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;TCGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTAC GTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCGA ; J ? 2 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG) (DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA) (DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA) (DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG) (DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA) (DT)(DC)(DC)(DG)(DA) ; ;TCGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCC CGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCGA ; I ? 3 'polypeptide(L)' no no 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;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 7 'polypeptide(L)' no no ;GHMNHRGETLLHIASIKGDIPSVEYLLQNGSDPNVKDHAGWTPLHEACNHGHLKVVELLLQHKALVNTTGYQNDSPLHDA AKNGHVDIVKLLLSYGASRNAVNIFGLRPVDYTDDESMKSLLLLPEKNESSSASHCSVMNTGQRRDGPLVLIGSGLSSEQ QKMLSELAVILKAKKYTEFDSTVTHVVVPGDAVQSTLKCMLGILNGCWILKFEWVKACLRRKVCEQEEKYEIPEGPRRSR LNREQLLPKLFDGCYFYLWGTFKHHPKDNLIKLVTAGGGQILSRKPKPDSDVTQTINTVAYHARPDSDQRFCTQYIIYED LCNYHPERVRQGKVWKAPSSWFIDCVMSFELLPLDS ; ;GHMNHRGETLLHIASIKGDIPSVEYLLQNGSDPNVKDHAGWTPLHEACNHGHLKVVELLLQHKALVNTTGYQNDSPLHDA AKNGHVDIVKLLLSYGASRNAVNIFGLRPVDYTDDESMKSLLLLPEKNESSSASHCSVMNTGQRRDGPLVLIGSGLSSEQ QKMLSELAVILKAKKYTEFDSTVTHVVVPGDAVQSTLKCMLGILNGCWILKFEWVKACLRRKVCEQEEKYEIPEGPRRSR LNREQLLPKLFDGCYFYLWGTFKHHPKDNLIKLVTAGGGQILSRKPKPDSDVTQTINTVAYHARPDSDQRFCTQYIIYED LCNYHPERVRQGKVWKAPSSWFIDCVMSFELLPLDS ; K ? 8 'polypeptide(L)' no no ;GHMDYDIPTTMQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLV 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DG n 2 33 DG n 2 34 DT n 2 35 DC n 2 36 DG n 2 37 DT n 2 38 DA n 2 39 DG n 2 40 DA n 2 41 DC n 2 42 DA n 2 43 DG n 2 44 DC n 2 45 DT n 2 46 DC n 2 47 DT n 2 48 DA n 2 49 DG n 2 50 DC n 2 51 DA n 2 52 DC n 2 53 DC n 2 54 DG n 2 55 DC n 2 56 DT n 2 57 DT n 2 58 DA n 2 59 DA n 2 60 DA n 2 61 DC n 2 62 DG n 2 63 DC n 2 64 DA n 2 65 DC n 2 66 DG n 2 67 DT n 2 68 DA n 2 69 DC n 2 70 DG n 2 71 DC n 2 72 DG n 2 73 DC n 2 74 DT n 2 75 DG n 2 76 DT n 2 77 DC n 2 78 DC n 2 79 DC n 2 80 DC n 2 81 DC n 2 82 DG n 2 83 DC n 2 84 DG n 2 85 DT n 2 86 DT n 2 87 DT n 2 88 DT n 2 89 DA n 2 90 DA n 2 91 DC n 2 92 DC n 2 93 DG n 2 94 DC n 2 95 DC n 2 96 DA n 2 97 DA n 2 98 DG n 2 99 DG n 2 100 DG n 2 101 DG n 2 102 DA n 2 103 DT n 2 104 DT n 2 105 DA n 2 106 DC n 2 107 DT n 2 108 DC n 2 109 DC n 2 110 DC n 2 111 DT n 2 112 DA n 2 113 DG n 2 114 DT n 2 115 DC n 2 116 DT n 2 117 DC n 2 118 DC n 2 119 DA n 2 120 DG n 2 121 DG n 2 122 DC n 2 123 DA n 2 124 DC n 2 125 DG n 2 126 DT n 2 127 DG n 2 128 DT n 2 129 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_refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 16155 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.727 ? 23074 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 26.693 ? 6533 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.047 ? 2622 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1921 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7E8I _struct.title 'Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7E8I _struct_keywords.text 'BRCA1, nucleosome, DNA damage, chromatin, BARD1, NUCLEAR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7E8I 7E8I ? 1 ? 1 2 PDB 7E8I 7E8I ? 2 ? 1 3 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 3 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 4 UNP H4_XENLA P62799 ? 4 ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 2 5 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 5 ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 2 6 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 6 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 7 UNP BARD1_HUMAN Q99728 ? 7 ;NHRGETLLHIASIKGDIPSVEYLLQNGSDPNVKDHAGWTPLHEACNHGHLKVVELLLQHKALVNTTGYQNDSPLHDAAKN GHVDIVKLLLSYGASRNAVNIFGLRPVDYTDDESMKSLLLLPEKNESSSASHCSVMNTGQRRDGPLVLIGSGLSSEQQKM LSELAVILKAKKYTEFDSTVTHVVVPGDAVQSTLKCMLGILNGCWILKFEWVKACLRRKVCEQEEKYEIPEGPRRSRLNR EQLLPKLFDGCYFYLWGTFKHHPKDNLIKLVTAGGGQILSRKPKPDSDVTQTINTVAYHARPDSDQRFCTQYIIYEDLCN YHPERVRQGKVWKAPSSWFIDCVMSFELLPLDS ; 425 8 UNP J3QS39_HUMAN J3QS39 ? 8 MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7E8I J 1 ? 145 ? 7E8I 2 ? 146 ? 2 146 2 2 7E8I I 1 ? 145 ? 7E8I 2 ? 146 ? 2 146 3 3 7E8I A 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 4 4 7E8I B 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 5 5 7E8I C 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 6 6 7E8I D 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 7 3 7E8I E 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 8 4 7E8I F 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 9 5 7E8I G 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 10 6 7E8I H 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 11 7 7E8I K 4 ? 356 ? Q99728 425 ? 777 ? 425 777 12 8 7E8I L 11 ? 86 ? J3QS39 1 ? 76 ? 1 76 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 5 7E8I CYS C 15 ? UNP Q6AZJ8 LYS 16 'engineered mutation' 15 1 6 7E8I THR D 29 ? 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UNP J3QS39 GLY 76 'engineered mutation' 76 18 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 61540 ? 1 MORE -384 ? 1 'SSA (A^2)' 89810 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'native gel electrophoresis' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY C 44 ? GLN C 55 ? GLY A 44 GLN A 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG C 63 ? GLN C 76 ? ARG A 63 GLN A 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN C 85 ? ALA C 95 ? GLN A 85 ALA A 95 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 SER C 96 ? ALA C 114 ? SER A 96 ALA A 114 1 ? 19 HELX_P HELX_P5 AA5 MET C 120 ? GLY C 132 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP D 24 ? ILE D 29 ? ASP B 24 ILE B 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 THR D 30 ? GLY D 42 ? THR B 30 GLY B 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU D 49 ? ALA D 76 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA D 83 ? GLN D 93 ? ALA B 83 GLN B 93 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 THR E 16 ? ALA E 21 ? THR C 16 ALA C 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO E 26 ? LYS E 36 ? PRO C 26 LYS C 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA E 45 ? ASN E 73 ? ALA C 45 ASN C 73 1 ? 29 HELX_P HELX_P13 AB4 ILE E 79 ? ASP E 90 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP E 90 ? GLY E 98 ? ASP C 90 GLY C 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 TYR F 34 ? HIS F 46 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 SER F 52 ? 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THR L 55 TYR L 59 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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LYS CD HD3 sing N N 357 LYS CE NZ sing N N 358 LYS CE HE2 sing N N 359 LYS CE HE3 sing N N 360 LYS NZ HZ1 sing N N 361 LYS NZ HZ2 sing N N 362 LYS NZ HZ3 sing N N 363 LYS OXT HXT sing N N 364 MET N CA sing N N 365 MET N H sing N N 366 MET N H2 sing N N 367 MET CA C sing N N 368 MET CA CB sing N N 369 MET CA HA sing N N 370 MET C O doub N N 371 MET C OXT sing N N 372 MET CB CG sing N N 373 MET CB HB2 sing N N 374 MET CB HB3 sing N N 375 MET CG SD sing N N 376 MET CG HG2 sing N N 377 MET CG HG3 sing N N 378 MET SD CE sing N N 379 MET CE HE1 sing N N 380 MET CE HE2 sing N N 381 MET CE HE3 sing N N 382 MET OXT HXT sing N N 383 PHE N CA sing N N 384 PHE N H sing N N 385 PHE N H2 sing N N 386 PHE CA C sing N N 387 PHE CA CB sing N N 388 PHE CA HA sing N N 389 PHE C O doub N N 390 PHE C OXT sing N N 391 PHE CB CG sing N N 392 PHE CB HB2 sing N N 393 PHE CB HB3 sing N N 394 PHE CG CD1 doub Y N 395 PHE CG CD2 sing Y N 396 PHE CD1 CE1 sing Y N 397 PHE CD1 HD1 sing N N 398 PHE CD2 CE2 doub Y N 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