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C1 ? ? R BMA 3 R MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 25 C . ? SER 7 J PRO 26 C ? PRO 8 J 1 -7.19 2 TRP 112 C . ? TRP 94 J PRO 113 C ? PRO 95 J 1 -4.97 3 SER 25 G . ? SER 7 K PRO 26 G ? PRO 8 K 1 -7.24 4 TRP 112 G . ? TRP 94 K PRO 113 G ? PRO 95 K 1 -4.69 5 SER 25 K . ? SER 7 L PRO 26 K ? PRO 8 L 1 -7.30 6 TRP 112 K . ? TRP 94 L PRO 113 K ? PRO 95 L 1 -4.80 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 17 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 17 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 17 ? AC5 ? 7 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? parallel AA1 7 8 ? parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA1 9 10 ? anti-parallel AA1 10 11 ? parallel AA1 11 12 ? anti-parallel AA1 12 13 ? anti-parallel AA1 13 14 ? anti-parallel AA1 14 15 ? anti-parallel AA1 15 16 ? anti-parallel AA1 16 17 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB3 6 7 ? parallel AB3 7 8 ? parallel AB3 8 9 ? anti-parallel AB3 9 10 ? anti-parallel AB3 10 11 ? parallel AB3 11 12 ? anti-parallel AB3 12 13 ? anti-parallel AB3 13 14 ? anti-parallel AB3 14 15 ? anti-parallel AB3 15 16 ? anti-parallel AB3 16 17 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC4 6 7 ? parallel AC4 7 8 ? parallel AC4 8 9 ? anti-parallel AC4 9 10 ? anti-parallel AC4 10 11 ? parallel AC4 11 12 ? anti-parallel AC4 12 13 ? anti-parallel AC4 13 14 ? anti-parallel AC4 14 15 ? anti-parallel AC4 15 16 ? anti-parallel AC4 16 17 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC5 6 7 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR D 42 ? 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The Fab ADI-15878 was added to increase complex size and assist in angular sampling but was not build in the associated model. ; 'Complex of Bundibugyo virus GP (mucin deleted) bound to the antibody Fab BDBV-43 and ADI-15878' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2, 3, 4' ? ? 2 1 ? 'Bundibugyo virus GP (mucin deleted)' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 4' ? ? 3 1 ? 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L ASP 143 1311 1 Y 1 F ASP 645 ? L ASP 144 1312 1 Y 1 F ASP 646 ? L ASP 145 1313 1 Y 1 F ASP 647 ? L ASP 146 1314 1 Y 1 F LYS 648 ? L LYS 147 1315 1 Y 1 F ALA 649 ? L ALA 148 1316 1 Y 1 F GLY 650 ? L GLY 149 1317 1 Y 1 F TRP 651 ? L TRP 150 1318 1 Y 1 F SER 652 ? L SER 151 1319 1 Y 1 F HIS 653 ? L HIS 152 1320 1 Y 1 F PRO 654 ? L PRO 153 1321 1 Y 1 F GLN 655 ? L GLN 154 1322 1 Y 1 F PHE 656 ? L PHE 155 1323 1 Y 1 F GLU 657 ? L GLU 156 1324 1 Y 1 F LYS 658 ? L LYS 157 1325 1 Y 1 F GLY 659 ? L GLY 158 1326 1 Y 1 F GLY 660 ? L GLY 159 1327 1 Y 1 F GLY 661 ? L GLY 160 1328 1 Y 1 F SER 662 ? L SER 161 1329 1 Y 1 F GLY 663 ? L GLY 162 1330 1 Y 1 F GLY 664 ? L GLY 163 1331 1 Y 1 F GLY 665 ? L GLY 164 1332 1 Y 1 F SER 666 ? L SER 165 1333 1 Y 1 F GLY 667 ? L GLY 166 1334 1 Y 1 F GLY 668 ? L GLY 167 1335 1 Y 1 F GLY 669 ? L GLY 168 1336 1 Y 1 F SER 670 ? L SER 169 1337 1 Y 1 F TRP 671 ? L TRP 170 1338 1 Y 1 F SER 672 ? L SER 171 1339 1 Y 1 F HIS 673 ? L HIS 172 1340 1 Y 1 F PRO 674 ? L PRO 173 1341 1 Y 1 F GLN 675 ? L GLN 174 1342 1 Y 1 F PHE 676 ? L PHE 175 1343 1 Y 1 F GLU 677 ? L GLU 176 1344 1 Y 1 F LYS 678 ? L LYS 177 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 1 ? ? 565995 ? ? 'Bundibugyo ebolavirus' ? ? 2 1 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 3 2 ? ? 565995 ? ? 'Bundibugyo ebolavirus' ? ? 4 3 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain ? 1 1 9606 'Homo sapiens' ? ? ? 2 2 9606 'Homo sapiens' ? ? ? 3 3 9606 'Homo sapiens' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 60 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'U19 AI109762' 1 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'U19 AI142785' 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 5 NAG 1 M NAG 1 B NAG 1257 n M 5 NAG 2 M NAG 2 B NAG 1258 n N 5 NAG 1 N NAG 1 M NAG 1 n N 5 NAG 2 N NAG 2 M NAG 2 n O 6 NAG 1 O NAG 1 N NAG 1 n O 6 NAG 2 O NAG 2 N NAG 2 n O 6 BMA 3 O BMA 3 N BMA 3 n O 6 MAN 4 O MAN 4 N MAN 4 n O 6 MAN 5 O MAN 5 N MAN 5 n P 6 NAG 1 P NAG 1 O NAG 1 n P 6 NAG 2 P NAG 2 O NAG 2 n P 6 BMA 3 P BMA 3 O BMA 3 n P 6 MAN 4 P MAN 4 O MAN 4 n P 6 MAN 5 P MAN 5 O MAN 5 n Q 5 NAG 1 Q NAG 1 P NAG 1 n Q 5 NAG 2 Q NAG 2 P NAG 2 n R 6 NAG 1 R NAG 1 Q NAG 1 n R 6 NAG 2 R NAG 2 Q NAG 2 n R 6 BMA 3 R BMA 3 Q BMA 3 n R 6 MAN 4 R MAN 4 Q MAN 4 n R 6 MAN 5 R MAN 5 Q MAN 5 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 6 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 6 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n 6 MAN 4 n 6 MAN 5 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 7 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #