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? primary 'Gilchuk, P.' 2 ? primary 'Ilinykh, P.A.' 3 ? primary 'Huang, K.' 4 ? primary 'Kuzmina, N.' 5 ? primary 'Shen, X.' 6 ? primary 'Bruhn, J.F.' 7 ? primary 'Bryan, A.L.' 8 ? primary 'Davidson, E.' 9 ? primary 'Doranz, B.J.' 10 ? primary 'Williamson, L.E.' 11 ? primary 'Copps, J.' 12 ? primary 'Alkutkar, T.' 13 ? primary 'Flyak, A.I.' 14 ? primary 'Bukreyev, A.' 15 ? primary 'Crowe Jr., J.E.' 16 ? primary 'Ward, A.B.' 17 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Virion spike glycoprotein 1' 34978.613 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'Antibody Fab EBOV-442 heavy chain' 25294.287 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'Antibody Fab EBOV-442 light chain' 23715.314 3 ? ? ? ? 4 polymer man 'Virion spike glycoprotein 2' 22158.592 3 ? ? ? ? 5 branched man 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;MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARSIPLGVIHNSTLQVSDVDKLVCRDKLSSTNQLRSVGLNLEGNGVA TDVPSVTKRWGFRSGVPPKVVNYEAGEWAENCYNLEIKKPDGSECLPAAPDGIRGFPRCRYVHKVSGTGPCAGDFAFHKE GAFFLYDRLASTVIYRGTTFAEGVVAFLILPQAKKDFFSSHPLREPVNATEDPSSGYYSTTIRYQATGFGTNETEYLFEV DNLTYVQLESRFTPQFLLQLNETIYASGKRSNTTGKLIWKVNPEIDTTIGEWAFWETKKNLTRKIRSEELSFT ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCTGSGGTGFTFKYAGMSWVRQAPGKGPEWIGRIKSRIDGGTTDYAAPVKDRFIVSRDDS RNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCATGSGKGPSASFGESYYYYDFINVWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAA LGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD ; ;EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCTGSGGTGFTFKYAGMSWVRQAPGKGPEWIGRIKSRIDGGTTDYAAPVKDRFIVSRDDS RNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCATGSGKGPSASFGESYYYYDFINVWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAA LGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD ; G,H,I ? 3 'polypeptide(L)' no no ;ESVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSISRKYLAWYQQKPGQAPRLLIYGSSSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLE 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PRO 8 L 1 -0.68 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 12 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 12 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 7 ? AC4 ? 12 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA2 8 9 ? anti-parallel AA2 9 10 ? anti-parallel AA2 10 11 ? anti-parallel AA2 11 12 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? parallel AB3 6 7 ? parallel AB3 7 8 ? anti-parallel AB3 8 9 ? anti-parallel AB3 9 10 ? anti-parallel AB3 10 11 ? anti-parallel AB3 11 12 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC3 6 7 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? parallel AC4 6 7 ? parallel AC4 7 8 ? anti-parallel AC4 8 9 ? anti-parallel AC4 9 10 ? anti-parallel AC4 10 11 ? anti-parallel AC4 11 12 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 47 ? 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PHE A 151 HIS A 154 AA4 1 GLN B 3 ? SER B 7 ? GLN G 3 SER G 7 AA4 2 LEU B 18 ? SER B 25 ? LEU G 18 SER G 25 AA4 3 THR B 83 ? MET B 88 ? THR G 83 MET G 88 AA4 4 PHE B 73 ? ASP B 78 ? PHE G 73 ASP G 78 AA5 1 GLY B 10 ? VAL B 12 ? GLY G 10 VAL G 12 AA5 2 THR B 130 ? VAL B 134 ? THR G 130 VAL G 134 AA5 3 ALA B 97 ? THR B 103 ? ALA G 97 THR G 103 AA5 4 MET B 37 ? GLN B 42 ? MET G 37 GLN G 42 AA5 5 GLU B 49 ? ILE B 54 ? GLU G 49 ILE G 54 AA5 6 THR B 63 ? TYR B 65 ? THR G 63 TYR G 65 AA6 1 GLY B 10 ? VAL B 12 ? GLY G 10 VAL G 12 AA6 2 THR B 130 ? VAL B 134 ? THR G 130 VAL G 134 AA6 3 ALA B 97 ? THR B 103 ? ALA G 97 THR G 103 AA6 4 VAL B 125 ? TRP B 126 ? VAL G 125 TRP G 126 AA7 1 LEU C 4 ? SER C 7 ? LEU J 4 SER J 7 AA7 2 ALA C 19 ? ALA C 25 ? ALA J 19 ALA J 25 AA7 3 ASP C 71 ? ILE C 76 ? ASP J 71 ILE J 76 AA7 4 PHE C 63 ? SER C 68 ? PHE J 63 SER J 68 AA8 1 THR C 10 ? SER C 12 ? THR J 10 SER J 12 AA8 2 THR C 103 ? GLU C 106 ? THR J 103 GLU J 106 AA8 3 VAL C 86 ? GLN C 91 ? 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ALA H 97 THR H 103 AB7 4 VAL F 125 ? TRP F 126 ? VAL H 125 TRP H 126 AB8 1 LEU G 4 ? SER G 7 ? LEU K 4 SER K 7 AB8 2 ALA G 19 ? ALA G 25 ? ALA K 19 ALA K 25 AB8 3 ASP G 71 ? ILE G 76 ? ASP K 71 ILE K 76 AB8 4 PHE G 63 ? SER G 68 ? PHE K 63 SER K 68 AB9 1 THR G 10 ? SER G 12 ? THR K 10 SER K 12 AB9 2 THR G 103 ? GLU G 106 ? THR K 103 GLU K 106 AB9 3 VAL G 86 ? GLN G 91 ? VAL K 86 GLN K 91 AB9 4 LEU G 34 ? GLN G 39 ? LEU K 34 GLN K 39 AC1 1 THR G 10 ? SER G 12 ? THR K 10 SER K 12 AC1 2 THR G 103 ? GLU G 106 ? THR K 103 GLU K 106 AC1 3 VAL G 86 ? GLN G 91 ? VAL K 86 GLN K 91 AC1 4 THR G 98 ? PHE G 99 ? THR K 98 PHE K 99 AC2 1 ILE G 49 ? TYR G 50 ? ILE K 49 TYR K 50 AC2 2 SER G 54 ? ARG G 55 ? SER K 54 ARG K 55 AC3 1 LEU I 47 ? VAL I 49 ? LEU C 43 VAL C 45 AC3 2 GLY I 40 ? ILE I 42 ? GLY C 36 ILE C 38 AC3 3 THR I 179 ? ILE I 189 ? THR C 175 ILE C 185 AC3 4 LEU I 67 ? ASN I 73 ? LEU C 63 ASN C 69 AC3 5 ALA I 105 ? GLU I 107 ? ALA C 101 GLU C 103 AC3 6 LEU L 55 ? THR L 59 ? 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? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'U19 AI109762' 1 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'U19 AI142785' 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 5 NAG 1 M NAG 1 A NAG 1257 n M 5 NAG 2 M NAG 2 A NAG 1258 n M 5 BMA 3 M BMA 3 A BMA 1259 n M 5 MAN 4 M MAN 4 A MAN 1260 n M 5 MAN 5 M MAN 5 A MAN 1261 n N 6 NAG 1 N NAG 1 A NAG 1228 n N 6 NAG 2 N NAG 2 A NAG 1229 n O 5 NAG 1 O NAG 1 D NAG 1563 n O 5 NAG 2 O NAG 2 D NAG 1564 n O 5 BMA 3 O BMA 3 D BMA 1565 n O 5 MAN 4 O MAN 4 D MAN 1566 n O 5 MAN 5 O MAN 5 D MAN 1567 n P 5 NAG 1 P NAG 1 B NAG 1257 n P 5 NAG 2 P NAG 2 B NAG 1258 n P 5 BMA 3 P BMA 3 B BMA 1259 n P 5 MAN 4 P MAN 4 B MAN 1260 n P 5 MAN 5 P MAN 5 B MAN 1261 n Q 6 NAG 1 Q NAG 1 B NAG 1228 n Q 6 NAG 2 Q NAG 2 B NAG 1229 n R 5 NAG 1 R NAG 1 E NAG 1563 n R 5 NAG 2 R NAG 2 E NAG 1564 n R 5 BMA 3 R BMA 3 E BMA 1565 n R 5 MAN 4 R MAN 4 E MAN 1566 n R 5 MAN 5 R MAN 5 E MAN 1567 n S 5 NAG 1 S NAG 1 C NAG 1257 n S 5 NAG 2 S NAG 2 C NAG 1258 n S 5 BMA 3 S BMA 3 C BMA 1259 n S 5 MAN 4 S MAN 4 C MAN 1260 n S 5 MAN 5 S MAN 5 C MAN 1261 n T 6 NAG 1 T NAG 1 C NAG 1228 n T 6 NAG 2 T NAG 2 C NAG 1229 n U 5 NAG 1 U NAG 1 F NAG 1563 n U 5 NAG 2 U NAG 2 F NAG 1564 n U 5 BMA 3 U BMA 3 F BMA 1565 n U 5 MAN 4 U MAN 4 F MAN 1566 n U 5 MAN 5 U MAN 5 F MAN 1567 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 4 5 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 5 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 5 MAN 4 n 5 MAN 5 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 7 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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