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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7JZY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7JZY _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 ? 25143 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.967 ? 34415 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 21.622 ? 9357 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.053 ? 3885 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 4315 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7JZY _struct.title 'CryoEM structure of a CRISPR-Cas complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7JZY _struct_keywords.text 'CRISPR, HYDROLASE-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE/RNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 5 ? H N N 5 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 6 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 9 ? LYS A 31 ? THR A 9 LYS A 31 1 ? 23 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 38 ? HIS A 47 ? ASP A 38 HIS A 47 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 50 ? GLY A 61 ? GLU A 50 GLY A 61 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 111 ? ALA A 113 ? ASN A 111 ALA A 113 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA A 114 ? SER A 122 ? ALA A 114 SER A 122 1 ? 9 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN A 129 ? GLU A 136 ? 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ALA D 151 ASN D 163 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 ALA E 190 ? SER E 204 ? ALA D 209 SER D 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P36 AD9 HIS E 256 ? ARG E 265 ? HIS D 275 ARG D 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP E 303 ? LEU E 313 ? ASP D 322 LEU D 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 ALA E 319 ? GLY E 333 ? ALA D 338 GLY D 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 AE3 GLN F 32 ? SER F 36 ? GLN E 51 SER E 55 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP F 63 ? GLN F 72 ? ASP E 82 GLN E 91 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP F 111 ? GLN F 129 ? ASP E 130 GLN E 148 1 ? 19 HELX_P HELX_P42 AE6 ALA F 132 ? ASN F 144 ? ALA E 151 ASN E 163 1 ? 13 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA F 190 ? SER F 204 ? ALA E 209 SER E 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 AE8 HIS F 256 ? ARG F 265 ? HIS E 275 ARG E 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU F 274 ? GLY F 278 ? GLU E 293 GLY E 297 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 ASP F 303 ? LEU F 313 ? ASP E 322 LEU E 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P47 AF2 ALA F 319 ? GLY F 333 ? ALA E 338 GLY E 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P48 AF3 GLN G 32 ? SER G 36 ? GLN F 51 SER F 55 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP G 63 ? SER G 73 ? ASP F 82 SER F 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P50 AF5 ASP G 111 ? GLN G 129 ? ASP F 130 GLN F 148 1 ? 19 HELX_P HELX_P51 AF6 ALA G 132 ? ASN G 144 ? ALA F 151 ASN F 163 1 ? 13 HELX_P HELX_P52 AF7 GLU G 191 ? GLY G 205 ? GLU F 210 GLY F 224 1 ? 15 HELX_P HELX_P53 AF8 HIS G 256 ? ARG G 265 ? HIS F 275 ARG F 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP G 303 ? LEU G 313 ? ASP F 322 LEU F 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P55 AG1 ALA G 319 ? GLY G 333 ? ALA F 338 GLY F 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP H 63 ? GLN H 72 ? ASP G 82 GLN G 91 1 ? 10 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP H 111 ? GLN H 129 ? ASP G 130 GLN G 148 1 ? 19 HELX_P HELX_P58 AG4 ALA H 132 ? ASN H 144 ? ALA G 151 ASN G 163 1 ? 13 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP H 189 ? SER H 204 ? ASP G 208 SER G 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P60 AG6 HIS H 256 ? ARG H 265 ? HIS G 275 ARG G 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P61 AG7 GLU H 274 ? GLY H 278 ? GLU G 293 GLY G 297 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 AG8 ASP H 303 ? LEU H 313 ? 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TYPE_11_PAIR ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id HIS _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 95 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id C _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id HIS _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 93 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id C _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 96 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 C _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 94 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 C _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 4.49 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 2 ? 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AG1 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE1 5 6 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE7 4 5 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE8 4 5 ? anti-parallel AE8 5 6 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF5 5 6 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLN A 64 ? 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ILE B 144 LEU B 145 AA9 1 ARG B 65 ? ALA B 68 ? ARG B 65 ALA B 68 AA9 2 ALA B 103 ? HIS B 114 ? ALA B 103 HIS B 114 AA9 3 ALA B 8 ? ILE B 17 ? ALA B 8 ILE B 17 AA9 4 ALA B 157 ? LEU B 160 ? ALA B 157 LEU B 160 AB1 1 ILE B 70 ? SER B 71 ? ILE B 70 SER B 71 AB1 2 VAL B 80 ? PHE B 81 ? VAL B 80 PHE B 81 AB2 1 TYR B 304 ? HIS B 306 ? TYR B 304 HIS B 306 AB2 2 ARG B 315 ? SER B 317 ? ARG B 315 SER B 317 AB3 1 GLY C 43 ? SER C 45 ? GLY C 41 SER C 43 AB3 2 ARG C 59 ? ALA C 64 ? ARG C 57 ALA C 62 AB3 3 HIS C 5 ? LEU C 11 ? HIS C 3 LEU C 9 AB3 4 LEU C 85 ? PHE C 87 ? LEU C 83 PHE C 85 AB4 1 GLY C 43 ? SER C 45 ? GLY C 41 SER C 43 AB4 2 ARG C 59 ? ALA C 64 ? ARG C 57 ALA C 62 AB4 3 HIS C 5 ? LEU C 11 ? HIS C 3 LEU C 9 AB4 4 ALA C 91 ? VAL C 92 ? ALA C 89 VAL C 90 AB5 1 TYR C 99 ? ARG C 100 ? TYR C 97 ARG C 98 AB5 2 VAL C 186 ? PRO C 187 ? VAL C 184 PRO C 185 AB6 1 VAL C 102 ? VAL C 105 ? VAL C 100 VAL C 103 AB6 2 HIS C 156 ? HIS C 163 ? HIS C 154 HIS C 161 AB6 3 PHE C 145 ? ARG C 149 ? PHE C 143 ARG C 147 AB7 1 ALA E 13 ? PHE E 14 ? ALA D 32 PHE D 33 AB7 2 GLY E 334 ? VAL E 335 ? GLY D 353 VAL D 354 AB8 1 ASP E 19 ? PRO E 20 ? ASP D 38 PRO D 39 AB8 2 THR E 90 ? VAL E 99 ? THR D 109 VAL D 118 AB8 3 VAL E 209 ? ARG E 218 ? VAL D 228 ARG D 237 AB8 4 VAL E 158 ? HIS E 164 ? VAL D 177 HIS D 183 AB8 5 ARG E 172 ? ASP E 177 ? ARG D 191 ASP D 196 AB9 1 ASP E 19 ? PRO E 20 ? ASP D 38 PRO D 39 AB9 2 THR E 90 ? VAL E 99 ? THR D 109 VAL D 118 AB9 3 ALA E 23 ? GLY E 28 ? ALA D 42 GLY D 47 AB9 4 ALA E 254 ? ILE E 255 ? ALA D 273 ILE D 274 AC1 1 ARG E 45 ? LYS E 47 ? ARG D 64 LYS D 66 AC1 2 VAL E 79 ? VAL E 81 ? VAL D 98 VAL D 100 AC2 1 GLN E 229 ? GLU E 230 ? GLN D 248 GLU D 249 AC2 2 THR E 245 ? LEU E 246 ? THR D 264 LEU D 265 AC3 1 THR E 266 ? ASP E 268 ? THR D 285 ASP D 287 AC3 2 ILE E 280 ? ALA E 281 ? ILE D 299 ALA D 300 AC4 1 SER E 287 ? VAL E 288 ? SER D 306 VAL D 307 AC4 2 LYS E 293 ? ALA E 294 ? LYS D 312 ALA D 313 AC5 1 ALA F 108 ? CYS F 109 ? ALA E 127 CYS E 128 AC5 2 LEU F 12 ? PHE F 14 ? LEU E 31 PHE E 33 AC5 3 GLY F 334 ? PHE F 336 ? GLY E 353 PHE E 355 AC6 1 VAL F 170 ? ALA F 173 ? VAL E 189 ALA E 192 AC6 2 VAL F 158 ? ILE F 165 ? VAL E 177 ILE E 184 AC6 3 PHE F 176 ? ASP F 177 ? PHE E 195 ASP E 196 AC7 1 VAL F 170 ? ALA F 173 ? VAL E 189 ALA E 192 AC7 2 VAL F 158 ? ILE F 165 ? VAL E 177 ILE E 184 AC7 3 VAL F 209 ? ARG F 218 ? VAL E 228 ARG E 237 AC7 4 THR F 90 ? VAL F 99 ? THR E 109 VAL E 118 AC7 5 ALA F 23 ? GLY F 28 ? ALA E 42 GLY E 47 AC7 6 ALA F 254 ? ILE F 255 ? ALA E 273 ILE E 274 AC8 1 ARG F 45 ? GLY F 51 ? ARG E 64 GLY E 70 AC8 2 ASN F 75 ? VAL F 81 ? ASN E 94 VAL E 100 AC9 1 GLN F 229 ? GLU F 230 ? GLN E 248 GLU E 249 AC9 2 THR F 245 ? LEU F 246 ? THR E 264 LEU E 265 AD1 1 SER F 287 ? VAL F 288 ? SER E 306 VAL E 307 AD1 2 LYS F 293 ? ALA F 294 ? LYS E 312 ALA E 313 AD2 1 ALA G 108 ? CYS G 109 ? ALA F 127 CYS F 128 AD2 2 LEU G 12 ? PHE G 14 ? LEU F 31 PHE F 33 AD2 3 GLY G 334 ? PHE G 336 ? GLY F 353 PHE F 355 AD3 1 ASP G 19 ? PRO G 20 ? ASP F 38 PRO F 39 AD3 2 THR G 90 ? VAL G 99 ? THR F 109 VAL F 118 AD3 3 VAL G 209 ? ARG G 218 ? VAL F 228 ARG F 237 AD3 4 VAL G 158 ? ILE G 165 ? VAL F 177 ILE F 184 AD3 5 PHE G 176 ? ASP G 177 ? PHE F 195 ASP F 196 AD4 1 VAL G 170 ? ALA G 173 ? VAL F 189 ALA F 192 AD4 2 VAL G 158 ? ILE G 165 ? VAL F 177 ILE F 184 AD4 3 VAL G 209 ? ARG G 218 ? VAL F 228 ARG F 237 AD4 4 THR G 90 ? VAL G 99 ? THR F 109 VAL F 118 AD4 5 ALA G 23 ? GLY G 28 ? ALA F 42 GLY F 47 AD4 6 ALA G 254 ? ILE G 255 ? ALA F 273 ILE F 274 AD5 1 VAL G 44 ? GLY G 51 ? VAL F 63 GLY F 70 AD5 2 ASN G 75 ? ALA G 82 ? ASN F 94 ALA F 101 AD6 1 THR G 266 ? ASP G 268 ? THR F 285 ASP F 287 AD6 2 ILE G 280 ? ALA G 281 ? ILE F 299 ALA F 300 AD7 1 SER G 287 ? VAL G 288 ? SER F 306 VAL F 307 AD7 2 LYS G 293 ? ALA G 294 ? LYS F 312 ALA F 313 AD8 1 ALA H 108 ? CYS H 109 ? ALA G 127 CYS G 128 AD8 2 LEU H 12 ? PHE H 14 ? LEU G 31 PHE G 33 AD8 3 GLY H 334 ? PHE H 336 ? 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