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'Cambillau, C.' 2 0000-0001-5502-4729 'Goulet, A.' 3 0000-0002-5971-9488 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country CH _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Viruses _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1999-4915 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural Insights into Lactococcal Siphophage p2 Baseplate Activation Mechanism.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.3390/v12080878 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32796652 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Spinelli, S.' 1 ? primary 'Tremblay, D.' 2 ? primary 'Moineau, S.' 3 0000-0002-2832-5101 primary 'Cambillau, C.' 4 0000-0001-5502-4729 primary 'Goulet, A.' 5 0000-0002-5971-9488 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Receptor binding protein' 28668.057 18 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Distal tail protein' 34511.992 12 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Baseplate protein gp16' 42883.266 3 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'RBP,Gene product 18,Gp18' 2 'Dit,Gene product 15,Gp15' 3 'Gene product 16,Gp16,Tail-associated lysine-like protein' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id 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;MVRQYKIHTNLDGTDDKVWDVTNGKVRFYQPSNLGLQSTNNIWQSNGIGVMGTRSITQPQIEFKLETFGESLEENYQLMK DFVNDILSKKFVTLEYQTEIFQVYADLALADVTKTEGYGKNGTFSEKITFDIITKWYTYENLTFDKIQNGKVIAGMSKIY GGTAPGNYKYIKGTSYTYYGESDIDRLSRWDIKEEIFSFMGILYPKLPKTPAGVRFLDDIGNEYTAIVFKTEQVQDYILI NTDVNDETYQGWKGTTALNLFPVMDFERYRTRIIEKGQMELINLSKAEFKIKRKADFV ; S,T,U,V,W,X,2,3,4,5,6,7 ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MLEANVYDNFNPNYYNISDFSMPNGKKEKRGLPIPKARCQVINYELWETGYLYTSSATLTVSVEVGDIVQILFPEVVPIE EALGKKKKLNLDMVYLVTDVDESNKATLKNYFWAMIESLDVPNAITKTTNFAIIDYLIDPNKNNLMSYGYFFNSSIFAGK ATINRKAETSSAHDVAKRIFSKVQFQPTTTIQHAPSETDPRNLLFINFASRNWNRKRITTRVDIKQSVTMDTETIVERSA YNFAVVFVKNKATDDYTDPPKMYIAKNNGDVIDYSTYHGDGTDLPDVRTAKTLFYDRDDHGNPPELSTIKVEISPSTIVT RLIFNQNELLPLYVNDLVDIWYEGKLYSGYIADRVKTEFNDRLIFVESGDKPNVI ; ;MLEANVYDNFNPNYYNISDFSMPNGKKEKRGLPIPKARCQVINYELWETGYLYTSSATLTVSVEVGDIVQILFPEVVPIE EALGKKKKLNLDMVYLVTDVDESNKATLKNYFWAMIESLDVPNAITKTTNFAIIDYLIDPNKNNLMSYGYFFNSSIFAGK ATINRKAETSSAHDVAKRIFSKVQFQPTTTIQHAPSETDPRNLLFINFASRNWNRKRITTRVDIKQSVTMDTETIVERSA YNFAVVFVKNKATDDYTDPPKMYIAKNNGDVIDYSTYHGDGTDLPDVRTAKTLFYDRDDHGNPPELSTIKVEISPSTIVT RLIFNQNELLPLYVNDLVDIWYEGKLYSGYIADRVKTEFNDRLIFVESGDKPNVI ; Y,Z,1 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 ILE n 1 4 LYS n 1 5 ASN n 1 6 PHE n 1 7 THR n 1 8 PHE n 1 9 PHE n 1 10 SER n 1 11 PRO n 1 12 ASN n 1 13 SER n 1 14 THR n 1 15 GLU n 1 16 PHE n 1 17 PRO n 1 18 VAL n 1 19 GLY n 1 20 SER n 1 21 ASN n 1 22 ASN n 1 23 ASP n 1 24 GLY n 1 25 LYS n 1 26 LEU n 1 27 TYR n 1 28 MET n 1 29 MET n 1 30 LEU n 1 31 THR n 1 32 GLY n 1 33 MET n 1 34 ASP n 1 35 TYR n 1 36 ARG n 1 37 THR n 1 38 ILE n 1 39 ARG n 1 40 ARG n 1 41 LYS n 1 42 ASP n 1 43 TRP n 1 44 SER n 1 45 SER n 1 46 PRO n 1 47 LEU n 1 48 ASN n 1 49 THR n 1 50 ALA n 1 51 LEU n 1 52 ASN n 1 53 VAL n 1 54 GLN n 1 55 TYR n 1 56 THR n 1 57 ASN n 1 58 THR n 1 59 SER n 1 60 ILE n 1 61 ILE n 1 62 ALA n 1 63 GLY n 1 64 GLY n 1 65 ARG n 1 66 TYR n 1 67 PHE n 1 68 GLU n 1 69 LEU n 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_exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ZIG _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6ZIG _struct.title 'Topological model of the p2 virion baseplate in activated conformation (closed Tal trimer)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZIG _struct_keywords.text 'lactococcal siphophage p2, baseplate, receptor-binding protein, Distal Tail protein, Tail-associated lysin, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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D3WAD3 1 ? 298 ? 1 298 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 33-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 33 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _em_3d_fitting.entry_id 6ZIG _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code 1 1 ? ? ? 2X53 1 ? ? 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