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Baculovirus ? ? ? pBacPAK-LL-melittin-zGDNFmat-3C-ProteinA ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A8E7C6_DANRE A8E7C6 ? 1 ;GLYFPQRLYTENIYVGQQQGSPLLQVISMREFPTERPYFFLCSHRDAFTSWFHIDEASGVLYLNKTLEWSDFSSLRSGSV RSPKDLTLKVGVSSTPPMKVMCTILPTVEVKLSFINDTAPSCGQVELSTLCFPEKISNPHITENREPGALRQLRRFTHMS ICPNYTISYGVVAGSSVPFAVDDSTSELVVTAQVDREEKEVYHLDIVCMVRTERNLEEVFRSLHVNIYDEDDNSPYVNGT DTEDVLVEFDRSEGTVFGTLFVYDRDTTPVYPTNQVQNKLVGTLMTNDSWIKNNFAIEHKFREEKAIFGNVRGTVHEYKL KLSQNLSVTEQRSFLLGYLVNDTTFPGPEGTVLLHFNVTVLPVPIRFSNVTYSFTVSQKATTYSQIGKVCVENCQKFKGI DVTYQLEIVDRNITAEAQSCYWAVSLAQNPNDNTGVLYVNDTKVLRRPECQELEYVVIAQEQQNKLQAKTQLTVSFQGEA DSLKTDEPRFPACAEKRQRGDCEATRGLGAPTGRCQWRQGRDKGISKRYSTCSPNLGTCPDGYCDAIESKNISICPQDCS SEAIIGGYERDLYGIKAGHGTCYCFEGKCFCERDEPEDDICNDMC ; 22 2 UNP Q98TT9_DANRE Q98TT9 ? 2 ;EESYFSSSNRLDCVKANELCLKEPGCSSKYRTMRQCVAGRESNFSMATGMEAKDECRLVLDALKQSPLYNCRCKRGMKKE KNCLRIYWGIYQHLQGNDLLEDSPYEPVNSRLSDIFRLAPIYSGEPALAKENNCLNAAKACNLNDTCKKYRSAYISPCTS RVSTAEVCNKRKCHKALRQFFDKVPPKHSYGMLYCSCPLGDQSACSERRRQTIVPACSYEDKERPNCLTLQVSCKTNYIC RSRLADFFTNCQPEPLSLSGCLKENYADCLLSYSGLIGTVMTPNYLRSPKISVSPFCDCSSSGNSKEECDRFTEFFTDNA CLRNAIQAFGNG ; 20 3 UNP GDNF_DANRE Q98TU0 ? 3 ;VKGQGRGCLLKEIHLNVTDLDLGYRTKEELIFRYCSGPCHDAETNYDKILNNLTHNKKLDKDTPSRTCCRPIAFDDDISF LDDSLEYHTLKKHSAKKCACV ; 135 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7AML A 1 ? 605 ? 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'expression tag' 630 5 1 7AML GLU A 610 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 631 6 1 7AML ASN A 611 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 632 7 1 7AML LEU A 612 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 633 8 1 7AML TYR A 613 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 634 9 1 7AML PHE A 614 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 635 10 1 7AML GLN A 615 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 636 11 2 7AML ARG D 484 ? UNP A8E7C6 LYS 505 conflict 505 12 2 7AML GLY D 606 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 627 13 2 7AML SER D 607 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 628 14 2 7AML GLU D 608 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 629 15 2 7AML PHE D 609 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 630 16 2 7AML GLU D 610 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 631 17 2 7AML ASN D 611 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 632 18 2 7AML LEU D 612 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 633 19 2 7AML TYR D 613 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 634 20 2 7AML PHE D 614 ? UNP A8E7C6 ? ? 'expression tag' 635 21 2 7AML GLN D 615 ? UNP A8E7C6 ? ? 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'expression tag' 364 56 5 7AML GLY E 346 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 365 57 5 7AML GLY E 347 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 366 58 5 7AML GLU E 348 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 367 59 5 7AML ASN E 349 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 368 60 5 7AML LEU E 350 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 369 61 5 7AML TYR E 351 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 370 62 5 7AML PHE E 352 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 371 63 5 7AML GLN E 353 ? UNP Q98TT9 ? ? 'expression tag' 372 64 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7AML _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 37.37 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7AML _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 16330 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.819 ? 22104 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 23.629 ? 6156 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.057 ? 2486 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 2872 ? f_plane_restr ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 0.303118945511 ? ? 1 'NCS constraints' ? A ? ? ? ens_1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 0.0448414218699 ? ? 2 'NCS constraints' ? A ? ? ? ens_2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ? ? 0.422740336666 ? ? 3 'NCS constraints' ? A ? ? ? ens_3 # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given -0.999998415374 -0.00177998617107 0 0.00177998726659 -0.999998415153 0 0 0 0.999999998882 179.366558691 165.967286175 -0.179739366316 ? 2 given -0.999720161988 -0.00942115824473 -0.0216988362036 0.00923448692586 -0.999919626719 0.00868702211368 -0.021778934007 0.00848421353545 0.999726810761 181.27484087 165.214413934 0.41746535266 ? 3 given -0.999989199402 0 0.00464761817397 0.000133492566125 -0.999736963592 0.0229343804838 0.00464577856382 0.0229347532013 0.999726169427 179.221881202 165.271640213 -2.39670297898 ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;chain "D" ; ens_1 d_2 ;chain "A" ; ens_2 d_1 ;chain "B" ; ens_2 d_2 ;chain "E" ; ens_3 d_1 ;chain "C" ; ens_3 d_2 ;chain "F" ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details ens_1 d_1 1 . L GLY 1 . L PRO 596 ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 2 . M NAG . . M NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 3 . N NAG . . N NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 4 . O NAG . . O NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 5 . P NAG . . P NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 6 . Q NAG . . Q NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 7 . R NAG . . R NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_1 8 . S NAG . . S NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 1 . A GLY 1 . A PRO 596 ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 2 . B NAG . . B NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 3 . C NAG . . C NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 4 . D NAG . . D NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 5 . E NAG . . E NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 6 . F NAG . . F NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 7 . G NAG . . G NAG . ? ? ? ? ? ? ens_1 d_2 8 . H NAG . . H NAG . ? ? ? ? ? ? ens_2 d_1 1 . I ARG 1 . I GLY 304 ? ? ? ? ? ? ens_2 d_2 1 . T ARG 1 . T GLY 304 ? ? ? ? ? ? ens_3 d_1 1 . J GLN 1 . J VAL 98 ? ? ? ? ? ? ens_3 d_1 2 . K NAG . . K NAG . ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 1 . U GLN 1 . U VAL 98 ? ? ? ? ? ? ens_3 d_2 2 . V NAG . . V NAG . ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? ens_3 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_2 d_2 d_1 2 ens_3 d_2 d_1 3 # _struct.entry_id 7AML _struct.title 'RET/GDNF/GFRa1 extracellular complex Cryo-EM structure' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7AML _struct_keywords.text 'VERTEBRATE DEVELOPMENT, PART OF THE RET-GFL-GFRA COMPLEX, NEUROTROPHIC FACTOR, SIGNALING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 5 ? Q N N 5 ? R N N 4 ? S N N 4 ? T N N 4 ? U N N 4 ? V N N 5 ? W N N 5 ? X N N 5 ? Y N N 5 ? Z N N 5 ? AA N N 5 ? BA N N 5 ? CA N N 5 ? DA N N 5 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 47 ? SER A 50 ? ALA A 68 SER A 71 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 68 ? LEU A 75 ? GLU A 89 LEU A 96 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 AA3 MET A 98 ? CYS A 102 ? MET A 119 CYS A 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG A 155 ? ILE A 161 ? ARG A 176 ILE A 182 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 288 ? ASN A 294 ? ASP A 309 ASN A 315 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 THR A 414 ? SER A 419 ? THR A 435 SER A 440 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 CYS A 420 ? TRP A 422 ? CYS A 441 TRP A 443 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO A 448 ? CYS A 450 ? PRO A 469 CYS A 471 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 GLN A 498 ? ALA A 504 ? GLN A 519 ALA A 525 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 CYS A 555 ? SER A 560 ? CYS A 576 SER A 581 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA B 47 ? SER B 50 ? ALA D 68 SER D 71 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU B 68 ? LEU B 75 ? GLU D 89 LEU D 96 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 MET B 98 ? CYS B 102 ? MET D 119 CYS D 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 ARG B 155 ? CYS B 162 ? ARG D 176 CYS D 183 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP B 288 ? ASN B 294 ? ASP D 309 ASN D 315 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 AB7 THR B 414 ? SER B 419 ? THR D 435 SER D 440 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 CYS B 420 ? TRP B 422 ? CYS D 441 TRP D 443 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG B 447 ? CYS B 450 ? ARG D 468 CYS D 471 5 ? 4 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN B 498 ? ALA B 504 ? GLN D 519 ALA D 525 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 CYS B 555 ? SER B 560 ? CYS D 576 SER D 581 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 CYS C 13 ? LEU C 21 ? CYS B 32 LEU B 40 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 AC4 GLU C 23 ? VAL C 37 ? GLU B 42 VAL B 56 1 ? 15 HELX_P HELX_P23 AC5 CYS C 56 ? SER C 66 ? CYS B 75 SER B 85 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO C 67 ? CYS C 71 ? PRO B 86 CYS B 90 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 GLU C 80 ? LEU C 94 ? GLU B 99 LEU B 113 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN C 109 ? ARG C 117 ? ASN B 128 ARG B 136 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA C 119 ? GLU C 125 ? ALA B 138 GLU B 144 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN C 133 ? ASN C 142 ? ASN B 152 ASN B 161 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 THR C 146 ? TYR C 154 ? THR B 165 TYR B 173 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 AD3 ILE C 155 ? SER C 160 ? ILE B 174 SER B 179 5 ? 6 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN C 169 ? VAL C 184 ? ASN B 188 VAL B 203 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO C 185 ? CYS C 195 ? PRO B 204 CYS B 214 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 AD6 SER C 203 ? GLN C 211 ? SER B 222 GLN B 230 1 ? 9 HELX_P HELX_P34 AD7 VAL C 214 ? TYR C 219 ? VAL B 233 TYR B 238 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 ASN C 226 ? LYS C 235 ? ASN B 245 LYS B 254 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 ILE C 239 ? GLN C 252 ? ILE B 258 GLN B 271 1 ? 14 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN C 265 ? GLY C 275 ? ASN B 284 GLY B 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 SER C 302 ? ASN C 304 ? SER B 321 ASN B 323 5 ? 3 HELX_P HELX_P39 AE3 SER C 305 ? ASP C 318 ? SER B 324 ASP B 337 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 AE4 ASN C 319 ? ASN C 331 ? ASN B 338 ASN B 350 1 ? 13 HELX_P HELX_P41 AE5 THR D 18 ? ASP D 21 ? THR C 152 ASP C 155 5 ? 4 HELX_P HELX_P42 AE6 CYS D 39 ? GLU D 43 ? CYS C 173 GLU C 177 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 THR D 44 ? ASN D 56 ? THR C 178 ASN C 190 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 AE8 CYS E 13 ? LEU E 21 ? CYS E 32 LEU E 40 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU E 23 ? VAL E 37 ? GLU E 42 VAL E 56 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 AF1 CYS E 56 ? SER E 66 ? 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THR F 178 ASN F 190 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 582 SG ? ? ? 1_555 A CYS 591 SG ? ? A CYS 603 A CYS 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 584 SG ? ? ? 1_555 A CYS 589 SG ? ? A CYS 605 A CYS 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf12 disulf ? ? B CYS 42 SG ? ? ? 1_555 B CYS 102 SG ? ? D CYS 63 D CYS 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf13 disulf ? ? B CYS 122 SG ? ? ? 1_555 B CYS 162 SG ? ? D CYS 143 D CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 131 SG ? ? ? 1_555 B CYS 208 SG ? ? D CYS 152 D CYS 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 390 SG ? ? ? 1_555 B CYS 394 SG ? ? D CYS 411 D CYS 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 420 SG ? ? ? 1_555 B CYS 450 SG ? ? D CYS 441 D CYS 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 493 SG ? ? ? 1_555 B CYS 515 SG ? ? D CYS 514 D CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 502 SG ? ? ? 1_555 B CYS 532 SG ? ? 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B CYS 153 B CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf28 disulf ? ? C CYS 141 SG ? ? ? 1_555 C CYS 147 SG ? ? B CYS 160 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 158 SG ? ? ? 1_555 C CYS 173 SG ? ? B CYS 177 B CYS 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 168 SG ? ? ? 1_555 C CYS 217 SG ? ? B CYS 187 B CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 197 SG ? ? ? 1_555 C CYS 205 SG ? ? B CYS 216 B CYS 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 227 SG ? ? ? 1_555 C CYS 297 SG ? ? B CYS 246 B CYS 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 234 SG ? ? ? 1_555 C CYS 240 SG ? ? B CYS 253 B CYS 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 251 SG ? ? ? 1_555 C CYS 269 SG ? ? B CYS 270 B CYS 288 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 261 SG ? ? ? 1_555 C CYS 321 SG ? ? B CYS 280 B CYS 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf36 disulf ? ? 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D ASP 566 D CA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.181 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 82 A . ? SER 103 A PRO 83 A ? PRO 104 A 1 0.58 2 TYR 271 A . ? TYR 292 A PRO 272 A ? PRO 293 A 1 -3.18 3 SER 82 B . ? SER 103 D PRO 83 B ? PRO 104 D 1 0.62 4 TYR 271 B . ? TYR 292 D PRO 272 B ? PRO 293 D 1 -3.10 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 8 ? 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VAL D 129 PHE D 135 AB5 3 LYS B 84 ? SER B 93 ? LYS D 105 SER D 114 AB5 4 TYR B 38 ? CYS B 42 ? TYR D 59 CYS D 63 AB6 1 LEU B 24 ? GLN B 25 ? LEU D 45 GLN D 46 AB6 2 VAL B 60 ? LEU B 63 ? VAL D 81 LEU D 84 AB6 3 PHE B 52 ? ILE B 54 ? PHE D 73 ILE D 75 AB7 1 HIS B 140 ? THR B 142 ? HIS D 161 THR D 163 AB7 2 GLU B 217 ? TYR B 228 ? GLU D 238 TYR D 249 AB7 3 VAL B 201 ? VAL B 210 ? VAL D 222 VAL D 231 AB7 4 ILE B 167 ? VAL B 171 ? ILE D 188 VAL D 192 AB8 1 ALA B 149 ? GLN B 152 ? ALA D 170 GLN D 173 AB8 2 GLU B 187 ? VAL B 190 ? GLU D 208 VAL D 211 AB8 3 PHE B 179 ? VAL B 181 ? PHE D 200 VAL D 202 AB9 1 GLU B 243 ? ASP B 244 ? GLU D 264 ASP D 265 AB9 2 PHE B 356 ? VAL B 360 ? PHE D 377 VAL D 381 AB9 3 ARG B 332 ? LEU B 336 ? ARG D 353 LEU D 357 AC1 1 LEU B 260 ? ASP B 264 ? LEU D 281 ASP D 285 AC1 2 GLY B 313 ? LEU B 322 ? GLY D 334 LEU D 343 AC1 3 PHE B 295 ? HIS B 299 ? PHE D 316 HIS D 320 AC2 1 LEU B 260 ? ASP B 264 ? LEU D 281 ASP D 285 AC2 2 GLY B 313 ? LEU B 322 ? GLY D 334 LEU D 343 AC2 3 ARG B 302 ? GLU B 304 ? ARG D 323 GLU D 325 AC3 1 VAL B 281 ? LEU B 284 ? VAL D 302 LEU D 305 AC3 2 TYR B 338 ? ASN B 341 ? TYR D 359 ASN D 362 AC3 3 THR B 351 ? LEU B 353 ? THR D 372 LEU D 374 AC4 1 LYS B 388 ? VAL B 389 ? LYS D 409 VAL D 410 AC4 2 THR B 434 ? VAL B 436 ? THR D 455 VAL D 457 AC4 3 ALA B 427 ? ASN B 429 ? ALA D 448 ASN D 450 AC5 1 VAL B 402 ? ILE B 408 ? VAL D 423 ILE D 429 AC5 2 GLU B 452 ? GLU B 461 ? GLU D 473 GLU D 482 AC5 3 GLN B 467 ? SER B 475 ? GLN D 488 SER D 496 AC6 1 GLN B 516 ? TRP B 517 ? GLN D 537 TRP D 538 AC6 2 CYS B 532 ? SER B 533 ? CYS D 553 SER D 554 AC7 1 ILE B 564 ? GLY B 566 ? ILE D 585 GLY D 587 AC7 2 CYS B 589 ? CYS B 591 ? CYS D 610 CYS D 612 AC7 3 TYR B 583 ? CYS B 584 ? TYR D 604 CYS D 605 AC8 1 TYR B 568 ? ARG B 570 ? TYR D 589 ARG D 591 AC8 2 ILE B 575 ? GLY B 578 ? ILE D 596 GLY D 599 AC9 1 ASN C 284 ? TYR C 285 ? ASN B 303 TYR B 304 AC9 2 VAL C 293 ? SER C 294 ? VAL B 312 SER B 313 AD1 1 LEU D 9 ? ASN D 16 ? 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N ILE A 34 O SER A 113 ? O SER A 134 AA1 2 3 O PHE A 114 ? O PHE A 135 N LYS A 84 ? N LYS A 105 AA1 3 4 O SER A 93 ? O SER A 114 N TYR A 38 ? N TYR A 59 AA2 1 2 N LEU A 24 ? N LEU A 45 O LEU A 61 ? O LEU A 82 AA2 2 3 O TYR A 62 ? O TYR A 83 N HIS A 53 ? N HIS A 74 AA3 1 2 N ILE A 141 ? N ILE A 162 O TYR A 228 ? O TYR A 249 AA3 2 3 O ARG A 221 ? O ARG A 242 N ILE A 206 ? N ILE A 227 AA3 3 4 O MET A 209 ? O MET A 230 N SER A 168 ? N SER A 189 AA4 1 2 N LEU A 150 ? N LEU A 171 O LEU A 188 ? O LEU A 209 AA4 2 3 O VAL A 189 ? O VAL A 210 N ALA A 180 ? N ALA A 201 AA5 1 2 N GLU A 243 ? N GLU A 264 O ASN A 357 ? O ASN A 378 AA5 2 3 O VAL A 360 ? O VAL A 381 N ARG A 332 ? N ARG A 353 AA6 1 2 N LEU A 260 ? N LEU A 281 O TYR A 318 ? O TYR A 339 AA6 2 3 O LYS A 321 ? O LYS A 342 N ALA A 296 ? N ALA A 317 AA7 1 2 N LEU A 260 ? N LEU A 281 O TYR A 318 ? O TYR A 339 AA7 2 3 O GLY A 313 ? O GLY A 334 N GLU A 304 ? N GLU A 325 AA8 1 2 N THR A 283 ? N THR A 304 O LEU A 339 ? 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B GLU 610 34 1 Y 1 D ASN 632 ? B ASN 611 35 1 Y 1 D LEU 633 ? B LEU 612 36 1 Y 1 D TYR 634 ? B TYR 613 37 1 Y 1 D PHE 635 ? B PHE 614 38 1 Y 1 D GLN 636 ? B GLN 615 39 1 Y 1 B GLU 20 ? C GLU 1 40 1 Y 1 B GLU 21 ? C GLU 2 41 1 Y 1 B SER 22 ? C SER 3 42 1 Y 1 B TYR 23 ? C TYR 4 43 1 Y 1 B PHE 24 ? C PHE 5 44 1 Y 1 B SER 25 ? C SER 6 45 1 Y 1 B SER 26 ? C SER 7 46 1 Y 1 B SER 27 ? C SER 8 47 1 Y 1 B ASN 28 ? C ASN 9 48 1 Y 1 B ARG 59 ? C ARG 40 49 1 Y 1 B GLU 60 ? C GLU 41 50 1 Y 1 B SER 61 ? C SER 42 51 1 Y 1 B ASN 62 ? C ASN 43 52 1 Y 1 B PHE 63 ? C PHE 44 53 1 Y 1 B SER 64 ? C SER 45 54 1 Y 1 B MET 65 ? C MET 46 55 1 Y 1 B ALA 66 ? C ALA 47 56 1 Y 1 B THR 67 ? C THR 48 57 1 Y 1 B GLY 68 ? C GLY 49 58 1 Y 1 B MET 69 ? C MET 50 59 1 Y 1 B GLU 70 ? C GLU 51 60 1 Y 1 B ALA 71 ? C ALA 52 61 1 Y 1 B LYS 72 ? C LYS 53 62 1 Y 1 B ASP 73 ? C ASP 54 63 1 Y 1 B GLN 114 ? C GLN 95 64 1 Y 1 B GLY 115 ? C GLY 96 65 1 Y 1 B ASN 116 ? C ASN 97 66 1 Y 1 B ASP 117 ? C ASP 98 67 1 Y 1 B GLY 352 ? C GLY 333 68 1 Y 1 B SER 353 ? C SER 334 69 1 Y 1 B GLU 354 ? C GLU 335 70 1 Y 1 B PHE 355 ? C PHE 336 71 1 Y 1 B LEU 356 ? C LEU 337 72 1 Y 1 B GLU 357 ? C GLU 338 73 1 Y 1 B VAL 358 ? C VAL 339 74 1 Y 1 B LEU 359 ? C LEU 340 75 1 Y 1 B PHE 360 ? C PHE 341 76 1 Y 1 B GLN 361 ? C GLN 342 77 1 Y 1 B GLY 362 ? C GLY 343 78 1 Y 1 B PRO 363 ? C PRO 344 79 1 Y 1 B GLY 364 ? C GLY 345 80 1 Y 1 B GLY 365 ? C GLY 346 81 1 Y 1 B GLY 366 ? C GLY 347 82 1 Y 1 B GLU 367 ? C GLU 348 83 1 Y 1 B ASN 368 ? C ASN 349 84 1 Y 1 B LEU 369 ? C LEU 350 85 1 Y 1 B TYR 370 ? C TYR 351 86 1 Y 1 B PHE 371 ? C PHE 352 87 1 Y 1 B GLN 372 ? C GLN 353 88 1 Y 1 C VAL 135 ? D VAL 1 89 1 Y 1 C LYS 136 ? D LYS 2 90 1 Y 1 C GLY 137 ? D GLY 3 91 1 Y 1 E GLU 20 ? E GLU 1 92 1 Y 1 E GLU 21 ? E GLU 2 93 1 Y 1 E SER 22 ? E SER 3 94 1 Y 1 E TYR 23 ? E TYR 4 95 1 Y 1 E PHE 24 ? E PHE 5 96 1 Y 1 E SER 25 ? E SER 6 97 1 Y 1 E SER 26 ? E SER 7 98 1 Y 1 E SER 27 ? E SER 8 99 1 Y 1 E ASN 28 ? E ASN 9 100 1 Y 1 E ARG 59 ? E ARG 40 101 1 Y 1 E GLU 60 ? E GLU 41 102 1 Y 1 E SER 61 ? E SER 42 103 1 Y 1 E ASN 62 ? E ASN 43 104 1 Y 1 E PHE 63 ? E PHE 44 105 1 Y 1 E SER 64 ? E SER 45 106 1 Y 1 E MET 65 ? E MET 46 107 1 Y 1 E ALA 66 ? E ALA 47 108 1 Y 1 E THR 67 ? E THR 48 109 1 Y 1 E GLY 68 ? E GLY 49 110 1 Y 1 E MET 69 ? E MET 50 111 1 Y 1 E GLU 70 ? E GLU 51 112 1 Y 1 E ALA 71 ? E ALA 52 113 1 Y 1 E LYS 72 ? E LYS 53 114 1 Y 1 E ASP 73 ? E ASP 54 115 1 Y 1 E GLN 114 ? E GLN 95 116 1 Y 1 E GLY 115 ? E GLY 96 117 1 Y 1 E ASN 116 ? E ASN 97 118 1 Y 1 E ASP 117 ? E ASP 98 119 1 Y 1 E GLY 352 ? E GLY 333 120 1 Y 1 E SER 353 ? E SER 334 121 1 Y 1 E GLU 354 ? E GLU 335 122 1 Y 1 E PHE 355 ? E PHE 336 123 1 Y 1 E LEU 356 ? E LEU 337 124 1 Y 1 E GLU 357 ? E GLU 338 125 1 Y 1 E VAL 358 ? E VAL 339 126 1 Y 1 E LEU 359 ? E LEU 340 127 1 Y 1 E PHE 360 ? E PHE 341 128 1 Y 1 E GLN 361 ? E GLN 342 129 1 Y 1 E GLY 362 ? E GLY 343 130 1 Y 1 E PRO 363 ? E PRO 344 131 1 Y 1 E GLY 364 ? E GLY 345 132 1 Y 1 E GLY 365 ? E GLY 346 133 1 Y 1 E GLY 366 ? E GLY 347 134 1 Y 1 E GLU 367 ? E GLU 348 135 1 Y 1 E ASN 368 ? E ASN 349 136 1 Y 1 E LEU 369 ? E LEU 350 137 1 Y 1 E TYR 370 ? E TYR 351 138 1 Y 1 E PHE 371 ? E PHE 352 139 1 Y 1 E GLN 372 ? E GLN 353 140 1 Y 1 F VAL 135 ? F VAL 1 141 1 Y 1 F LYS 136 ? F LYS 2 142 1 Y 1 F GLY 137 ? F GLY 3 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM '(HOCH2)3CNH2' tris-HCl 1 2 150 mM NaCl 'sodium chloride' 1 3 1 mM CaCL2 'calcium chloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.24 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 7955 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Danio rerio' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 7108 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Spodoptera frugiperda' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid pBacPAK _em_entity_assembly_recombinant.strain IPLB-Sf21-AE # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 48.6 _em_image_recording.average_exposure_time 9 _em_image_recording.details '6105 movies were collected without stage tilt, 6375 movies were collected with a tilt angle of 30 degrees.' _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 12475 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details '1156517 particles picked from 0 tilt data, 1393023 particles picked from 30-degree tilt data' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 2549540 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? RELION ? 1 ? ? 2 'PARTICLE SELECTION' ? Gautomatch ? 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4.1 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? PHENIX 1.18.2 ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? cryoSPARC 2 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 2 1 ? ? 14 'VOLUME SELECTION' ? ? ? 1 1 1 15 'SERIES ALIGNMENT' ? ? ? 1 1 1 16 'MOLECULAR REPLACEMENT' ? ? ? 1 1 1 17 'LATTICE DISTORTION CORRECTION' ? ? ? 1 1 1 18 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 19 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 20 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.18.2 ? 1 ? 21 'MODEL REFINEMENT' ? Coot ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.1 _em_specimen.details ;Crosslinked using the GraFIX method with a gradient of 0-0.1% glutaraldehyde, 5-20% sucrose. Further purified by size exclusion chromatography. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'The Francis Crick Institute' _pdbx_audit_support.country 'United Kingdom' _pdbx_audit_support.grant_number 10115 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4 'CALCIUM ION' CA 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ? 2 1 homology ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #