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'Mammalian 1 orthobornavirus' 1714619 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SCN5A_RAT P15389 ? 1 ;MANLLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGGSATSQESREGLQEEEAPRPQLDLQASKKLPDLYGNPPRELIGEP LEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHPVRRAAVKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKY VEYTFTAIYTFESLVKILARGFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTELNGTNGSVEADGLVWNSLDVYLNDPANYLLKNG TTDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSFAWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFL GSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSS ; 1 2 UNP SCN5A_RAT P15389 ? 1 ;ARQRALSAVSVLTSALEELEESHRKCPPCWNRFAQHYLIWECCPLWMSIKQKVKFVVMDPFADLTITMCIVLNTLFMALE HYNMTAEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYYFQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMGNLSVLRSFRLLRVFK LAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRHRISDSGLLPRWHMMDFFHAFLIIFRIL CGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDEDGEMNNLQLALARIQRGLRFVKR TTWDFCCGILRRRPKKPAALATHSQLPSCITAPRSPPPPEVEKVPPARKETRFEEDKRPGQGTPGDSEPVCVPIAVAESD TEDQEEDEEN ; 659 3 UNP SCN5A_RAT P15389 ? 1 ;GKVWWRLRKTCYRIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYF TNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLI FSIMGVNLFAGKFGRCINQTEGDLPLNYTIVNNKSECESFNVTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYA AVDSRGYEEQPQWEDNLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQ KPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTMMVETDDQSPEKVNILAKINLLFVAIFTGECIVKMAALRHYYF TNSWNIFDFVVVILSIVGTVLSDIIQKYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLV MFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNLPNSNGSRGNCGSPAV GILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYLALSDFADALSEPLRI AKPNQISLINMDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTL ; 1190 4 UNP B7UCZ6_9RHAB B7UCZ6 ? 1 ;MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMK QHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKN GIKVNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYK ; 512 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7FBS A 1 ? 461 ? 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UNP P15389 ? ? linker 1901 6 3 7FBS PHE A 1584 ? UNP P15389 ? ? linker 1902 7 3 7FBS GLN A 1585 ? UNP P15389 ? ? linker 1903 8 3 7FBS GLY A 1586 ? UNP P15389 ? ? linker 1904 9 3 7FBS PRO A 1587 ? UNP P15389 ? ? linker 1905 10 3 7FBS GLY A 1588 ? UNP P15389 ? ? linker 1906 11 3 7FBS SER A 1589 ? UNP P15389 ? ? linker 1907 12 4 7FBS GLY A 1829 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2147 13 4 7FBS SER A 1830 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2148 14 4 7FBS ASP A 1831 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2149 15 4 7FBS TYR A 1832 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2150 16 4 7FBS LYS A 1833 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2151 17 4 7FBS ASP A 1834 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2152 18 4 7FBS ASP A 1835 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2153 19 4 7FBS ASP A 1836 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2154 20 4 7FBS ASP A 1837 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2155 21 4 7FBS LYS A 1838 ? UNP B7UCZ6 ? ? 'expression tag' 2156 22 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 4Y4 non-polymer . '1-[2-[(2R)-2-oxidanyl-3-(propylamino)propoxy]phenyl]-3-phenyl-propan-1-one' ? 'C21 H27 N O3' 341.444 6OU non-polymer . '[(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate' ? 'C39 H76 N O8 P' 717.996 9Z9 non-polymer . '(3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en' ? 'C34 H56 O5' 544.805 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7FBS _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7FBS _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 9688 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.813 ? 13148 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.342 ? 1463 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.047 ? 1535 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 1537 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7FBS _struct.title 'structure of a channel' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7FBS _struct_keywords.text 'ion channel, four-domain, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 4 ? P N N 3 ? Q N N 5 ? 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VAL A 211 ? PRO A 193 VAL A 211 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 218 ? ARG A 223 ? ALA A 218 ARG A 223 5 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 VAL A 224 ? ILE A 234 ? VAL A 224 ILE A 234 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 ILE A 234 ? LEU A 244 ? ILE A 234 LEU A 244 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 ILE A 245 ? LEU A 251 ? ILE A 245 LEU A 251 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 251 ? MET A 274 ? LEU A 251 MET A 274 1 ? 24 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 303 ? TYR A 308 ? ASN A 303 TYR A 308 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 358 ? THR A 371 ? SER A 358 THR A 371 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 CYS A 374 ? ALA A 386 ? CYS A 374 ALA A 386 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY A 387 ? ILE A 389 ? GLY A 387 ILE A 389 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 TYR A 390 ? LEU A 400 ? TYR A 390 LEU A 400 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY A 401 ? GLU A 429 ? GLY A 401 GLU A 429 1 ? 29 HELX_P HELX_P18 AB9 MET A 508 ? VAL A 518 ? MET A 705 VAL A 715 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA A 523 ? ALA A 539 ? ALA A 720 ALA A 736 1 ? 17 HELX_P HELX_P20 AC2 THR A 546 ? LEU A 575 ? 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