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_citation.pdbx_database_id_PubMed 33513362 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kumar, N.' 1 ? primary 'Arthur, C.P.' 2 ? primary 'Ciferri, C.' 3 ? primary 'Matsumoto, M.L.' 4 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7K0C _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? 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;KSPIFGPEEVNSVEGNSVSITCYYPPTSVNRHTRKYWCRQGARGGCITLISSEGYVSSKYAGRANLTNFPENGTFVVNIA QLSQDDSGRYKCGLGINSRGLSFDVSLEVSQGPGLLNDTKVYTVDLGRTVTINCPFKTENAQKRKSLYKQIGLYPVLVID SSGYVNPNYTGRIRLDIQGTGQLLFSVVINQLRLSDAGQYLCQAGDDSNSNKKNADLQVLKPEPELVYEDLRGSVTFHCA LGPEVANVAKFLCRQSSGENCDVVVNTLGKRAPAFEGRILLNPQDKDGSFSVVITGLRKEDAGRYLCGAHSDGQLQEGSP IQAWQLFVNEESTIPRSPTVVKGVAGGSVAVLCPYNRKESKSIKYWCLWEGAQNGRCPLLVDSEGWVKAQYEGRLSLLEE PGNGTFTVILNQLTSRDAGFYWCLTNGDTLWRTTVEIKIIEGEPNLKVPGNVTAVLGETLKVPCHFPCKFSSYEKYWCKW NNTGCQALPSQDEGPSKAFVNCDENSRLVSLTLNLVTRADEGWYWCGVKQGHFYGETAAVYVAVEERKAAGSRDVSLAKA DAAPDEKVLDSGFREIENKAIQDPRHHHHHH ; C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;DYKDDDDKLEVLFQGPGSLPVIAELPPKVSVFVPPRDGFFGNPRKSKLICQATGFSPRQIQVSWLREGKQVGSGVTTDQV QAEAKESGPTTYKVTSTLTIKESDWLGQSMFTCRVDHRGLTFQQNASSMCVPDQDTAIRVFAIPPSFASIFLTKSTKLTC LVTDLTTYDSVTISWTRQNGEAVKTHTNISESHPNATFSAVGEASICEDDWNSGERFTCTVTHTDLPSPLKQTISRPKGV ALHRPDVYLLPPAREQLNLRESATITCLVTGFSPADVFVQWMQRGQPLSPEKYVTSAPMPEPQAPGRYFAHSILTVSEEE 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'Chinese hamster' 'Cricetulus griseus' 10029 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PIGR_HUMAN P01833 ? 1 ;KSPIFGPEEVNSVEGNSVSITCYYPPTSVNRHTRKYWCRQGARGGCITLISSEGYVSSKYAGRANLTNFPENGTFVVNIA QLSQDDSGRYKCGLGINSRGLSFDVSLEVSQGPGLLNDTKVYTVDLGRTVTINCPFKTENAQKRKSLYKQIGLYPVLVID SSGYVNPNYTGRIRLDIQGTGQLLFSVVINQLRLSDAGQYLCQAGDDSNSNKKNADLQVLKPEPELVYEDLRGSVTFHCA LGPEVANVAKFLCRQSSGENCDVVVNTLGKRAPAFEGRILLNPQDKDGSFSVVITGLRKEDAGRYLCGAHSDGQLQEGSP IQAWQLFVNEESTIPRSPTVVKGVAGGSVAVLCPYNRKESKSIKYWCLWEGAQNGRCPLLVDSEGWVKAQYEGRLSLLEE PGNGTFTVILNQLTSRDAGFYWCLTNGDTLWRTTVEIKIIEGEPNLKVPGNVTAVLGETLKVPCHFPCKFSSYEKYWCKW NNTGCQALPSQDEGPSKAFVNCDENSRLVSLTLNLVTRADEGWYWCGVKQGHFYGETAAVYVAVEERKAAGSRDVSLAKA DAAPDEKVLDSGFREIENKAIQDPR ; 19 2 UNP IGHM_HUMAN P01871 ? 2 ;LPVIAELPPKVSVFVPPRDGFFGNPRKSKLICQATGFSPRQIQVSWLREGKQVGSGVTTDQVQAEAKESGPTTYKVTSTL TIKESDWLGQSMFTCRVDHRGLTFQQNASSMCVPDQDTAIRVFAIPPSFASIFLTKSTKLTCLVTDLTTYDSVTISWTRQ NGEAVKTHTNISESHPNATFSAVGEASICEDDWNSGERFTCTVTHTDLPSPLKQTISRPKGVALHRPDVYLLPPAREQLN LRESATITCLVTGFSPADVFVQWMQRGQPLSPEKYVTSAPMPEPQAPGRYFAHSILTVSEEEWNTGETYTCVVAHEALPN RVTERTVDKSTGKPTLYNVSLVMSDTAGTCY ; 103 3 UNP IGJ_HUMAN P01591 ? 3 ;QEDERIVLVDNKCKCARITSRIIRSSEDPNEDIVERNIRIIVPLNNRENISDPTSPLRTRFVYHLSDLCKKCDPTEVELD NQIVTATQSNICDEDSATETCYTYDRNKCYTAVVPLVYGGETKMVETALTPDACYPD ; 23 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7K0C C 1 ? 585 ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7K0C _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7K0C _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 23090 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.972 ? 31571 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.420 ? 3126 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.055 ? 3683 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 4056 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7K0C _struct.title 'Structure of Secretory IgM Core' _struct.pdbx_descriptor 'Polymeric immunoglobulin receptor, Immunoglobulin heavy constant mu, Immunoglobulin J chain' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7K0C _struct_keywords.text 'Immunoglobulin M, IMMUNE SYSTEM' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 3 ? K N N 2 ? L N N 2 ? 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A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 92 SG ? ? C CYS 22 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 38 SG ? ? ? 1_555 A CYS 46 SG ? ? C CYS 38 C CYS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 134 SG ? ? ? 1_555 A CYS 202 SG ? ? C CYS 134 C CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 239 SG ? ? ? 1_555 A CYS 307 SG ? ? C CYS 239 C CYS 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 253 SG ? ? ? 1_555 A CYS 261 SG ? ? C CYS 253 C CYS 261 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? A CYS 464 SG ? ? ? 1_555 A CYS 526 SG ? ? C CYS 464 C CYS 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf7 disulf ? ? A CYS 468 SG ? ? ? 1_555 L CYS 207 SG ? ? C CYS 468 F CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf8 disulf ? ? A CYS 478 SG ? ? ? 1_555 A CYS 485 SG ? ? C CYS 478 C CYS 485 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf9 disulf ? ? B CYS 160 SG ? ? ? 1_555 B CYS 219 SG ? ? A CYS 367 A CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf10 disulf ? ? B CYS 267 SG ? ? ? 1_555 B CYS 329 SG ? ? A CYS 474 A CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 160 SG ? ? ? 1_555 C CYS 219 SG ? ? B CYS 367 B CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 207 SG ? ? ? 1_555 D CYS 207 SG ? ? B CYS 414 K CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 267 SG ? ? ? 1_555 C CYS 329 SG ? ? B CYS 474 B CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 160 SG ? ? ? 1_555 D CYS 219 SG ? ? K CYS 367 K CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 267 SG ? ? ? 1_555 D CYS 329 SG ? ? K CYS 474 K CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 160 SG ? ? ? 1_555 E CYS 219 SG ? ? L CYS 367 L CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 207 SG ? ? ? 1_555 F CYS 207 SG ? ? L CYS 414 I CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 267 SG ? ? ? 1_555 E CYS 329 SG ? ? L CYS 474 L CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf19 disulf ? ? F CYS 160 SG ? ? ? 1_555 F CYS 219 SG ? ? I CYS 367 I CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf20 disulf ? ? F CYS 267 SG ? ? ? 1_555 F CYS 329 SG ? ? I CYS 474 I CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf21 disulf ? ? G CYS 160 SG ? ? ? 1_555 G CYS 219 SG ? ? J CYS 367 J CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf22 disulf ? ? G CYS 207 SG ? ? ? 1_555 H CYS 207 SG ? ? J CYS 414 E CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf23 disulf ? ? G CYS 267 SG ? ? ? 1_555 G CYS 329 SG ? ? J CYS 474 J CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf24 disulf ? ? H CYS 160 SG ? ? ? 1_555 H CYS 219 SG ? ? E CYS 367 E CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf25 disulf ? ? H CYS 267 SG ? ? ? 1_555 H CYS 329 SG ? ? E CYS 474 E CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf26 disulf ? ? I CYS 160 SG ? ? ? 1_555 I CYS 219 SG ? ? H CYS 367 H CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf27 disulf ? ? I CYS 207 SG ? ? ? 1_555 K CYS 207 SG ? ? H CYS 414 G CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf28 disulf ? ? I CYS 267 SG ? ? ? 1_555 I CYS 329 SG ? ? H CYS 474 H CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf29 disulf ? ? I CYS 368 SG ? ? ? 1_555 K CYS 368 SG ? ? H CYS 575 G CYS 575 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf30 disulf ? ? J CYS 13 SG ? ? ? 1_555 J CYS 101 SG ? ? D CYS 13 D CYS 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf31 disulf ? ? J CYS 15 SG ? ? ? 1_555 L CYS 368 SG ? ? D CYS 15 F CYS 575 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? ? disulf32 disulf ? ? J CYS 109 SG ? ? ? 1_555 J CYS 134 SG ? ? D CYS 109 D CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf33 disulf ? ? K CYS 160 SG ? ? ? 1_555 K CYS 219 SG ? ? G CYS 367 G CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf34 disulf ? ? K CYS 267 SG ? ? ? 1_555 K CYS 329 SG ? ? G CYS 474 G CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? disulf35 disulf ? ? L CYS 160 SG ? ? ? 1_555 L CYS 219 SG ? ? F CYS 367 F CYS 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf36 disulf ? ? L CYS 267 SG ? ? ? 1_555 L CYS 329 SG ? ? F CYS 474 F CYS 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? covale1 covale one ? J ASN 49 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? D ASN 49 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale2 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 273 B . ? SER 480 A PRO 274 B ? PRO 481 A 1 -9.12 2 SER 273 C . ? SER 480 B PRO 274 C ? PRO 481 B 1 -1.19 3 SER 273 D . ? SER 480 K PRO 274 D ? PRO 481 K 1 6.53 4 SER 273 E . ? SER 480 L PRO 274 E ? PRO 481 L 1 -3.12 5 SER 273 F . ? SER 480 I PRO 274 F ? PRO 481 I 1 2.41 6 SER 273 G . ? SER 480 J PRO 274 G ? PRO 481 J 1 -3.67 7 SER 273 H . ? SER 480 E PRO 274 H ? PRO 481 E 1 -10.13 8 SER 273 I . ? SER 480 H PRO 274 I ? PRO 481 H 1 -3.93 9 SER 273 K . ? SER 480 G PRO 274 K ? PRO 481 G 1 -8.07 10 SER 273 L . ? SER 480 F PRO 274 L ? PRO 481 F 1 -4.56 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 3 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 3 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 3 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 3 ? AF8 ? 3 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 3 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 2 ? AG5 ? 2 ? AG6 ? 2 ? AG7 ? 2 ? AG8 ? 4 ? AG9 ? 4 ? AH1 ? 2 ? AH2 ? 3 ? AH3 ? 3 ? AH4 ? 4 ? AH5 ? 2 ? AH6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB8 1 2 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? parallel AE8 2 3 ? parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? parallel AG3 1 2 ? parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG8 3 4 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH3 2 3 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH4 3 4 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH6 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU A 9 ? VAL A 13 ? GLU C 9 VAL C 13 AA1 2 SER A 102 ? SER A 110 ? SER C 102 SER C 110 AA1 3 GLY A 88 ? LEU A 94 ? GLY C 88 LEU C 94 AA1 4 LYS A 35 ? ARG A 39 ? LYS C 35 ARG C 39 AA1 5 ILE A 47 ? SER A 51 ? ILE C 47 SER C 51 AA2 1 SER A 17 ? TYR A 23 ? SER C 17 TYR C 23 AA2 2 THR A 74 ? ALA A 80 ? THR C 74 ALA C 80 AA2 3 ALA A 64 ? PHE A 69 ? ALA C 64 PHE C 69 AA3 1 THR A 123 ? ASP A 125 ? THR C 123 ASP C 125 AA3 2 ASN A 214 ? LEU A 220 ? ASN C 214 LEU C 220 AA3 3 GLY A 198 ? LEU A 201 ? GLY C 198 LEU C 201 AA4 1 VAL A 130 ? PRO A 135 ? VAL C 130 PRO C 135 AA4 2 LEU A 184 ? ILE A 189 ? LEU C 184 ILE C 189 AA4 3 ILE A 173 ? ASP A 176 ? ILE C 173 ASP C 176 AA5 1 LEU A 147 ? ILE A 151 ? LEU C 147 ILE C 151 AA5 2 TYR A 154 ? ILE A 159 ? TYR C 154 ILE C 159 AA6 1 LEU A 226 ? GLU A 229 ? LEU C 226 GLU C 229 AA6 2 ALA A 323 ? VAL A 328 ? ALA C 323 VAL C 328 AA6 3 GLY A 303 ? GLY A 308 ? GLY C 303 GLY C 308 AA6 4 PHE A 251 ? ARG A 254 ? PHE C 251 ARG C 254 AA6 5 ASP A 262 ? ASN A 266 ? ASP C 262 ASN C 266 AA7 1 SER A 234 ? CYS A 239 ? SER C 234 CYS C 239 AA7 2 PHE A 290 ? THR A 295 ? PHE C 290 THR C 295 AA7 3 ILE A 279 ? LEU A 281 ? ILE C 279 LEU C 281 AA8 1 VAL A 340 ? VAL A 344 ? VAL C 340 VAL C 344 AA8 2 THR A 434 ? ILE A 440 ? THR C 434 ILE C 440 AA8 3 GLY A 419 ? LEU A 424 ? GLY C 419 LEU C 424 AA8 4 TYR A 365 ? LEU A 368 ? TYR C 365 LEU C 368 AA8 5 LEU A 379 ? ASP A 382 ? LEU C 379 ASP C 382 AA9 1 VAL A 349 ? PRO A 354 ? VAL C 349 PRO C 354 AA9 2 THR A 405 ? LEU A 410 ? THR C 405 LEU C 410 AA9 3 LEU A 395 ? LEU A 398 ? LEU C 395 LEU C 398 AB1 1 LEU A 460 ? VAL A 462 ? LEU C 460 VAL C 462 AB1 2 LEU A 511 ? LEU A 513 ? LEU C 511 LEU C 513 AB2 1 GLU A 474 ? LYS A 479 ? GLU C 474 LYS C 479 AB2 2 GLY A 522 ? GLN A 530 ? GLY C 522 GLN C 530 AB2 3 PHE A 533 ? VAL A 542 ? PHE C 533 VAL C 542 AB3 1 ARG B 139 ? ILE B 143 ? ARG A 346 ILE A 350 AB3 2 THR B 159 ? LEU B 165 ? THR A 366 LEU A 372 AB3 3 PHE B 198 ? GLY B 202 ? PHE A 405 GLY A 409 AB4 1 THR B 172 ? THR B 176 ? 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CTFFIND 4 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cisTEM ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cisTEM ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.2 _em_specimen.details 'Sample was monodisperse.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 4 NAG 1 M NAG 1 D NAG 202 n M 4 NAG 2 M NAG 2 D NAG 203 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #