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NRGHAPEHFYKAGGSIIRKALQQLEAAGFVQKVPGEGRIVTPQGQSFLDRIATELKKELEEQLPELKKY ; ;ATVYDVPGDLLVERTAKALKEVEAIKPPEWAPFVKTGRHKERIPEQEDWWYYRVASIFRKIYIDGPVGIERLRTWYGGRK NRGHAPEHFYKAGGSIIRKALQQLEAAGFVQKVPGEGRIVTPQGQSFLDRIATELKKELEEQLPELKKY ; V ? 23 'polypeptide(L)' no no KFEVPVCTSCGKEITPREHATHFVCPNCGEAIIWRCESCRVLSVPYKCPKCGWEGP KFEVPVCTSCGKEITPREHATHFVCPNCGEAIIWRCESCRVLSVPYKCPKCGWEGP W ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MEIKVREMKENRLLGRKEIYFDVIHEGEATPSRADVKGKLVAMLDLNPETVVIQYIRSYFGSRVSRGYAKAYESKERMLY IEPEYVLVRDGIIKKEE ; ;MEIKVREMKENRLLGRKEIYFDVIHEGEATPSRADVKGKLVAMLDLNPETVVIQYIRSYFGSRVSRGYAKAYESKERMLY IEPEYVLVRDGIIKKEE ; X ? 25 'polypeptide(L)' no no LPKNLIPMPKSRFLRVKCIDCGNEQIVFSNPSTTVRCLVCGATLVEPTGGKGILKAKVLEVLE LPKNLIPMPKSRFLRVKCIDCGNEQIVFSNPSTTVRCLVCGATLVEPTGGKGILKAKVLEVLE Y ? 26 'polypeptide(L)' no no MGQKWKLYEVKGGKVRRKNKFCPRCGPGVFMAEHKDRWSCGRCGYTEWKR MGQKWKLYEVKGGKVRRKNKFCPRCGPGVFMAEHKDRWSCGRCGYTEWKR Z ? 27 'polypeptide(L)' no no MSDEGYPAEVIEIVARTGVTGGVTQVKVRILEGRDKGRVIRRNVKGPVRVGDIVILRETEREAREI MSDEGYPAEVIEIVARTGVTGGVTQVKVRILEGRDKGRVIRRNVKGPVRVGDIVILRETEREAREI a ? 28 'polypeptide(L)' no no ;MAKPSYVKFEVPAELAEKALEAVELARDTGRIRKGTNETTKAVERGQAKLVVIAEDVDPEEIVAHLPPLCEEKEIPYIYV PSKKELGAAAGIEVPAASVAILEPGKGRELVEDIAAKVRELMK ; ;MAKPSYVKFEVPAELAEKALEAVELARDTGRIRKGTNETTKAVERGQAKLVVIAEDVDPEEIVAHLPPLCEEKEIPYIYV PSKKELGAAAGIEVPAASVAILEPGKGRELVEDIAAKVRELMK ; b ? 29 'polypeptide(L)' no no MKRRPRKWKKKGRMRWKWIKKRIRRLKKQRRKERGLI MKRRPRKWKKKGRMRWKWIKKRIRRLKKQRRKERGLI c ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MRVAVINYDFCKPDKCNLECINFCPVDRSGGKAIELSEIVKGKPVIYEETCIGCGICVKKCPYEAISIVNLPDELEGEVI HRYKVNGFKLFGLPTPKNNTILGVLGKNGVGKTTVLKILAGEIIPNFGDPNSKVGKDEVLKRFRGKEIYNYFKELYSNEL KIVHKIQYVEYASKFLKGTVNEILTKIDERGKKDEVKELLNMTNLWNKDANILSGGGLQRLLVAASLLREADVYIFDAPS SYLDVRERMNMAKAIRELLKNKYVIVVDHDLIVLDYLTDLIHIIYGESSVYGRVSKSYAARVGINNFLKGYLPAENMKIR PDEIKFMLKEVSDLDLSKDLKTKMKWTKIIKKLGDFQLVVDNGEAKEGEIIGILGPNGIGKTTFARILVGEITADEGSVT PEKQILSYKPQRIFPNYDGTVQQYLENASKDALSTSSWFFEEVTKRLNLHRLLESNVNDLSGGELQKLYIAATLAKEADL 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'Thermococcus celer Vu 13 = JCM 8558' 1293037 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 GB CP014854.1 1214542111 ? 1 ;AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGCCACUGCUAUGGGGGUCCGACUAAGCCAUGCGAGUCAUGGGGCGCCUUGCGCGCACC GGCGGACGGCUCAGUAACACGUCGGUAACCUACCCUCGGGAGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAG GCCUGAGGUACUGGAAGGUCCUCAGGCCGAAAGGGGCUCUGCCCGCCCGAGGAUGGGCCGGCGGCCGAUUAGGUAGUUGG UGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCGGUACGGGCCAUGAGAGUGGGAGCCCGGAGAUGGACACUGAGACACGGGUC CAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGCAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGUGCCGUGGCAA CGCCACGGCUUUUCCGGAGUGUAAAAAGCUCCGGGAAUAAGGGCUGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCG GCGGCCCGAGUGGUGGCCGCUAUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGGCCCGUAAGUCCCUGGCGAAAUCCCACGGC UCAACCGUGGGGCUUGCUGGGGAUACUGCGGGCCUUGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUACCCCUGGGGUAGGGGUGAAAU CCUAUAAUCCCAGGGGGACCGCCAGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGGGACGAAGGCCAGGGGA GCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAAGGAUGCGGGCUAGGUGUCGGGCGAGCUUCGAGCUCGCCCGG UGCCGAAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCA CUACAAGGGGUGGAGCGUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAACCUCACCGGGGGCGACGGCAGGAUGAAGGCCAGG CUGAAGGUCUUGCCGGACACGCCGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCACUUAAGUGUGG UAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGUCCUUCCCGCUGGGGAGGAGGCACUCUGGGGGGACCGCCGGCGAUAAG CCGGAGGAAGGAGCGGGCGACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAACCCCCGGGCUACACGCGCGCUACAAUGGGCGGGACAA UGGGAUCCGACCCCGAAAGGGGAAGGGAAUCCCCUAAACCCGCCCCCAGUUCGGAUCGCGGGCUGCAACUCGCCCGCGUG AAGCUGGAAUCCCUAGUACCCGCGUGUCAUCAUCGCGCGGCGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCACUC CACCCGAGCGGGGUCCGGAUGAGGCCUGAUCUCCCUUCGGGGAGGUCGGGUCGAGUCUGGGCUCCGUGAGGGGGGAGAAG UCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUACGGCUCGAUCACCUCC ; 1055940 2 UNP A0A218NZR2_THECE A0A218NZR2 ? 2 ;YLVPLDQYLAAGVHIGTQQKTQDMKKFIYRVRQDGLYVLDVRKTDERLRTAGKFLAKFDPTSILAVSVRLYGQKPVKKFG EVTGARAIPGRFLPGTMTNPQVKNFIEPDVLIVTDPRADHQAMKEAIEIGIPIVALVDTENFLSYVDLAIPTNNKGRKAL ALIYWILAREILYNRKEIESREDFKVPVEEFEMRI ; 4 3 UNP A0A218NZU7_THECE A0A218NZU7 ? 3 ;MAIERYFIEEGVREMLIDEYLEKELRRAGYSGIDIKKTPLGTKVVIFAASPGYVIGRGGRRIRELTRILERQFGLENPQI EVEEIKNPYLNAKVQAIRLARALERGIHFRRAAYSAIRAIMRNGARGVEIRLSGKLTGERAKSVRFYQGYLAKVGNPAET LVSRGYAQAKLKLGVIGVKVSIMPPDAKLPDEI ; 1 4 UNP A0A218P0R0_THECE A0A218P0R0 ? 4 ;DKWKMKEWYVVYAPDFFGSKEIGLTPADEPEKVIGRVIETTLRDLTGDFTKGQVKLYFQIYDVKGQNAYTKFKGHTLARS YIRSLVRRRTTRIDGIFNVTTKDGYKLRVMGMVIAYRRIQTSQERAIREIIRDIIYKKAEELNYRDFVLEAVSGKMAAEI AKEARRIYPIKRAEIRKIKVLAEP ; 15 5 UNP A0A218NZV3_THECE A0A218NZV3 ? 5 ;DPKRQRKKYETPSHPWIKERLDRERVIMRKYALKNKKELWRHETQLKEFRRRARRLLAARGKQAEVERVQLLQRLNRLGL LPADAVLDDVLSLTVEDVLDRRLQTIVYKKGLARTPRQARQLIVHGHIEVNGQIIRSPGYLVLKAEEDTITYSKTSPFAR ESHPERMVIEQAKQGGEA ; 3 6 UNP A0A218NZX1_THECE A0A218NZX1 ? 6 ;RKGAKRHLKRLAAPDQWYISRKRYKWAVRPRPGPHSMKTSIPLLYIVRDYLGYAKTAREARKILNEGRILVDGRVRRDYK FPVGIMDVVSIPETGEHYRVLPNRIGKLVLHPISEKEANIKPLRISNKRMVKGAKVQLNLHDGSNHLVTVDDKDNYRTAY TVLMKVPDREVIEILPFDVGAYVFVTRGKNVARKGKIVEVRRFPMGWPDVVTIEDENGELFDTLKEYAFVVGKEKPEISL P ; 3 7 UNP A0A218P4N5_THECE A0A218P4N5 ? 7 ;SQRVLEEWEPRTKLGQLVKAGQITDIHEIFRKGYQIKEPEIVDVLLPEVNMRENQEVLDIALTVRMTDSGRRIRFRVLAA VGNRDGYVGLGIGHGREVGIAIRKAINYAKMNIIEIKRGCGSWECRCRRPHSIPFAVEGKEGSVRVKLMPGPRGLGLVIG DVGKKILSLAGVQDVWSQSLGETRTTVNFAKAVFNALYNTNRVAIQPGMEEKYGIVVGRE ; 2 8 UNP A0A218P2W6_THECE A0A218P2W6 ? 8 ;MATFKLVISNPRNGIARQVEISGESAEKLVGKRIGDEIPASELGLNLTEIFGEEIPGDVKLRITGGTDRDGFAMRPDVHG PRRVKILVSRGPGFRPKERGERRKKTVRGNTISPEIVQVNMKLVF ; 1 9 UNP A0A218P4K4_THECE A0A218P4K4 ? 9 ;AKALTERFYQPKELKVMGRWSVEDVTVNDPSLRPYINLEARLLPHSHGRHAKKAFGKANVHIVERLINKVMRSGASSHKA GGHFMRREHRSLMSKKMKAYEVVKEAFMIIERRTKQNPIQVLVRAIENSAPREDTTTIAFGGIRYHMAVDVSPLRRLDIA LKNIALGASAKCYRNKTSYAQALAEEIIAAANADPKSFAYSRKEEIERIAQSSR ; 2 10 UNP A0A218NZT7_THECE A0A218NZT7 ? 10 ;TLLDPLANALSHITNSERVGKKEVYLKPASKLMGEVLRVMQENGYIGEFEFIDDGRAGIYRVQLIGKINKAGAIKPRFPV KAREYEAWEKRFLPAFEFGILIVSTSQGVMTHKEAIEKGIGGRLIAYVY ; 2 11 UNP A0A218P4F6_THECE A0A218P4F6 ? 11 ;AIWQGRSLKKPSGGRIILARKKRKRELGREPAFTRVGEEKEKKKIIRTYGGNRKVRLIEAIYANVFENGKGRKVKVLGVV ENPANRQYVRRDIITKGAIIETEAGRAIVTSRPGQDGVVNAVLIKE ; 2 12 UNP A0A218NZS6_THECE A0A218NZS6 ? 12 ;MKVIQTAGKRKTAIARATIREGKGRVRINHRPVEIIEPEIARFTIMEPLVLAGEEIVKGVDIDVKVEGGGFMGQAEAARV AIARALVEWTNDMNLKEKFMKYDRTMLVGDSRRTEPHKPNRSTKGPRAKRQK ; 1 13 UNP A0A218P3Q8_THECE A0A218P3Q8 ? 13 ;MQKARIKLASTDIKALNEVTDQIRQIAERTGVRMSGPIPLPTKRIRITTRKSPDGEGTATFDKFELRVHKRLVDIEADER AMRQIMRIRVPEDVTIEIELIS ; 1 14 UNP A0A218NZU0_THECE A0A218NZU0 ? 14 ;QVNLKKKEKWGVAHIYSSYNNTIIHITDLTGAETVSRWSGGMVVKADRDEPSPYAAMIAARRAAEEAMEKGFTGVHIKVR APGGSKSKSPGPGAQAAIRALARAGLRIGRVEDVTPIPHDGTRPKGGRRGRRV ; 7 15 UNP A0A218P4I2_THECE A0A218P4I2 ? 15 ;GKKAPYGEFAGRKLKLKRKKFRWSDIRYKRRVLRLKEKSDPLEGAPQAKGIVLEKIAVEAKQPNSAMRKAVRVQLIKNGK VVTAFTPGDGAINHIDEHDEVIIEGIGGPKGGSMGDIPGIRYKVVKVNRVSLKELVKGRKEKPR ; 3 16 UNP A0A218NZT2_THECE A0A218NZT2 ? 16 ;DEFRHIVRIAGVDLNGNKQLRWALTGIRGIGINFATMVLRVAGIDPYMKTGYLTNEQIKKIEEILEDPVAHGIPAWAVNR PKDYETGKDMHLITAKLVMAWREDVNRLRRVRAYRGIRHELGLPLRGQRTRSNFRH ; 3 17 UNP A0A218NZW1_THECE A0A218NZW1 ? 17 MAKADYNKRKPRKFGKGARRCVRCGQYGPVIRVHGLMLCRHCFREIAPKLGFKKYE 1 18 UNP A0A218P0Q1_THECE A0A218P0Q1 ? 18 ;MARMHARKRGKSGSKRPPRTAPPTWVEYTAEEVEGLVVKLRKEGYSAAMIGTILRDQYGIPSVKLITGKKITKILEENGL APQIPEDLMALIRKAVNLRKHLEMHPKDRHSMRGLQLTESKIRRLVKYYRRTGKLPAKWRYDPEQAKLLVR ; 1 19 UNP A0A218NZX3_THECE A0A218NZX3 ? 19 ;MREIGLKVQPPAEKCDDPHCPWHGHLRIHGRYFEGIVVSDKGKKTVVVERRHYHYLKKYERYELRRSKVHAHNPECIDAK VGDRVLVAETRPISKTKSWVVVAVTKRAGER ; 1 20 UNP A0A218P2C1_THECE A0A218P2C1 ? 20 MGNIKQMFIKRTARELFDRYPNEFSRDFEHNKKKVEELTNVTSKTIRNRIAGYITKLVRMKEEG 1 21 UNP A0A218P4M9_THECE A0A218P4M9 ? 21 ;EFKYRGYTFEELLNMSLEDFAKLLPSRQRRSLKRGLSPEQKKLLRKIRLARKGKYKKPIRTHSRDMVILPEMVGITIHVY NGKEFVPVEIKEEMIGHYLGEFALTRKVVQHGSPG ; 6 22 UNP A0A218P4W7_THECE A0A218P4W7 ? 22 ;ATVYDVPGDLLVERTAKALKEVEAIKPPEWAPFVKTGRHKERIPEQEDWWYYRVASIFRKIYIDGPVGIERLRTWYGGRK NRGHAPEHFYKAGGSIIRKALQQLEAAGFVQKVPGEGRIVTPQGQSFLDRIATELKKELEEQLPELKKY ; 2 23 UNP A0A218P055_THECE A0A218P055 ? 23 KFEVPVCTSCGKEITPREHATHFVCPNCGEAIIWRCESCRVLSVPYKCPKCGWEGP 4 24 UNP A0A218P0B9_THECE A0A218P0B9 ? 24 ;MEIKVREMKENRLLGRKEIYFDVIHEGEATPSRADVKGKLVAMLDLNPETVVIQYIRSYFGSRVSRGYAKAYESKERMLY IEPEYVLVRDGIIKKEE ; 1 25 UNP A0A218NZS1_THECE A0A218NZS1 ? 25 LPKNLIPMPKSRFLRVKCIDCGNEQIVFSNPSTTVRCLVCGATLVEPTGGKGILKAKVLEVLE 3 26 UNP A0A218P0A5_THECE A0A218P0A5 ? 26 MGQKWKLYEVKGGKVRRKNKFCPRCGPGVFMAEHKDRWSCGRCGYTEWKR 1 27 UNP A0A218P147_THECE A0A218P147 ? 27 MSDEGYPAEVIEIVARTGVTGGVTQVKVRILEGRDKGRVIRRNVKGPVRVGDIVILRETEREAREI 1 28 UNP A0A218P167_THECE A0A218P167 ? 28 ;MAKPSYVKFEVPAELAEKALEAVELARDTGRIRKGTNETTKAVERGQAKLVVIAEDVDPEEIVAHLPPLCEEKEIPYIYV PSKKELGAAAGIEVPAASVAILEPGKGRELVEDIAAKVRELMK ; 1 29 UNP A0A218P2S9_THECE A0A218P2S9 ? 29 MKRRPRKWKKKGRMRWKWIKKRIRRLKKQRRKERGLI 1 30 UNP A0A0E3MFT8_SACSO A0A0E3MFT8 ? 30 ;MRVAVINYDFCKPDKCNLECINFCPVDRSGGKAIELSEIVKGKPVIYEETCIGCGICVKKCPYEAISIVNLPDELEGEVI HRYKVNGFKLFGLPTPKNNTILGVLGKNGVGKTTVLKILAGEIIPNFGDPNSKVGKDEVLKRFRGKEIYNYFKELYSNEL KIVHKIQYVEYASKFLKGTVNEILTKIDERGKKDEVKELLNMTNLWNKDANILSGGGLQRLLVAASLLREADVYIFDEPS SYLDVRERMNMAKAIRELLKNKYVIVVDHDLIVLDYLTDLIHIIYGESSVYGRVSKSYAARVGINNFLKGYLPAENMKIR PDEIKFMLKEVSDLDLSKDLKTKMKWTKIIKKLGDFQLVVDNGEAKEGEIIGILGPNGIGKTTFARILVGEITADEGSVT PEKQILSYKPQRIFPNYDGTVQQYLENASKDALSTSSWFFEEVTKRLNLHRLLESNVNDLSGGELQKLYIAATLAKEADL YVLDEPSSYLDVEERYIVAKAIKRVTRERKAVTFIIDHDLSIHDYIADRIIVFKGEPEKAGLATSPVTLKTGMNEFLREL EVTFRRDAETGRPRVNKIGSYLDRVQKERGDYYS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6TMF A 1 ? 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A0A218NZR2 4 ? 198 ? 4 198 3 3 6TMF C 1 ? 193 ? A0A218NZU7 1 ? 193 ? 1 193 4 4 6TMF D 1 ? 184 ? A0A218P0R0 15 ? 198 ? 15 198 5 5 6TMF E 1 ? 178 ? A0A218NZV3 3 ? 180 ? 3 180 6 6 6TMF F 1 ? 241 ? A0A218NZX1 3 ? 243 ? 3 243 7 7 6TMF G 1 ? 220 ? A0A218P4N5 2 ? 221 ? 2 221 8 8 6TMF H 1 ? 125 ? A0A218P2W6 1 ? 125 ? 1 125 9 9 6TMF I 1 ? 214 ? A0A218P4K4 2 ? 215 ? 2 215 10 10 6TMF J 1 ? 129 ? A0A218NZT7 2 ? 130 ? 2 130 11 11 6TMF K 1 ? 126 ? A0A218P4F6 2 ? 127 ? 2 127 12 12 6TMF L 1 ? 132 ? A0A218NZS6 1 ? 132 ? 1 132 13 13 6TMF M 1 ? 102 ? A0A218P3Q8 1 ? 102 ? 1 102 14 14 6TMF N 1 ? 133 ? A0A218NZU0 7 ? 139 ? 7 139 15 15 6TMF O 1 ? 144 ? A0A218P4I2 3 ? 146 ? 3 146 16 16 6TMF P 1 ? 136 ? A0A218NZT2 3 ? 138 ? 3 138 17 17 6TMF Q 1 ? 56 ? A0A218NZW1 1 ? 56 ? 1 56 18 18 6TMF R 1 ? 151 ? A0A218P0Q1 1 ? 151 ? 1 151 19 19 6TMF S 1 ? 111 ? A0A218NZX3 1 ? 111 ? 1 111 20 20 6TMF T 1 ? 64 ? A0A218P2C1 1 ? 64 ? 1 64 21 21 6TMF U 1 ? 115 ? A0A218P4M9 6 ? 120 ? 6 120 22 22 6TMF V 1 ? 149 ? A0A218P4W7 2 ? 150 ? 2 150 23 23 6TMF W 1 ? 56 ? A0A218P055 4 ? 59 ? 4 59 24 24 6TMF X 1 ? 97 ? A0A218P0B9 1 ? 97 ? 1 97 25 25 6TMF Y 1 ? 63 ? A0A218NZS1 3 ? 65 ? 3 65 26 26 6TMF Z 1 ? 50 ? A0A218P0A5 1 ? 50 ? 1 50 27 27 6TMF a 1 ? 66 ? A0A218P147 1 ? 66 ? 1 66 28 28 6TMF b 1 ? 123 ? A0A218P167 1 ? 123 ? 1 123 29 29 6TMF c 1 ? 37 ? A0A218P2S9 1 ? 37 ? 1 37 30 30 6TMF d 1 ? 594 ? A0A0E3MFT8 1 ? 594 ? 1 594 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 30 6TMF ALA d 238 ? UNP A0A0E3MFT8 GLU 238 'engineered mutation' 238 1 30 6TMF ALA d 485 ? UNP A0A0E3MFT8 GLU 485 'engineered mutation' 485 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ANP non-polymer . 'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' ? 'C10 H17 N6 O12 P3' 506.196 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.1094 ? 101585 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0713 ? 12442 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0074 ? 7352 ? f_plane_restr ? ? 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A C 337 A MG 1513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? metalc11 metalc ? ? A U 445 OP1 ? ? ? 1_555 DB MG . MG ? ? A U 445 A MG 1526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc12 metalc ? ? A A 514 OP2 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A A 514 A MG 1514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc13 metalc ? ? A A 515 OP2 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A A 515 A MG 1514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc14 metalc ? ? A A 516 OP2 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A A 516 A MG 1514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc15 metalc ? ? A A 550 OP2 ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A A 550 A MG 1515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc16 metalc ? ? A A 725 OP1 ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? A A 725 A MG 1507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? metalc17 metalc ? ? A A 737 OP1 ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? A A 737 A MG 1507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc18 metalc ? ? A G 805 OP2 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A G 805 A MG 1505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc19 metalc ? ? A G 816 O6 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A G 816 A MG 1505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? metalc20 metalc ? ? A U 831 "O2'" ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? A U 831 A MG 1506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.945 ? metalc21 metalc ? ? A G 832 OP2 ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? A G 832 A MG 1506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc22 metalc ? ? A A 883 OP1 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A A 883 A MG 1516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? metalc23 metalc ? ? A A 883 OP2 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A A 883 A MG 1516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.930 ? metalc24 metalc ? ? A A 885 OP2 ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? A A 885 A MG 1517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc25 metalc ? ? A G 924 OP1 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A G 924 A MG 1518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? metalc26 metalc ? ? A C 995 OP1 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A C 995 A MG 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc27 metalc ? ? A C 995 "O5'" ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A C 995 A MG 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? metalc28 metalc ? ? A C 1010 OP2 ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? A C 1010 A MG 1519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc29 metalc ? ? A G 1051 OP2 ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? A G 1051 A MG 1520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.797 ? metalc30 metalc ? ? A C 1107 OP2 ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? A C 1107 A MG 1521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc31 metalc ? ? A G 1146 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A G 1146 A MG 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? metalc32 metalc ? ? A G 1146 OP2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A G 1146 A MG 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc33 metalc ? ? A G 1147 OP2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A G 1147 A MG 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc34 metalc ? ? A A 1187 OP2 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? A A 1187 A MG 1524 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? metalc35 metalc ? ? A C 1252 OP1 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? A C 1252 A MG 1525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc36 metalc ? ? A G 1253 OP2 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? A G 1253 A MG 1525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.130 ? metalc37 metalc ? ? A C 1284 O2 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? A C 1284 A MG 1524 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc38 metalc ? ? A C 1291 OP1 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A C 1291 A MG 1516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc39 metalc ? ? A A 1445 OP1 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? A A 1445 A MG 1510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc40 metalc ? ? A A 1445 OP2 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? A A 1445 A MG 1510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc41 metalc ? ? A A 1446 OP1 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A A 1446 A MG 1509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? metalc42 metalc ? ? A A 1446 OP2 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? A A 1446 A MG 1510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? metalc43 metalc ? ? A G 1451 OP1 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A G 1451 A MG 1509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc44 metalc ? ? A G 1451 OP2 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? A G 1451 A MG 1510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc45 metalc ? ? A G 1454 OP1 ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? A G 1454 A MG 1508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? metalc46 metalc ? ? A G 1454 OP1 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A G 1454 A MG 1509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc47 metalc ? ? A C 1467 OP1 ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? A C 1467 A MG 1508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc48 metalc ? ? Q CYS 21 SG ? ? ? 1_555 FB ZN . ZN ? ? Q CYS 21 Q ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc49 metalc ? ? Q CYS 24 SG ? ? ? 1_555 FB ZN . ZN ? ? Q CYS 24 Q ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc50 metalc ? ? Q CYS 39 SG ? ? ? 1_555 FB ZN . ZN ? ? Q CYS 39 Q ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc51 metalc ? ? Q CYS 42 SG ? ? ? 1_555 FB ZN . ZN ? ? Q CYS 42 Q ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc52 metalc ? ? W CYS 7 SG ? ? ? 1_555 HB ZN . ZN ? ? W CYS 10 W ZN 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc53 metalc ? ? W CYS 10 SG ? ? ? 1_555 HB ZN . ZN ? ? W CYS 13 W ZN 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc54 metalc ? ? W CYS 25 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? W CYS 28 W ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc55 metalc ? ? W CYS 28 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? W CYS 31 W ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc56 metalc ? ? W CYS 36 SG ? ? ? 1_555 HB ZN . ZN ? ? W CYS 39 W ZN 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc57 metalc ? ? W CYS 39 SG ? ? ? 1_555 HB ZN . ZN ? ? W CYS 42 W ZN 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc58 metalc ? ? W CYS 48 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? W CYS 51 W ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc59 metalc ? ? W CYS 51 SG ? ? ? 1_555 GB ZN . ZN ? ? W CYS 54 W ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc60 metalc ? ? Y CYS 18 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? Y CYS 20 Y ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc61 metalc ? ? Y CYS 37 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? Y CYS 39 Y ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc62 metalc ? ? Y CYS 40 SG ? ? ? 1_555 IB ZN . ZN ? ? Y CYS 42 Y ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc63 metalc ? ? DA CYS 51 SG ? ? ? 1_555 JB SF4 . FE2 ? ? d CYS 51 d SF4 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc64 metalc ? ? DA GLY 53 O ? ? ? 1_555 JB SF4 . FE4 ? ? d GLY 53 d SF4 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc65 metalc ? ? DA CYS 61 SG ? ? ? 1_555 KB SF4 . FE3 ? ? d CYS 61 d SF4 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.120 ? metalc66 metalc ? ? DA THR 113 OG1 ? ? ? 1_555 MB MG . MG ? ? d THR 113 d MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc67 metalc ? ? DA GLN 167 OE1 ? ? ? 1_555 MB MG . MG ? ? d GLN 167 d MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc68 metalc ? ? DA THR 382 OG1 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? d THR 382 d MG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc69 metalc ? ? LB ANP . O3G ? ? ? 1_555 MB MG . MG ? ? d ANP 603 d MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? metalc70 metalc ? ? LB ANP . O2B ? ? ? 1_555 MB MG . MG ? ? d ANP 603 d MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc71 metalc ? ? NB ANP . O2G ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? d ANP 605 d MG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.750 ? metalc72 metalc ? ? NB ANP . O1B ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? d ANP 605 d MG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? hydrog1 hydrog ? ? A C 4 N3 ? ? ? 1_555 A G 20 N1 ? ? A C 4 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2 hydrog ? ? A C 4 N4 ? ? ? 1_555 A G 20 O6 ? ? A C 4 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A C 4 O2 ? ? ? 1_555 A G 20 N2 ? ? A C 4 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A C 5 N3 ? ? ? 1_555 A G 19 N1 ? ? A C 5 A G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A C 5 N4 ? ? ? 1_555 A G 19 O6 ? ? A C 5 A G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A C 5 O2 ? ? ? 1_555 A G 19 N2 ? ? A C 5 A G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A G 6 N1 ? ? ? 1_555 A C 18 N3 ? ? A G 6 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A G 6 N2 ? ? ? 1_555 A C 18 O2 ? ? A G 6 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 6 O6 ? ? ? 1_555 A C 18 N4 ? ? A G 6 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A G 7 N1 ? ? ? 1_555 A C 17 N3 ? ? A G 7 A C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog11 hydrog ? ? A G 7 N2 ? ? ? 1_555 A C 17 O2 ? ? A G 7 A C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 7 O6 ? ? ? 1_555 A C 17 N4 ? ? A G 7 A C 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog13 hydrog ? ? A U 8 O4 ? ? ? 1_555 A U 15 N3 ? ? A U 8 A U 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 8 N3 ? ? ? 1_555 A A 862 N7 ? ? A U 8 A A 862 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog15 hydrog ? ? A U 8 O4 ? ? ? 1_555 A A 862 N6 ? ? A U 8 A A 862 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 10 N1 ? ? ? 1_555 A U 867 O2 ? ? A G 10 A U 867 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog17 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A U 867 N3 ? ? A G 10 A U 867 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog18 hydrog ? ? A A 11 N6 ? ? ? 1_555 A A 866 N1 ? ? A A 11 A A 866 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog19 hydrog ? ? A U 12 N3 ? ? ? 1_555 A A 865 N1 ? ? A U 12 A A 865 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A U 12 O4 ? ? ? 1_555 A A 865 N6 ? ? A U 12 A A 865 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? A U 12 O2 ? ? ? 1_555 A G 1020 N2 ? ? A U 12 A G 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 13 N3 ? ? ? 1_555 A G 864 N1 ? ? A C 13 A G 864 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? A C 13 N4 ? ? ? 1_555 A G 864 O6 ? ? A C 13 A G 864 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? A C 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 864 N2 ? ? A C 13 A G 864 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? A C 14 N3 ? ? ? 1_555 A G 863 N1 ? ? A C 14 A G 863 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? A C 14 N4 ? ? ? 1_555 A G 863 O6 ? ? A C 14 A G 863 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? A C 14 O2 ? ? ? 1_555 A G 863 N2 ? ? A C 14 A G 863 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? A U 15 O2 ? ? ? 1_555 A A 862 N6 ? ? A U 15 A A 862 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 16 N2 ? ? ? 1_555 A A 861 N7 ? ? A G 16 A A 861 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog30 hydrog ? ? A G 16 N3 ? ? ? 1_555 A A 861 N6 ? ? A G 16 A A 861 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog31 hydrog ? ? A A 21 N6 ? ? ? 1_555 A C 500 O2 ? ? A A 21 A C 500 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-C MISPAIR' ? ? hydrog32 hydrog ? ? A G 22 N1 ? ? ? 1_555 A C 498 N3 ? ? A G 22 A C 498 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? A G 22 N2 ? ? ? 1_555 A C 498 O2 ? ? A G 22 A C 498 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? A G 22 O6 ? ? ? 1_555 A C 498 N4 ? ? A G 22 A C 498 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? A G 23 N1 ? ? ? 1_555 A C 497 N3 ? ? A G 23 A C 497 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? A G 23 N2 ? ? ? 1_555 A C 497 O2 ? ? A G 23 A C 497 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? A G 23 O6 ? ? ? 1_555 A C 497 N4 ? ? A G 23 A C 497 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog38 hydrog ? ? A C 24 N3 ? ? ? 1_555 A G 496 N1 ? ? A C 24 A G 496 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? A C 24 N4 ? ? ? 1_555 A G 496 O6 ? ? A C 24 A G 496 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? A C 24 O2 ? ? ? 1_555 A G 496 N2 ? ? A C 24 A G 496 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog41 hydrog ? ? A C 25 N3 ? ? ? 1_555 A G 495 N1 ? ? A C 25 A G 495 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? A C 25 N4 ? ? ? 1_555 A G 495 O6 ? ? A C 25 A G 495 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? A C 25 O2 ? ? ? 1_555 A G 495 N2 ? ? A C 25 A G 495 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog44 hydrog ? ? A A 26 N1 ? ? ? 1_555 A U 494 N3 ? ? A A 26 A U 494 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? A A 26 N6 ? ? ? 1_555 A U 494 O4 ? ? A A 26 A U 494 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? A C 27 N3 ? ? ? 1_555 A G 493 N1 ? ? A C 27 A G 493 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? A C 27 N4 ? ? ? 1_555 A G 493 O6 ? ? A C 27 A G 493 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog48 hydrog ? ? A C 27 O2 ? ? ? 1_555 A G 493 N2 ? ? A C 27 A G 493 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog49 hydrog ? ? A U 28 N3 ? ? ? 1_555 A G 492 O6 ? ? A U 28 A G 492 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog50 hydrog ? ? A U 28 O2 ? ? ? 1_555 A G 492 N1 ? ? A U 28 A G 492 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog51 hydrog ? ? A G 29 N1 ? ? ? 1_555 A U 491 O2 ? ? A G 29 A U 491 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog52 hydrog ? ? A G 29 O6 ? ? ? 1_555 A U 491 N3 ? ? A G 29 A U 491 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog53 hydrog ? ? A C 30 N3 ? ? ? 1_555 A G 490 N1 ? ? A C 30 A G 490 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog54 hydrog ? ? A C 30 N4 ? ? ? 1_555 A G 490 O6 ? ? A C 30 A G 490 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog55 hydrog ? ? A C 30 O2 ? ? ? 1_555 A G 490 N2 ? ? A C 30 A G 490 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog56 hydrog ? ? A U 31 N3 ? ? ? 1_555 A A 382 N7 ? ? A U 31 A A 382 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog57 hydrog ? ? 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? 0.055 'SIDE CHAIN' 2 1 C A 830 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 3 1 C A 1000 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 H GLU 53 ? 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DA THR 342 CG2 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 d GLU 330 ? DA GLU 330 2 1 Y 1 d VAL 331 ? DA VAL 331 3 1 Y 1 d SER 332 ? DA SER 332 4 1 Y 1 d ASP 333 ? DA ASP 333 5 1 Y 1 d LEU 334 ? DA LEU 334 6 1 Y 1 d ASP 335 ? DA ASP 335 7 1 Y 1 d LEU 336 ? DA LEU 336 8 1 Y 1 d SER 337 ? DA SER 337 9 1 Y 1 d LYS 338 ? DA LYS 338 10 1 Y 1 d ASP 339 ? DA ASP 339 11 1 Y 1 d LEU 340 ? DA LEU 340 12 1 Y 1 d LYS 341 ? 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'Saccharolobus solfataricus' ? ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 3 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 562 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 25 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON II (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION 3 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6TMF 'double helix' 6TMF 'a-form double helix' 6TMF 'hairpin loop' 6TMF tetraloop 6TMF 'bulge loop' 6TMF 'mismatched base pair' 6TMF 'internal loop' 6TMF 'triple helix' 6TMF 'quadruple helix' 6TMF 'three-way junction' 6TMF 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 382 1_555 A U 31 1_555 -4.020 -2.420 -0.102 2.272 -8.031 -90.290 1 A_A382:U31_A A 382 ? A 31 ? 24 4 1 A G 490 1_555 A C 30 1_555 -0.116 -0.228 0.123 -4.866 -5.771 1.015 2 A_G490:C30_A A 490 ? A 30 ? 19 1 1 A U 491 1_555 A G 29 1_555 1.469 -0.661 -0.020 3.735 -6.551 -11.145 3 A_U491:G29_A A 491 ? A 29 ? 28 1 1 A G 492 1_555 A U 28 1_555 -2.013 -0.481 -0.322 -1.679 -6.414 1.725 4 A_G492:U28_A A 492 ? A 28 ? 28 1 1 A G 493 1_555 A C 27 1_555 -0.050 -0.209 -0.385 -7.894 -9.233 -3.583 5 A_G493:C27_A A 493 ? A 27 ? 19 1 1 A U 494 1_555 A A 26 1_555 -0.026 -0.302 0.046 -3.002 -3.429 -4.300 6 A_U494:A26_A A 494 ? A 26 ? 20 1 1 A G 495 1_555 A C 25 1_555 -0.108 -0.277 -0.020 -3.708 -6.583 -0.362 7 A_G495:C25_A A 495 ? A 25 ? 19 1 1 A G 496 1_555 A C 24 1_555 -0.108 -0.288 -0.002 -3.242 -5.939 1.536 8 A_G496:C24_A A 496 ? A 24 ? 19 1 1 A C 497 1_555 A G 23 1_555 -0.003 -0.226 0.087 1.210 -1.576 -1.609 9 A_C497:G23_A A 497 ? A 23 ? 19 1 1 A C 498 1_555 A G 22 1_555 0.161 -0.174 0.045 3.596 -1.773 0.758 10 A_C498:G22_A A 498 ? A 22 ? 19 1 1 A C 500 1_555 A A 21 1_555 6.709 -1.741 0.089 -34.625 12.386 47.608 11 A_C500:A21_A A 500 ? A 21 ? ? 5 1 A C 4 1_555 A G 20 1_555 0.176 -0.274 0.159 5.614 -7.235 -4.238 12 A_C4:G20_A A 4 ? A 20 ? 19 1 1 A C 5 1_555 A G 19 1_555 0.262 -0.314 0.394 -0.439 -13.594 -0.758 13 A_C5:G19_A A 5 ? A 19 ? 19 1 1 A G 6 1_555 A C 18 1_555 -0.073 -0.237 -0.031 -2.338 -5.988 -2.001 14 A_G6:C18_A A 6 ? A 18 ? 19 1 1 A G 7 1_555 A C 17 1_555 -0.053 -0.179 -0.075 -3.452 -5.982 -1.435 15 A_G7:C17_A A 7 ? A 17 ? 19 1 1 A A 861 1_555 A G 16 1_555 -6.639 -4.115 0.114 3.479 -0.667 -1.486 16 A_A861:G16_A A 861 ? A 16 ? 11 9 1 A A 862 1_555 A U 8 1_555 0.817 -3.523 0.502 -7.617 -4.559 66.976 17 A_A862:U8_A A 862 ? A 8 ? 23 3 1 A G 863 1_555 A C 14 1_555 -0.130 -0.219 -0.191 1.645 -10.623 1.547 18 A_G863:C14_A A 863 ? A 14 ? 19 1 1 A G 864 1_555 A C 13 1_555 -0.047 -0.251 0.084 0.161 -7.249 0.693 19 A_G864:C13_A A 864 ? 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