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TYR C 527 ASN C 536 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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HOOGSTEEN ? ? ? hydrog291 hydrog ? ? B A 475 N7 ? ? ? 1_555 B U 522 N3 ? ? A A 475 A U 522 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? ? hydrog292 hydrog ? ? B C 476 N3 ? ? ? 1_555 B G 521 N2 ? ? A C 476 A G 521 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog293 hydrog ? ? B C 476 O2 ? ? ? 1_555 B G 521 N1 ? ? A C 476 A G 521 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog294 hydrog ? ? B U 477 O4 ? ? ? 1_555 B G 519 N1 ? ? A U 477 A G 519 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog295 hydrog ? ? B C 478 N3 ? ? ? 1_555 B G 519 N1 ? ? A C 478 A G 519 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog296 hydrog ? ? B C 478 N4 ? ? ? 1_555 B G 519 O6 ? ? A C 478 A G 519 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog297 hydrog ? ? B C 478 O2 ? ? ? 1_555 B G 519 N2 ? ? A C 478 A G 519 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog298 hydrog ? ? B A 481 N3 ? ? ? 1_555 B C 514 N4 ? ? A A 481 A C 514 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-C MISPAIR' ? ? ? hydrog299 hydrog ? ? B U 483 O2 ? ? ? 1_555 B A 516 N6 ? ? A U 483 A A 516 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog300 hydrog ? ? B A 492 N1 ? ? ? 1_555 B U 506 N3 ? ? A A 492 A U 506 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog301 hydrog ? ? B A 492 N6 ? ? ? 1_555 B U 506 O4 ? ? A A 492 A U 506 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog302 hydrog ? ? B A 493 N1 ? ? ? 1_555 B U 505 N3 ? ? A A 493 A U 505 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog303 hydrog ? ? B A 493 N6 ? ? ? 1_555 B U 505 O4 ? ? A A 493 A U 505 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog304 hydrog ? ? B G 494 N1 ? ? ? 1_555 B C 504 N3 ? ? A G 494 A C 504 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog305 hydrog ? ? B G 494 N2 ? ? ? 1_555 B C 504 O2 ? ? A G 494 A C 504 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog306 hydrog ? ? B G 494 O6 ? ? ? 1_555 B C 504 N4 ? ? A G 494 A C 504 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog307 hydrog ? ? B G 495 N1 ? ? ? 1_555 B C 503 N3 ? ? A G 495 A C 503 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog308 hydrog ? ? 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'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' ? ? ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7D1A 'double helix' 7D1A 'a-form double helix' 7D1A 'hairpin loop' 7D1A 'bulge loop' 7D1A 'mismatched base pair' 7D1A 'internal loop' 7D1A 'triple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 B G 1 1_555 B G 470 1_555 4.188 -5.480 2.279 13.041 22.835 13.214 1 A_G1:G470_A A 1 ? 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A 2481 ? ? 1 1 B G 853 1_555 B C 890 1_555 -0.190 -0.135 0.233 -21.341 2.440 3.482 10 A_G2443:C2480_A A 2443 ? A 2480 ? 19 1 1 B U 854 1_555 B C 889 1_555 1.299 -2.368 2.118 -1.087 10.075 47.023 11 A_U2444:C2479_A A 2444 ? A 2479 ? 18 1 1 B G 855 1_555 B U 887 1_555 -3.607 -1.519 -0.460 -6.217 -0.148 -19.821 12 A_G2445:U2477_A A 2445 ? A 2477 ? 28 1 1 B C 856 1_555 B G 886 1_555 0.214 -0.210 -0.171 3.994 0.684 -1.324 13 A_C2446:G2476_A A 2446 ? A 2476 ? 19 1 1 B A 858 1_555 B G 885 1_555 -1.897 0.161 1.697 16.381 16.375 -14.036 14 A_A2448:G2475_A A 2448 ? A 2475 ? 8 1 1 B A 859 1_555 B A 881 1_555 -2.039 2.003 -0.995 -61.358 -15.395 60.662 15 A_A2449:A2471_A A 2449 ? A 2471 ? ? 1 1 B C 860 1_555 B G 883 1_555 2.475 -1.933 -2.435 3.820 -0.952 17.306 16 A_C2450:G2473_A A 2450 ? A 2473 ? ? 1 1 B C 861 1_555 B G 882 1_555 0.013 -0.800 -1.222 23.719 -5.582 -0.834 17 A_C2451:G2472_A A 2451 ? 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