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'Ito, T.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first 7102 _citation.page_last 7102 _citation.title 'eIF2B-capturing viral protein NSs suppresses the integrated stress response.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-021-27337-x _citation.pdbx_database_id_PubMed 34876589 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kashiwagi, K.' 1 ? primary 'Shichino, Y.' 2 ? primary 'Osaki, T.' 3 ? primary 'Sakamoto, A.' 4 ? primary 'Nishimoto, M.' 5 ? primary 'Takahashi, M.' 6 ? primary 'Mito, M.' 7 ? primary 'Weber, F.' 8 ? primary 'Ikeuchi, Y.' 9 ? primary 'Iwasaki, S.' 10 ? primary 'Ito, T.' 11 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7F64 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7F64 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha' 33754.148 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Translation initiation factor eIF-2B subunit beta' 39039.547 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma' 50304.230 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Translation initiation factor eIF-2B subunit delta' 57640.168 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon' 80466.609 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Non-structural protein 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;MDDKELIEYFKSQMKEDPDMASAVAAIRTLLEFLKRDKGETIQGLRANLTSAIETLCGVDSSVAVSSGGELFLRFISLAS LEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSRVVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLS GKKMAKALCHLNVPVTVVLDAAVGYIMEKADLVIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFVRLFP LNQQDVPDKFKYKADTLKVAQTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDELIKLYL ; A,B ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MPGSAAKGSELSERIESFVETLKRGGGPRSSEEMARETLGLLRQIITDHRWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGN MVRRVLKIIREEYGRLHGRSDESDQQESLHKLLTSGGLNEDFSFHYAQLQSNIIEAINELLVELEGTMENIAAQALEHIH SNEVIMTIGFSRTVEAFLKEAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEMAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTIL ANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPEL ITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL ; ;MPGSAAKGSELSERIESFVETLKRGGGPRSSEEMARETLGLLRQIITDHRWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGN MVRRVLKIIREEYGRLHGRSDESDQQESLHKLLTSGGLNEDFSFHYAQLQSNIIEAINELLVELEGTMENIAAQALEHIH SNEVIMTIGFSRTVEAFLKEAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEMAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTIL ANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPEL ITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL ; C,D ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MEFQAVVMAVGGGSRMTDLTSSIPKPLLPVGNKPLIWYPLNLLERVGFEEVIVVTTRDVQKALCAEFKMKMKPDIVCIPD DADMGTADSLRYIYPKLKTDVLVLSCDLITDVALHEVVDLFRAYDASLAMLMRKGQDSIEPVPGQKGKKKAVEQRDFIGV DSTGKRLLFMANEADLDEELVIKGSILQKHPRIRFHTGLVDAHLYCLKKYIVDFLMENGSITSIRSELIPYLVRKQFSSA SSQQGQEEKEEDLKKKELKSLDIYSFIKEANTLNLAPYDACWNACRGDRWEDLSRSQVRCYVHIMKEGLCSRVSTLGLYM EANRQVPKLLSALCPEEPPVHSSAQIVSKHLVGVDSLIGPETQIGEKSSIKRSVIGSSCLIKDRVTITNCLLMNSVTVEE GSNIQGSVICNNAVIEKGADIKDCLIGSGQRIEAKAKRVNEVIVGNDQLMEI ; ;MEFQAVVMAVGGGSRMTDLTSSIPKPLLPVGNKPLIWYPLNLLERVGFEEVIVVTTRDVQKALCAEFKMKMKPDIVCIPD DADMGTADSLRYIYPKLKTDVLVLSCDLITDVALHEVVDLFRAYDASLAMLMRKGQDSIEPVPGQKGKKKAVEQRDFIGV DSTGKRLLFMANEADLDEELVIKGSILQKHPRIRFHTGLVDAHLYCLKKYIVDFLMENGSITSIRSELIPYLVRKQFSSA SSQQGQEEKEEDLKKKELKSLDIYSFIKEANTLNLAPYDACWNACRGDRWEDLSRSQVRCYVHIMKEGLCSRVSTLGLYM EANRQVPKLLSALCPEEPPVHSSAQIVSKHLVGVDSLIGPETQIGEKSSIKRSVIGSSCLIKDRVTITNCLLMNSVTVEE GSNIQGSVICNNAVIEKGADIKDCLIGSGQRIEAKAKRVNEVIVGNDQLMEI ; E,F ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAAVAVAVREDSGSGMKAELPPGPGAVGREMTKEEKLQLRKEKKQQKKKRKEEKGAEPETGSAVSAAQCQVGPTRELPES GIQLGTPREKVPAGRSKAELRAERRAKQEAERALKQARKGEQGGPPPKASPSTAGETPSGVKRLPEYPQVDDLLLRRLVK KPERQQVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQFMSIPSSVIHPAMVRLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDY TTPPNEELSRDLVNKLKPYMSFLTQCRPLSASMHNAIKFLNKEITSVGSSKREEEAKSELRAAIDRYVQEKIVLAAQAIS RFAYQKISNGDVILVYGCSSLVSRILQEAWTEGRRFRVVVVDSRPWLEGRHTLRSLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK VLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAHNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLQCKRGEHVALANWQNHA SLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ ; ;MAAVAVAVREDSGSGMKAELPPGPGAVGREMTKEEKLQLRKEKKQQKKKRKEEKGAEPETGSAVSAAQCQVGPTRELPES GIQLGTPREKVPAGRSKAELRAERRAKQEAERALKQARKGEQGGPPPKASPSTAGETPSGVKRLPEYPQVDDLLLRRLVK KPERQQVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQFMSIPSSVIHPAMVRLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDY 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'EIF2B1, EIF2BA' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 351 Human ? 'EIF2B2, EIF2BB' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 452 Human ? EIF2B3 ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 'Biological sequence' 1 523 Human ? 'EIF2B4, EIF2BD' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 721 Human ? 'EIF2B5, EIF2BE' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 261 SFS ? NSS ? ? ? ? ? ? 'Sandfly fever sicilian virus' 28292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP EI2BA_HUMAN Q14232 ? 1 ;MDDKELIEYFKSQMKEDPDMASAVAAIRTLLEFLKRDKGETIQGLRANLTSAIETLCGVDSSVAVSSGGELFLRFISLAS LEYSDYSKCKKIMIERGELFLRRISLSRNKIADLCHTFIKDGATILTHAYSRVVLRVLEAAVAAKKRFSVYVTESQPDLS GKKMAKALCHLNVPVTVVLDAAVGYIMEKADLVIVGAEGVVENGGIINKIGTNQMAVCAKAQNKPFYVVAESFKFVRLFP LNQQDVPDKFKYKADTLKVAQTGQDLKEEHPWVDYTAPSLITLLFTDLGVLTPSAVSDELIKLYL ; 1 2 UNP EI2BB_HUMAN P49770 ? 2 ;MPGSAAKGSELSERIESFVETLKRGGGPRSSEEMARETLGLLRQIITDHRWSNAGELMELIRREGRRMTAAQPSETTVGN MVRRVLKIIREEYGRLHGRSDESDQQESLHKLLTSGGLNEDFSFHYAQLQSNIIEAINELLVELEGTMENIAAQALEHIH SNEVIMTIGFSRTVEAFLKEAARKRKFHVIVAECAPFCQGHEMAVNLSKAGIETTVMTDAAIFAVMSRVNKVIIGTKTIL ANGALRAVTGTHTLALAAKHHSTPLIVCAPMFKLSPQFPNEEDSFHKFVAPEEVLPFTEGDILEKVSVHCPVFDYVPPEL ITLFISNIGGNAPSYIYRLMSELYHPDDHVL ; 1 3 UNP EI2BG_HUMAN Q9NR50 ? 3 ;MEFQAVVMAVGGGSRMTDLTSSIPKPLLPVGNKPLIWYPLNLLERVGFEEVIVVTTRDVQKALCAEFKMKMKPDIVCIPD DADMGTADSLRYIYPKLKTDVLVLSCDLITDVALHEVVDLFRAYDASLAMLMRKGQDSIEPVPGQKGKKKAVEQRDFIGV DSTGKRLLFMANEADLDEELVIKGSILQKHPRIRFHTGLVDAHLYCLKKYIVDFLMENGSITSIRSELIPYLVRKQFSSA SSQQGQEEKEEDLKKKELKSLDIYSFIKEANTLNLAPYDACWNACRGDRWEDLSRSQVRCYVHIMKEGLCSRVSTLGLYM EANRQVPKLLSALCPEEPPVHSSAQIVSKHLVGVDSLIGPETQIGEKSSIKRSVIGSSCLIKDRVTITNCLLMNSVTVEE GSNIQGSVICNNAVIEKGADIKDCLIGSGQRIEAKAKRVNEVIVGNDQLMEI ; 1 4 UNP EI2BD_HUMAN Q9UI10 ? 4 ;MAAVAVAVREDSGSGMKAELPPGPGAVGREMTKEEKLQLRKEKKQQKKKRKEEKGAEPETGSAVSAAQCQVGPTRELPES GIQLGTPREKVPAGRSKAELRAERRAKQEAERALKQARKGEQGGPPPKASPSTAGETPSGVKRLPEYPQVDDLLLRRLVK KPERQQVPTRKDYGSKVSLFSHLPQYSRQNSLTQFMSIPSSVIHPAMVRLGLQYSQGLVSGSNARCIALLRALQQVIQDY TTPPNEELSRDLVNKLKPYMSFLTQCRPLSASMHNAIKFLNKEITSVGSSKREEEAKSELRAAIDRYVQEKIVLAAQAIS RFAYQKISNGDVILVYGCSSLVSRILQEAWTEGRRFRVVVVDSRPWLEGRHTLRSLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK VLLGAHALLANGSVMSRVGTAQLALVARAHNVPVLVCCETYKFCERVQTDAFVSNELDDPDDLQCKRGEHVALANWQNHA SLRLLNLVYDVTPPELVDLVITELGMIPCSSVPVVLRVKSSDQ ; 1 5 UNP EI2BE_HUMAN Q13144 ? 5 ;MAAPVVAPPGVVVSRANKRSGAGPGGSGGGGARGAEEEPPPPLQAVLVADSFDRRFFPISKDQPRVLLPLANVALIDYTL EFLTATGVQETFVFCCWKAAQIKEHLLKSKWCRPTSLNVVRIITSELYRSLGDVLRDVDAKALVRSDFLLVYGDVISNIN ITRALEEHRLRRKLEKNVSVMTMIFKESSPSHPTRCHEDNVVVAVDSTTNRVLHFQKTQGLRRFAFPLSLFQGSSDGVEV RYDLLDCHISICSPQVAQLFTDNFDYQTRDDFVRGLLVNEEILGNQIHMHVTAKEYGARVSNLHMYSAVCADVIRRWVYP LTPEANFTDSTTQSCTHSRHNIYRGPEVSLGHGSILEENVLLGSGTVIGSNCFITNSVIGPGCHIGDNVVLDQTYLWQGV RVAAGAQIHQSLLCDNAEVKERVTLKPRSVLTSQVVVGPNITLPEGSVISLHPPDAEEDEDDGEFSDDSGADQEKDKVKM KGYNPAEVGAAGKGYLWKAAGMNMEEEEELQQNLWGLKINMEEESESESEQSMDSEEPDSRGGSPQMDDIKVFQNEVLGT LQRGKEENISCDNLVLEINSLKYAYNISLKEVMQVLSHVVLEFPLQQMDSPLDSSRYCALLLPLLKAWSPVFRNYIKRAA DHLEALAAIEDFFLEHEALGISMAKVLMAFYQLEILAEETILSWFSQRDTTDKGQQLRKNQQLQRFIQWLKEAEEESSED D ; 1 6 UNP NSS_SFSV P12792 ? 6 ;MNSQYMFDYPAINIDVRCHRLLSSVSYVAYNKFHTHDVSTYEHCEIPLEKLRLGFGRRNSLADFYSLGELPASWGPACYF SSVKPMMYTFQGMASDLSRFDLTSFSRKGLPNVLKALSWPLGIPDCEIFSICSDRFVRGLQTRDQLMSYILRMGDSHSLD ECIVQAHKKILQEARRLGLSDEHYNGYDLFREIGSLVCLRLINAEPFDTASSGEALDVRTVIRSYRASDPSTGLTEYGNS LWTPIHSHVDENDESSSDSDF ; 7 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7F64 A 1 ? 305 ? Q14232 1 ? 305 ? 1 305 2 1 7F64 B 1 ? 305 ? Q14232 1 ? 305 ? 1 305 3 2 7F64 C 1 ? 351 ? P49770 1 ? 351 ? 1 351 4 2 7F64 D 1 ? 351 ? P49770 1 ? 351 ? 1 351 5 3 7F64 E 1 ? 452 ? Q9NR50 1 ? 452 ? 1 452 6 3 7F64 F 1 ? 452 ? Q9NR50 1 ? 452 ? 1 452 7 4 7F64 G 1 ? 523 ? Q9UI10 1 ? 523 ? 1 523 8 4 7F64 H 1 ? 523 ? Q9UI10 1 ? 523 ? 1 523 9 5 7F64 I 1 ? 721 ? Q13144 1 ? 721 ? 1 721 10 5 7F64 J 1 ? 721 ? Q13144 1 ? 721 ? 1 721 11 6 7F64 K 1 ? 261 ? P12792 7 ? 267 ? 1 261 12 6 7F64 L 1 ? 261 ? P12792 7 ? 267 ? 1 261 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7F64 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7F64 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 29292 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.520 ? 39700 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.050 ? 3998 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.042 ? 4634 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 5072 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7F64 _struct.title 'eIF2B-SFSV NSs' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7F64 _struct_keywords.text 'translation initiation factor, viral protein, TRANSLATION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLATION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 2 ? ASP A 17 ? ASP A 2 ASP A 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 21 ? ARG A 36 ? ALA A 21 ARG A 36 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 ILE A 42 ? ASP A 60 ? ILE A 42 ASP A 60 1 ? 19 HELX_P HELX_P4 AA4 SER A 62 ? TYR A 83 ? SER A 62 TYR A 83 1 ? 22 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 85 ? HIS A 116 ? ASP A 85 HIS A 116 1 ? 32 HELX_P HELX_P6 AA6 THR A 117 ? ILE A 119 ? THR A 117 ILE A 119 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 SER A 131 ? ALA A 144 ? SER A 131 ALA A 144 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 AA8 LEU A 159 ? LEU A 171 ? LEU A 159 LEU A 171 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA A 182 ? MET A 187 ? ALA A 182 MET A 187 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY A 211 ? GLN A 222 ? GLY A 211 GLN A 222 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 GLU A 231 ? PHE A 235 ? GLU A 231 PHE A 235 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO A 247 ? TYR A 252 ? PRO A 247 TYR A 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA A 277 ? ILE A 281 ? ALA A 277 ILE A 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 THR A 292 ? TYR A 304 ? THR A 292 TYR A 304 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP B 2 ? ASP B 17 ? ASP B 2 ASP B 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 AB7 ALA B 21 ? ARG B 36 ? ALA B 21 ARG B 36 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 AB8 ILE B 42 ? ASP B 60 ? ILE B 42 ASP B 60 1 ? 19 HELX_P HELX_P18 AB9 SER B 62 ? TYR B 83 ? SER B 62 TYR B 83 1 ? 22 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP B 85 ? LEU B 106 ? ASP B 85 LEU B 106 1 ? 22 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU B 106 ? HIS B 116 ? LEU B 106 HIS B 116 1 ? 11 HELX_P HELX_P21 AC3 THR B 117 ? ILE B 119 ? THR B 117 ILE B 119 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 SER B 131 ? ALA B 144 ? SER B 131 ALA B 144 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU B 159 ? HIS B 170 ? LEU B 159 HIS B 170 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA B 182 ? MET B 187 ? ALA B 182 MET B 187 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY B 211 ? GLN B 222 ? GLY B 211 GLN B 222 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 AC8 GLU B 231 ? PHE B 235 ? GLU B 231 PHE B 235 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 PRO B 247 ? TYR B 252 ? PRO B 247 TYR B 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA B 277 ? ILE B 281 ? ALA B 277 ILE B 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 THR B 292 ? TYR B 304 ? THR B 292 TYR B 304 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 SER C 9 ? ARG C 24 ? SER C 9 ARG C 24 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 AD4 SER C 30 ? HIS C 49 ? SER C 30 HIS C 49 1 ? 20 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN C 53 ? GLN C 72 ? ASN C 53 GLN C 72 1 ? 20 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU C 75 ? GLY C 98 ? GLU C 75 GLY C 98 1 ? 24 HELX_P HELX_P34 AD7 SER C 108 ? SER C 115 ? 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AD5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? parallel AA5 5 6 ? parallel AA5 6 7 ? parallel AA5 7 8 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA7 6 7 ? parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? parallel AA8 6 7 ? parallel AA8 7 8 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB1 4 5 ? parallel AB1 5 6 ? parallel AB1 6 7 ? parallel AB1 7 8 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB3 6 7 ? anti-parallel AB3 7 8 ? parallel AB3 8 9 ? anti-parallel AB3 9 10 ? anti-parallel AB3 10 11 ? parallel AB3 11 12 ? parallel AB3 12 13 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB5 6 7 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB6 6 7 ? anti-parallel AB6 7 8 ? parallel AB6 8 9 ? anti-parallel AB6 9 10 ? anti-parallel AB6 10 11 ? parallel AB6 11 12 ? parallel AB6 12 13 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? parallel AC2 6 7 ? parallel AC2 7 8 ? parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? parallel AC6 6 7 ? parallel AC6 7 8 ? parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? parallel AC8 3 4 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? parallel AD5 1 2 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 175 ? VAL A 178 ? VAL A 175 VAL A 178 AA1 2 SER A 149 ? THR A 153 ? SER A 149 THR A 153 AA1 3 THR A 124 ? LEU A 126 ? THR A 124 LEU A 126 AA1 4 LEU A 192 ? GLY A 196 ? LEU A 192 GLY A 196 AA1 5 PHE A 226 ? VAL A 229 ? PHE A 226 VAL A 229 AA1 6 LEU A 283 ? THR A 286 ? LEU A 283 THR A 286 AA1 7 GLY A 289 ? LEU A 291 ? GLY A 289 LEU A 291 AA2 1 GLY A 199 ? VAL A 200 ? GLY A 199 VAL A 200 AA2 2 ILE A 206 ? LYS A 209 ? ILE A 206 LYS A 209 AA2 3 VAL A 273 ? THR A 276 ? VAL A 273 THR A 276 AA3 1 VAL B 175 ? VAL B 178 ? VAL B 175 VAL B 178 AA3 2 SER B 149 ? THR B 153 ? SER B 149 THR B 153 AA3 3 THR B 124 ? THR B 127 ? THR B 124 THR B 127 AA3 4 LEU B 192 ? VAL B 195 ? LEU B 192 VAL B 195 AA3 5 PHE B 226 ? VAL B 229 ? PHE B 226 VAL B 229 AA3 6 LEU B 283 ? THR B 286 ? LEU B 283 THR B 286 AA3 7 GLY B 289 ? LEU B 291 ? GLY B 289 LEU B 291 AA4 1 GLY B 199 ? VAL B 200 ? GLY B 199 VAL B 200 AA4 2 ILE B 206 ? LYS B 209 ? ILE B 206 LYS B 209 AA4 3 VAL B 273 ? THR B 276 ? VAL B 273 THR B 276 AA5 1 GLY C 329 ? 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SER D 326 ? LEU D 323 SER D 326 AA8 3 LEU D 265 ? CYS D 268 ? LEU D 265 CYS D 268 AA8 4 LYS D 231 ? ILE D 234 ? LYS D 231 ILE D 234 AA8 5 VAL D 164 ? ILE D 168 ? VAL D 164 ILE D 168 AA8 6 HIS D 188 ? ALA D 192 ? HIS D 188 ALA D 192 AA8 7 GLU D 213 ? MET D 217 ? GLU D 213 MET D 217 AA8 8 LEU G 482 ? LEU G 484 ? LEU G 482 LEU G 484 AA9 1 THR D 238 ? ILE D 239 ? THR D 238 ILE D 239 AA9 2 LEU D 245 ? VAL D 248 ? LEU D 245 VAL D 248 AA9 3 PHE D 313 ? VAL D 316 ? PHE D 313 VAL D 316 AB1 1 VAL D 306 ? VAL D 308 ? VAL D 306 VAL D 308 AB1 2 ALA G 383 ? LEU G 387 ? ALA G 383 LEU G 387 AB1 3 ARG G 357 ? ASP G 362 ? ARG G 357 ASP G 362 AB1 4 VAL G 332 ? TYR G 336 ? VAL G 332 TYR G 336 AB1 5 LYS G 400 ? GLY G 404 ? LYS G 400 GLY G 404 AB1 6 VAL G 434 ? CYS G 437 ? VAL G 434 CYS G 437 AB1 7 LEU G 499 ? THR G 502 ? LEU G 499 THR G 502 AB1 8 GLY G 505 ? ILE G 507 ? GLY G 505 ILE G 507 AB2 1 ASP E 74 ? PRO E 79 ? ASP E 74 PRO E 79 AB2 2 GLU E 50 ? THR E 55 ? GLU E 50 THR E 55 AB2 3 GLN E 4 ? MET E 8 ? 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ILE F 75 PRO F 79 AB5 2 VAL F 51 ? THR F 55 ? VAL F 51 THR F 55 AB5 3 GLN F 4 ? MET F 8 ? GLN F 4 MET F 8 AB5 4 VAL F 101 ? SER F 105 ? VAL F 101 SER F 105 AB5 5 LEU F 199 ? LEU F 207 ? LEU F 199 LEU F 207 AB5 6 LEU F 128 ? LYS F 134 ? LEU F 128 LYS F 134 AB5 7 ILE F 263 ? LYS F 268 ? ILE F 263 LYS F 268 AB6 1 LEU F 167 ? ASN F 172 ? LEU F 167 ASN F 172 AB6 2 ASP F 156 ? VAL F 160 ? ASP F 156 VAL F 160 AB6 3 ARG F 192 ? HIS F 196 ? ARG F 192 HIS F 196 AB6 4 VAL J 238 ? ARG J 241 ? VAL J 238 ARG J 241 AB6 5 VAL J 201 ? ASP J 206 ? VAL J 201 ASP J 206 AB6 6 ARG J 211 ? LYS J 217 ? ARG J 211 LYS J 217 AB6 7 ILE J 287 ? THR J 292 ? ILE J 287 THR J 292 AB6 8 MET J 181 ? GLU J 187 ? MET J 181 GLU J 187 AB6 9 LEU J 244 ? ILE J 251 ? LEU J 244 ILE J 251 AB6 10 LEU J 149 ? TYR J 152 ? LEU J 149 TYR J 152 AB6 11 GLN J 44 ? VAL J 48 ? GLN J 44 VAL J 48 AB6 12 GLU J 90 ? CYS J 95 ? GLU J 90 CYS J 95 AB6 13 VAL J 119 ? THR J 124 ? VAL J 119 THR J 124 AB7 1 GLU F 179 ? LYS F 183 ? 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