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'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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ASP H5 57 LYS H5 60 5 ? 4 HELX_P HELX_P49 AF4 GLY O 33 ? LEU O 39 ? GLY F5 33 LEU F5 39 5 ? 7 HELX_P HELX_P50 AF5 GLU O 91 ? LEU O 95 ? GLU F5 91 LEU F5 95 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 SER O 132 ? ASP O 137 ? SER F5 132 ASP F5 137 5 ? 6 HELX_P HELX_P52 AF7 THR O 192 ? THR O 197 ? THR F5 192 THR F5 197 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 VAL O 202 ? VAL O 207 ? VAL F5 202 VAL F5 207 5 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 PRO O 320 ? ALA O 322 ? PRO F5 320 ALA F5 322 5 ? 3 HELX_P HELX_P55 AG1 SER O 323 ? LEU O 333 ? SER F5 323 LEU F5 333 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 23 SG ? ? ? 1_555 A CYS 88 SG ? ? L1 CYS 23 L1 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 18 SG ? ? ? 1_555 B CYS 91 SG ? ? H1 CYS 18 H1 CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 19 SG ? ? ? 1_555 F CYS 114 SG ? ? F1 CYS 19 F2 CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 114 SG ? ? ? 1_555 O CYS 19 SG ? ? F1 CYS 114 F5 CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf5 disulf ? ? D CYS 23 SG ? ? ? 1_555 D CYS 88 SG ? ? L2 CYS 23 L2 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf6 disulf ? ? E CYS 18 SG ? ? ? 1_555 E CYS 91 SG ? ? H2 CYS 18 H2 CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf7 disulf ? ? F CYS 19 SG ? ? ? 1_555 I CYS 114 SG ? ? F2 CYS 19 F3 CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? disulf8 disulf ? ? G CYS 23 SG ? ? ? 1_555 G CYS 88 SG ? ? L3 CYS 23 L3 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf9 disulf ? ? H CYS 18 SG ? ? ? 1_555 H CYS 91 SG ? ? H3 CYS 18 H3 CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf10 disulf ? ? I CYS 19 SG ? ? ? 1_555 L CYS 114 SG ? ? F3 CYS 19 F4 CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.070 ? ? disulf11 disulf ? ? J CYS 23 SG ? ? ? 1_555 J CYS 88 SG ? ? L4 CYS 23 L4 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? K CYS 18 SG ? ? ? 1_555 K CYS 91 SG ? ? H4 CYS 18 H4 CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf13 disulf ? ? L CYS 19 SG ? ? ? 1_555 O CYS 114 SG ? ? F4 CYS 19 F5 CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? ? disulf14 disulf ? ? M CYS 23 SG ? ? ? 1_555 M CYS 88 SG ? ? L5 CYS 23 L5 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? N CYS 18 SG ? ? ? 1_555 N CYS 91 SG ? ? H5 CYS 18 H5 CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 94 A . ? PHE 94 L1 PRO 95 A ? PRO 95 L1 1 6.20 2 PHE 94 D . ? PHE 94 L2 PRO 95 D ? PRO 95 L2 1 6.21 3 PHE 94 G . ? PHE 94 L3 PRO 95 G ? PRO 95 L3 1 6.25 4 PHE 94 J . ? PHE 94 L4 PRO 95 J ? PRO 95 L4 1 6.22 5 PHE 94 M . ? PHE 94 L5 PRO 95 M ? PRO 95 L5 1 6.16 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 5 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 3 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE6 4 5 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 MET A 4 ? 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GLY F1 277 VAL F1 290 AA6 3 HIS C 297 ? GLY C 301 ? HIS F1 297 GLY F1 301 AA7 1 SER C 99 ? GLN C 104 ? SER F1 99 GLN F1 104 AA7 2 GLY C 277 ? VAL C 290 ? GLY F1 277 VAL F1 290 AA7 3 GLN C 161 ? GLY C 168 ? GLN F1 161 GLY F1 168 AA7 4 THR C 237 ? THR C 244 ? THR F1 237 THR F1 244 AA7 5 VAL O 252 ? THR O 256 ? VAL F5 252 THR F5 256 AA8 1 PRO C 144 ? ASP C 146 ? PRO F1 144 ASP F1 146 AA8 2 LYS C 151 ? SER C 154 ? LYS F1 151 SER F1 154 AA9 1 LYS C 213 ? LYS C 215 ? LYS F1 213 LYS F1 215 AA9 2 ASP C 173 ? GLY C 176 ? ASP F1 173 GLY F1 176 AA9 3 TRP C 227 ? PRO C 229 ? TRP F1 227 PRO F1 229 AB1 1 VAL C 252 ? THR C 256 ? VAL F1 252 THR F1 256 AB1 2 THR F 237 ? THR F 244 ? THR F2 237 THR F2 244 AB1 3 GLN F 161 ? GLY F 168 ? GLN F2 161 GLY F2 168 AB1 4 GLY F 277 ? VAL F 290 ? GLY F2 277 VAL F2 290 AB1 5 SER F 99 ? GLN F 104 ? SER F2 99 GLN F2 104 AB2 1 VAL C 252 ? THR C 256 ? VAL F1 252 THR F1 256 AB2 2 THR F 237 ? THR F 244 ? THR F2 237 THR F2 244 AB2 3 GLN F 161 ? GLY F 168 ? GLN F2 161 GLY F2 168 AB2 4 GLY F 277 ? VAL F 290 ? GLY F2 277 VAL F2 290 AB2 5 HIS F 297 ? GLY F 301 ? HIS F2 297 GLY F2 301 AB3 1 MET D 4 ? GLN D 6 ? MET L2 4 GLN L2 6 AB3 2 VAL D 19 ? VAL D 29 ? VAL L2 19 VAL L2 29 AB3 3 PHE D 62 ? ILE D 75 ? PHE L2 62 ILE L2 75 AB4 1 ASN D 53 ? ARG D 54 ? ASN L2 53 ARG L2 54 AB4 2 LYS D 45 ? TYR D 49 ? LYS L2 45 TYR L2 49 AB4 3 VAL D 33 ? GLN D 38 ? VAL L2 33 GLN L2 38 AB4 4 VAL D 85 ? GLN D 90 ? VAL L2 85 GLN L2 90 AB5 1 CYS E 18 ? SER E 19 ? CYS H2 18 SER H2 19 AB5 2 THR E 73 ? ARG E 77 ? THR H2 73 ARG H2 77 AB5 3 THR E 64 ? ASP E 68 ? THR H2 64 ASP H2 68 AB6 1 THR E 53 ? TYR E 55 ? THR H2 53 TYR H2 55 AB6 2 GLY E 40 ? ILE E 47 ? GLY H2 40 ILE H2 47 AB6 3 MET E 30 ? VAL E 36 ? MET H2 30 VAL H2 36 AB6 4 ILE E 88 ? ARG E 93 ? ILE H2 88 ARG H2 93 AB6 5 TYR E 107 ? TRP E 108 ? TYR H2 107 TRP H2 108 AB7 1 VAL F 46 ? LEU F 53 ? VAL F2 46 LEU F2 53 AB7 2 ARG F 304 ? VAL F 315 ? ARG F2 304 VAL F2 315 AB7 3 LEU F 117 ? VAL F 129 ? LEU F2 117 VAL F2 129 AB7 4 THR F 261 ? VAL F 262 ? THR F2 261 VAL F2 262 AB8 1 PRO F 144 ? ASP F 146 ? PRO F2 144 ASP F2 146 AB8 2 LYS F 151 ? SER F 154 ? LYS F2 151 SER F2 154 AB9 1 LYS F 213 ? LYS F 215 ? LYS F2 213 LYS F2 215 AB9 2 ASP F 173 ? GLY F 176 ? ASP F2 173 GLY F2 176 AB9 3 TRP F 227 ? PRO F 229 ? TRP F2 227 PRO F2 229 AC1 1 VAL F 252 ? THR F 256 ? VAL F2 252 THR F2 256 AC1 2 THR I 237 ? THR I 244 ? THR F3 237 THR F3 244 AC1 3 GLN I 161 ? GLY I 168 ? GLN F3 161 GLY F3 168 AC1 4 GLY I 277 ? VAL I 290 ? GLY F3 277 VAL F3 290 AC1 5 SER I 99 ? GLN I 104 ? SER F3 99 GLN F3 104 AC2 1 VAL F 252 ? THR F 256 ? VAL F2 252 THR F2 256 AC2 2 THR I 237 ? THR I 244 ? THR F3 237 THR F3 244 AC2 3 GLN I 161 ? GLY I 168 ? GLN F3 161 GLY F3 168 AC2 4 GLY I 277 ? VAL I 290 ? GLY F3 277 VAL F3 290 AC2 5 HIS I 297 ? GLY I 301 ? HIS F3 297 GLY F3 301 AC3 1 MET G 4 ? GLN G 6 ? MET L3 4 GLN L3 6 AC3 2 VAL G 19 ? VAL G 29 ? VAL L3 19 VAL L3 29 AC3 3 PHE G 62 ? ILE G 75 ? 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RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 2.8 _em_specimen.details 'MuPyV (2.8 mg/mL) was incubated with 8A7H5 Fab (1.1 mg/mL) for 30 m at room temperature' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _em_virus_shell.id 1 _em_virus_shell.entity_assembly_id 1 _em_virus_shell.diameter 450 _em_virus_shell.name ? _em_virus_shell.triangulation 7 # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' R01NS088367 1 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' R01NS092662 2 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' R01AI107121 3 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' F32NS106730 4 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' F31NS083336 5 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' T32CA060395 6 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #