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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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LEU I 572 ARG I 576 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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F CYS 3 SG ? ? ? 1_555 F CYS 13 SG ? ? G CYS 115 G CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 7 SG ? ? ? 1_555 F CYS 31 SG ? ? G CYS 119 G CYS 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 41 SG ? ? ? 1_555 H CYS 41 SG ? ? G CYS 153 I CYS 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? ? disulf13 disulf ? ? F CYS 109 SG ? ? ? 1_555 F CYS 120 SG ? ? G CYS 221 G CYS 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? ? disulf14 disulf ? ? F CYS 328 SG ? ? ? 1_555 F CYS 385 SG ? ? G CYS 440 G CYS 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? ? disulf15 disulf ? ? F CYS 426 SG ? ? ? 1_555 F CYS 452 SG ? ? G CYS 538 G CYS 564 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? ? disulf16 disulf ? ? H CYS 3 SG ? ? ? 1_555 H CYS 13 SG ? ? I CYS 115 I CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? ? disulf17 disulf ? ? H CYS 109 SG ? ? ? 1_555 H CYS 120 SG ? ? I CYS 221 I CYS 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.780 ? ? disulf18 disulf ? ? H CYS 328 SG ? ? ? 1_555 H CYS 385 SG ? ? I CYS 440 I CYS 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? ? disulf19 disulf ? ? H CYS 426 SG ? ? ? 1_555 H CYS 452 SG ? ? I CYS 538 I CYS 564 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.788 ? ? metalc1 metalc ? ? A ASP 96 O ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? A ASP 96 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? ? metalc2 metalc ? ? A ASP 96 OD1 ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? A ASP 96 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? ? metalc3 metalc ? ? B THR 56 O ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? B THR 168 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? ? metalc4 metalc ? ? B THR 56 OG1 ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? B THR 168 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? ? metalc5 metalc ? ? B PHE 58 O ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? B PHE 170 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? ? metalc6 metalc ? ? B ASP 60 OD1 ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? B ASP 172 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.250 ? ? metalc7 metalc ? ? B SER 62 OG ? ? ? 1_555 U CA . CA ? ? B SER 174 B CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? ? metalc8 metalc ? ? B HIS 224 NE2 ? ? ? 1_555 O HEC . FE ? ? B HIS 336 B HEC 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? ? metalc9 metalc ? ? C ASP 96 O ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? D ASP 96 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? metalc10 metalc ? ? C ASP 96 OD1 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? D ASP 96 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? ? metalc11 metalc ? ? D THR 56 O ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? E THR 168 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? ? metalc12 metalc ? ? D THR 56 OG1 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? E THR 168 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? ? metalc13 metalc ? ? D PHE 58 O ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? E PHE 170 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc14 metalc ? ? D ASP 60 OD1 ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? E ASP 172 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? ? metalc15 metalc ? ? D SER 62 OG ? ? ? 1_555 HA CA . CA ? ? E SER 174 E CA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? ? metalc16 metalc ? ? D HIS 224 NE2 ? ? ? 1_555 FA HEC . FE ? ? E HIS 336 E HEC 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? ? metalc17 metalc ? ? E ASP 96 O ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? F ASP 96 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.200 ? ? metalc18 metalc ? ? E ASP 96 OD1 ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? F ASP 96 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? ? metalc19 metalc ? ? F THR 56 O ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? G THR 168 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? ? metalc20 metalc ? ? F THR 56 OG1 ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? G THR 168 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? ? metalc21 metalc ? ? F PHE 58 O ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? G PHE 170 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? ? metalc22 metalc ? ? F ASP 60 OD1 ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? G ASP 172 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? ? metalc23 metalc ? ? F SER 62 OG ? ? ? 1_555 VA CA . CA ? ? G SER 174 G CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? ? metalc24 metalc ? ? F HIS 224 NE2 ? ? ? 1_555 PA HEC . FE ? ? G HIS 336 G HEC 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? ? metalc25 metalc ? ? G ASP 96 O ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? H ASP 96 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? ? metalc26 metalc ? ? G ASP 96 OD1 ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? H ASP 96 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.670 ? ? metalc27 metalc ? ? H THR 56 O ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? I THR 168 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? ? metalc28 metalc ? ? H THR 56 OG1 ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? I THR 168 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? ? metalc29 metalc ? ? H PHE 58 O ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? I PHE 170 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? ? metalc30 metalc ? ? H ASP 60 OD1 ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? I ASP 172 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? ? metalc31 metalc ? ? H SER 62 OG ? ? ? 1_555 JB CA . CA ? ? I SER 174 I CA 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? ? metalc32 metalc ? ? H HIS 224 NE2 ? ? ? 1_555 IB HEC . FE ? ? I HIS 336 I HEC 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 11 B . ? PRO 123 B PRO 12 B ? PRO 124 B 1 6.14 2 GLU 242 B . ? GLU 354 B PRO 243 B ? PRO 355 B 1 1.07 3 ASN 437 B . ? ASN 549 B ASN 438 B ? 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SB 11 HOH 45 745 66 HOH HOH I . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,LB,MB 2 1 C,D,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,NB,OB 3 1 E,F,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,PB,QB 4 1 G,H,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,RB,SB # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 13430 ? 1 MORE -105 ? 1 'SSA (A^2)' 21710 ? 2 'ABSA (A^2)' 13700 ? 2 MORE -102 ? 2 'SSA (A^2)' 22620 ? 3 'ABSA (A^2)' 14130 ? 3 MORE -98 ? 3 'SSA (A^2)' 22960 ? 4 'ABSA (A^2)' 13620 ? 4 MORE -102 ? 4 'SSA (A^2)' 21770 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O ? 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LEU CD2 HD21 sing N N 351 LEU CD2 HD22 sing N N 352 LEU CD2 HD23 sing N N 353 LEU OXT HXT sing N N 354 LYS N CA sing N N 355 LYS N H sing N N 356 LYS N H2 sing N N 357 LYS CA C sing N N 358 LYS CA CB sing N N 359 LYS CA HA sing N N 360 LYS C O doub N N 361 LYS C OXT sing N N 362 LYS CB CG sing N N 363 LYS CB HB2 sing N N 364 LYS CB HB3 sing N N 365 LYS CG CD sing N N 366 LYS CG HG2 sing N N 367 LYS CG HG3 sing N N 368 LYS CD CE sing N N 369 LYS CD HD2 sing N N 370 LYS CD HD3 sing N N 371 LYS CE NZ sing N N 372 LYS CE HE2 sing N N 373 LYS CE HE3 sing N N 374 LYS NZ HZ1 sing N N 375 LYS NZ HZ2 sing N N 376 LYS NZ HZ3 sing N N 377 LYS OXT HXT sing N N 378 MAN C1 C2 sing N N 379 MAN C1 O1 sing N N 380 MAN C1 O5 sing N N 381 MAN C1 H1 sing N N 382 MAN C2 C3 sing N N 383 MAN C2 O2 sing N N 384 MAN C2 H2 sing N N 385 MAN C3 C4 sing N N 386 MAN C3 O3 sing N N 387 MAN C3 H3 sing N N 388 MAN C4 C5 sing N N 389 MAN C4 O4 sing N N 390 MAN C4 H4 sing N N 391 MAN C5 C6 sing N N 392 MAN C5 O5 sing N 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436 NAG C5 H5 sing N N 437 NAG C6 O6 sing N N 438 NAG C6 H61 sing N N 439 NAG C6 H62 sing N N 440 NAG C7 C8 sing N N 441 NAG C7 N2 sing N N 442 NAG C7 O7 doub N N 443 NAG C8 H81 sing N N 444 NAG C8 H82 sing N N 445 NAG C8 H83 sing N N 446 NAG N2 HN2 sing N N 447 NAG O1 HO1 sing N N 448 NAG O3 HO3 sing N N 449 NAG O4 HO4 sing N N 450 NAG O6 HO6 sing N N 451 PHE N CA sing N N 452 PHE N H sing N N 453 PHE N H2 sing N N 454 PHE CA C sing N N 455 PHE CA CB sing N N 456 PHE CA HA sing N N 457 PHE C O doub N N 458 PHE C OXT sing N N 459 PHE CB CG sing N N 460 PHE CB HB2 sing N N 461 PHE CB HB3 sing N N 462 PHE CG CD1 doub Y N 463 PHE CG CD2 sing Y N 464 PHE CD1 CE1 sing Y N 465 PHE CD1 HD1 sing N N 466 PHE CD2 CE2 doub Y N 467 PHE CD2 HD2 sing N N 468 PHE CE1 CZ doub Y N 469 PHE CE1 HE1 sing N N 470 PHE CE2 CZ sing Y N 471 PHE CE2 HE2 sing N N 472 PHE CZ HZ sing N N 473 PHE OXT HXT sing N N 474 PRO N CA sing N N 475 PRO N CD sing N N 476 PRO N H sing N N 477 PRO CA C sing N N 478 PRO CA CB 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CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man FUC 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 LFucpa FUC 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-L-fucopyranose FUC 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-L-Fucp FUC 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Fuc MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id 7GD _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id 7GD _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 3 'CHLORIDE ION' CL 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 5 alpha-L-fucopyranose FUC 6 'HEME C' HEC 7 beta-D-mannopyranose BMA 8 alpha-D-mannopyranose MAN 9 '7-benzyl-1H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-5-amine' 7GD 10 'CALCIUM ION' CA 11 water HOH # _pdbx_initial_refinement_model.id 1 _pdbx_initial_refinement_model.entity_id_list ? _pdbx_initial_refinement_model.type 'experimental model' _pdbx_initial_refinement_model.source_name PDB _pdbx_initial_refinement_model.accession_code 6QJ2 _pdbx_initial_refinement_model.details ? # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #