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;GYTRERTNRHFFVARANAFFSRLPIARVQRSLAMEAVREGRMRPWKYTKEQILGAPVTCNFEYNPRPVRLIGTVMDAHTE ETSIKGGLKVYARNEETNMMLWIPPGNPKLRHEVTSTKGSFQHYLDERDKWDEAWITG ; ;GYTRERTNRHFFVARANAFFSRLPIARVQRSLAMEAVREGRMRPWKYTKEQILGAPVTCNFEYNPRPVRLIGTVMDAHTE ETSIKGGLKVYARNEETNMMLWIPPGNPKLRHEVTSTKGSFQHYLDERDKWDEAWITG ; AT ? 15 'polypeptide(L)' no no ;HYRAKLELDRIRSMLRGRARLERKVGLKRLFFLMRTQTRYRVEQQAHWERAIVRKNVDSAAREHGTGWQHLRNELGRQNV MLLPRSQQLLAQYEPLAFRAVVELCASRIPPPPPPVVASVPEESYTLWPPASHDNSECASTDGSDAPHGQQQSLSHPAAR VELRCGVERVLRRGPSGLGNNVNELIDAWKEFDVSP ; ;HYRAKLELDRIRSMLRGRARLERKVGLKRLFFLMRTQTRYRVEQQAHWERAIVRKNVDSAAREHGTGWQHLRNELGRQNV MLLPRSQQLLAQYEPLAFRAVVELCASRIPPPPPPVVASVPEESYTLWPPASHDNSECASTDGSDAPHGQQQSLSHPAAR VELRCGVERVLRRGPSGLGNNVNELIDAWKEFDVSP ; AU ? 16 'polypeptide(L)' no no ;NGLRCPDALITRTLNPLLNGPKFAVIYCGNHQYKVAVGDVIAVQRLRVEIGSHIALKKVLMVGGPRFTAIGRPLLEGVRV TAQVEEQKRMRNVVSLFATPGRRHVRWVDAPHAATIIRICEIFYSPNVVGELDKYKGELLETFTPGQHTNPVYPVDDGYD VFRKKDKEAMENATTFLDLL ; 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no ;NIKGGVGSFLMRRAAPKSIRQKYQTGPQFYKRKFFQFQKGHHRLHRRISGVQTGSPTHQREYERFHHLPGDVRTRPQFDF TFGETRADRVMFAWRKRGDLQLYQMSGRGETFVCYRCGYPVRSQLVAVKADNWDYRMCYRCYTNTVHRGMENDT(UNK) ; ;NIKGGVGSFLMRRAAPKSIRQKYQTGPQFYKRKFFQFQKGHHRLHRRISGVQTGSPTHQREYERFHHLPGDVRTRPQFDF TFGETRADRVMFAWRKRGDLQLYQMSGRGETFVCYRCGYPVRSQLVAVKADNWDYRMCYRCYTNTVHRGMENDTX ; XA ? 66 'polypeptide(L)' no no ;VPQQLKAYGGTFSRSVGERSNHLVSDVVLQSLSPSSTHNSPLLSKNIKTKTVTSFEDMPLYPELRSALRQLRITTPSPIQ QSAVEVIMQRKDTVVAAPHGEGKTLAYLLPLYQNMIKDRDVYKIPLRERRPRMILLAPTRELIAQLHHVCSVLGEATGLH AISFTSRKRANHRLSRLLKQQLVDVMIMDPKIVLRLIRARRVFLDDLRYVAVDEADGMLSSQHDHDAVHLLMKVQKRVMF KHLWPVQTQTVFATAFITRKLEFVVGKKYPDAVTCIRRQRMHRPPGTLRHRFLPVEREREKMDTLQHLLKKHGNRPREIL TDIEEEQAYSKPHYLSGSLEELVELRGLHLRRRPRMERHDHEGETPIATLSSTSAGDVSNYKVEENRSGFAAKGDNADEM KERVRHALEGVRPVHWGHLTTVAAPFTCHVPRTVFADGKRCIIFTRGIDCATAVYHRLRGCGYTCSLLHAALPAAVRRRM FADFASGRTNILCSTDVAARGLDLHVDFVVNFDMPTNALTYLSRAGRTARQGRLGQVYSLYTKRQGVIVSAVRAFLQKQL 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ATKHGMSFLFDEQMPSPLSNPLQFYRHLITKPVNMQVSVIRDPNSLTSIKSDLAVMQERKLVQIGDIDYSTRVREPCVYN VSERFTEKMEEILKTHRGPNSVVLSCYLPEDSSPFVMLREVFDLRHASFHDLYGLL ; XC ? 68 'polypeptide(L)' no yes ;QYLLNKDDVLTRVLEVVKNFEKVDASKVTPQSHFVNDLGLN(4HH)LDVVEVVFAIEQEFILDIPDHDAEKIQSITDAVE YISQNPM ; ;QYLLNKDDVLTRVLEVVKNFEKVDASKVTPQSHFVNDLGLNXLDVVEVVFAIEQEFILDIPDHDAEKIQSITDAVEYISQ NPM ; XD,XE ? 69 'polypeptide(L)' no no ;QSYLNAVVVSNQVLRAADDVLIALSIGEMEAVRQTHGNLIDCVAALDASLQQTTENEEGGGGNGATQEVDCLSTWPLFTT IQFLVEEGGLPLGPFPRMSRAYYRLKESTPVVAHSQLVWRTFELSRGPEGPTGELPAWPHRGFLRDIQRQIAEYTTDPPE RIMAGVTGEKGPLRARVSGARLGLQRTPARIPWTMQGL ; ;QSYLNAVVVSNQVLRAADDVLIALSIGEMEAVRQTHGNLIDCVAALDASLQQTTENEEGGGGNGATQEVDCLSTWPLFTT IQFLVEEGGLPLGPFPRMSRAYYRLKESTPVVAHSQLVWRTFELSRGPEGPTGELPAWPHRGFLRDIQRQIAEYTTDPPE RIMAGVTGEKGPLRARVSGARLGLQRTPARIPWTMQGL ; XF ? 70 'polypeptide(L)' no no ;KLPAGKPANKSWFRHNLIIRRKASYRSRWGTGAEGYGTGVPFSDQVKLHCVDNTNCKHVRLISKATAERFAHCRVFPAVA HRVSVQRFKSGRGEVSRHRVKPGNIYWVCLLSRRQTNTRMSGLRTNFDRNTCILMNDQRVPLGTRVMYCAGRHVNHKYHL KAVVLANFFV ; 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217 ? 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'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 FES non-polymer . 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' ? 'Fe2 S2' 175.820 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GTP non-polymer n "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O14 P3' 523.180 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 NAD non-polymer . NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE ? 'C21 H27 N7 O14 P2' 663.425 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7AOI _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7AOI _struct.title 'Trypanosoma brucei mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate' _struct.pdbx_descriptor ;bL28m, uL29m, uL30m, bL32m, bL33m, Ribosomal protein L3 mitochondrial, putative, Ribosomal protein L4/L1 family, RIBOSOMAL_L9 domain-containing protein, Ribosomal protein L11,uL11m, 50S ribosomal protein L13, Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein, 50S ribosomal protein L17, bL19m, bL20m, Ribosomal protein L21, Ribosomal protein L22p/L17e, Ribosomal protein L23, uL24m, mL41, mL42, Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain containing protein, mL49, mL52, mL53, mL63, mL64,mL64, mL67, mL68,mL68,mL68, mL70, mL71, Tetratricopeptide repeat, mL74, Mitochondrial RNA binding complex 1 subunit, mL76, Chaperone protein DNAj, putative,mL77,Chaperone protein DNAj, putative, mL78, mL80, mL81, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mL84, mL85, mL86, mL87, mL89, LIM domain containing protein,mL90, mL93, mL94, mL95, mL98, mL99, mL100,mL100, UNK1, UNK2, UNK3, UNK4, UNK5, UNK6/mt-LAF15_2, UNK7, UNK8, UNK9, UNK10, UNK11, mt-LAF7,mt-LAF7, DEAD-box helicase, putative,mt-LAF2, mt-LAF4, Acyl carrier protein, mt-LAF15_1, 50S ribosomal protein L14, mt-LAF8, mt-LAF14, RNA uridylyltransferase, GTP-binding protein, putative,mt-EngA, Complex1-LYR-like, mt-LAF12, SpoU rRNA Methylase family, Pseudouridylate synthase, putative, GTP-binding protein, Lipase (Class 3), mL101, mt-LAF19/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7AOI _struct_keywords.text 'mitochondria, translation, trypanosoma, assembly, evolution, ribosome, large subunit' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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LYS XT 73 ILE XT 79 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A5 CYS 70 A5 FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? metalc4 metalc ? ? D CYS 50 SG ? ? ? 1_555 FC FES . FE2 ? ? A5 CYS 75 A5 FES 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? ? metalc5 metalc ? ? TA CYS 19 SG ? ? ? 1_555 HC ZN . ZN ? ? BX CYS 79 BX ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? ? metalc6 metalc ? ? TA CYS 22 SG ? ? ? 1_555 HC ZN . ZN ? ? BX CYS 82 BX ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc7 metalc ? ? TA HIS 53 ND1 ? ? ? 1_555 HC ZN . ZN ? ? BX HIS 113 BX ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? ? metalc8 metalc ? ? TA CYS 56 SG ? ? ? 1_555 HC ZN . ZN ? ? BX CYS 116 BX ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc9 metalc ? ? TA CYS 59 SG ? ? ? 1_555 IC ZN . ZN ? ? BX CYS 119 BX ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? ? metalc10 metalc ? ? TA CYS 62 SG ? ? ? 1_555 IC ZN . ZN ? ? BX CYS 122 BX ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc11 metalc ? ? TA CYS 80 SG ? ? ? 1_555 IC ZN . ZN ? ? BX CYS 140 BX ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc12 metalc ? ? TA CYS 83 SG ? ? ? 1_555 IC ZN . ZN ? ? BX CYS 143 BX ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc13 metalc ? ? AB CYS 5 SG ? ? ? 1_555 JC ZN . ZN ? ? Bh CYS 6 Bh ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? ? metalc14 metalc ? ? AB CYS 8 SG ? ? ? 1_555 JC ZN . ZN ? ? Bh CYS 9 Bh ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc15 metalc ? ? AB CYS 31 SG ? ? ? 1_555 JC ZN . ZN ? ? Bh CYS 32 Bh ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? ? metalc16 metalc ? ? AB CYS 34 SG ? ? ? 1_555 JC ZN . ZN ? ? Bh CYS 35 Bh ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc17 metalc ? ? MB CYS 114 SG ? ? ? 1_555 KC ZN . ZN ? ? XA CYS 116 XA ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? ? metalc18 metalc ? ? MB CYS 117 SG ? ? ? 1_555 KC ZN . ZN ? ? XA CYS 119 XA ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? ? metalc19 metalc ? ? MB CYS 138 SG ? ? ? 1_555 KC ZN . ZN ? ? XA CYS 140 XA ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc20 metalc ? ? MB CYS 141 SG ? ? ? 1_555 KC ZN . ZN ? ? XA CYS 143 XA ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc21 metalc ? ? LC MG . MG ? ? ? 1_555 MC ADP . O1B ? ? 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AA A 22 AA U 95 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? F U 23 N3 ? ? ? 1_555 F U 94 O2 ? ? AA U 23 AA U 94 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? F U 23 O4 ? ? ? 1_555 F U 94 N3 ? ? AA U 23 AA U 94 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? F U 24 N3 ? ? ? 1_555 F A 93 N1 ? ? AA U 24 AA A 93 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? F U 24 O4 ? ? ? 1_555 F A 93 N6 ? ? AA U 24 AA A 93 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? F A 25 N1 ? ? ? 1_555 F U 92 N3 ? ? AA A 25 AA U 92 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? F A 25 N6 ? ? ? 1_555 F U 92 O4 ? ? AA A 25 AA U 92 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? F U 26 N3 ? ? ? 1_555 F U 91 O4 ? ? AA U 26 AA U 91 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? F U 26 O2 ? ? ? 1_555 F U 91 N3 ? ? AA U 26 AA U 91 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? F A 27 N1 ? ? ? 1_555 F U 86 N3 ? ? AA A 27 AA U 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? F A 27 N6 ? ? ? 1_555 F U 86 O4 ? ? AA A 27 AA U 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? F U 59 O4 ? ? ? 1_555 F A 72 N6 ? ? AA U 59 AA A 72 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? F A 63 N6 ? ? ? 1_555 F G 70 N7 ? ? AA A 63 AA G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? F U 107 N3 ? ? ? 1_555 F U 117 O4 ? ? AA U 107 AA U 117 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? F U 107 O2 ? ? ? 1_555 F U 117 N3 ? ? AA U 107 AA U 117 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? F U 125 N3 ? ? ? 1_555 F A 140 N1 ? ? AA U 125 AA A 140 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? F U 125 O4 ? ? ? 1_555 F A 140 N6 ? ? AA U 125 AA A 140 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? F A 126 N1 ? ? ? 1_555 F U 139 N3 ? ? AA A 126 AA U 139 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? F A 126 N6 ? ? ? 1_555 F U 139 O4 ? ? AA A 126 AA U 139 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? F A 127 N1 ? ? ? 1_555 F U 138 N3 ? ? AA A 127 AA U 138 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? F A 127 N6 ? ? ? 1_555 F U 138 O4 ? ? AA A 127 AA U 138 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? F A 128 N1 ? ? ? 1_555 F U 137 N3 ? ? AA A 128 AA U 137 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? F A 128 N6 ? ? ? 1_555 F U 137 O4 ? ? AA A 128 AA U 137 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? F U 129 N3 ? ? ? 1_555 F U 136 O4 ? ? AA U 129 AA U 136 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? F U 129 O2 ? ? ? 1_555 F U 136 N3 ? ? AA U 129 AA U 136 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? F U 134 N3 ? ? ? 1_555 F A 487 N7 ? ? AA U 134 AA A 826 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? F U 134 O4 ? ? ? 1_555 F A 487 N6 ? ? AA U 134 AA A 826 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? F U 141 N3 ? ? ? 1_555 F A 379 N1 ? ? AA U 141 AA A 503 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? F U 141 O4 ? ? ? 1_555 F A 379 N6 ? ? AA U 141 AA A 503 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? F A 142 N1 ? ? ? 1_555 F U 378 N3 ? ? AA A 142 AA U 502 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? F A 142 N6 ? ? ? 1_555 F U 378 O4 ? ? AA A 142 AA U 502 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? F U 143 N3 ? ? ? 1_555 F A 377 N1 ? ? AA U 143 AA A 501 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? F U 143 O4 ? ? ? 1_555 F A 377 N6 ? ? AA U 143 AA A 501 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? F U 144 N3 ? ? ? 1_555 F A 376 N1 ? ? AA U 144 AA A 500 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? F U 144 O4 ? ? ? 1_555 F A 376 N6 ? ? AA U 144 AA A 500 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? F U 145 N3 ? ? ? 1_555 F U 375 O4 ? ? AA U 145 AA U 499 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? F U 145 O2 ? ? ? 1_555 F U 375 N3 ? ? AA U 145 AA U 499 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? F A 148 N6 ? ? ? 1_555 F A 371 N7 ? ? AA A 148 AA A 495 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? F A 148 N7 ? ? ? 1_555 F A 371 N6 ? ? AA A 148 AA A 495 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_2_PAIR ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? F A 162 N1 ? ? ? 1_555 F U 169 N3 ? ? AA A 162 AA U 169 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? F A 162 N6 ? ? ? 1_555 F U 169 O4 ? ? AA A 162 AA U 169 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? F U 163 O2 ? ? ? 1_555 F A 168 N6 ? ? AA U 163 AA A 168 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? F U 183 N3 ? ? ? 1_555 F A 240 N1 ? ? AA U 183 AA A 293 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? F U 183 O4 ? ? ? 1_555 F A 240 N6 ? ? AA U 183 AA A 293 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? 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F U 649 N3 ? ? ? 1_555 F U 663 O2 ? ? AA U 1006 AA U 1077 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog269 hydrog ? ? F U 649 O4 ? ? ? 1_555 F U 663 N3 ? ? AA U 1006 AA U 1077 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog270 hydrog ? ? F U 649 O2 ? ? ? 1_555 F A 665 N6 ? ? AA U 1006 AA A 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog271 hydrog ? ? F C 650 N3 ? ? ? 1_555 F G 662 N1 ? ? AA C 1007 AA G 1076 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog272 hydrog ? ? F C 650 N4 ? ? ? 1_555 F G 662 O6 ? ? AA C 1007 AA G 1076 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog273 hydrog ? ? F C 650 O2 ? ? ? 1_555 F G 662 N2 ? ? AA C 1007 AA G 1076 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog274 hydrog ? ? F A 651 N1 ? ? ? 1_555 F U 661 N3 ? ? AA A 1008 AA U 1075 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog275 hydrog ? ? F G 654 N1 ? ? ? 1_555 F C 658 N3 ? ? AA G 1011 AA C 1072 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog276 hydrog ? ? F G 654 N2 ? ? ? 1_555 F C 658 O2 ? ? AA G 1011 AA C 1072 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog277 hydrog ? ? F G 654 O6 ? ? ? 1_555 F C 658 N4 ? ? AA G 1011 AA C 1072 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog278 hydrog ? ? F U 655 N3 ? ? ? 1_555 F U 657 O4 ? ? AA U 1012 AA U 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog279 hydrog ? ? F U 655 O2 ? ? ? 1_555 F U 657 N3 ? ? AA U 1012 AA U 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog280 hydrog ? ? F U 705 N3 ? ? ? 1_555 F A 730 N1 ? ? AA U 1123 AA A 1148 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog281 hydrog ? ? F U 705 O4 ? ? ? 1_555 F A 730 N6 ? ? AA U 1123 AA A 1148 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog282 hydrog ? ? F A 706 N1 ? ? ? 1_555 F U 729 N3 ? ? AA A 1124 AA U 1147 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog283 hydrog ? ? F A 706 N6 ? ? ? 1_555 F U 729 O4 ? ? AA A 1124 AA U 1147 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog284 hydrog ? ? F A 707 N1 ? ? ? 1_555 F U 728 N3 ? ? AA A 1125 AA U 1146 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog285 hydrog ? ? F A 707 N6 ? ? ? 1_555 F U 728 O4 ? ? AA A 1125 AA U 1146 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog286 hydrog ? ? F U 708 N3 ? ? ? 1_555 F A 727 N1 ? ? AA U 1126 AA A 1145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog287 hydrog ? ? F U 708 O4 ? ? ? 1_555 F A 727 N6 ? ? AA U 1126 AA A 1145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog288 hydrog ? ? F A 711 N1 ? ? ? 1_555 F U 725 N3 ? ? AA A 1129 AA U 1143 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog289 hydrog ? ? F A 712 N6 ? ? ? 1_555 F U 724 O4 ? ? AA A 1130 AA U 1142 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog290 hydrog ? ? F U 714 N3 ? ? ? 1_555 F A 723 N7 ? ? AA U 1132 AA A 1141 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog291 hydrog ? ? F U 714 O2 ? ? ? 1_555 F A 723 N6 ? ? AA U 1132 AA A 1141 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog292 hydrog ? ? F A 715 N6 ? ? ? 1_555 F G 722 N3 ? ? AA A 1133 AA G 1140 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog293 hydrog ? ? F A 715 N7 ? ? ? 1_555 F G 722 N2 ? ? AA A 1133 AA G 1140 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog294 hydrog ? ? F C 716 N3 ? ? ? 1_555 F G 721 N1 ? ? AA C 1134 AA G 1139 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog295 hydrog ? ? F C 716 N4 ? ? ? 1_555 F G 721 O6 ? ? AA C 1134 AA G 1139 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog296 hydrog ? ? F C 716 O2 ? ? ? 1_555 F G 721 N2 ? ? AA C 1134 AA G 1139 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog297 hydrog ? ? F G 717 N2 ? ? ? 1_555 F A 720 N7 ? ? AA G 1135 AA A 1138 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 116 B . ? TYR 124 A2 PRO 117 B ? PRO 125 A2 1 -0.96 2 PHE 285 B . ? PHE 293 A2 PRO 286 B ? PRO 294 A2 1 -5.32 3 TRP 379 B . ? TRP 387 A2 PRO 380 B ? 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anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD3 5 6 ? anti-parallel AD3 6 7 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 6 7 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? 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parallel AI9 2 3 ? parallel AI9 3 4 ? parallel AJ1 1 2 ? anti-parallel AJ2 1 2 ? anti-parallel AJ2 2 3 ? anti-parallel AJ2 3 4 ? anti-parallel AJ3 1 2 ? parallel AJ4 1 2 ? anti-parallel AJ5 1 2 ? parallel AJ5 2 3 ? anti-parallel AJ6 1 2 ? anti-parallel AJ6 2 3 ? anti-parallel AJ6 3 4 ? anti-parallel AJ6 4 5 ? anti-parallel AJ7 1 2 ? parallel AJ7 2 3 ? parallel AJ7 3 4 ? parallel AJ7 4 5 ? parallel AJ7 5 6 ? parallel AJ7 6 7 ? parallel AJ8 1 2 ? parallel AJ8 2 3 ? parallel AJ8 3 4 ? parallel AJ8 4 5 ? parallel AJ8 5 6 ? parallel AJ9 1 2 ? anti-parallel AK1 1 2 ? parallel AK2 1 2 ? anti-parallel AK2 2 3 ? anti-parallel AK2 3 4 ? anti-parallel AK3 1 2 ? anti-parallel AK3 2 3 ? parallel AK3 3 4 ? anti-parallel AK3 4 5 ? anti-parallel AK3 5 6 ? anti-parallel AK3 6 7 ? anti-parallel AK4 1 2 ? anti-parallel AK4 2 3 ? anti-parallel AK5 1 2 ? anti-parallel AK5 2 3 ? anti-parallel AK6 1 2 ? anti-parallel AK7 1 2 ? anti-parallel AK8 1 2 ? anti-parallel AK9 1 2 ? parallel AK9 2 3 ? anti-parallel AK9 3 4 ? 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n YB 76 347 CYS 347 395 395 CYS CYS XN . n YB 76 348 PRO 348 396 396 PRO PRO XN . n YB 76 349 LEU 349 397 397 LEU LEU XN . n YB 76 350 LEU 350 398 398 LEU LEU XN . n YB 76 351 PHE 351 399 399 PHE PHE XN . n YB 76 352 ALA 352 400 400 ALA ALA XN . n YB 76 353 ILE 353 401 401 ILE ILE XN . n YB 76 354 PRO 354 402 402 PRO PRO XN . n YB 76 355 HIS 355 403 403 HIS HIS XN . n YB 76 356 MET 356 404 404 MET MET XN . n YB 76 357 ARG 357 405 405 ARG ARG XN . n YB 76 358 THR 358 406 406 THR THR XN . n YB 76 359 VAL 359 407 407 VAL VAL XN . n YB 76 360 VAL 360 408 408 VAL VAL XN . n YB 76 361 ASP 361 409 409 ASP ASP XN . n YB 76 362 LEU 362 410 410 LEU LEU XN . n YB 76 363 HIS 363 411 411 HIS HIS XN . n YB 76 364 ALA 364 412 412 ALA ALA XN . n YB 76 365 GLU 365 413 413 GLU GLU XN . n YB 76 366 HIS 366 414 414 HIS HIS XN . n YB 76 367 MET 367 415 415 MET MET XN . n YB 76 368 ILE 368 416 416 ILE ILE XN . n YB 76 369 PRO 369 417 417 PRO PRO XN . n YB 76 370 THR 370 418 418 THR THR XN . n YB 76 371 ILE 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n YB 76 469 LEU 469 517 517 LEU LEU XN . n YB 76 470 LEU 470 518 518 LEU LEU XN . n YB 76 471 TYR 471 519 519 TYR TYR XN . n YB 76 472 VAL 472 520 520 VAL VAL XN . n YB 76 473 MET 473 521 521 MET MET XN . n YB 76 474 GLN 474 522 522 GLN GLN XN . n YB 76 475 TRP 475 523 523 TRP TRP XN . n YB 76 476 SER 476 524 524 SER SER XN . n YB 76 477 GLY 477 525 525 GLY GLY XN . n YB 76 478 HIS 478 526 526 HIS HIS XN . n YB 76 479 ILE 479 527 527 ILE ILE XN . n YB 76 480 LYS 480 528 528 LYS LYS XN . n YB 76 481 ASP 481 529 529 ASP ASP XN . n YB 76 482 PHE 482 530 530 PHE PHE XN . n YB 76 483 LEU 483 531 531 LEU LEU XN . n YB 76 484 GLY 484 532 532 GLY GLY XN . n YB 76 485 VAL 485 533 533 VAL VAL XN . n YB 76 486 ARG 486 534 534 ARG ARG XN . n YB 76 487 GLY 487 535 535 GLY GLY XN . n YB 76 488 MET 488 536 536 MET MET XN . n YB 76 489 ARG 489 537 537 ARG ARG XN . n YB 76 490 GLN 490 538 538 GLN GLN XN . n YB 76 491 ARG 491 539 539 ARG ARG XN . n YB 76 492 LEU 492 540 540 LEU LEU XN . n YB 76 493 ALA 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