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EMD-11734 'other EM volume' EMDB ;Cryo-EM structure of an extracellular contractile injection system in marine bacterium Algoriphagus machipongonensis, the sheath-tube module in extended state. ; EMD-11735 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7AE0 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-09-17 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Xu, J.' 1 ? 'Ericson, C.' 2 ? 'Feldmueller, M.' 3 ? 'Lien, Y.W.' 4 ? 'Pilhofer, M.' 5 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Microbiol' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2058-5276 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 7 _citation.language ? _citation.page_first 397 _citation.page_last 410 _citation.title ;Identification and structure of an extracellular contractile injection system from the marine bacterium Algoriphagus machipongonensis. ; _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41564-022-01059-2 _citation.pdbx_database_id_PubMed 35165385 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Xu, J.' 1 0000-0003-1833-1513 primary 'Ericson, C.F.' 2 ? primary 'Lien, Y.W.' 3 0000-0003-2455-5273 primary 'Rutaganira, F.U.N.' 4 0000-0001-5587-1872 primary 'Eisenstein, F.' 5 0000-0002-1261-7126 primary 'Feldmuller, M.' 6 ? primary 'King, N.' 7 ? primary 'Pilhofer, M.' 8 0000-0002-3649-3340 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Putative phage tail sheath protein FI' 76319.039 18 ? ? ? 'the residues (273-449aa) are not built up in the model due to the poor map density.' 2 polymer nat 'Phage tail protein' 16375.458 18 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MATYKTPGVYIEEITKFPPSVAQVETAIPAFIGYTQFARTKPSVDSDDLILKPKRISSLLDFTTYYGGAQNEQGITVKLT DTLIEGAENRTINVPEPTFKSPYLMFYSLQMYFANGGGPCYIVSTGVYDDWSDSETPPTINFSDLESGLAVIRKEDEPTL LLFPDATNLPTDDEFYSLYNSALMQCNDLQDRFTILDTYSDQTYNDGVEDLDPIPALRNGINLTKDYLKYGAAYYPFVQT ILNYQYSADEIVIQHLSYNPNAIATALDNLNAVNGPTFIDAILDDLRDLSLPDISGEISDAVGFMYDDVDGFDIDGTFTT NSVKVANFASLVESVLSTLNELIDAKEEINKDVNSAIASSEEDNAIKTAISDALDVFNEDFEGADKIESVAKNLSDLLIK IKQADTNTKVENVLSINALNFSAEFEKLLTYDVNTGLTASVTLDLFANIGTRLDDIIAAVSAAEPIDVNNGKLNGRLLSD IEPLDNATYNTILLEINSHKVTLPPSSSMAGAYARVDNDRGVWKSPANIGLNYVSKPSVTVSHEEQESMNVHGTGKSVNA 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;MSYPLSKFHFSVEWGGTKIGFTEVSGLDLETEIIEYRHGASPEYSKIKMPGMQKFSNITLKRGTFKSDNEYFQWYNTINL NKVERRDLTISLLNEEHEPVVTWKVKNAWPLKVQSTDLKGDGNEVAIESMELAHEGLVIQNE ; ;MSYPLSKFHFSVEWGGTKIGFTEVSGLDLETEIIEYRHGASPEYSKIKMPGMQKFSNITLKRGTFKSDNEYFQWYNTINL NKVERRDLTISLLNEEHEPVVTWKVKNAWPLKVQSTDLKGDGNEVAIESMELAHEGLVIQNE ; 3a,3b,3c,3d,3e,3f,4a,4b,4c,4d,4e,4f,5a,5b,5c,5d,5e,5f ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 THR n 1 4 TYR n 1 5 LYS n 1 6 THR n 1 7 PRO n 1 8 GLY n 1 9 VAL n 1 10 TYR n 1 11 ILE n 1 12 GLU n 1 13 GLU n 1 14 ILE n 1 15 THR n 1 16 LYS n 1 17 PHE n 1 18 PRO n 1 19 PRO n 1 20 SER n 1 21 VAL n 1 22 ALA n 1 23 GLN n 1 24 VAL n 1 25 GLU n 1 26 THR n 1 27 ALA n 1 28 ILE n 1 29 PRO n 1 30 ALA n 1 31 PHE n 1 32 ILE n 1 33 GLY n 1 34 TYR n 1 35 THR n 1 36 GLN n 1 37 PHE n 1 38 ALA n 1 39 ARG n 1 40 THR n 1 41 LYS n 1 42 PRO n 1 43 SER n 1 44 VAL n 1 45 ASP n 1 46 SER n 1 47 ASP n 1 48 ASP n 1 49 LEU n 1 50 ILE n 1 51 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AO6 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB5 1 2 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB6 6 7 ? parallel AB6 7 8 ? 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