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'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 'Biological sequence' 1 1289 ;Baker's yeast ; ? 'TRS120, YDR407C, D9509.25, ESBP10' ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 'Biological sequence' 1 560 ;Baker's yeast ; ? 'TRS65, KRE11, YGR166W' ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TCA17_YEAST P32613 ? 1 ;MSLRPCFVSLIDESDKPILIYVPNEAENEMNDVLKYNVLSNISLDYFESALVEWHSLDSKPLLKSIFQLEGVSVFAMLIK QTGLKIVIGFEQKSLSGADDEFEAINQIFETVRKIYIRVKCNPLLVSGDEKSIIKSLERKFDELFISTEVEL ; 1 2 UNP BET3_YEAST P36149 ? 2 ;MVSTTQSRSLKAMGEEIWKNKTEKINTELFTLTYGSIVAQLCQDYERDFNKVNDHLYSMGYNIGCRLIEDFLARTALPRC ENLVKTSEVLSKCAFKIFLNITPNITNWSHNKDTFSLILDENPLADFVELPMDAMKSLWYSNILCGVLKGSLEMVQLDCD VWFVSDILRGDSQTEIKVKLNRILKDEIPIG ; 1 3 UNP TRS33_YEAST Q99394 ? 3 ;MSSTHSNNVGHPQSSPQGPLTEQQRAQQQYQIFENSLPKVSQSVYQMLLNEMVPLAMGIERQISGDVISSDSNVTSENGN INNMIKRLKIEEHHTVDIIRSHNLIHELYKADEEEKEKVLARLRNIGFQIGLKLSELLIFSNNPNLKFKEMDLLLIMKFI CRDVWKQIFGKQIDNLKTNHRGTFYLLDYDYRPIQSFSLEEDAKNEELKMIEPFLEIPVGIIRGVLSSLGYSSEEVICLA SFIDRPTDRPKTAFPKGVSFHVQVTMPQ ; 1 4 UNP BET5_YEAST Q03630 ? 4 ;MGIYSFWIFDRHCNCIFDREWTLASNSASGTINSKQNEEDAKLLYGMIFSLRSITQKLSKGSVKNDIRSISTGKYRVHTY CTASGLWFVLLSDFKQQSYTQVLQYIYSHIYVKYVSNNLLSPYDFAENENEMRGQGTRKITNRNFISVLESFLAPMVNQ ; 1 5 UNP TRS23_YEAST Q03784 ? 5 ;MAIETILVINKSGGLIYQRNFTNDEQKLNSNEYLILASTLHGVFAIASQLTPKALQLTQQTNIENTIPYIPYVGMSSNRS DTRNGGGNNNKHTNNEKLGSFKGDDFFKEPFTNWNKSGLRQLCTDQFTMFIYQTLTGLKFVAISSSVMPQRQPTIATTDK PDRPKSTSNLAIQIADNFLRKVYCLYSDYVMKDPSYSMEMPIRSNLFDEKVKKMVENLQ ; 1 6 UNP TRS31_YEAST Q03337 ? 6 ;MSQRIIQPSASDQQFPGKSDGYEYTVGPKQAITSEASTTYIPSRIYSESLLFKRQEASLSAMAFLFQEMISQLHRTCKTA GDFETKLSDYGHNIGIRLLELLNFRASVSPSSLPRASAFLSQNESSSKLSNASNSPGMLANSSTATSASANERLQEKQTE SLSNYITKMRRRDLKILDILQFIHGTLWSYLFNHVSDDLVKSSERDNEYMIVDNFPTLTQFIPGENVSCEYFVCGIIKGF LFNAGFPCGVTAHRMPQGGHSQRTVYLIQFDRQVLDREGLRFG ; 1 7 UNP TRS20_YEAST P38334 ? 7 ;MPQYFAIIGKKDNPVYEIEFTNAENPQGFPQDLKELNPFILHASLDIVEDLQWQINPTSQLNGNGGNGSNGGGGFLRSRA VNNTDNCYLGKVDHFYGLAITAYISYSGMKFVMIHGNSANSSVVIDDNNMRSFYQEVHELYVKTLMNPFYKITDPIRSPA FDSRVRTLARKHLSK ; 1 8 UNP TR130_YEAST Q03660 ? 8 ;MDKEIYCGSVPVSYFDPFDLFESLRPEFQQILPLDNIHWKAFDGTVRTVNRLPIELIPEGRGEADKSNDEQPFIRFLIVN CISIDQYRAKVRPLVRQWLPNLESVSSSTGEKMIYKPIILLYANSEVVDSNLFKSVSLMEKFGKDFPHVQTLEVRSVYRS PKERQEFWNQFSQKIKASVLSIFQKRLTHLQHSLANLQKGNNFEEQLLTREKLYELYVVFNILEDASLELQKIKKEILRR NMNMPDGKLQVPFESSSKSDESLGSIIIEGTLDKFQLHKYFFIRRLRLLKLEDQTLTAFVGAFQLIKNFIESISIEYRKS VRLLEFKHYFITSMLSYFEFENVSNPLLCEIKAELLMLKRDNWVQGVMATSGYRLMDKNYPNSDVKYKFDLLKETFVDET VFQENFLTLTKEILSLFNKCEGKRQRIVDILSIEIGLLYYQGKKYEEAVSLFLSCYEYYTQTNWNSIGLKILQVFIDSLS HCPKLDVLQIDGESVSASAVLTNAFLNILKLCKDNDSKEIWWKKFMDLQMKNNIHLMYPLDGLFEVTLNSKVHLARANVS AIEVNLKSYGFPEDISTKTMRLSLKNMGGDVIVFGASDFLLKKGENKLILECRDIMYGEFSLLSFEIIVEGITFVKEFPE NQDEFIVVPEIYCKESTKVLVKQAHNLNLGEYALELKSVQSDALESLQVEVEVQKNIGNMKNLPVSFSMDEIQARKRYNT PFENVRLEYYLLDQITAFDLIIKTSFTKKNDQGTFGETKKVRIQCYLQLSVSVEDIFKKDIFFFKFLLNSSVREEPVILY SSELSAPDTRNDYNIRGDYIATTPALITFDGNESFINCYEITANNNFDSKDIFNLKVRYNTLKEQLDCFITDAVLIEGDV EWFILFEKWKTFWELEILKKLKYDYDAFKENRIIRLLKTSIDLNKTKSKIRNLCIEKAVLDKILICLNKVSRGIAVCNTD MDEYVRNLVPKQLTVPVQLPGFEQFFHVQFEQMETSHDALHDTIATIGNSLSYTVIVENLSGQWGQDVIDDGGYIFEILS SNEWLIHGQKRCAIKEKRKEFEVHLIPLKKGYLNFPRVEITNINGKSCRVDHSNAFESILIF ; 1 9 UNP TR120_YEAST Q04183 ? 9 ;MNILKHFPSYVGPSKIRTLVIPIGHWTRKEFNNAVQKLSEFNEIHLSDVTPIDSPIFTPQGFPHGKLFFDFLTIDHDDAL ELFLYDFEPFRKTFVIIGLVNDYSDPLTNLNFMKEKYPTLISPNLVYASSTPTKELEQTIDTMENVFASSPDMQKNIETI MCDIARNFLTALNSYYSSYKHVTLRSPGAIGGNAVLKTTLIRQNSYTSSSSSTPMSAVQSSVSSSSKAGSVTTASKRLSS FEMTTNSLKRSASLKLATTLSTSENRSQQKSLGRQMKILGNFQLLAGRYVDALNSFVDAITTLYKVRDYLWLGSALDGIS ICFLLLSYLGLSYQIPQIVSLICPVEKLNFESSSTGISPVDSNSKATASTTASSTPRNSISIAAMQSPRNSIMSLSAPAL NIDVENINLPLLIKCISDKVLYYYDLSLMHNSEYAPQVVYCEFLLKTLTFMTSCYKSSEFSKDVLDNIVKNQHRALSDIP NSPMFPRFEVYFYSNKLFELQLKEMQVEAQIKIYSTMAEVYRLLGYKRKQLFVLRLLMVALLATPNKIAWHPDYRTLIDT IIELLNINESEAKINVDDPSQSTWLILQKKILQLCIKVSRKINDFEYVAKFSSILITKYTHLLNQSEQDALFKEYIQPSI TNESITSYWDPFILREVVINRILDSDPTSNEIPLESDVSSLESLENRQKTQDINPQEVFNPFKRVQPTSFVSNNSTKVPI LVFLVGDKAEFTCRVQNPFKFDFTINDIQLDEEISEFCEIDRKAVSYSGPYNVKAESIRSITLPLIIKKPTYKKIYEISC LKISILKLPLQKFDIINDSRRSNPVEEEAEYSKCIYGKLKIKILPEQPQLELLSTSKMTRNSWMMLDGTKTDFHITVRNK SLSCAINHIKIIPMNNIEQMLKPDYWKKMPPDDLYIMEKQLDWLSKSCVRIIKLPTVIKPNETITFDLELDNTAVPFNFT GFDLLIEYGMSATDESCIYLKKLSIPYEVTLRRTIEVPSMDIIPLNELFSSQVENVDWIEYVMSKIRAESNLHSRDFILL LLDFRNSWIDGIKLNVQFEDFTSNEYHVEASHTSRIIVPIKKIDYKKYNFENTPIPRIYPGRQFIQSGLNEEQTIEMRQK FWCREHIISKLKCNWKLTTDQSVTGSVDFNKFIEKFDHKMVYTIYPGRLFYGVQLLLDEPKVKVGEIINLKIITEPTSTC RRKQNSTVNFLDIVIFDSKTSKILPRSNRRILYNGSLTKPISTTKVSEINLEIIPIEKGRYEFSVCISKSNNQDGIIQFD SENVILSVI ; 1 10 UNP TRS65_YEAST P32893 ? 10 ;MECFVPLRCDLDGSNIEQLRQSHLSRKFIIFDEQLNLWLWFQGNSQENKRFVLQNMIILINEAQVTRTSTIDDYFTQVEN NENLWRLKNDCCSKILFKSNVVMNNGYNNQIKFVFEYKSVDANFNNQDSLQDPQAKYTLDKYSSEEILPSFEPVYSWSSA ATKSSKNTNNHLEKNNRATHRVSSKNSEVHEADVSRNPNTFTLKLQYPIFSLLNMRLRNISLKSEHCILSSLDFQTSKAS EQLTKKFIYPQEHNSFLKLNFQEISYKLIDGTSQIELDPICPLKVPLTAFSYDSISATFKLVLLPKSTQPHRVKITLAYE LELHPNLKLPVRTSWETEVTLKRSMPISSTSSQYSSNNNNTNHSASFNGAANNVNSGGLANLRLGGVSSSRFSLGAASTT SLVNSKLSNVKFKFINSNIKVIKGEKFTMRLQIINSSSSPLDLVVYYNNTINPIPSANNVRNSNGINNCGMNNGTIPNSP LTLENQYQLHNKYRKIAEGIILLSNDYKIPVVPPRETYFADLRFIGIMSGYYGTLSGLKVLDLNTNELIEVGNGASVLIQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7E2D A 1 ? 152 ? 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'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7E2D _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 7E2D _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 23732 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.399 ? 32319 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 19.491 ? 7908 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.071 ? 3878 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 4199 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7E2D _struct.title 'Monomer of TRAPPII (Closed)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7E2D _struct_keywords.text 'Monomer of TRAPPII close state., PROTEIN TRANSPORT' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN TRANSPORT' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 2 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 10 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 33 ? TYR A 46 ? VAL A 33 TYR A 46 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 100 ? LYS A 120 ? ASP A 100 LYS A 120 1 ? 21 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 131 ? PHE A 145 ? LYS A 131 PHE A 145 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 SER B 9 ? ILE B 17 ? SER C 9 ILE C 17 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 AA5 TRP B 18 ? ASN B 20 ? TRP C 18 ASN C 20 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 AA6 PHE B 30 ? TYR B 45 ? 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LEU K 483 GLY K 499 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 10 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 3 ? 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