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'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7FH1 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7FH1 _struct.title 'Structure of the human Meckelin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7FH1 _struct_keywords.text 'Cryo-EM, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 45 ? CYS A 49 ? GLN A 45 CYS A 49 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 174 ? SER A 181 ? GLU A 174 SER A 181 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 223 ? LEU A 230 ? SER A 223 LEU A 230 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 230 ? VAL A 239 ? LEU A 230 VAL A 239 1 ? 10 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 242 ? ASN A 256 ? ASN A 242 ASN A 256 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 266 ? THR A 278 ? ASP A 266 THR A 278 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 306 ? SER A 311 ? ALA A 306 SER A 311 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 360 ? ALA A 366 ? THR A 360 ALA A 366 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO A 381 ? PHE A 389 ? PRO A 381 PHE A 389 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY A 518 ? ARG A 549 ? GLY A 518 ARG A 549 1 ? 32 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 557 ? ALA A 592 ? LEU A 557 ALA A 592 1 ? 36 HELX_P HELX_P12 AB3 MET A 602 ? THR A 633 ? MET A 602 THR A 633 1 ? 32 HELX_P HELX_P13 AB4 ILE A 667 ? ILE A 680 ? ILE A 667 ILE A 680 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN A 687 ? VAL A 701 ? ASN A 687 VAL A 701 1 ? 15 HELX_P HELX_P15 AB6 GLY A 703 ? LEU A 709 ? GLY A 703 LEU A 709 5 ? 7 HELX_P HELX_P16 AB7 LEU A 731 ? PHE A 758 ? LEU A 731 PHE A 758 1 ? 28 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP A 761 ? MET A 772 ? ASP A 761 MET A 772 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 AB9 SER A 836 ? ARG A 845 ? SER A 836 ARG A 845 1 ? 10 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN A 869 ? ASP A 886 ? GLN A 869 ASP A 886 1 ? 18 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU A 902 ? GLY A 907 ? LEU A 902 GLY A 907 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 TYR A 925 ? VAL A 930 ? TYR A 925 VAL A 930 5 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 ASN A 935 ? PHE A 946 ? ASN A 935 PHE A 946 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 PHE A 946 ? CYS A 954 ? PHE A 946 CYS A 954 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 AC6 PHE A 957 ? THR A 987 ? PHE A 957 THR A 987 1 ? 31 HELX_P HELX_P25 AC7 GLN B 45 ? CYS B 49 ? GLN B 45 CYS B 49 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 GLU B 174 ? SER B 181 ? GLU B 174 SER B 181 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 AC9 SER B 223 ? LEU B 230 ? SER B 223 LEU B 230 1 ? 8 HELX_P HELX_P28 AD1 LEU B 230 ? VAL B 239 ? LEU B 230 VAL B 239 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN B 242 ? ASN B 256 ? ASN B 242 ASN B 256 1 ? 15 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP B 266 ? THR B 278 ? ASP B 266 THR B 278 1 ? 13 HELX_P HELX_P31 AD4 ALA B 306 ? SER B 311 ? ALA B 306 SER B 311 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 THR B 360 ? ALA B 366 ? THR B 360 ALA B 366 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA B 367 ? SER B 369 ? ALA B 367 SER B 369 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO B 381 ? PHE B 389 ? PRO B 381 PHE B 389 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY B 518 ? ARG B 549 ? GLY B 518 ARG B 549 1 ? 32 HELX_P HELX_P36 AD9 LEU B 557 ? ALA B 592 ? LEU B 557 ALA B 592 1 ? 36 HELX_P HELX_P37 AE1 MET B 602 ? THR B 633 ? MET B 602 THR B 633 1 ? 32 HELX_P HELX_P38 AE2 ILE B 667 ? ILE B 680 ? ILE B 667 ILE B 680 1 ? 14 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN B 687 ? VAL B 701 ? ASN B 687 VAL B 701 1 ? 15 HELX_P HELX_P40 AE4 GLY B 703 ? LEU B 709 ? GLY B 703 LEU B 709 5 ? 7 HELX_P HELX_P41 AE5 LEU B 731 ? PHE B 758 ? LEU B 731 PHE B 758 1 ? 28 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP B 761 ? MET B 772 ? ASP B 761 MET B 772 1 ? 12 HELX_P HELX_P43 AE7 SER B 836 ? ARG B 845 ? SER B 836 ARG B 845 1 ? 10 HELX_P HELX_P44 AE8 GLN B 869 ? ASP B 886 ? GLN B 869 ASP B 886 1 ? 18 HELX_P HELX_P45 AE9 LEU B 902 ? GLY B 907 ? LEU B 902 GLY B 907 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 TYR B 925 ? VAL B 930 ? TYR B 925 VAL B 930 5 ? 6 HELX_P HELX_P47 AF2 ASN B 935 ? PHE B 946 ? ASN B 935 PHE B 946 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 PHE B 946 ? CYS B 954 ? PHE B 946 CYS B 954 1 ? 9 HELX_P HELX_P49 AF4 PHE B 957 ? THR B 987 ? PHE B 957 THR B 987 1 ? 31 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 49 SG ? ? ? 1_555 A CYS 62 SG ? ? A CYS 49 A CYS 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 65 SG ? ? ? 1_555 A CYS 78 SG ? ? A CYS 65 A CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 80 SG ? ? ? 1_555 A CYS 97 SG ? ? A CYS 80 A CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 100 SG ? ? ? 1_555 A CYS 114 SG ? ? A CYS 100 A CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 117 SG ? ? ? 1_555 A CYS 127 SG ? ? A CYS 117 A CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf6 disulf ? ? A CYS 129 SG ? ? ? 1_555 A CYS 150 SG ? ? A CYS 129 A CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf7 disulf ? ? A CYS 153 SG ? ? ? 1_555 A CYS 170 SG ? ? A CYS 153 A CYS 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf8 disulf ? ? A CYS 173 SG ? ? ? 1_555 A CYS 184 SG ? ? A CYS 173 A CYS 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf9 disulf ? ? A CYS 186 SG ? ? ? 1_555 A CYS 197 SG ? ? A CYS 186 A CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf10 disulf ? ? A CYS 237 SG ? ? ? 1_555 A CYS 246 SG ? ? A CYS 237 A CYS 246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 253 SG ? ? ? 1_555 A CYS 268 SG ? ? A CYS 253 A CYS 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf12 disulf ? ? A CYS 357 SG ? ? ? 1_555 A CYS 378 SG ? ? A CYS 357 A CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf13 disulf ? ? B CYS 49 SG ? ? ? 1_555 B CYS 62 SG ? ? B CYS 49 B CYS 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 65 SG ? ? ? 1_555 B CYS 78 SG ? ? B CYS 65 B CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 80 SG ? ? ? 1_555 B CYS 97 SG ? ? B CYS 80 B CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 100 SG ? ? ? 1_555 B CYS 114 SG ? ? B CYS 100 B CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 117 SG ? ? ? 1_555 B CYS 127 SG ? ? B CYS 117 B CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 129 SG ? ? ? 1_555 B CYS 150 SG ? ? B CYS 129 B CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 153 SG ? ? ? 1_555 B CYS 170 SG ? ? B CYS 153 B CYS 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 173 SG ? ? ? 1_555 B CYS 184 SG ? ? B CYS 173 B CYS 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 186 SG ? ? ? 1_555 B CYS 197 SG ? ? B CYS 186 B CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 237 SG ? ? ? 1_555 B CYS 246 SG ? ? B CYS 237 B CYS 246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 253 SG ? ? ? 1_555 B CYS 268 SG ? ? B CYS 253 B CYS 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf24 disulf ? ? B CYS 357 SG ? ? ? 1_555 B CYS 378 SG ? ? B CYS 357 B CYS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale both ? C NAG . O4 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale2 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale3 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale4 covale both ? F NAG . 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4 3 'DManpb1-3[DManpb1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 3 'WURCS=2.0/2,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2-2-2/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 3 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][b-D-Manp]{}[(6+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 2 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 3 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 3 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 3 4 BMA C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 3 5 BMA C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 2 NAG 1 n 2 NAG 2 n 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n 3 BMA 3 n 3 BMA 4 n 3 BMA 5 n # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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