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N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.477 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 122 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 149 A NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 165 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 234 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 282 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 331 A NAG 1414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? A ASN 343 A NAG 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? A ASN 603 A NAG 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? A ASN 616 A NAG 1417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 657 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? A ASN 657 A NAG 1418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? A ASN 709 A NAG 1419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 717 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 801 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.485 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 1074 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 1074 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? 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K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? E NAG 2 E NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale57 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale58 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale59 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale60 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? ? covale61 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale62 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale63 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale64 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale65 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . 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? -64.99 -158.10 146 1 LEU B 492 ? ? -33.73 136.68 147 1 TYR B 505 ? ? -90.59 59.34 148 1 HIS B 519 ? ? -142.40 -5.07 149 1 PHE B 543 ? ? -68.40 94.75 150 1 ASP B 568 ? ? -103.04 -61.57 151 1 GLN B 580 ? ? -93.86 -60.00 152 1 GLU B 619 ? ? -141.49 40.61 153 1 ILE B 692 ? ? -170.07 136.65 154 1 ASN B 710 ? ? -140.04 46.25 155 1 SER B 758 ? ? -105.43 41.57 156 1 ALA B 783 ? ? -91.18 56.47 157 1 LYS B 811 ? ? -171.22 148.36 158 1 LEU B 945 ? ? -96.23 37.49 159 1 THR B 1116 ? ? -115.22 -167.22 160 1 SER B 1123 ? ? -166.57 118.24 161 1 CYS B 1126 ? ? -45.01 82.18 162 1 ASP B 1127 ? ? -161.94 13.06 163 1 VAL B 1128 ? ? -133.46 -44.87 164 1 LEU B 1141 ? ? -96.60 -60.29 165 1 LEU C 18 ? ? -176.91 146.71 166 1 THR C 19 ? ? 175.68 -36.68 167 1 THR C 20 ? ? 79.71 -103.09 168 1 ARG C 21 ? ? -177.81 -41.47 169 1 THR C 22 ? ? -39.59 166.28 170 1 GLN C 23 ? ? 167.19 -34.15 171 1 LEU C 24 ? ? 48.75 -157.17 172 1 PRO C 39 ? ? -86.52 34.61 173 1 ASP C 40 ? ? -175.07 -173.50 174 1 ASP C 53 ? ? -161.35 -166.56 175 1 ASN C 61 ? ? -108.90 68.88 176 1 ALA C 67 ? ? -78.39 -143.80 177 1 THR C 73 ? ? 173.18 -45.68 178 1 ASN C 74 ? ? 168.76 110.35 179 1 THR C 76 ? ? 48.81 111.56 180 1 ASP C 80 ? ? -155.55 41.62 181 1 ASN C 87 ? ? 38.74 -100.18 182 1 THR C 95 ? ? -95.44 -65.07 183 1 GLU C 96 ? ? 48.45 71.86 184 1 LYS C 113 ? ? 71.36 -7.36 185 1 ASN C 122 ? ? 61.23 77.02 186 1 ALA C 123 ? ? -68.11 63.60 187 1 LYS C 147 ? ? 70.51 -15.19 188 1 ASN C 149 ? ? 72.60 -10.56 189 1 LYS C 150 ? ? 39.14 72.20 190 1 SER C 151 ? ? -171.98 134.57 191 1 PHE C 168 ? ? 170.01 159.22 192 1 GLU C 169 ? ? -176.06 104.63 193 1 LEU C 179 ? ? -157.12 -65.38 194 1 GLU C 180 ? ? 45.02 -93.97 195 1 GLN C 183 ? ? 29.45 54.24 196 1 LYS C 187 ? ? 64.30 -9.55 197 1 LYS C 206 ? ? -173.44 147.40 198 1 ARG C 214 ? ? -121.80 -54.27 199 1 ILE C 231 ? ? -107.82 -65.93 200 1 TYR C 248 ? ? -142.04 -146.78 201 1 LEU C 249 ? ? -65.44 72.03 202 1 TRP C 258 ? ? -161.15 -154.42 203 1 THR C 259 ? ? 64.02 76.04 204 1 THR C 286 ? ? -56.48 -91.76 205 1 ALA C 292 ? ? 113.94 -28.45 206 1 LEU C 293 ? ? -51.04 -70.71 207 1 ASN C 343 ? ? -96.57 30.13 208 1 SER C 373 ? ? -140.56 19.65 209 1 ASP C 428 ? ? -90.09 -61.46 210 1 PHE C 429 ? ? 56.99 75.15 211 1 LEU C 455 ? ? -153.03 54.37 212 1 PHE C 456 ? ? -155.09 -153.86 213 1 ARG C 457 ? ? -35.06 -94.63 214 1 LYS C 458 ? ? 67.43 -25.58 215 1 ASN C 460 ? ? 34.34 94.73 216 1 GLN C 498 ? ? 172.28 158.96 217 1 THR C 500 ? ? 68.57 -90.69 218 1 LYS C 558 ? ? -107.38 72.49 219 1 PRO C 579 ? ? -85.38 37.90 220 1 GLN C 580 ? ? -127.24 -54.46 221 1 ASP C 614 ? ? 22.29 88.32 222 1 CYS C 617 ? ? -53.04 7.98 223 1 GLU C 619 ? ? -140.12 27.89 224 1 ASP C 663 ? ? -90.23 -64.04 225 1 SER C 691 ? ? 167.76 172.29 226 1 ASN C 710 ? ? -141.53 38.68 227 1 PHE C 802 ? ? -98.90 31.54 228 1 SER C 810 ? ? -159.80 -150.74 229 1 LYS C 811 ? ? -36.17 135.84 230 1 SER C 813 ? ? 53.64 71.36 231 1 LYS C 814 ? ? -67.73 78.75 232 1 THR C 827 ? ? -43.91 77.04 233 1 ASP C 1041 ? ? 64.55 -5.77 234 1 CYS C 1043 ? ? -106.04 56.27 235 1 GLU C 1111 ? ? -150.73 84.12 236 1 CYS C 1126 ? ? -92.78 49.47 237 1 ASP C 1127 ? ? -145.54 15.23 238 1 TYR C 1138 ? ? -44.99 161.57 239 1 LEU C 1141 ? ? -138.53 -41.11 240 1 SER H 7 ? ? -140.25 22.38 241 1 ASP H 55 ? ? 76.12 -4.36 242 1 MET H 59 ? ? -44.89 157.08 243 1 GLU H 89 ? ? -97.87 51.18 244 1 PRO H 106 ? ? -68.68 3.66 245 1 GLN H 120 ? ? 69.63 -12.23 246 1 SER H 130 ? ? -118.65 -152.07 247 1 PRO H 141 ? ? -44.81 -142.85 248 1 SER H 142 ? ? -172.98 -168.81 249 1 ASP H 159 ? ? 34.58 53.34 250 1 PRO H 162 ? ? -57.52 -4.85 251 1 GLU H 163 ? ? 80.77 -91.23 252 1 PRO H 164 ? ? -92.45 -151.82 253 1 VAL H 165 ? ? 168.97 -134.70 254 1 THR H 166 ? ? -171.36 -62.15 255 1 VAL H 167 ? ? 92.43 -87.47 256 1 SER H 168 ? ? 58.61 -45.37 257 1 ASN H 170 ? ? 177.35 -158.61 258 1 SER H 171 ? ? -109.77 49.56 259 1 THR H 175 ? ? -165.50 6.57 260 1 PRO H 182 ? ? -101.29 47.79 261 1 ALA H 183 ? ? 38.64 -149.95 262 1 VAL H 184 ? ? 174.05 168.36 263 1 GLN H 186 ? ? -45.91 172.23 264 1 SER H 192 ? ? -166.94 109.50 265 1 VAL H 226 ? ? -118.74 73.90 266 1 VAL L 3 ? ? -179.65 80.40 267 1 MET L 4 ? ? -76.66 -145.99 268 1 THR L 5 ? ? -161.07 -136.65 269 1 GLN L 6 ? ? -156.60 -147.21 270 1 SER L 7 ? ? -151.18 -58.61 271 1 LEU L 9 ? ? 43.50 20.40 272 1 SER L 10 ? ? 174.84 -104.56 273 1 SER L 11 ? ? 77.96 54.07 274 1 PRO L 12 ? ? -54.86 100.31 275 1 ARG L 50 ? ? -84.52 -87.63 276 1 LEU L 51 ? ? 171.73 158.31 277 1 LEU L 52 ? ? -145.67 -141.66 278 1 LYS L 55 ? ? 36.43 65.38 279 1 ILE L 56 ? ? 59.66 -88.43 280 1 ASN L 58 ? ? -151.27 -158.73 281 1 ASP L 65 ? ? 60.45 64.94 282 1 THR L 74 ? ? -136.38 -31.68 283 1 ARG L 82 ? ? 43.87 70.38 284 1 ALA L 96 ? ? -147.40 30.52 285 1 GLN L 98 ? ? 76.64 50.95 286 1 PHE L 99 ? ? 34.35 -86.27 287 1 PRO L 100 ? ? -51.89 82.73 288 1 TYR L 101 ? ? -53.23 179.25 289 1 GLN L 105 ? ? -62.40 7.14 290 1 THR L 107 ? ? -161.58 108.51 291 1 ASP L 110 ? ? -164.65 -166.25 292 1 VAL L 115 ? ? -69.17 78.70 293 1 SER L 126 ? ? -50.23 172.16 294 1 ASN L 143 ? ? 72.47 105.81 295 1 PHE L 144 ? ? 177.86 179.11 296 1 ARG L 147 ? ? 169.40 -42.52 297 1 LYS L 150 ? ? -175.51 120.54 298 1 LYS L 154 ? ? -118.98 63.64 299 1 VAL L 155 ? ? -45.33 84.37 300 1 ASN L 157 ? ? 70.25 94.83 301 1 ALA L 158 ? ? 174.00 21.81 302 1 LEU L 159 ? ? 28.42 99.57 303 1 THR L 177 ? ? -94.78 -155.03 304 1 TYR L 178 ? ? -160.71 98.72 305 1 LYS L 193 ? ? -69.04 82.80 306 1 HIS L 194 ? ? 170.36 -173.78 307 1 LYS L 195 ? ? -167.66 -72.67 308 1 VAL L 196 ? ? -64.04 78.80 309 1 VAL L 210 ? ? -70.77 -161.08 310 1 THR L 211 ? ? 165.95 82.82 311 1 GLU L 218 ? ? 54.84 -163.28 312 1 SER I 7 ? ? -140.21 22.38 313 1 ASP I 55 ? ? 76.14 -4.39 314 1 MET I 59 ? ? -44.90 157.11 315 1 GLU I 89 ? ? -97.85 51.18 316 1 PRO I 106 ? ? -68.67 3.62 317 1 GLN I 120 ? ? 69.64 -12.23 318 1 SER I 130 ? ? -118.64 -152.10 319 1 PRO I 141 ? ? -44.78 -142.84 320 1 SER I 142 ? ? -173.02 -168.80 321 1 ASP I 159 ? ? 34.57 53.38 322 1 PRO I 162 ? ? -57.51 -4.85 323 1 GLU I 163 ? ? 80.74 -91.19 324 1 PRO I 164 ? ? -92.50 -151.83 325 1 VAL I 165 ? ? 169.02 -134.66 326 1 THR I 166 ? ? -171.41 -62.20 327 1 VAL I 167 ? ? 92.45 -87.52 328 1 SER I 168 ? ? 58.66 -45.35 329 1 ASN I 170 ? ? 177.37 -158.60 330 1 SER I 171 ? ? -109.79 49.56 331 1 THR I 175 ? ? -165.45 6.56 332 1 PRO I 182 ? ? -101.32 47.81 333 1 ALA I 183 ? ? 38.67 -149.99 334 1 VAL I 184 ? ? 174.04 168.37 335 1 GLN I 186 ? ? -45.93 172.24 336 1 SER I 192 ? ? -166.87 109.52 337 1 VAL I 226 ? ? -118.78 73.92 338 1 VAL M 3 ? ? -179.68 80.38 339 1 MET M 4 ? ? -76.61 -145.96 340 1 THR M 5 ? ? -161.06 -136.62 341 1 GLN M 6 ? ? -156.62 -147.21 342 1 SER M 7 ? ? -151.16 -58.65 343 1 LEU M 9 ? ? 43.45 20.45 344 1 SER M 10 ? ? 174.85 -104.58 345 1 SER M 11 ? ? 77.94 54.08 346 1 PRO M 12 ? ? -54.84 100.32 347 1 ARG M 50 ? ? -84.53 -87.61 348 1 LEU M 51 ? ? 171.73 158.32 349 1 LEU M 52 ? ? -145.65 -141.65 350 1 LYS M 55 ? ? 36.39 65.41 351 1 ILE M 56 ? ? 59.67 -88.44 352 1 ASN M 58 ? ? -151.27 -158.70 353 1 ASP M 65 ? ? 60.44 64.92 354 1 THR M 74 ? ? -136.38 -31.69 355 1 ARG M 82 ? ? 43.86 70.42 356 1 ALA M 96 ? ? -147.37 30.54 357 1 GLN M 98 ? ? 76.63 50.96 358 1 PHE M 99 ? ? 34.37 -86.27 359 1 PRO M 100 ? ? -51.90 82.75 360 1 TYR M 101 ? ? -53.25 179.26 361 1 GLN M 105 ? ? -62.49 7.21 362 1 THR M 107 ? ? -161.60 108.50 363 1 ASP M 110 ? ? -164.66 -166.23 364 1 VAL M 115 ? ? -69.11 78.68 365 1 SER M 126 ? ? -50.22 172.12 366 1 ASN M 143 ? ? 72.46 105.79 367 1 PHE M 144 ? ? 177.87 179.08 368 1 ARG M 147 ? ? 169.37 -42.49 369 1 LYS M 150 ? ? -175.53 120.53 370 1 LYS M 154 ? ? -118.97 63.64 371 1 VAL M 155 ? ? -45.34 84.37 372 1 ASN M 157 ? ? 70.23 94.85 373 1 ALA M 158 ? ? 173.99 21.75 374 1 LEU M 159 ? ? 28.45 99.60 375 1 THR M 177 ? ? -94.81 -155.06 376 1 TYR M 178 ? ? -160.67 98.69 377 1 LYS M 193 ? ? -69.02 82.81 378 1 HIS M 194 ? ? 170.35 -173.79 379 1 LYS M 195 ? ? -167.65 -72.65 380 1 VAL M 196 ? ? -64.03 78.73 381 1 VAL M 210 ? ? -70.77 -161.07 382 1 THR M 211 ? ? 165.94 82.78 383 1 GLU M 218 ? ? 54.82 -163.30 384 1 SER J 7 ? ? -140.22 22.36 385 1 ASP J 55 ? ? 76.10 -4.30 386 1 MET J 59 ? ? -44.96 157.12 387 1 GLU J 89 ? 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4 5 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 5 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 4 3 NAG C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 NAG 3 n 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id NAG _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id NAG _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 6 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #