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D-alloisoleucine ? 'C6 H13 N O2' 131.173 2PO non-polymer . PHOSPHONATE ? 'H O3 P -2' 79.980 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 DAL 'D-peptide linking' . D-ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 DAR 'D-peptide linking' . D-ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 DGL 'D-peptide linking' . 'D-GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 DTH 'D-peptide linking' . D-THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MUB 'D-saccharide, alpha linking' . 'N-acetyl-alpha-muramic acid' 'N-acetyl-muramic acid; N-ACETYLMURAMIC ACID' 'C11 H19 N O8' 293.270 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 P1W non-polymer . 3-methylbut-2-en-1-ol ? 'C5 H10 O' 86.132 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 ZAE 'D-peptide linking' . N-methyl-D-phenylalanine ? 'C10 H13 N O2' 179.216 # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier MUB 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-GlcpNAc3 MUB 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 MurNAc NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 ZAE 1 1 1 ZAE DPH A . n A 1 2 ILE 2 2 2 ILE ILE A . n A 1 3 SER 3 3 3 SER SER A . n A 1 4 DAR 4 4 4 DAR DAR A . n A 1 5 28J 5 5 5 28J 28J A . n A 1 6 ILE 6 6 6 ILE ILE A . n A 1 7 SER 7 7 7 SER SER A . n A 1 8 DTH 8 8 8 DTH DTC A . n A 1 9 ALA 9 9 9 ALA ALA A . n A 1 10 LEU 10 10 10 LEU LEU A . n A 1 11 ILE 11 11 11 ILE ILE A . n B 1 1 ZAE 1 1 1 ZAE DPH B . n B 1 2 ILE 2 2 2 ILE ILE B . n B 1 3 SER 3 3 3 SER SER B . n B 1 4 DAR 4 4 4 DAR DAR B . n B 1 5 28J 5 5 5 28J 28J B . n B 1 6 ILE 6 6 6 ILE ILE B . n B 1 7 SER 7 7 7 SER SER B . n B 1 8 DTH 8 8 8 DTH DTC B . n B 1 9 ALA 9 9 9 ALA ALA B . n B 1 10 LEU 10 10 10 LEU LEU B . n B 1 11 ILE 11 11 11 ILE ILE B . n C 1 1 ZAE 1 1 1 ZAE DPH E . n C 1 2 ILE 2 2 2 ILE ILE E . n C 1 3 SER 3 3 3 SER SER E . n C 1 4 DAR 4 4 4 DAR DAR E . n C 1 5 28J 5 5 5 28J 28J E . n C 1 6 ILE 6 6 6 ILE ILE E . n C 1 7 SER 7 7 7 SER SER E . n C 1 8 DTH 8 8 8 DTH DTC E . n C 1 9 ALA 9 9 9 ALA ALA E . n C 1 10 LEU 10 10 10 LEU LEU E . n C 1 11 ILE 11 11 11 ILE ILE E . n D 1 1 ZAE 1 1 1 ZAE DPH F . n D 1 2 ILE 2 2 2 ILE ILE F . n D 1 3 SER 3 3 3 SER SER F . n D 1 4 DAR 4 4 4 DAR DAR F . n D 1 5 28J 5 5 5 28J 28J F . n D 1 6 ILE 6 6 6 ILE ILE F . n D 1 7 SER 7 7 7 SER SER F . n D 1 8 DTH 8 8 8 DTH DTC F . n D 1 9 ALA 9 9 9 ALA ALA F . n D 1 10 LEU 10 10 10 LEU LEU F . n D 1 11 ILE 11 11 11 ILE ILE F . n E 2 1 ALA 1 1 1 ALA ALA C . n E 2 2 DGL 2 2 2 DGL DGL C . n E 2 3 LYS 3 3 3 LYS LYS C . n E 2 4 DAL 4 4 4 DAL DAL C . n E 2 5 DAL 5 5 5 DAL DAL C . n F 2 1 ALA 1 1 1 ALA ALA D . n F 2 2 DGL 2 2 2 DGL DGL D . n F 2 3 LYS 3 3 3 LYS LYS D . n F 2 4 DAL 4 4 4 DAL DAL D . n F 2 5 DAL 5 5 5 DAL DAL D . n G 2 1 ALA 1 1 1 ALA ALA G . n G 2 2 DGL 2 2 2 DGL DGL G . n G 2 3 LYS 3 3 3 LYS LYS G . n G 2 4 DAL 4 4 4 DAL DAL G . n G 2 5 DAL 5 5 5 DAL DAL G . n H 2 1 ALA 1 1 1 ALA ALA H . n H 2 2 DGL 2 2 2 DGL DGL H . n H 2 3 LYS 3 3 3 LYS LYS H . n H 2 4 DAL 4 4 4 DAL DAL H . n H 2 5 DAL 5 5 5 DAL DAL H . n # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero I 3 MUB 1 I MUB 1 C NAM 6 n I 3 NAG 2 I NAG 2 C NAG 7 n J 3 MUB 1 J MUB 1 D NAM 6 n J 3 NAG 2 J NAG 2 D NAG 7 n K 3 MUB 1 K MUB 1 G NAM 6 n K 3 NAG 2 K NAG 2 G NAG 7 n L 3 MUB 1 L MUB 1 H NAM 6 n L 3 NAG 2 L NAG 2 H NAG 7 n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 4 2PO 1 101 8 2PO PHO A . 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FA N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 6YFY 6YFY ? 1 ? 1 2 PDB 6YFY 6YFY ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6YFY A 1 ? 11 ? 6YFY 1 ? 11 ? 1 11 2 1 6YFY B 1 ? 11 ? 6YFY 1 ? 11 ? 1 11 3 1 6YFY E 1 ? 11 ? 6YFY 1 ? 11 ? 1 11 4 1 6YFY F 1 ? 11 ? 6YFY 1 ? 11 ? 1 11 5 2 6YFY C 1 ? 5 ? 6YFY 1 ? 5 ? 1 5 6 2 6YFY D 1 ? 5 ? 6YFY 1 ? 5 ? 1 5 7 2 6YFY G 1 ? 5 ? 6YFY 1 ? 5 ? 1 5 8 2 6YFY H 1 ? 5 ? 6YFY 1 ? 5 ? 1 5 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 8730 ? 1 MORE -31 ? 1 'SSA (A^2)' 5130 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'assay for oligomerization' 'Excimer Fluorescence with tagged Lipid II' 2 1 microscopy 'Fluorescence microscopy with tagged Lipid II' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A ZAE 1 C ? ? ? 1_555 A ILE 2 N ? ? A ZAE 1 A ILE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale2 covale both ? A SER 3 C ? ? ? 1_555 A DAR 4 N ? ? A SER 3 A DAR 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? ? covale3 covale both ? A DAR 4 C ? ? ? 1_555 A 28J 5 N ? ? A DAR 4 A 28J 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.320 ? ? covale4 covale both ? A 28J 5 C ? ? ? 1_555 A ILE 6 N ? ? A 28J 5 A ILE 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? ? covale5 covale both ? A SER 7 C ? ? ? 1_555 A DTH 8 N ? ? A SER 7 A DTH 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? ? covale6 covale both ? A DTH 8 C ? ? ? 1_555 A ALA 9 N ? ? A DTH 8 A ALA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale7 covale one ? A DTH 8 OG1 ? ? ? 1_555 A ILE 11 C ? ? A DTH 8 A ILE 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale8 covale none ? M 2PO . O3P ? ? ? 1_555 N 2PO . P ? ? A 2PO 101 A 2PO 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.601 ? ? covale9 covale one ? M 2PO . P ? ? ? 1_555 I MUB . O1 ? ? A 2PO 101 I MUB 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.636 ? ? covale10 covale one ? N 2PO . O3P ? ? ? 1_555 O P1W . C1 ? ? A 2PO 102 A P1W 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale11 covale one ? O P1W . C4 ? ? ? 1_555 P P1W . C1 ? ? A P1W 103 A P1W 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.526 ? ? covale12 covale one ? P P1W . C4 ? ? ? 1_555 Q P1W . C1 ? ? A P1W 104 A P1W 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.534 ? ? covale13 covale one ? R P1W . C4 ? ? ? 1_555 S P1W . C1 ? ? A P1W 106 A P1W 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.537 ? ? covale14 covale one ? R P1W . C1 ? ? ? 1_555 V P1W . C4 ? ? A P1W 106 B P1W 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.540 ? ? covale15 covale both ? B ZAE 1 C ? ? ? 1_555 B ILE 2 N ? ? B ZAE 1 B ILE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? ? covale16 covale both ? B SER 3 C ? ? ? 1_555 B DAR 4 N ? ? B SER 3 B DAR 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale17 covale both ? B DAR 4 C ? ? ? 1_555 B 28J 5 N ? ? B DAR 4 B 28J 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale18 covale both ? B 28J 5 C ? ? ? 1_555 B ILE 6 N ? ? B 28J 5 B ILE 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.361 ? ? covale19 covale both ? B SER 7 C ? ? ? 1_555 B DTH 8 N ? ? B SER 7 B DTH 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.361 ? ? covale20 covale both ? B DTH 8 C ? ? ? 1_555 B ALA 9 N ? ? B DTH 8 B ALA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? ? covale21 covale one ? B DTH 8 OG1 ? ? ? 1_555 B ILE 11 C ? ? B DTH 8 B ILE 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale22 covale none ? T 2PO . O3P ? ? ? 1_555 U 2PO . P ? ? B 2PO 101 B 2PO 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.594 ? ? covale23 covale one ? T 2PO . P ? ? ? 1_555 J MUB . O1 ? ? B 2PO 101 J MUB 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.630 ? ? covale24 covale one ? U 2PO . O3P ? ? ? 1_555 V P1W . C1 ? ? B 2PO 102 B P1W 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale25 covale both ? C ZAE 1 C ? ? ? 1_555 C ILE 2 N ? ? E ZAE 1 E ILE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.307 ? ? covale26 covale both ? C SER 3 C ? ? ? 1_555 C DAR 4 N ? ? E SER 3 E DAR 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.309 ? ? covale27 covale both ? C DAR 4 C ? ? ? 1_555 C 28J 5 N ? ? E DAR 4 E 28J 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale28 covale both ? C 28J 5 C ? ? ? 1_555 C ILE 6 N ? ? E 28J 5 E ILE 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale29 covale both ? C SER 7 C ? ? ? 1_555 C DTH 8 N ? ? E SER 7 E DTH 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale30 covale both ? C DTH 8 C ? ? ? 1_555 C ALA 9 N ? ? E DTH 8 E ALA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? ? covale31 covale one ? C DTH 8 OG1 ? ? ? 1_555 C ILE 11 C ? ? E DTH 8 E ILE 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale32 covale none ? W 2PO . O3P ? ? ? 1_555 X 2PO . P ? ? E 2PO 101 E 2PO 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.594 ? ? covale33 covale one ? W 2PO . P ? ? ? 1_555 K MUB . O1 ? ? E 2PO 101 K MUB 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.623 ? ? covale34 covale one ? X 2PO . O3P ? ? ? 1_555 Y P1W . C1 ? ? E 2PO 102 E P1W 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? ? covale35 covale one ? Y P1W . C4 ? ? ? 1_555 Z P1W . C1 ? ? E P1W 103 F P1W 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.542 ? ? covale36 covale both ? D ZAE 1 C ? ? ? 1_555 D ILE 2 N ? ? F ZAE 1 F ILE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale37 covale both ? D SER 3 C ? ? ? 1_555 D DAR 4 N ? ? 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CB D DAL 4 ? ? 1.720 1.520 0.200 0.021 N 181 17 CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 1.684 1.525 0.159 0.026 N 182 17 C D DAL 5 ? ? OXT D DAL 5 ? ? 1.391 1.229 0.162 0.019 N 183 17 N G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? 1.604 1.459 0.145 0.020 N 184 17 CA G DAL 4 ? ? CB G DAL 4 ? ? 1.720 1.520 0.200 0.021 N 185 17 CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 1.684 1.525 0.159 0.026 N 186 17 C G DAL 5 ? ? OXT G DAL 5 ? ? 1.391 1.229 0.162 0.019 N 187 17 N H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? 1.604 1.459 0.145 0.020 N 188 17 CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 1.720 1.520 0.200 0.021 N 189 17 CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 1.685 1.525 0.160 0.026 N 190 17 C H DAL 5 ? ? O H DAL 5 ? ? 1.393 1.229 0.164 0.019 N 191 18 CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 1.712 1.520 0.192 0.021 N 192 18 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? 1.602 1.459 0.143 0.020 N 193 18 CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 1.710 1.520 0.190 0.021 N 194 18 CA G DAL 4 ? ? CB G DAL 4 ? ? 1.710 1.520 0.190 0.021 N 195 18 CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 1.711 1.520 0.191 0.021 N 196 19 N C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? 1.583 1.459 0.124 0.020 N 197 19 CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 1.718 1.520 0.198 0.021 N 198 19 CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 1.691 1.525 0.166 0.026 N 199 19 N D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? 1.586 1.459 0.127 0.020 N 200 19 CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 1.716 1.520 0.196 0.021 N 201 19 CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 1.692 1.525 0.167 0.026 N 202 19 N G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? 1.587 1.459 0.128 0.020 N 203 19 CA G DAL 4 ? ? CB G DAL 4 ? ? 1.705 1.520 0.185 0.021 N 204 19 CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 1.688 1.525 0.163 0.026 N 205 19 N H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? 1.585 1.459 0.126 0.020 N 206 19 CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 1.720 1.520 0.200 0.021 N 207 19 CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 1.693 1.525 0.168 0.026 N 208 19 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? 1.621 1.459 0.162 0.020 N 209 20 N C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? 1.582 1.459 0.123 0.020 N 210 20 CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 1.713 1.520 0.193 0.021 N 211 20 CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 1.686 1.525 0.161 0.026 N 212 20 N D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? 1.583 1.459 0.124 0.020 N 213 20 CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 1.713 1.520 0.193 0.021 N 214 20 N G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? 1.583 1.459 0.124 0.020 N 215 20 CA G DAL 4 ? ? CB G DAL 4 ? ? 1.714 1.520 0.194 0.021 N 216 20 N H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? 1.583 1.459 0.124 0.020 N 217 20 CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 1.714 1.520 0.194 0.021 N 218 21 CB C DGL 2 ? ? CG C DGL 2 ? ? 1.636 1.517 0.119 0.019 N 219 21 N C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? 1.580 1.459 0.121 0.020 N 220 21 CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 1.727 1.520 0.207 0.021 N 221 21 CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 1.689 1.525 0.164 0.026 N 222 21 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? 1.583 1.459 0.124 0.020 N 223 21 C C DAL 5 ? ? O C DAL 5 ? ? 1.355 1.229 0.126 0.019 N 224 21 CB D DGL 2 ? ? CG D DGL 2 ? ? 1.641 1.517 0.124 0.019 N 225 21 N D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? 1.592 1.459 0.133 0.020 N 226 21 CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 1.708 1.520 0.188 0.021 N 227 21 CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 1.692 1.525 0.167 0.026 N 228 21 C D DAL 5 ? ? 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CB C DAL 5 ? ? 99.26 110.10 -10.84 1.40 N 106 7 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 96.60 110.40 -13.80 2.00 N 107 7 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 127.56 111.70 15.86 2.30 N 108 7 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 126.93 110.10 16.83 1.50 N 109 7 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 100.79 110.10 -9.31 1.40 N 110 7 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 96.11 110.40 -14.29 2.00 N 111 7 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 127.63 111.70 15.93 2.30 N 112 7 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 126.96 110.10 16.86 1.50 N 113 7 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 100.43 110.10 -9.67 1.40 N 114 7 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 96.18 110.40 -14.22 2.00 N 115 7 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 127.80 111.70 16.10 2.30 N 116 7 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 126.32 110.10 16.22 1.50 N 117 7 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 93.71 110.10 -16.39 1.40 N 118 8 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 127.97 111.70 16.27 2.30 N 119 8 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 127.10 110.10 17.00 1.50 N 120 8 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 96.95 110.10 -13.15 1.40 N 121 8 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 96.26 110.40 -14.14 2.00 N 122 8 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 127.92 111.70 16.22 2.30 N 123 8 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 127.09 110.10 16.99 1.50 N 124 8 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 96.68 110.10 -13.42 1.40 N 125 8 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 96.21 110.40 -14.19 2.00 N 126 8 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 127.89 111.70 16.19 2.30 N 127 8 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 127.17 110.10 17.07 1.50 N 128 8 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 96.81 110.10 -13.29 1.40 N 129 8 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 95.15 110.40 -15.25 2.00 N 130 8 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 127.95 111.70 16.25 2.30 N 131 8 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 126.51 110.10 16.41 1.50 N 132 8 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 96.55 110.10 -13.55 1.40 N 133 8 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? C H DAL 5 ? ? 93.50 111.00 -17.50 2.70 N 134 9 CB C DGL 2 ? ? CA C DGL 2 ? ? C C DGL 2 ? ? 97.39 110.40 -13.01 2.00 N 135 9 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 130.07 111.70 18.37 2.30 N 136 9 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 127.58 110.10 17.48 1.50 N 137 9 N C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 118.64 110.10 8.54 1.40 N 138 9 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 97.13 110.10 -12.97 1.40 N 139 9 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 97.05 110.40 -13.35 2.00 N 140 9 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 130.09 111.70 18.39 2.30 N 141 9 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 127.65 110.10 17.55 1.50 N 142 9 N D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 118.77 110.10 8.67 1.40 N 143 9 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 98.69 110.10 -11.41 1.40 N 144 9 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 97.44 110.40 -12.96 2.00 N 145 9 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 130.05 111.70 18.35 2.30 N 146 9 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 127.60 110.10 17.50 1.50 N 147 9 N G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? CB G DAL 4 ? ? 118.68 110.10 8.58 1.40 N 148 9 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 97.20 110.10 -12.90 1.40 N 149 9 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 97.36 110.40 -13.04 2.00 N 150 9 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 130.11 111.70 18.41 2.30 N 151 9 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 127.57 110.10 17.47 1.50 N 152 9 N H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 118.70 110.10 8.60 1.40 N 153 9 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 97.18 110.10 -12.92 1.40 N 154 10 CB C DGL 2 ? ? CA C DGL 2 ? ? C C DGL 2 ? ? 94.89 110.40 -15.51 2.00 N 155 10 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 126.75 111.70 15.05 2.30 N 156 10 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 126.71 110.10 16.61 1.50 N 157 10 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 96.65 110.10 -13.45 1.40 N 158 10 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? C C DAL 5 ? ? 92.53 111.00 -18.47 2.70 N 159 10 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 96.30 110.40 -14.10 2.00 N 160 10 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 126.64 111.70 14.94 2.30 N 161 10 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 126.74 110.10 16.64 1.50 N 162 10 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 96.93 110.10 -13.17 1.40 N 163 10 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? C D DAL 5 ? ? 91.64 111.00 -19.36 2.70 N 164 10 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 126.65 111.70 14.95 2.30 N 165 10 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 126.78 110.10 16.68 1.50 N 166 10 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 96.97 110.10 -13.13 1.40 N 167 10 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? C G DAL 5 ? ? 91.65 111.00 -19.35 2.70 N 168 10 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 94.86 110.40 -15.54 2.00 N 169 10 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 126.63 111.70 14.93 2.30 N 170 10 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 126.83 110.10 16.73 1.50 N 171 10 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 96.82 110.10 -13.28 1.40 N 172 10 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? C H DAL 5 ? ? 91.38 111.00 -19.62 2.70 N 173 11 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 131.02 111.70 19.32 2.30 N 174 11 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 127.82 110.10 17.72 1.50 N 175 11 N C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 119.22 110.10 9.12 1.40 N 176 11 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 95.63 110.10 -14.47 1.40 N 177 11 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 131.16 111.70 19.46 2.30 N 178 11 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 127.98 110.10 17.88 1.50 N 179 11 N D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 119.09 110.10 8.99 1.40 N 180 11 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 95.87 110.10 -14.23 1.40 N 181 11 CB G DGL 2 ? ? 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C H DAL 4 ? ? 126.90 110.10 16.80 1.50 N 219 13 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 95.96 110.10 -14.14 1.40 N 220 14 CB C DGL 2 ? ? CA C DGL 2 ? ? C C DGL 2 ? ? 97.08 110.40 -13.32 2.00 N 221 14 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 128.68 111.70 16.98 2.30 N 222 14 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 127.15 110.10 17.05 1.50 N 223 14 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 101.20 110.10 -8.90 1.40 N 224 14 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 96.99 110.40 -13.41 2.00 N 225 14 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 128.60 111.70 16.90 2.30 N 226 14 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 127.22 110.10 17.12 1.50 N 227 14 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 101.23 110.10 -8.87 1.40 N 228 14 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 96.00 110.40 -14.40 2.00 N 229 14 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 128.64 111.70 16.94 2.30 N 230 14 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 126.98 110.10 16.88 1.50 N 231 14 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 97.10 110.40 -13.30 2.00 N 232 14 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 128.63 111.70 16.93 2.30 N 233 14 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 127.21 110.10 17.11 1.50 N 234 14 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 101.23 110.10 -8.87 1.40 N 235 15 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 129.81 111.70 18.11 2.30 N 236 15 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 127.88 110.10 17.78 1.50 N 237 15 N C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? CB C DAL 4 ? ? 119.44 110.10 9.34 1.40 N 238 15 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 98.54 110.10 -11.56 1.40 N 239 15 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 129.76 111.70 18.06 2.30 N 240 15 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 127.82 110.10 17.72 1.50 N 241 15 N D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? CB D DAL 4 ? ? 119.43 110.10 9.33 1.40 N 242 15 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 98.55 110.10 -11.55 1.40 N 243 15 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 129.62 111.70 17.92 2.30 N 244 15 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 128.12 110.10 18.02 1.50 N 245 15 N G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? CB G DAL 4 ? ? 119.44 110.10 9.34 1.40 N 246 15 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 129.79 111.70 18.09 2.30 N 247 15 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 127.90 110.10 17.80 1.50 N 248 15 N H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 119.42 110.10 9.32 1.40 N 249 15 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 98.65 110.10 -11.45 1.40 N 250 16 CB C DGL 2 ? ? CA C DGL 2 ? ? C C DGL 2 ? ? 95.79 110.40 -14.61 2.00 N 251 16 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 127.69 111.70 15.99 2.30 N 252 16 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 125.95 110.10 15.85 1.50 N 253 16 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 93.98 110.10 -16.12 1.40 N 254 16 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? C C DAL 5 ? ? 91.72 111.00 -19.28 2.70 N 255 16 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 93.49 110.40 -16.91 2.00 N 256 16 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 127.65 111.70 15.95 2.30 N 257 16 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 126.73 110.10 16.63 1.50 N 258 16 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 95.90 110.10 -14.20 1.40 N 259 16 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? C D DAL 5 ? ? 93.74 111.00 -17.26 2.70 N 260 16 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 97.56 110.40 -12.84 2.00 N 261 16 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 127.70 111.70 16.00 2.30 N 262 16 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 126.66 110.10 16.56 1.50 N 263 16 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 96.02 110.10 -14.08 1.40 N 264 16 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? C G DAL 5 ? ? 93.90 111.00 -17.10 2.70 N 265 16 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 96.72 110.40 -13.68 2.00 N 266 16 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 127.70 111.70 16.00 2.30 N 267 16 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 126.13 110.10 16.03 1.50 N 268 16 N H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? CB H DAL 4 ? ? 118.57 110.10 8.47 1.40 N 269 16 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 94.75 110.10 -15.35 1.40 N 270 16 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? C H DAL 5 ? ? 91.46 111.00 -19.54 2.70 N 271 17 CB C DGL 2 ? ? CA C DGL 2 ? ? C C DGL 2 ? ? 98.29 110.40 -12.11 2.00 N 272 17 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 129.85 111.70 18.15 2.30 N 273 17 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 127.51 110.10 17.41 1.50 N 274 17 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 89.31 110.10 -20.79 1.40 N 275 17 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? C C DAL 5 ? ? 91.97 111.00 -19.03 2.70 N 276 17 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 130.23 111.70 18.53 2.30 N 277 17 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 128.13 110.10 18.03 1.50 N 278 17 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 97.40 110.10 -12.70 1.40 N 279 17 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 97.02 110.40 -13.38 2.00 N 280 17 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 130.25 111.70 18.55 2.30 N 281 17 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 128.13 110.10 18.03 1.50 N 282 17 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 97.34 110.10 -12.76 1.40 N 283 17 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 97.20 110.40 -13.20 2.00 N 284 17 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 130.08 111.70 18.38 2.30 N 285 17 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 128.10 110.10 18.00 1.50 N 286 17 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 97.08 110.10 -13.02 1.40 N 287 18 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? NZ C LYS 3 ? ? 128.20 111.70 16.50 2.30 N 288 18 CB C DAL 4 ? ? CA C DAL 4 ? ? C C DAL 4 ? ? 126.54 110.10 16.44 1.50 N 289 18 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? CB C DAL 5 ? ? 95.58 110.10 -14.52 1.40 N 290 18 N C DAL 5 ? ? CA C DAL 5 ? ? C C DAL 5 ? ? 93.76 111.00 -17.24 2.70 N 291 18 CB D DGL 2 ? ? CA D DGL 2 ? ? C D DGL 2 ? ? 97.11 110.40 -13.29 2.00 N 292 18 CD D LYS 3 ? ? CE D LYS 3 ? ? NZ D LYS 3 ? ? 128.09 111.70 16.39 2.30 N 293 18 CB D DAL 4 ? ? CA D DAL 4 ? ? C D DAL 4 ? ? 127.03 110.10 16.93 1.50 N 294 18 N D DAL 5 ? ? CA D DAL 5 ? ? CB D DAL 5 ? ? 95.34 110.10 -14.76 1.40 N 295 18 CB G DGL 2 ? ? CA G DGL 2 ? ? C G DGL 2 ? ? 97.49 110.40 -12.91 2.00 N 296 18 CD G LYS 3 ? ? CE G LYS 3 ? ? NZ G LYS 3 ? ? 128.20 111.70 16.50 2.30 N 297 18 CB G DAL 4 ? ? CA G DAL 4 ? ? C G DAL 4 ? ? 127.25 110.10 17.15 1.50 N 298 18 N G DAL 5 ? ? CA G DAL 5 ? ? CB G DAL 5 ? ? 95.34 110.10 -14.76 1.40 N 299 18 CB H DGL 2 ? ? CA H DGL 2 ? ? C H DGL 2 ? ? 97.60 110.40 -12.80 2.00 N 300 18 CD H LYS 3 ? ? CE H LYS 3 ? ? NZ H LYS 3 ? ? 128.40 111.70 16.70 2.30 N 301 18 CB H DAL 4 ? ? CA H DAL 4 ? ? C H DAL 4 ? ? 126.98 110.10 16.88 1.50 N 302 18 N H DAL 5 ? ? CA H DAL 5 ? ? CB H DAL 5 ? ? 95.31 110.10 -14.79 1.40 N 303 19 CB C DGL 2 ? ? CA C DGL 2 ? ? C C DGL 2 ? ? 97.07 110.40 -13.33 2.00 N 304 19 CD C LYS 3 ? ? CE C LYS 3 ? ? 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'Glycan component' ? # loop_ _pdbx_molecule.instance_id _pdbx_molecule.prd_id _pdbx_molecule.asym_id 1 PRD_002267 A 2 PRD_002267 B 3 PRD_002267 C 4 PRD_002267 D 5 PRD_002268 E 5 PRD_002268 I 5 PRD_002268 M 5 PRD_002268 N 5 PRD_002268 O 5 PRD_002268 P 5 PRD_002268 Q 6 PRD_002268 F 6 PRD_002268 J 6 PRD_002268 R 6 PRD_002268 S 6 PRD_002268 T 6 PRD_002268 U 6 PRD_002268 V 7 PRD_002268 G 7 PRD_002268 K 7 PRD_002268 W 7 PRD_002268 X 7 PRD_002268 Y 7 PRD_002268 Z 7 PRD_002268 AA 8 PRD_002268 H 8 PRD_002268 L 8 PRD_002268 BA 8 PRD_002268 CA 8 PRD_002268 DA 8 PRD_002268 EA 8 PRD_002268 FA # _pdbx_entry_details.entry_id 6YFY _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details 'Lipid II is a precursor molecule in the synthesis of the cell wall of bacteria' _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 6YFY _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 26 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 26 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'all calculated structures submitted' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 6YFY _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria medoid # _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.contents ;25 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 1.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] D-Arg,Leu10-teixobactin, 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Lipid II, 1.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Leu10-teixobactin, 40mM Phosphate 25mM NaCl ; _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '40mM Phosphate 25mM NaCl' _pdbx_nmr_sample_details.label 13C15N_TeixoLII _pdbx_nmr_sample_details.type liposome _pdbx_nmr_sample_details.details ? # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 'sodium chloride' 25 ? mM none 1 'sodium phosphate' 40 ? mM none 1 D-Arg,Leu10-teixobactin 1.6 ? mM '[U-99% 13C; U-99% 15N]' 1 'Lipid II' 0.8 ? mM '[U-99% 13C; U-99% 15N]' 1 Leu10-teixobactin 1.6 ? mM '[U-99% 13C; U-99% 15N]' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 40 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label 'NMR Buffer' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err 0.2 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err 0.5 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D NH' 1 anisotropic 2 1 1 '2D CC' 1 anisotropic 3 1 1 '2D TOBSY' 1 anisotropic 4 1 1 '3D HNCO' 1 anisotropic 6 1 1 '3D HNCA' 1 anisotropic # _pdbx_nmr_details.entry_id 6YFY _pdbx_nmr_details.text ;All the structures are aligned to chains A,B,E,F of model 5. Residues 1-5 and 9-12 in chains C,D,G,H are highly flexible (no NMR restraints were applied).Alignment was performed in PyMol using the alignto command, and we converted the pdb file to a cif file using the online convertor provided by wwPDB. ; # _pdbx_nmr_refine.entry_id 6YFY _pdbx_nmr_refine.method 'torsion angle dynamics' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 2 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 refinement CNS ? 'Brunger A. T. et.al.' 2 'structure calculation' HADDOCK ? Bonvin 3 'chemical shift assignment' Sparky ? Goddard 4 'peak picking' TopSpin ? 'Bruker Biospin' # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 28J N N N N 1 28J CA C N R 2 28J CB C N S 3 28J CG2 C N N 4 28J CG1 C N N 5 28J CD1 C N N 6 28J C C N N 7 28J O O N N 8 28J H H N N 9 28J HA H N N 10 28J H22 H N N 11 28J H23 H N N 12 28J H24 H N N 13 28J H25 H N N 14 28J H26 H N N 15 28J H27 H N N 16 28J H28 H N N 17 28J H29 H N N 18 28J H30 H N N 19 28J H2 H N N 20 28J OXT O N N 21 28J HXT H N N 22 2PO P P N N 23 2PO O1P O N N 24 2PO O2P O N N 25 2PO O3P O N N 26 2PO HP H N N 27 ALA N N N N 28 ALA CA C N S 29 ALA C C N N 30 ALA O O N N 31 ALA CB C N N 32 ALA OXT O N N 33 ALA H H N N 34 ALA H2 H N N 35 ALA HA H N N 36 ALA HB1 H N N 37 ALA HB2 H N N 38 ALA HB3 H N N 39 ALA HXT H N N 40 DAL N N N N 41 DAL CA C N R 42 DAL CB C N N 43 DAL C C N N 44 DAL O O N N 45 DAL OXT O N N 46 DAL H H N N 47 DAL H2 H N N 48 DAL HA H N N 49 DAL HB1 H N N 50 DAL HB2 H N N 51 DAL HB3 H N N 52 DAL HXT H N N 53 DAR N N N N 54 DAR CA C N R 55 DAR CB C N N 56 DAR CG C N N 57 DAR CD C N N 58 DAR NE N N N 59 DAR CZ C N N 60 DAR NH1 N N N 61 DAR NH2 N N N 62 DAR C C N N 63 DAR O O N N 64 DAR OXT O N N 65 DAR H H N N 66 DAR H2 H N N 67 DAR HA H N N 68 DAR HB2 H N N 69 DAR HB3 H N N 70 DAR HG2 H N N 71 DAR HG3 H N N 72 DAR HD2 H N N 73 DAR HD3 H N N 74 DAR HE H N N 75 DAR HH11 H N N 76 DAR HH12 H N N 77 DAR HH21 H N N 78 DAR HH22 H N N 79 DAR HXT H N N 80 DGL N N N N 81 DGL CA C N R 82 DGL C C N N 83 DGL O O N N 84 DGL CB C N N 85 DGL CG C N N 86 DGL CD C N N 87 DGL OE1 O N N 88 DGL OE2 O N N 89 DGL OXT O N N 90 DGL H H N N 91 DGL H2 H N N 92 DGL HA H N N 93 DGL HB2 H N N 94 DGL HB3 H N N 95 DGL HG2 H N N 96 DGL HG3 H N N 97 DGL HE2 H N N 98 DGL HXT H N N 99 DTH N N N N 100 DTH CA C N R 101 DTH CB C N S 102 DTH CG2 C N N 103 DTH OG1 O N N 104 DTH C C N N 105 DTH O O N N 106 DTH OXT O N N 107 DTH H H N N 108 DTH H2 H N N 109 DTH HA H N N 110 DTH HB H N N 111 DTH HG21 H N N 112 DTH HG22 H N N 113 DTH HG23 H N N 114 DTH HG1 H N N 115 DTH HXT H N N 116 ILE N N N N 117 ILE CA C N S 118 ILE C C N N 119 ILE O O N N 120 ILE CB C N S 121 ILE CG1 C N N 122 ILE CG2 C N N 123 ILE CD1 C N N 124 ILE OXT O N N 125 ILE H H N N 126 ILE H2 H N N 127 ILE HA H N N 128 ILE HB H N N 129 ILE HG12 H N N 130 ILE HG13 H N N 131 ILE HG21 H N N 132 ILE HG22 H N N 133 ILE HG23 H N N 134 ILE HD11 H N N 135 ILE HD12 H N N 136 ILE HD13 H N N 137 ILE HXT H N N 138 LEU N N N N 139 LEU CA C N S 140 LEU C C N N 141 LEU O O N N 142 LEU CB C N N 143 LEU CG C N N 144 LEU CD1 C N N 145 LEU CD2 C N N 146 LEU OXT O N N 147 LEU H H N N 148 LEU H2 H N N 149 LEU HA H N N 150 LEU HB2 H N N 151 LEU HB3 H N N 152 LEU HG H N N 153 LEU HD11 H N N 154 LEU HD12 H N N 155 LEU HD13 H N N 156 LEU HD21 H N N 157 LEU HD22 H N N 158 LEU HD23 H N N 159 LEU HXT H N N 160 LYS N N N N 161 LYS CA C N S 162 LYS C C N N 163 LYS O O N N 164 LYS CB C N N 165 LYS CG C N N 166 LYS CD C N N 167 LYS CE C N N 168 LYS NZ N N N 169 LYS OXT O N N 170 LYS H H N N 171 LYS H2 H N N 172 LYS HA H N N 173 LYS HB2 H N N 174 LYS HB3 H N N 175 LYS HG2 H N N 176 LYS HG3 H N N 177 LYS HD2 H N N 178 LYS HD3 H N N 179 LYS HE2 H N N 180 LYS HE3 H N N 181 LYS HZ1 H N N 182 LYS HZ2 H N N 183 LYS HZ3 H N N 184 LYS HXT H N N 185 MUB C1 C N S 186 MUB C2 C N R 187 MUB C3 C N R 188 MUB C4 C N S 189 MUB C5 C N R 190 MUB C6 C N N 191 MUB C7 C N N 192 MUB C8 C N N 193 MUB C9 C N R 194 MUB C10 C N N 195 MUB C11 C N N 196 MUB O1 O N N 197 MUB O3 O N N 198 MUB O4 O N N 199 MUB O5 O N N 200 MUB O6 O N N 201 MUB O7 O N N 202 MUB O11 O N N 203 MUB O10 O N N 204 MUB N2 N N N 205 MUB H1 H N N 206 MUB H2 H N N 207 MUB HN2 H N N 208 MUB H81 H N N 209 MUB H82 H N N 210 MUB H83 H N N 211 MUB H3 H N N 212 MUB H9 H N N 213 MUB H111 H N N 214 MUB H112 H N N 215 MUB H113 H N N 216 MUB H4 H N N 217 MUB H5 H N N 218 MUB H61 H N N 219 MUB H62 H N N 220 MUB HO6 H N N 221 MUB HO4 H N N 222 MUB HO11 H N N 223 MUB HO1 H N N 224 NAG C1 C N R 225 NAG C2 C N R 226 NAG C3 C N R 227 NAG C4 C N S 228 NAG C5 C N R 229 NAG C6 C N N 230 NAG C7 C N N 231 NAG C8 C N N 232 NAG N2 N N N 233 NAG O1 O N N 234 NAG O3 O N N 235 NAG O4 O N N 236 NAG O5 O N N 237 NAG O6 O N N 238 NAG O7 O N N 239 NAG H1 H N N 240 NAG H2 H N N 241 NAG H3 H N N 242 NAG H4 H N N 243 NAG H5 H N N 244 NAG H61 H N N 245 NAG H62 H N N 246 NAG H81 H N N 247 NAG H82 H N N 248 NAG H83 H N N 249 NAG HN2 H N N 250 NAG HO1 H N N 251 NAG HO3 H N N 252 NAG HO4 H N N 253 NAG HO6 H N N 254 P1W C1 C N N 255 P1W C2 C N N 256 P1W C3 C N N 257 P1W C4 C N N 258 P1W C5 C N N 259 P1W O1 O N N 260 P1W H12 H N N 261 P1W H11 H N N 262 P1W H2 H N N 263 P1W H43 H N N 264 P1W H41 H N N 265 P1W H42 H N N 266 P1W H51 H N N 267 P1W H52 H N N 268 P1W H53 H N N 269 P1W H1 H N N 270 SER N N N N 271 SER CA C N S 272 SER C C N N 273 SER O O N N 274 SER CB C N N 275 SER OG O N N 276 SER OXT O N N 277 SER H H N N 278 SER H2 H N N 279 SER HA H N N 280 SER HB2 H N N 281 SER HB3 H N N 282 SER HG H N N 283 SER HXT H N N 284 ZAE N N N N 285 ZAE CA C N R 286 ZAE C C N N 287 ZAE O O N N 288 ZAE OXT O N N 289 ZAE CB C N N 290 ZAE CG C Y N 291 ZAE CD1 C Y N 292 ZAE CD2 C Y N 293 ZAE CE1 C Y N 294 ZAE CE2 C Y N 295 ZAE CZ C Y N 296 ZAE C10 C N N 297 ZAE H H N N 298 ZAE HA H N N 299 ZAE HXT H N N 300 ZAE HB2 H N N 301 ZAE HB3 H N N 302 ZAE HD1 H N N 303 ZAE HD2 H N N 304 ZAE HE1 H N N 305 ZAE HE2 H N N 306 ZAE HZ H N N 307 ZAE H11 H N N 308 ZAE H12 H N N 309 ZAE H13 H N N 310 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 28J CG2 CB sing N N 1 28J CB CG1 sing N N 2 28J CB CA sing N N 3 28J CG1 CD1 sing N N 4 28J CA N sing N N 5 28J CA C sing N N 6 28J C O doub N N 7 28J N H sing N N 8 28J CA HA sing N N 9 28J CB H22 sing N N 10 28J CG2 H23 sing N N 11 28J CG2 H24 sing N N 12 28J CG2 H25 sing N N 13 28J CG1 H26 sing N N 14 28J CG1 H27 sing N N 15 28J CD1 H28 sing N N 16 28J CD1 H29 sing N N 17 28J CD1 H30 sing N N 18 28J N H2 sing N N 19 28J C OXT sing N N 20 28J OXT HXT sing N N 21 2PO P O1P sing N N 22 2PO P O2P sing N N 23 2PO P O3P doub N N 24 2PO P HP sing N N 25 ALA N CA sing N N 26 ALA N H sing N N 27 ALA N H2 sing N N 28 ALA CA C sing N N 29 ALA CA CB sing N N 30 ALA CA HA sing N N 31 ALA C O doub N N 32 ALA C OXT sing N N 33 ALA CB HB1 sing N N 34 ALA CB HB2 sing N N 35 ALA CB HB3 sing N N 36 ALA OXT HXT sing N N 37 DAL N CA sing N N 38 DAL N H sing N N 39 DAL N H2 sing N N 40 DAL CA CB sing N N 41 DAL CA C sing N N 42 DAL CA HA sing N N 43 DAL CB HB1 sing N N 44 DAL CB HB2 sing N N 45 DAL CB HB3 sing N N 46 DAL C O doub N N 47 DAL C OXT sing N N 48 DAL OXT HXT sing N N 49 DAR N CA sing N N 50 DAR N H sing N N 51 DAR N H2 sing N N 52 DAR CA CB sing N N 53 DAR CA C sing N N 54 DAR CA HA sing N N 55 DAR CB CG sing N N 56 DAR CB HB2 sing N N 57 DAR CB HB3 sing N N 58 DAR CG CD sing N N 59 DAR CG HG2 sing N N 60 DAR CG HG3 sing N N 61 DAR CD NE sing N N 62 DAR CD HD2 sing N N 63 DAR CD HD3 sing N N 64 DAR NE CZ sing N N 65 DAR NE HE sing N N 66 DAR CZ NH1 sing N N 67 DAR CZ NH2 doub N N 68 DAR NH1 HH11 sing N N 69 DAR NH1 HH12 sing N N 70 DAR NH2 HH21 sing N N 71 DAR NH2 HH22 sing N N 72 DAR C O doub N N 73 DAR C OXT sing N N 74 DAR OXT HXT sing N N 75 DGL N CA sing N N 76 DGL N H sing N N 77 DGL N H2 sing N N 78 DGL CA C sing N N 79 DGL CA CB sing N N 80 DGL CA HA sing N N 81 DGL C O doub N N 82 DGL C OXT sing N N 83 DGL CB CG sing N N 84 DGL CB HB2 sing N N 85 DGL CB HB3 sing N N 86 DGL CG CD sing N N 87 DGL CG HG2 sing N N 88 DGL CG HG3 sing N N 89 DGL CD OE1 doub N N 90 DGL CD OE2 sing N N 91 DGL OE2 HE2 sing N N 92 DGL OXT HXT sing N N 93 DTH N CA sing N N 94 DTH N H sing N N 95 DTH N H2 sing N N 96 DTH CA CB sing N N 97 DTH CA C sing N N 98 DTH CA HA sing N N 99 DTH CB CG2 sing N N 100 DTH CB OG1 sing N N 101 DTH CB HB sing N N 102 DTH CG2 HG21 sing N N 103 DTH 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