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'Zhou, D.' 2 ? 'Zhao, Y.' 3 ? 'Fry, E.E.' 4 ? 'Ren, J.' 5 ? 'Stuart, D.I.' 6 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 27 _citation.language ? _citation.page_first 950 _citation.page_last 958 _citation.title 'Structural basis for the neutralization of SARS-CoV-2 by an antibody from a convalescent patient.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-020-0480-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 32737466 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID 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'polypeptide(L)' no no ;EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASAFTFSSYDMHWVRQAPGKGLEWVAVISYDGSNKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLY LQMNSLRAEDTAVYYCAKDGGKLWVYYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTV SWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK ; ;EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASAFTFSSYDMHWVRQAPGKGLEWVAVISYDGSNKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLY LQMNSLRAEDTAVYYCAKDGGKLWVYYFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTV SWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDK ; H,D,G ? 3 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP EDFATYYCQQSYSTLALTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNS QESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP EDFATYYCQQSYSTLALTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNS QESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; L,F,I ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PHE n 1 3 VAL n 1 4 PHE n 1 5 LEU n 1 6 VAL n 1 7 LEU n 1 8 LEU n 1 9 PRO n 1 10 LEU n 1 11 VAL n 1 12 SER n 1 13 SER n 1 14 GLN n 1 15 CYS n 1 16 VAL n 1 17 ASN n 1 18 LEU n 1 19 THR n 1 20 THR n 1 21 ARG n 1 22 THR n 1 23 GLN n 1 24 LEU n 1 25 PRO n 1 26 PRO n 1 27 ALA n 1 28 TYR n 1 29 THR n 1 30 ASN n 1 31 SER n 1 32 PHE n 1 33 THR n 1 34 ARG n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 TYR n 1 38 TYR n 1 39 PRO n 1 40 ASP n 1 41 LYS n 1 42 VAL n 1 43 PHE n 1 44 ARG n 1 45 SER n 1 46 SER n 1 47 VAL n 1 48 LEU n 1 49 HIS n 1 50 SER n 1 51 THR n 1 52 GLN n 1 53 ASP n 1 54 LEU n 1 55 PHE n 1 56 LEU n 1 57 PRO n 1 58 PHE n 1 59 PHE n 1 60 SER n 1 61 ASN n 1 62 VAL n 1 63 THR n 1 64 TRP n 1 65 PHE n 1 66 HIS n 1 67 ALA n 1 68 ILE n 1 69 HIS n 1 70 VAL n 1 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NAG C 1302 ? 1_555 ASN C 234 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 20 NAG O . ? ASN B 801 ? NAG O 1 ? 1_555 ASN B 801 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 21 NAG OA . ? ASN C 282 ? NAG C 1303 ? 1_555 ASN C 282 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 22 NAG P . ? ASN B 1098 ? NAG P 1 ? 1_555 ASN B 1098 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 23 NAG PA . ? ASN C 616 ? NAG C 1306 ? 1_555 ASN C 616 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 24 NAG Q . ? ASN B 1134 ? NAG Q 1 ? 1_555 ASN B 1134 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 25 NAG QA . ? ASN C 657 ? NAG C 1307 ? 1_555 ASN C 657 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 26 NAG R . ? ASN C 331 ? NAG R 1 ? 1_555 ASN C 331 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 27 NAG RA . ? ASN C 709 ? NAG C 1308 ? 1_555 ASN C 709 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 28 NAG S . ? ASN C 717 ? NAG S 1 ? 1_555 ASN C 717 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 29 NAG SA . ? ASN C 1074 ? NAG C 1313 ? 1_555 ASN C 1074 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 30 NAG T . ? ASN C 801 ? NAG T 1 ? 1_555 ASN C 801 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 31 NAG U . ? ASN C 1098 ? NAG U 1 ? 1_555 ASN C 1098 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 32 NAG V . ? ASN C 1134 ? NAG V 1 ? 1_555 ASN C 1134 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 33 NAG W . ? ASN A 61 ? NAG A 1301 ? 1_555 ASN A 61 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 34 NAG X . ? ASN A 234 ? NAG A 1302 ? 1_555 ASN A 234 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 35 NAG Y . ? ASN A 282 ? NAG A 1303 ? 1_555 ASN A 282 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 36 NAG Z . ? ASN A 331 ? NAG A 1304 ? 1_555 ASN A 331 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 37 CYS A 131 ? CYS A 166 ? CYS A 131 ? 1_555 CYS A 166 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 38 CYS A 291 ? CYS A 301 ? CYS A 291 ? 1_555 CYS A 301 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 39 CYS A 336 ? CYS A 361 ? CYS A 336 ? 1_555 CYS A 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 40 CYS A 379 ? CYS A 432 ? CYS A 379 ? 1_555 CYS A 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 41 CYS A 391 ? CYS A 525 ? CYS A 391 ? 1_555 CYS A 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 42 CYS A 480 ? CYS A 488 ? CYS A 480 ? 1_555 CYS A 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 43 CYS A 538 ? CYS A 590 ? CYS A 538 ? 1_555 CYS A 590 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 44 CYS A 617 ? CYS A 649 ? CYS A 617 ? 1_555 CYS A 649 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 45 CYS A 662 ? CYS A 671 ? CYS A 662 ? 1_555 CYS A 671 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 46 CYS A 738 ? CYS A 760 ? CYS A 738 ? 1_555 CYS A 760 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 47 CYS A 743 ? CYS A 749 ? CYS A 743 ? 1_555 CYS A 749 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 48 CYS A 1032 ? CYS A 1043 ? CYS A 1032 ? 1_555 CYS A 1043 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 49 CYS A 1082 ? CYS A 1126 ? CYS A 1082 ? 1_555 CYS A 1126 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 50 CYS B 131 ? CYS B 166 ? CYS B 131 ? 1_555 CYS B 166 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 51 CYS B 291 ? CYS B 301 ? CYS B 291 ? 1_555 CYS B 301 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 52 CYS B 336 ? CYS B 361 ? CYS B 336 ? 1_555 CYS B 361 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 53 CYS B 379 ? CYS B 432 ? CYS B 379 ? 1_555 CYS B 432 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 54 CYS B 391 ? CYS B 525 ? CYS B 391 ? 1_555 CYS B 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 55 CYS B 480 ? CYS B 488 ? CYS B 480 ? 1_555 CYS B 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 56 CYS B 538 ? CYS B 590 ? CYS B 538 ? 1_555 CYS B 590 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 57 CYS B 617 ? CYS B 649 ? 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CYS C 391 ? 1_555 CYS C 525 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 68 CYS C 480 ? CYS C 488 ? CYS C 480 ? 1_555 CYS C 488 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 69 CYS C 538 ? CYS C 590 ? CYS C 538 ? 1_555 CYS C 590 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 70 CYS C 617 ? CYS C 649 ? CYS C 617 ? 1_555 CYS C 649 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 71 CYS C 662 ? CYS C 671 ? CYS C 662 ? 1_555 CYS C 671 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 72 CYS C 738 ? CYS C 760 ? CYS C 738 ? 1_555 CYS C 760 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 73 CYS C 743 ? CYS C 749 ? CYS C 743 ? 1_555 CYS C 749 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 74 CYS C 1032 ? CYS C 1043 ? CYS C 1032 ? 1_555 CYS C 1043 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 75 CYS C 1082 ? CYS C 1126 ? CYS C 1082 ? 1_555 CYS C 1126 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 76 CYS D 22 ? CYS D 96 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 77 CYS D 148 ? CYS D 204 ? CYS H 148 ? 1_555 CYS H 204 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 78 CYS D 224 ? CYS E 215 ? CYS H 224 ? 1_555 CYS L 215 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 79 CYS E 23 ? CYS E 88 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 80 CYS E 135 ? CYS E 195 ? CYS L 135 ? 1_555 CYS L 195 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 81 CYS F 22 ? CYS F 96 ? CYS D 22 ? 1_555 CYS D 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 82 CYS F 148 ? CYS F 204 ? CYS D 148 ? 1_555 CYS D 204 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 83 CYS F 224 ? CYS G 215 ? CYS D 224 ? 1_555 CYS F 215 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 84 CYS G 23 ? CYS G 88 ? CYS F 23 ? 1_555 CYS F 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 85 CYS G 135 ? CYS G 195 ? CYS F 135 ? 1_555 CYS F 195 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 86 CYS H 22 ? CYS H 96 ? CYS G 22 ? 1_555 CYS G 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 87 CYS H 148 ? CYS H 204 ? CYS G 148 ? 1_555 CYS G 204 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 88 CYS H 224 ? CYS I 215 ? CYS G 224 ? 1_555 CYS I 215 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 89 CYS I 23 ? CYS I 88 ? CYS I 23 ? 1_555 CYS I 88 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 90 CYS I 135 ? CYS I 195 ? CYS I 135 ? 1_555 CYS I 195 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 154 D . ? PHE 154 H PRO 155 D ? PRO 155 H 1 -3.81 2 GLU 156 D . ? GLU 156 H PRO 157 D ? PRO 157 H 1 -2.74 3 SER 7 E . ? SER 7 L PRO 8 E ? PRO 8 L 1 -5.72 4 TYR 141 E . ? TYR 141 L PRO 142 E ? PRO 142 L 1 0.00 5 PHE 154 F . ? PHE 154 D PRO 155 F ? PRO 155 D 1 -3.68 6 GLU 156 F . ? GLU 156 D PRO 157 F ? PRO 157 D 1 -3.73 7 SER 7 G . ? SER 7 F PRO 8 G ? PRO 8 F 1 -5.27 8 TYR 141 G . ? TYR 141 F PRO 142 G ? PRO 142 F 1 -0.68 9 PHE 154 H . ? PHE 154 G PRO 155 H ? PRO 155 G 1 -3.55 10 GLU 156 H . ? GLU 156 G PRO 157 H ? PRO 157 G 1 -3.42 11 SER 7 I . ? SER 7 I PRO 8 I ? PRO 8 I 1 -6.28 12 TYR 141 I . ? TYR 141 I PRO 142 I ? PRO 142 I 1 -0.12 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 7 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 8 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 7 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 7 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 6 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 6 ? AF3 ? 4 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 3 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 5 ? AF8 ? 4 ? AF9 ? 4 ? 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AI2 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC1 6 7 ? anti-parallel AC1 7 8 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC6 6 7 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? 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