data_7ALU # _entry.id 7ALU # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.383 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7ALU pdb_00007alu 10.2210/pdb7alu/pdb WWPDB D_1292111419 ? ? BMRB 34565 ? ? # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details 'NMR structure of a DNA G-quadruplex containing two SP1 binding sites from HIV-1 promoter' _pdbx_database_related.db_id 34565 _pdbx_database_related.content_type unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.entry_id 7ALU _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-10-07 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.status_code_nmr_data REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'De Rache, A.' 1 0000-0003-0868-3670 'Marquevielle, J.' 2 0000-0001-8155-5195 'Amrane, S.' 3 0000-0003-0147-776X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev J.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.journal_id_ISSN 1089-8638 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first 168359 _citation.page_last 168359 _citation.title 'Structure of a DNA G-quadruplex that modulates SP1 binding sites architecture in HIV-1 promoter.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.jmb.2023.168359 _citation.pdbx_database_id_PubMed 37952768 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'De Rache, A.' 1 ? primary 'Marquevielle, J.' 2 ? primary 'Bouaziz, S.' 3 ? primary 'Vialet, B.' 4 ? primary 'Andreola, M.L.' 5 ? primary 'Mergny, J.L.' 6 ? primary 'Amrane, S.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn ;DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*TP*GP*TP*GP*GP*CP*CP*TP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*G)-3') ; 6970.461 1 ? ? ? ? 2 non-polymer syn 'POTASSIUM ION' 39.098 2 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG) (DG)(DG) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can AGGGAGGTGTGGCCTGGGCGGG _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DA n 1 2 DG n 1 3 DG n 1 4 DG n 1 5 DA n 1 6 DG n 1 7 DG n 1 8 DT n 1 9 DG n 1 10 DT n 1 11 DG n 1 12 DG n 1 13 DC n 1 14 DC n 1 15 DT n 1 16 DG n 1 17 DG n 1 18 DG n 1 19 DC n 1 20 DG n 1 21 DG n 1 22 DG n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 22 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Human immunodeficiency virus 1' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 11676 _pdbx_entity_src_syn.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 7ALU _struct_ref.pdbx_db_accession 7ALU _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 7ALU _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 22 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 7ALU _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 22 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 22 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 K non-polymer . 'POTASSIUM ION' ? 'K 1' 39.098 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 2 '2D 1H-1H NOESY' 3 anisotropic 2 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 3 anisotropic 3 1 1 '2D 1H-13C HSQC aromatic' 2 anisotropic 4 1 1 '2D 1H-13C HSQC aliphatic' 2 anisotropic 5 1 1 '2D 1H-1H TOCSY' 2 anisotropic # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 293 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 6.9 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength '70 KCl; 20 KPi' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label HIVpro3 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units 'Not defined' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 '2.4 mM None HIVpro3, 100% D2O' '100% D2O' HIVpro3_D2O solution ? 2 '857 uM None HIVpro3, 90% H2O/10% D2O' '90% H2O/10% D2O' HIVpro3_H2O solution ? # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.type _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength _pdbx_nmr_spectrometer.details 1 'AVANCE III' ? Bruker 400 ? 2 'AVANCE III' ? Bruker 700 ? 3 'AVANCE III' ? Bruker 800 ? # _pdbx_nmr_refine.entry_id 7ALU _pdbx_nmr_refine.method 'molecular dynamics' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 4 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 7ALU _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 750 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 7ALU _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 'data analysis' TopSpin ? 'Bruker Biospin' 2 'chemical shift assignment' Sparky ? Goddard 3 'structure calculation' ARIA ? ;Linge, O'Donoghue and Nilges ; 4 refinement Amber ? 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7ALU _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7ALU _struct.title 'NMR structure of a DNA G-quadruplex containing two SP1 binding sites from HIV-1 promoter' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7ALU _struct_keywords.text 'Virus, HIV-1, G-quadruplex, SP1, DNA' _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 2 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? ? metalc2 metalc ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 3 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? ? metalc3 metalc ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 3 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? ? metalc4 metalc ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 4 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? ? metalc5 metalc ? ? A DG 9 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 9 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? ? metalc6 metalc ? ? A DG 11 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 11 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? ? metalc7 metalc ? ? A DG 11 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 11 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.973 ? ? metalc8 metalc ? ? A DG 12 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 12 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? ? metalc9 metalc ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 16 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? ? metalc10 metalc ? ? A DG 17 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 17 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? ? metalc11 metalc ? ? A DG 17 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 17 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.690 ? ? metalc12 metalc ? ? A DG 18 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 18 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? ? metalc13 metalc ? ? A DG 20 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 20 A K 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? ? metalc14 metalc ? ? A DG 21 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 21 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? ? metalc15 metalc ? ? A DG 22 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 22 A K 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DA 1 N6 ? ? ? 1_555 A DT 15 O2 ? ? A DA 1 A DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DA 1 N7 ? ? ? 1_555 A DT 15 N3 ? ? A DA 1 A DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 2 N7 ? ? ? 1_555 A DG 12 N2 ? ? A DG 2 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 A DG 12 N1 ? ? A DG 2 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 A DG 20 O6 ? ? A DG 2 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 A DG 20 N7 ? ? A DG 2 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 3 N1 ? ? ? 1_555 A DG 11 O6 ? ? A DG 3 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 3 N2 ? ? ? 1_555 A DG 11 N7 ? ? A DG 3 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 3 N7 ? ? ? 1_555 A DG 21 N2 ? ? A DG 3 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 A DG 21 N1 ? ? A DG 3 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DT 8 O2 ? ? A DG 4 A DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DT 8 N3 ? ? A DG 4 A DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DG 9 O6 ? ? A DG 4 A DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 A DG 9 N7 ? ? A DG 4 A DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 4 N7 ? ? ? 1_555 A DG 22 N2 ? ? A DG 4 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DG 22 N1 ? ? A DG 4 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 9 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 9 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 9 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 9 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 A DG 17 O6 ? ? A DG 11 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 A DG 17 N7 ? ? A DG 11 A DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 12 N7 ? ? ? 1_555 A DG 16 N2 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 12 O6 ? ? ? 1_555 A DG 16 N1 ? ? A DG 12 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 16 N7 ? ? ? 1_555 A DG 20 N2 ? ? A DG 16 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 A DG 20 N1 ? ? A DG 16 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 17 N1 ? ? ? 1_555 A DG 21 O6 ? ? A DG 17 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 17 N2 ? ? ? 1_555 A DG 21 N7 ? ? A DG 17 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 18 N1 ? ? ? 1_555 A DG 22 O6 ? ? A DG 18 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 18 N2 ? ? ? 1_555 A DG 22 N7 ? ? A DG 18 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # _atom_sites.entry_id 7ALU _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H K N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DA 1 1 1 DA DA A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG DG A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DA 5 5 5 DA DA A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT DT A . n A 1 9 DG 9 9 9 DG DG A . n A 1 10 DT 10 10 10 DT DT A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG DG A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DC 13 13 13 DC DC A . n A 1 14 DC 14 14 14 DC DC A . n A 1 15 DT 15 15 15 DT DT A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DG 17 17 17 DG DG A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DC 19 19 19 DC DC A . n A 1 20 DG 20 20 20 DG DG A . n A 1 21 DG 21 21 21 DG DG A . n A 1 22 DG 22 22 22 DG DG A . n # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email samir.amrane@u-bordeaux.fr _pdbx_contact_author.name_first Samir _pdbx_contact_author.name_last Amrane _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-0147-776X # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 K 1 101 23 K K A . C 2 K 1 102 24 K K A . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 76.8 ? 2 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 103.5 ? 3 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 70.6 ? 4 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 12 ? A DG 12 ? 1_555 74.4 ? 5 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 12 ? A DG 12 ? 1_555 122.6 ? 6 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 12 ? A DG 12 ? 1_555 69.4 ? 7 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 123.0 ? 8 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 156.0 ? 9 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 112.6 ? 10 O6 ? A DG 12 ? A DG 12 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 78.9 ? 11 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 164.1 ? 12 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 87.3 ? 13 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 70.3 ? 14 O6 ? A DG 12 ? A DG 12 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 115.0 ? 15 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 72.5 ? 16 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 86.9 ? 17 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 91.7 ? 18 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 156.3 ? 19 O6 ? A DG 12 ? A DG 12 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 134.3 ? 20 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 77.3 ? 21 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 K ? B K . ? A K 101 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 93.9 ? 22 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 71.7 ? 23 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 123.7 ? 24 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 77.0 ? 25 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 68.0 ? 26 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 89.1 ? 27 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 65.9 ? 28 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 88.5 ? 29 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 153.0 ? 30 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 100.6 ? 31 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 66.1 ? 32 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 160.3 ? 33 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 120.5 ? 34 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 75.7 ? 35 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 124.1 ? 36 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 83.9 ? 37 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 58.6 ? 38 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 114.1 ? 39 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 167.6 ? 40 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 107.3 ? 41 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 67.0 ? 42 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 101.7 ? 43 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 92.5 ? 44 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 75.1 ? 45 O6 ? A DG 9 ? A DG 9 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 122.9 ? 46 O6 ? A DG 11 ? A DG 11 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 158.3 ? 47 O6 ? A DG 17 ? A DG 17 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 125.2 ? 48 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 77.3 ? 49 O6 ? A DG 21 ? A DG 21 ? 1_555 K ? C K . ? A K 102 ? 1_555 O6 ? A DG 22 ? A DG 22 ? 1_555 67.4 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2022-06-01 2 'Structure model' 1 1 2023-06-14 3 'Structure model' 1 2 2023-12-13 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' Other 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' pdbx_database_status 2 3 'Structure model' chem_comp_atom 3 3 'Structure model' chem_comp_bond 4 3 'Structure model' citation 5 3 'Structure model' citation_author # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_pdbx_database_status.status_code_nmr_data' 2 3 'Structure model' '_citation.country' 3 3 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 4 3 'Structure model' '_citation.journal_id_ASTM' 5 3 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 6 3 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 7 3 'Structure model' '_citation.page_first' 8 3 'Structure model' '_citation.page_last' 9 3 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 10 3 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 11 3 'Structure model' '_citation.title' 12 3 'Structure model' '_citation.year' 13 3 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 14 3 'Structure model' '_citation_author.name' # _pdbx_entry_details.entry_id 7ALU _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 HIVpro3 2.4 ? mM None 2 HIVpro3 857 ? uM None # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 120.70 117.70 3.00 0.50 N 2 1 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.08 118.60 -5.52 0.60 N 3 1 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.37 119.90 -4.53 0.70 N 4 1 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 127.00 119.70 7.30 1.20 Y 5 1 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 6 1 N1 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? O6 A DG 3 ? ? 116.02 119.90 -3.88 0.60 N 7 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 8 1 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 9 1 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 122.08 117.70 4.38 0.50 N 10 1 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 110.62 118.60 -7.98 0.60 N 11 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 12 1 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.70 119.90 -4.20 0.60 N 13 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.31 108.30 5.01 0.30 N 14 1 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.39 119.90 -4.51 0.60 N 15 1 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 112.49 108.30 4.19 0.30 N 16 1 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 118.92 122.90 -3.98 0.60 N 17 1 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.14 111.90 3.24 0.50 N 18 1 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.55 128.60 -3.05 0.50 N 19 1 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 127.75 119.70 8.05 1.20 Y 20 1 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 21 1 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 117.57 122.30 -4.73 0.60 N 22 1 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 113.79 108.30 5.49 0.30 N 23 1 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 24 1 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.52 121.90 -4.38 0.70 N 25 1 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 26 1 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 27 1 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.55 122.30 -3.75 0.60 N 28 1 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 115.95 108.30 7.65 0.30 N 29 1 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.20 108.30 4.90 0.30 N 30 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.65 108.30 2.35 0.30 N 31 1 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 127.67 119.70 7.97 1.20 Y 32 1 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 98.53 105.90 -7.37 0.80 N 33 1 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 113.27 108.30 4.97 0.30 N 34 1 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 112.66 108.30 4.36 0.30 N 35 1 N3 A DG 20 ? ? C4 A DG 20 ? ? C5 A DG 20 ? ? 125.51 128.60 -3.09 0.50 N 36 1 C5 A DG 20 ? ? C6 A DG 20 ? ? N1 A DG 20 ? ? 114.62 111.50 3.12 0.50 N 37 1 N1 A DG 20 ? ? C6 A DG 20 ? ? O6 A DG 20 ? ? 116.25 119.90 -3.65 0.60 N 38 1 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 129.30 119.70 9.60 1.20 Y 39 1 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.99 108.30 3.69 0.30 N 40 2 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 114.18 118.60 -4.42 0.60 N 41 2 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.21 128.60 -3.39 0.50 N 42 2 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y 43 2 "C3'" A DG 4 ? ? "O3'" A DG 4 ? ? P A DA 5 ? ? 127.14 119.70 7.44 1.20 Y 44 2 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 45 2 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.50 118.60 -5.10 0.60 N 46 2 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.94 108.30 4.64 0.30 N 47 2 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.12 119.90 -4.78 0.60 N 48 2 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.56 108.30 5.26 0.30 N 49 2 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 114.55 119.90 -5.35 0.60 N 50 2 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 116.48 108.30 8.18 0.30 N 51 2 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 115.97 122.30 -6.33 0.60 N 52 2 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.44 111.90 3.54 0.50 N 53 2 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.00 128.60 -3.60 0.50 N 54 2 C5 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? N1 A DG 9 ? ? 114.52 111.50 3.02 0.50 N 55 2 N1 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? O6 A DG 9 ? ? 116.27 119.90 -3.63 0.60 N 56 2 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.29 119.70 8.59 1.20 Y 57 2 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.70 108.30 2.40 0.30 N 58 2 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 117.61 122.30 -4.69 0.60 N 59 2 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 118.92 122.90 -3.98 0.60 N 60 2 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 112.70 108.30 4.40 0.30 N 61 2 "C3'" A DG 12 ? ? "O3'" A DG 12 ? ? P A DC 13 ? ? 126.96 119.70 7.26 1.20 Y 62 2 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 111.74 108.30 3.44 0.30 N 63 2 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 112.17 108.30 3.87 0.30 N 64 2 N3 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? O2 A DC 14 ? ? 117.67 121.90 -4.23 0.70 N 65 2 "C3'" A DC 14 ? ? "O3'" A DC 14 ? ? P A DT 15 ? ? 127.31 119.70 7.61 1.20 Y 66 2 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 67 2 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.32 122.30 -3.98 0.60 N 68 2 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.84 108.30 5.54 0.30 N 69 2 "C3'" A DG 17 ? ? "C2'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? 97.59 102.40 -4.81 0.80 N 70 2 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 115.65 108.30 7.35 0.30 N 71 2 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 128.44 119.70 8.74 1.20 Y 72 2 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 97.92 105.90 -7.98 0.80 N 73 2 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 117.66 108.30 9.36 0.30 N 74 2 N3 A DC 19 ? ? C4 A DC 19 ? ? C5 A DC 19 ? ? 124.51 121.90 2.61 0.40 N 75 2 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.57 118.90 3.67 0.60 N 76 2 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.80 121.90 -5.10 0.70 N 77 2 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 112.02 108.30 3.72 0.30 N 78 2 N3 A DG 20 ? ? C4 A DG 20 ? ? C5 A DG 20 ? ? 125.52 128.60 -3.08 0.50 N 79 2 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 127.79 119.70 8.09 1.20 Y 80 3 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 81 3 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 82 3 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 112.43 118.60 -6.17 0.60 N 83 3 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.12 128.60 -3.48 0.50 N 84 3 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 127.83 119.70 8.13 1.20 Y 85 3 C5 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? N1 A DG 3 ? ? 114.75 111.50 3.25 0.50 N 86 3 N1 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? O6 A DG 3 ? ? 115.88 119.90 -4.02 0.60 N 87 3 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.39 108.30 3.09 0.30 N 88 3 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 89 3 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.20 118.60 -6.40 0.60 N 90 3 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 91 3 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.70 119.90 -4.20 0.60 N 92 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 93 3 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.28 119.90 -4.62 0.60 N 94 3 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.93 108.30 3.63 0.30 N 95 3 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.18 122.90 -3.72 0.60 N 96 3 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.55 128.60 -3.05 0.50 N 97 3 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.58 119.70 8.88 1.20 Y 98 3 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 117.86 122.30 -4.44 0.60 N 99 3 "C3'" A DG 11 ? ? "C2'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? 97.59 102.40 -4.81 0.80 N 100 3 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? "C2'" A DG 11 ? ? 100.92 105.90 -4.98 0.80 N 101 3 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 113.81 108.30 5.51 0.30 N 102 3 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N 103 3 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 113.07 108.30 4.77 0.30 N 104 3 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.34 122.30 -3.96 0.60 N 105 3 N3 A DG 16 ? ? C4 A DG 16 ? ? C5 A DG 16 ? ? 125.24 128.60 -3.36 0.50 N 106 3 "C3'" A DG 17 ? ? "C2'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? 97.55 102.40 -4.85 0.80 N 107 3 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 115.66 108.30 7.36 0.30 N 108 3 C5 A DG 17 ? ? C6 A DG 17 ? ? N1 A DG 17 ? ? 114.79 111.50 3.29 0.50 N 109 3 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 127.17 119.70 7.47 1.20 Y 110 3 "C3'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? 97.49 102.40 -4.91 0.80 N 111 3 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 98.88 105.90 -7.02 0.80 N 112 3 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 115.32 108.30 7.02 0.30 N 113 3 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.16 121.90 -4.74 0.70 N 114 3 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 115 3 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 128.00 119.70 8.30 1.20 Y 116 3 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 117 4 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 120.96 117.70 3.26 0.50 N 118 4 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 111.90 118.60 -6.70 0.60 N 119 4 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.46 128.60 -3.14 0.50 N 120 4 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 127.17 119.70 7.47 1.20 Y 121 4 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 122 4 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 120.86 117.70 3.16 0.50 N 123 4 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.08 118.60 -5.52 0.60 N 124 4 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 125 4 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 114.62 119.90 -5.28 0.60 N 126 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.62 108.30 4.32 0.30 N 127 4 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 114.87 119.90 -5.03 0.60 N 128 4 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 116.87 108.30 8.57 0.30 N 129 4 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 116.71 122.30 -5.59 0.60 N 130 4 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.16 111.90 3.26 0.50 N 131 4 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.04 128.60 -3.56 0.50 N 132 4 C5 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? N1 A DG 9 ? ? 114.58 111.50 3.08 0.50 N 133 4 N1 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? O6 A DG 9 ? ? 116.23 119.90 -3.67 0.60 N 134 4 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 129.09 119.70 9.39 1.20 Y 135 4 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.70 108.30 3.40 0.30 N 136 4 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.08 122.30 -4.22 0.60 N 137 4 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 138 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 139 4 "C3'" A DG 12 ? ? "O3'" A DG 12 ? ? P A DC 13 ? ? 127.01 119.70 7.31 1.20 Y 140 4 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 141 4 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.60 121.90 -4.30 0.70 N 142 4 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 112.57 108.30 4.27 0.30 N 143 4 N1 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? O2 A DC 14 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 144 4 N3 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? O2 A DC 14 ? ? 117.56 121.90 -4.34 0.70 N 145 4 "C3'" A DC 14 ? ? "O3'" A DC 14 ? ? P A DT 15 ? ? 127.46 119.70 7.76 1.20 Y 146 4 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.19 122.30 -4.11 0.60 N 147 4 "C3'" A DG 16 ? ? "C2'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? 97.57 102.40 -4.83 0.80 N 148 4 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 115.03 108.30 6.73 0.30 N 149 4 N3 A DG 16 ? ? C4 A DG 16 ? ? C5 A DG 16 ? ? 125.43 128.60 -3.17 0.50 N 150 4 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 115.00 108.30 6.70 0.30 N 151 4 C5 A DG 17 ? ? C6 A DG 17 ? ? N1 A DG 17 ? ? 114.54 111.50 3.04 0.50 N 152 4 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 127.33 119.70 7.63 1.20 Y 153 4 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 97.42 105.90 -8.48 0.80 N 154 4 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 117.01 108.30 8.71 0.30 N 155 4 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.80 121.90 -5.10 0.70 N 156 4 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 113.02 108.30 4.72 0.30 N 157 4 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 128.54 119.70 8.84 1.20 Y 158 4 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 159 5 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.10 117.70 3.40 0.50 N 160 5 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 112.45 118.60 -6.15 0.60 N 161 5 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.19 128.60 -3.41 0.50 N 162 5 "C3'" A DG 3 ? ? "O3'" A DG 3 ? ? P A DG 4 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y 163 5 "C3'" A DG 4 ? ? "O3'" A DG 4 ? ? P A DA 5 ? ? 127.13 119.70 7.43 1.20 Y 164 5 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.72 117.70 4.02 0.50 N 165 5 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.35 118.60 -6.25 0.60 N 166 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 114.33 108.30 6.03 0.30 N 167 5 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.04 119.90 -4.86 0.60 N 168 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.96 108.30 4.66 0.30 N 169 5 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.39 119.90 -4.51 0.60 N 170 5 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 116.79 108.30 8.49 0.30 N 171 5 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 116.54 122.30 -5.76 0.60 N 172 5 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.58 111.90 3.68 0.50 N 173 5 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.43 119.70 8.73 1.20 Y 174 5 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.24 122.30 -4.06 0.60 N 175 5 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 119.17 122.90 -3.73 0.60 N 176 5 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 177 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.36 108.30 2.06 0.30 N 178 5 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 112.55 108.30 4.25 0.30 N 179 5 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 111.60 108.30 3.30 0.30 N 180 5 C6 A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? 117.82 120.30 -2.48 0.40 N 181 5 N3 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? O2 A DC 14 ? ? 117.32 121.90 -4.58 0.70 N 182 5 "C3'" A DC 14 ? ? "O3'" A DC 14 ? ? P A DT 15 ? ? 126.92 119.70 7.22 1.20 Y 183 5 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 184 5 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.57 122.30 -3.73 0.60 N 185 5 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 186 5 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.26 108.30 4.96 0.30 N 187 5 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.84 108.30 2.54 0.30 N 188 5 N1 A DG 18 ? ? C6 A DG 18 ? ? O6 A DG 18 ? ? 116.06 119.90 -3.84 0.60 N 189 5 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 128.07 119.70 8.37 1.20 Y 190 5 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 97.13 105.90 -8.77 0.80 N 191 5 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 119.27 108.30 10.97 0.30 N 192 5 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.68 118.90 3.78 0.60 N 193 5 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.03 121.90 -4.87 0.70 N 194 5 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 113.38 108.30 5.08 0.30 N 195 5 N3 A DG 20 ? ? C2 A DG 20 ? ? N2 A DG 20 ? ? 115.00 119.90 -4.90 0.70 N 196 5 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 128.76 119.70 9.06 1.20 Y 197 5 N1 A DG 21 ? ? C6 A DG 21 ? ? O6 A DG 21 ? ? 115.93 119.90 -3.97 0.60 N 198 5 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 199 6 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 200 6 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 201 6 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.40 118.60 -5.20 0.60 N 202 6 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.30 128.60 -3.30 0.50 N 203 6 C5 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? N1 A DG 2 ? ? 114.74 111.50 3.24 0.50 N 204 6 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.18 119.90 -4.72 0.70 N 205 6 N1 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? O6 A DG 3 ? ? 116.05 119.90 -3.85 0.60 N 206 6 "C3'" A DG 3 ? ? "O3'" A DG 3 ? ? P A DG 4 ? ? 127.06 119.70 7.36 1.20 Y 207 6 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 208 6 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.06 118.60 -6.54 0.60 N 209 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 113.14 108.30 4.84 0.30 N 210 6 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 114.97 119.90 -4.93 0.60 N 211 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.74 108.30 4.44 0.30 N 212 6 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.28 119.90 -4.62 0.60 N 213 6 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 116.83 108.30 8.53 0.30 N 214 6 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 116.41 122.30 -5.89 0.60 N 215 6 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.88 111.90 3.98 0.50 N 216 6 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.18 128.60 -3.42 0.50 N 217 6 C5 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? N1 A DG 9 ? ? 114.53 111.50 3.03 0.50 N 218 6 N1 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? O6 A DG 9 ? ? 116.25 119.90 -3.65 0.60 N 219 6 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.63 119.70 8.93 1.20 Y 220 6 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 221 6 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 117.96 122.30 -4.34 0.60 N 222 6 "C3'" A DG 11 ? ? "C2'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? 96.92 102.40 -5.48 0.80 N 223 6 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 111.79 108.30 3.49 0.30 N 224 6 "C3'" A DG 12 ? ? "O3'" A DG 12 ? ? P A DC 13 ? ? 127.63 119.70 7.93 1.20 Y 225 6 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 226 6 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 112.22 108.30 3.92 0.30 N 227 6 "C3'" A DC 14 ? ? "O3'" A DC 14 ? ? P A DT 15 ? ? 126.99 119.70 7.29 1.20 Y 228 6 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 229 6 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.30 122.30 -4.00 0.60 N 230 6 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.20 108.30 4.90 0.30 N 231 6 C5 A DG 16 ? ? C6 A DG 16 ? ? N1 A DG 16 ? ? 114.62 111.50 3.12 0.50 N 232 6 "C3'" A DG 17 ? ? "C2'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? 97.58 102.40 -4.82 0.80 N 233 6 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 114.70 108.30 6.40 0.30 N 234 6 C5 A DG 17 ? ? C6 A DG 17 ? ? N1 A DG 17 ? ? 114.77 111.50 3.27 0.50 N 235 6 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 128.04 119.70 8.34 1.20 Y 236 6 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 98.35 105.90 -7.55 0.80 N 237 6 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 238 6 N3 A DG 20 ? ? C2 A DG 20 ? ? N2 A DG 20 ? ? 115.54 119.90 -4.36 0.70 N 239 6 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 129.90 119.70 10.20 1.20 Y 240 6 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 241 6 N3 A DG 22 ? ? C2 A DG 22 ? ? N2 A DG 22 ? ? 115.24 119.90 -4.66 0.70 N 242 7 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 120.72 117.70 3.02 0.50 N 243 7 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 244 7 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.39 128.60 -3.21 0.50 N 245 7 C5 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? N1 A DG 2 ? ? 114.62 111.50 3.12 0.50 N 246 7 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 127.04 119.70 7.34 1.20 Y 247 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.35 108.30 3.05 0.30 N 248 7 N3 A DG 4 ? ? C4 A DG 4 ? ? C5 A DG 4 ? ? 125.56 128.60 -3.04 0.50 N 249 7 "C3'" A DG 4 ? ? "O3'" A DG 4 ? ? P A DA 5 ? ? 127.39 119.70 7.69 1.20 Y 250 7 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 251 7 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 252 7 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 110.97 118.60 -7.63 0.60 N 253 7 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 254 7 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 114.64 119.90 -5.26 0.60 N 255 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.41 108.30 5.11 0.30 N 256 7 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.32 119.90 -4.58 0.60 N 257 7 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 117.81 108.30 9.51 0.30 N 258 7 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 117.79 122.30 -4.51 0.60 N 259 7 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.29 111.90 3.39 0.50 N 260 7 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.15 128.60 -3.45 0.50 N 261 7 C5 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? N1 A DG 9 ? ? 114.71 111.50 3.21 0.50 N 262 7 N1 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? O6 A DG 9 ? ? 116.29 119.90 -3.61 0.60 N 263 7 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 129.18 119.70 9.48 1.20 Y 264 7 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 265 7 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.42 122.30 -3.88 0.60 N 266 7 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 113.36 108.30 5.06 0.30 N 267 7 N1 A DG 12 ? ? C6 A DG 12 ? ? O6 A DG 12 ? ? 116.29 119.90 -3.61 0.60 N 268 7 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 112.43 108.30 4.13 0.30 N 269 7 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.45 121.90 -4.45 0.70 N 270 7 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 113.28 108.30 4.98 0.30 N 271 7 C6 A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? 117.88 120.30 -2.42 0.40 N 272 7 "C3'" A DC 14 ? ? "O3'" A DC 14 ? ? P A DT 15 ? ? 127.39 119.70 7.69 1.20 Y 273 7 "O4'" A DT 15 ? ? "C1'" A DT 15 ? ? N1 A DT 15 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 274 7 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 117.79 122.30 -4.51 0.60 N 275 7 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.19 108.30 5.89 0.30 N 276 7 N3 A DG 16 ? ? C2 A DG 16 ? ? N2 A DG 16 ? ? 115.39 119.90 -4.51 0.70 N 277 7 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 115.06 108.30 6.76 0.30 N 278 7 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 127.80 119.70 8.10 1.20 Y 279 7 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 96.74 105.90 -9.16 0.80 N 280 7 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 120.01 108.30 11.71 0.30 N 281 7 C6 A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? 117.79 120.30 -2.51 0.40 N 282 7 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.91 118.90 4.01 0.60 N 283 7 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.56 121.90 -4.34 0.70 N 284 7 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 128.77 119.70 9.07 1.20 Y 285 7 N3 A DG 22 ? ? C2 A DG 22 ? ? N2 A DG 22 ? ? 115.47 119.90 -4.43 0.70 N 286 7 N1 A DG 22 ? ? C6 A DG 22 ? ? O6 A DG 22 ? ? 116.16 119.90 -3.74 0.60 N 287 8 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 288 8 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 120.86 117.70 3.16 0.50 N 289 8 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.33 118.60 -5.27 0.60 N 290 8 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 124.66 128.60 -3.94 0.50 N 291 8 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 129.70 126.00 3.70 0.60 N 292 8 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 126.97 119.70 7.27 1.20 Y 293 8 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 294 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.81 108.30 3.51 0.30 N 295 8 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 296 8 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 122.45 117.70 4.75 0.50 N 297 8 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.08 118.60 -4.52 0.60 N 298 8 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.90 108.30 3.60 0.30 N 299 8 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.26 119.90 -4.64 0.60 N 300 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 301 8 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 114.85 119.90 -5.05 0.60 N 302 8 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.61 108.30 3.31 0.30 N 303 8 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.07 122.30 -4.23 0.60 N 304 8 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.05 122.90 -3.85 0.60 N 305 8 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.73 111.90 3.83 0.50 N 306 8 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.16 128.60 -3.44 0.50 N 307 8 C5 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? N1 A DG 9 ? ? 114.96 111.50 3.46 0.50 N 308 8 N1 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? O6 A DG 9 ? ? 115.58 119.90 -4.32 0.60 N 309 8 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.38 119.70 8.68 1.20 Y 310 8 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 311 8 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.01 122.30 -4.29 0.60 N 312 8 C6 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? C7 A DT 10 ? ? 118.97 122.90 -3.93 0.60 N 313 8 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 113.94 108.30 5.64 0.30 N 314 8 "C3'" A DG 11 ? ? "O3'" A DG 11 ? ? P A DG 12 ? ? 127.01 119.70 7.31 1.20 Y 315 8 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 316 8 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.55 121.90 -4.35 0.70 N 317 8 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 111.53 108.30 3.23 0.30 N 318 8 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.29 122.30 -4.01 0.60 N 319 8 "C3'" A DG 16 ? ? "C2'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? 97.52 102.40 -4.88 0.80 N 320 8 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 321 8 "C3'" A DG 17 ? ? "C2'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? 97.06 102.40 -5.34 0.80 N 322 8 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.75 108.30 5.45 0.30 N 323 8 N1 A DG 18 ? ? C6 A DG 18 ? ? O6 A DG 18 ? ? 116.05 119.90 -3.85 0.60 N 324 8 "C3'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? 97.56 102.40 -4.84 0.80 N 325 8 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 96.82 105.90 -9.08 0.80 N 326 8 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 119.39 108.30 11.09 0.30 N 327 8 C6 A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? 117.69 120.30 -2.61 0.40 N 328 8 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.54 118.90 3.64 0.60 N 329 8 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.19 121.90 -4.71 0.70 N 330 8 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 331 8 N3 A DG 20 ? ? C4 A DG 20 ? ? C5 A DG 20 ? ? 125.28 128.60 -3.32 0.50 N 332 8 C5 A DG 20 ? ? C6 A DG 20 ? ? N1 A DG 20 ? ? 114.56 111.50 3.06 0.50 N 333 8 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 128.77 119.70 9.07 1.20 Y 334 8 N1 A DG 21 ? ? C6 A DG 21 ? ? O6 A DG 21 ? ? 115.99 119.90 -3.91 0.60 N 335 8 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 336 9 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.98 117.00 -3.02 0.50 N 337 9 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 338 9 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 112.76 118.60 -5.84 0.60 N 339 9 N3 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? C5 A DG 2 ? ? 125.29 128.60 -3.31 0.50 N 340 9 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.47 119.90 -4.43 0.70 N 341 9 "C3'" A DG 2 ? ? "O3'" A DG 2 ? ? P A DG 3 ? ? 127.45 119.70 7.75 1.20 Y 342 9 C5 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? N1 A DG 3 ? ? 114.82 111.50 3.32 0.50 N 343 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 344 9 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 345 9 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 346 9 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 347 9 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.04 118.60 -5.56 0.60 N 348 9 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 349 9 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.64 119.90 -4.26 0.60 N 350 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.55 108.30 4.25 0.30 N 351 9 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 114.99 119.90 -4.91 0.60 N 352 9 C2 A DG 9 ? ? N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? 115.78 111.90 3.88 0.50 N 353 9 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.23 128.60 -3.37 0.50 N 354 9 C5 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? N1 A DG 9 ? ? 114.56 111.50 3.06 0.50 N 355 9 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.81 119.70 9.11 1.20 Y 356 9 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 357 9 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 118.12 122.30 -4.18 0.60 N 358 9 "C3'" A DG 11 ? ? "C2'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? 97.18 102.40 -5.22 0.80 N 359 9 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 111.59 108.30 3.29 0.30 N 360 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.98 108.30 2.68 0.30 N 361 9 N3 A DG 12 ? ? C2 A DG 12 ? ? N2 A DG 12 ? ? 115.31 119.90 -4.59 0.70 N 362 9 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 363 9 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.49 121.90 -4.41 0.70 N 364 9 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 112.69 108.30 4.39 0.30 N 365 9 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.10 122.30 -4.20 0.60 N 366 9 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 116.75 108.30 8.45 0.30 N 367 9 N3 A DG 16 ? ? C4 A DG 16 ? ? C5 A DG 16 ? ? 125.29 128.60 -3.31 0.50 N 368 9 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 115.33 108.30 7.03 0.30 N 369 9 C5 A DG 17 ? ? C6 A DG 17 ? ? N1 A DG 17 ? ? 114.95 111.50 3.45 0.50 N 370 9 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 127.86 119.70 8.16 1.20 Y 371 9 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 97.18 105.90 -8.72 0.80 N 372 9 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 116.37 108.30 8.07 0.30 N 373 9 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.55 118.90 3.65 0.60 N 374 9 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.95 121.90 -4.95 0.70 N 375 9 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 112.22 108.30 3.92 0.30 N 376 9 "C3'" A DG 20 ? ? "O3'" A DG 20 ? ? P A DG 21 ? ? 128.25 119.70 8.55 1.20 Y 377 9 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 378 10 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.92 117.00 -3.08 0.50 N 379 10 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.25 117.70 3.55 0.50 N 380 10 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 114.47 118.60 -4.13 0.60 N 381 10 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.38 119.90 -4.52 0.70 N 382 10 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.74 108.30 2.44 0.30 N 383 10 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N 384 10 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 385 10 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.45 117.00 -3.55 0.50 N 386 10 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 111.99 118.60 -6.61 0.60 N 387 10 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 113.41 108.30 5.11 0.30 N 388 10 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 115.23 119.90 -4.67 0.60 N 389 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 390 10 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.23 119.90 -4.67 0.60 N 391 10 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 392 10 N3 A DG 9 ? ? C4 A DG 9 ? ? C5 A DG 9 ? ? 125.31 128.60 -3.29 0.50 N 393 10 N1 A DG 9 ? ? C6 A DG 9 ? ? O6 A DG 9 ? ? 116.23 119.90 -3.67 0.60 N 394 10 "C3'" A DG 9 ? ? "O3'" A DG 9 ? ? P A DT 10 ? ? 128.88 119.70 9.18 1.20 Y 395 10 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 396 10 N3 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? O2 A DT 10 ? ? 117.70 122.30 -4.60 0.60 N 397 10 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 115.34 108.30 7.04 0.30 N 398 10 N1 A DG 11 ? ? C6 A DG 11 ? ? O6 A DG 11 ? ? 115.89 119.90 -4.01 0.60 N 399 10 "C3'" A DG 11 ? ? "O3'" A DG 11 ? ? P A DG 12 ? ? 127.36 119.70 7.66 1.20 Y 400 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.06 108.30 2.76 0.30 N 401 10 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 111.70 108.30 3.40 0.30 N 402 10 N3 A DC 13 ? ? C4 A DC 13 ? ? C5 A DC 13 ? ? 124.88 121.90 2.98 0.40 N 403 10 N1 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 122.64 118.90 3.74 0.60 N 404 10 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 405 10 "C3'" A DC 13 ? ? "O3'" A DC 13 ? ? P A DC 14 ? ? 127.38 119.70 7.68 1.20 Y 406 10 "O4'" A DC 14 ? ? "C1'" A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? 113.06 108.30 4.76 0.30 N 407 10 C6 A DC 14 ? ? N1 A DC 14 ? ? C2 A DC 14 ? ? 117.70 120.30 -2.60 0.40 N 408 10 N3 A DT 15 ? ? C2 A DT 15 ? ? O2 A DT 15 ? ? 118.16 122.30 -4.14 0.60 N 409 10 "C3'" A DG 16 ? ? "C2'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? 97.34 102.40 -5.06 0.80 N 410 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 115.99 108.30 7.69 0.30 N 411 10 C5 A DG 16 ? ? C6 A DG 16 ? ? N1 A DG 16 ? ? 114.84 111.50 3.34 0.50 N 412 10 "C3'" A DG 17 ? ? "C2'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? 97.47 102.40 -4.93 0.80 N 413 10 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 114.80 108.30 6.50 0.30 N 414 10 C5 A DG 17 ? ? C6 A DG 17 ? ? N1 A DG 17 ? ? 114.74 111.50 3.24 0.50 N 415 10 "C3'" A DG 18 ? ? "O3'" A DG 18 ? ? P A DC 19 ? ? 127.52 119.70 7.82 1.20 Y 416 10 "C3'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? 97.31 102.40 -5.09 0.80 N 417 10 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? "C2'" A DC 19 ? ? 97.52 105.90 -8.38 0.80 N 418 10 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 116.72 108.30 8.42 0.30 N 419 10 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 122.61 118.90 3.71 0.60 N 420 10 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 116.36 121.90 -5.54 0.70 N 421 10 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 113.23 108.30 4.93 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DA A 1 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 2 1 DG A 2 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 4 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 4 1 DG A 7 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 5 1 DG A 11 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 6 1 DC A 13 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 7 1 DC A 14 ? ? 0.233 'SIDE CHAIN' 8 1 DG A 17 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 9 1 DG A 18 ? ? 0.142 'SIDE CHAIN' 10 1 DC A 19 ? ? 0.206 'SIDE CHAIN' 11 2 DG A 4 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 12 2 DG A 7 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 13 2 DC A 14 ? ? 0.200 'SIDE CHAIN' 14 2 DG A 17 ? ? 0.130 'SIDE CHAIN' 15 2 DG A 18 ? ? 0.133 'SIDE CHAIN' 16 3 DG A 4 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 17 3 DA A 5 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 18 3 DG A 7 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 19 3 DG A 11 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 20 3 DC A 14 ? ? 0.213 'SIDE CHAIN' 21 3 DG A 17 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 22 3 DG A 18 ? ? 0.137 'SIDE CHAIN' 23 4 DG A 4 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 24 4 DT A 8 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 25 4 DG A 9 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 26 4 DG A 11 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 27 4 DC A 14 ? ? 0.208 'SIDE CHAIN' 28 4 DG A 17 ? ? 0.150 'SIDE CHAIN' 29 4 DG A 18 ? ? 0.128 'SIDE CHAIN' 30 4 DG A 20 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 31 5 DG A 4 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 32 5 DA A 5 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 33 5 DG A 6 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' 34 5 DT A 8 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 35 5 DG A 9 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 36 5 DT A 10 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 37 5 DC A 14 ? ? 0.165 'SIDE CHAIN' 38 5 DG A 17 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 39 5 DG A 18 ? ? 0.122 'SIDE CHAIN' 40 5 DC A 19 ? ? 0.124 'SIDE CHAIN' 41 6 DA A 5 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 42 6 DG A 7 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 43 6 DT A 8 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 44 6 DG A 9 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 45 6 DC A 14 ? ? 0.220 'SIDE CHAIN' 46 6 DG A 17 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 47 6 DG A 18 ? ? 0.157 'SIDE CHAIN' 48 6 DC A 19 ? ? 0.159 'SIDE CHAIN' 49 6 DG A 20 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 50 7 DA A 1 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 51 7 DA A 5 ? ? 0.116 'SIDE CHAIN' 52 7 DG A 6 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 53 7 DG A 7 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 54 7 DT A 8 ? ? 0.124 'SIDE CHAIN' 55 7 DG A 9 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 56 7 DC A 14 ? ? 0.184 'SIDE CHAIN' 57 7 DG A 16 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 58 7 DG A 17 ? ? 0.119 'SIDE CHAIN' 59 7 DG A 18 ? ? 0.134 'SIDE CHAIN' 60 7 DC A 19 ? ? 0.149 'SIDE CHAIN' 61 8 DG A 4 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 62 8 DA A 5 ? ? 0.124 'SIDE CHAIN' 63 8 DG A 6 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 64 8 DT A 10 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 65 8 DG A 11 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 66 8 DG A 12 ? ? 0.110 'SIDE CHAIN' 67 8 DC A 13 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 68 8 DC A 14 ? ? 0.214 'SIDE CHAIN' 69 8 DG A 17 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 70 8 DG A 18 ? ? 0.159 'SIDE CHAIN' 71 8 DC A 19 ? ? 0.135 'SIDE CHAIN' 72 9 DG A 4 ? ? 0.121 'SIDE CHAIN' 73 9 DT A 8 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 74 9 DC A 14 ? ? 0.220 'SIDE CHAIN' 75 9 DG A 17 ? ? 0.127 'SIDE CHAIN' 76 9 DG A 18 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 77 9 DC A 19 ? ? 0.115 'SIDE CHAIN' 78 10 DG A 4 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 79 10 DG A 7 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 80 10 DT A 8 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 81 10 DT A 10 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 82 10 DG A 11 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 83 10 DC A 13 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 84 10 DC A 14 ? ? 0.183 'SIDE CHAIN' 85 10 DG A 17 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 86 10 DG A 18 ? ? 0.149 'SIDE CHAIN' 87 10 DG A 20 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 K K K N N 144 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7ALU 'double helix' 7ALU 'quadruple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DA 1 1_555 A DT 15 1_555 -4.352 -1.823 0.688 0.940 10.992 -104.819 1 A_DA1:DT15_A A 1 ? A 15 ? 24 4 1 A DG 2 1_555 A DG 20 1_555 2.216 2.934 -0.057 4.976 -4.870 -88.094 2 A_DG2:DG20_A A 2 ? A 20 ? 6 3 1 A DG 12 1_555 A DG 16 1_555 -2.113 -2.959 -0.629 1.282 6.564 93.593 3 A_DG12:DG16_A A 12 ? A 16 ? 6 3 1 A DG 11 1_555 A DG 17 1_555 1.136 4.058 0.220 -8.767 -8.079 -83.420 4 A_DG11:DG17_A A 11 ? A 17 ? 6 3 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DA 1 1_555 A DT 15 1_555 A DG 2 1_555 A DG 20 1_555 -0.808 1.573 -2.928 -2.483 5.161 9.841 13.523 6.767 -1.646 27.260 13.114 11.382 1 AA_DA1DG2:DG20DT15_AA A 1 ? A 15 ? A 2 ? A 20 ? 1 A DG 2 1_555 A DG 20 1_555 A DG 12 1_555 A DG 16 1_555 -1.880 -3.218 -0.280 -6.460 -6.049 179.233 -1.609 0.940 -0.278 -3.025 3.230 179.235 2 AA_DG2DG12:DG16DG20_AA A 2 ? A 20 ? A 12 ? A 16 ? 1 A DG 12 1_555 A DG 16 1_555 A DG 11 1_555 A DG 17 1_555 1.978 2.568 2.706 -76.783 151.927 -87.141 -1.968 0.647 0.856 -77.315 -39.074 -172.924 3 AA_DG12DG11:DG17DG16_AA A 12 ? A 16 ? A 11 ? A 17 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Agence Nationale de la Recherche (ANR)' _pdbx_audit_support.country France _pdbx_audit_support.grant_number 'ANRS / AAP 2019-2 / ECTZ103899' _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name 'POTASSIUM ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id K # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'native gel electrophoresis' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #