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EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? RELION ? 1 ? ? 6 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL FITTING' ? ? ? ? 1 ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? 11 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 12 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 13 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;Recombinantly expressed and purified Drosophila ORC and Cdc6 were mixed with DNA and the DNA-bound ternary complex purified by size exclusion chromatography. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _ndb_struct_conf_na.entry_id 7JGR _ndb_struct_conf_na.feature 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 H DA 24 1_555 I DT 61 1_555 0.566 0.496 -0.171 -0.387 -2.478 13.861 1 H_DA1:DT68_I H 1 ? I 68 ? ? ? 1 H DG 25 1_555 I DC 60 1_555 0.528 0.084 -0.331 -2.328 -2.848 6.075 2 H_DG2:DC67_I H 2 ? I 67 ? 19 1 1 H DA 26 1_555 I DT 59 1_555 0.639 -0.411 -0.403 -1.260 -5.673 9.966 3 H_DA3:DT66_I H 3 ? I 66 ? 20 1 1 H DT 27 1_555 I DA 58 1_555 0.326 -0.663 -0.436 -0.425 -7.735 4.733 4 H_DT4:DA65_I H 4 ? I 65 ? 20 1 1 H DT 28 1_555 I DA 57 1_555 -0.170 -0.549 -0.246 -1.945 -6.973 3.532 5 H_DT5:DA64_I H 5 ? I 64 ? 20 1 1 H DT 29 1_555 I DA 56 1_555 -0.283 -0.625 -0.207 0.762 -9.760 8.420 6 H_DT6:DA63_I H 6 ? I 63 ? 20 1 1 H DT 30 1_555 I DA 55 1_555 -0.314 -0.429 -0.130 1.447 -5.362 10.385 7 H_DT7:DA62_I H 7 ? I 62 ? 20 1 1 H DA 31 1_555 I DT 54 1_555 -0.361 -0.155 0.028 0.233 -3.902 8.374 8 H_DA8:DT61_I H 8 ? I 61 ? 20 1 1 H DT 32 1_555 I DA 53 1_555 -0.459 -0.055 -0.068 2.549 -4.930 4.029 9 H_DT9:DA60_I H 9 ? I 60 ? 20 1 1 H DG 33 1_555 I DC 52 1_555 -0.499 0.046 -0.053 1.445 -7.241 5.604 10 H_DG10:DC59_I H 10 ? I 59 ? 19 1 1 H DT 34 1_555 I DA 51 1_555 -0.302 0.129 -0.269 2.786 -11.435 5.466 11 H_DT11:DA58_I H 11 ? I 58 ? 20 1 1 H DT 35 1_555 I DA 50 1_555 -0.201 0.281 -0.197 0.320 -10.548 5.063 12 H_DT12:DA57_I H 12 ? I 57 ? 20 1 1 H DT 36 1_555 I DA 49 1_555 -0.048 0.399 -0.127 0.886 -10.626 0.884 13 H_DT13:DA56_I H 13 ? I 56 ? 20 1 1 H DA 37 1_555 I DT 48 1_555 0.480 0.287 -0.365 -1.960 -8.509 5.186 14 H_DA14:DT55_I H 14 ? I 55 ? 20 1 1 H DG 38 1_555 I DC 47 1_555 0.379 0.042 -0.458 -2.515 -9.526 5.767 15 H_DG15:DC54_I H 15 ? I 54 ? 19 1 1 H DA 39 1_555 I DT 46 1_555 0.553 -0.381 -0.315 -3.924 -7.253 9.212 16 H_DA16:DT53_I H 16 ? I 53 ? 20 1 1 H DT 40 1_555 I DA 45 1_555 0.309 -0.641 -0.242 -1.218 -9.065 4.651 17 H_DT17:DA52_I H 17 ? I 52 ? 20 1 1 H DC 41 1_555 I DG 44 1_555 0.173 -0.942 -0.258 -2.922 -5.345 5.267 18 H_DC18:DG51_I H 18 ? I 51 ? 22 1 1 H DT 42 1_555 I DA 43 1_555 -0.385 -0.789 -0.292 0.850 -5.076 9.148 19 H_DT19:DA50_I H 19 ? 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I 35 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 H DA 24 1_555 I DT 61 1_555 H DG 25 1_555 I DC 60 1_555 -1.060 -0.327 3.490 -1.542 -0.369 32.885 -0.509 1.587 3.538 -0.651 2.723 32.922 1 HH_DA1DG2:DC67DT68_II H 1 ? I 68 ? H 2 ? I 67 ? 1 H DG 25 1_555 I DC 60 1_555 H DA 26 1_555 I DT 59 1_555 -0.374 0.183 3.271 -1.586 1.367 43.105 0.114 0.352 3.286 1.860 2.158 43.153 2 HH_DG2DA3:DT66DC67_II H 2 ? I 67 ? H 3 ? I 66 ? 1 H DA 26 1_555 I DT 59 1_555 H DT 27 1_555 I DA 58 1_555 -0.771 -0.842 3.512 2.316 -2.885 34.642 -0.934 1.666 3.511 -4.829 -3.875 34.833 3 HH_DA3DT4:DA65DT66_II H 3 ? I 66 ? H 4 ? I 65 ? 1 H DT 27 1_555 I DA 58 1_555 H DT 28 1_555 I DA 57 1_555 0.630 1.262 3.562 1.570 -4.568 38.626 2.487 -0.742 3.419 -6.873 -2.362 38.916 4 HH_DT4DT5:DA64DA65_II H 4 ? I 65 ? H 5 ? I 64 ? 1 H DT 28 1_555 I DA 57 1_555 H DT 29 1_555 I DA 56 1_555 -0.133 -0.937 3.227 -1.739 -0.834 31.974 -1.548 -0.070 3.252 -1.512 3.153 32.031 5 HH_DT5DT6:DA63DA64_II H 5 ? I 64 ? H 6 ? I 63 ? 1 H DT 29 1_555 I DA 56 1_555 H DT 30 1_555 I DA 55 1_555 0.991 0.293 3.203 0.750 1.149 38.914 0.302 -1.398 3.228 1.724 -1.125 38.937 6 HH_DT6DT7:DA62DA63_II H 6 ? I 63 ? H 7 ? I 62 ? 1 H DT 30 1_555 I DA 55 1_555 H DA 31 1_555 I DT 54 1_555 0.062 0.598 3.391 -0.248 -1.275 40.311 1.016 -0.120 3.371 -1.849 0.360 40.331 7 HH_DT7DA8:DT61DA62_II H 7 ? I 62 ? H 8 ? I 61 ? 1 H DA 31 1_555 I DT 54 1_555 H DT 32 1_555 I DA 53 1_555 -0.335 -1.290 3.277 0.007 -0.739 28.616 -2.440 0.679 3.309 -1.496 -0.015 28.625 8 HH_DA8DT9:DA60DT61_II H 8 ? I 61 ? H 9 ? I 60 ? 1 H DT 32 1_555 I DA 53 1_555 H DG 33 1_555 I DC 52 1_555 0.188 0.125 3.307 0.307 -0.050 36.458 0.208 -0.257 3.308 -0.081 -0.491 36.459 9 HH_DT9DG10:DC59DA60_II H 9 ? I 60 ? H 10 ? I 59 ? 1 H DG 33 1_555 I DC 52 1_555 H DT 34 1_555 I DA 51 1_555 -0.182 -0.373 3.263 2.949 -1.855 36.703 -0.339 0.686 3.253 -2.938 -4.670 36.863 10 HH_DG10DT11:DA58DC59_II H 10 ? I 59 ? H 11 ? I 58 ? 1 H DT 34 1_555 I DA 51 1_555 H DT 35 1_555 I DA 50 1_555 0.531 0.430 3.313 3.866 -1.119 40.349 0.748 -0.326 3.335 -1.617 -5.588 40.541 11 HH_DT11DT12:DA57DA58_II H 11 ? I 58 ? H 12 ? 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