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three protein 18' 36 'Utp21, U3 snoRNA-associated protein 21,U three protein 21' 37 'Utp6, U3 snoRNA-associated protein 6,U three protein 6' 38 'Bud21, U three protein 16,U3 small nucleolar RNA-associated protein 16,U3 snoRNA-associated protein 16' 39 'Utp7, U3 snoRNA-associated protein 7,U three protein 7' 40 'Utp11, U3 snoRNA-associated protein 11,U three protein 11' 41 'Mpp10, U3 snoRNA-associated protein MPP10,M phase phosphoprotein 10' 42 'Imp3, U3 snoRNP protein IMP3,Interacting with MPP10 protein 3' 43 'Imp4, U3 snoRNP protein IMP4,Interacting with MPP10 protein 4' 44 'Sas10, U three protein 3,U3 small nucleolar RNA-associated protein 3,U3 snoRNA-associated protein 11' 45 'Sof1, U3 small nucleolar RNA-associated protein SOF1,U3 snoRNA-associated protein SOF1' 46 'FAF1 copurifying factor 2' 47 'Utp24, FAF1-copurifying factor 1' 48 'Enp2, Essential nuclear protein 2' 49 Lcp5 50 'Utp22, U3 snoRNA-associated protein 22,U three protein 22' 51 Rrp7 52 ;Emg1, 18S rRNA 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'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7D63 7D63 ? 1 ? 1 2 PDB 7D63 7D63 ? 2 ? 1 3 PDB 7D63 7D63 ? 3 ? 1 4 UNP RS3A1_YEAST P33442 ? 4 ;MAVGKNKRLSKGKKGQKKRVVDPFTRKEWFDIKAPSTFENRNVGKTLVNKSTGLKSASDALKGRVVEVCLADLQGSEDHS FRKIKLRVDEVQGKNLLTNFHGMDFTTDKLRSMVRKWQTLIEANVTVKTSDDYVLRIFAIAFTRKQANQVKRHSYAQSSH IRAIRKVISEILTKEVQGSTLAQLTSKLIPEVINKEIENATKDIFPLQNIHVRKVKLLKQPKFDVGALMALHGEGSGEEK GKKVTGFKDEVLETV ; 1 5 UNP RS4A_YEAST P0CX35 ? 5 ;MARGPKKHLKRLAAPHHWLLDKLSGCYAPRPSAGPHKLRESLPLIVFLRNRLKYALNGREVKAILMQRHVKVDGKVRTDT TYPAGFMDVITLDATNENFRLVYDVKGRFAVHRITDEEASYKLGKVKKVQLGKKGVPYVVTHDGRTIRYPDPNIKVNDTV KIDLASGKITDFIKFDAGKLVYVTGGRNLGRIGTIVHKERHDGGFDLVHIKDSLDNTFVTRLNNVFVIGEQGKPYISLPK GKGIKLSIAEERDRRRAQQGL ; 1 6 UNP RS5_YEAST P26783 ? 6 ;MSDTEAPVEVQEDFEVVEEFTPVVLATPIPEEVQQAQTEIKLFNKWSFEEVEVKDASLVDYVQVRQPIFVAHTAGRYANK RFRKAQCPIIERLTNSLMMNGRNNGKKLKAVRIIKHTLDIINVLTDQNPIQVVVDAITNTGPREDTTRVGGGGAARRQAV DVSPLRRVNQAIALLTIGAREAAFRNIKTIAETLAEELINAAKGSSTSYAIKKKDELERVAKSNR ; 1 7 UNP RS6A_YEAST P0CX37 ? 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'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7D63 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7D63 _struct.title 'Cryo-EM structure of 90S preribosome with inactive Utp24 (state C)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7D63 _struct_keywords.text 'ribosome assembly, 90S to pre-40S transition, cryo-EM, Dhr1, Utp24, RIBOSOME' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? 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SA C 59 SA G 63 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? ? hydrog365 hydrog ? ? C G 71 N1 ? ? ? 1_555 C C 95 N3 ? ? SA G 63 SA C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog366 hydrog ? ? C G 71 N2 ? ? ? 1_555 C C 95 O2 ? ? SA G 63 SA C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog367 hydrog ? ? C G 71 O6 ? ? ? 1_555 C C 95 N4 ? ? SA G 63 SA C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog368 hydrog ? ? C U 72 N3 ? ? ? 1_555 C A 94 N1 ? ? SA U 64 SA A 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog369 hydrog ? ? C U 72 O4 ? ? ? 1_555 C A 94 N6 ? ? SA U 64 SA A 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog370 hydrog ? ? C U 72 N3 ? ? ? 1_555 C C 95 N3 ? ? SA U 64 SA C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog371 hydrog ? ? C U 72 O4 ? ? ? 1_555 C C 95 N4 ? ? SA U 64 SA C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog372 hydrog ? ? C A 75 N6 ? ? ? 1_555 C G 91 N3 ? ? SA A 67 SA G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog373 hydrog ? ? C A 75 N7 ? ? ? 1_555 C G 91 N2 ? ? 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TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog521 hydrog ? ? C G 281 N1 ? ? ? 1_555 C U 291 O2 ? ? SA G 273 SA U 283 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog522 hydrog ? ? C G 281 O6 ? ? ? 1_555 C U 291 N3 ? ? SA G 273 SA U 283 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog523 hydrog ? ? C G 282 N1 ? ? ? 1_555 C C 290 N3 ? ? SA G 274 SA C 282 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog524 hydrog ? ? C G 282 N2 ? ? ? 1_555 C C 290 O2 ? ? SA G 274 SA C 282 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog525 hydrog ? ? C G 282 O6 ? ? ? 1_555 C C 290 N4 ? ? SA G 274 SA C 282 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog526 hydrog ? ? C C 283 N3 ? ? ? 1_555 C G 289 N1 ? ? SA C 275 SA G 281 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog527 hydrog ? ? C C 283 N4 ? ? ? 1_555 C G 289 O6 ? ? SA C 275 SA G 281 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog528 hydrog ? ? C C 283 O2 ? ? ? 1_555 C G 289 N2 ? ? SA C 275 SA G 281 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog529 hydrog ? ? C C 284 N3 ? ? ? 1_555 C G 287 N1 ? ? 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SA A 483 SA U 504 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog651 hydrog ? ? C C 492 N3 ? ? ? 1_555 C G 511 N1 ? ? SA C 484 SA G 503 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog652 hydrog ? ? C C 492 N4 ? ? ? 1_555 C G 511 O6 ? ? SA C 484 SA G 503 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog653 hydrog ? ? C C 492 O2 ? ? ? 1_555 C G 511 N2 ? ? SA C 484 SA G 503 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog654 hydrog ? ? C A 493 N1 ? ? ? 1_555 C U 510 N3 ? ? SA A 485 SA U 502 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog655 hydrog ? ? C A 493 N6 ? ? ? 1_555 C U 510 O4 ? ? SA A 485 SA U 502 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog656 hydrog ? ? C G 494 N1 ? ? ? 1_555 C U 509 O2 ? ? SA G 486 SA U 501 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog657 hydrog ? ? C G 494 O6 ? ? ? 1_555 C U 509 N3 ? ? SA G 486 SA U 501 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog658 hydrog ? ? C G 495 N1 ? ? ? 1_555 C C 508 N3 ? ? SA G 487 SA C 500 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog659 hydrog ? ? 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SA G 1777 SA C 1784 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1300 hydrog ? ? C G 1785 N2 ? ? ? 1_555 C C 1792 O2 ? ? SA G 1777 SA C 1784 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1301 hydrog ? ? C G 1785 O6 ? ? ? 1_555 C C 1792 N4 ? ? SA G 1777 SA C 1784 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1302 hydrog ? ? C G 1786 N1 ? ? ? 1_555 C C 1792 N3 ? ? SA G 1778 SA C 1784 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1303 hydrog ? ? C G 1786 N2 ? ? ? 1_555 C C 1792 O2 ? ? SA G 1778 SA C 1784 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1304 hydrog ? ? C G 1786 O6 ? ? ? 1_555 C C 1792 N4 ? ? SA G 1778 SA C 1784 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1305 hydrog ? ? C U 1787 N3 ? ? ? 1_555 C C 1791 N3 ? ? SA U 1779 SA C 1783 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog1306 hydrog ? ? C U 1787 O4 ? ? ? 1_555 C C 1791 N4 ? ? SA U 1779 SA C 1783 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 40 N . ? GLU 40 SR PRO 41 N ? PRO 41 SR 1 13.08 2 ARG 123 N . ? ARG 123 SR PRO 124 N ? PRO 124 SR 1 6.11 3 ARG 28 O . ? ARG 28 SX PRO 29 O ? PRO 29 SX 1 0.13 4 LEU 546 KA . ? 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GLY GLY RL . n FB 55 31 ASP 31 31 31 ASP ASP RL . n FB 55 32 ARG 32 32 32 ARG ARG RL . n FB 55 33 ALA 33 33 33 ALA ALA RL . n FB 55 34 ARG 34 34 34 ARG ARG RL . n FB 55 35 ASN 35 35 35 ASN ASN RL . n FB 55 36 GLN 36 36 36 GLN GLN RL . n FB 55 37 LEU 37 37 37 LEU LEU RL . n FB 55 38 PRO 38 38 38 PRO PRO RL . n FB 55 39 ASN 39 39 39 ASN ASN RL . n FB 55 40 LEU 40 40 40 LEU LEU RL . n FB 55 41 HIS 41 41 41 HIS HIS RL . n FB 55 42 TYR 42 42 42 TYR TYR RL . n FB 55 43 LEU 43 43 43 LEU LEU RL . n FB 55 44 MET 44 44 44 MET MET RL . n FB 55 45 MET 45 45 45 MET MET RL . n FB 55 46 SER 46 46 46 SER SER RL . n FB 55 47 ALA 47 47 47 ALA ALA RL . n FB 55 48 ASP 48 48 48 ASP ASP RL . n FB 55 49 LEU 49 49 49 LEU LEU RL . n FB 55 50 LYS 50 50 50 LYS LYS RL . n FB 55 51 MET 51 51 51 MET MET RL . n FB 55 52 ASN 52 52 52 ASN ASN RL . n FB 55 53 LYS 53 53 53 LYS LYS RL . n FB 55 54 SER 54 54 54 SER SER RL . n FB 55 55 VAL 55 55 55 VAL VAL RL . n FB 55 56 LEU 56 56 56 LEU LEU RL . n FB 55 57 TRP 57 57 57 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N1 5A U 91 ? ? 126.47 122.70 3.77 0.50 N 26 1 N1 5A U 310 ? ? C2 5A U 310 ? ? O2 5A U 310 ? ? 127.89 122.80 5.09 0.70 N 27 1 N3 5A U 310 ? ? C2 5A U 310 ? ? O2 5A U 310 ? ? 116.15 122.20 -6.05 0.70 N 28 1 C5 5A U 312 ? ? C6 5A U 312 ? ? N1 5A U 312 ? ? 119.15 122.70 -3.55 0.50 N 29 1 C2 5A U 312 ? ? N1 5A U 312 ? ? "C1'" 5A U 312 ? ? 110.29 117.70 -7.41 1.20 N 30 1 "C3'" 5A U 312 ? ? "O3'" 5A U 312 ? ? P 5A A 313 ? ? 130.44 119.70 10.74 1.20 Y 31 1 "O3'" 5A U 312 ? ? P 5A A 313 ? ? OP1 5A A 313 ? ? 120.15 110.50 9.65 1.10 Y 32 1 "C3'" 5A G 492 ? ? "O3'" 5A G 492 ? ? P 5A A 493 ? ? 126.90 119.70 7.20 1.20 Y 33 1 N1 SA C 38 ? ? C2 SA C 38 ? ? O2 SA C 38 ? ? 122.67 118.90 3.77 0.60 N 34 1 "C3'" SA U 56 ? ? "O3'" SA U 56 ? ? P SA G 57 ? ? 127.78 119.70 8.08 1.20 Y 35 1 N1 SA C 166 ? ? C2 SA C 166 ? ? O2 SA C 166 ? ? 123.65 118.90 4.75 0.60 N 36 1 N3 SA C 166 ? ? C2 SA C 166 ? ? O2 SA C 166 ? ? 117.44 121.90 -4.46 0.70 N 37 1 N1 SA U 209 ? ? C2 SA U 209 ? ? O2 SA U 209 ? ? 127.05 122.80 4.25 0.70 N 38 1 N3 SA U 209 ? ? C2 SA U 209 ? ? O2 SA U 209 ? ? 117.45 122.20 -4.75 0.70 N 39 1 N1 SA C 258 ? ? C2 SA C 258 ? ? O2 SA C 258 ? ? 123.91 118.90 5.01 0.60 N 40 1 N3 SA C 258 ? ? C2 SA C 258 ? ? O2 SA C 258 ? ? 117.12 121.90 -4.78 0.70 N 41 1 C2 SA C 258 ? ? N1 SA C 258 ? ? "C1'" SA C 258 ? ? 127.41 118.80 8.61 1.10 N 42 1 "C3'" SA U 272 ? ? "O3'" SA U 272 ? ? P SA G 273 ? ? 128.15 119.70 8.45 1.20 Y 43 1 C4 SA G 273 ? ? N9 SA G 273 ? ? "C1'" SA G 273 ? ? 134.42 126.50 7.92 1.30 N 44 1 N1 SA C 275 ? ? C2 SA C 275 ? ? O2 SA C 275 ? ? 123.72 118.90 4.82 0.60 N 45 1 N3 SA C 275 ? ? C2 SA C 275 ? ? O2 SA C 275 ? ? 117.46 121.90 -4.44 0.70 N 46 1 C2 SA C 275 ? ? N1 SA C 275 ? ? "C1'" SA C 275 ? ? 126.82 118.80 8.02 1.10 N 47 1 N1 SA U 280 ? ? C2 SA U 280 ? ? O2 SA U 280 ? ? 127.32 122.80 4.52 0.70 N 48 1 N3 SA U 280 ? ? C2 SA U 280 ? ? O2 SA U 280 ? ? 117.39 122.20 -4.81 0.70 N 49 1 C2 SA U 280 ? ? N1 SA U 280 ? ? "C1'" SA U 280 ? ? 125.53 117.70 7.83 1.20 N 50 1 N3 SA U 302 ? ? C2 SA U 302 ? ? O2 SA U 302 ? ? 117.68 122.20 -4.52 0.70 N 51 1 N1 SA U 311 ? ? C2 SA U 311 ? ? O2 SA U 311 ? ? 127.71 122.80 4.91 0.70 N 52 1 C2 SA U 311 ? ? N1 SA U 311 ? ? "C1'" SA U 311 ? ? 125.79 117.70 8.09 1.20 N 53 1 N1 SA U 374 ? ? C2 SA U 374 ? ? O2 SA U 374 ? ? 128.16 122.80 5.36 0.70 N 54 1 N3 SA U 374 ? ? C2 SA U 374 ? ? O2 SA U 374 ? ? 117.39 122.20 -4.81 0.70 N 55 1 C2 SA U 374 ? ? N1 SA U 374 ? ? "C1'" SA U 374 ? ? 127.08 117.70 9.38 1.20 N 56 1 C6 SA C 376 ? ? N1 SA C 376 ? ? C2 SA C 376 ? ? 117.86 120.30 -2.44 0.40 N 57 1 N1 SA C 376 ? ? C2 SA C 376 ? ? O2 SA C 376 ? ? 125.13 118.90 6.23 0.60 N 58 1 N3 SA C 376 ? ? C2 SA C 376 ? ? O2 SA C 376 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 59 1 C2 SA C 376 ? ? N1 SA C 376 ? ? "C1'" SA C 376 ? ? 128.09 118.80 9.29 1.10 N 60 1 N3 SA C 381 ? ? C2 SA C 381 ? ? O2 SA C 381 ? ? 117.10 121.90 -4.80 0.70 N 61 1 "C3'" SA A 401 ? ? "O3'" SA A 401 ? ? P SA C 402 ? ? 127.49 119.70 7.79 1.20 Y 62 1 N7 SA G 514 ? ? C8 SA G 514 ? ? N9 SA G 514 ? ? 116.15 113.10 3.05 0.50 N 63 1 "O4'" SA A 545 ? ? "C1'" SA A 545 ? ? N9 SA A 545 ? ? 113.51 108.50 5.01 0.70 N 64 1 "O4'" SA G 562 ? ? "C1'" SA G 562 ? ? N9 SA G 562 ? ? 112.87 108.50 4.37 0.70 N 65 1 N1 SA C 575 ? ? C2 SA C 575 ? ? O2 SA C 575 ? ? 122.53 118.90 3.63 0.60 N 66 1 "C3'" SA A 579 ? ? "O3'" SA A 579 ? ? P SA A 580 ? ? 128.26 119.70 8.56 1.20 Y 67 1 C2 SA G 607 ? ? N3 SA G 607 ? ? C4 SA G 607 ? ? 115.90 111.90 4.00 0.50 N 68 1 N3 SA G 607 ? ? C4 SA G 607 ? ? C5 SA G 607 ? ? 124.53 128.60 -4.07 0.50 N 69 1 N3 SA G 607 ? ? C4 SA G 607 ? ? N9 SA G 607 ? ? 130.00 126.00 4.00 0.60 N 70 1 C8 SA G 607 ? ? N9 SA G 607 ? ? "C1'" SA G 607 ? ? 119.09 127.00 -7.91 1.30 N 71 1 C4 SA G 607 ? ? N9 SA G 607 ? ? "C1'" SA G 607 ? ? 136.63 126.50 10.13 1.30 N 72 1 C2 SA U 608 ? ? N1 SA U 608 ? ? "C1'" SA U 608 ? ? 125.66 117.70 7.96 1.20 N 73 1 N3 SA G 648 ? ? C4 SA G 648 ? ? N9 SA G 648 ? ? 130.01 126.00 4.01 0.60 N 74 1 C8 SA G 648 ? ? N9 SA G 648 ? ? "C1'" SA G 648 ? ? 119.09 127.00 -7.91 1.30 N 75 1 C4 SA G 648 ? ? N9 SA G 648 ? ? "C1'" SA G 648 ? ? 134.73 126.50 8.23 1.30 N 76 1 "O4'" SA U 826 ? ? "C1'" SA U 826 ? ? N1 SA U 826 ? ? 113.13 108.50 4.63 0.70 N 77 1 N1 SA U 861 ? ? C2 SA U 861 ? ? O2 SA U 861 ? ? 127.16 122.80 4.36 0.70 N 78 1 C6 SA U 861 ? ? N1 SA U 861 ? ? "C1'" SA U 861 ? ? 110.58 121.20 -10.62 1.40 N 79 1 C2 SA U 861 ? ? N1 SA U 861 ? ? "C1'" SA U 861 ? ? 130.44 117.70 12.74 1.20 N 80 1 N1 SA U 864 ? ? C2 SA U 864 ? ? O2 SA U 864 ? ? 127.09 122.80 4.29 0.70 N 81 1 N3 SA U 864 ? ? C2 SA U 864 ? ? O2 SA U 864 ? ? 117.76 122.20 -4.44 0.70 N 82 1 C2 SA U 864 ? ? N1 SA U 864 ? ? "C1'" SA U 864 ? ? 125.50 117.70 7.80 1.20 N 83 1 N1 SA U 935 ? ? C2 SA U 935 ? ? O2 SA U 935 ? ? 127.07 122.80 4.27 0.70 N 84 1 C2 SA U 965 ? ? N1 SA U 965 ? ? "C1'" SA U 965 ? ? 125.39 117.70 7.69 1.20 N 85 1 C6 SA C 1034 ? ? N1 SA C 1034 ? ? C2 SA C 1034 ? ? 117.57 120.30 -2.73 0.40 N 86 1 C5 SA C 1034 ? ? C6 SA C 1034 ? ? N1 SA C 1034 ? ? 126.02 121.00 5.02 0.50 N 87 1 "O4'" SA U 1052 ? ? "C1'" SA U 1052 ? ? N1 SA U 1052 ? ? 113.50 108.50 5.00 0.70 N 88 1 "O5'" SA G 1053 ? ? P SA G 1053 ? ? OP1 SA G 1053 ? ? 98.56 105.70 -7.14 0.90 N 89 1 N3 SA U 1055 ? ? C2 SA U 1055 ? ? O2 SA U 1055 ? ? 117.93 122.20 -4.27 0.70 N 90 1 N1 SA U 1056 ? ? C2 SA U 1056 ? ? O2 SA U 1056 ? ? 127.66 122.80 4.86 0.70 N 91 1 N3 SA U 1056 ? ? C2 SA U 1056 ? ? O2 SA U 1056 ? ? 117.86 122.20 -4.34 0.70 N 92 1 "O3'" SA A 1084 ? ? P SA G 1085 ? ? OP1 SA G 1085 ? ? 118.21 110.50 7.71 1.10 Y 93 1 C6 SA C 1174 ? ? N1 SA C 1174 ? ? C2 SA C 1174 ? ? 117.63 120.30 -2.67 0.40 N 94 1 N1 SA C 1174 ? ? C2 SA C 1174 ? ? O2 SA C 1174 ? ? 125.12 118.90 6.22 0.60 N 95 1 N3 SA C 1174 ? ? C2 SA C 1174 ? ? O2 SA C 1174 ? ? 115.83 121.90 -6.07 0.70 N 96 1 C2 SA C 1174 ? ? N1 SA C 1174 ? ? "C1'" SA C 1174 ? ? 127.89 118.80 9.09 1.10 N 97 1 N1 SA U 1175 ? ? 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"C1'" SA U 1258 ? ? 126.42 117.70 8.72 1.20 N 109 1 C6 SA C 1274 ? ? N1 SA C 1274 ? ? C2 SA C 1274 ? ? 116.71 120.30 -3.59 0.40 N 110 1 C5 SA C 1274 ? ? C6 SA C 1274 ? ? N1 SA C 1274 ? ? 125.10 121.00 4.10 0.50 N 111 1 N1 SA C 1274 ? ? C2 SA C 1274 ? ? O2 SA C 1274 ? ? 123.61 118.90 4.71 0.60 N 112 1 N3 SA C 1274 ? ? C2 SA C 1274 ? ? O2 SA C 1274 ? ? 117.37 121.90 -4.53 0.70 N 113 1 C2 SA C 1274 ? ? N1 SA C 1274 ? ? "C1'" SA C 1274 ? ? 128.40 118.80 9.60 1.10 N 114 1 N3 SA C 1439 ? ? C2 SA C 1439 ? ? O2 SA C 1439 ? ? 117.68 121.90 -4.22 0.70 N 115 1 C6 SA C 1440 ? ? N1 SA C 1440 ? ? C2 SA C 1440 ? ? 117.77 120.30 -2.53 0.40 N 116 1 C5 SA C 1440 ? ? C6 SA C 1440 ? ? N1 SA C 1440 ? ? 124.03 121.00 3.03 0.50 N 117 1 N3 SA C 1441 ? ? C2 SA C 1441 ? ? O2 SA C 1441 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 118 1 C6 SA C 1451 ? ? N1 SA C 1451 ? ? C2 SA C 1451 ? ? 117.01 120.30 -3.29 0.40 N 119 1 N1 SA C 1451 ? ? C2 SA C 1451 ? ? O2 SA C 1451 ? ? 123.17 118.90 4.27 0.60 N 120 1 N3 SA C 1451 ? ? 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? -101.77 -60.61 262 1 VAL AE 1165 ? ? -128.05 -52.14 263 1 TYR AE 1370 ? ? -118.99 58.86 264 1 ASN AE 1418 ? ? -108.93 42.49 265 1 THR AE 1467 ? ? -93.25 58.66 266 1 THR AE 1471 ? ? 66.06 -1.08 267 1 LYS AE 1491 ? ? 68.36 -8.85 268 1 GLU AE 1509 ? ? -102.14 79.32 269 1 ASP AE 1541 ? ? -91.45 51.02 270 1 ASP AE 1557 ? ? -121.54 -66.25 271 1 ASN AE 1563 ? ? -93.17 55.32 272 1 ALA AE 1564 ? ? 61.12 66.34 273 1 GLU AE 1568 ? ? -151.71 87.97 274 1 THR AE 1569 ? ? -130.57 -63.86 275 1 ARG AE 1587 ? ? 65.72 -1.04 276 1 GLU AE 1636 ? ? -140.20 46.97 277 1 SER AE 1642 ? ? -143.70 21.18 278 1 HIS AE 1683 ? ? -100.63 -60.85 279 1 SER AE 1700 ? ? 58.27 72.87 280 1 LEU AE 1723 ? ? -77.34 -164.87 281 1 ASP AE 1739 ? ? -92.85 33.50 282 1 THR AF 61 ? ? 39.66 34.99 283 1 ARG AF 79 ? ? -92.55 54.62 284 1 ASP AF 82 ? ? -118.45 -168.74 285 1 ASN AF 112 ? ? -160.50 85.92 286 1 ALA AF 122 ? ? -79.40 -158.74 287 1 GLN AF 135 ? ? -93.20 -60.01 288 1 ASP AF 145 ? ? -87.66 47.09 289 1 ALA AF 157 ? ? -98.12 36.05 290 1 ASP AF 169 ? ? -163.97 114.77 291 1 LEU AF 192 ? ? 60.40 72.63 292 1 SER AF 200 ? ? -79.44 -162.54 293 1 VAL AF 221 ? ? -93.47 -63.88 294 1 ASN AF 250 ? ? -89.25 31.75 295 1 ASN AF 263 ? ? 64.84 -0.98 296 1 SER AF 276 ? ? -141.80 33.58 297 1 LEU AF 277 ? ? 59.90 5.98 298 1 ASP AF 288 ? ? -103.15 72.17 299 1 GLN AF 313 ? ? 59.00 5.92 300 1 MET AF 361 ? ? -106.29 40.84 301 1 PHE AF 405 ? ? -93.57 35.72 302 1 ASP AF 435 ? ? -148.55 -159.66 303 1 ALA AG 21 ? ? 60.36 73.00 304 1 LEU AG 22 ? ? -69.32 -176.39 305 1 LEU AG 79 ? ? -141.63 20.44 306 1 GLN AG 100 ? ? 55.76 13.42 307 1 LYS AG 130 ? ? -97.32 39.70 308 1 ALA AG 137 ? ? -79.76 -161.35 309 1 GLU AG 139 ? ? -48.19 154.81 310 1 LEU AG 141 ? ? 58.29 73.89 311 1 SER AG 147 ? ? -148.14 -158.22 312 1 PHE AG 157 ? ? -125.50 -166.05 313 1 LYS AG 183 ? ? -133.59 -32.69 314 1 HIS AG 189 ? ? 58.20 76.73 315 1 ASP AG 298 ? ? -125.25 -169.39 316 1 LYS AG 319 ? ? -92.06 48.67 317 1 ASN AG 338 ? ? 36.18 48.35 318 1 LEU AG 347 ? ? -131.47 -38.33 319 1 THR AG 361 ? ? -94.37 31.38 320 1 LEU AG 383 ? ? 63.28 73.86 321 1 ILE AG 396 ? ? -102.61 -70.24 322 1 LYS AG 397 ? ? -160.34 97.29 323 1 SER AG 413 ? ? -76.71 -166.65 324 1 GLN AG 434 ? ? -63.31 53.96 325 1 ASN AG 465 ? ? 38.50 56.66 326 1 ASN AG 469 ? ? -160.86 -168.14 327 1 SER AG 521 ? ? -91.67 32.59 328 1 ASN AG 549 ? ? 49.16 73.47 329 1 HIS AG 551 ? ? 69.02 -1.58 330 1 LYS AG 597 ? ? -90.16 -62.11 331 1 SER AG 610 ? ? -95.99 56.65 332 1 LYS AG 648 ? ? 36.44 57.54 333 1 ASN AG 699 ? ? -96.70 -66.29 334 1 LEU AG 722 ? ? -162.09 115.88 335 1 THR AG 736 ? ? -126.75 -169.76 336 1 SER AG 748 ? ? 61.21 67.85 337 1 ASP AG 749 ? ? 63.70 60.56 338 1 ASN AG 881 ? ? 49.58 23.89 339 1 ASP B1 76 ? ? -141.67 21.96 340 1 SER B1 247 ? ? -150.52 50.55 341 1 TRP B1 248 ? ? 60.82 66.02 342 1 GLU B1 335 ? ? -69.39 91.73 343 1 ASP B1 346 ? ? 72.48 -9.45 344 1 LEU B1 416 ? ? -96.58 32.84 345 1 ASP B1 451 ? ? -143.13 18.76 346 1 PHE B1 453 ? ? 66.03 -0.01 347 1 TRP B1 493 ? ? -67.82 2.73 348 1 ARG B1 505 ? ? 68.87 -3.94 349 1 ALA B1 520 ? ? 64.02 76.64 350 1 SER B1 577 ? ? -143.27 31.74 351 1 LYS B1 578 ? ? -97.10 55.70 352 1 ASN B1 599 ? ? -98.74 30.07 353 1 ASN B1 624 ? ? -90.53 -62.38 354 1 ASN B1 691 ? ? 36.19 57.58 355 1 LEU B1 711 ? ? 61.62 81.06 356 1 PHE B1 712 ? ? -55.36 108.33 357 1 ASP B1 716 ? ? 34.28 56.22 358 1 PHE B1 817 ? ? -93.31 48.65 359 1 SER B2 19 ? ? -118.27 -166.32 360 1 GLU B2 47 ? ? 64.06 -3.15 361 1 ASP B2 92 ? ? 63.85 65.10 362 1 ASN B2 118 ? ? -50.42 -73.38 363 1 THR B2 132 ? ? -26.39 -46.01 364 1 THR B2 134 ? ? 57.34 -0.16 365 1 SER B2 165 ? ? -170.36 129.34 366 1 ASP B2 214 ? ? -35.73 -38.06 367 1 SER B2 224 ? ? 67.35 -7.05 368 1 SER B2 266 ? ? 72.96 -13.83 369 1 ASP B2 267 ? ? -124.34 -78.68 370 1 LYS B2 268 ? ? -178.11 126.41 371 1 LYS B2 279 ? ? 62.97 -1.39 372 1 SER B2 347 ? ? 65.53 -2.17 373 1 SER B2 348 ? ? 56.57 11.72 374 1 THR B2 361 ? ? -172.52 134.76 375 1 TYR B2 369 ? ? -162.14 117.79 376 1 LYS B2 371 ? ? 76.72 -5.34 377 1 ARG B2 372 ? ? -130.55 -38.35 378 1 THR B2 375 ? ? 57.60 18.19 379 1 ARG B2 391 ? ? 68.02 -8.45 380 1 SER B2 400 ? ? -78.39 -160.38 381 1 ASP B2 402 ? ? -144.27 -3.15 382 1 SER B2 462 ? ? -78.00 -164.79 383 1 SER B2 463 ? ? -63.88 -70.14 384 1 ASN B2 553 ? ? 58.84 9.35 385 1 LYS B2 573 ? ? 81.15 7.58 386 1 LEU B2 577 ? ? -87.92 -156.69 387 1 SER B2 578 ? ? -39.53 138.02 388 1 HIS B2 614 ? ? 48.85 77.23 389 1 GLN B2 615 ? ? -63.39 8.97 390 1 SER B2 617 ? ? -172.11 128.15 391 1 LYS B2 779 ? ? -125.46 -168.15 392 1 MET B2 840 ? ? -94.27 47.89 393 1 THR B3 5 ? ? -142.50 18.21 394 1 SER B3 26 ? ? -78.49 -165.92 395 1 ASN B3 28 ? ? -120.98 -53.54 396 1 LYS B3 91 ? ? -30.97 -37.48 397 1 ASP B3 111 ? ? -79.70 -166.94 398 1 SER B3 139 ? ? -93.23 -62.77 399 1 SER B3 165 ? ? 62.98 70.85 400 1 ASN B3 221 ? ? -39.46 122.64 401 1 PHE B3 225 ? ? 62.99 72.60 402 1 LEU B3 237 ? ? -157.65 86.51 403 1 ASN B3 240 ? ? -164.59 116.44 404 1 GLU B3 244 ? ? 60.37 68.51 405 1 PHE B3 248 ? ? 60.94 65.50 406 1 GLU B3 273 ? ? 46.50 24.85 407 1 SER B3 276 ? ? -162.40 110.39 408 1 LEU B3 297 ? ? 61.90 60.31 409 1 ASN B3 336 ? ? -172.02 147.62 410 1 ASN B3 351 ? ? -86.84 -159.48 411 1 LYS B3 352 ? ? 55.08 76.13 412 1 PRO B3 360 ? ? -85.74 45.82 413 1 HIS B3 433 ? ? -176.31 -178.79 414 1 ALA B3 436 ? ? 34.66 62.39 415 1 VAL B3 446 ? ? -95.40 30.36 416 1 THR B3 472 ? ? 76.54 -6.83 417 1 SER B3 474 ? ? 31.02 58.31 418 1 ALA B3 496 ? ? 60.82 66.80 419 1 SER B3 510 ? ? -161.37 -160.97 420 1 TYR B3 511 ? ? 63.96 64.02 421 1 ASP B3 512 ? ? 60.85 69.44 422 1 LYS B3 513 ? ? 80.24 -1.36 423 1 GLU B3 521 ? ? -159.34 -155.26 424 1 ASN B3 522 ? ? -55.22 109.48 425 1 THR B3 528 ? ? -97.42 56.81 426 1 ASN B3 531 ? ? -141.42 45.94 427 1 MET B3 568 ? ? 60.22 69.86 428 1 ASN B3 585 ? ? 73.90 -27.18 429 1 LYS B3 586 ? ? -150.32 -52.10 430 1 GLN B3 587 ? ? -141.44 -23.57 431 1 CYS B3 593 ? ? 61.04 67.67 432 1 TRP B3 621 ? ? -115.07 79.00 433 1 ALA B3 622 ? ? -171.02 130.06 434 1 MET B3 626 ? ? -97.00 37.78 435 1 MET B3 631 ? ? -83.50 -148.57 436 1 ILE B3 632 ? ? -39.96 124.12 437 1 ALA B3 637 ? ? -79.91 -155.58 438 1 MET B3 778 ? ? -96.27 30.24 439 1 ASN B8 41 ? ? 57.95 12.97 440 1 THR B8 221 ? ? -82.76 -76.49 441 1 LEU B8 222 ? ? -130.16 -60.78 442 1 ASN B8 224 ? ? -86.11 47.50 443 1 SER B8 225 ? ? -120.22 -56.08 444 1 LYS B8 226 ? ? 64.33 -4.30 445 1 LYS B8 231 ? ? 71.47 -10.30 446 1 GLN B8 307 ? ? 38.05 50.18 447 1 GLN B8 310 ? ? 57.25 70.51 448 1 SER B8 343 ? ? -140.09 15.41 449 1 ASN B8 369 ? ? -94.38 50.07 450 1 ALA B8 499 ? ? -94.70 32.75 451 1 SER B8 503 ? ? 67.95 -8.24 452 1 ILE BE 23 ? ? -103.81 -62.91 453 1 TYR BE 94 ? ? -124.90 -165.67 454 1 PRO BE 145 ? ? -66.72 4.25 455 1 ASN BE 178 ? ? 33.57 52.12 456 1 GLN BE 248 ? ? 39.83 63.79 457 1 SER BE 269 ? ? -65.28 3.90 458 1 LEU BE 343 ? ? -129.05 -161.88 459 1 ARG BE 373 ? ? 70.35 31.57 460 1 TRP BE 427 ? ? -149.22 -159.99 461 1 ASN BE 429 ? ? -131.55 -33.10 462 1 ASP BE 459 ? ? -140.72 19.48 463 1 LEU BE 605 ? ? -65.43 2.12 464 1 SER BE 854 ? ? -94.67 46.97 465 1 PHE BE 855 ? ? -122.75 -71.74 466 1 ASN BE 899 ? ? -96.62 55.06 467 1 ASN B6 44 ? ? -97.80 49.93 468 1 ASN B6 81 ? ? 38.20 48.96 469 1 SER B6 82 ? ? -125.69 -166.56 470 1 PRO B6 104 ? ? -87.03 44.60 471 1 PRO B6 176 ? ? -87.58 44.57 472 1 ARG B6 266 ? ? -126.72 -167.11 473 1 PHE B6 326 ? ? -92.80 30.85 474 1 TYR B6 347 ? ? 66.37 -0.05 475 1 ASP B6 348 ? ? -140.04 26.51 476 1 LYS B6 353 ? ? -149.50 -153.95 477 1 ASP B6 354 ? ? -57.73 170.24 478 1 GLU B6 377 ? ? -102.17 41.23 479 1 ASP 5B 169 ? ? -126.92 -166.65 480 1 ARG 5C 15 ? ? 60.84 81.14 481 1 GLU 5C 16 ? ? -48.45 -13.25 482 1 GLU 5C 77 ? ? 55.95 14.51 483 1 ASN 5C 151 ? ? -67.41 6.45 484 1 LEU 5C 160 ? ? -95.28 -81.80 485 1 GLN 5C 170 ? ? -93.03 -158.25 486 1 HIS 5C 363 ? ? -92.20 32.76 487 1 ASP 5C 388 ? ? -90.43 51.38 488 1 SER 5C 456 ? ? 60.56 79.20 489 1 SER 5C 457 ? ? -36.13 139.73 490 1 ALA 5C 463 ? ? 71.29 -16.84 491 1 ARG 5C 552 ? ? 85.79 -4.91 492 1 LYS 5D 11 ? ? -78.75 -168.62 493 1 ARG 5D 22 ? ? -94.99 50.76 494 1 PHE 5D 27 ? ? 60.60 79.86 495 1 ASN 5D 59 ? ? 61.35 84.89 496 1 PRO 5D 60 ? ? -63.67 8.51 497 1 ASP 5D 61 ? ? -106.18 45.18 498 1 ASP 5D 73 ? ? -77.17 -167.47 499 1 SER 5D 139 ? ? -43.27 -71.05 500 1 ARG 5D 140 ? ? -144.00 -24.86 501 1 THR 5D 147 ? ? 51.78 77.64 502 1 ASN 5D 153 ? ? 72.09 -9.99 503 1 PHE 5E 347 ? ? -166.91 -169.65 504 1 ASN 5E 377 ? ? -92.89 54.19 505 1 SER 5E 452 ? ? -94.59 51.85 506 1 MET 5E 476 ? ? 59.08 -12.47 507 1 PRO 5E 481 ? ? -97.70 -158.79 508 1 LEU 5E 482 ? ? 72.47 -4.51 509 1 SER 5E 485 ? ? 62.41 61.02 510 1 LYS 5F 4 ? ? 52.57 73.87 511 1 GLU 5F 42 ? ? 75.06 -4.39 512 1 LYS 5F 91 ? ? -99.53 39.39 513 1 SER 5F 92 ? ? -77.54 -163.31 514 1 ASN 5F 163 ? ? 81.06 3.18 515 1 ASN 5F 175 ? ? 33.65 43.78 516 1 SER 5G 93 ? ? -72.94 -70.21 517 1 ARG 5G 94 ? ? -172.01 126.89 518 1 ASN 5G 113 ? ? 33.70 48.04 519 1 PRO 5G 158 ? ? -68.92 74.83 520 1 HIS 5G 159 ? ? 37.63 48.72 521 1 ASN 5G 193 ? ? 34.33 58.70 522 1 LYS 5H 595 ? ? 66.78 -7.71 523 1 SER 5I 9 ? ? 70.82 -13.63 524 1 ALA 5I 10 ? ? 58.21 0.81 525 1 PHE 5I 35 ? ? -100.91 68.42 526 1 HIS 5I 109 ? ? -127.80 -169.59 527 1 LEU 5I 172 ? ? 60.24 71.70 528 1 SER 5I 192 ? ? 59.82 14.48 529 1 LEU 5I 215 ? ? -117.28 77.30 530 1 ALA 5I 219 ? ? -93.18 53.62 531 1 ASP 5I 241 ? ? -93.87 32.15 532 1 THR 5I 255 ? ? -126.55 -52.57 533 1 ALA 5I 274 ? ? 67.13 -7.91 534 1 HIS 5I 336 ? ? -94.69 -64.81 535 1 ARG 5I 405 ? ? -39.74 -34.95 536 1 LYS 5I 459 ? ? -69.59 4.66 537 1 HIS 5J 126 ? ? -108.48 41.36 538 1 HIS 5J 135 ? ? 60.58 73.27 539 1 TRP 5J 141 ? ? 58.46 70.25 540 1 TYR 5J 160 ? ? 71.63 -8.30 541 1 SER 5J 161 ? ? -99.41 -60.46 542 1 LYS 5J 170 ? ? -124.33 -169.77 543 1 GLU 5K 30 ? ? -107.71 41.65 544 1 PHE 5K 52 ? ? -81.33 -150.27 545 1 LEU RA 49 ? ? -93.35 -60.27 546 1 GLU RA 57 ? ? 77.58 -1.05 547 1 ASN RA 60 ? ? -95.83 -63.04 548 1 TYR RA 70 ? ? 62.07 68.00 549 1 LYS RA 78 ? ? 46.30 74.22 550 1 HIS RA 82 ? ? 52.51 70.74 551 1 ASN RA 127 ? ? -124.68 -167.01 552 1 ASN RA 150 ? ? 67.00 -0.58 553 1 CYS RA 151 ? ? 61.57 68.64 554 1 ASN RA 174 ? ? 27.95 65.06 555 1 LEU RA 178 ? ? -101.95 -168.08 556 1 THR RA 201 ? ? -97.30 37.72 557 1 ASN RA 202 ? ? 67.17 -0.33 558 1 PRO RA 228 ? ? -66.95 85.62 559 1 PHE RA 272 ? ? -100.70 -61.25 560 1 ASP RA 273 ? ? -162.99 113.54 561 1 THR RA 285 ? ? 42.49 70.97 562 1 GLU RA 286 ? ? -74.14 -166.23 563 1 ASN RA 287 ? ? 36.09 40.88 564 1 LEU RA 303 ? ? 67.79 -5.32 565 1 ASN RA 333 ? ? -127.27 -166.81 566 1 SER RB 237 ? ? 55.94 15.47 567 1 SER RB 252 ? ? -97.27 32.18 568 1 VAL RB 267 ? ? -105.16 -73.04 569 1 ASN RB 268 ? ? -105.80 60.71 570 1 ILE RB 274 ? ? -76.69 -82.68 571 1 LYS RB 275 ? ? -179.27 148.21 572 1 ASN RB 298 ? ? -125.30 -168.24 573 1 ARG RB 332 ? ? -162.77 115.75 574 1 ARG RB 341 ? ? -37.83 138.81 575 1 LYS RB 344 ? ? -92.87 48.24 576 1 LYS RE 117 ? ? -89.94 47.08 577 1 PHE RE 153 ? ? -94.29 31.54 578 1 ASN RE 173 ? ? -92.84 55.51 579 1 TYR RE 178 ? ? -104.35 77.63 580 1 THR RE 208 ? ? -79.02 -167.82 581 1 ASP RE 218 ? ? -67.94 7.69 582 1 ASN RE 221 ? ? 37.74 58.06 583 1 PHE RE 222 ? ? 46.22 23.80 584 1 TYR RE 286 ? ? -142.24 20.09 585 1 LYS RE 287 ? ? -108.66 -60.19 586 1 PHE RE 303 ? ? -128.05 -169.70 587 1 MET RE 379 ? ? -172.54 -179.54 588 1 SER RE 380 ? ? -131.77 -37.02 589 1 SER RE 382 ? ? -95.59 36.99 590 1 CYS RE 435 ? ? -95.01 -62.67 591 1 ASP RE 459 ? ? -97.88 34.33 592 1 GLU RE 623 ? ? -140.37 30.85 593 1 TYR RE 762 ? ? 60.16 61.23 594 1 ASP RE 1046 ? ? -161.78 89.87 595 1 LYS RE 1094 ? ? 72.39 -10.06 596 1 ASP RE 1097 ? ? 73.65 -15.72 597 1 PHE RE 1098 ? ? -164.43 118.46 598 1 SER RE 1130 ? ? -140.89 31.89 599 1 ASN RE 1180 ? ? -168.36 115.80 600 1 PHE RE 1190 ? ? -94.95 53.80 601 1 ASN RE 1199 ? ? -151.90 57.42 602 1 LYS RE 1205 ? ? -113.87 77.12 603 1 PRO RF 21 ? ? -69.17 -172.31 604 1 ASN RF 46 ? ? -79.20 -165.97 605 1 ASP RF 51 ? ? 33.47 53.87 606 1 ASN RF 90 ? ? -91.08 59.41 607 1 THR RF 162 ? ? -47.45 107.54 608 1 ASP RF 210 ? ? -84.52 -71.04 609 1 LYS RF 221 ? ? 64.23 -4.48 610 1 LYS RF 252 ? ? -63.78 -71.69 611 1 ALA RF 253 ? ? 176.66 159.19 612 1 LYS RF 254 ? ? -174.35 136.79 613 1 PHE RF 257 ? ? 73.79 -16.28 614 1 LYS RG 36 ? ? -60.19 1.49 615 1 ALA RG 87 ? ? -96.69 57.66 616 1 LEU RG 148 ? ? 68.31 -6.49 617 1 PRO RG 166 ? ? -79.60 -168.50 618 1 GLU RG 200 ? ? 70.89 -7.42 619 1 TYR RG 220 ? ? -134.40 -33.39 620 1 ALA RH 87 ? ? -100.74 74.98 621 1 LEU RH 160 ? ? -160.47 111.49 622 1 ALA RH 208 ? ? -98.25 35.29 623 1 ASN RH 250 ? ? 60.94 60.18 624 1 ARG RJ 61 ? ? 59.36 18.02 625 1 LYS RJ 82 ? ? 35.10 -96.43 626 1 ASP RJ 100 ? ? 60.89 68.34 627 1 MET RJ 164 ? ? -39.37 114.15 628 1 LEU RJ 252 ? ? -94.29 50.99 629 1 ALA RJ 356 ? ? -155.76 80.48 630 1 MET RJ 358 ? ? 68.43 -4.53 631 1 LEU RJ 400 ? ? -94.11 51.16 632 1 GLN RJ 401 ? ? -93.55 -61.06 633 1 GLU RJ 404 ? ? -94.49 30.48 634 1 SER RJ 406 ? ? -92.33 50.66 635 1 GLN RJ 770 ? ? -69.80 76.03 636 1 GLU RJ 771 ? ? -141.87 -159.76 637 1 GLU RJ 781 ? ? -124.13 -59.20 638 1 PHE RJ 783 ? ? 60.34 69.64 639 1 ALA RJ 785 ? ? -172.50 143.53 640 1 PHE RJ 942 ? ? -120.72 -168.41 641 1 LYS RJ 949 ? ? -85.15 -71.47 642 1 LYS RJ 1026 ? ? 71.81 -14.32 643 1 LYS RK 134 ? ? -61.14 -70.82 644 1 ASP RK 171 ? ? -140.77 18.07 645 1 ALA RK 288 ? ? 66.95 -7.40 646 1 GLU RK 306 ? ? -91.47 49.98 647 1 ASP RK 343 ? ? -98.07 34.00 648 1 GLU RL 110 ? ? -95.57 51.34 649 1 THR RL 165 ? ? -93.52 -69.46 650 1 MET RL 166 ? ? -132.60 -63.08 651 1 HIS RL 169 ? ? -128.93 -169.89 652 1 ASN RL 197 ? ? -98.92 35.12 653 1 SER RL 290 ? ? 73.51 -5.63 654 1 ALA RL 291 ? ? 63.15 61.75 655 1 SER RL 306 ? ? -99.89 58.12 656 1 GLN RL 335 ? ? -160.32 102.06 657 1 LYS RL 352 ? ? -162.23 -167.93 658 1 LEU RL 378 ? ? -98.01 37.65 659 1 HIS RL 545 ? ? -79.16 -163.18 660 1 TYR RL 546 ? ? -96.80 39.10 661 1 LYS RL 547 ? ? 61.60 67.44 662 1 LEU RL 567 ? ? -91.14 50.27 663 1 LEU RL 568 ? ? -75.18 -74.01 664 1 LYS RL 574 ? ? -77.26 -164.69 665 1 ARG RL 637 ? ? -126.31 -168.19 666 1 LYS RL 711 ? ? -88.46 49.52 667 1 PRO RL 744 ? ? -23.12 18.73 668 1 VAL RL 745 ? ? -36.67 136.57 669 1 ARG RL 748 ? ? -79.23 -164.28 670 1 TRP RL 773 ? ? -141.84 10.75 671 1 LYS RL 819 ? ? -93.61 -63.52 672 1 HIS RL 820 ? ? -143.45 18.88 673 1 ASN RL 822 ? ? -94.93 57.42 674 1 TYR RL 852 ? ? -104.66 41.53 675 1 ALA RL 899 ? ? -94.14 -63.22 676 1 LYS RM 21 ? ? 68.64 -4.26 677 1 ARG RM 32 ? ? -97.98 32.70 678 1 TYR RM 108 ? ? -99.66 36.09 679 1 GLN RM 125 ? ? -93.10 31.28 680 1 MET RM 164 ? ? -93.31 51.97 681 1 ARG RM 171 ? ? -93.02 -61.13 682 1 ALA RM 182 ? ? -93.97 52.72 683 1 LYS RM 230 ? ? -94.37 -60.15 684 1 LEU RM 253 ? ? -90.69 54.40 685 1 SER RM 290 ? ? 73.97 -9.76 686 1 ALA RM 292 ? ? -133.88 -39.13 687 1 SER RM 312 ? ? -158.62 88.21 688 1 SER RM 314 ? ? -151.88 56.14 689 1 GLU RM 323 ? ? -92.76 50.00 690 1 LEU RM 383 ? ? -96.95 53.04 691 1 SER RM 423 ? ? -126.79 -168.01 692 1 ALA RM 477 ? ? -70.17 -70.32 693 1 THR RM 507 ? ? -150.57 48.41 694 1 TYR RM 546 ? ? -78.67 -165.02 695 1 ASP RM 581 ? ? -150.50 69.36 696 1 ARG RM 608 ? ? -93.60 -62.27 697 1 ASP RM 612 ? ? -93.52 49.42 698 1 TYR RM 727 ? ? -170.21 -172.54 699 1 PRO RM 744 ? ? -17.86 -2.97 700 1 ALA RM 751 ? ? -167.67 -168.26 701 1 PHE RM 793 ? ? -103.94 40.10 702 1 PHE RM 796 ? ? 67.59 -2.52 703 1 THR RM 797 ? ? -140.16 43.06 704 1 ALA RM 798 ? ? -79.11 -169.77 705 1 ASP RM 817 ? ? -120.01 -65.19 706 1 LEU RM 904 ? ? -79.75 -87.18 707 1 PRO RM 905 ? ? -89.79 -72.40 708 1 SER RM 906 ? ? 175.85 165.16 709 1 PRO RN 285 ? ? -34.28 -80.96 710 1 SER RN 286 ? ? -161.61 90.59 711 1 ASP RN 287 ? ? 61.51 -10.77 712 1 ASP RN 385 ? ? 75.23 -8.30 713 1 LYS RN 392 ? ? -99.61 30.46 714 1 LEU RN 396 ? ? -95.33 -69.16 715 1 ASP RN 397 ? ? -134.40 -39.31 716 1 ALA RN 415 ? ? -69.67 85.27 717 1 ASN RN 438 ? ? -141.45 33.30 718 1 GLN RN 439 ? ? -79.96 -70.14 719 1 LYS RN 443 ? ? -82.18 -159.22 720 1 ASN RN 444 ? ? -63.52 96.95 721 1 THR RN 510 ? ? -89.19 34.76 722 1 TYR RN 596 ? ? -68.85 8.15 723 1 LYS RN 609 ? ? -98.18 32.85 724 1 THR RN 612 ? ? -133.72 -157.31 725 1 ILE RN 614 ? ? 54.12 79.49 726 1 PRO RN 615 ? ? -68.36 59.12 727 1 LEU RN 616 ? ? -141.04 56.66 728 1 ALA RN 626 ? ? -95.81 53.45 729 1 GLN RO 23 ? ? -67.65 -76.61 730 1 TYR RO 24 ? ? -137.09 -44.03 731 1 ILE RO 27 ? ? -122.18 -64.32 732 1 PHE RO 54 ? ? -121.44 -54.23 733 1 LEU RO 55 ? ? 70.52 -11.09 734 1 LEU RO 74 ? ? -75.74 -73.54 735 1 PRO RO 75 ? ? -95.99 53.82 736 1 LYS RO 84 ? ? -93.37 51.57 737 1 SER RO 114 ? ? 67.97 -3.89 738 1 LYS RO 138 ? ? -92.23 55.63 739 1 PHE RO 142 ? ? -140.58 46.41 740 1 LYS RO 214 ? ? -91.29 -61.00 741 1 ASP RO 233 ? ? -131.06 -37.55 742 1 ALA RO 234 ? ? -160.17 119.90 743 1 GLU RO 237 ? ? -124.70 -169.51 744 1 GLN RO 268 ? ? 39.13 64.15 745 1 HIS RO 288 ? ? -96.73 52.81 746 1 ASN RO 304 ? ? -94.34 30.71 747 1 ALA RO 312 ? ? -93.46 51.63 748 1 ASN RO 331 ? ? -69.15 82.78 749 1 ASN RO 441 ? ? -92.49 47.23 750 1 HIS RO 457 ? ? -88.31 49.30 751 1 PRO RO 487 ? ? -69.54 -177.30 752 1 ASN RO 494 ? ? 56.87 71.12 753 1 PHE RO 523 ? ? -100.24 75.63 754 1 ASN RO 528 ? ? -93.08 -61.41 755 1 GLU RP 29 ? ? 41.96 75.46 756 1 HIS RP 46 ? ? 67.27 -6.31 757 1 THR RP 76 ? ? 58.98 74.50 758 1 LYS RP 218 ? ? -99.31 36.28 759 1 ALA RP 251 ? ? -98.95 35.05 760 1 THR RP 264 ? ? 61.34 70.49 761 1 PHE RP 399 ? 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? -95.37 -65.80 791 1 ASP RP 1074 ? ? -99.30 35.32 792 1 SER RP 1076 ? ? -95.91 -61.43 793 1 VAL RP 1085 ? ? -121.75 -66.80 794 1 VAL RP 1087 ? ? -129.47 -50.39 795 1 LEU RP 1099 ? ? -97.49 37.27 796 1 HIS RP 1166 ? ? -95.43 -61.01 797 1 PHE RP 1210 ? ? -140.62 49.33 798 1 ASP RP 1214 ? ? -121.95 -51.26 799 1 LEU RP 1249 ? ? 60.28 64.84 800 1 LEU RP 1264 ? ? -98.56 37.41 801 1 GLU RP 1286 ? ? 71.71 -11.94 802 1 ASP RP 1433 ? ? 72.42 -4.70 803 1 PHE RP 1434 ? ? -106.55 -61.90 804 1 SER RP 1480 ? ? -85.40 49.80 805 1 LEU RP 1527 ? ? -92.60 -61.72 806 1 MET RP 1610 ? ? -118.44 50.47 807 1 ASP RP 1627 ? ? -78.88 -168.52 808 1 SER RP 1647 ? ? -91.17 53.38 809 1 SER RP 1708 ? ? -79.93 -165.74 810 1 ASP RP 1709 ? ? -94.89 33.06 811 1 SER RP 1714 ? ? 65.78 -2.09 812 1 HIS RP 1739 ? ? -64.86 -72.33 813 1 LYS RP 1746 ? ? 73.91 -13.72 814 1 SER RP 1747 ? ? 57.07 1.62 815 1 LYS RP 1749 ? ? -90.50 50.30 816 1 ALA RP 1758 ? ? -131.41 -37.33 817 1 VAL RP 1779 ? ? -122.01 -75.56 818 1 ARG RP 1780 ? ? 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SerialEM ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4.1.8 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 3.0 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION 3.0 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? 14 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 2.0 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7D63 'double helix' 7D63 'a-form double helix' 7D63 'hairpin loop' 7D63 'bulge loop' 7D63 'mismatched base pair' 7D63 'internal loop' 7D63 'triple helix' 7D63 'three-way junction' 7D63 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A U 2 1_555 C C 1131 1_555 0.015 -1.351 -0.138 -14.561 -11.159 -4.018 1 3A_U2:C1123_SA 3A 2 ? 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