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EMDB EMD-21068 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2020-01-01 2 'Structure model' 1 1 2020-01-22 3 'Structure model' 1 2 2024-03-06 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 3 'Structure model' chem_comp_atom 3 3 'Structure model' chem_comp_bond 4 3 'Structure model' database_2 # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 2 'Structure model' '_citation.page_first' 3 2 'Structure model' '_citation.page_last' 4 2 'Structure model' '_citation.year' 5 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 6 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6V6C _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-12-04 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of GCP6 in the native human gamma-tubulin ring complex' _pdbx_database_related.db_id EMD-21068 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wieczorek, M.' 1 ? 'Urnavicius, L.' 2 ? 'Ti, S.' 3 ? 'Molloy, K.R.' 4 ? 'Chait, B.T.' 5 ? 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See below for full sequence. ; # _entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name GCP-6 # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type 'polypeptide(L)' _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;MASITQLFDDLCEALLPAAKTHLGQRSVNRKRAKRSLKKVAYNALFTNLFQDETQQLQPDMSKLPARNKILMLSFDLRVG GLGPKADRLEELVEELEAAPCCPLLEVGSVLDLLVQLAGSGPPQVLPRKRDYFLNNKHVGRNVPYSGYDCDDLSVFEMDV QSLISREECLCHSMIQETLQVMEAAPGTGLPTVGLFSFGDPCGDRFERDTRVSLFGALVHSRTYDMDVRLGLPPVPDNAD LSGLAIKVPPSVDQWEDEGFQSASNLTPDSQSEPSVTPDVDLWEAALTYEASKRRCWERVGCPPGHREEPYLTEAGRDAF DKFCRLHQGELQLLAGGVLQAPQPVLVKECELVKDVLNVLIGVVSATFSLCQPAQAFVVKRGVHVSGASPESISSLLSEV AEYGTCYTRLSHFSLQPVLDSLYSKGLVFQAFTSGLRRYLQYYRACVLSTPPTLSLLTIGFLFKKLGRQLRYLAELCGVG AVLPGTCGGGPRAAFPTGVKLLSYLYQEALHNCSNEHYPVLLSLLKTSCEPYTRFIHDWVYSGVFRDAYGEFMIQVNHEY LSFRDKLYWTHGYVLISKEVEDCVPVFLKHIAHDIYVCGKTINLLKLCCPRHYLCWSDVPVPRISVIFSLEELKEIEKDC AVYVGRMERVARHSSVSKEEKELRMEIAKQELIAHAREAASRVLSALSDRQMSERMALDARKREQFQRLKEQFVKDQERR 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GPRGAEHPNFALMQQSYNTFKYYSHFLFKVVTKLVNRGYQPHLEDFLLRINFNNYYQDA ; _entity_poly.pdbx_strand_id L _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 SER n 1 4 ILE n 1 5 THR n 1 6 GLN n 1 7 LEU n 1 8 PHE n 1 9 ASP n 1 10 ASP n 1 11 LEU n 1 12 CYS n 1 13 GLU n 1 14 ALA n 1 15 LEU n 1 16 LEU n 1 17 PRO n 1 18 ALA n 1 19 ALA n 1 20 LYS n 1 21 THR n 1 22 HIS n 1 23 LEU n 1 24 GLY n 1 25 GLN n 1 26 ARG n 1 27 SER n 1 28 VAL n 1 29 ASN n 1 30 ARG n 1 31 LYS n 1 32 ARG n 1 33 ALA n 1 34 LYS n 1 35 ARG n 1 36 SER n 1 37 LEU n 1 38 LYS n 1 39 LYS n 1 40 VAL n 1 41 ALA n 1 42 TYR n 1 43 ASN n 1 44 ALA n 1 45 LEU n 1 46 PHE n 1 47 THR n 1 48 ASN n 1 49 LEU n 1 50 PHE n 1 51 GLN n 1 52 ASP n 1 53 GLU n 1 54 THR n 1 55 GLN n 1 56 GLN n 1 57 LEU n 1 58 GLN n 1 59 PRO n 1 60 ASP n 1 61 MET n 1 62 SER n 1 63 LYS n 1 64 LEU n 1 65 PRO n 1 66 ALA n 1 67 ARG n 1 68 ASN n 1 69 LYS n 1 70 ILE n 1 71 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 676 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6V6C _struct.title 'Structure of GCP6 in the native human gamma-tubulin ring complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6V6C _struct_keywords.text ;GCP, GCP6, gamma-tubulin ring complex, gTuRC, g-TuRC, microtubule, microtubule nucleation, single particle cryo-EM structure, STRUCTURAL PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code GCP6_HUMAN _struct_ref.pdbx_db_accession Q96RT7 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MASITQLFDDLCEALLPAAKTHLGQRSVNRKRAKRSLKKVAYNALFTNLFQDETQQLQPDMSKLPARNKILMLSFDLRVG GLGPKADRLEELVEELEAAPCCPLLEVGSVLDLLVQLAGSGPPQVLPRKRDYFLNNKHVGRNVPYSGYDCDDLSVFEMDV QSLISREECLCHSMIQETLQVMEAAPGTGLPTVGLFSFGDPCGDRFERDTRVSLFGALVHSRTYDMDVRLGLPPVPDNAD LSGLAIKVPPSVDQWEDEGFQSASNLTPDSQSEPSVTPDVDLWEAALTYEASKRRCWERVGCPPGHREEPYLTEAGRDAF DKFCRLHQGELQLLAGGVLQAPQPVLVKECELVKDVLNVLIGVVSATFSLCQPAQAFVVKRGVHVSGASPESISSLLSEV AEYGTCYTRLSHFSLQPVLDSLYSKGLVFQAFTSGLRRYLQYYRACVLSTPPTLSLLTIGFLFKKLGRQLRYLAELCGVG AVLPGTCGGGPRAAFPTGVKLLSYLYQEALHNCSNEHYPVLLSLLKTSCEPYTRFIHDWVYSGVFRDAYGEFMIQVNHEY LSFRDKLYWTHGYVLISKEVEDCVPVFLKHIAHDIYVCGKTINLLKLCCPRHYLCWSDVPVPRISVIFSLEELKEIEKDC AVYVGRMERVARHSSVSKEEKELRMEIAKQELIAHAREAASRVLSALSDRQMSERMALDARKREQFQRLKEQFVKDQERR QAARQEELDDDFSYARELRDRERRLKSLEEELERKARQALVDHYSKLSAEAARREQKALWRIQRHRLESARLRFLLEDEK HIQEMLKAVSEAHQPQEPPDVLLSVHPQVTSPGPEHPEGGQGCDSGSAEQHSPAWDGWNRPGLLTPQPLKPLAVGAGGRG LQQAEGARPFSDSLSIGDFLPVGPGAEPSVQTGMVPLLEVALQTINLDLPPSAPGEAPAAASTQPSRPQEYDFSTVLRPA VATSPAPGPLQAAECSLGSSGLQLWEDSCGKMDACGSASRETLLPSHPPRRAALEEGSSQPTERLFGQVSGGGLPTGDYA SEIAPTRPRWNTHGHVSDASIRVGENVSDVAPTQPRWNTHGHVSNASISLGESVSDVAPTRPRWNIHGHVSNASIRVGEN VSDVAPTRPRWNTHGHVSNASIRVGENVSDVAPTRPRWNTHGHVSDASISLGESVSDMAPARPRWNTHGHVSDASISLGE SVSDMAPTRPRWNTHGHVSDTSIRVGENVSDVAPIRSRCNTHGHVSDASISLGEPVSDVVSTRPRWNTHVPIPPPHMVLG ALSPEAEPNTPRPQQSPPGHTSQSALSLGAQSTVLDCGPRLPVEVGPSLSSPSSGCGEGSISVGENVSDVAPTQPWWPNT PGDSVSEELGPGRSGDTEDLSPNWPLNSQEDTAAQSSPGRGEEAEASAAEAQGGEQAYLAGLAGQYHLERYPDSYESMSE PPIAHLLRPVLPRAFAFPVDPQVQSAADETAVQLSELLTLPVLMKRSITAPLAAHISLVNKAAVDYFFVELHLEAHYEAL RHFLLMEDGEFAQSLSDLLFEKLGAGQTPGELLNPLVLNSVLSKALQCSLHGDTPHASNLSLALKYLPEVFAPNAPDVLS CLELRYKVDWPLNIVITEGCVSKYSGVFSFLLQLKLMMWALKDVCFHLKRTALLSHMAGSVQFRQLQLFKHEMQHFVKVI QGYIANQILHVTWCEFRARLATVGDLEEIQRAHAEYLHKAVFRGLLTEKAAPVMNVIHSIFSLVLKFRSQLISQAWGPPG GPRGAEHPNFALMQQSYNTFKYYSHFLFKVVTKLVNRGYQPHLEDFLLRINFNNYYQDA ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 6V6C _struct_ref_seq.pdbx_strand_id L _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 1819 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession Q96RT7 _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 1819 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1811 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'mass spectrometry' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? 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