data_6UPK # _entry.id 6UPK # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.388 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 6UPK pdb_00006upk 10.2210/pdb6upk/pdb WWPDB D_1000243699 ? ? EMDB EMD-20840 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2019-12-11 2 'Structure model' 1 1 2019-12-18 3 'Structure model' 1 2 2020-01-29 4 'Structure model' 1 3 2024-03-20 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Author supporting evidence' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' pdbx_audit_support 2 3 'Structure model' citation 3 4 'Structure model' chem_comp_atom 4 4 'Structure model' chem_comp_bond 5 4 'Structure model' database_2 # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_pdbx_audit_support.funding_organization' 2 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 3 3 'Structure model' '_citation.page_first' 4 3 'Structure model' '_citation.page_last' 5 3 'Structure model' '_citation.year' 6 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 7 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6UPK _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-10-17 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of FACT_subnucleosome complex 1' _pdbx_database_related.db_id EMD-20840 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhou, K.' 1 0000-0003-0258-1489 'Tan, Y.Z.' 2 0000-0001-6656-6320 'Wei, H.' 3 0000-0001-6777-1772 'Liu, Y.' 4 0000-0001-7187-9196 'Carragher, B.' 5 0000-0002-0624-5020 'Potter, C.' 6 0000-0003-2394-0831 'Luger, K.' 7 0000-0001-5136-5331 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nature _citation.journal_id_ASTM NATUAS _citation.journal_id_CSD 0006 _citation.journal_id_ISSN 1476-4687 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 577 _citation.language ? _citation.page_first 426 _citation.page_last 431 _citation.title 'FACT caught in the act of manipulating the nucleosome.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-019-1820-0 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31775157 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Liu, Y.' 1 ? primary 'Zhou, K.' 2 ? primary 'Zhang, N.' 3 ? primary 'Wei, H.' 4 ? primary 'Tan, Y.Z.' 5 ? primary 'Zhang, Z.' 6 ? primary 'Carragher, B.' 7 ? primary 'Potter, C.S.' 8 ? primary ;D'Arcy, S. ; 9 ? primary 'Luger, K.' 10 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3.1' 15437.167 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H4' 11394.426 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H2A' 14135.523 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2B' 13937.213 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'FACT complex subunit SPT16' 109574.867 1 ? ? ? ;Amino acids 640-651 cannot be identified due to the resolution limitations. To show the connectivity of the electron density, poly-(UNK) was placed. This was also done for the end of this chain (926-967). The full sequence for the experiment is: MHHHHHHAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKII FMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCL NKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGA DPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLK ELRHGVKICDVYNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKEGKKP EEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKR RAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATI KNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKT REAEEKEKEGIVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDG EMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEE LEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAI PVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDD YEEEEEDSDEDYSSEAEESDYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRG SRHSSAPPKKKRK ; 6 polymer man 'FACT complex subunit SSRP1' 73361.172 1 ? ? ? ;The poly-(UNK) was placed to show the electron density between 171-198. The full sequence for the experiment is: MAETLEFNDVYQEVKGSMNDGRLRLSRQGIIFKNSKTGKVDNIQAGELTEGIWRRVALGHGLKLLTKNGHVYKYDGFRES EFEKLSDFFKTHYRLELMEKDLCVKGWNWGTVKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSL MEVRFYVPPTQEDGVDPVEAFAQNVLSKADVIQATGDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVL RLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKA LVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQ YTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDE SFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNA SREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARRDYEKAMKEYEGGRGESSKRDKSKKKKKVKVKMEKK STPSRGSSSKSSSRQLSESFKSKEFVSSDESSSGENKSKKKRRRSEDSEEEELASTPPSSEDSASGSDE ; 7 polymer syn 'DNA (79-mer)' 24144.422 1 ? ? ? ? 8 polymer syn 'DNA (79-mer)' 24584.680 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Histone H3/a,Histone H3/b,Histone H3/c,Histone H3/d,Histone H3/f,Histone H3/h,Histone H3/i,Histone H3/j,Histone H3/k,Histone H3/l' 3 'Histone H2A/l' 4 'Histone H2B.1 A, Histone H2B.a, H2B/a, Histone H2B.g, H2B/g, Histone H2B.h, H2B/h, Histone H2B.k, H2B/k, Histone H2B.l, H2B/l' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MHHHHHHAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKII FMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCL NKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGA DPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLK ELRHGVKICDVYNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKEGKKP EEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKR RAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATI KNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYK (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)VKQDSLVINLNRSNPKLKDL YIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVG EITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALV NATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKI MKTIVDDPEGFFEQGGWSFL(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;MHHHHHHAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTIMVFCDDKII FMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKNGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCL NKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFNKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGA DPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVVSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLK ELRHGVKICDVYNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKEGKKP EEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGSRAALLTERTRNEMTAEEKR RAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATI KNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGNIFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKX XXXXXXXXXXXVKQDSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDG EMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAFKNFIEKVEALTKEE LEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAI PVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIVDDPEGFFEQGGWSFLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXX ; G ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAETLEFNDVYQEVKGSMNDGRLRLSRQGIIFKNSKTGKVDNIQAGELTEGIWRRVALGHGLKLLTKNGHVYKYDGFRES EFEKLSDFFKTHYRLELMEKDLCVKGWNWGTVKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSL MEVRFYVPPTQ(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)DAICIFRELQCLTPRGRYDI RIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVLRLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEK RFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKALVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISF VNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQYTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERM KEEGKIREENANDSSDDSGEETDESFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPV EVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNASREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARRDYEKAMKEYEG GRGESSKRDKSKKKKKVKVKMEKK ; ;MAETLEFNDVYQEVKGSMNDGRLRLSRQGIIFKNSKTGKVDNIQAGELTEGIWRRVALGHGLKLLTKNGHVYKYDGFRES EFEKLSDFFKTHYRLELMEKDLCVKGWNWGTVKFGGQLLSFDIGDQPVFEIPLSNVSQCTTGKNEVTLEFHQNDDAEVSL MEVRFYVPPTQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXDAICIFRELQCLTPRGRYDIRIYPTFLHLHGKTFDYKIPYTTVL RLFLLPHKDQRQMFFVISLDPPIKQGQTRYHFLILLFSKDEDISLTLNMNEEEVEKRFEGRLTKNMSGSLYEMVSRVMKA LVNRKITVPGNFQGHSGAQCITCSYKASSGLLYPLERGFIYVHKPPVHIRFDEISFVNFARGTTTTRSFDFEIETKQGTQ YTFSSIEREEYGKLFDFVNAKKLNIKNRGLKEGMNPSYDEYADSDEDQHDAYLERMKEEGKIREENANDSSDDSGEETDE SFNPGEEEEDVAEEFDSNASASSSSNEGDSDRDEKKRKQLKKAKMAKDRKSRKKPVEVKKGKDPNAPKRPMSAYMLWLNA SREKIKSDHPGISITDLSKKAGEIWKGMSKEKKEEWDRKAEDARRDYEKAMKEYEGGRGESSKRDKSKKKKKVKVKMEKK ; H ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC) (DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC) (DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG) (DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA) ; TCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTA I ? 8 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC) (DG)(DG)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG) (DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA) ; TAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGA J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN n 1 7 THR n 1 8 ALA n 1 9 ARG n 1 10 LYS n 1 11 SER n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 GLY n 1 15 LYS n 1 16 ALA n 1 17 PRO n 1 18 ARG n 1 19 LYS n 1 20 GLN n 1 21 LEU n 1 22 ALA n 1 23 THR n 1 24 LYS n 1 25 ALA n 1 26 ALA n 1 27 ARG n 1 28 LYS n 1 29 SER n 1 30 ALA n 1 31 PRO n 1 32 ALA n 1 33 THR n 1 34 GLY n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 LYS n 1 38 LYS n 1 39 PRO n 1 40 HIS n 1 41 ARG n 1 42 TYR n 1 43 ARG n 1 44 PRO n 1 45 GLY n 1 46 THR n 1 47 VAL n 1 48 ALA n 1 49 LEU n 1 50 ARG n 1 51 GLU n 1 52 ILE n 1 53 ARG 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 136 Human ? ;H3C1, H3FA, HIST1H3A, H3C2, H3FL, HIST1H3B, H3C3, H3FC HIST1H3C, H3C4, H3FB, HIST1H3D, H3C6, H3FD, HIST1H3E, H3C7, H3FI, HIST1H3F, H3C8, H3FH, HIST1H3G, H3C10, H3FK, HIST1H3H, H3C11, H3FF, HIST1H3I, H3C12, H3FJ, HIST1H3J ; ? ? ? ? ? ? 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J N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H31_HUMAN P68431 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_HUMAN P62805 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A1C_HUMAN Q93077 ? 3 ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 4 UNP H2B1C_HUMAN P62807 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; 1 5 PDB 6UPK 6UPK ? 5 ? 1 6 PDB 6UPK 6UPK ? 6 ? 1 7 PDB 6UPK 6UPK ? 7 ? 1 8 PDB 6UPK 6UPK ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6UPK A 1 ? 136 ? P68431 1 ? 136 ? 0 135 2 2 6UPK B 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 3 3 6UPK C 1 ? 130 ? Q93077 1 ? 130 ? 0 129 4 4 6UPK D 1 ? 126 ? P62807 1 ? 126 ? 0 125 5 1 6UPK E 1 ? 136 ? P68431 1 ? 136 ? 0 135 6 2 6UPK F 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 7 5 6UPK G 1 ? 966 ? 6UPK -5 ? 960 ? -5 960 8 6 6UPK H 1 ? 640 ? 6UPK 1 ? 640 ? 1 640 9 7 6UPK I 1 ? 79 ? 6UPK -39 ? 39 ? -39 39 10 8 6UPK J 1 ? 79 ? 6UPK -39 ? 39 ? -39 39 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'native gel electrophoresis' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ARG A 64 ? 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PHE G 916 PHE G 924 5 ? 9 HELX_P HELX_P30 AD3 SER H 80 ? LYS H 90 ? SER H 80 LYS H 90 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 UNK H 176 ? UNK H 180 ? UNK H 176 UNK H 180 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 GLU H 292 ? GLU H 299 ? GLU H 292 GLU H 299 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 AD6 SER H 309 ? ASN H 323 ? SER H 309 ASN H 323 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY H 334 ? ALA H 338 ? GLY H 334 ALA H 338 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU H 407 ? LYS H 421 ? GLU H 407 LYS H 421 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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J 28 ? 1 I DT 12 1_555 J DA 68 1_555 I DC 13 1_555 J DG 67 1_555 1.835 0.077 3.500 4.503 4.668 34.290 -0.656 -2.304 3.682 7.830 -7.554 34.880 12 II_DT-28DC-27:DG27DA28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 13 1_555 J DG 67 1_555 I DT 14 1_555 J DA 66 1_555 0.206 0.465 3.289 2.131 -6.519 35.425 1.670 -0.032 3.163 -10.591 -3.462 36.062 13 II_DC-27DT-26:DA26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? J 26 ? 1 I DG 16 1_555 J DC 64 1_555 I DC 17 1_555 J DG 63 1_555 -1.204 -1.388 3.586 -4.159 -1.622 37.254 -1.920 1.261 3.749 -2.528 6.482 37.512 14 II_DG-24DC-23:DG23DC24_JJ I -24 ? J 24 ? I -23 ? J 23 ? 1 I DC 17 1_555 J DG 63 1_555 I DA 18 1_555 J DT 62 1_555 -0.287 -0.166 3.198 -6.153 15.603 31.203 -2.534 -0.418 2.812 26.726 10.540 35.327 15 II_DC-23DA-22:DT22DG23_JJ I -23 ? J 23 ? I -22 ? J 22 ? 1 I DA 18 1_555 J DT 62 1_555 I DC 19 1_555 J DG 61 1_555 -0.143 -1.181 3.483 -3.598 -0.492 30.665 -2.117 -0.480 3.495 -0.927 6.773 30.874 16 II_DA-22DC-21:DG21DT22_JJ I -22 ? J 22 ? I -21 ? J 21 ? 1 I DC 19 1_555 J DG 61 1_555 I DC 20 1_555 J DG 60 1_555 -1.438 -0.606 3.184 -3.779 2.942 32.654 -1.562 1.896 3.260 5.198 6.676 32.994 17 II_DC-21DC-20:DG20DG21_JJ I -21 ? J 21 ? I -20 ? J 20 ? 1 I DC 20 1_555 J DG 60 1_555 I DG 21 1_555 J DC 59 1_555 0.593 -0.325 2.885 -1.120 5.168 34.291 -1.237 -1.144 2.788 8.701 1.886 34.684 18 II_DC-20DG-19:DC19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DG 21 1_555 J DC 59 1_555 I DC 22 1_555 J DG 58 1_555 -0.565 -0.758 3.048 0.667 2.684 35.824 -1.582 1.004 2.975 4.355 -1.082 35.927 19 II_DG-19DC-18:DG18DC19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DC 22 1_555 J DG 58 1_555 I DT 23 1_555 J DA 57 1_555 1.419 0.392 3.074 5.150 3.383 31.408 0.112 -1.662 3.283 6.174 -9.401 31.992 20 II_DC-18DT-17:DA17DG18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DT 23 1_555 J DA 57 1_555 I DT 24 1_555 J DA 56 1_555 0.613 0.641 3.241 2.622 -1.258 37.267 1.164 -0.613 3.253 -1.965 -4.096 37.376 21 II_DT-17DT-16:DA16DA17_JJ I -17 ? J 17 ? I -16 ? J 16 ? 1 I DT 24 1_555 J DA 56 1_555 I DA 25 1_555 J DT 55 1_555 -0.026 2.099 3.894 4.323 -15.368 40.144 4.499 0.497 2.920 -21.394 -6.018 43.080 22 II_DT-16DA-15:DT15DA16_JJ I -16 ? J 16 ? I -15 ? J 15 ? 1 I DA 25 1_555 J DT 55 1_555 I DA 26 1_555 J DT 54 1_555 -0.902 -0.346 3.223 -5.963 7.710 30.319 -2.042 0.555 3.159 14.285 11.048 31.813 23 II_DA-15DA-14:DT14DT15_JJ I -15 ? J 15 ? I -14 ? J 14 ? 1 I DA 26 1_555 J DT 54 1_555 I DA 27 1_555 J DT 53 1_555 -0.749 0.001 4.008 -1.432 -1.881 35.859 0.332 0.964 4.028 -3.050 2.323 35.935 24 II_DA-14DA-13:DT13DT14_JJ I -14 ? J 14 ? I -13 ? J 13 ? 1 I DA 27 1_555 J DT 53 1_555 I DC 28 1_555 J DG 52 1_555 -1.285 -0.514 3.539 -5.669 -1.828 37.033 -0.532 1.171 3.709 -2.856 8.856 37.492 25 II_DA-13DC-12:DG12DT13_JJ I -13 ? J 13 ? I -12 ? J 12 ? 1 I DC 28 1_555 J DG 52 1_555 I DG 29 1_555 J DC 51 1_555 1.181 0.292 3.190 -8.489 1.162 35.108 0.318 -3.030 2.845 1.891 13.820 36.106 26 II_DC-12DG-11:DC11DG12_JJ I -12 ? J 12 ? I -11 ? J 11 ? 1 I DG 29 1_555 J DC 51 1_555 I DC 30 1_555 J DG 50 1_555 -1.339 -0.575 3.186 -0.812 3.923 36.619 -1.427 2.013 3.138 6.220 1.288 36.830 27 II_DG-11DC-10:DG10DC11_JJ I -11 ? J 11 ? I -10 ? J 10 ? 1 I DC 30 1_555 J DG 50 1_555 I DA 31 1_555 J DT 49 1_555 -0.176 -0.318 3.496 9.886 21.570 34.003 -2.888 1.367 2.699 32.449 -14.873 41.262 28 II_DC-10DA-9:DT9DG10_JJ I -10 ? J 10 ? I -9 ? J 9 ? 1 I DA 31 1_555 J DT 49 1_555 I DC 32 1_555 J DG 48 1_555 0.570 -0.087 3.134 -4.810 1.979 31.033 -0.511 -1.901 3.002 3.667 8.912 31.455 29 II_DA-9DC-8:DG8DT9_JJ I -9 ? J 9 ? I -8 ? J 8 ? 1 I DC 32 1_555 J DG 48 1_555 I DT 34 1_555 J DA 46 1_555 0.017 2.531 6.650 8.582 14.380 71.278 1.141 0.575 6.951 12.173 -7.265 72.964 30 II_DC-8DT-6:DA6DG8_JJ I -8 ? J 8 ? I -6 ? J 6 ? 1 I DT 34 1_555 J DA 46 1_555 I DA 35 1_555 J DT 45 1_555 -0.433 3.147 3.995 -16.906 -4.364 41.097 4.641 -1.311 3.565 -5.905 22.879 44.504 31 II_DT-6DA-5:DT5DA6_JJ I -6 ? J 6 ? I -5 ? J 5 ? 1 I DA 35 1_555 J DT 45 1_555 I DC 36 1_555 J DG 44 1_555 0.035 0.153 3.044 -6.771 1.522 40.679 0.065 -0.728 3.004 2.170 9.655 41.242 32 II_DA-5DC-4:DG4DT5_JJ I -5 ? J 5 ? I -4 ? J 4 ? 1 I DC 36 1_555 J DG 44 1_555 I DG 37 1_555 J DC 43 1_555 -1.156 0.803 3.542 -5.405 -1.189 35.235 1.502 1.022 3.646 -1.949 8.862 35.653 33 II_DC-4DG-3:DC3DG4_JJ I -4 ? J 4 ? I -3 ? J 3 ? 1 I DG 37 1_555 J DC 43 1_555 I DC 38 1_555 J DG 42 1_555 -0.201 -0.359 3.583 -3.259 1.211 38.714 -0.702 -0.132 3.575 1.822 4.905 38.864 34 II_DG-3DC-2:DG2DC3_JJ I -3 ? J 3 ? I -2 ? J 2 ? 1 I DC 38 1_555 J DG 42 1_555 I DG 39 1_555 J DC 41 1_555 -1.096 0.190 3.113 -3.113 5.510 28.368 -0.802 1.517 3.192 11.070 6.255 29.051 35 II_DC-2DG-1:DC1DG2_JJ I -2 ? J 2 ? I -1 ? J 1 ? 1 I DG 39 1_555 J DC 41 1_555 I DC 40 1_555 J DG 40 1_555 -0.209 -0.764 3.190 -0.635 7.214 35.829 -2.169 0.249 2.988 11.580 1.019 36.530 36 II_DG-1DC0:DG0DC1_JJ I -1 ? J 1 ? I 0 ? J 0 ? 1 I DC 40 1_555 J DG 40 1_555 I DT 41 1_555 J DA 39 1_555 0.724 -0.967 3.455 12.378 18.681 30.403 -4.001 0.534 2.574 30.901 -20.475 37.612 37 II_DC0DT1:DA-1DG0_JJ I 0 ? J 0 ? I 1 ? J -1 ? 1 I DT 41 1_555 J DA 39 1_555 I DG 42 1_555 J DC 38 1_555 -0.139 2.848 3.806 -0.240 0.514 35.396 4.595 0.187 3.847 0.845 0.395 35.400 38 II_DT1DG2:DC-2DA-1_JJ I 1 ? J -1 ? I 2 ? J -2 ? 1 I DG 42 1_555 J DC 38 1_555 I DT 43 1_555 J DA 37 1_555 0.056 0.533 3.436 -4.147 2.354 28.977 0.517 -1.052 3.427 4.665 8.218 29.359 39 II_DG2DT3:DA-3DC-2_JJ I 2 ? J -2 ? I 3 ? J -3 ? 1 I DT 43 1_555 J DA 37 1_555 I DC 44 1_555 J DG 36 1_555 1.702 0.970 3.859 -1.285 -0.904 38.192 1.615 -2.789 3.779 -1.381 1.963 38.223 40 II_DT3DC4:DG-4DA-3_JJ I 3 ? J -3 ? I 4 ? J -4 ? 1 I DC 46 1_555 J DG 34 1_555 I DC 47 1_555 J DG 33 1_555 -0.800 1.168 3.647 -4.633 -2.006 34.411 2.297 0.546 3.648 -3.369 7.779 34.769 41 II_DC6DC7:DG-7DG-6_JJ I 6 ? J -6 ? I 7 ? J -7 ? 1 I DC 47 1_555 J DG 33 1_555 I DC 48 1_555 J DG 32 1_555 -1.728 -0.048 3.146 -6.665 3.791 34.305 -0.652 1.856 3.388 6.329 11.127 35.126 42 II_DC7DC8:DG-8DG-7_JJ I 7 ? J -7 ? I 8 ? J -8 ? 1 I DC 48 1_555 J DG 32 1_555 I DG 49 1_555 J DC 31 1_555 0.265 -0.378 3.154 2.491 20.503 32.583 -2.985 -0.110 2.509 32.765 -3.981 38.427 43 II_DC8DG9:DC-9DG-8_JJ I 8 ? J -8 ? I 9 ? J -9 ? 1 I DG 49 1_555 J DC 31 1_555 I DC 50 1_555 J DG 30 1_555 1.230 0.871 3.223 -1.572 -0.481 31.991 1.662 -2.505 3.148 -0.872 2.850 32.032 44 II_DG9DC10:DG-10DC-9_JJ I 9 ? J -9 ? I 10 ? J -10 ? 1 I DC 50 1_555 J DG 30 1_555 I DG 51 1_555 J DC 29 1_555 -0.752 -0.490 3.180 -4.937 6.689 34.683 -1.748 0.529 3.109 11.024 8.138 35.636 45 II_DC10DG11:DC-11DG-10_JJ I 10 ? J -10 ? I 11 ? J -11 ? 1 I DG 51 1_555 J DC 29 1_555 I DT 52 1_555 J DA 28 1_555 1.278 -0.067 3.068 -0.310 3.869 33.963 -0.686 -2.220 3.031 6.596 0.529 34.177 46 II_DG11DT12:DA-12DC-11_JJ I 11 ? J -11 ? I 12 ? 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