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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ZM1 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6ZM1 _struct.title 'Open-closed state of the Bt1762-Bt1763 levan transport system' _struct.pdbx_descriptor 'SusD homolog, SusC homolog' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZM1 _struct_keywords.text 'Levan, transporter, SusCD, TonB-dependent, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 CYS A 19 ? LEU A 23 ? CYS A 1 LEU A 5 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 35 ? SER A 39 ? ASP A 17 SER A 21 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 45 ? ALA A 52 ? ASN A 27 ALA A 34 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 87 ? SER A 95 ? GLY A 69 SER A 77 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 102 ? LEU A 126 ? ASP A 84 LEU A 108 1 ? 25 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 127 ? MET A 129 ? 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ARG B 910 ALA B 914 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 SER B 964 ? VAL B 968 ? SER B 939 VAL B 943 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO B 986 ? LYS B 992 ? PRO B 961 LYS B 967 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP C 35 ? GLU C 41 ? ASP C 17 GLU C 23 5 ? 7 HELX_P HELX_P38 AE2 TYR C 42 ? GLY C 57 ? TYR C 24 GLY C 39 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 AE3 LEU C 66 ? VAL C 71 ? LEU C 48 VAL C 53 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY C 86 ? SER C 95 ? GLY C 68 SER C 77 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP C 102 ? GLN C 128 ? ASP C 84 GLN C 110 1 ? 27 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP C 130 ? TYR C 134 ? ASP C 112 TYR C 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 LEU C 136 ? LYS C 160 ? LEU C 118 LYS C 142 1 ? 25 HELX_P HELX_P44 AE8 PRO C 172 ? LEU C 178 ? PRO C 154 LEU C 160 5 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 THR C 184 ? LEU C 203 ? THR C 166 LEU C 185 1 ? 20 HELX_P HELX_P46 AF1 ALA C 214 ? TYR C 231 ? ALA C 196 TYR C 213 1 ? 18 HELX_P HELX_P47 AF2 ASN C 244 ? TYR C 254 ? ASN C 226 TYR C 236 1 ? 11 HELX_P HELX_P48 AF3 ASP C 256 ? LYS C 262 ? ASP C 238 LYS C 244 1 ? 7 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP C 270 ? GLU C 280 ? ASP C 252 GLU C 262 5 ? 11 HELX_P HELX_P50 AF5 ASN C 303 ? GLY C 307 ? ASN C 285 GLY C 289 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 PRO C 311 ? GLY C 315 ? PRO C 293 GLY C 297 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 SER C 323 ? PHE C 330 ? SER C 305 PHE C 312 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 AF8 ARG C 358 ? THR C 362 ? ARG C 340 THR C 344 1 ? 5 HELX_P HELX_P54 AF9 TYR C 425 ? LEU C 439 ? TYR C 407 LEU C 421 1 ? 15 HELX_P HELX_P55 AG1 ARG C 443 ? GLY C 460 ? ARG C 425 GLY C 442 1 ? 18 HELX_P HELX_P56 AG2 ALA C 487 ? PHE C 503 ? ALA C 469 PHE C 485 1 ? 17 HELX_P HELX_P57 AG3 SER C 508 ? GLY C 517 ? SER C 490 GLY C 499 1 ? 10 HELX_P HELX_P58 AG4 GLU C 518 ? SER C 532 ? GLU C 500 SER C 514 1 ? 15 HELX_P HELX_P59 AG5 CYS C 534 ? ALA C 540 ? CYS C 516 ALA C 522 5 ? 7 HELX_P HELX_P60 AG6 PRO C 553 ? ASN C 561 ? PRO C 535 ASN C 543 1 ? 9 HELX_P HELX_P61 AG7 ASN D 258 ? ASP D 273 ? ASN D 233 ASP D 248 1 ? 16 HELX_P HELX_P62 AG8 ASN D 276 ? ASN D 280 ? 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LYS D 967 ARG D 969 5 ? 3 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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C CYS 387 C CYS 389 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 CYS 316 A . ? CYS 298 A CYS 317 A ? CYS 299 A 1 22.72 2 CYS 316 C . ? CYS 298 C CYS 317 C ? CYS 299 C 1 5.38 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 2 ? C ? 5 ? D ? 2 ? E ? 20 ? F ? 2 ? G ? 4 ? H ? 6 ? I ? 2 ? J ? 2 ? K ? 3 ? L ? 2 ? M ? 2 ? N ? 2 ? O ? 2 ? P ? 23 ? Q ? 2 ? R ? 2 ? S ? 2 ? T ? 2 ? U ? 2 ? V ? 2 ? W ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? parallel C 4 5 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel E 5 6 ? anti-parallel E 6 7 ? anti-parallel E 7 8 ? anti-parallel E 8 9 ? anti-parallel E 9 10 ? anti-parallel E 10 11 ? anti-parallel E 11 12 ? anti-parallel E 12 13 ? anti-parallel E 13 14 ? anti-parallel E 14 15 ? anti-parallel E 15 16 ? anti-parallel E 16 17 ? anti-parallel E 17 18 ? anti-parallel E 18 19 ? anti-parallel E 19 20 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel P 4 5 ? anti-parallel P 5 6 ? anti-parallel P 6 7 ? anti-parallel P 7 8 ? anti-parallel P 8 9 ? anti-parallel P 9 10 ? anti-parallel P 10 11 ? anti-parallel P 11 12 ? anti-parallel P 12 13 ? anti-parallel P 13 14 ? anti-parallel P 14 15 ? anti-parallel P 15 16 ? anti-parallel P 16 17 ? anti-parallel P 17 18 ? anti-parallel P 18 19 ? anti-parallel P 19 20 ? anti-parallel P 20 21 ? anti-parallel P 21 22 ? anti-parallel P 22 23 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 TRP A 287 ? 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'Bacteroides thetaiotaomicron (strain ATCC 29148 / DSM 2079 / NCTC 10582 / E50 / VPI-5482)' ? ? # _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 2 _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 818 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Bacteroides thetaiotaomicron' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 63.84 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 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