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EMDB EMD-31541 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, Oxr1 bound V1' _pdbx_database_related.db_id EMD-31541 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7FDE _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-07-16 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Khan, M.M.' 1 ? 'Lee, S.' 2 ? 'Oot, R.A.' 3 ? 'Couoh-Cardel, S.' 4 ? 'KIm, H.' 5 ? 'Wilkens, S.' 6 0000-0002-2721-2789 'Roh, S.H.' 7 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Embo J.' _citation.journal_id_ASTM EMJODG _citation.journal_id_CSD 0897 _citation.journal_id_ISSN 1460-2075 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase and Oxr1-bound V1 Reveal a Novel Mechanism of Regulation.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Khan, M.M.' 1 ? primary 'Lee, S.' 2 ? primary 'Oot, R.A.' 3 ? primary 'Couoh-Cardel, S.' 4 ? primary 'Kim, H.' 5 ? primary 'Wilkens, S.' 6 ? primary 'Roh, S.H.' 7 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7FDE _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7FDE _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'V-type proton ATPase subunit C' 44241.352 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit E' 26508.393 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit G' 13735.680 3 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Yeast Vacuolar ATPase A subunit' 67796.508 3 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit B' 57815.023 3 ? ? ? ? 6 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit D' 29235.023 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'V-type proton ATPase subunit F' 13479.170 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Oxidation resistance protein 1' 30818.334 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'V-ATPase subunit C' 2 'V-ATPase subunit E' 5 'V-ATPase subunit B' 6 'V-ATPase subunit D' 7 'V-ATPase subunit F' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; O ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; G,K,I ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MDYKDDDDKSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKA EAGVQGELAEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; ;MDYKDDDDKSQKNGIATLLQAEKEAHEIVSKARKYRQDKLKQAKTDAAKEIDSYKIQKDKELKEFEQKNAGGVGELEKKA EAGVQGELAEIKKIAEKKKDDVVKILIETVIKPSAEVHINAL ; H,L,J ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGL TVGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYG SVFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRV LDALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVGCGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVA NTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAEALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAV ALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLDKKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFP VLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQK AVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD ; ;MAGAIENARKEIKRISLEDHAESEYGAIYSVSGPVVIAENMIGCAMYELVKVGHDNLVGEVIRIDGDKATIQVYEETAGL TVGDPVLRTGKPLSVELGPGLMETIYDGIQRPLKAIKEESQSIYIPRGIDTPALDRTIKWQFTPGKFQVGDHISGGDIYG SVFENSLISSHKILLPPRSRGTITWIAPAGEYTLDEKILEVEFDGKKSDFTLYHTWPVRVPRPVTEKLSADYPLLTGQRV LDALFPCVQGGTTCIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDAIIYVGCGERGNEMAEVLMEFPELYTEMSGTKEPIMKRTTLVA NTSNMPVAAREASIYTGITLAEYFRDQGKNVSMIADSSSRWAEALREISGRLGEMPADQGFPAYLGAKLASFYERAGKAV ALGSPDRTGSVSIVAAVSPAGGDFSDPVTTATLGITQVFWGLDKKLAQRKHFPSINTSVSYSKYTNVLNKFYDSNYPEFP VLRDRMKEILSNAEELEQVVQLVGKSALSDSDKITLDVATLIKEDFLQQNGYSTYDAFCPIWKTFDMMRAFISYHDEAQK AVANGANWSKLADSTGDVKHAVSSSKFFEPSRGEKEVHGEFEKLLSTMQERFAESTD ; A,C,E ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; B,D,F ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; M ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; N ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MFGVKDAIFKIKRSIAGTDSSDSTAYTTASESSPQLKDSHNPFRNKTTSERTIVEEGSLPPVRLNGYLPSTKNKLLTPEM CDEIRTLMPTRIQLYTEWNLLYSLEQHGSSLHSLYSNVAPDSKEFRRVGYVLVIKDRKNGIFGAYSNEAFHPNEHRQYTG NGECFLWKLDKVPDVNISEKEESEQEGKEGKEEGDKEERWRFSGYPYTGVNEFAIYCTSEFLSMGAGDGHYGLLCDDGLL HGVSNPCQTYGNEVLSKEGKKFSIVALEVWRVG ; ;MFGVKDAIFKIKRSIAGTDSSDSTAYTTASESSPQLKDSHNPFRNKTTSERTIVEEGSLPPVRLNGYLPSTKNKLLTPEM CDEIRTLMPTRIQLYTEWNLLYSLEQHGSSLHSLYSNVAPDSKEFRRVGYVLVIKDRKNGIFGAYSNEAFHPNEHRQYTG NGECFLWKLDKVPDVNISEKEESEQEGKEGKEEGDKEERWRFSGYPYTGVNEFAIYCTSEFLSMGAGDGHYGLLCDDGLL HGVSNPCQTYGNEVLSKEGKKFSIVALEVWRVG ; P ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 THR n 1 4 ALA n 1 5 LEU n 1 6 TYR n 1 7 THR n 1 8 ALA n 1 9 ASN n 1 10 ASP n 1 11 PHE n 1 12 ILE n 1 13 LEU n 1 14 ILE n 1 15 SER n 1 16 LEU n 1 17 PRO n 1 18 GLN n 1 19 ASN n 1 20 ALA n 1 21 GLN n 1 22 PRO n 1 23 VAL n 1 24 THR n 1 25 ALA n 1 26 PRO n 1 27 GLY n 1 28 SER n 1 29 LYS n 1 30 THR n 1 31 ASP n 1 32 SER n 1 33 TRP n 1 34 PHE n 1 35 ASN n 1 36 GLU n 1 37 THR n 1 38 LEU n 1 39 ILE n 1 40 GLY n 1 41 GLY n 1 42 ARG n 1 43 ALA n 1 44 PHE n 1 45 VAL n 1 46 SER n 1 47 ASP n 1 48 PHE n 1 49 LYS n 1 50 ILE n 1 51 PRO n 1 52 GLU n 1 53 PHE n 1 54 LYS n 1 55 ILE n 1 56 GLY n 1 57 SER n 1 58 LEU n 1 59 ASP n 1 60 THR n 1 61 LEU n 1 62 ILE n 1 63 VAL n 1 64 GLU n 1 65 SER n 1 66 GLU n 1 67 GLU n 1 68 LEU n 1 69 SER n 1 70 LYS n 1 71 VAL n 1 72 ASP n 1 73 ASN n 1 74 GLN n 1 75 ILE n 1 76 GLY n 1 77 ALA n 1 78 SER n 1 79 ILE n 1 80 GLY n 1 81 LYS n 1 82 ILE n 1 83 ILE n 1 84 GLU n 1 85 ILE n 1 86 LEU n 1 87 GLN n 1 88 GLY n 1 89 LEU n 1 90 ASN n 1 91 GLU n 1 92 THR n 1 93 SER n 1 94 THR n 1 95 ASN n 1 96 ALA n 1 97 TYR n 1 98 ARG n 1 99 THR n 1 100 LEU n 1 101 PRO n 1 102 ILE n 1 103 ASN n 1 104 ASN n 1 105 MET n 1 106 PRO n 1 107 VAL n 1 108 PRO n 1 109 GLU n 1 110 TYR n 1 111 LEU n 1 112 GLU n 1 113 ASN n 1 114 PHE n 1 115 GLN n 1 116 TRP n 1 117 GLN n 1 118 THR n 1 119 ARG n 1 120 LYS n 1 121 PHE n 1 122 LYS n 1 123 LEU n 1 124 ASP n 1 125 LYS n 1 126 SER n 1 127 ILE n 1 128 LYS n 1 129 ASP n 1 130 LEU n 1 131 ILE n 1 132 THR n 1 133 LEU n 1 134 ILE n 1 135 SER n 1 136 ASN n 1 137 GLU n 1 138 SER n 1 139 SER n 1 140 GLN n 1 141 LEU n 1 142 ASP n 1 143 ALA n 1 144 ASP n 1 145 VAL n 1 146 ARG n 1 147 ALA n 1 148 THR n 1 149 TYR n 1 150 ALA n 1 151 ASN n 1 152 TYR n 1 153 ASN n 1 154 SER n 1 155 ALA n 1 156 LYS n 1 157 THR n 1 158 ASN n 1 159 LEU n 1 160 ALA n 1 161 ALA n 1 162 ALA n 1 163 GLU n 1 164 ARG n 1 165 LYS n 1 166 LYS n 1 167 THR n 1 168 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S288c ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP VATC_YEAST P31412 ? 1 ;MATALYTANDFILISLPQNAQPVTAPGSKTDSWFNETLIGGRAFVSDFKIPEFKIGSLDTLIVESEELSKVDNQIGASIG KIIEILQGLNETSTNAYRTLPINNMPVPEYLENFQWQTRKFKLDKSIKDLITLISNESSQLDADVRATYANYNSAKTNLA AAERKKTGDLSVRSLHDIVKPEDFVLNSEHLTTVLVAVPKSLKSDFEKSYETLSKNVVPASASVIAEDAEYVLFNVHLFK KNVQEFTTAAREKKFIPREFNYSEELIDQLKKEHDSAASLEQSLRVQLVRLAKTAYVDVFINWFHIKALRVYVESVLRYG LPPHFNIKIIAVPPKNLSKCKSELIDAFGFLGGNAFMKDKKGKINKQDTSLHQYASLVDTEYEPFVMYIINL ; 1 2 UNP VATE_YEAST P22203 ? 2 ;MSSAITALTPNQVNDELNKMQAFIRKEAEEKAKEIQLKADQEYEIEKTNIVRNETNNIDGNFKSKLKKAMLSQQITKSTI ANKMRLKVLSAREQSLDGIFEETKEKLSGIANNRDEYKPILQSLIVEALLKLLEPKAIVKALERDVDLIESMKDDIMREY GEKAQRAPLEEIVISNDYLNKDLVSGGVVVSNASDKIEINNTLEERLKLLSEEALPAIRLELYGPSKTRKFFD ; 1 3 PDB 7FDE 7FDE ? 3 ? 1 4 PDB 7FDE 7FDE ? 4 ? 1 5 UNP VATB_YEAST P16140 ? 5 ;MVLSDKELFAINKKAVEQGFNVKPRLNYNTVSGVNGPLVILEKVKFPRYNEIVNLTLPDGTVRQGQVLEIRGDRAIVQVF EGTSGIDVKKTTVEFTGESLRIPVSEDMLGRIFDGSGRPIDNGPKVFAEDYLDINGSPINPYARIYPEEMISTGVSAIDT MNSIARGQKIPIFSASGLPHNEIAAQICRQAGLVRPTKDVHDGHEENFSIVFAAMGVNLETARFFKQDFEENGSLERTSL FLNLANDPTIERIITPRLALTTAEYLAYQTERHVLTILTDMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLSTIYERAG RVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIFVDRQLHNKGIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVS NQLYAKYAIGKDAAAMKAVVGEEALSIEDKLSLEFLEKFEKTFITQGAYEDRTVFESLDQAWSLLRIYPKEMLNRISPKI LDEFYDRARDDADEDEEDPDTRSSGKKKDASQEESLI ; 1 6 UNP VATD_YEAST P32610 ? 6 ;MSGNREQVFPTRMTLGLMKTKLKGANQGYSLLKRKSEALTKRFRDITKRIDDAKQKMGRVMQTAAFSLAEVSYATGENIG YQVQESVSTARFKVRARQENVSGVYLSQFESYIDPEINDFRLTGLGRGGQQVQRAKEIYSRAVETLVELASLQTAFIILD EVIKVTNRRVNAIEHVIIPRTENTIAYINSELDELDREEFYRLKKVQEKKQNETAKLDAEMKLKRDRAEQDASEVAADEE PQGETLVADQEDDVIF ; 1 7 UNP VATF_YEAST P39111 ? 7 ;MAEKRTLIAVIADEDTTTGLLLAGIGQITPETQEKNFFVYQEGKTTKEEITDKFNHFTEERDDIAILLINQHIAENIRAR VDSFTNAFPAILEIPSKDHPYDPEKDSVLKRVRKLFGE ; 1 8 UNP OXR1_YEAST Q08952 ? 8 ;MFGVKDAIFKIKRSIAGTDSSDSTAYTTASESSPQLKDSHNPFRNKTTSERTIVEEGSLPPVRLNGYLPSTKNKLLTPEM CDEIRTLMPTRIQLYTEWNLLYSLEQHGSSLHSLYSNVAPDSKEFRRVGYVLVIKDRKNGIFGAYSNEAFHPNEHRQYTG NGECFLWKLDKVPDVNISEKEESEQEGKEGKEEGDKEERWRFSGYPYTGVNEFAIYCTSEFLSMGAGDGHYGLLCDDGLL HGVSNPCQTYGNEVLSKEGKKFSIVALEVWRVG ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7FDE O 1 ? 392 ? 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'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 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AF9 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD8 5 6 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? parallel AE1 2 3 ? parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE6 4 5 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? parallel AE8 2 3 ? parallel AE8 3 4 ? parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? parallel AF3 1 2 ? parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? parallel AF6 2 3 ? parallel AF6 3 4 ? parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF8 5 6 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 45 ? ASP A 47 ? VAL O 45 ASP O 47 AA1 2 LYS A 328 ? ILE A 330 ? LYS O 328 ILE O 330 AA1 3 PHE A 11 ? ILE A 14 ? PHE O 11 ILE O 14 AA1 4 MET A 387 ? ILE A 390 ? MET O 387 ILE O 390 AA2 1 SER A 223 ? GLU A 227 ? SER O 223 GLU O 227 AA2 2 TYR A 231 ? LEU A 238 ? TYR O 231 LEU O 238 AA2 3 THR A 192 ? PRO A 199 ? THR O 192 PRO O 199 AA2 4 ILE A 256 ? PRO A 257 ? ILE O 256 PRO O 257 AA3 1 VAL B 173 ? ILE B 174 ? VAL G 173 ILE G 174 AA3 2 ILE B 138 ? LYS B 140 ? ILE G 138 LYS G 140 AA3 3 VAL B 188 ? SER B 191 ? VAL G 188 SER G 191 AA3 4 ILE B 197 ? ASN B 201 ? ILE G 197 ASN G 201 AA3 5 ASN I 27 ? TYR I 28 ? ASN F 27 TYR F 28 AA3 6 VAL I 93 ? GLU I 94 ? VAL F 93 GLU F 94 AA4 1 GLY D 26 ? ALA D 27 ? GLY A 25 ALA A 26 AA4 2 PRO D 85 ? VAL D 86 ? PRO A 84 VAL A 85 AA5 1 SER D 30 ? SER D 32 ? SER A 29 SER A 31 AA5 2 VAL D 35 ? ILE D 37 ? VAL A 34 ILE A 36 AA5 3 LYS D 68 ? VAL D 73 ? LYS A 67 VAL A 72 AA5 4 LEU D 57 ? ASP D 65 ? LEU A 56 ASP A 64 AA5 5 LEU D 49 ? VAL D 52 ? 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ILE I 197 ASN I 201 AB3 3 VAL N 188 ? ASN N 192 ? VAL I 188 ASN I 192 AB3 4 LYS N 136 ? LYS N 140 ? LYS I 136 LYS I 140 AB3 5 GLU N 171 ? ILE N 174 ? GLU I 171 ILE I 174 AB4 1 LEU E 38 ? LEU E 41 ? LEU B 38 LEU B 41 AB4 2 ALA E 75 ? VAL E 79 ? ALA B 75 VAL B 79 AB4 3 GLY E 65 ? VAL E 67 ? GLY B 65 VAL B 67 AB5 1 VAL E 53 ? THR E 56 ? VAL B 53 THR B 56 AB5 2 THR E 92 ? PHE E 95 ? THR B 92 PHE B 95 AB6 1 ARG E 101 ? VAL E 104 ? ARG B 101 VAL B 104 AB6 2 ASP E 130 ? ASP E 133 ? ASP B 130 ASP B 133 AB7 1 ILE E 112 ? PHE E 113 ? ILE B 112 PHE B 113 AB7 2 LEU E 240 ? PHE E 241 ? LEU B 240 PHE B 241 AB7 3 PHE E 208 ? ALA E 213 ? PHE B 208 ALA B 213 AB7 4 HIS E 273 ? ILE E 277 ? HIS B 273 ILE B 277 AB7 5 GLN E 331 ? ILE E 332 ? GLN B 331 ILE B 332 AB8 1 MET E 150 ? ILE E 151 ? MET B 150 ILE B 151 AB8 2 ILE E 164 ? ALA E 165 ? ILE B 164 ALA B 165 AB9 1 GLY F 26 ? SER F 32 ? GLY C 25 SER C 31 AB9 2 VAL F 35 ? GLU F 39 ? VAL C 34 GLU C 38 AB9 3 LYS F 68 ? VAL F 73 ? 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THR C 302 GLU C 303 AC7 2 THR F 308 ? LYS F 309 ? THR C 307 LYS C 308 AC8 1 ASN F 350 ? VAL F 351 ? ASN C 349 VAL C 350 AC8 2 SER F 410 ? VAL F 411 ? SER C 409 VAL C 410 AC9 1 ASN G 27 ? TYR G 28 ? ASN D 27 TYR D 28 AC9 2 VAL G 93 ? GLU G 94 ? VAL D 93 GLU D 94 AD1 1 VAL G 31 ? ASN G 35 ? VAL D 31 ASN D 35 AD1 2 LEU G 38 ? LEU G 41 ? LEU D 38 LEU D 41 AD1 3 ALA G 75 ? VAL G 79 ? ALA D 75 VAL D 79 AD1 4 VAL G 62 ? ILE G 70 ? VAL D 62 ILE D 70 AD1 5 ILE G 52 ? THR G 56 ? ILE D 52 THR D 56 AD2 1 ARG G 101 ? VAL G 104 ? ARG D 101 VAL D 104 AD2 2 ASP G 130 ? ASP G 133 ? ASP D 130 ASP D 133 AD3 1 ARG G 111 ? PHE G 113 ? ARG D 111 PHE D 113 AD3 2 SER G 239 ? PHE G 241 ? SER D 239 PHE D 241 AD4 1 ARG G 144 ? ILE G 145 ? ARG D 144 ILE D 145 AD4 2 ARG G 321 ? VAL G 322 ? ARG D 321 VAL D 322 AD5 1 ILE G 151 ? SER G 152 ? ILE D 151 SER D 152 AD5 2 GLY G 192 ? LEU G 193 ? GLY D 192 LEU D 193 AD6 1 SER G 209 ? ALA G 214 ? SER D 209 ALA D 214 AD6 2 VAL G 274 ? THR G 279 ? VAL D 274 THR D 279 AD7 1 PHE G 359 ? VAL G 360 ? PHE D 359 VAL D 360 AD7 2 ILE G 373 ? ASN G 374 ? ILE D 373 ASN D 374 AD8 1 LEU H 49 ? VAL H 52 ? LEU E 48 VAL E 51 AD8 2 LEU H 57 ? ASP H 65 ? LEU E 56 ASP E 64 AD8 3 LYS H 68 ? VAL H 73 ? LYS E 67 VAL E 72 AD8 4 VAL H 35 ? GLU H 39 ? VAL E 34 GLU E 38 AD8 5 GLY H 26 ? SER H 32 ? GLY E 25 SER E 31 AD8 6 PRO H 85 ? VAL H 86 ? PRO E 84 VAL E 85 AD9 1 SER H 94 ? GLU H 96 ? SER E 93 GLU E 95 AD9 2 THR H 215 ? PRO H 217 ? THR E 214 PRO E 216 AE1 1 ILE H 105 ? TYR H 106 ? ILE E 104 TYR E 105 AE1 2 THR H 316 ? THR H 322 ? THR E 315 THR E 321 AE1 3 ILE H 279 ? GLU H 286 ? ILE E 278 GLU E 285 AE2 1 GLY H 160 ? VAL H 162 ? GLY E 159 VAL E 161 AE2 2 TRP H 140 ? PRO H 144 ? TRP E 139 PRO E 143 AE2 3 GLY H 190 ? TYR H 192 ? GLY E 189 TYR E 191 AE3 1 HIS H 152 ? ILE H 153 ? HIS E 151 ILE E 152 AE3 2 GLY H 181 ? ILE H 186 ? GLY E 180 ILE E 185 AE3 3 LEU H 199 ? GLU H 202 ? LEU E 198 GLU E 201 AE4 1 GLU H 226 ? LYS H 227 ? 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