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_citation.title 'Snapshots of native pre-50S ribosomes reveal a biogenesis factor network and evolutionary specialization.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2021.02.006 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33639093 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nikolay, R.' 1 ? primary 'Hilal, T.' 2 ? primary 'Schmidt, S.' 3 ? primary 'Qin, B.' 4 ? primary 'Schwefel, D.' 5 ? primary 'Vieira-Vieira, C.H.' 6 ? primary 'Mielke, T.' 7 ? primary 'Burger, J.' 8 ? primary 'Loerke, J.' 9 ? primary 'Amikura, K.' 10 ? primary 'Flugel, T.' 11 ? primary 'Ueda, T.' 12 ? primary 'Selbach, M.' 13 ? primary 'Deuerling, E.' 14 ? primary 'Spahn, C.M.T.' 15 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation 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CGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUC CUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAG GCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUG UGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAA CCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGG UAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAA ACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUC GGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGG GUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAU GUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGU CGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGG AGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAU AAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUA AGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGA AGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCU GAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACA UCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAG GCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCG AAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCC UGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAA CUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGU CUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACC UUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGC AUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCU 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;MKFVDEASILVVAGDGGNGCVSFRREKYIPKGGPDGGDGGDGGDVWMEADENLNTLIDYRFEKSFRAERGQNGASRDCTG KRGKDVTIKVPVGTRVIDQGTGETMGDMTKHGQRLLVAKGGWHGLGNTRFKSSVNRTPRQKTNGTPGDKRELLLELMLLA DVGMLGMPNAGKSTFIRAVSAAKPKVADYPFTTLVPSLGVVRMDNEKSFVVADIPGLIEGAAEGAGLGIRFLKHLERCRV LLHLIDIDPIDGTDPVENARIIISELEKYSQDLATKPRWLVFNKIDLLDKVEAEEKAKAIAEALGWEDKYYLISAASGLG VKDLCWDVMTFIIENPVVQAEEAKQPEKVEFMWDDYHRQQLEEIAEEDDEDWDDDWDEDDEEGVEFIYKR ; ;MKFVDEASILVVAGDGGNGCVSFRREKYIPKGGPDGGDGGDGGDVWMEADENLNTLIDYRFEKSFRAERGQNGASRDCTG KRGKDVTIKVPVGTRVIDQGTGETMGDMTKHGQRLLVAKGGWHGLGNTRFKSSVNRTPRQKTNGTPGDKRELLLELMLLA DVGMLGMPNAGKSTFIRAVSAAKPKVADYPFTTLVPSLGVVRMDNEKSFVVADIPGLIEGAAEGAGLGIRFLKHLERCRV LLHLIDIDPIDGTDPVENARIIISELEKYSQDLATKPRWLVFNKIDLLDKVEAEEKAKAIAEALGWEDKYYLISAASGLG VKDLCWDVMTFIIENPVVQAEEAKQPEKVEFMWDDYHRQQLEEIAEEDDEDWDDDWDEDDEEGVEFIYKR ; 9P1 ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAVVKCKPTSPGRRHVVKVVNPELHKGKPFAPLLEKNSKSGGRNNNGRITTRHIGGGHKQAYRIVDFKRNKDGIPAVVER LEYDPNRSANIALVLYKDGERRYILAPKGLKAGDQIQSGVDAAIKPGNTLPMRNIPVGSTVHNVEMKPGKGGQLARSAGT YVQIVARDGAYVTLRLRSGEMRKVEADCRATLGEVGNAEHMLRVLGKAGAARWRGVRPTVRGTAMNPVDHPHGGGEGRNF GKHPVTPWGVQTKGKKTRSNKRTDKFIVRRRSK ; ;MAVVKCKPTSPGRRHVVKVVNPELHKGKPFAPLLEKNSKSGGRNNNGRITTRHIGGGHKQAYRIVDFKRNKDGIPAVVER LEYDPNRSANIALVLYKDGERRYILAPKGLKAGDQIQSGVDAAIKPGNTLPMRNIPVGSTVHNVEMKPGKGGQLARSAGT YVQIVARDGAYVTLRLRSGEMRKVEADCRATLGEVGNAEHMLRVLGKAGAARWRGVRPTVRGTAMNPVDHPHGGGEGRNF GKHPVTPWGVQTKGKKTRSNKRTDKFIVRRRSK ; C ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MIGLVGKKVGMTRIFTEDGVSIPVTVIEVEANRVTQVKDLANDGYRAIQVTTGAKKANRVTKPEAGHFAKAGVEAGRGLW EFRLAEGEEFTVGQSISVELFADVKKVDVTGTSKGKGFAGTVKRWNFRTQDATHGNSLSHRVPGSIGQNQTPGKVFKGKK MAGQMGNERVTVQSLDVVRVDAERNLLLVKGAVPGATGSDLIVKPAVKA ; ;MIGLVGKKVGMTRIFTEDGVSIPVTVIEVEANRVTQVKDLANDGYRAIQVTTGAKKANRVTKPEAGHFAKAGVEAGRGLW EFRLAEGEEFTVGQSISVELFADVKKVDVTGTSKGKGFAGTVKRWNFRTQDATHGNSLSHRVPGSIGQNQTPGKVFKGKK MAGQMGNERVTVQSLDVVRVDAERNLLLVKGAVPGATGSDLIVKPAVKA ; D ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MELVLKDAQSALTVSETTFGRDFNEALVHQVVVAYAAGARQGTRAQKTRAEVTGSGKKPWRQKGTGRARSGSIKSPIWRS GGVTFAARPQDHSQKVNKKMYRGALKSILSELVRQDRLIVVEKFSVEAPKTKLLAQKLKDMALEDVLIITGELDENLFLA ARNLHKVDVRDATGIDPVSLIAFDKVVMTADAVKQVEEMLA ; ;MELVLKDAQSALTVSETTFGRDFNEALVHQVVVAYAAGARQGTRAQKTRAEVTGSGKKPWRQKGTGRARSGSIKSPIWRS GGVTFAARPQDHSQKVNKKMYRGALKSILSELVRQDRLIVVEKFSVEAPKTKLLAQKLKDMALEDVLIITGELDENLFLA ARNLHKVDVRDATGIDPVSLIAFDKVVMTADAVKQVEEMLA ; E ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSRVAKAPVVVPAGVDVKINGQVITIKGKNGELTRTLNDAVEVKHADNTLTFGPRDGYADGWAQAGTARALLNSMVIGVT EGFTKKLQLVGVGYRAAVKGNVINLSLGFSHPVDHQLPAGITAECPTQTEIVLKGADKQVIGQVAADLRAYRRPEPYKGK GVRYADEVVRTKEAKKK ; ;MSRVAKAPVVVPAGVDVKINGQVITIKGKNGELTRTLNDAVEVKHADNTLTFGPRDGYADGWAQAGTARALLNSMVIGVT EGFTKKLQLVGVGYRAAVKGNVINLSLGFSHPVDHQLPAGITAECPTQTEIVLKGADKQVIGQVAADLRAYRRPEPYKGK GVRYADEVVRTKEAKKK ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; J ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MRLNTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLS DLAKVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIEE ; ;MRLNTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLS DLAKVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIEE ; L ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MRHRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLF NELGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELVDRSEKAEAAAE ; ;MRHRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLF NELGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELVDRSEKAEAAAE ; N ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MDKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAE RALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF ; ;MDKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAE RALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF ; O ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFI NGLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA ; ;MARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFI NGLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA ; Q ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRR KHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA ; ;MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRR KHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA ; R ? 14 'polypeptide(L)' no no ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; ;METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGP SMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; S ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDW KKAYVTLKEGQNLDFVGGAE ; ;MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDW KKAYVTLKEGQNLDFVGGAE ; T ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MAAKIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKA DRVGFRFEDGKKVRFFKSNSETIK ; ;MAAKIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKA DRVGFRFEDGKKVRFFKSNSETIK ; U ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; V ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MAHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFI SIEAE ; ;MAHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFI SIEAE ; W ? 19 'polypeptide(L)' no no MSRVCQVTGKRPVTGNNRSHALNATKRRFLPNLHSHRFWVESEKRFVTLRVSAKGMRVIDKKGIDTVLAELRARGEKY MSRVCQVTGKRPVTGNNRSHALNATKRRFLPNLHSHRFWVESEKRFVTLRVSAKGMRVIDKKGIDTVLAELRARGEKY X ? 20 'polypeptide(L)' no no MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEKAGA MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEKAGA Y ? 21 'polypeptide(L)' no no MAKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE MAKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE Z ? 22 'polypeptide(L)' no no MAVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK MAVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK 0 ? 23 'polypeptide(L)' no no MAKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAKIK MAKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAKIK 1 ? 24 'polypeptide(L)' no no MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK 2 ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MAKKVQAYVKLQVAAGMANPSPPVGPALGQQGVNIMEFCKAFNAKTDSIEKGLPIPVVITVYADRSFTFVTKTPPAAVLL KKAAGIKSGSGKPNKDKVGKISRAQLQEIAQTKAADMTGADIEAMTRSIEGTARSMGLVVED ; ;MAKKVQAYVKLQVAAGMANPSPPVGPALGQQGVNIMEFCKAFNAKTDSIEKGLPIPVVITVYADRSFTFVTKTPPAAVLL KKAAGIKSGSGKPNKDKVGKISRAQLQEIAQTKAADMTGADIEAMTRSIEGTARSMGLVVED ; I ? 26 'polypeptide(L)' no no ;MIQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFD GNACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL ; ;MIQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFD GNACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL ; K ? 27 'polypeptide(L)' no no ;MSNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPV VDSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; ;MSNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPV VDSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; P ? 28 'polypeptide(L)' no no ;MQGKALQDFVIDKIDDLKGQDIIALDVQGKSSITDCMIICTGTSSRHVMSIADHVVQESRAAGLLPLGVEGENSADWIVV DLGDVIVHVMQEESRRLYELEKLWS ; ;MQGKALQDFVIDKIDDLKGQDIIALDVQGKSSITDCMIICTGTSSRHVMSIADHVVQESRAAGLLPLGVEGENSADWIVV DLGDVIVHVMQEESRRLYELEKLWS ; 6 ? 29 'polypeptide(L)' no no ;MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTI ASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE ; ;MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTI ASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE ; H ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MAKLHDYYKDEVVKKLMTEFNYNSVMQVPRVEKITLNMGVGEAIADKKLLDNAAADLAAISGQKPLITKARKSVAGFKIR QGYPIGCKVTLRGERMWEFFERLITIAVPRIRDFRGLSAKSFDGRGNYSMGVREQIIFPEIDYDKVDRVRGLDITITTTA KSDEEGRALLAAFDFPFRK ; ;MAKLHDYYKDEVVKKLMTEFNYNSVMQVPRVEKITLNMGVGEAIADKKLLDNAAADLAAISGQKPLITKARKSVAGFKIR QGYPIGCKVTLRGERMWEFFERLITIAVPRIRDFRGLSAKSFDGRGNYSMGVREQIIFPEIDYDKVDRVRGLDITITTTA KSDEEGRALLAAFDFPFRK ; F ? 31 'polypeptide(L)' no no MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNIPGSK MKKDIHPKYEEITASCSCGNVMKIRSTVGHDLNLDVCSKCHPFFTGKQRDVATGGRVDRFNKRFNIPGSK b ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 32 'MAGNESIUM ION' MG 33 'ZINC ION' ZN 34 water HOH # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 U n 1 3 U n 1 4 G n 1 5 U n 1 6 A n 1 7 A n 1 8 G n 1 9 G n 1 10 U n 1 11 U n 1 12 A n 1 13 A n 1 14 G n 1 15 C n 1 16 G n 1 17 A n 1 18 C n 1 19 U n 1 20 A n 1 21 A n 1 22 G n 1 23 C n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 A n 1 27 C n 1 28 A n 1 29 C n 1 30 G n 1 31 G n 1 32 U n 1 33 G n 1 34 G n 1 35 A n 1 36 U n 1 37 G n 1 38 C n 1 39 C n 1 40 C n 1 41 U n 1 42 G n 1 43 G n 1 44 C n 1 45 A n 1 46 G n 1 47 U n 1 48 C n 1 49 A n 1 50 G n 1 51 A n 1 52 G n 1 53 G n 1 54 C n 1 55 G n 1 56 A n 1 57 U n 1 58 G n 1 59 A n 1 60 A n 1 61 G n 1 62 G n 1 63 A n 1 64 C n 1 65 G n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 U n 1 70 A n 1 71 A n 1 72 U n 1 73 C n 1 74 U n 1 75 G n 1 76 C n 1 77 G n 1 78 A n 1 79 U n 1 80 A n 1 81 A n 1 82 G n 1 83 C n 1 84 G n 1 85 U n 1 86 C n 1 87 G n 1 88 G n 1 89 U n 1 90 A n 1 91 A n 1 92 G n 1 93 G n 1 94 U n 1 95 G n 1 96 A n 1 97 U n 1 98 A n 1 99 U n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 A n 1 103 C n 1 104 C n 1 105 G n 1 106 U n 1 107 U n 1 108 A n 1 109 U n 1 110 A n 1 111 A n 1 112 C n 1 113 C n 1 114 G n 1 115 G n 1 116 C n 1 117 G n 1 118 A n 1 119 U n 1 120 U n 1 121 U n 1 122 C n 1 123 C n 1 124 G n 1 125 A n 1 126 A n 1 127 U n 1 128 G n 1 129 G n 1 130 G n 1 131 G n 1 132 A n 1 133 A n 1 134 A n 1 135 C n 1 136 C n 1 137 C n 1 138 A n 1 139 G n 1 140 U n 1 141 G n 1 142 U n 1 143 G n 1 144 U n 1 145 U n 1 146 U n 1 147 C n 1 148 G n 1 149 A n 1 150 C n 1 151 A n 1 152 C n 1 153 A n 1 154 C n 1 155 U n 1 156 A n 1 157 U n 1 158 C n 1 159 A n 1 160 U n 1 161 U n 1 162 A n 1 163 A n 1 164 C n 1 165 U n 1 166 G n 1 167 A n 1 168 A n 1 169 U n 1 170 C n 1 171 C n 1 172 A n 1 173 U n 1 174 A n 1 175 G n 1 176 G n 1 177 U n 1 178 U n 1 179 A n 1 180 A n 1 181 U n 1 182 G n 1 183 A n 1 184 G n 1 185 G n 1 186 C n 1 187 G n 1 188 A n 1 189 A n 1 190 C n 1 191 C n 1 192 G n 1 193 G n 1 194 G n 1 195 G n 1 196 G n 1 197 A n 1 198 A n 1 199 C n 1 200 U n 1 201 G n 1 202 A n 1 203 A n 1 204 A n 1 205 C n 1 206 A n 1 207 U n 1 208 C n 1 209 U n 1 210 A n 1 211 A n 1 212 G n 1 213 U n 1 214 A n 1 215 C n 1 216 C n 1 217 C n 1 218 C n 1 219 G n 1 220 A n 1 221 G n 1 222 G n 1 223 A n 1 224 A n 1 225 A n 1 226 A n 1 227 G n 1 228 A n 1 229 A n 1 230 A n 1 231 U n 1 232 C n 1 233 A n 1 234 A n 1 235 C n 1 236 C n 1 237 G n 1 238 A n 1 239 G n 1 240 A n 1 241 U n 1 242 U n 1 243 C n 1 244 C n 1 245 C n 1 246 C n 1 247 C n 1 248 A n 1 249 G n 1 250 U n 1 251 A n 1 252 G n 1 253 C n 1 254 G n 1 255 G n 1 256 C n 1 257 G n 1 258 A n 1 259 G n 1 260 C n 1 261 G n 1 262 A n 1 263 A n 1 264 C n 1 265 G n 1 266 G n 1 267 G n 1 268 G n 1 269 A n 1 270 G n 1 271 C n 1 272 A n 1 273 G n 1 274 C n 1 275 C n 1 276 C n 1 277 A n 1 278 G n 1 279 A n 1 280 G n 1 281 C n 1 282 C n 1 283 U n 1 284 G n 1 285 A n 1 286 A n 1 287 U n 1 288 C n 1 289 A n 1 290 G n 1 291 U n 1 292 G n 1 293 U n 1 294 G n 1 295 U n 1 296 G n 1 297 U n 1 298 G n 1 299 U n 1 300 U n 1 301 A n 1 302 G n 1 303 U n 1 304 G n 1 305 G n 1 306 A n 1 307 A n 1 308 G n 1 309 C n 1 310 G n 1 311 U n 1 312 C n 1 313 U 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K12 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 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SER T 17 LYS T 26 1 ? 10 HELX_P HELX_P59 AG5 THR O 39 ? GLU O 52 ? THR T 39 GLU T 52 1 ? 14 HELX_P HELX_P60 AG6 GLY Q 13 ? ALA Q 22 ? GLY V 13 ALA V 22 1 ? 10 HELX_P HELX_P61 AG7 HIS Q 44 ? GLN Q 51 ? HIS V 44 GLN V 51 1 ? 8 HELX_P HELX_P62 AG8 LYS Q 53 ? SER Q 58 ? LYS V 53 SER V 58 5 ? 6 HELX_P HELX_P63 AG9 ALA S 53 ? GLY S 63 ? ALA X 52 GLY X 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 AH1 GLY S 63 ? ARG S 74 ? GLY X 62 ARG X 73 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 AH2 MET T 1 ? LEU T 6 ? MET Y 1 LEU Y 6 5 ? 6 HELX_P HELX_P66 AH3 SER T 10 ? ARG T 23 ? SER Y 10 ARG Y 23 1 ? 14 HELX_P HELX_P67 AH4 ARG T 23 ? SER T 34 ? ARG Y 23 SER Y 34 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 AH5 SER T 40 ? LEU T 56 ? SER Y 40 LEU Y 56 1 ? 17 HELX_P HELX_P69 AH6 LEU U 17 ? GLY U 28 ? LEU Z 16 GLY Z 27 1 ? 12 HELX_P HELX_P70 AH7 THR U 41 ? VAL U 51 ? THR Z 40 VAL Z 50 1 ? 11 HELX_P HELX_P71 AH8 THR V 9 ? ARG V 17 ? THR 0 8 ARG 0 16 1 ? 9 HELX_P HELX_P72 AH9 SER V 18 ? ALA V 21 ? SER 0 17 ALA 0 20 5 ? 4 HELX_P HELX_P73 AI1 SER X 8 ? GLY X 17 ? 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SER 6 44 ALA 6 62 1 ? 19 HELX_P HELX_P88 AJ7 GLU BA 92 ? ARG BA 96 ? GLU 6 92 ARG 6 96 1 ? 5 HELX_P HELX_P89 AJ8 LYS CA 22 ? ARG CA 27 ? LYS H 22 ARG H 27 1 ? 6 HELX_P HELX_P90 AJ9 LYS CA 42 ? ILE CA 72 ? LYS H 42 ILE H 72 1 ? 31 HELX_P HELX_P91 AK1 GLY CA 85 ? GLU CA 87 ? GLY H 85 GLU H 87 5 ? 3 HELX_P HELX_P92 AK2 GLY CA 95 ? GLY CA 107 ? GLY H 95 GLY H 107 1 ? 13 HELX_P HELX_P93 AK3 ALA CA 111 ? SER CA 113 ? ALA H 111 SER H 113 5 ? 3 HELX_P HELX_P94 AK4 LYS DA 3 ? GLU DA 11 ? LYS F 2 GLU F 10 1 ? 9 HELX_P HELX_P95 AK5 GLU DA 11 ? ASN DA 21 ? GLU F 10 ASN F 20 1 ? 11 HELX_P HELX_P96 AK6 SER DA 24 ? VAL DA 28 ? SER F 23 VAL F 27 5 ? 5 HELX_P HELX_P97 AK7 GLY DA 41 ? ASP DA 46 ? GLY F 40 ASP F 45 5 ? 6 HELX_P HELX_P98 AK8 LYS DA 47 ? SER DA 61 ? LYS F 46 SER F 60 1 ? 15 HELX_P HELX_P99 AK9 VAL DA 74 ? LYS DA 78 ? VAL F 73 LYS F 77 5 ? 5 HELX_P HELX_P100 AL1 GLY DA 93 ? ILE DA 106 ? GLY F 92 ILE F 105 1 ? 14 HELX_P HELX_P101 AL2 GLU DA 134 ? PHE DA 138 ? 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A U 142 N3 ? ? ? 1_555 A A 151 N1 ? ? A U 135 A A 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog222 hydrog ? ? A U 142 O4 ? ? ? 1_555 A A 151 N6 ? ? A U 135 A A 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog223 hydrog ? ? A G 143 N1 ? ? ? 1_555 A C 150 N3 ? ? A G 136 A C 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog224 hydrog ? ? A G 143 N2 ? ? ? 1_555 A C 150 O2 ? ? A G 136 A C 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog225 hydrog ? ? A G 143 O6 ? ? ? 1_555 A C 150 N4 ? ? A G 136 A C 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog226 hydrog ? ? A U 144 N3 ? ? ? 1_555 A A 149 N1 ? ? A U 137 A A 142 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog227 hydrog ? ? A U 144 O4 ? ? ? 1_555 A A 149 N6 ? ? A U 137 A A 142 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog228 hydrog ? ? A A 156 N6 ? ? ? 1_555 A G 184 N7 ? ? A A 149 A G 177 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog229 hydrog ? ? A U 157 N3 ? ? ? 1_555 A A 183 N1 ? ? A U 150 A A 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog230 hydrog ? ? A U 157 O4 ? ? ? 1_555 A A 183 N6 ? ? A U 150 A A 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog231 hydrog ? ? A C 158 N3 ? ? ? 1_555 A G 182 N1 ? ? A C 151 A G 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog232 hydrog ? ? A C 158 N4 ? ? ? 1_555 A G 182 O6 ? ? A C 151 A G 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog233 hydrog ? ? A C 158 O2 ? ? ? 1_555 A G 182 N2 ? ? A C 151 A G 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? A A 159 N1 ? ? ? 1_555 A U 181 N3 ? ? A A 152 A U 174 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? A A 159 N6 ? ? ? 1_555 A U 181 O4 ? ? A A 152 A U 174 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? A U 160 N3 ? ? ? 1_555 A A 180 N1 ? ? A U 153 A A 173 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? A U 160 O4 ? ? ? 1_555 A A 180 N6 ? ? A U 153 A A 173 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog238 hydrog ? ? A U 161 N3 ? ? ? 1_555 A A 179 N1 ? ? 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'C-C MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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A 2909 ? 19 1 1 A U 2 1_555 A A 2915 1_555 -0.022 -0.105 -0.146 -0.932 10.163 1.022 2 A_U-5:A2908_A A -5 ? A 2908 ? 20 1 1 A U 3 1_555 A A 2914 1_555 -0.020 -0.093 0.097 1.267 0.795 3.592 3 A_U-4:A2907_A A -4 ? A 2907 ? 20 1 1 A G 4 1_555 A C 2913 1_555 -0.163 -0.217 -0.785 -4.253 -2.002 0.518 4 A_G-3:C2906_A A -3 ? A 2906 ? 19 1 1 A U 5 1_555 A A 2912 1_555 -0.053 -0.116 -0.425 -0.492 -0.960 1.142 5 A_U-2:A2905_A A -2 ? A 2905 ? 20 1 1 A A 6 1_555 A U 2911 1_555 0.058 -0.127 -0.544 -7.630 4.196 1.367 6 A_A-1:U2904_A A -1 ? A 2904 ? 20 1 1 A A 7 1_555 A U 2910 1_555 0.075 -0.160 -0.624 -2.288 4.817 0.197 7 A_A0:U2903_A A 0 ? A 2903 ? 20 1 1 A G 8 1_555 A C 2909 1_555 -0.160 -0.284 -0.973 -1.019 -0.514 1.021 8 A_G1:C2902_A A 1 ? A 2902 ? 19 1 1 A G 9 1_555 A C 2908 1_555 -0.118 -0.230 -0.968 -8.949 4.733 -0.983 9 A_G2:C2901_A A 2 ? A 2901 ? 19 1 1 A U 10 1_555 A A 2907 1_555 -0.059 -0.172 -0.599 -2.465 11.758 -1.294 10 A_U3:A2900_A A 3 ? A 2900 ? 20 1 1 A U 11 1_555 A A 2906 1_555 -0.012 -0.148 -0.514 -1.650 -2.847 3.108 11 A_U4:A2899_A A 4 ? A 2899 ? 20 1 1 A A 12 1_555 A U 2905 1_555 0.035 -0.072 0.075 -6.189 1.462 1.498 12 A_A5:U2898_A A 5 ? A 2898 ? 20 1 1 A A 13 1_555 A U 2904 1_555 0.084 -0.099 0.031 -3.332 4.609 -0.650 13 A_A6:U2897_A A 6 ? A 2897 ? 20 1 1 A G 14 1_555 A C 2903 1_555 -0.146 -0.195 0.588 1.020 3.931 0.308 14 A_G7:C2896_A A 7 ? A 2896 ? 19 1 1 A C 15 1_555 A G 2902 1_555 0.213 -0.216 0.682 2.988 2.408 1.162 15 A_C8:G2895_A A 8 ? A 2895 ? 19 1 1 A G 16 1_555 A A 2807 1_555 3.638 -3.591 -0.721 -2.453 1.467 -59.632 16 A_G9:A2800_A A 9 ? A 2800 ? 10 6 1 A A 17 1_555 A U 2636 1_555 -4.431 -1.775 -0.674 -0.518 -3.184 -96.881 17 A_A10:U2629_A A 10 ? A 2629 ? 24 4 1 A G 377 1_555 A C 276 1_555 -0.159 -0.258 0.826 -3.772 -1.018 1.230 18 A_G370:C269_A A 370 ? A 269 ? 19 1 1 A G 431 1_555 A C 275 1_555 -0.181 -0.130 -0.375 -3.903 1.446 1.772 19 A_G424:C268_A A 424 ? 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