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19 ? 1 20 UNP W5PZE3_SHEEP W5PZE3 ? 20 ;MSGYTPDEKLRLQQLRELRRRWLKDQELSPREPVLPPRRVSPVERFWNKFLQDGALWKNVIYKTYRHSIFAFTHVLIPVW IIHYYLKYHVTTKPYTIVEKKPRIFPGDTILETGEVIPPMKEFPDQHH ; 1 21 UNP W5P5V3_SHEEP W5P5V3 ? 21 ;MGAHLARRYLGDASVEPEPLRMPTFPPDYGFPERKEREMVATQQEMNDAQLVLQQRDYCAHYLIRFLKCKRDSFPNFLAC KHEQHDWDYCEHLDYVKRMKEFERERRLLQRKKRREQREADMAKGLGPGEVAPEVAL ; 1 22 UNP W5PGA3_SHEEP W5PGA3 ? 22 ;MAFLPSAAYLTHQQKVLQLYKRALRHLESRCVHRDKYRYFACLLRARFDEHKNEKDMVKATQLLREAEKEFWHGQHPQPY IFPESPGGTSYERYECYKVPEWCLDDWHPSEKAMYPDYFAKREQWKKLRRESWEREVKQLQEETPVGGPRTEALPPARKQ GDLPPLWWHIVTRPRERPM ; 1 23 UNP W5PVD7_SHEEP W5PVD7 ? 23 ;MAGMSALKRLAPFAHVGGHLFRGRCARAVGAGGVRRAGGGAHIEPRYRQFPQLTRSQVIQAEFFSATMWFWILWRFWHDS DAVLGHFPYPDPSQWTDEELGIPPDDED ; 1 24 UNP W5Q1B0_SHEEP W5Q1B0 ? 24 ;MAAARAGVLGIRWLQKAARNVVPLGARTASHITKDMLPGPYPKTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPKLPD RSQQERDPWYDWDHPDLRLNWGEPMHWDLDMYIRNRVDTSPTPVNWNLMCKHLFGFVAFMLFMFWVGETYPTYQPVGPKQ YPYNNLYLERGGDPNKEPEPVVHYEI ; 1 25 UNP W5PWF1_SHEEP W5PWF1 ? 25 ;MAAGMLGLCGRRLLAVAATRGLPAASVRWESSSSRAVIAPSTLAGKRPSEPTLRWQEDPEPEDENLYEKNPDSHGYDKDP AVDVWNMRVVFFFGFSIVLVLGSTFVAYLPDYRMQEWARREAERLVKYREAHGLPLMESNCFDPSKIQLPEDED ; 1 26 PDB 6ZKA 6ZKA ? 26 ? 1 27 PDB 6ZKA 6ZKA ? 27 ? 1 28 PDB 6ZKA 6ZKA ? 28 ? 1 29 PDB 6ZKA 6ZKA ? 29 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6ZKA A 1 ? 115 ? O78753 1 ? 115 ? 1 115 2 2 6ZKA H 1 ? 318 ? O78747 1 ? 318 ? 1 318 3 3 6ZKA J 1 ? 175 ? O78757 1 ? 175 ? 1 175 4 4 6ZKA K 1 ? 98 ? O78754 1 ? 98 ? 1 98 5 5 6ZKA L 1 ? 606 ? O78756 1 ? 606 ? 1 606 6 6 6ZKA M 1 ? 459 ? O78755 1 ? 459 ? 1 459 7 7 6ZKA N 1 ? 347 ? O78748 1 ? 347 ? 1 347 8 8 6ZKA V 1 ? 141 ? W5PAR2 1 ? 141 ? 0 140 9 9 6ZKA W 1 ? 189 ? W5QHN8 1 ? 189 ? -45 143 10 10 6ZKA X 1 ? 157 ? W5NQT7 1 ? 157 ? -68 88 11 11 6ZKA Y 1 ? 172 ? W5PYA5 1 ? 172 ? 0 171 12 12 6ZKA Z 1 ? 175 ? 6ZKA 1 ? 175 ? 1 175 13 13 6ZKA k 1 ? 355 ? W5QBF5 1 ? 355 ? -34 320 14 14 6ZKA l 1 ? 106 ? W5QFF9 1 ? 106 ? 0 105 15 15 6ZKA m 1 ? 84 ? W5NYM7 1 ? 84 ? 0 83 16 16 6ZKA n 1 ? 98 ? W5Q5T4 1 ? 98 ? 0 97 17 17 6ZKA o 1 ? 122 ? W5P9Q8 1 ? 122 ? -1 120 18 18 6ZKA p 1 ? 130 ? W5QF73 1 ? 130 ? -1 128 19 19 6ZKA q 1 ? 144 ? 6ZKA 0 ? 143 ? 0 143 20 20 6ZKA r 1 ? 128 ? W5PZE3 1 ? 128 ? 0 127 21 21 6ZKA s 1 ? 137 ? W5P5V3 1 ? 137 ? 0 136 22 22 6ZKA t 1 ? 179 ? W5PGA3 1 ? 179 ? 0 178 23 23 6ZKA u 1 ? 108 ? 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CARDIOLIPIN ;DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL; BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL ; 'C81 H156 O17 P2 -2' 1464.043 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DCQ non-polymer . 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione decylubiquinone 'C19 H30 O4' 322.439 FME 'L-peptide linking' n N-FORMYLMETHIONINE ? 'C6 H11 N O3 S' 177.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MYR non-polymer . 'MYRISTIC ACID' ? 'C14 H28 O2' 228.371 PC1 non-polymer . 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE 3-SN-PHOSPHATIDYLCHOLINE 'C44 H88 N O8 P' 790.145 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SEP 'L-peptide linking' n PHOSPHOSERINE PHOSPHONOSERINE 'C3 H8 N O6 P' 185.072 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZMP non-polymer . 'S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate' ? 'C25 H49 N2 O8 P S' 568.704 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ZKA _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 6ZKA _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 40538 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.996 ? 54705 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.405 ? 24584 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.062 ? 5922 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 6678 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6ZKA _struct.title 'Membrane domain of open complex I during turnover' _struct.pdbx_descriptor ;NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 (E.C.7.1.1.2), NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (E.C.7.1.1.2), NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 (E.C.7.1.1.2), NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L (E.C.7.1.1.2), NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (E.C.7.1.1.2), NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (E.C.7.1.1.2), NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 (E.C.7.1.1.2), Uncharacterized protein, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B5, Acyl carrier protein, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, Mitochondrial complex I, PDSW subunit, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S5, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A3, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4, Mitochondrial complex I, B16.6 subunit, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B7, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9, NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, Mitochondrial complex I, KFYI subunit, Mitochondrial complex I, MNLL subunit, Mitochondrial complex I, MWFE subunit, Mitochondrial complex I, ND4L subunit ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZKA _struct_keywords.text 'complex, respiration, NADH, proton pump, mitochondria, iron-sulphur cluster, oxidoreductase, membrane protein, ELECTRON TRANSPORT' _struct_keywords.pdbx_keywords 'ELECTRON TRANSPORT' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? EA N N 31 ? FA N N 32 ? GA N N 30 ? HA N N 32 ? IA N N 32 ? JA N N 32 ? KA N N 30 ? LA N N 33 ? MA N N 32 ? NA N N 32 ? OA N N 30 ? PA N N 33 ? QA N N 32 ? RA N N 32 ? SA N N 32 ? TA N N 33 ? UA N N 33 ? VA N N 33 ? WA N N 34 ? XA N N 33 ? YA N N 35 ? ZA N N 32 ? AB N N 32 ? BB N N 33 ? CB N N 32 ? DB N N 36 ? EB N N 30 ? FB N N 37 ? GB N N 37 ? HB N N 37 ? IB N N 37 ? JB N N 37 ? KB N N 37 ? LB N N 37 ? MB N N 37 ? NB N N 37 ? OB N N 37 ? PB N N 37 ? QB N N 37 ? RB N N 37 ? SB N N 37 ? TB N N 37 ? UB N N 37 ? VB N N 37 ? WB N N 37 ? XB N N 37 ? YB N N 37 ? ZB N N 37 ? AC N N 37 ? BC N N 37 ? CC N N 37 ? DC N N 37 ? EC N N 37 ? FC N N 37 ? GC N N 37 ? 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SER q 30 MET q 97 1 ? 68 HELX_P HELX_P176 AT5 MET S 120 ? GLY S 126 ? MET q 119 GLY q 125 1 ? 7 HELX_P HELX_P177 AT6 THR S 129 ? TYR S 143 ? THR q 128 TYR q 142 1 ? 15 HELX_P HELX_P178 AT7 THR T 5 ? ASP T 25 ? THR r 4 ASP r 24 1 ? 21 HELX_P HELX_P179 AT8 SER T 68 ? HIS T 74 ? SER r 67 HIS r 73 1 ? 7 HELX_P HELX_P180 AT9 VAL T 75 ? HIS T 89 ? VAL r 74 HIS r 88 1 ? 15 HELX_P HELX_P181 AU1 ALA U 3 ? LEU U 10 ? ALA s 2 LEU s 9 1 ? 8 HELX_P HELX_P182 AU2 THR U 42 ? ALA U 49 ? THR s 41 ALA s 48 1 ? 8 HELX_P HELX_P183 AU3 CYS U 59 ? SER U 73 ? CYS s 58 SER s 72 1 ? 15 HELX_P HELX_P184 AU4 CYS U 80 ? ALA U 123 ? CYS s 79 ALA s 122 1 ? 44 HELX_P HELX_P185 AU5 THR V 11 ? CYS V 31 ? THR t 10 CYS t 30 1 ? 21 HELX_P HELX_P186 AU6 HIS V 33 ? HIS V 51 ? HIS t 32 HIS t 50 1 ? 19 HELX_P HELX_P187 AU7 ASP V 56 ? GLN V 75 ? ASP t 55 GLN t 74 1 ? 20 HELX_P HELX_P188 AU8 GLU V 92 ? LYS V 98 ? GLU t 91 LYS t 97 5 ? 7 HELX_P HELX_P189 AU9 PRO V 100 ? TRP V 107 ? 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C1 ? ? s GLY 1 s MYR 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 MET 91 B . ? MET 91 H PRO 92 B ? PRO 92 H 1 -9.05 2 ALA 196 B . ? ALA 196 H PRO 197 B ? PRO 197 H 1 10.47 3 MET 207 F . ? MET 207 M PRO 208 F ? PRO 208 M 1 -1.08 4 ASN 251 F . ? ASN 251 M PRO 252 F ? PRO 252 M 1 -1.59 5 PRO 370 F . ? PRO 370 M PRO 371 F ? PRO 371 M 1 -3.91 6 ALA 109 G . ? ALA 109 N PRO 110 G ? PRO 110 N 1 8.87 7 PRO 255 G . ? PRO 255 N PRO 256 G ? PRO 256 N 1 10.87 8 GLU 32 T . ? GLU 31 r PRO 33 T ? PRO 32 r 1 0.62 9 MET 22 U . ? MET 21 s PRO 23 U ? PRO 22 s 1 3.21 10 PHE 74 U . ? PHE 73 s PRO 75 U ? PRO 74 s 1 2.17 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU C 112 ? 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GLU k 219 TYR k 223 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL C 113 ? 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