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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.762 ? 38682 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.522 ? 10401 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.114 ? 4704 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.012 ? 4845 ? f_plane_restr ? ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.R_factor_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.wR_factor_all _refine_ls_shell.wR_factor_obs _refine_ls_shell.wR_factor_R_free _refine_ls_shell.wR_factor_R_work _refine_ls_shell.pdbx_R_complete _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.pdbx_phase_error _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.44 3.52 . . 144 212477 100.00 . . . 0.5400 . 0.5368 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.52 3.61 . . 120 213097 100.00 . . . 0.5319 . 0.5371 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.61 3.71 . . 132 213115 100.00 . . . 0.5123 . 0.5226 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.71 3.81 . . 144 213041 100.00 . . . 0.5399 . 0.5132 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.82 3.94 . . 120 212785 100.00 . . . 0.4893 . 0.4918 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 3.94 4.08 . . 144 212543 100.00 . . . 0.5142 . 0.4826 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.08 4.24 . . 120 212748 100.00 . . . 0.4658 . 0.4638 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.24 4.43 . . 144 213146 100.00 . . . 0.4296 . 0.4454 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.44 4.67 . . 120 212643 100.00 . . . 0.4156 . 0.4131 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.67 4.96 . . 144 212921 100.00 . . . 0.4369 . 0.4130 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 4.96 5.34 . . 144 212805 100.00 . . . 0.4094 . 0.4185 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 5.35 5.88 . . 132 212833 100.00 . . . 0.4494 . 0.4125 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 5.88 6.73 . . 144 213046 100.00 . . . 0.4442 . 0.4157 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 6.73 8.48 . . 132 212692 100.00 . . . 0.3094 . 0.3687 . . . . . . . . . . . 'ELECTRON MICROSCOPY' 8.49 396.00 . . 146 211210 99.00 . . . 0.3032 . 0.2755 . . . . . . . . . . . # _struct.entry_id 7KRQ _struct.title 'Structural impact on SARS-CoV-2 spike protein by D614G substitution' _struct.pdbx_descriptor 'Spike glycoprotein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7KRQ _struct_keywords.text 'VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? 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LEU C 1141 THR C 1160 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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B CYS 291 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 336 SG ? ? ? 1_555 B CYS 361 SG ? ? B CYS 336 B CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 379 SG ? ? ? 1_555 B CYS 432 SG ? ? B CYS 379 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 391 SG ? ? ? 1_555 B CYS 525 SG ? ? B CYS 391 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 480 SG ? ? ? 1_555 B CYS 488 SG ? ? B CYS 480 B CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 538 SG ? ? ? 1_555 B CYS 590 SG ? ? B CYS 538 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? ? disulf24 disulf ? ? B CYS 617 SG ? ? ? 1_555 B CYS 649 SG ? ? B CYS 617 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? ? disulf25 disulf ? ? B CYS 662 SG ? ? ? 1_555 B CYS 671 SG ? ? B CYS 662 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? ? disulf26 disulf ? ? B CYS 738 SG ? ? ? 1_555 B CYS 760 SG ? ? B CYS 738 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? ? disulf27 disulf ? ? B CYS 743 SG ? ? ? 1_555 B CYS 749 SG ? ? B CYS 743 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf28 disulf ? ? B CYS 840 SG ? ? ? 1_555 B CYS 851 SG ? ? B CYS 840 B CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf29 disulf ? ? B CYS 1032 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1043 SG ? ? B CYS 1032 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? disulf30 disulf ? ? B CYS 1082 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1126 SG ? ? B CYS 1082 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 15 SG ? ? ? 1_555 C CYS 136 SG ? ? C CYS 15 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 131 SG ? ? ? 1_555 C CYS 166 SG ? ? C CYS 131 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 291 SG ? ? ? 1_555 C CYS 301 SG ? ? C CYS 291 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 336 SG ? ? ? 1_555 C CYS 361 SG ? ? C CYS 336 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 379 SG ? ? ? 1_555 C CYS 432 SG ? ? C CYS 379 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 391 SG ? ? ? 1_555 C CYS 525 SG ? ? C CYS 391 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf37 disulf ? ? C CYS 480 SG ? ? ? 1_555 C CYS 488 SG ? ? C CYS 480 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? ? disulf38 disulf ? ? C CYS 538 SG ? ? ? 1_555 C CYS 590 SG ? ? C CYS 538 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? ? disulf39 disulf ? ? C CYS 617 SG ? ? ? 1_555 C CYS 649 SG ? ? C CYS 617 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? ? disulf40 disulf ? ? C CYS 662 SG ? ? ? 1_555 C CYS 671 SG ? ? C CYS 662 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? ? disulf41 disulf ? ? C CYS 738 SG ? ? ? 1_555 C CYS 760 SG ? ? C CYS 738 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? ? disulf42 disulf ? ? C CYS 743 SG ? ? ? 1_555 C CYS 749 SG ? ? C CYS 743 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf43 disulf ? ? C CYS 840 SG ? ? ? 1_555 C CYS 851 SG ? ? C CYS 840 C CYS 851 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf44 disulf ? ? C CYS 1032 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1043 SG ? ? C CYS 1032 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? ? disulf45 disulf ? ? C CYS 1082 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1126 SG ? ? C CYS 1082 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? A ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 122 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? A ASN 149 A NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.369 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 234 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.310 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 282 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.578 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? A ASN 331 A NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.553 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 343 A NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 603 A NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.541 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 616 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? A ASN 709 A NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.362 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 717 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 801 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.490 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 1098 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 1158 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? A ASN 1158 A NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.513 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? B ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? B ASN 61 B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 122 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? B ASN 149 B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.360 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? B ASN 165 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.599 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? B ASN 234 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.280 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 282 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.589 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? B ASN 331 B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.555 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? B ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? B ASN 343 B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.484 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? B ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? B ASN 603 B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.538 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? B ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? B ASN 616 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? B ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? B ASN 709 B NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? B ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? B ASN 717 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? B ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 801 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? B ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 1098 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.287 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? B ASN 1158 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? B ASN 1158 B NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? C ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? C ASN 61 C NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? C ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 122 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? C ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? C ASN 149 C NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.302 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? C ASN 234 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 234 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.279 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? C ASN 282 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 282 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.532 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? C ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? C ASN 331 C NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.554 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? C ASN 343 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? C ASN 343 C NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.530 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? C ASN 603 C NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.541 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 616 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 616 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? C ASN 709 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? C ASN 709 C NAG 1407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.365 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? C ASN 717 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 717 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.533 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? C ASN 801 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 801 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.480 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? C ASN 1098 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 1098 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.272 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? C ASN 1134 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 1134 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.522 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? C ASN 1158 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? C ASN 1158 C NAG 1408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.521 ? N-Glycosylation covale45 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale46 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale47 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E MAN . C1 ? ? E NAG 2 E MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale48 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale49 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale50 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G NAG 2 G MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale51 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale52 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? H NAG 2 H MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale53 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale54 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale55 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? J NAG 2 J MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale56 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale57 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K MAN . C1 ? ? K NAG 2 K MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale58 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale59 covale both ? L NAG . O6 ? ? ? 1_555 L FUC . C1 ? ? L NAG 1 L FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale60 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale61 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M NAG 2 M MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale62 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale63 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N NAG 2 N MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale64 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale65 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale66 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P MAN . C1 ? ? P NAG 2 P MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale67 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale68 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale69 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? R NAG 2 R MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale70 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale71 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S NAG 2 S MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale72 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale73 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale74 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U NAG 2 U MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale75 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale76 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V NAG 2 V MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale77 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale78 covale both ? W NAG . O6 ? ? ? 1_555 W FUC . C1 ? ? W NAG 1 W FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale79 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale80 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X MAN . C1 ? ? X NAG 2 X MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale81 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale82 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y NAG 2 Y MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale83 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale84 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale85 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a NAG 2 a MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale86 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale87 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale88 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c NAG 2 c MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? ? covale89 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale90 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d NAG 2 d MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale91 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale92 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale93 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f NAG 2 f MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale94 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale95 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g NAG 2 g MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? ? covale96 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale97 covale both ? HA NAG . O6 ? ? ? 1_555 HA FUC . C1 ? ? h NAG 1 h FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale98 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale99 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i NAG 2 i MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale100 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale101 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? j NAG 2 j MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 7 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 6 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 7 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 6 ? AE6 ? 5 ? AE7 ? 5 ? AE8 ? 3 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 2 ? 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RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.3 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' AI147884 1 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' AI141002 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero D 2 NAG 1 D NAG 1 A NAG 2000 n D 2 NAG 2 D NAG 2 A NAG 2001 n E 3 NAG 1 E NAG 1 A NAG 2003 n E 3 NAG 2 E NAG 2 A NAG 2004 n E 3 MAN 3 E MAN 3 A MAN 2005 n F 2 NAG 1 F NAG 1 A NAG 2007 n F 2 NAG 2 F NAG 2 A NAG 2008 n G 3 NAG 1 G NAG 1 A NAG 2009 n G 3 NAG 2 G NAG 2 A NAG 2010 n G 3 MAN 3 G MAN 3 A MAN 2011 n H 3 NAG 1 H NAG 1 A NAG 2012 n H 3 NAG 2 H NAG 2 A NAG 2013 n H 3 MAN 3 H MAN 3 A MAN 2014 n I 2 NAG 1 I NAG 1 A NAG 2019 n I 2 NAG 2 I NAG 2 A NAG 2020 n J 3 NAG 1 J NAG 1 A NAG 2024 n J 3 NAG 2 J NAG 2 A NAG 2025 n J 3 MAN 3 J MAN 3 A MAN 2026 n K 3 NAG 1 K NAG 1 A NAG 2027 n K 3 NAG 2 K NAG 2 A NAG 2028 n K 3 MAN 3 K MAN 3 A MAN 2029 n L 4 NAG 1 L NAG 1 A NAG 2030 n L 4 NAG 2 L NAG 2 A NAG 2031 n L 4 FUC 3 L FUC 3 A FUC 2032 n M 3 NAG 1 M NAG 1 A NAG 2033 n M 3 NAG 2 M NAG 2 A NAG 2034 n M 3 MAN 3 M MAN 3 A MAN 2035 n N 3 NAG 1 N NAG 1 A NAG 2036 n N 3 NAG 2 N NAG 2 A NAG 2037 n N 3 MAN 3 N MAN 3 A MAN 2038 n O 2 NAG 1 O NAG 1 B NAG 2000 n O 2 NAG 2 O NAG 2 B NAG 2001 n P 3 NAG 1 P NAG 1 B NAG 2003 n P 3 NAG 2 P NAG 2 B NAG 2004 n P 3 MAN 3 P MAN 3 B MAN 2005 n Q 2 NAG 1 Q NAG 1 B NAG 2007 n Q 2 NAG 2 Q NAG 2 B NAG 2008 n R 3 NAG 1 R NAG 1 B NAG 2009 n R 3 NAG 2 R NAG 2 B NAG 2010 n R 3 MAN 3 R MAN 3 B MAN 2011 n S 3 NAG 1 S NAG 1 B NAG 2012 n S 3 NAG 2 S NAG 2 B NAG 2013 n S 3 MAN 3 S MAN 3 B MAN 2014 n T 2 NAG 1 T NAG 1 B NAG 2019 n T 2 NAG 2 T NAG 2 B NAG 2020 n U 3 NAG 1 U NAG 1 B NAG 2024 n U 3 NAG 2 U NAG 2 B NAG 2025 n U 3 MAN 3 U MAN 3 B MAN 2026 n V 3 NAG 1 V NAG 1 B NAG 2027 n V 3 NAG 2 V NAG 2 B NAG 2028 n V 3 MAN 3 V MAN 3 B MAN 2029 n W 4 NAG 1 W NAG 1 B NAG 2030 n W 4 NAG 2 W NAG 2 B NAG 2031 n W 4 FUC 3 W FUC 3 B FUC 2032 n X 3 NAG 1 X NAG 1 B NAG 2033 n X 3 NAG 2 X NAG 2 B NAG 2034 n X 3 MAN 3 X MAN 3 B MAN 2035 n Y 3 NAG 1 Y NAG 1 B NAG 2036 n Y 3 NAG 2 Y NAG 2 B NAG 2037 n Y 3 MAN 3 Y MAN 3 B MAN 2038 n Z 2 NAG 1 Z NAG 1 C NAG 2000 n Z 2 NAG 2 Z NAG 2 C NAG 2001 n AA 3 NAG 1 a NAG 1 C NAG 2003 n AA 3 NAG 2 a NAG 2 C NAG 2004 n AA 3 MAN 3 a MAN 3 C MAN 2005 n BA 2 NAG 1 b NAG 1 C NAG 2007 n BA 2 NAG 2 b NAG 2 C NAG 2008 n CA 3 NAG 1 c NAG 1 C NAG 2009 n CA 3 NAG 2 c NAG 2 C NAG 2010 n CA 3 MAN 3 c MAN 3 C MAN 2011 n DA 3 NAG 1 d NAG 1 C NAG 2012 n DA 3 NAG 2 d NAG 2 C NAG 2013 n DA 3 MAN 3 d MAN 3 C MAN 2014 n EA 2 NAG 1 e NAG 1 C NAG 2019 n EA 2 NAG 2 e NAG 2 C NAG 2020 n FA 3 NAG 1 f NAG 1 C NAG 2024 n FA 3 NAG 2 f NAG 2 C NAG 2025 n FA 3 MAN 3 f MAN 3 C MAN 2026 n GA 3 NAG 1 g NAG 1 C NAG 2027 n GA 3 NAG 2 g NAG 2 C NAG 2028 n GA 3 MAN 3 g MAN 3 C MAN 2029 n HA 4 NAG 1 h NAG 1 C NAG 2030 n HA 4 NAG 2 h NAG 2 C NAG 2031 n HA 4 FUC 3 h FUC 3 C FUC 2032 n IA 3 NAG 1 i NAG 1 C NAG 2033 n IA 3 NAG 2 i NAG 2 C NAG 2034 n IA 3 MAN 3 i MAN 3 C MAN 2035 n JA 3 NAG 1 j NAG 1 C NAG 2036 n JA 3 NAG 2 j NAG 2 C NAG 2037 n JA 3 MAN 3 j MAN 3 C MAN 2038 n # 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loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 2 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 3 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 3 3 MAN C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 5 4 3 FUC C1 O1 1 NAG O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 2 NAG 1 n 2 NAG 2 n 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n 3 MAN 3 n 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 FUC 3 n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id NAG _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id NAG _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #