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EMDB EMD-12192 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'different focussed portion of volume' EMD-12183 'other EM volume' EMDB 'different focussed portion of volume' EMD-12190 'other EM volume' EMDB 'Salmonella export gate and rod refined in focussed C1 map' EMD-12192 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7BIN _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-01-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Johnson, S.' 1 0000-0002-7877-3543 'Furlong, E.' 2 0000-0002-9086-2979 'Lea, S.M.' 3 0000-0001-9287-8053 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Microbiol' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2058-5276 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 6 _citation.language ? _citation.page_first 712 _citation.page_last 721 _citation.title 'Molecular structure of the intact bacterial flagellar basal body.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41564-021-00895-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 33931760 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Johnson, S.' 1 ? primary 'Furlong, E.J.' 2 ? primary 'Deme, J.C.' 3 ? primary 'Nord, A.L.' 4 ? primary 'Caesar, J.J.E.' 5 ? primary 'Chevance, F.F.V.' 6 ? primary 'Berry, R.M.' 7 ? primary 'Hughes, K.T.' 8 ? primary 'Lea, S.M.' 9 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7BIN _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? 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ASN n 1 77 ALA n 1 78 LEU n 1 79 GLY n 1 80 THR n 1 81 PRO n 1 82 SER n 1 83 ALA n 1 84 PRO n 1 85 PRO n 1 86 ASN n 1 87 GLN n 1 88 VAL n 1 89 LEU n 1 90 LEU n 1 91 GLY n 1 92 LEU n 1 93 ALA n 1 94 LEU n 1 95 PHE n 1 96 LEU n 1 97 THR n 1 98 PHE n 1 99 PHE n 1 100 ILE n 1 101 MET n 1 102 SER n 1 103 PRO n 1 104 VAL n 1 105 ILE n 1 106 ASP n 1 107 LYS n 1 108 ILE n 1 109 TYR n 1 110 VAL n 1 111 ASP n 1 112 ALA n 1 113 TYR n 1 114 GLN n 1 115 PRO n 1 116 PHE n 1 117 SER n 1 118 GLU n 1 119 GLN n 1 120 LYS n 1 121 ILE n 1 122 SER n 1 123 MET n 1 124 GLN n 1 125 GLU n 1 126 ALA n 1 127 LEU n 1 128 ASP n 1 129 LYS n 1 130 GLY n 1 131 ALA n 1 132 GLN n 1 133 PRO n 1 134 LEU n 1 135 ARG n 1 136 ALA n 1 137 PHE n 1 138 MET n 1 139 LEU n 1 140 ARG n 1 141 GLN n 1 142 THR n 1 143 ARG n 1 144 GLU n 1 145 ALA n 1 146 ASP n 1 147 LEU n 1 148 ALA n 1 149 LEU n 1 150 PHE n 1 151 ALA n 1 152 ARG n 1 153 LEU n 1 154 ALA n 1 155 ASN n 1 156 SER n 1 157 GLY n 1 158 PRO n 1 159 LEU n 1 160 GLN n 1 161 GLY 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LEU n 8 81 HIS n 8 82 SER n 8 83 GLN n 8 84 GLY n 8 85 ASN n 8 86 LEU n 8 87 SER n 8 88 GLN n 8 89 THR n 8 90 ASN n 8 91 ASN n 8 92 SER n 8 93 LYS n 8 94 ASP n 8 95 VAL n 8 96 ALA n 8 97 ILE n 8 98 LYS n 8 99 GLY n 8 100 GLN n 8 101 GLY n 8 102 PHE n 8 103 PHE n 8 104 GLN n 8 105 VAL n 8 106 MET n 8 107 LEU n 8 108 PRO n 8 109 ASP n 8 110 GLY n 8 111 THR n 8 112 SER n 8 113 ALA n 8 114 TYR n 8 115 THR n 8 116 ARG n 8 117 ASP n 8 118 GLY n 8 119 SER n 8 120 PHE n 8 121 GLN n 8 122 VAL n 8 123 ASP n 8 124 GLN n 8 125 ASN n 8 126 GLY n 8 127 GLN n 8 128 LEU n 8 129 VAL n 8 130 THR n 8 131 ALA n 8 132 GLY n 8 133 GLY n 8 134 PHE n 8 135 GLN n 8 136 VAL n 8 137 GLN n 8 138 PRO n 8 139 ALA n 8 140 ILE n 8 141 THR n 8 142 ILE n 8 143 PRO n 8 144 ALA n 8 145 ASN n 8 146 ALA n 8 147 LEU n 8 148 SER n 8 149 ILE n 8 150 THR n 8 151 ILE n 8 152 GLY n 8 153 ARG n 8 154 ASP n 8 155 GLY n 8 156 VAL n 8 157 VAL n 8 158 SER n 8 159 VAL n 8 160 THR n 8 161 GLN n 8 162 GLN n 8 163 GLY n 8 164 GLN n 8 165 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n 8 249 THR n 8 250 THR n 8 251 ASP n 8 252 GLN n 8 253 MET n 8 254 LEU n 8 255 GLN n 8 256 LYS n 8 257 LEU n 8 258 THR n 8 259 GLN n 8 260 LEU n # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 245 ? 'Salmonella typhi' 90370 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 264 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 89 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 104 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? 'LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 138 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? 'LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 134 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? 'LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 251 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? 'LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 260 ? 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi' 90370 ? ? 'LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q8Z5R3_SALTI Q8Z5R3 ? 1 ;MRRLLFLSLAGLWLFSPAAAAQLPGLISQPLAGGGQSWSLSVQTLVFITSLTFLPAILLMMTSFTRIIIVFGLLRNALGT PSAPPNQVLLGLALFLTFFIMSPVIDKIYVDAYQPFSEQKISMQEALDKGAQPLRAFMLRQTREADLALFARLANSGPLQ GPEAVPMRILLPAYVTSELKTAFQIGFTIFIPFLIIDLVIASVLMALGMMMVPPATIALPFKLMLFVLVDGWQLLVGSLA QSFYS ; 1 2 UNP A0A3U0BCQ2_SALET A0A3U0BCQ2 ? 2 ;MIQVTSEQWLYWLHLYFWPLLRVLALISTAPILSERAIPKRVKLGLGIMITLVIAPSLPANDTPLFSIAALWLAMQQILI GIALGFTMQFAFAAVRTAGEFIGLQMGLSFATFVDPGSHLNMPVLARIMDMLAMLLFLTFNGHLWLISLLVDTFHTLPIG SNPVNSNAFMALARAGGLIFLNGLMLALPVITLLLTLNLALGLLNRMAPQLSIFVIGFPLTLTVGIMLMAALMPLIAPFC EHLFSEIFNLLADIVSEMPINNNP ; 1 3 UNP A0A3Y0WXN7_SALET A0A3Y0WXN7 ? 3 ;MTPESVMMMGTEAMKVALALAAPLLLVALITGLIISILQAATQINEMTLSFIPKIVAVFIAIIVAGPWMLNLLLDYVRTL FSNLPYIIG ; 1 4 UNP FLIE_SALTY P26462 ? 4 ;MAAIQGIEGVISQLQATAMAARGQDTHSQSTVSFAGQLHAALDRISDRQAAARVQAEKFTLGEPGIALNDVMADMQKASV SMQMGIQVRNKLVAAYQEVMSMQV ; 1 5 UNP FLGB_SALTY P16437 ? 5 ;MLDRLDAALRFQQEALNLRAQRQEILAANIANADTPGYQARDIDFASELKKVMVRGREETGGVALTLTSSHHIPAQAVSS PAVDLLYRVPDQPSLDGNTVDMDRERTQFADNSLKYQMGLTVLGSQLKGMMNVLQGGN ; 1 6 UNP FLGC_SALTY P0A1I7 ? 6 ;MALLNIFDIAGSALAAQSKRLNVAASNLANADSVTGPDGQPYRAKQVVFQVDAAPGQATGGVKVASVIESQAPEKLVYEP GNPLADANGYVKMPNVDVVGEMVNTMSASRSYQANIEVLNTVKSMMLKTLTLGQ ; 1 7 UNP FLGF_SALTY P16323 ? 7 ;MDHAIYTAMGAASQTLNQQAVTASNLANASTPGFRAQLNALRAVPVDGLSLATRTLVTASTPGADMTPGQLDYTSRPLDV ALQQDGWLVVQAADGAEGYTRNGNIQVGPTGQLTIQGHPVIGEGGPITVPEGSEITIAADGTISALNPGDPPNTVAPVGR LKLVKAEGNEVQRSDDGLFRLTAEAQAERGAVLAADPSIRIMSGVLEGSNVKPVEAMTDMIANARRFEMQMKVITSVDEN EGRANQLLSMS ; 1 8 UNP FLGG_SALTY P0A1J3 ? 8 ;MISSLWIAKTGLDAQQTNMDVIANNLANVSTNGFKRQRAVFEDLLYQTIRQPGAQSSEQTTLPSGLQIGTGVRPVATERL HSQGNLSQTNNSKDVAIKGQGFFQVMLPDGTSAYTRDGSFQVDQNGQLVTAGGFQVQPAITIPANALSITIGRDGVVSVT QQGQAAPVQVGQLNLTTFMNDTGLESIGENLYIETQSSGAPNESTPGLNGAGLLYQGYVETSNVNVAEELVNMIQVQRAY EINSKAVSTTDQMLQKLTQL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7BIN A 1 ? 245 ? 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P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 46 8 7BIN t 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 47 8 7BIN u 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 48 8 7BIN v 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 49 8 7BIN w 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 50 8 7BIN x 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 51 8 7BIN y 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 52 8 7BIN z 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 53 8 7BIN 1 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 54 8 7BIN 2 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 55 8 7BIN 3 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 56 8 7BIN 4 1 ? 260 ? P0A1J3 1 ? 260 ? 1 260 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7BIN MET A 236 ? 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AZ9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? 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