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2 ;MKKNTDSEMDQRLGYKFLVPDPKAGVFYRPLHFQYVSYSNFILHRLHEILTVKRPLLSFKNNTERIMIEISNVKVTPPDY SPIIASIKGKSYDALATFTVNIFKEVMTKEGISITKISSYEGKDSHLIKIPLLIGYGNKNPLDTAKYLVPNVIGGVFINK QSVEKVGINLVEKITTWPKFRVVKPNSFTFSFSSVSPPNVLPTRYRHYKISLDISQLEALNISSTKTFITVNIVLLSQYL SRVSLEFIRRSLSYDMPPEVVYLVNAIIDSAKRITESITDFNIDTYINDLVEAEHIKQKSQLTINEFKYEMLHNFLPHMN YTPDQLKGFYMISLLRKFLYCIFHTSRYPDRDSMVCHRILTYGKYFETLAHDELENYIGNIRNDIMNNHKNRGTYAVNIH VLTTPGLNHAFSSLLSGKFKKSDGSYRTHPHYSWMQNISIPRSVGFYPDQVKISKMFSVRKYHPSQYLYFCSSDVPERGP QVGLVSQLSVLSSITNILTSEYLDLEKKICEYIRSYYKDDISYFETGFPITIENALVASLNPNMICDFVTDFRRRKRMGF FGNLEVGITLVRDHMNEIRINIGAGRLVRPFLVVDNGELMMDVCPELESRLDDMTFSDIQKEFPHVIEMVDIEQFTFSNV CESVQKFRMMSKDERKQYDLCDFPAEFRDGYVASSLVGINHNSGPRAILGCAQAKQAISCLSSDIRNKIDNGIHLMYPER PIVISKALETSKIAANCFGQHVTIALMSYKGINQEDGIIIKKQFIQRGGLDIVTAKKHQVEIPLENFNNKERDRSNAYSK LESNGLVRLNAFLESGDAMARNISSRTLEDDFARDNQISFDVSEKYTDMYKSRVERVQVELTDKVKVRVLTMKERRPILG DKFTTRTSQKGTVAYVADETELPYDENGITPDVIINSTSIFSRKTISMLIEVILTAAYSAKPYNNKGENRPVCFPSSNET SIDTYMQFAKQCYEHSNPKLSDEELSDKIFCEKILYDPETDKPYASKVFFGPIYYLRLRHLTQDKATVRCRGKKTKLIRQ ANEGRKRGGGIKFGEMERDCLIAHGAANTITEVLKDSEEDYQDVYVCENCGDIAAQIKGINTCLRCSKLNLSPLLTKIDT THVSKVFLTQMNARGVKVKLDFERRPPSFYKPLDKVDLKPSFLV ; 1 3 UNP Q49PG1_9POXV Q49PG1 ? 3 ;MQHPREENSIVVELEPSLATFIKQGFNNLVKWPLLNIGIVLSNTSTAVNEEWLTAVEHIPTMKIFYKHIHKILTREMGFL VYLKRSQSERDNYITLYDFDYYIIDKDTNSVTMVDKPTELKETLLHVFQEYRLKSSQTIELIAFSSGTVINEDIVSKLTF LDVEVFNREYNNVKTIIDPDFVFRSPFIVISPMGKLTFFVEVYSWFDFKSCFKDIIDFLEGALIANIHNHMIKVGNCDET VSSYNPESGMLFVNDLMTMNIVNFFGCNSRLESYHRFDMTKVDVELFIKALSDACKKILSASNRL ; 1 4 UNP A4GDF1_9POXV A4GDF1 ? 4 ;MNQYNVKYLAKILCLKTEIARDPYAVINRNVLLRYTTDIEYNDLVTLITVRHKIDSMKTVFQVFNESSINYTPVDDDYGE PIIITSYLQKGHNKFPVNFLYIDVVISDLFPSFVRLDTTETNIVNSVLQTGDGKKTLRLPKMLETEIVVKILYRPNIPLK IVRFFRNNMVTGVEIADRSVISVAD ; 1 5 UNP Q49QC8_9POXV Q49QC8 ? 5 ;MADTDDIIDYESDDLTEYEDDEEEEEDGESLETSDIDPKSSYKIVESASTHIEDAHSNLKHIGNHISALKRRYTRRISLF EIAGIIAESYNLLQRGRLPLVSEFSDETMKQNMLHVIIQEIEEGSCPIVIEKNGELLSVNDFDKDGLKFHLDYIIKIWKL QKRY ; 1 6 UNP Q49PL6_9POXV Q49PL6 ? 6 ;MSSFVTNGYLSVTLEPHELTLDIKTNIRNAVYKTYLHREISGKMAKKIEIREDVELPLGEIVNNSVVINVPCVITYAYYH VGDIVRGTLNIEDESNVTIQCGDLICKLSRDSGTVSFSDSKYCFFRNGNAYDNGSEVTAVLMEAQQGIESSFVFLANIVD S ; 1 7 UNP Q1PIU7_9POXV Q1PIU7 ? 7 ;MDSKETILIEIIPKIKAYLLDANISPKSYDDFISRNKNIFVINLYNVSTITEEDIRLLYTTIEQNIDADDQTLVAIFSYI GYKFEQAVKEEISTSLSFNDKNTTDEMTYNLYDLFFNTLDMYLRQKKISILVNDDVRGDVIVSYKNSDLVSSFNAELEPE IKKIPFNMKNLLPYLEKNLDQLRFSKKYLDFAYLCRHIGIPISKKKYNVRYVFLYKIDGLSIPIIIKDFLDVKYVYLENT GKIYKNSFSEDHNNSLSDWGKVIIPLLKDRHLYSYIFLSSYHLHSYYTDLIARDEPVFVKRKKLDIIEIDEPEAWKRDVR VEFAPCEHQIRLKEAMKVDANYFTKINNFANEFIYYEDGVAYCRVCGINIPIFNLDAADVIKNTVIVSTFNKTIFLSEPY SYFVHSQRFIFNIIMSFDNIMKSQTWVMKYNINRLILNFLIDINSRRQEYEKKFSSEIKRGLFFLRLSANLFESQVSSTE LFYVSKMLNLNYIVALVIILNSSADFIVSYMTSKNKTVEESTLKYAISVVIYDFLVKTRICEKGSLDTIVLFTDVYTSIM PEELDLHFQRITLELRKLVSIQRSALEPNYDVESRGEELPLSALKFFDTSTIIVKTMAPVHTCVEQKIVAPTPSVEPTDA SLKNFKELTCDEDIKILIRVHDTNATKLVIFPSHLKIEIERKKLIIPLKSLYITNTLKYYYSNSYLYVFRFGDPMPFEEE LIDHEHVQYKINCYNILRYHLLPDSDVFVYFSNSLNREALEYAFYIFLSKYVNVKQWIDENITRIKELYMINFNN ; 1 8 UNP Q49QI2_9POXV Q49QI2 ? 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12 ? 1 13 UNP Q49QE8_9POXV Q49QE8 ? 13 ;MNTGIIDLFDNHVDSIPTILPHQLATLDYLVRTIIDENRSVLLFHIMGSGKTIIALLFALVASRFKKVYILVPNINILKI FNYNMGVAMNLFNDEFIAENIFIHSTTSFYSLNYNDNVINYNGLSRYNNSIFIVDEAHNIFGNNTGELMTVIKNKNKIPF LLLSGSPITNTPNTLGHIIDLMSEETIDFGEIISRGKKVIQTLLNERGVNVLKDLLKGRISYYEMPDKDLPTIRYHGRKF LDTRVVYCHMSKLQERDYMITRRQLCYHEMFDKNMYNVSMAVLGQLNLMNNLDTLFQEQDKELYPNLKINNGVLYGEELV TLNISSKFKYFINRIQTLNGKHFIYFSNSTYGGLVIKYIMLSNGYSEYNGSQGTNPHMINGKPKTFAIVTSKMKSSLEDL LDVYNSPENDDGSQLMFLFSSNIMSESYTLKEVRHIWFMTIPDTFSQYNQILGRSIRKFSYADISEPVNVYLLAAVYSDF NDEVTSLNDYTQDELINVLPFDIKKLLYLKFKTKETNRIYSILQEMSETYSLPPHPSIVKVLLGELVRQFFYNNSRIKYN DTKLLKMVTSVIKNKEDARNYIDDIVNGHFFVSNKVFDKSLLYKYENDIITVPFRLSYEPFVWGVNFRKEYNVVSSP ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7AMV A 1 ? 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Q49QE8 1 ? 637 ? 1 637 # _struct_ref_seq_dif.align_id 2 _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code 7AMV _struct_ref_seq_dif.mon_id ASN _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id B _struct_ref_seq_dif.seq_num 6 _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code ? _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name UNP _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code Q49PH2 _struct_ref_seq_dif.db_mon_id ASP _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num 6 _struct_ref_seq_dif.details conflict _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num 6 _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7AMV _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7AMV _struct.title 'Atomic structure of the poxvirus transcription pre-initiation complex in the initially melted state' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7AMV _struct_keywords.text 'Vaccinia, Virus, RNA polymerase, DNA-dependent, pre-initiation complex, PIC, initially melted, poxvirus, poxviridae, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? 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J DA 25 N1 ? ? ? 1_555 L DT 36 N3 ? ? N DA 25 T DT 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? J DA 25 N6 ? ? ? 1_555 L DT 36 O4 ? ? N DA 25 T DT 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? J DT 26 N3 ? ? ? 1_555 L DA 35 N1 ? ? N DT 26 T DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? J DT 26 O4 ? ? ? 1_555 L DA 35 N6 ? ? N DT 26 T DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? J DA 42 N1 ? ? ? 1_555 L DT 19 N3 ? ? N DA 42 T DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? J DA 42 N6 ? ? ? 1_555 L DT 19 O4 ? ? N DA 42 T DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? J DT 43 N3 ? ? ? 1_555 L DA 18 N1 ? ? N DT 43 T DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? J DT 43 O4 ? ? ? 1_555 L DA 18 N6 ? ? N DT 43 T DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? J DC 44 N3 ? ? ? 1_555 L DG 17 N1 ? ? N DC 44 T DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? J DC 44 N4 ? ? ? 1_555 L DG 17 O6 ? ? N DC 44 T DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? J DC 44 O2 ? ? ? 1_555 L DG 17 N2 ? ? N DC 44 T DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? J DC 45 N3 ? ? ? 1_555 L DG 16 N1 ? ? N DC 45 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? J DC 45 N4 ? ? ? 1_555 L DG 16 O6 ? ? N DC 45 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? J DC 45 O2 ? ? ? 1_555 L DG 16 N2 ? ? N DC 45 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? J DA 46 N1 ? ? ? 1_555 L DT 15 N3 ? ? N DA 46 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? J DA 46 N6 ? ? ? 1_555 L DT 15 O4 ? ? N DA 46 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? J DT 47 N3 ? ? ? 1_555 L DA 14 N1 ? ? N DT 47 T DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? J DT 47 O4 ? ? ? 1_555 L DA 14 N6 ? ? N DT 47 T DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog61 hydrog ? ? J DA 48 N1 ? ? ? 1_555 L DT 13 N3 ? ? N DA 48 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? J DA 48 N6 ? ? ? 1_555 L DT 13 O4 ? ? N DA 48 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? J DA 49 N1 ? ? ? 1_555 L DG 11 N1 ? ? N DA 49 T DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? J DA 49 N6 ? ? ? 1_555 L DG 11 O6 ? ? N DA 49 T DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog65 hydrog ? ? J DC 50 O2 ? ? ? 1_555 L DG 11 N2 ? ? N DC 50 T DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog66 hydrog ? ? J DC 51 N3 ? ? ? 1_555 L DG 10 N2 ? ? N DC 51 T DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog67 hydrog ? ? J DC 52 N3 ? ? ? 1_555 L DG 9 N2 ? ? N DC 52 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog68 hydrog ? ? J DA 53 N1 ? ? ? 1_555 L DT 8 N3 ? ? N DA 53 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog69 hydrog ? ? J DA 53 N6 ? ? ? 1_555 L DT 8 O4 ? ? N DA 53 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog70 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 381 A . ? GLN 381 A PRO 382 A ? PRO 382 A 1 -1.55 2 GLU 1076 A . ? GLU 1076 A PRO 1077 A ? PRO 1077 A 1 -1.00 3 LEU 201 B . ? LEU 201 B PRO 202 B ? 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