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_citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yu, J.' 1 ? primary 'Rao, P.' 2 ? primary 'Clark, S.' 3 ? primary 'Mitra, J.' 4 ? primary 'Ha, T.' 5 ? primary 'Gouaux, E.' 6 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7LEP _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? 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CYS n 4 61 CYS n 4 62 LEU n 4 63 LEU n 4 64 ARG n 4 65 LYS n 4 66 LEU n 4 67 VAL n 4 68 VAL n 4 69 PRO n 4 70 GLU n 4 71 TYR n 4 72 SER n 4 73 ILE n 4 74 HIS n 4 75 GLY n 4 76 LEU n 4 77 PHE n 4 78 CYS n 4 79 LEU n 4 80 MET n 4 81 PHE n 4 82 LEU n 4 83 CYS n 4 84 ALA n 4 85 ALA n 4 86 GLU n 4 87 TRP n 4 88 VAL n 4 89 THR n 4 90 LEU n 4 91 GLY n 4 92 LEU n 4 93 ASN n 4 94 ILE n 4 95 PRO n 4 96 LEU n 4 97 LEU n 4 98 PHE n 4 99 THR n 4 100 HIS n 4 101 LEU n 4 102 TRP n 4 103 ARG n 4 104 TYR n 4 105 PHE n 4 106 HIS n 4 107 ARG n 4 108 PRO n 4 109 ALA n 4 110 ASP n 4 111 GLY n 4 112 SER n 4 113 GLU n 4 114 VAL n 4 115 MET n 4 116 TYR n 4 117 ASP n 4 118 ALA n 4 119 VAL n 4 120 SER n 4 121 ILE n 4 122 MET n 4 123 ASN n 4 124 ALA n 4 125 ASP n 4 126 ILE n 4 127 LEU n 4 128 ASN n 4 129 TYR n 4 130 CYS n 4 131 GLN n 4 132 LYS n 4 133 GLU n 4 134 SER n 4 135 TRP n 4 136 CYS n 4 137 LYS n 4 138 LEU n 4 139 ALA n 4 140 PHE n 4 141 TYR n 4 142 LEU n 4 143 LEU n 4 144 SER n 4 145 PHE n 4 146 PHE n 4 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n 5 79 ARG n 5 80 GLY n 5 81 VAL n 5 82 CYS n 5 83 VAL n 5 84 LYS n 5 85 ILE n 5 86 ASN n 5 87 HIS n 5 88 PHE n 5 89 PRO n 5 90 GLU n 5 91 ASP n 5 92 THR n 5 93 ASP n 5 94 TYR n 5 95 ASP n 5 96 HIS n 5 97 ASP n 5 98 SER n 5 99 ALA n 5 100 GLU n 5 101 TYR n 5 102 LEU n 5 103 LEU n 5 104 ARG n 5 105 VAL n 5 106 VAL n 5 107 ARG n 5 108 ALA n 5 109 SER n 5 110 SER n 5 111 ILE n 5 112 PHE n 5 113 PRO n 5 114 ILE n 5 115 LEU n 5 116 SER n 5 117 ALA n 5 118 ILE n 5 119 LEU n 5 120 LEU n 5 121 LEU n 5 122 LEU n 5 123 GLY n 5 124 GLY n 5 125 VAL n 5 126 CYS n 5 127 VAL n 5 128 ALA n 5 129 ALA n 5 130 SER n 5 131 ARG n 5 132 VAL n 5 133 TYR n 5 134 LYS n 5 135 SER n 5 136 LYS n 5 137 ARG n 5 138 ASN n 5 139 ILE n 5 140 ILE n 5 141 LEU n 5 142 GLY n 5 143 ALA n 5 144 GLY n 5 145 ILE n 5 146 LEU n 5 147 PHE n 5 148 VAL n 5 149 ALA n 5 150 ALA n 5 151 GLY n 5 152 LEU n 5 153 SER n 5 154 ASN n 5 155 ILE n 5 156 ILE n 5 157 GLY n 5 158 VAL n 5 159 ILE n 5 160 VAL n 5 161 TYR n 5 162 ILE n 5 163 SER n 5 164 ALA n 5 165 ASN n 5 166 ALA n 5 167 GLY n 5 168 GLU n 5 169 PRO n 5 170 GLY n 5 171 PRO n 5 172 LYS n 5 173 ARG n 5 174 ASP n 5 175 GLU n 5 176 GLU n 5 177 LYS n 5 178 LYS n 5 179 ASN n 5 180 HIS n 5 181 TYR n 5 182 SER n 5 183 TYR n 5 184 GLY n 5 185 TRP n 5 186 SER n 5 187 PHE n 5 188 TYR n 5 189 PHE n 5 190 GLY n 5 191 GLY n 5 192 LEU n 5 193 SER n 5 194 PHE n 5 195 ILE n 5 196 LEU n 5 197 ALA n 5 198 GLU n 5 199 VAL n 5 200 ILE n 5 201 GLY n 5 202 VAL n 5 203 LEU n 5 204 ALA n 5 205 VAL n 5 206 ASN n 5 207 ILE n 5 208 TYR n 5 209 ILE n 5 210 GLU n 5 211 ARG n 5 212 SER n 5 213 ARG n 5 214 GLU n 5 215 ALA n # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 414 Mouse 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 424 Mouse 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 413 Mouse 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 159 Mouse 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 215 Mouse 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7LEP 7LEP ? 1 ? 1 2 UNP C9K0Z0_MOUSE C9K0Z0 ? 2 ;VVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIA IAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEE FEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIES AEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQR KPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKEKTSALSLSNVAGV FYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR ; 417 3 PDB 7LEP 7LEP ? 3 ? 1 4 UNP CNIH2_MOUSE O35089 ? 4 ;AFTFAAFCYMLTLVLCASLIFFVIWHIIAFDELRTDFKNPIDQGNPARARERLKNIERICCLLRKLVVPEYSIHGLFCLM FLCAAEWVTLGLNIPLLFYHLWRYFHRPADGSEVMYDAVSIMNADILNYCQKESWCKLAFYLLSFFYYLYSMVYTLVSF ; 2 5 UNP CCG8_MOUSE Q8VHW2 ? 5 ;VQVLLTTIGAFSAFGLMTIAISTDYWLYTRALICNTTNLTAGDDGPPHRGGSGSSEKKDPGGLTHSGLWRICCLEGLKRG VCVKINHFPEDTDYDHDSAEYLLRVVRASSIFPILSAILLLLGGVCVAASRVYKSKRNIILGAGILFVAAGLSNIIGVIV YISANAGEPGPKRDEEKKNHYSYGWSFYFGGLSFILAEVIGVLAVNIYIERSREA ; 19 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7LEP A 1 ? 414 ? 7LEP 390 ? 813 ? 390 813 2 2 7LEP B 1 ? 424 ? C9K0Z0 417 ? 840 ? 396 819 3 3 7LEP C 1 ? 413 ? 7LEP 390 ? 813 ? 390 813 4 2 7LEP D 1 ? 424 ? C9K0Z0 417 ? 840 ? 396 819 5 4 7LEP E 1 ? 159 ? O35089 2 ? 160 ? 2 160 6 4 7LEP F 1 ? 159 ? O35089 2 ? 160 ? 2 160 7 5 7LEP G 1 ? 215 ? Q8VHW2 19 ? 233 ? 19 233 8 5 7LEP H 1 ? 215 ? Q8VHW2 19 ? 233 ? 19 233 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 2 7LEP GLU B 361 ? UNP C9K0Z0 GLN 777 conflict 756 1 4 7LEP GLU D 361 ? UNP C9K0Z0 GLN 777 conflict 756 2 5 7LEP THR E 99 ? UNP O35089 TYR 100 conflict 100 3 6 7LEP THR F 99 ? UNP O35089 TYR 100 conflict 100 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C14 non-polymer . TETRADECANE ? 'C14 H30' 198.388 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 D10 non-polymer . DECANE ? 'C10 H22' 142.282 D12 non-polymer . DODECANE ? 'C12 H26' 170.335 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 OCT non-polymer . N-OCTANE ? 'C8 H18' 114.229 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 POV non-polymer . '(2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate' POPC 'C42 H82 N O8 P' 760.076 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 XVD non-polymer . '6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol' ? 'C14 H8 Cl F3 N2 O2' 328.674 ZK1 non-polymer . '{[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid' '[[3,4-Dihydro-7-(4-morpholinyl)-2,3-dioxo-6-(trifluorom ethyl)-1(2H)-quinoxalinyl]methyl]phosphonic acid' 'C14 H15 F3 N3 O6 P' 409.254 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7LEP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7LEP _struct.title 'The composite LBD-TMD structure combined from all hippocampal AMPAR subtypes at 3.25 Angstrom resolution' _struct.pdbx_descriptor ;Mix of AMPAR subunits (GluA1, GluA3, and GluA4), Glutamate receptor, Mix of AMPAR subunits (GluA1, GluA3, and GluAX), Protein cornichon homolog 2, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7LEP _struct_keywords.text 'Native hippocampal ion channel, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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XA N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 23 ? ALA A 26 ? GLU A 412 ALA A 415 5 ? 4 HELX_P HELX_P2 AA2 TYR A 31 ? GLY A 44 ? TYR A 420 GLY A 433 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 68 ? TYR A 76 ? ASN A 457 TYR A 465 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 89 ? ILE A 96 ? THR A 478 ILE A 485 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 AA5 PHE A 122 ? ASP A 126 ? PHE A 511 ASP A 515 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA A 129 ? ARG A 152 ? 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