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'Barnett, J.T.' 1 ? primary 'Kuper, J.' 2 ? primary 'Koelmel, W.' 3 ? primary 'Kisker, C.' 4 ? primary 'Kad, N.M.' 5 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7AD8 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7AD8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 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'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 1 1 sample 1 49 'Homo sapiens' ? 9606 ? 2 1 sample 1 49 'Homo sapiens' ? 9606 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7AD8 7AD8 ? 1 ? 1 2 PDB 7AD8 7AD8 ? 2 ? 1 3 UNP ERCC3_HUMAN P19447 ? 3 ;MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAP DGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCT VSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTAESSGGPSTSRVTDPQG KSDIPMDLFDFYEQMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQ EKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKP IGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDL NFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIV FADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRL GRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAAT DLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHVHPLFKRFRK ; 1 4 UNP TF2H5_HUMAN Q6ZYL4 ? 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7 ;MDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVVDGSRTMEDQDLKPNR LTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLSIAMQTLKHMP GHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLIKTLKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTVLARETGGTYHVILDESHYKELLTHHVSPPP ASSSSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDGNTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLAR SYHHLFPLDAFQEIPLEEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCAVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGV ; 1 8 UNP TF2H4_HUMAN Q92759 ? 8 ;MESTPSRGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFS KAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVL HFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSTEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQL SFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTVHQPGFIVVETNYRLYAYTE SELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDR LRFTEGVLYNQFLSQVDFELLLAHARELGVLVFENSAKRLMVVTPAGHSDVKRFWKRQKHSS ; 1 9 UNP XPA_HUMAN P23025 ? 9 ;MAAADGALPEAAALEQPAELPASVRASIERKRQRALMLRQARLAARPYSATAAAATGGMANVKAAPKIIDTGGGFILEEE EEEEQKIGKVVHQPGPVMEFDYVICEECGKEFMDSYLMNHFDLPTCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCDLEKREP PLKFIVKKNPHHSQWGDMKLYLKLQIVKRSLEVWGSQEALEEAKEVRQENREKMKQKKFDKKVKELRRAVRSSVWKRETI VHQHEYGPEENLEDDMYRKTCTMCGHELTYEKM ; 1 10 UNP TF2H1_HUMAN P32780 ? 10 ;MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFS NESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSTSNH KQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTSDIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSK DLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSASNSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLR KQEAQNEQTSEPSNMDGNSGDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSVKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDI INSFQSIRQEMEAYTPKLTQVLSSSAASSTITALSPGGALMQGGTQQAINQMVPNDIQSELKHLYVAVGELLRHFWSCFP VNTPFLEEKVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRLMKKT ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7AD8 J 1 ? 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P19447 1 ? 782 ? 1 782 4 4 7AD8 F 1 ? 71 ? Q6ZYL4 1 ? 71 ? 1 71 5 5 7AD8 B 1 ? 760 ? P18074 1 ? 760 ? 1 760 6 6 7AD8 E 1 ? 308 ? Q13889 1 ? 308 ? 1 308 7 7 7AD8 D 1 ? 395 ? Q13888 1 ? 395 ? 1 395 8 8 7AD8 C 1 ? 462 ? Q92759 1 ? 462 ? 1 462 9 9 7AD8 G 1 ? 273 ? P23025 1 ? 273 ? 1 273 10 10 7AD8 I 1 ? 548 ? P32780 1 ? 548 ? 1 548 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7AD8 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7AD8 _struct.title 'Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7AD8 _struct_keywords.text 'DNA repair, transcription factor, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 12 ? N N N 12 ? O N N 12 ? P N N 12 ? Q N N 12 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TYR C 93 ? VAL C 101 ? TYR A 93 VAL A 101 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 THR C 119 ? VAL C 129 ? THR A 119 VAL A 129 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN C 132 ? LEU C 140 ? GLN A 132 LEU A 140 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 ILE C 152 ? CYS C 159 ? ILE A 152 CYS A 159 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 HIS C 181 ? LEU C 189 ? 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ASN A 537 ARG A 553 1 ? 17 HELX_P HELX_P20 AC2 VAL C 565 ? ILE C 573 ? VAL A 565 ILE A 573 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN C 586 ? PHE C 596 ? GLN A 586 PHE A 596 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG C 634 ? GLN C 638 ? ARG A 634 GLN A 638 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ARG C 639 ? VAL C 643 ? ARG A 639 VAL A 643 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 GLN C 668 ? GLN C 677 ? GLN A 668 GLN A 677 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 AC7 PHE C 679 ? GLY C 684 ? PHE A 679 GLY A 684 5 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 LYS C 706 ? LEU C 717 ? LYS A 706 LEU A 717 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 ASP D 13 ? LEU D 23 ? ASP F 13 LEU F 23 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 LEU D 49 ? ASP D 62 ? LEU F 49 ASP F 62 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 TYR E 18 ? ASP E 33 ? TYR B 18 ASP B 33 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY E 47 ? TYR E 63 ? GLY B 47 TYR B 63 1 ? 17 HELX_P HELX_P31 AD4 THR E 76 ? GLY E 99 ? THR B 76 GLY B 99 1 ? 24 HELX_P HELX_P32 AD5 PHE E 126 ? ALA E 139 ? PHE B 126 ALA B 139 1 ? 14 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA E 144 ? HIS E 148 ? ALA B 144 HIS B 148 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 CYS E 155 ? GLY E 165 ? CYS B 155 GLY B 165 1 ? 11 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN E 176 ? GLY E 188 ? ASN B 176 GLY B 188 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 CYS E 190 ? SER E 198 ? CYS B 190 SER B 198 1 ? 9 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP E 214 ? SER E 222 ? ASP B 214 SER B 222 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 ASN E 238 ? SER E 246 ? ASN B 238 SER B 246 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG E 253 ? LEU E 271 ? ARG B 253 LEU B 271 1 ? 19 HELX_P HELX_P40 AE4 GLU E 327 ? ARG E 345 ? GLU B 327 ARG B 345 1 ? 19 HELX_P HELX_P41 AE5 ALA E 356 ? LEU E 361 ? ALA B 356 LEU B 361 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 PHE E 374 ? GLU E 387 ? PHE B 374 GLU B 387 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 AE7 PHE E 394 ? THR E 405 ? PHE B 394 THR B 405 1 ? 12 HELX_P HELX_P44 AE8 PRO E 446 ? PHE E 451 ? PRO B 446 PHE B 451 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 ILE E 466 ? LEU E 471 ? ILE B 466 LEU B 471 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 ASP E 513 ? SER E 528 ? ASP B 513 SER B 528 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 AF2 SER E 541 ? GLU E 554 ? 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SER E 170 LEU E 172 5 ? 3 HELX_P HELX_P62 AG8 GLN F 173 ? MET F 178 ? GLN E 173 MET E 178 1 ? 6 HELX_P HELX_P63 AG9 MET F 178 ? LYS F 186 ? MET E 178 LYS E 186 1 ? 9 HELX_P HELX_P64 AH1 SER F 200 ? THR F 210 ? SER E 200 THR E 210 1 ? 11 HELX_P HELX_P65 AH2 SER F 222 ? PHE F 231 ? SER E 222 PHE E 231 1 ? 10 HELX_P HELX_P66 AH3 ASP F 234 ? SER F 239 ? ASP E 234 SER E 239 1 ? 6 HELX_P HELX_P67 AH4 SER G 68 ? ASP G 73 ? SER D 68 ASP D 73 5 ? 6 HELX_P HELX_P68 AH5 ASN G 79 ? PHE G 96 ? ASN D 79 PHE D 96 1 ? 18 HELX_P HELX_P69 AH6 HIS G 127 ? LYS G 132 ? HIS D 127 LYS D 132 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 AH7 LYS G 133 ? MET G 137 ? LYS D 133 MET D 137 5 ? 5 HELX_P HELX_P71 AH8 ASN G 147 ? THR G 155 ? ASN D 147 THR D 155 1 ? 9 HELX_P HELX_P72 AH9 ASP G 184 ? ALA G 192 ? ASP D 184 ALA D 192 1 ? 9 HELX_P HELX_P73 AI1 ARG G 206 ? GLY G 216 ? ARG D 206 GLY D 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P74 AI2 ASP G 224 ? THR G 233 ? ASP D 224 THR D 233 1 ? 10 HELX_P HELX_P75 AI3 SER G 314 ? ARG G 320 ? SER D 314 ARG D 320 1 ? 7 HELX_P HELX_P76 AI4 CYS G 368 ? SER G 378 ? CYS D 368 SER D 378 1 ? 11 HELX_P HELX_P77 AI5 LEU H 19 ? GLY H 25 ? LEU C 19 GLY C 25 1 ? 7 HELX_P HELX_P78 AI6 SER H 27 ? TYR H 35 ? SER C 27 TYR C 35 1 ? 9 HELX_P HELX_P79 AI7 ALA H 39 ? GLU H 47 ? ALA C 39 GLU C 47 1 ? 9 HELX_P HELX_P80 AI8 LEU H 51 ? MET H 59 ? LEU C 51 MET C 59 1 ? 9 HELX_P HELX_P81 AI9 SER H 80 ? LEU H 93 ? SER C 80 LEU C 93 1 ? 14 HELX_P HELX_P82 AJ1 ASN H 111 ? LEU H 122 ? ASN C 111 LEU C 122 1 ? 12 HELX_P HELX_P83 AJ2 PRO H 146 ? HIS H 161 ? PRO C 146 HIS C 161 1 ? 16 HELX_P HELX_P84 AJ3 PHE H 162 ? VAL H 164 ? PHE C 162 VAL C 164 5 ? 3 HELX_P HELX_P85 AJ4 SER H 172 ? GLY H 183 ? SER C 172 GLY C 183 1 ? 12 HELX_P HELX_P86 AJ5 THR H 197 ? LEU H 205 ? THR C 197 LEU C 205 1 ? 9 HELX_P HELX_P87 AJ6 PRO H 209 ? GLY H 227 ? PRO C 209 GLY C 227 1 ? 19 HELX_P HELX_P88 AJ7 ASP H 229 ? SER H 241 ? ASP C 229 SER C 241 1 ? 13 HELX_P HELX_P89 AJ8 ASP H 256 ? GLY H 269 ? ASP C 256 GLY C 269 1 ? 14 HELX_P HELX_P90 AJ9 THR H 284 ? ASN H 289 ? THR C 284 ASN C 289 5 ? 6 HELX_P HELX_P91 AK1 SER H 321 ? ALA H 329 ? SER C 321 ALA C 329 1 ? 9 HELX_P HELX_P92 AK2 THR H 347 ? ALA H 356 ? THR C 347 ALA C 356 1 ? 10 HELX_P HELX_P93 AK3 ALA H 361 ? ARG H 371 ? ALA C 361 ARG C 371 1 ? 11 HELX_P HELX_P94 AK4 PRO H 384 ? ARG H 400 ? PRO C 384 ARG C 400 1 ? 17 HELX_P HELX_P95 AK5 VAL H 416 ? LEU H 421 ? VAL C 416 LEU C 421 1 ? 6 HELX_P HELX_P96 AK6 LEU H 422 ? GLY H 429 ? LEU C 422 GLY C 429 5 ? 8 HELX_P HELX_P97 AK7 THR H 444 ? HIS H 448 ? THR C 444 HIS C 448 5 ? 5 HELX_P HELX_P98 AK8 ASP H 450 ? ARG H 457 ? ASP C 450 ARG C 457 1 ? 8 HELX_P HELX_P99 AK9 THR I 142 ? GLU I 147 ? THR G 142 GLU G 147 1 ? 6 HELX_P HELX_P100 AL1 LYS I 183 ? TRP I 194 ? LYS G 183 TRP G 194 1 ? 12 HELX_P HELX_P101 AL2 SER I 196 ? GLU I 198 ? SER G 196 GLU G 198 5 ? 3 HELX_P HELX_P102 AL3 ALA I 199 ? ARG I 227 ? ALA G 199 ARG G 227 1 ? 29 HELX_P HELX_P103 AL4 ARG I 227 ? LYS I 236 ? 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VAL I 522 LYS I 547 1 ? 26 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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ZN ? ? D CYS 345 D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? ? metalc11 metalc ? ? G CYS 348 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? D CYS 348 D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? ? metalc12 metalc ? ? G CYS 360 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? D CYS 360 D ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? ? metalc13 metalc ? ? G CYS 363 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? D CYS 363 D ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? ? metalc14 metalc ? ? G CYS 368 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? D CYS 368 D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? ? metalc15 metalc ? ? G CYS 371 SG ? ? ? 1_555 O ZN . ZN ? ? D CYS 371 D ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? ? metalc16 metalc ? ? G CYS 382 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? D CYS 382 D ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? ? metalc17 metalc ? ? G CYS 385 SG ? ? ? 1_555 P ZN . ZN ? ? D CYS 385 D ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? ? metalc18 metalc ? ? I CYS 105 SG ? ? ? 1_555 Q ZN . ZN ? ? G CYS 105 G ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? ? metalc19 metalc ? ? I GLU 107 OE1 ? ? ? 1_555 Q ZN . ZN ? ? 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'DT-DA PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLU _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 159 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id I _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLU _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 159 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id G _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 160 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 I _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 160 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 G _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 0.69 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 2 ? 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'Homo sapiens' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 2 ? 7111 'Trichoplusia ni' ? ? 3 3 ? 32630 'synthetic construct' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 41 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7AD8 'double helix' 7AD8 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 20 1_555 B DA 30 1_555 -7.110 -5.522 -0.245 -45.486 0.639 -17.906 1 J_DC20:DA30_K J 20 ? 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