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no ;MATTNQLIRKGRTTLVEKSKVPALKACPQRRGVCTRVYTTTPKKPNSAMRKVCRVRLTSGFEVSSYIGGEGHNLQEHSVV LIRGGRVKDLPGVRYHTVRGSLDCAGVKDRNQSRSKYGAKRPKK ; ;MATTNQLIRKGRTTLVEKSKVPALKACPQRRGVCTRVYTTTPKKPNSAMRKVCRVRLTSGFEVSSYIGGEGHNLQEHSVV LIRGGRVKDLPGVRYHTVRGSLDCAGVKDRNQSRSKYGAKRPKK ; l ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MARIAGVNIPDNKHAVISLTYIFGIGRHTAKNILAAVGITETTKIRELDDAQLDAIRAEVAKVPTEGDLRREISMNIKRL MDLGCYRGLRHRRSLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; ;MARIAGVNIPDNKHAVISLTYIFGIGRHTAKNILAAVGITETTKIRELDDAQLDAIRAEVAKVPTEGDLRREISMNIKRL MDLGCYRGLRHRRSLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; m ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MAKKGMINRELKREKTVAKYAAKRAELKATIANVNASDEERFEAMLKLQALPRNASPVRLRNRCGLTGRPHGYFRKFGLS RNKLRDTVMQGDVPGVVKASW ; ;MAKKGMINRELKREKTVAKYAAKRAELKATIANVNASDEERFEAMLKLQALPRNASPVRLRNRCGLTGRPHGYFRKFGLS RNKLRDTVMQGDVPGVVKASW ; n ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MALTNADRAEIIAKFARAENDTGSPEVQVALLTAQINDLQGHFKAHKHDHHSRRGLIRMVNQRRKLLDYLNGKDHERYTA LIGALGLRR ; ;MALTNADRAEIIAKFARAENDTGSPEVQVALLTAQINDLQGHFKAHKHDHHSRRGLIRMVNQRRKLLDYLNGKDHERYTA LIGALGLRR ; o ? 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_entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 1544 ? 'Acinetobacter baumannii' 470 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 250 ? 'Acinetobacter baumannii' 470 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 250 ? 'Acinetobacter baumannii' 470 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 208 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 165 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 127 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 156 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 131 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 1 128 ? 'Acinetobacter baumannii' 470 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 1 103 ? 'Acinetobacter sp. ANC 5600' 1960940 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 1 128 ? 'Acinetobacter sp. 263903-1' 1310678 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 1 124 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 1 118 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 1 101 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 1 89 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample 1 101 ? 'Acinetobacter baumannii' 470 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample 1 85 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample 1 75 ? 'Acinetobacter venetianus' 52133 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 19 1 sample 1 91 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 20 1 sample 1 88 ? 'Acinetobacter baumannii (strain AB0057)' 480119 ? ? AB0057 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 GB CP044356.1 CP044356.1 ? 1 ;UUUAACUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCUUAACACAUGCAAGUCGAGCGGGGGAAGGUA GCUUGCUACCGGACCUAGCGGCGGACGGGUGAGUAAUGCUUAGGAAUCUGCCUAUUAGUGGGGGACAACAUCUCGAAAGG GAUGCUAAUACCGCAUACGUCCUACGGGAGAAAGCAGGGGAUCUUCGGACCUUGCGCUAAUAGAUGAGCCUAAGUCGGAU UAGCUAGUUGGUGGGGUAAAGGCCUACCAAGGCGACGAUCUGUAGCGGGUCUGAGAGGAUGAUCCGCCACACUGGGACUG AGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGGACAAUGGGGGGAACCCUGAUCCAGCCAUGCCGCG UGUGUGAAGAAGGCCUUAUGGUUGUAAAGCACUUUAAGCGAGGAGGAGGCUACUCUAGUUAAUACCUAGGGAUAGUGGAC GUUACUCGCAGAAUAAGCACCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAGAGGGUGCGAGCGUUAAUCGGAUUUA CUGGGCGUAAAGCGUGCGUAGGCGGCUUAUUAAGUCGGAUGUGAAAUCCCCGAGCUUAACUUGGGAAUUGCAUUCGAUAC UGGUGAGCUAGAGUAUGGGAGAGGAUGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGAU GGCGAAGGCAGCCAUCUGGCCUAAUACUGACGCUGAGGUACGAAAGCAUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAG UCCAUGCCGUAAACGAUGUCUACUAGCCGUUGGGGCCUUUGAGGCUUUAGUGGCGCAGCUAACGCGAUAAGUAGACCGCC UGGGGAGUACGGUCGCAAGACUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCG AUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGCCUUGACAUACUAGAAACUUUCCAGAGAUGGAUUGGUGCCUUCGGGAAUCUAGAU ACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUUUCCUUA CUUGCCAGCAUUUCGGAUGGGAACUUUAAGGAUACUGCCAGUGACAAACUGGAGGAAGGCGGGGACGACGUCAAGUCAUC AUGGCCCUUACGGCCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGUCGGUACAAAGGGUUGCUACACAGCGAUGUGAUGCUAAUCU CAAAAAGCCGAUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGAA UGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUUUGUUGCACCAGAAGUAGCUAGC CUAACUGCAAAGAGGGCGGUUACCACGGUGUGGCCGAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUG CGGCUGGAUCACCUCCUUAACGAA ; 213954 2 UNP V5VBC2_ACIBA V5VBC2 ? 2 ;MADYNVSMRDLLQAGAHFGHQTRFWNPKMRQYIFGARNKIHIINLEHTVPALNDALNFANQLASKKNKVLFVGTKRAASN IIREQAQRAGQPYVDHRWLGGMLTNWKTLRQSINRLKDLQTQSQDGTFAKLTKREALERTREMEKLERSLGGVKNMGGLP DALFVIDVDHEAIAIKEAKNLGIPVIGIVDTNSNPDNVDYVIPGNDDAIRAVTLYASAMADAILAGKEYAQSQANAQAKG DDAAKDASEA ; 1 3 UNP V5V9N0_ACIBA V5V9N0 ? 3 ;MGQKVHPIGIRLGVVKRHNANWYANPKQYAEYLLKDLQVREFLTKKLKNAMVSNILIERPSGAAKVTISTARPGIVIGKK GEDIEKLQRELTNIMGVPAQVSINEIDRPDLDARLVAEAIASQLEKRVMFRRAMKRAVQNTMRAGAKGIKVEVSGRLGGA EIARTEWYREGRVPLHTLRADIDYATMRAETTYGTIGVKVWIFRGEILGGMKQVMNPAPAEERPAKRGRGRGEGQERRGR RGDRAADKGE ; 1 4 UNP RS4_ACIB5 B7IA15 ? 4 ;MARYIGPKCKLSRREGTDLQLKSGVKPFDVKTKKANKAPGQHGQARGGKQSEYSLQLREKQKVRRIYGVLERQFSNYYKE AARVKGATGENLLKLLESRLDNVVYRMGFGSTRAEARQLVSHRSITLNGRRVNIASIQVKAGDVIAVHEGAKQQLRIKNA IELAAQRGIPAWIEVDHSKLEGTFKAAPDRSDLPAEINESLIVELYSK ; 1 5 UNP RS5_ACIB5 B7IA22 ? 5 ;MAKVEQNEGLVEKLVAVDRVAKVVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGRGKAREVPAAISKALEAARRNMITVDLAGTTL QHPVNARHGASRVYMQPASEGTGVIAGGAMRAVLEAAGVHNVLAKCYGSTNAANVVNATFKGLRDMTSPEKVAAKRGKSV EEIQG ; 1 6 UNP RS6_ACIB5 B7IBC1 ? 6 ;MRHYEIVLLVHPDQSDQVVGMVERYISQIKEADGQIHRLEDWGRRQLAYPINKIHKAHYILMNVECGQSTLDELEELFRY NDAIIRNLIIRREHAITEESLLAKSAEEKRARKAQREEAQQVAQEAE ; 1 7 UNP RS7_ACIB5 B7I7S0 ? 7 ;MPRRRVVAAREILPDPKFSSQTIAKFMNHVMQDGKKSIAESIVYGALERVQEKNKVDPVEFFETTLEKVRPMVEVKARRV GGATYQVPMEVRPSRRTALAMRWLVDAAAKRSEKTMALRLAGELLDAAEGKGAAIKKREDVHRMAEANKAFSHYRF ; 1 8 UNP RS8_ACIB5 B7IA25 ? 8 ;MSMQDTVADMLTRVRNAQMAKKQTVSMPSSKLKVAIANVLQQEGYISNVEVAQEETKSTLTITLKYFEGKPVIEMVKRVS RPGLRQYRGKDKLPSVKQGLGIAIVSTSKGIMTDRAARAAGIGGEVIAFVS ; 1 9 UNP V5VBA5_ACIBA V5VBA5 ? 9 ;MATNYGTGRRKTATARVFLSAGTGKLVINNRTLEQYFGRETARMVVRQPLELLEATEKYDLYITVKGGGIGGQAGAIRHG ITRALIAADETLKPVLRQAGFVTRDAREVERKKLGLRKARKRPQFSKR ; 1 10 UNP A0A1T1GZ10_9GAMM A0A1T1GZ10 ? 10 ;MSNQRIRIRLKSFDHRLIDQSAQEIVETAKRTGAQVCGPIPMPTRIERFNVLTSPHVNKDARDQYEIRTYKRLIDIVQPT DKTVDALMKLDLAAGVDVQIALG ; 1 11 UNP A0A062C259_9GAMM A0A062C259 ? 11 ;MAKDTRTRKKVTRTVSEGVAHIHASFNNTIVTITDRQGNALAWATSGGQGFRGSRKSTPFAAQVAAEVAGKAALDYGLKN LDVLVKGPGPGRESAVRALGAVGYKINSITDVTPIPHNGCRPPKKRRV ; 1 12 UNP RS12_ACIB5 B7I7R9 ? 12 ;MATTNQLIRKGRTTLVEKSKVPALKACPQRRGVCTRVYTTTPKKPNSAMRKVCRVRLTSGFEVSSYIGGEGHNLQEHSVV LIRGGRVKDLPGVRYHTVRGSLDCAGVKDRNQSRSKYGAKRPKK ; 1 13 UNP RS13_ACIB5 B7IA17 ? 13 ;MARIAGVNIPDNKHAVISLTYIFGIGRHTAKNILAAVGITETTKIRELDDAQLDAIRAEVAKVPTEGDLRREISMNIKRL MDLGCYRGLRHRRSLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; 1 14 UNP RS14_ACIB5 B7IA26 ? 14 ;MAKKGMINRELKREKTVAKYAAKRAELKATIANVNASDEERFEAMLKLQALPRNASPVRLRNRCGLTGRPHGYFRKFGLS RNKLRDTVMQGDVPGVVKASW ; 1 15 UNP RS15_ACIB5 B7I3U0 ? 15 ;MALTNADRAEIIAKFARAENDTGSPEVQVALLTAQINDLQGHFKAHKHDHHSRRGLIRMVNQRRKLLDYLNGKDHERYTA LIGALGLRR ; 1 16 UNP A0A1V3DIZ9_ACIBA A0A1V3DIZ9 ? 16 ;MLPMVGAGIIRKNYKAFIMVVIRLARGGAKKRPFYQIVVTDSRNARDGRFIERIGFFNPTAQGQAEKLRLDADRFAHWVS QGAQPSERVASLAAQAKKATA ; 1 17 UNP RS17_ACIB5 B7IA30 ? 17 ;MSEKTVRTLTGKVVSDKMDKSIVVLIERRVQHPLYGKSIRRSTKLHAHDENNVAKIGDVVTIKESRPISKTKAWTLVEVV EAAAE ; 1 18 UNP A0A150HZL5_9GAMM A0A150HZL5 ? 18 MARFYRRRKFCRFTAENVAYIDYKDIDTLKQYITENGKIVPSRITGTKARYQRQLALAIKQARYLSLIPYTDNHK 1 19 UNP RS19_ACIB5 B7IA35 ? 19 ;MPRSLKKGPFVDAHLFAKVEAAVASNSRKPIKTWSRRSMILPDFVGLTISVHNGRNHVPVIVTEHMVGHKLGEFAPTRTY RGHGVDKKSKR ; 1 20 UNP RS20_ACIB5 B7I5N9 ? 20 ;MANSAQAKKRARQNVKARKHNASLRSMVRTYIKRTLSAIAGGDYAVATEAYKKAVPVIDRMADKGIIHKNKAARHKSRLN AQVKALAN ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6V3E sN1 1 ? 1544 ? 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B7I5N9 1 ? 88 ? 1 88 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 2MG 'RNA linking' n "2N-METHYLGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H16 N5 O8 P' 377.247 4OC 'RNA linking' n "4N,O2'-METHYLCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H18 N3 O8 P' 351.250 5MC 'RNA linking' n "5-METHYLCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N3 O8 P' 337.223 7MG 'RNA linking' n "7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C11 H18 N5 O8 P' 379.263 A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 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HIS t 68 ALA t 87 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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A G 13 O6 ? ? ? 1_555 A C 25 N4 ? ? sN1 G 13 sN1 C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 A G 24 O6 ? ? sN1 U 14 sN1 G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 14 O2 ? ? ? 1_555 A G 24 N1 ? ? sN1 U 14 sN1 G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 15 O4 ? ? ? 1_555 A A 912 N6 ? ? sN1 U 15 sN1 A 912 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 17 N1 ? ? ? 1_555 A U 917 O2 ? ? sN1 G 17 sN1 U 917 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog13 hydrog ? ? A G 17 O6 ? ? ? 1_555 A U 917 N3 ? ? sN1 G 17 sN1 U 917 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 19 N3 ? ? ? 1_555 A A 916 N1 ? ? sN1 U 19 sN1 A 916 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog15 hydrog ? ? A U 19 O2 ? ? ? 1_555 A G 1076 N2 ? ? sN1 U 19 sN1 G 1076 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog16 hydrog ? ? A C 20 N3 ? ? ? 1_555 A G 914 N1 ? ? sN1 C 20 sN1 G 914 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog17 hydrog ? ? A C 20 N4 ? ? ? 1_555 A G 914 O6 ? ? sN1 C 20 sN1 G 914 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog18 hydrog ? ? A C 20 O2 ? ? ? 1_555 A G 914 N2 ? ? sN1 C 20 sN1 G 914 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A A 21 N1 ? ? ? 1_555 A U 913 N3 ? ? sN1 A 21 sN1 U 913 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A A 21 N6 ? ? ? 1_555 A U 913 O4 ? ? sN1 A 21 sN1 U 913 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? A U 22 N3 ? ? ? 1_555 A U 913 O2 ? ? sN1 U 22 sN1 U 913 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog22 hydrog ? ? A G 23 N2 ? ? ? 1_555 A A 911 N7 ? ? sN1 G 23 sN1 A 911 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog23 hydrog ? ? A G 23 N3 ? ? ? 1_555 A A 911 N6 ? ? sN1 G 23 sN1 A 911 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog24 hydrog ? ? A A 28 N6 ? ? ? 1_555 A G 555 N3 ? ? sN1 A 28 sN1 G 555 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog25 hydrog ? ? A A 28 N7 ? ? ? 1_555 A G 555 N2 ? ? sN1 A 28 sN1 G 555 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog26 hydrog ? ? A G 29 N1 ? ? ? 1_555 A C 553 N3 ? ? sN1 G 29 sN1 C 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 29 N2 ? ? ? 1_555 A C 553 O2 ? ? sN1 G 29 sN1 C 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 29 O6 ? ? ? 1_555 A C 553 N4 ? ? sN1 G 29 sN1 C 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? A A 30 N1 ? ? ? 1_555 A U 552 N3 ? ? sN1 A 30 sN1 U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? A A 30 N6 ? ? ? 1_555 A U 552 O4 ? ? sN1 A 30 sN1 U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? A U 31 N3 ? ? ? 1_555 A A 551 N1 ? ? sN1 U 31 sN1 A 551 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog32 hydrog ? ? A U 32 N3 ? ? ? 1_555 A A 550 N1 ? ? sN1 U 32 sN1 A 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? A U 32 O4 ? ? ? 1_555 A A 550 N6 ? ? sN1 U 32 sN1 A 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? A A 34 N1 ? ? ? 1_555 A U 549 N3 ? ? sN1 A 34 sN1 U 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? A A 34 N6 ? ? ? 1_555 A U 549 O4 ? ? sN1 A 34 sN1 U 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? A A 35 N1 ? ? ? 1_555 A U 548 N3 ? ? sN1 A 35 sN1 U 548 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? A A 35 N6 ? ? ? 1_555 A U 548 O4 ? ? sN1 A 35 sN1 U 548 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog38 hydrog ? ? A C 36 N3 ? ? ? 1_555 A G 547 N1 ? ? sN1 C 36 sN1 G 547 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? A C 36 N4 ? ? ? 1_555 A G 547 O6 ? ? sN1 C 36 sN1 G 547 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? A C 36 O2 ? ? ? 1_555 A G 547 N2 ? ? sN1 C 36 sN1 G 547 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog41 hydrog ? ? A G 37 N1 ? ? ? 1_555 A C 546 N3 ? ? sN1 G 37 sN1 C 546 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? A G 37 N2 ? ? ? 1_555 A C 546 O2 ? ? sN1 G 37 sN1 C 546 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? A G 37 O6 ? ? ? 1_555 A C 546 N4 ? ? sN1 G 37 sN1 C 546 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog44 hydrog ? ? A C 38 N3 ? ? ? 1_555 A G 545 N1 ? ? sN1 C 38 sN1 G 545 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? A C 38 N4 ? ? ? 1_555 A G 545 O6 ? ? sN1 C 38 sN1 G 545 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? A C 38 O2 ? ? ? 1_555 A G 545 N2 ? ? sN1 C 38 sN1 G 545 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? A U 39 N3 ? ? ? 1_555 A A 393 N1 ? ? sN1 U 39 sN1 A 393 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog48 hydrog ? ? A U 39 O2 ? ? ? 1_555 A A 393 N6 ? ? sN1 U 39 sN1 A 393 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog49 hydrog ? ? A G 41 N1 ? ? ? 1_555 A C 399 N3 ? ? sN1 G 41 sN1 C 399 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog50 hydrog ? ? A G 41 N2 ? ? ? 1_555 A C 399 O2 ? ? sN1 G 41 sN1 C 399 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog51 hydrog ? ? A G 41 O6 ? ? ? 1_555 A C 399 N4 ? ? sN1 G 41 sN1 C 399 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog52 hydrog ? ? A C 42 N3 ? ? ? 1_555 A G 398 N1 ? ? sN1 C 42 sN1 G 398 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'G-A MISPAIR' ? ? hydrog62 hydrog ? ? A C 45 N3 ? ? ? 1_555 A G 395 N1 ? ? sN1 C 45 sN1 G 395 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog63 hydrog ? ? A C 45 N4 ? ? ? 1_555 A G 395 O6 ? ? sN1 C 45 sN1 G 395 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog64 hydrog ? ? A C 45 O2 ? ? ? 1_555 A G 395 N2 ? ? sN1 C 45 sN1 G 395 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog65 hydrog ? ? A A 46 N1 ? ? ? 1_555 A U 394 N3 ? ? sN1 A 46 sN1 U 394 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog66 hydrog ? ? A A 46 N6 ? ? ? 1_555 A U 394 O4 ? ? sN1 A 46 sN1 U 394 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog67 hydrog ? ? A G 47 N1 ? ? ? 1_555 A C 392 N3 ? ? sN1 G 47 sN1 C 392 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog68 hydrog ? ? A G 47 N2 ? ? ? 1_555 A C 392 O2 ? ? sN1 G 47 sN1 C 392 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog69 hydrog ? ? A G 47 O6 ? ? ? 1_555 A C 392 N4 ? ? sN1 G 47 sN1 C 392 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog70 hydrog ? ? A G 48 N1 ? ? ? 1_555 A C 391 N3 ? ? sN1 G 48 sN1 C 391 1_555 ? ? ? ? ? ? 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Latitude ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION 'Focused classification' RELION ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6V3E 'double helix' 6V3E 'a-form double helix' 6V3E 'parallel strands' 6V3E 'hairpin loop' 6V3E tetraloop 6V3E 'bulge loop' 6V3E 'mismatched base pair' 6V3E 'internal loop' 6V3E 'triple helix' 6V3E 'quadruple helix' 6V3E 'three-way junction' 6V3E 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 393 1_555 A U 39 1_555 0.100 1.211 0.373 -2.369 1.345 163.074 1 sN1_A393:U39_sN1 sN1 393 ? 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