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'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TFB1_YEAST P32776 ? 1 ;MSHSGAAIFEKVSGIIAINEDVSPAELTWRSTDGDKVHTVVLSTIDKLQATPASSEKMMLRLIGKVDESKKRKDNEGNEV VPKPQRHMFSFNNRTVMDNIKMTLQQIISRYKDADIYEEKRRREESAQHTETPMSSSSVTAGTPTPHLDTPQLNNGAPLI NTAKLDDSLSKEKLLTNLKLQQSLLKGNKVLMKVFQETVINAGLPPSEFWSTRIPLLRAFALSTSQKVGPYNVLSTIKPV ASSENKVNVNLSREKILNIFENYPIVKKAYTDNVPKNFKEPEFWARFFSSKLFRKLRGEKIMQNDRGDVIIDRYLTLDQE FDRKDDDMLLHPVKKIIDLDGNIQDDPVVRGNRPDFTMQPGVDINGNSDGTVDILKGMNRLSEKMIMALKNEYSRTNLQN KSNITNDEEDEDNDERNELKIDDLNESYKTNYAIIHLKRNAHEKTTDNDAKSSADSIKNADLKVSNQQMLQQLSLVMDNL INKLDLNQVVPNNEVSNKINKRVITAIKINAKQAKHNNVNSALGSFVDNTSQANELEVKSTLPIDLLESCRMLHTTCCEF LKHFYIHFQSGEQKQASTVKKLYNHLKDCIEKLNELFQDVLNGDGESMSNTCTAYLKPVLNSITLATHKYDEYFNEYNNN SN ; 1 2 UNP TFB4_YEAST Q12004 ? 2 ;MDAISDPTFKHARSRKQVTEESPSLLTVIIEIAPKLWTTFDEEGNEKGSIIKVLEALIVFLNAHLAFNSANKVAVIAAYS QGIKYLYPESTSALKASESENKTRSDLKIINSDMYRRFRNVDETLVEEIYKLFELEKKQIEQNSQRSTLAGAMSAGLTYV NRISKESVTTSLKSRLLVLTCGSGSSKDEIFQYIPIMNCIFSATKMKCPIDVVKIGGSKESTFLQQTTDATNGVYLHVES TEGLIQYLATAMFIDPSLRPIIVKPNHGSVDFRTSCYLTGRVVAVGFICSVCLCVLSIIPPGNKCPACDSQFDEHVIAKL KRKPVVPRLKAKKKVTKP ; 1 3 UNP RAD25_YEAST Q00578 ? 3 ;MTDVEGYQPKSKGKIFPDMGESFFSSDEDSPATDAEIDENYDDNRETSEGRGERDTGAMVTGLKKPRKKTKSSRHTAADS SMNQMDAKDKALLQDTNSDIPADFVPDSVSGMFRSHDFSYLRLRPDHASRPLWISPSDGRIILESFSPLAEQAQDFLVTI AEPISRPSHIHEYKITAYSLYAAVSVGLETDDIISVLDRLSKVPVAESIINFIKGATISYGKVKLVIKHNRYFVETTQAD ILQMLLNDSVIGPLRIDSDHQVQPPEDVLQQQLQQTAGKPATNVNPNDVEAVFSAVIGGDNEREEEDDDIDAVHSFEIAN ESVEVVKKRCQEIDYPVLEEYDFRNDHRNPDLDIDLKPSTQIRPYQEKSLSKMFGNGRARSGIIVLPCGAGKTLVGITAA CTIKKSVIVLCTSSVSVMQWRQQFLQWCTLQPENCAVFTSDNKEMFQTESGLVVSTYSMVANTRNRSHDSQKVMDFLTGR EWGFIILDEVHVVPAAMFRRVVSTIAAHAKLGLTATLVREDDKIGDLNFLIGPKLYEANWMELSQKGHIANVQCAEVWCP MTAEFYQEYLRETARKRMLLYIMNPTKFQACQFLIQYHERRGDKIIVFSDNVYALQEYALKMGKPFIYGSTPQQERMNIL QNFQYNDQINTIFLSKVGDTSIDLPEATCLIQISSHYGSRRQEAQRLGRILRAKRRNDEGFNAFFYSLVSKDTQEMYYST KRQAFLVDQGYAFKVITHLHGMENIPNLAYASPRERRELLQEVLLKNEEAAGIEVGDDADNSVGRGSNGHKRFKSKAVRG EGSLSGLAGGEDMAYMEYSTNKNKELKEHHPLIRKMYYKNLKK ; 1 4 UNP TFB5_YEAST Q3E7C1 ? 4 MARARKGALVQCDPSIKALILQIDAKMSDIVLEELDDTHLLVNPSKVEFVKHELNRLLSKNIYNPMDEEENQ 1 5 UNP TFB2_YEAST Q02939 ? 5 ;MSDYSLKHSVTQYLEEIPQQVQNRLYTSPATCLAIYRILPPLAKFFIMAMVFNENEVPLLDLDKWVNSNGKLQFQNAIKS MKSLHLLIPNKSSGTLMINLNPTFKISLRNALTGGEVQNSFGVVVEENVVSLDLLDEYSANKWETILHFMVGTPLAKIPS EKVLNLLKHSKLMEEVNSTGEFKITNEGFQFLLQEINSQLWTLLLQYLKMIETSKMDLVDVLHFIFMLGALEVGKAYKID ALSETQRIMLQDMRDYGLVFQKHSNDSIFYPTKLALMLTSDTKTIRSASNAMDSVLRQNREEPSVNEDGANGKSTTDITT SDDLNKAGLKNQDIPDGSLIVETNFKIYSYSNSPLQIAVLSLFVHLKARFVNMVLGQITRESIRRALTNGITADQIIAYL ETHAHPQMRRLAEEKLEKKLELDPNCKEPLQVLPPTVVDQIRLWQLELDRVITYEGSLYSDFETSQEYNLLSKYAQDIGV LLWKDDKKKKFFISKEGNSQVLDFAKRKLKKKQ ; 1 6 UNP RAD3_YEAST P06839 ? 6 ;MKFYIDDLPVLFPYPKIYPEQYNYMCDIKKTLDVGGNSILEMPSGTGKTVSLLSLTIAYQMHYPEHRKIIYCSRTMSEIE KALVELENLMDYRTKELGYQEDFRGLGLTSRKNLCLHPEVSKERKGTVVDEKCRRMTNGQAKRKLEEDPEANVELCEYHE NLYNIEVEDYLPKGVFSFEKLLKYCEEKTLCPYFIVRRMISLCNIIIYSYHYLLDPKIAERVSNEVSKDSIVIFDEAHNI DNVCIESLSLDLTTDALRRATRGANALDERISEVRKVDSQKLQDEYEKLVQGLHSADILTDQEEPFVETPVLPQDLLTEA IPGNIRRAEHFVSFLKRLIEYLKTRMKVLHVISETPKSFLQHLKQLTFIERKPLRFCSERLSLLVRTLEVTEVEDFTALK DIATFATLISTYEEGFLLIIEPYEIENAAVPNPIMRFTCLDASIAIKPVFERFSSVIITSGTISPLDMYPRMLNFKTVLQ KSYAMTLAKKSFLPMIITKGSDQVAISSRFEIRNDPSIVRNYGSMLVEFAKITPDGMVVFFPSYLYMESIVSMWQTMGIL DEVWKHKLILVETPDAQETSLALETYRKACSNGRGAILLSVARGKVSEGIDFDHQYGRTVLMIGIPFQYTESRILKARLE FMRENYRIRENDFLSFDAMRHAAQCLGRVLRGKDDYGVMVLADRRFSRKRSQLPKWIAQGLSDADLNLSTDMAISNTKQF LRTMAQPTDPKDQEGVSVWSYEDLIKHQNSRKDQGGFIENENKEGEQDEDEDEDIEMQ ; 1 7 UNP SSL1_YEAST Q04673 ? 7 ;MAPVVISESEEDEDRVAITRRTKRQVHFDGEGDDRVDQQQQQHSSSHRDRDKHVQRKKKKRLSNRNLQGSNGGYAWEDEI KRSWDLVKVDDEGDMASLVASIVEARKKRTAKKNITPYQRGIIRSLILTLDCSEAMLEKDLRPNRHAMIIQYAIDFVHEF FDQNPISQMGIIIMRNGLAQLVSQVSGNPQDHIDALKSIRKQEPKGNPSLQNALEMARGLLLPVPAHCTREVLIVFGSLS TTDPGDIHQTIDSLVSEKIRVKVLGLSAQVAICKELCKATNYGDESFYKILLDETHLKELFNEAVTPLPVNKINKGFTLV KMGFPTRIFEDTPTFCSCHSKLVYGGYFCPNCHSKVCSLPTVCPCCDLMLILSTHLARSYHHLMPLKTFAEVPTTEKFRS EDCFSCQSRFPILKNHKNGKLLTSSRYRCEDCKQEFCVDCDVFIHEILHNCPGCESKPVIT ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7K01 1 1 ? 642 ? 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'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7K01 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7K01 _struct.title 'Structure of TFIIH in TFIIH/Rad4-Rad23-Rad33 DNA opening complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7K01 _struct_keywords.text 'TFIIH, Rad4, Rad4/23, XPC, NER, Nucleotide Excision Repair, GG-NER, NUCLEAR PROTEIN, NUCLEAR PROTEIN-Transferase complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN/Transferase' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? 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LEU 2 135 GLY 2 152 1 ? 18 HELX_P HELX_P62 AG8 SER E 160 ? SER E 170 ? SER 2 160 SER 2 170 1 ? 11 HELX_P HELX_P63 AG9 THR E 185 ? GLN E 194 ? THR 2 185 GLN 2 194 1 ? 10 HELX_P HELX_P64 AH1 ILE E 196 ? ILE E 211 ? ILE 2 196 ILE 2 211 1 ? 16 HELX_P HELX_P65 AH2 ASP E 217 ? LEU E 231 ? ASP 2 217 LEU 2 231 1 ? 15 HELX_P HELX_P66 AH3 SER E 243 ? TYR E 256 ? SER 2 243 TYR 2 256 1 ? 14 HELX_P HELX_P67 AH4 THR E 272 ? SER E 280 ? THR 2 272 SER 2 280 1 ? 9 HELX_P HELX_P68 AH5 SER E 353 ? LEU E 362 ? SER 2 353 LEU 2 362 1 ? 10 HELX_P HELX_P69 AH6 THR E 379 ? ASN E 389 ? THR 2 379 ASN 2 389 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 AH7 ASP E 394 ? HIS E 403 ? ASP 2 394 HIS 2 403 1 ? 10 HELX_P HELX_P71 AH8 ALA E 404 ? GLN E 407 ? ALA 2 404 GLN 2 407 5 ? 4 HELX_P HELX_P72 AH9 MET E 408 ? GLU E 417 ? MET 2 408 GLU 2 417 1 ? 10 HELX_P HELX_P73 AI1 PRO E 434 ? LEU E 448 ? PRO 2 434 LEU 2 448 1 ? 15 HELX_P HELX_P74 AI2 THR E 464 ? GLY E 479 ? THR 2 464 GLY 2 479 1 ? 16 HELX_P HELX_P75 AI3 LYS E 495 ? ARG E 507 ? 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CYS 6 451 SER 6 456 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? 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G ALA 100 722 1 Y 1 6 SER 101 ? G SER 101 723 1 Y 1 6 ILE 102 ? G ILE 102 724 1 Y 1 6 VAL 103 ? G VAL 103 725 1 Y 1 6 GLU 104 ? G GLU 104 726 1 Y 1 6 ALA 105 ? G ALA 105 727 1 Y 1 6 ARG 106 ? G ARG 106 728 1 Y 1 6 PRO 458 ? G PRO 458 729 1 Y 1 6 VAL 459 ? G VAL 459 730 1 Y 1 6 ILE 460 ? G ILE 460 731 1 Y 1 6 THR 461 ? G THR 461 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM ? HEPES 1 2 150 mM ? 'Potassium Acetate' 1 3 5 mM ? 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