qiao, S.' 1 ? primary 'Langlois, C.R.' 2 ? primary 'Chrustowicz, J.' 3 ? primary 'Sherpa, D.' 4 ? primary 'Karayel, O.' 5 ? primary 'Hansen, F.M.' 6 ? primary 'Beier, V.' 7 ? primary 'von Gronau, S.' 8 ? primary 'Bollschweiler, D.' 9 ? primary 'Schafer, T.' 10 ? primary 'Alpi, A.F.' 11 ? primary 'Mann, M.' 12 ? primary 'Rajan Prabu, J.' 13 ? primary 'Schulman, B.A.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Vacuolar import and degradation protein 28' 105658.203 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Glucose-induced degradation 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 921 ;Baker's yeast ; ? 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'FYV10, GID9, YIL097W' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae S288c' 559292 ? ? ? ? ? ? ? 'Fall armyworm' 'Spodoptera aff. frugiperda 1 BOLD-2017' 2449148 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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O PHE 4 330 AA7 7 8 N ILE D 327 ? N ILE 4 327 O LEU D 344 ? O LEU 4 344 AA7 8 9 O VAL D 345 ? O VAL 4 345 N THR D 130 ? N THR 4 130 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 TYR 5 5 ? ? -175.15 -175.88 2 1 SER 5 6 ? ? 62.57 81.53 3 1 GLU 5 163 ? ? 81.37 -6.69 4 1 CYS 5 242 ? ? -101.95 40.42 5 1 ARG 5 244 ? ? 78.06 -4.13 6 1 GLU 5 322 ? ? -94.12 51.97 7 1 THR 5 429 ? ? 68.34 -2.57 8 1 HIS 5 464 ? ? -104.22 41.30 9 1 VAL 5 726 ? ? -98.47 -64.13 10 1 TYR 5 758 ? ? 72.19 -7.91 11 1 TRP 5 777 ? ? -79.19 -166.73 12 1 THR 5 897 ? ? -97.33 30.18 13 1 SER 8 241 ? ? -176.33 -179.18 14 1 SER 8 279 ? ? -76.83 -169.51 15 1 ASN 8 318 ? ? 58.39 71.33 16 1 LEU 8 335 ? ? -149.71 -159.87 17 1 ASN 8 337 ? ? -170.34 -173.88 18 1 ASN 8 392 ? ? 60.97 60.97 19 1 ASN 8 417 ? ? -92.00 56.59 20 1 PRO 1 25 ? ? -65.97 2.41 21 1 LEU 1 81 ? ? -69.98 -175.03 22 1 LEU 1 84 ? ? -172.48 140.93 23 1 ILE 1 344 ? ? -125.23 -56.53 24 1 ARG 1 535 ? ? 75.83 -15.45 25 1 PRO 1 579 ? ? -62.69 4.11 26 1 ASP 1 596 ? ? 64.37 63.80 27 1 ALA 1 914 ? ? 73.26 -10.18 28 1 VAL 1 955 ? ? -120.90 -52.89 29 1 UNK 1 3808 ? ? -149.60 -64.83 30 1 UNK 1 3832 ? ? -95.96 30.92 31 1 UNK 1 3879 ? ? -70.69 -70.76 32 1 ASN 4 106 ? ? -59.16 109.49 33 1 PRO 4 107 ? ? -75.97 -169.28 34 1 ILE 4 109 ? ? -39.51 136.28 35 1 TYR 4 114 ? ? 73.57 -2.47 36 1 HIS 4 190 ? ? 72.61 -6.35 37 1 GLU 4 192 ? ? 61.80 -0.46 38 1 LEU 4 193 ? ? -141.29 46.03 39 1 ASP 4 202 ? ? -100.72 75.23 40 1 ASN 4 284 ? ? -91.24 52.88 41 1 ASP 4 313 ? ? -92.68 53.73 42 1 ASP 4 335 ? ? -96.06 54.93 43 1 ALA 4 336 ? ? -127.14 -169.52 44 1 ASP 9 241 ? ? -69.50 10.14 45 1 UNK 9 3203 ? ? -62.00 75.70 46 1 UNK 9 3214 ? ? -69.48 -72.54 47 1 UNK 9 3221 ? ? -67.71 -95.19 # loop_ _pdbx_validate_polymer_linkage.id _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_model_num _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.label_alt_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.label_alt_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.dist 1 1 C 1 LEU 958 ? ? 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