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16 180 ASP n 16 181 ASN n 16 182 LEU n 16 183 LEU n 16 184 GLN n 16 185 HIS n 16 186 ILE n 16 187 SER n 16 188 ASP n 16 189 PRO n 16 190 TRP n 16 191 HIS n 16 192 ASN n 16 193 THR n 16 194 ILE n 16 195 VAL n 16 196 GLN n 16 197 THR n 16 198 LEU n 17 1 ALA n 17 2 SER n 17 3 TYR n 17 4 LYS n 17 5 VAL n 17 6 LYS n 17 7 LEU n 17 8 VAL n 17 9 THR n 17 10 PRO n 17 11 ASP n 17 12 GLY n 17 13 THR n 17 14 GLN n 17 15 GLU n 17 16 PHE n 17 17 GLU n 17 18 CYS n 17 19 PRO n 17 20 SER n 17 21 ASP n 17 22 VAL n 17 23 TYR n 17 24 ILE n 17 25 LEU n 17 26 ASP n 17 27 HIS n 17 28 ALA n 17 29 GLU n 17 30 GLU n 17 31 VAL n 17 32 GLY n 17 33 ILE n 17 34 ASP n 17 35 LEU n 17 36 PRO n 17 37 TYR n 17 38 SER n 17 39 CYS n 17 40 ARG n 17 41 ALA n 17 42 GLY n 17 43 SER n 17 44 CYS n 17 45 SER n 17 46 SER n 17 47 CYS n 17 48 ALA n 17 49 GLY n 17 50 LYS n 17 51 VAL n 17 52 VAL n 17 53 GLY n 17 54 GLY n 17 55 GLU n 17 56 VAL n 17 57 ASP n 17 58 GLN n 17 59 SER n 17 60 ASP n 17 61 GLY n 17 62 SER n 17 63 PHE n 17 64 LEU n 17 65 ASP n 17 66 ASP n 17 67 GLU n 17 68 GLN n 17 69 ILE n 17 70 GLU n 17 71 ALA n 17 72 GLY n 17 73 PHE n 17 74 VAL n 17 75 LEU n 17 76 THR n 17 77 CYS n 17 78 VAL n 17 79 ALA n 17 80 TYR n 17 81 PRO n 17 82 THR n 17 83 SER n 17 84 ASP n 17 85 VAL n 17 86 VAL n 17 87 ILE n 17 88 GLU n 17 89 THR n 17 90 HIS n 17 91 LYS n 17 92 GLU n 17 93 GLU n 17 94 ASP n 17 95 LEU n 17 96 THR n 17 97 ALA n # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 743 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 733 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 80 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 143 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 66 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 154 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 97 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 88 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 1 31 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 1 42 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 1 81 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 1 157 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 1 193 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 1 208 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 1 221 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample 1 198 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample 1 97 Pea 'Pisum sativum' 3888 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A0F6NFW5_PEA A0A0F6NFW5 ? 1 ;PEVKILVDRDPIKTSFEQWAKPGHFSRTIAKGPDTTTWIWNLHADAHDFDSHTSDLEEISRKVFSAHFGQLSIIFLWLSG MYFHGARFSNYEAWLNDPTHIRPSAQVVWPIVGQEILNGDVGGGFRGIQITSGFFQIWRASGITSELQLYCTAIGALVFA ALMLFAGWFHYHKAAPKLVWFQDVESMLNHHLAGLLGLGSLSWAGHQVHVSLPINQFLNAGVDPKEIPLPHEFILNRDLL AQLYPSFAEGATPFFTLNWSKYADFLTFRGGLDPLTGGLWLTDIAHHHLAIAILFLIAGHMYRTNWGIGHGIKDILEAHK GPFTGQGHKGLYEILTTSWHAQLSINLAMLGSLTIIVAHHMYAMPPYPYLATDYGTQLSLFTHHMWIGGFLIVGAAAHAA IFMVRDYDPTTRYNDLLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYIHNDTMSALGRPQDMFSDTAIQLQPVFAQWIQNT HALAPGTTAPGATTSTSLTWGGGDLVSVGGKVALLPIPLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANL GFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNAISVVIFHFSWKMQSDVWGSINDQGVVTHITGGNFAQSSITINGWLRD FLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLFFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPATQPRALSIVQGRAVGV THYLLGGIATTWAFFLARIIAVG ; 16 2 UNP A0A0F6NGI2_PEA A0A0F6NGI2 ? 2 ;ALRFPRFSQGLAQDPTTRRIWFGIATAHDFESHDDITEGRLYQNIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFEAWVQDP LHVRPIAHAIWDPHFGQPAVEAFTRGGALGPVNIAYSGVYQWWYTIGLRTNEDLYTGAIFLLFLSFISLLAGWLHLQPKW KPSVSWFKNAESRLNHHLSGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPGSRGEYVRWNNFLSVLPHPQGLGPLFTGQWNLYAQNPDSSN HLFSTSQGAGTAILTLLGGFHPQTQSLWLTDMAHHHLAIAILFLIGGHMYRTNFGIGHSIKYILEAHIPPGGRLGRGHKG LYDTINNSIHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLPAYAFIAQDFTTQAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGAIFFIRDYNPE QNADNVLARMLEHKEAIISHLSWASLFLGFHTLGLYVHNDVMLAFGTPEKQILIEPIFAQWIQSAHGKTSYGFDVLLSST NSPALNAGRSIWLPGWLNAINENSNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDG PGRGGTCDISAWDAFYLAVFWMLNTIGWVTFYWHWKHITLWQGNVSQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGMN SLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLAWAHERTPLANLIRWRDKPVALSIVQARLVGLVHFSVGYIFTY AAFLIASTSGKFG ; 2 3 UNP PSAC_PEA P10793 ? 3 ;SHSVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMIPWGGCKAKQIASAPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLWHETTRSMGLAY ; 2 4 PDB 6YAC 6YAC ? 4 ? 1 5 PDB 6YAC 6YAC ? 5 ? 1 6 PDB 6YAC 6YAC ? 6 ? 1 7 PDB 6YAC 6YAC ? 7 ? 1 8 PDB 6YAC 6YAC ? 8 ? 1 9 UNP PSAI_PEA P17227 ? 9 INLPSLFVPLVGLLFPAVAMASLFLHVEKRL 2 10 UNP D5MAL3_PEA D5MAL3 ? 10 MRDLKTYLSVAPVASTLWFAALAGLLIEINRLFPDALTFPFF 1 11 UNP E1C9L3_PEA E1C9L3 ? 11 ;FIGSPTNLIMVTSTSLMLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEVRDSGLQTGDPAGFTLADTLACGVVGHIIGVGVVLGLKNI G ; 2 12 PDB 6YAC 6YAC ? 12 ? 1 13 PDB 6YAC 6YAC ? 13 ? 1 14 UNP Q41038_PEA Q41038 ? 14 ;TVAEPDRPLWFPGSTPPPWLDGSLPGDFGFDPLGLGSDPESLRWNVQAELVHSRWAMLGAAGIFIPEFLTKLGILNTPSW YTAGEQEYFTDTTTLFIVELVFIGWAEGRRWADILNPGCVNTDPIFPNNKLTGTDVGYPGGLWFDPLGWGSASPQKLKEL RTKEIKNGRLAMLAVMGAWFQHIYTGTGPIDNLFAHLADPGHATIFAA ; 58 15 UNP CB23_PEA Q32904 ? 15 ;RPLWFASKQSLSYLDGSLPGDYGFDPLGLSDPEGTGGFIEPRWLAYGEVINGRFAMLGAVGAIAPEYLGKVGLIPQETAL AWFQTGVIPPAGTYNYWADNYTLFVLEMALMGFAEHRRFQDWAKPGSMGKQYFLGLEKGFGGSGNPAYPGGPFFNPLGFG KDEKSLKELKLKEVKNGRLAMLAILGYFIQGLVTGVGPYQNLLDHVADPVNNNVLTSLKFH ; 55 16 UNP CB24_PEA Q9SQL2 ? 16 ;KKGEWLPGLASPGYLTGSLPGDNGFDPLGLAEDPENLRWFVQAELVNGRWAMLGVAGMLLPEVFTSIGIINVPKWYAAGK EEYFASSSTLFVIEFILSHYVEIRRWQDIKNPGSVNQDPIFKQYSLPAGEVGYPGGIFNPLNFAPTLEAKEKEIANGRLA MLAFLGFIIQHNVTGKGPFDNLLQHISDPWHNTIVQTL ; 52 17 UNP FER1_PEA P09911 ? 17 ;ASYKVKLVTPDGTQEFECPSDVYILDHAEEVGIDLPYSCRAGSCSSCAGKVVGGEVDQSDGSFLDDEQIEAGFVLTCVAY PTSDVVIETHKEEDLTA ; 53 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6YAC A 1 ? 743 ? A0A0F6NFW5 16 ? 758 ? 16 758 2 2 6YAC B 1 ? 733 ? A0A0F6NGI2 2 ? 734 ? 2 734 3 3 6YAC C 1 ? 80 ? P10793 2 ? 81 ? 2 81 4 4 6YAC D 1 ? 143 ? 6YAC 69 ? 211 ? 69 211 5 5 6YAC E 1 ? 66 ? 6YAC 64 ? 129 ? 64 129 6 6 6YAC F 1 ? 154 ? 6YAC 78 ? 231 ? 78 231 7 7 6YAC G 1 ? 97 ? 6YAC 58 ? 154 ? 58 154 8 8 6YAC H 1 ? 88 ? 6YAC 53 ? 140 ? 53 140 9 9 6YAC I 1 ? 31 ? P17227 2 ? 32 ? 2 32 10 10 6YAC J 1 ? 42 ? D5MAL3 1 ? 42 ? 1 42 11 11 6YAC K 1 ? 81 ? E1C9L3 2 ? 82 ? 46 126 12 12 6YAC L 1 ? 157 ? 6YAC 54 ? 210 ? 54 210 13 13 6YAC 1 1 ? 193 ? 6YAC 40 ? 232 ? 40 232 14 14 6YAC 2 1 ? 208 ? Q41038 58 ? 265 ? 58 265 15 15 6YAC 3 1 ? 221 ? Q32904 55 ? 275 ? 55 275 16 16 6YAC 4 1 ? 198 ? Q9SQL2 52 ? 249 ? 52 249 17 17 6YAC N 1 ? 97 ? P09911 53 ? 149 ? 1 97 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 10 6YAC PHE J 32 ? UNP D5MAL3 LEU 32 conflict 32 1 11 6YAC ALA K 41 ? UNP E1C9L3 VAL 42 conflict 86 2 16 6YAC LYS 4 38 ? UNP Q9SQL2 ARG 89 conflict 89 3 16 6YAC ASP 4 77 ? UNP Q9SQL2 ALA 128 conflict 128 4 16 6YAC PHE 4 98 ? UNP Q9SQL2 SER 149 conflict 149 5 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCR non-polymer . BETA-CAROTENE ? 'C40 H56' 536.873 C7Z non-polymer . ;(1~{S})-3,5,5-trimethyl-4-[(1~{E},3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{S})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohex-3-en-1-ol ; ? 'C40 H56 O2' 568.871 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CHL non-polymer . 'CHLOROPHYLL B' ? 'C55 H70 Mg N4 O6 2' 907.472 CL0 non-polymer . 'CHLOROPHYLL A ISOMER' ? 'C55 H72 Mg N4 O5 2' 893.489 CLA non-polymer . 'CHLOROPHYLL A' ? 'C55 H72 Mg N4 O5 2' 893.489 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DGD saccharide . 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' ? 'C51 H96 O15' 949.299 FES non-polymer . 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' ? 'Fe2 S2' 175.820 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LMG non-polymer . 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE ? 'C45 H86 O10' 787.158 LMT D-saccharide . DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE ? 'C24 H46 O11' 510.615 LUT non-polymer . "(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL" ;(3R,3'R)-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL; LUTEIN ; 'C40 H56 O2' 568.871 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PQN non-polymer . PHYLLOQUINONE 'VITAMIN K1; 2-METHYL-3-PHYTYL-1,4-NAPHTHOQUINONE' 'C31 H46 O2' 450.696 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 XAT non-polymer . ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; VIOLAXANTHIN 'C40 H56 O4' 600.870 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6YAC _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 48.74 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 6YAC _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0080 ? 40543 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.9111 ? 57176 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.1561 ? 5102 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0107 ? 7328 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 26.6509 ? 16639 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6YAC _struct.title 'Plant PSI-ferredoxin supercomplex' _struct.pdbx_descriptor ;Lhca1, Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic, Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic, Lhca4, Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 (E.C.1.97.1.12), Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 (E.C.1.97.1.12), Photosystem I iron-sulfur center (E.C.1.97.1.12), PsaD, PsaE, PsaF, PsaG, PsaH, Photosystem I reaction center subunit VIII, Photosystem I reaction center subunit IX, Photosystem I reaction center subunit X psaK, PsaL, Ferredoxin-1, chloroplastic ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6YAC _struct_keywords.text 'Membrane complex, photosystem I, ferredoxin, light harvesting, excitation transfer, PHOTOSYNTHESIS' _struct_keywords.pdbx_keywords PHOTOSYNTHESIS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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TI N N 19 ? UI N N 29 ? VI N N 29 ? WI N N 19 ? XI N N 27 ? YI N N 27 ? ZI N N 32 ? AJ N N 33 ? BJ N N 33 ? CJ N N 33 ? DJ N N 33 ? EJ N N 33 ? FJ N N 33 ? GJ N N 33 ? HJ N N 33 ? IJ N N 33 ? JJ N N 33 ? KJ N N 33 ? LJ N N 33 ? MJ N N 33 ? NJ N N 33 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 26 ? LYS A 31 ? SER A 41 LYS A 46 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 36 ? ASP A 45 ? 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C CYS 10 SG ? ? ? 1_555 CE SF4 . FE2 ? ? C CYS 11 C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc18 metalc ? ? C CYS 13 SG ? ? ? 1_555 CE SF4 . FE1 ? ? C CYS 14 C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? ? metalc19 metalc ? ? C CYS 16 SG ? ? ? 1_555 CE SF4 . FE4 ? ? C CYS 17 C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? ? metalc20 metalc ? ? C CYS 20 SG ? ? ? 1_555 BE SF4 . FE1 ? ? C CYS 21 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc21 metalc ? ? C CYS 47 SG ? ? ? 1_555 BE SF4 . FE4 ? ? C CYS 48 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? ? metalc22 metalc ? ? C CYS 50 SG ? ? ? 1_555 BE SF4 . FE3 ? ? C CYS 51 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? ? metalc23 metalc ? ? C CYS 53 SG ? ? ? 1_555 BE SF4 . FE2 ? ? C CYS 54 C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.260 ? ? metalc24 metalc ? ? C CYS 57 SG ? ? ? 1_555 CE SF4 . FE3 ? ? C CYS 58 C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? ? metalc25 metalc ? ? F SER 74 O ? ? ? 1_555 EE CLA . MG ? ? F SER 151 F CLA 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? ? metalc26 metalc ? ? G ASP 62 OD1 ? ? ? 1_555 OE CLA . MG ? ? G ASP 119 G CLA 1602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? ? metalc27 metalc ? ? HJ HOH . O ? ? ? 1_555 BF CLA . MG ? ? J HOH 902 J CLA 1901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? ? metalc28 metalc ? ? K LEU 25 O ? ? ? 1_555 IF CLA . MG ? ? K LEU 70 K CLA 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? ? metalc29 metalc ? ? JJ HOH . O ? ? ? 1_555 OF CLA . MG ? ? L HOH 903 L CLA 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? ? metalc30 metalc ? ? M TRP 2 O ? ? ? 1_555 DG CHL . MG ? ? 1 TRP 41 1 CHL 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? ? metalc31 metalc ? ? M GLN 70 OE1 ? ? ? 1_555 EG CHL . MG ? ? 1 GLN 109 1 CHL 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.898 ? ? metalc32 metalc ? ? M ASN 148 OD1 ? ? ? 1_555 WF CLA . MG ? ? 1 ASN 187 1 CLA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.790 ? ? metalc33 metalc ? ? M LEU 191 O ? ? ? 1_555 IG CLA . MG ? ? 1 LEU 230 1 CLA 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? ? metalc34 metalc ? ? N TRP 10 O ? ? ? 1_555 XG CHL . MG ? ? 2 TRP 67 2 CHL 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? ? metalc35 metalc ? ? O ASN 51 OD1 ? ? ? 1_555 SH CLA . MG ? ? 3 ASN 105 3 CLA 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.975 ? ? metalc36 metalc ? ? O VAL 87 O ? ? ? 1_555 WH CLA . MG ? ? 3 VAL 141 3 CLA 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? ? metalc37 metalc ? ? O GLU 115 OE1 ? ? ? 1_555 YH CLA . MG ? ? 3 GLU 169 3 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? ? metalc38 metalc ? ? O GLU 173 OE1 ? ? ? 1_555 OH CLA . MG ? ? 3 GLU 227 3 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? ? metalc39 metalc ? ? P TRP 5 O ? ? ? 1_555 QI CLA . MG ? ? 4 TRP 56 4 CLA 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? ? metalc40 metalc ? ? P GLU 102 OE2 ? ? ? 1_555 TI CLA . MG ? ? 4 GLU 153 4 CLA 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? ? metalc41 metalc ? ? P GLU 153 OE2 ? ? ? 1_555 II CLA . MG ? ? 4 GLU 204 4 CLA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? ? metalc42 metalc ? ? Q CYS 39 SG ? ? ? 1_555 ZI FES . FE1 ? ? N CYS 39 N FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.230 ? ? metalc43 metalc ? ? Q CYS 44 SG ? ? ? 1_555 ZI FES . FE1 ? ? N CYS 44 N FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc44 metalc ? ? Q CYS 47 SG ? ? ? 1_555 ZI FES . FE2 ? ? N CYS 47 N FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? ? metalc45 metalc ? ? Q CYS 77 SG ? ? ? 1_555 ZI FES . FE2 ? ? N CYS 77 N FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 4 B . ? PHE 5 B PRO 5 B ? PRO 6 B 1 2.58 2 ASP 60 C . ? ASP 61 C PHE 61 C ? PHE 62 C 1 2.34 3 HIS 100 D . ? HIS 168 D PRO 101 D ? 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AB7 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 7 ? 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TYR D 166 HIS D 168 AB1 1 GLN D 43 ? GLU D 46 ? GLN D 111 GLU D 114 AB1 2 ALA D 52 ? MET D 55 ? ALA D 120 MET D 123 AB2 1 THR E 54 ? TYR E 57 ? THR E 117 TYR E 120 AB2 2 VAL E 40 ? ARG E 43 ? VAL E 103 ARG E 106 AB2 3 THR E 24 ? VAL E 30 ? THR E 87 VAL E 93 AB2 4 LYS E 10 ? ILE E 13 ? LYS E 73 ILE E 76 AB2 5 VAL E 62 ? GLU E 64 ? VAL E 125 GLU E 127 AB3 1 THR F 6 ? PRO F 7 ? THR F 83 PRO F 84 AB3 2 LEU F 62 ? CYS F 63 ? LEU F 139 CYS F 140 AB3 3 PRO F 69 ? HIS F 70 ? PRO F 146 HIS F 147 AB4 1 GLU G 37 ? GLN G 38 ? GLU G 94 GLN G 95 AB4 2 VAL G 41 ? THR G 42 ? VAL G 98 THR G 99 AB5 1 TRP H 15 ? ASP H 16 ? TRP H 67 ASP H 68 AB5 2 LEU L 111 ? THR L 112 ? LEU L 164 THR L 165 AB6 1 GLY Q 12 ? GLU Q 17 ? GLY N 12 GLU N 17 AB6 2 LYS Q 4 ? THR Q 9 ? LYS N 4 THR N 9 AB6 3 VAL Q 85 ? GLU Q 88 ? VAL N 85 GLU N 88 AB6 4 VAL Q 51 ? GLY Q 53 ? VAL N 51 GLY N 53 AB7 1 ALA Q 48 ? GLY Q 49 ? ALA N 48 GLY N 49 AB7 2 VAL Q 74 ? LEU Q 75 ? VAL N 74 LEU N 75 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ASP A 8 ? 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N THR F 83 O CYS F 63 ? O CYS F 140 AB3 2 3 N LEU F 62 ? N LEU F 139 O HIS F 70 ? O HIS F 147 AB4 1 2 N GLN G 38 ? N GLN G 95 O VAL G 41 ? O VAL G 98 AB5 1 2 N ASP H 16 ? N ASP H 68 O LEU L 111 ? O LEU L 164 AB6 1 2 O GLY Q 12 ? O GLY N 12 N THR Q 9 ? N THR N 9 AB6 2 3 N LYS Q 6 ? N LYS N 6 O ILE Q 87 ? O ILE N 87 AB6 3 4 O VAL Q 86 ? O VAL N 86 N VAL Q 52 ? N VAL N 52 AB7 1 2 N GLY Q 49 ? N GLY N 49 O VAL Q 74 ? O VAL N 74 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A CL0 1011 ? 14 'binding site for residue CL0 A 1011' AC2 Software A CLA 1012 ? 14 'binding site for residue CLA A 1012' AC3 Software A CLA 1013 ? 19 'binding site for residue CLA A 1013' AC4 Software A CLA 1101 ? 14 'binding site for residue CLA A 1101' AC5 Software A CLA 1102 ? 13 'binding site for residue CLA A 1102' AC6 Software A CLA 1103 ? 16 'binding site for residue CLA A 1103' AC7 Software A CLA 1104 ? 7 'binding site for residue CLA A 1104' AC8 Software A CLA 1105 ? 12 'binding site for residue CLA A 1105' AC9 Software A CLA 1106 ? 13 'binding site for residue CLA A 1106' AD1 Software A CLA 1107 ? 13 'binding site for residue CLA A 1107' AD2 Software A CLA 1108 ? 16 'binding site for residue CLA A 1108' AD3 Software A CLA 1109 ? 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